Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0154
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0154, 690 aa
1>>>pF1KSDA0154 690 - 690 aa - 690 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7192+/-0.000948; mu= -2.7570+/- 0.057
mean_var=320.1043+/-67.038, 0's: 0 Z-trim(115.6): 29 B-trim: 414 in 1/53
Lambda= 0.071685
statistics sampled from 16163 (16186) to 16163 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.497), width: 16
Scan time: 3.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11716.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 690) 4563 485.6 9.9e-137
CCDS54164.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 651) 4110 438.8 1.2e-122
CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 723) 4110 438.8 1.3e-122
CCDS58597.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 ( 592) 3739 400.4 4e-111
CCDS10611.1 GGA2 gene_id:23062|Hs108|chr16 ( 613) 769 93.2 1.2e-18
CCDS54526.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 ( 566) 742 90.4 7.7e-18
CCDS13951.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 ( 639) 742 90.5 8.5e-18
CCDS33643.1 GGA1 gene_id:26088|Hs108|chr22 ( 552) 737 89.9 1.1e-17
>>CCDS11716.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 (690 aa)
initn: 4563 init1: 4563 opt: 4563 Z-score: 2568.2 bits: 485.6 E(32554): 9.9e-137
Smith-Waterman score: 4563; 100.0% identity (100.0% similar) in 690 aa overlap (1-690:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDND
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLR
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KSD YKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
670 680 690
>>CCDS54164.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 (651 aa)
initn: 4110 init1: 4110 opt: 4110 Z-score: 2315.4 bits: 438.8 E(32554): 1.2e-122
Smith-Waterman score: 4110; 100.0% identity (100.0% similar) in 623 aa overlap (68-690:29-651)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD KELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAK
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KSD IKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDL
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KSD QEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKE
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLT
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRS
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFF
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KSD SPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAP
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPL
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRIL
480 490 500 510 520 530
580 590 600 610 620 630
pF1KSD FHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPI
540 550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KSD QPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
600 610 620 630 640 650
>>CCDS11717.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 (723 aa)
initn: 4110 init1: 4110 opt: 4110 Z-score: 2314.7 bits: 438.8 E(32554): 1.3e-122
Smith-Waterman score: 4480; 95.4% identity (95.4% similar) in 722 aa overlap (2-690:2-723)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEW
10 20 30 40 50 60
70 80
pF1KSD EALQALT---------------------------------YLGDRVSEKVKTKVIELLYS
::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS11 EALQALTVLEACMKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYS
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KSD WTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAK
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KSD LLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDS
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KSD SDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQ
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD VINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPP
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD QASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD QREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAG
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD SSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPL
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KSD IPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVT
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KSD AYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPS
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KSD GTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQW
670 680 690 700 710 720
690
pF1KSD GNL
:::
CCDS11 GNL
>>CCDS58597.1 GGA3 gene_id:23163|Hs108|chr17 (592 aa)
initn: 3817 init1: 3739 opt: 3739 Z-score: 2108.6 bits: 400.4 E(32554): 4e-111
Smith-Waterman score: 3739; 99.6% identity (100.0% similar) in 568 aa overlap (90-657:1-568)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD WEALQALTYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPV
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVT
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDN
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAEL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDE
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ELLCLGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAP
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SSSSSQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVAPALAPKVEPAVPGHHGLALGNSA
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGS
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSML
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:
CCDS58 NTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKKQVLS
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690
pF1KSD RYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
CCDS58 FLGKACLQPWGQAILLTTSCLA
580 590
>>CCDS10611.1 GGA2 gene_id:23062|Hs108|chr16 (613 aa)
initn: 1200 init1: 664 opt: 769 Z-score: 448.3 bits: 93.2 E(32554): 1.2e-18
Smith-Waterman score: 1275; 37.8% identity (58.0% similar) in 722 aa overlap (8-688:25-611)
10 20 30 40
pF1KSD MAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGP
::: ::::::.:: ..:: : .::.:.: . .::
CCDS10 MAATAVAAAVAGTESAQGPPGPAASLELWLNKATDPSMSEQDWSAIQNFCEQVNTDPNGP
10 20 30 40 50 60
50 60 70
pF1KSD QIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALT---------------------------------YLG
: ::::::::::: ::: ::: :::
CCDS10 THAPWLLAHKIQSPQEKEALYALTVLEMCMNHCGEKFHSEVAKFRFLNELIKVLSPKYLG
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KSD DRVSEKVKTKVIELLYSWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPR
. .. ::: .:::.:.:::. .::. ::.:::.:::.:::...:: .:::. : : : :
CCDS10 SWATGKVKGRVIEILFSWTVWFPEDIKIRDAYQMLKKQGIIKQDPKLPVDKIL-PPPSPW
130 140 150 160 170
140 150 160 170 180
pF1KSD PKNPVFD-DEEKSKLLAKLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVN
::. .:: ::::::::..::::..:.::: ::.:::..:::.. . .::.::. ..:::
CCDS10 PKSSIFDADEEKSKLLTRLLKSNHPEDLQAANRLIKNLVKEEQEKSEKVSKRVSAVEEVR
180 190 200 210 220 230
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRELMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQA
..:..:.::: : . .. :.: .. ....::. : :::.:::.: :.:..:..::::
CCDS10 SHVKVLQEMLSMYRRPGQAPPDQEALQVVYERCEKLRPTLFRLASDTTDDDDALAEILQA
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SDNLSRVINSYKTIIEGQVINGEVATLTLPDS------EGNSQCSNQGTLIDLAELDTTN
.: :.. . :: ..::.: :. .: .: : .. . : . :::: :.:
CCDS10 NDLLTQGVLLYKQVMEGRVTFGNRVTSSLGDIPVSRVFQNPAGCMKTCPLIDL-EVD---
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSRSSSQAEATLGPSSTSNALSWLDEELLC
.:: . .:. :: : ..:
CCDS10 --------------------------NGPAQM-------GTVVPS-------LLHQDLAA
360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LGLADPAPNVPPKESAGNSQWHLLQREQSDLDFFSPRPGTAACGASDAPLLQPSAPSSSS
::..: :: .: . : : . ::::.
