Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0149
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0149, 830 aa
1>>>pF1KSDA0149 830 - 830 aa - 830 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1753+/-0.000427; mu= 5.5489+/- 0.027
mean_var=369.0180+/-73.274, 0's: 0 Z-trim(122.6): 427 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.066765
statistics sampled from 40471 (40947) to 40471 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.48), width: 16
Scan time: 12.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003684 (OMIM: 607873) scavenger receptor class ( 830) 6252 617.0 1.1e-175
NP_663325 (OMIM: 607873) scavenger receptor class ( 569) 4021 401.9 4.2e-111
NP_699165 (OMIM: 600920,613619) scavenger receptor ( 871) 2271 233.6 3e-60
NP_878315 (OMIM: 600920,613619) scavenger receptor ( 866) 2245 231.1 1.7e-59
XP_016880745 (OMIM: 607873) PREDICTED: scavenger r ( 419) 2167 223.2 2e-57
XP_016884554 (OMIM: 600920,613619) PREDICTED: scav ( 617) 2050 212.1 6.2e-54
XP_016878162 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1021) 1025 113.7 4.4e-24
NP_115821 (OMIM: 612454) multiple epidermal growth (1044) 1025 113.7 4.5e-24
XP_016878161 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1044) 1025 113.7 4.5e-24
XP_016878160 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1092) 1025 113.7 4.6e-24
XP_016878159 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep (1097) 1025 113.7 4.6e-24
XP_016856731 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 909) 980 109.3 8.3e-23
XP_016856729 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 909) 980 109.3 8.3e-23
XP_016856730 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 909) 980 109.3 8.3e-23
XP_016856727 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 973) 980 109.3 8.7e-23
XP_016856726 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 973) 980 109.3 8.7e-23
XP_016856728 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 973) 980 109.3 8.7e-23
XP_011507813 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1002) 980 109.3 8.8e-23
XP_011507812 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1037) 980 109.3 9e-23
NP_001073940 (OMIM: 610278) platelet endothelial a (1037) 980 109.3 9e-23
XP_016856725 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1037) 980 109.3 9e-23
XP_005245198 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1037) 980 109.3 9e-23
XP_016856723 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1125) 980 109.4 9.5e-23
XP_011507814 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en ( 868) 951 106.4 5.6e-22
XP_016856724 (OMIM: 610278) PREDICTED: platelet en (1081) 951 106.6 6.4e-22
XP_016865477 (OMIM: 612453,614399) PREDICTED: mult ( 760) 947 106.0 6.7e-22
NP_115822 (OMIM: 612453,614399) multiple epidermal (1140) 950 106.5 7.1e-22
XP_011541996 (OMIM: 612453,614399) PREDICTED: mult (1140) 950 106.5 7.1e-22
NP_001243474 (OMIM: 612453,614399) multiple epider (1140) 950 106.5 7.1e-22
XP_016865476 (OMIM: 612453,614399) PREDICTED: mult (1195) 950 106.5 7.3e-22
XP_011539190 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1364) 776 89.8 8.8e-17
XP_011539189 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1395) 776 89.8 8.9e-17
XP_006710469 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1436) 776 89.9 9e-17
NP_001400 (OMIM: 604266) multiple epidermal growth (1541) 776 89.9 9.4e-17
XP_011539188 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1560) 776 89.9 9.5e-17
XP_011539187 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1603) 776 89.9 9.7e-17
XP_016856022 (OMIM: 604266) PREDICTED: multiple ep (1559) 687 81.3 3.6e-14
NP_001295048 (OMIM: 612453,614399) multiple epider ( 567) 669 79.0 6.5e-14
NP_001295050 (OMIM: 612453,614399) multiple epider ( 567) 669 79.0 6.5e-14
XP_016878164 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep ( 854) 605 73.1 6e-12
XP_016878163 (OMIM: 612454) PREDICTED: multiple ep ( 854) 605 73.1 6e-12
NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin sub (1798) 527 66.0 1.7e-09
XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTE (1798) 527 66.0 1.7e-09
XP_016865156 (OMIM: 610119) PREDICTED: teneurin-2 (2613) 473 61.0 8e-08
