Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0167
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0167, 836 aa
1>>>pF1KSDA0167 836 - 836 aa - 836 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3257+/-0.00046; mu= -3.0632+/- 0.029
mean_var=291.0192+/-56.933, 0's: 0 Z-trim(120.4): 183 B-trim: 829 in 1/58
Lambda= 0.075182
statistics sampled from 35319 (35538) to 35319 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.417), width: 16
Scan time: 13.590
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK ( 836) 5455 606.0 2.3e-172
XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1172) 5121 569.9 2.4e-161
XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit ( 856) 3345 377.1 1.8e-103
NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, A (1192) 3011 341.0 1.9e-92
XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP wit (1192) 3011 341.0 1.9e-92
XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1098) 2531 288.9 8.3e-77
NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK ( 804) 1382 164.2 2.1e-39
XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 808) 1382 164.2 2.2e-39
XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1073) 1382 164.3 2.7e-39
NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 857) 1360 161.8 1.2e-38
XP_011508849 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1126) 1360 161.9 1.5e-38
XP_005250000 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 565) 1312 156.5 3.1e-37
XP_016867221 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 630) 1312 156.5 3.4e-37
XP_011514082 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 683) 1312 156.5 3.6e-37
NP_114152 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, ANK ( 911) 1312 156.6 4.6e-37
XP_006712298 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 882) 1280 153.2 4.9e-36
XP_006712297 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit ( 886) 1280 153.2 5e-36
XP_016858771 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1106) 1280 153.2 5.9e-36
XP_006712300 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1147) 1280 153.2 6e-36
XP_006712302 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP wit (1151) 1280 153.2 6.1e-36
XP_016867224 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 462) 1259 150.7 1.4e-35
XP_016867222 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 527) 1259 150.7 1.6e-35
NP_001268229 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 580) 1259 150.7 1.7e-35
XP_016867223 (OMIM: 616813) PREDICTED: arf-GAP wit ( 580) 1259 150.7 1.7e-35
NP_001231817 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, A ( 405) 1194 143.6 1.7e-33
NP_001036000 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 396) 1085 131.7 6.2e-30
NP_001295234 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 576) 992 121.8 9e-27
NP_001295233 (OMIM: 616813) arf-GAP with GTPase, A ( 343) 938 115.8 3.5e-25
XP_016857178 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 774) 423 60.2 4.3e-08
XP_016857177 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 793) 423 60.2 4.4e-08
XP_016857176 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 883) 423 60.2 4.7e-08
NP_001137250 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domai ( 894) 423 60.2 4.8e-08
NP_060177 (OMIM: 616594) arf-GAP with SH3 domain, ( 903) 423 60.2 4.8e-08
XP_016857175 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 905) 423 60.2 4.8e-08
XP_016857174 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 924) 423 60.2 4.9e-08
XP_011540057 (OMIM: 616594) PREDICTED: arf-GAP wit ( 926) 423 60.2 4.9e-08
XP_011510908 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 407 58.4 1.4e-07
XP_011510907 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 407 58.4 1.4e-07
XP_011510906 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 776) 407 58.4 1.4e-07
NP_036419 (OMIM: 607766) arf-GAP with coiled-coil, ( 778) 407 58.4 1.4e-07
XP_006713620 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 785) 407 58.4 1.4e-07
XP_016861538 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 806) 407 58.4 1.5e-07
XP_011510905 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 407 58.4 1.5e-07
XP_016861537 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 813) 407 58.4 1.5e-07
XP_011510904 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 820) 407 58.4 1.5e-07
XP_016861536 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 841) 407 58.5 1.5e-07
XP_016861535 (OMIM: 607766) PREDICTED: arf-GAP wit ( 848) 407 58.5 1.5e-07
XP_016868958 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1072) 401 57.9 2.9e-07
XP_016868957 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1073) 401 57.9 2.9e-07
XP_006716629 (OMIM: 605953) PREDICTED: arf-GAP wit (1075) 401 57.9 2.9e-07
>>NP_055585 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK repe (836 aa)
initn: 5455 init1: 5455 opt: 5455 Z-score: 3215.6 bits: 606.0 E(85289): 2.3e-172
Smith-Waterman score: 5455; 100.0% identity (100.0% similar) in 836 aa overlap (1-836:1-836)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830
pF1KSD QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
790 800 810 820 830
>>XP_005268682 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP with GT (1172 aa)
