Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0158
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0158, 361 aa
1>>>pF1KSDA0158 361 - 361 aa - 361 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2224+/- 0.001; mu= 12.3023+/- 0.060
mean_var=101.1105+/-20.449, 0's: 0 Z-trim(107.5): 47 B-trim: 340 in 2/49
Lambda= 0.127549
statistics sampled from 9557 (9601) to 9557 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 2.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2548.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 361) 2393 450.9 7.7e-127
CCDS74682.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 396) 2393 451.0 8.3e-127
CCDS63195.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 ( 371) 1921 364.1 1.1e-100
CCDS11609.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 459) 1385 265.5 6.4e-71
CCDS56041.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 470) 1385 265.5 6.5e-71
CCDS11610.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 478) 1385 265.5 6.6e-71
CCDS58582.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 493) 1385 265.5 6.8e-71
CCDS13764.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 ( 369) 1359 260.7 1.5e-69
CCDS10678.3 SEPT1 gene_id:1731|Hs108|chr16 ( 414) 1262 242.8 3.8e-64
CCDS58581.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 331) 1236 238.0 8.8e-63
CCDS56224.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 ( 346) 1177 227.2 1.7e-59
CCDS75582.1 SEPT7 gene_id:989|Hs108|chr7 ( 401) 1095 212.1 6.7e-55
CCDS45795.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 335) 981 191.1 1.2e-48
CCDS74166.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 362) 981 191.1 1.3e-48
CCDS45793.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 422) 981 191.1 1.4e-48
CCDS45794.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 474) 981 191.2 1.6e-48
CCDS14027.2 SEPT3 gene_id:55964|Hs108|chr22 ( 350) 979 190.7 1.6e-48
CCDS14026.2 SEPT3 gene_id:55964|Hs108|chr22 ( 358) 979 190.7 1.6e-48
CCDS77122.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 567) 981 191.2 1.8e-48
CCDS45791.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 568) 981 191.2 1.8e-48
CCDS45792.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 579) 981 191.2 1.8e-48
CCDS45790.1 SEPT9 gene_id:10801|Hs108|chr17 ( 586) 981 191.2 1.9e-48
CCDS10522.1 SEPT12 gene_id:124404|Hs108|chr16 ( 358) 903 176.7 2.6e-44
CCDS43360.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 429) 859 168.7 8.3e-42
CCDS43359.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 442) 859 168.7 8.5e-42
CCDS43358.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 483) 859 168.7 9.1e-42
CCDS34018.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 ( 429) 845 166.1 5e-41
CCDS77931.1 SEPT11 gene_id:55752|Hs108|chr4 ( 439) 845 166.1 5e-41
CCDS75298.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 440) 843 165.8 6.5e-41
CCDS14585.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 427) 841 165.4 8.2e-41
CCDS14583.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 429) 841 165.4 8.2e-41
CCDS14584.1 SEPT6 gene_id:23157|Hs108|chrX ( 434) 841 165.4 8.3e-41
CCDS5519.2 SEPT14 gene_id:346288|Hs108|chr7 ( 432) 820 161.5 1.2e-39
CCDS42726.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 431) 819 161.3 1.4e-39
CCDS82496.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 450) 819 161.4 1.4e-39
CCDS46383.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 454) 819 161.4 1.4e-39
CCDS82497.1 SEPT10 gene_id:151011|Hs108|chr2 ( 544) 819 161.4 1.6e-39
CCDS45743.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 ( 274) 730 144.8 8.1e-35
CCDS47262.1 SEPT8 gene_id:23176|Hs108|chr5 ( 369) 705 140.3 2.5e-33
CCDS53987.1 SEPT12 gene_id:124404|Hs108|chr16 ( 312) 420 87.8 1.3e-17
>>CCDS2548.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 (361 aa)
initn: 2393 init1: 2393 opt: 2393 Z-score: 2390.7 bits: 450.9 E(32554): 7.7e-127
Smith-Waterman score: 2393; 100.0% identity (100.0% similar) in 361 aa overlap (1-361:1-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIIS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 YIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 IAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 GSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHH
310 320 330 340 350 360
pF1KSD V
:
CCDS25 V
>>CCDS74682.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 (396 aa)
initn: 2393 init1: 2393 opt: 2393 Z-score: 2390.1 bits: 451.0 E(32554): 8.3e-127
Smith-Waterman score: 2393; 100.0% identity (100.0% similar) in 361 aa overlap (1-361:36-396)
10 20 30
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 EGRATRPCLRVPSARRGDEGLHQRDEASQKMSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRK
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD SVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD YFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKI
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD YHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD NDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NDFLKLRTMLITHMQDLQEVTQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELR
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KSD RMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
370 380 390
>>CCDS63195.1 SEPT2 gene_id:4735|Hs108|chr2 (371 aa)
initn: 2379 init1: 1920 opt: 1921 Z-score: 1921.1 bits: 364.1 E(32554): 1.1e-100
Smith-Waterman score: 2363; 97.3% identity (97.3% similar) in 371 aa overlap (1-361:1-371)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD DLYPERVIPGAA----------EKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAIN
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 DLYPERVIPGAAALNTRKTLLWEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAIN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD CRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 CRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD IHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 IHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLITHMQDLQEV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 TQDLHYENFRSERLKRGGRKVENEDMNKDQILLEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGG
310 320 330 340 350 360
360
pF1KSD DGDGGALGHHV
:::::::::::
CCDS63 DGDGGALGHHV
370
>>CCDS11609.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (459 aa)
initn: 1451 init1: 1284 opt: 1385 Z-score: 1386.7 bits: 265.5 E(32554): 6.4e-71
Smith-Waterman score: 1427; 61.1% identity (81.8% similar) in 352 aa overlap (17-344:105-456)
10 20 30 40
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGES
:::::.::::::::::::::.:::::.:::
CCDS11 CAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGES
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYG
:::::::.::::::::: .: . :: :.: .::.: .:.:::.::.::::.:::::.:
CCDS11 GLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFG
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVA
::.: .:.: . :::.:::.:..:::::::..: :::::::.::::::::::.::::
CCDS11 DAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVE
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210 220
pF1KSD FMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKE
::::.:..:::::..::::::: : .. :..: .:::. .::::..:: .::::::::
CCDS11 FMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKL
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THMQ
: . :: ::::.:.::: ..::.:..:::::::::.:::::: : ::.::::::. ::::
CCDS11 QDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQ
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320
pF1KSD DLQEVTQDLHYENFRSE------RL---KRGGRKVENE--------------DMNKDQIL
::..::.. ::::.:.. :: .:. :. : : . ....
CCDS11 DLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVPPGTDPETEKLI
380 390 400 410 420 430
330 340 350 360
pF1KSD LEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
::. ::::::::. ..: ::.
CCDS11 REKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
440 450
>>CCDS56041.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (470 aa)
initn: 1451 init1: 1284 opt: 1385 Z-score: 1386.6 bits: 265.5 E(32554): 6.5e-71
Smith-Waterman score: 1427; 61.1% identity (81.8% similar) in 352 aa overlap (17-344:116-467)
10 20 30 40
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGES
:::::.::::::::::::::.:::::.:::
CCDS56 CAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGES
90 100 110 120 130 140
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYG
:::::::.::::::::: .: . :: :.: .::.: .:.:::.::.::::.:::::.:
CCDS56 GLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFG
150 160 170 180 190 200
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVA
::.: .:.: . :::.:::.:..:::::::..: :::::::.::::::::::.::::
CCDS56 DAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVE
210 220 230 240 250 260
170 180 190 200 210 220
pF1KSD FMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKE
::::.:..:::::..::::::: : .. :..: .:::. .::::..:: .::::::::
CCDS56 FMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKL
270 280 290 300 310 320
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THMQ
: . :: ::::.:.::: ..::.:..:::::::::.:::::: : ::.::::::. ::::
CCDS56 QDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQ
330 340 350 360 370 380
290 300 310 320
pF1KSD DLQEVTQDLHYENFRSE------RL---KRGGRKVENE--------------DMNKDQIL
::..::.. ::::.:.. :: .:. :. : : . ....
CCDS56 DLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVPPGTDPETEKLI
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360
pF1KSD LEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
::. ::::::::. ..: ::.