XP_006714960 (OMIM: 610119) PREDICTED: teneurin-2 (2758) 473 61.0 8.2e-08
XP_005266007 (OMIM: 610119) PREDICTED: teneurin-2 (2765) 473 61.0 8.2e-08
NP_001116151 (OMIM: 610119) teneurin-2 isoform 1 [ (2765) 473 61.0 8.2e-08
XP_005252032 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1564) 463 59.8 1.1e-07
XP_005252031 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 463 59.8 1.2e-07
XP_006717164 (OMIM: 187380,615629) PREDICTED: tena (1655) 463 59.8 1.2e-07
>>NP_003684 (OMIM: 607873) scavenger receptor class F me (830 aa)
initn: 6252 init1: 6252 opt: 6252 Z-score: 3275.3 bits: 617.0 E(85289): 1.1e-175
Smith-Waterman score: 6252; 99.5% identity (99.9% similar) in 830 aa overlap (1-830:1-830)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGLGLLLPLLLLWTRGTQGSELDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MGLGLLLPLLLLWTRGTQGSELDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TALIVGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGST
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TALIAGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPPSAGWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPPSAGWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PPQEGMVPVAQAGSSEASLAAGAFPPPEDASTPFAIPRTSSLARAKRPSVSFAEGTKFAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PPQEGMVPVAQAGSSEASLAAGAFPPPEDASTPFAIPRTSSLARAKRPSVSFAEGTKFAP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD QSRRSSGELSSPLRKPKRLSRGAQSGPEGREAEESTGPDEAEAPESFPAAASPGDSATGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_003 QSRRSSGELSSPLRKPKRLSRGAQSGPEGREAEESTGPEEAEAPESFPAAASPGDSATGH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD RWPPLGSRTVAEHVEAIEGSVQESSGPVTTIYMLAGKPRGSEGPVRSVFRHFGSFQKGQA
: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RRPPLGGRTVAEHVEAIEGSVQESSGPVTTIYMLAGKPRGSEGPVRSVFRHFGSFQKGQA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EAKVKRAIPKPPRQALNRKKGSPGLASGSVGQSPNSAPKAGLPGATGPMAVRPEEAVRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EAKVKRAIPKPPRQALNRKKGSPGLASGSVGQSPNSAPKAGLPGATGPMAVRPEEAVRGL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD GAGTESSRRAQEPVSGCGSPEQDPQKQAEEERQEEPEYENVVPISRPPEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GAGTESSRRAQEPVSGCGSPEQDPQKQAEEERQEEPEYENVVPISRPPEP
790 800 810 820 830
>>NP_663325 (OMIM: 607873) scavenger receptor class F me (569 aa)
initn: 4607 init1: 4021 opt: 4021 Z-score: 2115.7 bits: 401.9 E(85289): 4.2e-111
Smith-Waterman score: 4021; 99.0% identity (99.4% similar) in 501 aa overlap (1-501:1-501)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGLGLLLPLLLLWTRGTQGSELDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 MGLGLLLPLLLLWTRGTQGSELDPKGQHVCVASSPSAELQCCAGWRQKDQECTIPICEGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 DACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYWGPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD QADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 QADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWWSSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 CKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWWGPECQQQCECVRGRCSAASGECTCP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 PGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCSPDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 TFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLGPRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 GSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCSVPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TALIVGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGST
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_663 TALIAGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWGTLTSLGST
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEPPSAGWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCV
:::::::::::::::.: :
NP_663 LPCRSLSSHKLPWVTASSSRPLPAGPLMTPSHPILSLERQMRFLPTVCHPKKGWSLWPRQ
490 500 510 520 530 540
>>NP_699165 (OMIM: 600920,613619) scavenger receptor cla (871 aa)
initn: 1779 init1: 1221 opt: 2271 Z-score: 1202.7 bits: 233.6 E(85289): 3e-60
Smith-Waterman score: 2322; 40.3% identity (61.8% similar) in 856 aa overlap (6-828:28-852)
10 20 30
pF1KSD MGLGLLLPLLLLWT--RGTQGSELDPKGQHVCVASSPS
:: ::::: . .::.:.:..:: : :.