initn: 5119 init1: 5119 opt: 5121 Z-score: 3017.7 bits: 569.9 E(85289): 2.4e-161
Smith-Waterman score: 5121; 99.2% identity (99.5% similar) in 790 aa overlap (47-836:383-1172)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
: : . .::::::::::::::::::::::
XP_005 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
360 370 380 390 400 410
80 90 100 110 120 130
pF1KSD GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
420 430 440 450 460 470
140 150 160 170 180 190
pF1KSD DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
480 490 500 510 520 530
200 210 220 230 240 250
pF1KSD RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
540 550 560 570 580 590
260 270 280 290 300 310
pF1KSD TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
600 610 620 630 640 650
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
660 670 680 690 700 710
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
720 730 740 750 760 770
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
780 790 800 810 820 830
500 510 520 530 540 550
pF1KSD QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILAS
840 850 860 870 880 890
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGI
900 910 920 930 940 950
620 630 640 650 660 670
pF1KSD HRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERES
960 970 980 990 1000 1010
680 690 700 710 720 730
pF1KSD WIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
740 750 760 770 780 790
pF1KSD SPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
800 810 820 830
pF1KSD GSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
1140 1150 1160 1170
>>XP_005268683 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP with GT (856 aa)
initn: 5441 init1: 3345 opt: 3345 Z-score: 1978.6 bits: 377.1 E(85289): 1.8e-103
Smith-Waterman score: 5405; 97.7% identity (97.7% similar) in 856 aa overlap (1-836:1-856)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MHAQRQFVVAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AACKSLPSSPSHSAASTPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GSLHRAAKRRTSLFANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KSD LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAE--------------------EENF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
XP_005 LSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENF
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD EFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQA
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD IRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELT
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KSD LVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGR
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KSD QLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGAD
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KSD VAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRR
790 800 810 820 830 840
830
pF1KSD SSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::
XP_005 SSAASVGRADAPVALV
850
>>NP_001116244 (OMIM: 605476) arf-GAP with GTPase, ANK r (1192 aa)
initn: 5105 init1: 3009 opt: 3011 Z-score: 1780.8 bits: 341.0 E(85289): 1.9e-92
Smith-Waterman score: 5071; 96.8% identity (97.0% similar) in 810 aa overlap (47-836:383-1192)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
: : . .::::::::::::::::::::::
NP_001 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
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pF1KSD GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
420 430 440 450 460 470
140 150 160 170 180 190
pF1KSD DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
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200 210 220 230 240 250
pF1KSD RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
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260 270 280 290 300 310
pF1KSD TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
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320 330 340 350 360 370
pF1KSD RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
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380 390 400 410 420 430
pF1KSD SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
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440 450 460 470 480 490
pF1KSD TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
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500 510 520 530
pF1KSD QRRKKLTTPSKTEGSAGQAE--------------------EENFEFLIVSSTGQTWHFEA
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_001 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEA
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540 550 560 570 580 590
pF1KSD ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
900 910 920 930 940 950
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pF1KSD NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
960 970 980 990 1000 1010
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
720 730 740 750 760 770
pF1KSD LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
1140 1150 1160 1170 1180 1190
>>XP_016874261 (OMIM: 605476) PREDICTED: arf-GAP with GT (1192 aa)
initn: 5105 init1: 3009 opt: 3011 Z-score: 1780.8 bits: 341.0 E(85289): 1.9e-92