CCDS56 REKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
450 460 470
>>CCDS11610.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (478 aa)
initn: 1451 init1: 1284 opt: 1385 Z-score: 1386.5 bits: 265.5 E(32554): 6.6e-71
Smith-Waterman score: 1427; 61.1% identity (81.8% similar) in 352 aa overlap (17-344:124-475)
10 20 30 40
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGES
:::::.::::::::::::::.:::::.:::
CCDS11 CAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGES
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYG
:::::::.::::::::: .: . :: :.: .::.: .:.:::.::.::::.:::::.:
CCDS11 GLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFG
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVA
::.: .:.: . :::.:::.:..:::::::..: :::::::.::::::::::.::::
CCDS11 DAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVE
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KSD FMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKE
::::.:..:::::..::::::: : .. :..: .:::. .::::..:: .::::::::
CCDS11 FMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKL
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THMQ
: . :: ::::.:.::: ..::.:..:::::::::.:::::: : ::.::::::. ::::
CCDS11 QDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQ
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320
pF1KSD DLQEVTQDLHYENFRSE------RL---KRGGRKVENE--------------DMNKDQIL
::..::.. ::::.:.. :: .:. :. : : . ....
CCDS11 DLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVPPGTDPETEKLI
400 410 420 430 440 450
330 340 350 360
pF1KSD LEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
::. ::::::::. ..: ::.
CCDS11 REKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
460 470
>>CCDS58582.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (493 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGES
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CCDS58 CAPAPLSPSARPRSPWGKLDPYDSSEDDKEYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGES
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50 60 70 80 90 100
pF1KSD GLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYG
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CCDS58 GLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLGAEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFG
170 180 190 200 210 220
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVA
::.: .:.: . :::.:::.:..:::::::..: :::::::.::::::::::.::::
CCDS58 DAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVE
230 240 250 260 270 280
170 180 190 200 210 220
pF1KSD FMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKE
::::.:..:::::..::::::: : .. :..: .:::. .::::..:: .::::::::
CCDS58 FMKALHQRVNIVPILAKADTLTPPEVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKL
290 300 310 320 330 340
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THMQ
: . :: ::::.:.::: ..::.:..:::::::::.:::::: : ::.::::::. ::::
CCDS58 QDQALKESIPFAVIGSNTVVEARGRRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQ
350 360 370 380 390 400
290 300 310 320
pF1KSD DLQEVTQDLHYENFRSE------RL---KRGGRKVENE--------------DMNKDQIL
::..::.. ::::.:.. :: .:. :. : : . ....
CCDS58 DLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTRLVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVPPGTDPETEKLI
410 420 430 440 450 460
330 340 350 360
pF1KSD LEKEAELRRMQEMIARMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
::. ::::::::. ..: ::.
CCDS58 REKDEELRRMQEMLHKIQKQMKENY
470 480 490
>>CCDS13764.1 SEPT5 gene_id:5413|Hs108|chr22 (369 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTL
:::::.::::::::::::::.:::::.::::::::::
CCDS13 MSTGLRYKSKLATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHRKSVKKGFDFTLMVAGESGLGKSTL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD INSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRD
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CCDS13 VHSLFLTDLYKDRKLLSAEERISQTVEILKHTVDIEEKGVKLKLTIVDTPGFGDAVNNTE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD CFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHN
:.: : .:.:.:::.:..:::::::..: :::::::.::::::::::.:.::.::::.:.