NP_699 MEGAGPRGAGPARRRGAGGPPSPLLPSLLLLLLLWMLPDTVAPQELNPRGRNVCRA--PG
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KSD AELQ-CCAGWRQKDQECTIPICEGPDACQKDEVCVKPGLCRCKPGFFGAHCSSRCPGQYW
... :::::::. .:: : .::: ..:...::::.:: :::. :.:::.:...:: :.:
NP_699 SQVPTCCAGWRQQGDECGIAVCEGNSTCSENEVCVRPGECRCRHGYFGANCDTKCPRQFW
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GPDCRESCPCHPHGQCEPATGACQCQADRWGARCEFPCACGPHGRCDPATGVCHCEPGWW
::::.: : :::::::: .:: : :.: ::::::: : : :: : : .:.:.::::::
NP_699 GPDCKELCSCHPHGQCEDVTGQCTCHARRWGARCEHACQC-QHGTCHPRSGACRCEPGWW
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SSTCRRPCQCNTAAARCEQATGACVCKPGWWGRRCSFRCNCHGSPCEQDSGRCACRPGWW
.. : : : .:..::. ::::.:. ::::: :. .: :..:::::.:::: :: .
NP_699 GAQCASACYC-SATSRCDPQTGACLCHAGWWGRSCNNQCACNSSPCEQQSGRCQCRERTF
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GPECQQQCECVRGRCSAASGECTCPPGFRGARCELPCPAGSHGVQCAHSCGRCKHNEPCS
: .:.. :.: :::: ..: :.: ::.:: :. ::::: .:. : . ::.:: ..::.
NP_699 GARCDRYCQCFRGRCHPVDGTCACEPGYRGKYCREPCPAGFYGLGCRRRCGQCKGQQPCT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PDTGSCESCEPGWNGTQCQQPCLPGTFGESCEQQCPHCRHGEACEPDTGHCQRCDPGWLG
: : .::::::::.:.::: : .::.: ..:: :: :.::. ::.: ::. ::.:
NP_699 VAEGRCLTCEPGWNGTKCDQPCATGFYGEGCSHRCPPCRDGHACNHVTGKCTRCNAGWIG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD PRCEDPCPTGTFGEDCGSTCPTCVQGSCDTVTGDCVCSAGYWGPSCNASCPAGFHGNNCS
::: : .::.::::. .: : .: :: .: :.:: : :: ::..:: :.:: .:.
NP_699 DRCETKCSNGTYGEDCAFVCADCGSGHCDFQSGRCLCSPGVHGPHCNVTCPPGLHGADCA
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VPCECPEGLCHPVSGSCQPGSGSRDTALIVGSLVPLLL-LFLGLACCACCCWAPRSDLKD
: : : : ::.:.:. ...: .. .:.:. ::. :.:.: : : : . .
NP_699 QACSCHEDTCDPVTGACHLETNQRKGVMGAGALLVLLVCLLLSLLGCCCACRGKDPTRRP
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD RPARDGATVSRMKL--QVWGTLTSLGSTLPCRSLSSHKLPWVTVSHHDPEVPFNHSFIEP
:: :. ...: : .. : .. .. :: : .::: :.:.::: . .: ::.::
NP_699 RPRRE-LSLGRKKAPHRLCGRFSRISMKLPRIPLRRQKLPKVVVAHHDLDNTLNCSFLEP
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KSD PSA------GWATDDSFSSDPESGEADEVPAYCVP----PQEGMVPVAQAGSSEASLAAG
::. .:.. :::: .:: :.:::: : :. : . . .:: : .
NP_699 PSGLEQPSPSWSSRASFSS---FDTTDEGPVYCVPHEEAPAESRDPEVPTVPAEAP-APS
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KSD AFPPPEDASTPFAIPRTSSLARAKRPSVSFAEGTKFAPQSRRSSGELSSPLRKPKRLSRG
: ::. ::: .: . ..: :.: .:: : .: . : . : : : :
NP_699 PVPLTTPASAEEAIPLPAS-SDSER-SASSVEGPGGALYARVARRE-ARPARA--RGEIG
600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KSD AQSGPEGREAEESTGPDEAEAPESFPAAASPGDSATGH--RWPPLGSRTVAEHVEAIEGS
. : . : .. :: : :. .. . .:.:. :: ::... . .