Smith-Waterman score: 5071; 96.8% identity (97.0% similar) in 810 aa overlap (47-836:383-1192)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD RRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
: : . .::::::::::::::::::::::
XP_016 TKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTLSRSIPELRLGVL
360 370 380 390 400 410
80 90 100 110 120 130
pF1KSD GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLVLIREEAGAPDAKFSGWA
420 430 440 450 460 470
140 150 160 170 180 190
pF1KSD DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARA
480 490 500 510 520 530
200 210 220 230 240 250
pF1KSD RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAAS
540 550 560 570 580 590
260 270 280 290 300 310
pF1KSD TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPVAGQASNGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFAN
600 610 620 630 640 650
320 330 340 350 360 370
pF1KSD RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHP
660 670 680 690 700 710
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPSASINGLVKDMSTVQMGEGLEAT
720 730 740 750 760 770
440 450 460 470 480 490
pF1KSD TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK
780 790 800 810 820 830
500 510 520 530
pF1KSD QRRKKLTTPSKTEGSAGQAE--------------------EENFEFLIVSSTGQTWHFEA
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_016 QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEA
840 850 860 870 880 890
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAP
900 910 920 930 940 950
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWE
960 970 980 990 1000 1010
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
720 730 740 750 760 770
pF1KSD LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYAR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
780 790 800 810 820 830
pF1KSD QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
1140 1150 1160 1170 1180 1190
>>XP_011508850 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (1098 aa)
initn: 2533 init1: 1774 opt: 2531 Z-score: 1499.9 bits: 288.9 E(85289): 8.3e-77
Smith-Waterman score: 2731; 55.7% identity (79.1% similar) in 790 aa overlap (40-804:304-1079)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD AAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSI--REAVINSQEWTLSRS
: ..: :.:. :.: .::::::::::
XP_011 RRDGGPGGGPSPRSGASRPRGYFSLRRAPAEAHSSSAESIDGSPRRDAFVNSQEWTLSRS
280 290 300 310 320 330
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESE----QYKKEMLVDGQTHLVLIRE
.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.:::.
XP_011 VPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEDMDAGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRD
340 350 360 370 380 390
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRI
:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. .. . :.:::::: :
XP_011 EGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGTQDAI
400 410 420 430 440 450
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAA
:...:::. ::::: : :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.::: ..
XP_011 SSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGP
460 470 480 490 500 510
250 260 270 280 290
pF1KSD CKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAG
:::::.:::::.. :. :.. :.:::: . ::::::.::.:.....::: .. .:
XP_011 CKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTA-
520 530 540 550 560 570
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNS
.:: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... ::::::::::..::::::.:
XP_011 -NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
580 590 600 610 620
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGP-
:::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::: :: .:
XP_011 LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
630 640 650 660 670 680
420 430 440 450 460
pF1KSD -SASINGLVKDMSTVQMGE----GL-EATTPMPSPSPSPS-SLQPPPDQTSKHLLKPDRN
: . ::: ::::..... :: ... :: : . : .:.::: : : . ..
XP_011 SSPKTNGLSKDMSSLHISPNSDTGLGDSVCSSPSISSTTSPKLDPPP---SPHANR--KK
690 700 710 720 730 740
470 480 490 500 510 520
pF1KSD LARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKK--QRRKKLTTPSKTEGSAGQAEEENFEFLI
: ::. . :: .. . ... . :. .. ..:: .::::::.:
XP_011 HRRKKSTSNFKADGLSGTAEAKRKAWKLNRVGSLRNIYSSSTNTE-----EQEENFEFII
750 760 770 780 790
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNA
:: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : : :::::.:.:.:::
XP_011 VSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNM
800 810 820 830 840 850
590 600 610 620 630 640
pF1KSD KGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLT
.::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: :..
XP_011 RGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMS
860 870 880 890 900 910
650 660 670 680 690 700
pF1KSD AIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWA
.:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: :::::: .: ::..:
XP_011 SIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLR
920 930 940 950 960 970
710 720 730 740 750 760
pF1KSD AVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAAR
:. .:. :..:::::. . .. . . . :. :::: . ..::..:::.:::.::.::
XP_011 ATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTAR
980 990 1000 1010 1020 1030
770 780 790 800 810 820
pF1KSD DAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAA
::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: : .::.
