Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0147
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0147, 1630 aa
1>>>pF1KSDA0147 1630 - 1630 aa - 1630 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2509+/-0.00107; mu= -5.6552+/- 0.065
mean_var=441.3760+/-87.935, 0's: 0 Z-trim(115.8): 133 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.061048
statistics sampled from 16289 (16422) to 16289 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.772), E-opt: 0.2 (0.504), width: 16
Scan time: 6.610
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1630) 10803 967.1 0
CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1655) 10383 930.1 0
CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 2108 200.9 9.1e-51
CCDS34172.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1302) 1327 132.5 9.2e-30
CCDS58954.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1346) 1327 132.5 9.4e-30
CCDS3990.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1371) 1327 132.5 9.5e-30
CCDS58953.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1412) 1327 132.5 9.7e-30
CCDS58952.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1419) 1327 132.5 9.8e-30
CCDS58951.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1367) 1322 132.0 1.3e-29
CCDS81341.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1495) 1303 130.4 4.4e-29
CCDS645.1 LRRC7 gene_id:57554|Hs108|chr1 (1537) 1303 130.4 4.5e-29
>>CCDS6411.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1630 aa)
initn: 10803 init1: 10803 opt: 10803 Z-score: 5157.0 bits: 967.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10803; 99.9% identity (99.9% similar) in 1630 aa overlap (1-1630:1-1630)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
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CCDS64 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PLSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
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CCDS64 GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
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CCDS64 PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
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CCDS64 EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD SPGRLSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVLLGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPGRLSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVLLGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRP
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630
pF1KSD GRRGLGPVPS
::::::::::
CCDS64 GRRGLGPVPS
1630
>>CCDS6412.1 SCRIB gene_id:23513|Hs108|chr8 (1655 aa)
initn: 10789 init1: 10351 opt: 10383 Z-score: 4957.0 bits: 930.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10743; 98.4% identity (98.4% similar) in 1655 aa overlap (1-1630:1-1655)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MLKCIPLWRCNRHVESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLRELPKPFFRLLN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEIADFSGNPLSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPASLSFLVKLEQLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSENRLEELPAELG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCENLSELILTENL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAVLPPELAHTTEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HVLDVAGNRLQSLPFALTHLNLKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGEKVLTCYLLPQQP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PLSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PPSLEDAGQQGSLSETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGLQRRATPHPSE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSASTVSEAEPEGPS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AEAQGGSQQEATTAGGEEDAEEDYQEPTVHFAEDALLPGDDREIEEGQPEAPWTLPGGRQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALLQGMQPDGEGPVAPGGWHNGPHAPWAPRAQKE
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pF1KSD EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EEEEEEGSPQEEEEEEEEENRAEEEEASTEEEDKEGAVVSAPSVKGVSFDQANNLLIEPA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RIEEEELTLTILRQTGGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKL
730 740 750 760 770 780
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pF1KSD LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LEVNGVALQGAEHHEAVEALRGAGTAVQMRVWRERMVEPENAVTITPLRPEDDYSPRERR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GGGLRLPLLPPESPGPLRQRHVACLARSERGLGFSIAGGKGSTPYRAGDAGIFVSRIAEG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GAAHRAGTLQVGDRVLSINGVDVTEARHDHAVSLLTAASPTIALLLEREAGGPLPPSPLP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 HSSPPTAAVATTSITTATPGVPGLPSLAPSLLAAALEGPYPVEEIRLPRAGGPLGLSIVG
970 980 990 1000 1010 1020
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pF1KSD GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GSDHSSHPFGVQEPGVFISKVLPRGLAARSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PCLELSLLVRRDPAPPGLRELCIQKAPGERLGISIRGGARGHAGNPRDPTDEGIFISKVS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 PTGAAGRDGRLRVGLRLLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLRSVGDTLTVLVCDGFEASTDAAL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EVSPGVIANPFAAGIGHRNSLESISSIDRELSPEGPGKEKELPGQTLHWGPEATEAAGRG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LQPLKLDYRALAAVPSAGSVQRVPSGAAGGKMAESPCSPSGQQPPSPPSPDELPANVKQA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 YRAFAAVPTSHPPEDAPAQPPTPGPAASPEQLSFRERQKYFELEVRVPQAEGPPKRVSLV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GADDLRKMQEEEARKLQQKRAQMLREAAEAGAEARLALDGETLGEEEQEDEQPPWASPSP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TSRQSPASPPPLGGGAPVRTAKAERRHQERLRVQSPEPPAPERALSPAELRALEAEKRAL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
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pF1KSD WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 WRAARMKSLEQDALRAQMVLSRSQEGRGTRGPLERLAEAPSPAPTPSPTPVEDLGPQTST
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1570 1580 1590
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::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SPGRLPLSGKKFDYRAFAALPSSRPVYDIQSPDFAEELRSLEPSPSPGPQEEDGEVALVL
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1600 1610 1620 1630
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LGRPSPGAVGPEDVALCSSRRPVRPGRRGLGPVPS
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10 20 30 40 50 60
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:..:::::::::::::.::::::: ::::::::.:::::::::::::::::. ::.:..