NP_699 GLSLSPSPERRKPPPPDPATKPKVSWIHGKHSAAAAGRAPSPPPPGSEAAPSPSKRKRTP
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KSD VQESSGPVTTIYMLAGKPRGSEGPVRSVFRHFGSFQKGQAEAKVKRAIPKPPRQALNRKK
..:. : :.:: . : : : . : :.::: : : .
NP_699 SDKSAHTVEH-----GSPRTRDPTPRP---------PGLPEEATALAAPSPPR-ARARGR
710 720 730 740 750
750 760 770 780
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: ::: . .: : :::.:. : : : .. : : :. . : : ....
NP_699 G-PGLLEPTDAGGPPRSAPEAASMLAAELRGKTRSLG-RAEVALGAQGPREKPAPPQKAK
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790 800 810 820 830
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:. :.: .: :. . : :. .::..::
NP_699 RSVPPASPARAPPATETPGPEKAATDLPAPETPRKKTPIQKPPRKKSREAAGELGRAGAP
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NP_699 TL
870
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10 20 30
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:: ::::: . .::.:.:..:: : :.
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40 50 60 70 80 90
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... :::::::. .:: : .::: ..:...::::.:: :::. :.:::.:...:: :.:
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::::.: : :::::::: .:: : :.: ::::::: : : :: : : .:.:.::::::
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160 170 180 190 200 210
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.. : : : .:..::. ::::.:. ::::: :. .: :..:::::.:::: :: .
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220 230 240 250 260 270
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: .:.. :.: :::: ..: :.: ::.:: :. ::::: .:. : . ::.:: ..::.
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: : .::::::::.:.::: : .::.: ..:: :: :.::. ::.: ::. ::.:
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::: : .::.::::. .: : .: :: .: :.:: : :: ::..:: :.:: .:.
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: : : : ::.:.:. ...: .. .:.:. ::. .: :. .::: : :. ::
NP_878 QACSCHEDTCDPVTGACHLETNQRKGVMGAGALLVLLVCLL-LSLLGCCC-ACRG--KD-
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:.: ...: : .. : .. .. :: : .::: :.:.::: . .: ::.:::
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:. .:.. :::: .:: :.:::: : :. : . . .:: : .
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: ::. ::: .: . ..: :.: .:: : .: . : . : : : :.
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: . : .. :: : :. .. . .:.:. :: ::... . .
NP_878 LSLSPSPERRKPPPPDPATKPKVSWIHGKHSAAAAGRAPSPPPPGSEAAPSPSKRKRTPS
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pF1KSD QESSGPVTTIYMLAGKPRGSEGPVRSVFRHFGSFQKGQAEAKVKRAIPKPPRQALNRKKG
..:. : :.:: . : : : . : :.::: : : .:
NP_878 DKSAHTVEH-----GSPRTRDPTPRP---------PGLPEEATALAAPSPPR-ARARGRG
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::: . .: : :::.:. : : : .. : : :. . : : ....:
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. :.: .: :. . : :. .::..::
NP_878 SVPPASPARAPPATETPGPEKAATDLPAPETPRKKTPIQKPPRKKSREAAGELGRAGAPT
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NP_878 L
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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: : : : ::.:.:. ...: .. .:.:. ::. :.:.: : : : . .
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::: :::. .:: :.: : : ::. : :. : :.:.:.::.:.:
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:::. . :.. :: :.. . :. .::::.:.::: :..:.
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: .:. .: :::. :.: :. :. :: :. :: ::.:..:. :: : ..
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XP_016 FPGWIGKDCSQACPPGFWGPACFHACSCHNGASCSAEDGACHCTPGWTGLFCTQRCPAAF
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>--
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XP_016 CLPGFSGALCNQVCAGGYFGQDCAQLCSCANNGTCSPIDGSCQ-CFPGWIGKDCSQACPP
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: .: .: . : :..: .: . : :. : ::: : : . ::.. ::.::: .: :
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.: ::: ..: :.: .:. : :. : : : .:. ::: .. : :.:.: .::
XP_016 NGASCDHISGKCTCRTGFTGQHCEQRCAPGTFGYGCQQLCECMNNSTCDHVTGTCYCSPG
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pF1KSD -SGSR--DTALIVGSLVPLLLLFLGLACCACCCWAPRSDLKDRPARDGATVSRMKLQVWG
.: : ..::.. : :
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