XP_011 DAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
1040 1050 1060 1070 1080 1090
830
pF1KSD SVGRADAPVALV
>>NP_055729 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK repe (804 aa)
initn: 2506 init1: 1260 opt: 1382 Z-score: 828.2 bits: 164.2 E(85289): 2.1e-39
Smith-Waterman score: 2889; 56.0% identity (79.5% similar) in 820 aa overlap (1-804:1-785)
10 20 30 40 50
pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
:. :.:.. ::.:::..: : .. . . .: :::..: ::..:. . .:..: .::
NP_055 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLV
::::::::.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.
NP_055 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGT
:::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. .. . :.::::
NP_055 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL
:: ::...:::. ::::: : :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.:::
NP_055 QDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD -LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAA
.. :::::.:::::.. :. :.. :.:::: . ::::::.::.:.....::: ..
NP_055 SIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKR
.: .:: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... ::::::::::..::::
NP_055 PTA--NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISA
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NP_055 SGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KSD FGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLA
.: : . ::: ::::.... ::.: : .:.
NP_055 CAPISSPKTNGLSKDMSSLHI---------------SPNS---------------DTGLG
420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLI
.. .. . :. :: . .::::: . ::.:::: :. :..: .: ::: :::::.:
NP_055 DSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFII
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNA
:: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : : :::::.:.:.:::
NP_055 VSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNM
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KSD KGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLT
.::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: :..
NP_055 RGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMS
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690 700
pF1KSD AIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWA
.:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: :::::: .: ::..:
NP_055 SIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLR
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KSD AVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAAR
:. .:. :..:::::. . .. . . . :. :::: . ..::..:::.:::.::.::
NP_055 ATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTAR
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KSD DAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAA
::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: : .::.
NP_055 DAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
750 760 770 780 790 800
830
pF1KSD SVGRADAPVALV
>>XP_005246116 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (808 aa)
initn: 2535 init1: 1260 opt: 1382 Z-score: 828.2 bits: 164.2 E(85289): 2.2e-39
Smith-Waterman score: 2872; 55.7% identity (79.1% similar) in 824 aa overlap (1-804:1-789)
10 20 30 40 50
pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
:. :.:.. ::.:::..: : .. . . .: :::..: ::..:. . .:..: .::
XP_005 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESE----QYKKEMLVDGQ
::::::::.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::
XP_005 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEDMDAGGRFKKEIVVDGQ
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pF1KSD THLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALA
..:.:::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. .. . :.
XP_005 SYLLLIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLV
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRK
:::::: ::...:::. ::::: : :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::
XP_005 LVGTQDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRK
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD QQQL-LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELR
.::: .. :::::.:::::.. :. :.. :.:::: . ::::::.::.:.....:::
XP_005 KQQLSIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD AEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSF
.. .: .:: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... ::::::::::..
XP_005 IDVPPTA--NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGM
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD LLKRSGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPR
::::::.::::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::
XP_005 LLKRSGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD AISAFGP--SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPD
: :: .: : . ::: ::::.... ::.: :
XP_005 ATSACAPISSPKTNGLSKDMSSLHI---------------SPNS---------------D
420 430 440
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pF1KSD RNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEE--ENF
.:. .. .. . :. :: . .::::: . ::.:::: :. :..: .: ::: :::
XP_005 TGLGDSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENF
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD EFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQA
::.::: :::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : : :::::.:.:.
XP_005 EFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQS
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pF1KSD IRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELT
::: .::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::
XP_005 IRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELI
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD LVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGR
:...:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: :::::: .: ::.
XP_005 KVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQ
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KSD QLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGAD
.: :. .:. :..:::::. . .. . . . :. :::: . ..::..:::.:::.:
XP_005 HLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVD
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KSD VAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRR
:.::::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: : .::.