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:::::::::::::::::.::::::::::::::.::::::::.:::::..::::::::.::
CCDS49 LRKLGLSDNEIQRLPPEIANFMQLVELDVSRNEIPEIPESISFCKALQVADFSGNPLTRL
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:..: .:..:. :..::.:::.:: ..::: ::..:::::::: :: ::. : .::.::
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::.:.. ::...::: .:..:::: :::: :: :.:::. :.::::::::::.:: :..
CCDS49 LGNNEIYNLPESIGALLHLKDLWLDGNQLSELPQEIGNLKNLLCLDVSENRLERLPEEIS
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::. ::::..:::::. .:::::.::.::::::::::: .. ::.:.::.:.::.::::
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:..::.:.::: ::.:::.:::.: .:: ::::: .:.:. .:::::. .: :....:::
CCDS49 LLTLPKSIGKLKKLSNLNADRNKLVSLPKEIGGCCSLTVFCVRDNRLTRIPAEVSQATEL
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:::::::::: ::..:: :.::::::..::.::.: :::. : ::::.::: :::: :
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pF1KSD --PLSLEDAGQQGSL--------SETWSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKRGL
: :. . :.: .:.:.. .:::.:.:.: :: :: : : :
CCDS49 SEPTCQENLPRCGALENLVNDVSDEAWNERAVNRVSAIRFVE----DEKDEEDN-ETRTL
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pF1KSD QRRATPHPSELKVMKRSIEGRRSEACPCQPDSGSPLPAEEEKRLSAESGLSEDSRPSAST
:::::::.::: ::...:. :..
CCDS49 LRRATPHPGELKHMKKTVENLRNDMNAAKGLDSNKNEVNHAIDRVTTSV
480 490 500 510 520
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10 20 30 40
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.. .: :: : : ..: ::::. ::.::. . ..:::: :::::..
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:::: .: .:.::.: ::.. :: .::...: :::::.: : :.::.:: ::.: :
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pF1KSD ADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPAS
.. : ::.:.:::::.:: .:..: :::. :. ::.. : :..: :::::: :: :: .
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170 180 190 200 210 220
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.. :..::.::::.:.. .:..: : .:.:.:.: :.:. .: .:.:..:. ::::.
CCDS34 MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSK
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230 240 250 260 270 280
pF1KSD NRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCE
: .: . .. : :::::.: :..::. ::.::... ::.:.:.: . ..::
CCDS34 NNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLI
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290 300 310 320 330 340
pF1KSD NLSELILTENLLMALPRSLGKLTKLTNLNVDRNHLEALPPEIGGCVALSVLSLRDNRLAV
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CCDS34 SVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLET
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:: :.. .:.:.... :::..:::..:.:. : :.::..::..:.. .: : :..: .
CCDS34 LPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQK
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::: :..:::: ::. ... :.. . : . .:..: .: :.: .::
CCDS34 MVLTNYMFPQQP--RTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVA--FECD-EDKDEREAP
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470 480 490 500 510 520
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.. .:.: ::.:.::: : .... .: . . ::: : : :... .. . :.
CCDS34 PREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDVGVK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD -SEDSRPSASTVSEAEPEGPSAEAQGGSQQEATTAGG------EEDAEEDYQEPTVH---
::.. : :.: : . .: :. :: . : . : :. .. . :
CCDS34 TSESTTTVKSKVDEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHDDV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
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: :. : .:.. .. : .:
CCDS34 FEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQN
600 610 620 630 640 650
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.. .: :: : : ..: ::::. ::.::. . ..:::: :::::..
CCDS58 MTTKRSLFVRLVPC-RCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEI
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CCDS58 ELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTI
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pF1KSD ADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPAS
.. : ::.:.:::::.:: .:..: :::. :. ::.. : :..: :::::: :: :: .
CCDS58 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSE
.. :..::.::::.:.. .:..: : .:.:.:.: :.:. .: .:.:..:. ::::.
CCDS58 MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSK
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pF1KSD NRLEELPAELGGLVLLTDLLLSQNLLRRLPDGIGQLKQLSILKVDQNRLCEVTEAIGDCE
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CCDS58 NNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLI
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.. :: . : . ::: :.:.::.: .. .:.:.:. ::::::. ..:: :..:.: .
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:: :.. .:.:.... :::..:::..:.:. : :.::..::..:.. .: : :..: .