CCDS10 LGISD-AP------VTGMVS------------------GQNCCE-------EKRNPSSST
380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SQAPLPPPFPAPVVPASVPAPSAGSSLFSTGVA-PALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHH
:: ..: ::: .:.. : :: :
CCDS10 ----LPG--------GGVQNPSADRNLLDLLSAQPAPCP---------------------
410 420 430
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pF1KSD LDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARPLLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPK
:. ..: .. .: : . : . .:: .: : .::..:
CCDS10 LNYVSQ-------------KSVPKEVPPGTKSSPGWSWEAGPLAP-----SPSSQNTP--
440 450 460 470
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRILFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTA
::.. :::::.:::: :. .::.::::::.::.. ::.:.: :....:..::
CCDS10 -----LAQVFVPLESVKPSSLPPLIVYDRNGFRILLHFSQTGAPGHPEVQVLLLTMMSTA
480 490 500 510 520
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pF1KSD PLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYK
: :: .:..:.::::::.::::: :...: :::..:::.:.:..:: :: :: .:::::
CCDS10 PQPVWDIMFQVAVPKSMRVKLQPASSSKLPAFSPLMPPAVISQMLLLDNPHKEPIRLRYK
530 540 550 560 570 580
670 680 690
pF1KSD LTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
::: : : .::::: .:: . :
CCDS10 LTFNQGGQPFSEVGEVKDFPDLAVLGAA
590 600 610
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40 50 60 70 80 90
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:::.:.:::::.:..:::::::..::::.:
CCDS54 MKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGSRTSEKVKNKILELLYSWTVGLPEEVK
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pF1KSD IKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLAKLLKSKNPDDL
: .::.:::.::::.::: .: : : .: ::::::: .:.::::::.::.::::..:.::
CCDS54 IAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPPRPKNVIFEDEEKSKMLARLLKSSHPEDL
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pF1KSD QEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQEDSSDGDRE-LMK
. :::::: ::.::. :..:..::....:::::::.::.::.. .:: .. :. : :::
CCDS54 RAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGGAAAGSSEDLMK
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::...:: : :::.:::.:::::..:..::::.:::..::: :: ...:. .::....
CCDS54 ELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQANDNLTQVINLYKQLVRGEEVNGDATAG
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pF1KSD TLPDSEGNSQCSNQGTLIDLAELDTTNSLSSVLAPAPTPPSSGIPILPPPPQASGPPRSR
..: : ..:.::. :: : :: : : .: .:
CCDS54 SIPGST--------SALLDLSGLD--------LPPAGTT----YPAMP----------TR
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340 350 360 370 380 390
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. :: .: . : ..: ::.::. :::.::.: : : .. :. .:
CCDS54 PGEQA----SPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTP--PSGPSLDGTGWNSFQ--------
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.::: .: ::. . ::: : :. .:.:: :. ..: :
CCDS54 -----------SSDA--TEPPAPALA--QAPSMESRP-PA-QTSLPASSGLDDLDLLG--
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pF1KSD PALAPKVEPAVPGHHGLALGNSALHHLDALDQLLEEAKVTSGLVKPTTSPLIPTTTPARP
.: . : : . . .. .: .: .... :. . .:: :. :..:
CCDS54 KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSSSCSSPSSSATS-LLHTVSPE--
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pF1KSD LLPFSTGPGSPLFQPLSFQSQGSPPKGPELSLASIHVPLESIKPSSALPVTAYDKNGFRI
: : ::. : ::::::: :::::::::. ::::.::..::::
CCDS54 -------PPRPPQQPV-------PT---ELSLASITVPLESIKPSNILPVTVYDQHGFRI
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pF1KSD LFHFAKECPPGRPDVLVVVVSMLNTAPLPVKSIVLQAAVPKSMKVKLQPPSGTELSPFSP
:::::.. ::: ::::::::::.::: :...::.:.:::: ::::::::::::: :.:
CCDS54 LFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQPPSGTELPAFNP
460 470 480 490 500 510
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pF1KSD IQPPAAITQVMLLANPLKEKVRLRYKLTFALGEQLSTEVGEVDQFPPVEQWGNL
: :.:::::.::::: ::::::::::::..:.: .:.:.:::::: : ::.:
CCDS54 IVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPETWGSL
520 530 540 550 560
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: :.::. .:.:::: :.. :: : :::.:.:...::: .:.::::::::::::