XP_005 VTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVP
750 760 770 780 790 800
830
pF1KSD SSAASVGRADAPVALV
XP_005 TII
>>XP_011508851 (OMIM: 608651) PREDICTED: arf-GAP with GT (1073 aa)
initn: 2407 init1: 1260 opt: 1382 Z-score: 826.5 bits: 164.3 E(85289): 2.7e-39
Smith-Waterman score: 2775; 56.6% identity (79.1% similar) in 786 aa overlap (40-804:304-1054)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD AAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSI--REAVINSQEWTLSRS
: ..: :.:. :.: .::::::::::
XP_011 RRDGGPGGGPSPRSGASRPRGYFSLRRAPAEAHSSSAESIDGSPRRDAFVNSQEWTLSRS
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pF1KSD IPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESE----QYKKEMLVDGQTHLVLIRE
.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.:::.
XP_011 VPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEDMDAGGRFKKEIVVDGQSYLLLIRD
340 350 360 370 380 390
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pF1KSD EAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGTQDRI
:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. .. . :.:::::: :
XP_011 EGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGTQDAI
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pF1KSD SASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL-LAA
:...:::. ::::: : :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.::: ..
XP_011 SSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQLSIGP
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pF1KSD CKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAG
:::::.:::::.. :. :.. :.:::: . ::::::.::.:.....::: .. .:
XP_011 CKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVPPTA-
520 530 540 550 560 570
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNS
.:: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... ::::::::::..::::::.:
XP_011 -NTPTPVRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKRSGKS
580 590 600 610 620
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGP-
:::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::: :: .:
XP_011 LNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSACAPI
630 640 650 660 670 680
420 430 440 450 460 470
pF1KSD -SASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPDRNLARALS
: . ::: ::::.... ::.: : .:. ..
XP_011 SSPKTNGLSKDMSSLHI---------------SPNS---------------DTGLGDSVC
690 700 710
480 490 500 510 520
pF1KSD TDCTPSGDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLTTPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLIVSST
.. . :. :: . .::::: . ::.:::: :. :..: .: ::: :::::.::: :
XP_011 SSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKSTSNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLT
720 730 740 750 760 770
530 540 550 560 570 580
pF1KSD GQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNS
::::::::...::::::::::::::::::: ::::: : : :::::.:.:.::: .:::
XP_011 GQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCESSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNS
780 790 800 810 820 830
590 600 610 620 630 640
pF1KSD ICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGN
:::: . ::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: :...:::
XP_011 HCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGN
840 850 860 870 880 890
650 660 670 680 690 700
pF1KSD DTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQA
. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::::: :::::: .: ::..: :.
XP_011 ELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAKYEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATAD
900 910 920 930 940 950
710 720 730 740 750 760
pF1KSD QDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQG
.:. :..:::::. . .. . . . :. :::: . ..::..:::.:::.::.::::.:
XP_011 EDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHLACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHG
960 970 980 990 1000 1010
770 780 790 800 810 820
pF1KSD RTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGR
::: :::::.:: : :.:::.::: : .::.
XP_011 NTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMATPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
1020 1030 1040 1050 1060 1070
830
pF1KSD ADAPVALV
>>NP_001032208 (OMIM: 608651) arf-GAP with GTPase, ANK r (857 aa)
initn: 2655 init1: 1260 opt: 1360 Z-score: 815.0 bits: 161.8 E(85289): 1.2e-38
Smith-Waterman score: 2901; 55.7% identity (79.3% similar) in 840 aa overlap (4-804:4-838)
10 20 30 40 50
pF1KSD MHAQRQFV-VAAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINS
:.:.. ::.:::..: : .. . . .: :::..: ::..:. . .:..: .::
NP_001 MNYQQQLANSAAIRAEIQRFESVHPNIYSIYELLERVEEPVLQNQIREHVIAIEDAFVNS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QEWTLSRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDGQTHLV
::::::::.:::..:..:. ::::.:.::.:::.: :. :. ..:::..::::..:.