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::: :..:::: ::. ... :.. . : . .:..: .: :.: .::
CCDS58 MVLTNYMFPQQP--RTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVA--FECD-EDKDEREAP
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pF1KSD AEKRGLQRRATPHPSELKVMKRSIEG--RRSEACPCQPDSGSPL-PAEEEKRLSAESGL-
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CCDS58 PREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDVGVK
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pF1KSD -SEDSRPSASTVSEAEPEGPSAEAQGGSQQEATTAGG------EEDAEEDYQEPTVH---
::.. : :.: : . .: :. :: . : . : :. .. . :
CCDS58 TSESTTTVKSKVDEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHDDV
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: :. : .:.. .. : .:
CCDS58 FEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQN
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CCDS39 MTTKRSLFVRLVPC-RCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIE
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pF1KSD ELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEI
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CCDS39 ELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTI
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pF1KSD ADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPAS
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CCDS39 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT
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pF1KSD LSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSE
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CCDS39 MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSK
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CCDS39 NNIEMVEEGISTCENLQDLLLSSNSLQQLPETIGSLKNITTLKIDENQLMYLPDSIGGLI
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CCDS39 SVEELDCSFNEVEALPSSIGQLTNLRTFAADHNYLQQLPPEIGSWKNITVLFLHSNKLET
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pF1KSD LPPELAHTTELHVLDVAGNRLQSLPFALTHLN-LKALWLAENQAQPMLRFQTEDDARTGE
:: :.. .:.:.... :::..:::..:.:. : :.::..::..:.. .: : :..: .
CCDS39 LPEEMGDMQKLKVINLSDNRLKNLPFSFTKLQQLTAMWLSDNQSKPLIPLQKETDSETQK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD KVLTCYLLPQQPPLSLEDA---GQQGSLSET-WSDAPPSRVSVIQFLEAPIGDEDAEEAA
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CCDS39 MVLTNYMFPQQP--RTEDVMFISDNESFNPSLWEEQRKQRAQVA--FECD-EDKDEREAP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD AEKRGLQRRATPHPSELKVMKRSIEG--RRSEACPCQPDSGSPL-PAEEEKRLSAESGL-
.. .:.: ::.:.::: : .... .: . . ::: : : :... .. . :.
CCDS39 PREGNLKRYPTPYPDELKNMVKTVQTIVHRLKDEETNEDSGRDLKPHEDQQDINKDVGVK
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD -SEDSRPSASTVSEAEPEGPSAEAQGGSQQEATTAGG------EEDAEEDYQEPTVH---
::.. : :.: : . .: :. :: . : . : :. .. . :
CCDS39 TSESTTTVKSKVDEREKYMIGNSVQKISEPEAEISPGSLPVTANMKASENLKHIVNHDDV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD FAEDALLPGDDR-EIEEGQPEAPWTLPGGRQRLIRKDTPHYKKHFKISKLPQPEAVVALL
: :. : .:.. .. : .:
CCDS39 FEESEELSSDEEMKMAEMRPPLIETSINQPKVVALSNNKKDDTKETDSLSDEVTHNSNQN
600 610 620 630 640 650
>>CCDS58953.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1412 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MLKCIPLWRCNRH----VESVDKRHCSLQAVPEEIYRYSRSLEELLLDANQLR
.. .: :: : : ..: ::::. ::.::. . ..:::: :::::..
CCDS58 MTTKRSLFVRLVPC-RCLRGEEETVTTLDYSHCSLEQVPKEIFTFEKTLEELYLDANQIE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ELPKPFFRLLNLRKLGLSDNEIQRLPPEVANFMQLVELDVSRNDIPEIPESIKFCKALEI
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CCDS58 ELPKQLFNCQSLHKLSLPDNDLTTLPASIANLINLRELDVSKNGIQEFPENIKNCKVLTI
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD ADFSGNPLSRLPDGFTQLRSLAHLALNDVSLQALPGDVGNLANLVTLELRENLLKSLPAS
.. : ::.:.:::::.:: .:..: :::. :. ::.. : :..: :::::: :: :: .
CCDS58 VEASVNPISKLPDGFSQLLNLTQLYLNDAFLEFLPANFGRLTKLQILELRENQLKMLPKT
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LSFLVKLEQLDLGGNDLEVLPDTLGALPNLRELWLDRNQLSALPPELGNLRRLVCLDVSE
.. :..::.::::.:.. .:..: : .:.:.:.: :.:. .: .:.:..:. ::::.
CCDS58 MNRLTQLERLDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLKEFWMDANRLTFIPGFIGSLKQLTYLDVSK
180 190 200 210 220 230
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CCDS81 ANQIEELPKQLFNCQALRKLSIPDNDLSNLPTTIASLVNLKELDISKNGVQEFPENIKCC
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CCDS81 TLPKSMHKLAQLERLDLGNNEFGELPEVLDQIQNLRELWMDNNALQVLPGSIGKLKMLVY
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CCDS81 VGKPSHGVRVENSNPTANTEQTVKEKYEHKWPVAPKEITVEDSFVHPANEMRIGELHPSL
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1630 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 00:15:20 2016 done: Thu Nov 3 00:15:21 2016
Total Scan time: 6.610 Total Display time: 0.460
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]