CCDS13 CWKPITDYVDQQFEQYFRDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPVDVGFMKALHE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKEQTRLLKA
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CCDS13 KVNIVPLIAKADCLVPSEIRKLKERIREEIDKFGIHVYQFPECDSDEDEDFKQQDRELKE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SIPFSVVGSNQLIEAKGKKVRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THMQDLQEVTQ
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CCDS13 SAPFAVIGSNTVVEAKGQRVRGRLYPWGIVEVENQAHCDFVKLRNMLIRTHMHDLKDVTC
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KSD DLHYENFRSERLKRGGRKVENE---------------DMNKDQILLEKEAELRRMQEMIA
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CCDS13 DVHYENYRAHCIQQMTSKLTQDSRMESPIPILPLPTPDAETEKLIRMKDEELRRMQEMLQ
310 320 330 340 350 360
340 350 360
pF1KSD RMQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV
::. ::: :
CCDS13 RMKQQMQDQ
>>CCDS10678.3 SEPT1 gene_id:1731|Hs108|chr16 (414 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MSKQQPTQFINPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGES
::::: ::::.:::::::::.:::::.:::
CCDS10 VEAALSFLPHQRKWGETAGAVMAGGVMDKEYVGFAALPNQLHRKSVKKGFDFTLMVAGES
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KSD GLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPGAAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYG
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CCDS10 GLGKSTLINSLFLTNLYEDRQVPEASARLTQTLAIERRGVEIEEGGVKVKLTLVDTPGFG
90 100 110 120 130 140
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pF1KSD DAINCRDCFKTIISYIDEQFERYLHDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVA
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CCDS10 DSVDCSDCWLPVVKFIEEQFEQYLRDESGLNRKNIQDSRVHCCLYFISPFGRGLRPLDVA
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200 210 220
pF1KSD FMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLKERERLKKRILDEIEEHNIKIYHLPDAESDEDEDFKE
:..:.:.::::.:::.:::.: .: . ::..: :...:..:.::..:. .::::::::.
CCDS10 FLRAVHEKVNIIPVIGKADALMPQETQALKQKIRDQLKEEEIHIYQFPECDSDEDEDFKR
210 220 230 240 250 260
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QTRLLKASIPFSVVGSNQLIEAKGKK-VRGRLYPWGVVEVENPEHNDFLKLRTMLI-THM
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CCDS10 QDAEMKESIPFAVVGSCEVVRDGGNRPVRGRRYSWGTVEVENPHHCDFLNLRRMLVQTHL
270 280 290 300 310 320
290 300 310 320
pF1KSD QDLQEVTQDLHYENFRS---ERLKRGG-----------RKVENE---DM----NKDQILL
:::.:::.:: ::..:. . : : : :. .: : . ....
CCDS10 QDLKEVTHDLLYEGYRARCLQSLARPGARDRASRSKLSRQSATEIPLPMLPLADTEKLIR
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360
pF1KSD EKEAELRRMQEMIARMQAQMQM-QMQGGDGDGGALGHHV
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CCDS10 EKDEELRRMQEMLEKMQAQMQQSQAQGEQSDAL
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>>CCDS58581.1 SEPT4 gene_id:5414|Hs108|chr17 (331 aa)
initn: 1302 init1: 1135 opt: 1236 Z-score: 1240.6 bits: 238.0 E(32554): 8.8e-63
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20 30 40 50 60 70
pF1KSD NPETPGYVGFANLPNQVHRKSVKKGFEFTLMVVGESGLGKSTLINSLFLTDLYPERVIPG
::.::::::::::.::::::::: .: . :
CCDS58 MVAGESGLGKSTLVNSLFLTDLYRDRKLLG
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD AAEKIERTVQIEASTVEIEERGVKLRLTVVDTPGYGDAINCRDCFKTIISYIDEQFERYL
: :.: .::.: .:.:::.::.::::.:::::.:::.: .:.: . :::.:::.:.
CCDS58 AEERIMQTVEITKHAVDIEEKGVRLRLTIVDTPGFGDAVNNTECWKPVAEYIDQQFEQYF
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD HDESGLNRRHIIDNRVHCCFYFISPFGHGLKPLDVAFMKAIHNKVNIVPVIAKADTLTLK
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CCDS58 RDESGLNRKNIQDNRVHCCLYFISPFGHGLRPLDVEFMKALHQRVNIVPILAKADTLTPP
100 110 120 130 140 150
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CCDS58 EVDHKKRKIREEIEHFGIKIYQFPDCDSDEDEDFKLQDQALKESIPFAVIGSNTVVEARG
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CCDS58 RRVRGRLYPWGIVEVENPGHCDFVKLRTMLVRTHMQDLKDVTRETHYENYRAQCIQSMTR
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CCDS58 LVVKERNRNKLTRESGTDFPIPAVPPGTDPETEKLIREKDEELRRMQEMLHKIQKQMKEN
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD MQGGDGDGGALGHHV
CCDS58 Y
361 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 00:20:44 2016 done: Thu Nov 3 00:20:45 2016
Total Scan time: 2.350 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]