CCDS13 MEPAMEPETLEARINRATNPLNKELDWASINGFCEQLNEDFEGPPLATRLLAHKIQSPQE
10 20 30 40 50 60
60 70 80
pF1KSD WEALQALT---------------------------------YLGDRVSEKVKTKVIELLY
:::.:::: :::.:.:::::.:..::::
CCDS13 WEAIQALTVLETCMKSCGKRFHDEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGSRTSEKVKNKILELLY
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90 100 110 120 130 140
pF1KSD SWTMALPEEAKIKDAYHMLKRQGIVQSDPPIPVDRTLIPSPPPRPKNPVFDDEEKSKLLA
:::..::::.:: .::.:::.::::.::: .: : : .: ::::::: .:.::::::.::
CCDS13 SWTVGLPEEVKIAEAYQMLKKQGIVKSDPKLP-DDTTFPLPPPRPKNVIFEDEEKSKMLA
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150 160 170 180 190 200
pF1KSD KLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQED
.::::..:.::. :::::: ::.::. :..:..::....:::::::.::.::.. .::
CCDS13 RLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGG
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210 220 230 240 250 260
pF1KSD SSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIE
.. :. : :::::...:: : :::.:::.:::::..:..::::.:::..::: :: ...
CCDS13 AAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALAEILQANDNLTQVINLYKQLVR
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270 280 290 300 310 320
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:. .::.... ..: : . .:.::. :: : :: : : .:
CCDS13 GEEVNGDATAGSIPGSTS--------ALLDLSGLD--------LPPAGTT----YPAMP-
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.: . :: .: . : ..: ::.::. :::.::.: : : .. :.
CCDS13 ---------TRPGEQA----SPEQPSASVSLLDDELMSLGLSDPTP--PSGPSLDGTGWN
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.: .::: .: ::. .::: : :. .:.:: :
CCDS13 SFQ-------------------SSDA--TEPPAPAL--AQAPSMESRP-PA-QTSLPASS
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. ..: : .: . : : . . .. .: .: .... :. . .::
CCDS13 GLDDLDLLG--KTLLQQSLP--PESQQVRWEKQQPTPRLTLRDLQNKSSSCSSPSSSATS
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:. :..: : : ::. : ::::::: :::::::::. ::
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::.::..:::::::::.. ::: ::::::::::.::: :...::.:.:::: :::::::
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:::::: :.:: :.:::::.::::: ::::::::::::..:.: .:.:.:::::: :
CCDS13 PSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPE
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690
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::.:
CCDS13 TWGSL
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:::.:::: :::.:.:::::.:..::::
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pF1KSD KLLKSKNPDDLQEANKLIKSMVKEDEARIQKVTKRLHTLEEVNNNVRLLSEMLLHYSQED
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CCDS33 RLLKSSHPEDLRAANKLIKEMVQEDQKRMEKISKRVNAIEEVNNNVKLLTEMVMSHSQGG
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210 220 230 240 250 260
pF1KSD SSDGDRE-LMKELFDQCENKRRTLFKLASETEDNDNSLGDILQASDNLSRVINSYKTIIE
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CCDS33 AAAGSSEDLMKELYQRCERMRPTLFRLASDTEDNDEALG----LSD---------PTPPS
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: :. .:.. : :.. :.:. . .:: ::. : :
CCDS33 G------------PSLDGTGWNSFQSS-------DATEPPAPALAQAPSMESR------P
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...: : : . : :: .. : :: :. :
CCDS33 --EKQQ-------PTPRLT---LRD---LQNKSSSCSS------------------PSSS
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: .: :: :.:
CCDS33 A------------------------------TSLLH---------------------TVS
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CCDS33 P-----EPPRP-------PQQPV-----------PT---ELSLASITVPLESIKPSNILP
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CCDS33 VTVYDQHGFRILFHFARDPLPGRSDVLVVVVSMLSTAPQPIRNIVFQSAVPKVMKVKLQP
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CCDS33 PSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQKEKVRLRYKLTFTMGDQTYNEMGDVDQFPPPE
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::.:
CCDS33 TWGSL
550
690 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 00:18:45 2016 done: Thu Nov 3 00:18:45 2016
Total Scan time: 3.860 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]