NP_001 QEWTLSRSVPELKVGIVGNLASGKSALVHRYLTGTYVQEESPEGGRFKKEIVVDGQSYLL
70 80 90 100 110 120
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pF1KSD LIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSLRGEGRGGLALALVGT
:::.:.: :.:.:. :.:::::::::::: :::.: . ...... :. .. . :.::::
NP_001 LIRDEGGPPEAQFAMWVDAVIFVFSLEDEISFQTVYHYYSRMANYRNTSE--IPLVLVGT
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCATYGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQL
:: ::...:::. ::::: : :.:::.::::::::::::.::::.::::.:. ::.:::
NP_001 QDAISSANPRVIDDARARKLSNDLKRCTYYETCATYGLNVERVFQDVAQKIVATRKKQQL
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD -LAACKSLPSSPSHSAA-STPVAG----QASNGGHT-SDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAA
.. :::::.:::::.. :. :.. :.:::: . ::::::.::.:.....::: ..
NP_001 SIGPCKSLPNSPSHSSVCSAQVSAVHISQTSNGGGSLSDYSSSVPSTPSTSQKELRIDVP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLFANRRGSD--SEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKR
.:. :: ... .:::..::..:.::: .::..:.::... ::::::::::..::::
NP_001 PTANTPTP--VRKQSKRRSNLFTSRKGSDPDKEKKGLESRADSIGSGRAIPIKQGMLLKR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SGNSLNKEWKKKYVTLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISA
::.::::::::::::: .:: : ::::..::....::::.::::::::::::::::: ::
NP_001 SGKSLNKEWKKKYVTLCDNGVLTYHPSLHDYMQNVHGKEIDLLRTTVKVPGKRPPRATSA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KSD FGP--SASINGLVKDMSTVQM----GEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPD---QTSKHLL
.: : . ::: ::::.... :. :. . . . : :.. :: : : .
NP_001 CAPISSPKTNGLSKDMSSLHISPNSGNVTSASGSQMASGISLVSFNSRPDGMHQRSYSVS
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500
pF1KSD KPDR-----NLAR-ALSTD-------CT-PS--GDLSPLSREPPPSPMV--KKQRRKKLT
. :. .: :.:.: :. :: . :: . .::::: . ::.:::: :
NP_001 SADQWSEATVIANSAISSDTGLGDSVCSSPSISSTTSP-KLDPPPSPHANRKKHRRKKST
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KSD TPSKTEGSAGQAEE--ENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDAWVQAIESQILASLQCCE
. :..: .: ::: :::::.::: :::::::::...::::::::::::::::::: ::
NP_001 SNFKADGLSGTAEEQEENFEFIIVSLTGQTWHFEATTYEERDAWVQAIESQILASLQSCE
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KSD SSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCGAPNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLG
::: : : :::::.:.:.::: .::: :::: . ::.:::::::::.::::::::::::
NP_001 SSKNKSRLTSQSEAMALQSIRNMRGNSHCVDCETQNPNWASLNLGALMCIECSGIHRNLG
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD THLSRVRSLDLDDWPRELTLVLTAIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAK
::::::::::::::: :: :...:::. :: ::: ...::.::: ::.:::.: :::::
NP_001 THLSRVRSLDLDDWPVELIKVMSSIGNELANSVWEESSQGRTKPSVDSTREEKERWIRAK
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KSD YEQLLFLAPLSTSEEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHL
::: :::::: .: ::..: :. .:. :..:::::. . .. . . . :. :::
NP_001 YEQKLFLAPLPCTELSLGQHLLRATADEDLRTAILLLAHGSRDEVNETCGEGDGRTALHL
720 730 740 750 760 770
750 760 770 780 790 800
pF1KSD AAELAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPGEGGSAAT
: . ..::..:::.:::.::.::::.: ::: :::::.:: : :.:::.::: : .
NP_001 ACRKGNVVLAQLLIWYGVDVTARDAHGNTALAYARQASSQECIDVLLQYGCPDERFVLMA
780 790 800 810 820 830
810 820 830
pF1KSD TPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV
::.
NP_001 TPNLSRRNNNRNNSSGRVPTII
840 850
836 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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