Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0172
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0172, 1352 aa
1>>>pF1KSDA0172 1352 - 1352 aa - 1352 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1852+/-0.00116; mu= 5.9138+/- 0.070
mean_var=226.5866+/-46.780, 0's: 0 Z-trim(110.3): 133 B-trim: 309 in 1/50
Lambda= 0.085203
statistics sampled from 11364 (11504) to 11364 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 3.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34976.1 KANK1 gene_id:23189|Hs108|chr9 (1352) 8808 1097.0 0
CCDS6441.1 KANK1 gene_id:23189|Hs108|chr9 (1194) 7733 964.8 0
CCDS12255.1 KANK2 gene_id:25959|Hs108|chr19 ( 851) 1100 149.3 4.2e-35
CCDS54219.1 KANK2 gene_id:25959|Hs108|chr19 ( 859) 1065 145.0 8.3e-34
CCDS620.1 KANK4 gene_id:163782|Hs108|chr1 ( 995) 1061 144.6 1.3e-33
CCDS81334.1 KANK4 gene_id:163782|Hs108|chr1 ( 367) 1041 141.8 3.3e-33
CCDS12199.1 KANK3 gene_id:256949|Hs108|chr19 ( 821) 903 125.1 7.9e-28
>>CCDS34976.1 KANK1 gene_id:23189|Hs108|chr9 (1352 aa)
initn: 8808 init1: 8808 opt: 8808 Z-score: 5861.6 bits: 1097.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8808; 99.9% identity (100.0% similar) in 1352 aa overlap (1-1352:1-1352)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAHTTKVNGSASGKAGDILSGDQDKEQKDPYFVETPYGYQLDLDFLKYVDDIQKGNTIKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAHTTKVNGSASGKAGDILSGDQDKEQKDPYFVETPYGYQLDLDFLKYVDDIQKGNTIKR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LNIQKRRKPSVPCPEPRTTSGQQGIWTSTESLSSSNSDDNKQCPNFLIARSQVTSTPISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNIQKRRKPSVPCPEPRTTSGQQGIWTSTESLSSSNSDDNKQCPNFLIARSQVTSTPISK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PPPPLETSLPFLTIPENRQLPPPSPQLPKHNLHVTKTLMETRRRLEQERATMQMTPGEFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PPPPLETSLPFLTIPENRQLPPPSPQLPKHNLHVTKTLMETRRRLEQERATMQMTPGEFR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RPRLASFGGMGTTSSLPSFVGSGNHNPAKHQLQNGYQGNGDYGSYAPAAPTTSSMGSSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RPRLASFGGMGTTSSLPSFVGSGNHNPAKHQLQNGYQGNGDYGSYAPAAPTTSSMGSSIR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD HSPLSSGISTPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQEEKRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HSPLSSGISTPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQEEKRQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LVSQLKNQRAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVSQLKNQRAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TQRIKEFRQLTADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TQRIKEFRQLTADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SCKDAAVGTLVEMRNCGVSVTEAMLGVMTEADKEIELQQQTIEALKEKIYRLEVQLRETT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS34 SCKDAAVGTLVEMRNCGVSVTEAMLGVMTEADKEIELQQQTIESLKEKIYRLEVQLRETT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HDREMTKLKQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEAVVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HDREMTKLKQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEAVVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SVETNSVGISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKSVSVEVSVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVETNSVGISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKSVSVEVSVC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ETGSNTEESVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ETGSNTEESVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AVMAVPRTADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVMAVPRTADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD EGRVKDINSSTKTRSIGVGTLLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EGRVKDINSSTKTRSIGVGTLLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CGPPQLTVGLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQAPLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CGPPQLTVGLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQAPLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNPDFQKTSLGKITG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNPDFQKTSLGKITG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD NYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD AAGLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSSSDESSSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAGLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSSSDESSSSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SDDECDVIEYPLEEEEEEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SDDECDVIEYPLEEEEEEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD ERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD AAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDADVCNVDHQNKAGYTPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDADVCNVDHQNKAGYTPI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD MLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGADV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD NIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350
pF1KSD YAHVNFAKAQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YAHVNFAKAQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
1330 1340 1350
>>CCDS6441.1 KANK1 gene_id:23189|Hs108|chr9 (1194 aa)
initn: 7733 init1: 7733 opt: 7733 Z-score: 5148.2 bits: 964.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7733; 99.9% identity (100.0% similar) in 1194 aa overlap (159-1352:1-1194)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LPFLTIPENRQLPPPSPQLPKHNLHVTKTLMETRRRLEQERATMQMTPGEFRRPRLASFG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 METRRRLEQERATMQMTPGEFRRPRLASFG
10 20 30
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GMGTTSSLPSFVGSGNHNPAKHQLQNGYQGNGDYGSYAPAAPTTSSMGSSIRHSPLSSGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GMGTTSSLPSFVGSGNHNPAKHQLQNGYQGNGDYGSYAPAAPTTSSMGSSIRHSPLSSGI
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KSD STPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQEEKRQLVSQLKNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 STPVTNVSPMHLQHIREQMAIALKRLKELEEQVRTIPVLQVKISVLQEEKRQLVSQLKNQ
100 110 120 130 140 150
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQSTQRIKEFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RAASQINVCGVRKRSYSAGNASQLEQLSRARRSGGELYIDYEEEEMETVEQSTQRIKEFR
160 170 180 190 200 210
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QLTADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSRSCKDAAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 QLTADMQALEQKIQDSSCEASSELRENGECRSVAVGAEENMNDIVVYHRGSRSCKDAAVG
220 230 240 250 260 270
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TLVEMRNCGVSVTEAMLGVMTEADKEIELQQQTIEALKEKIYRLEVQLRETTHDREMTKL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TLVEMRNCGVSVTEAMLGVMTEADKEIELQQQTIESLKEKIYRLEVQLRETTHDREMTKL
280 290 300 310 320 330
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEAVVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGTSVETNSVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 KQELQAAGSRKKVDKATMAQPLVFSKVVEAVVQTRDQMVGSHMDLVDTCVGTSVETNSVG
340 350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKSVSVEVSVCETGSNTEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ISCQPECKNKVVGPELPMNWWIVKERVEMHDRCAGRSVEMCDKSVSVEVSVCETGSNTEE
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEAAVMAVPRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SVNDLTLLKTNLNLKEVRSIGCGDCSVDVTVCSPKECASRGVNTEAVSQVEAAVMAVPRT
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVGEGRVKDIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 ADQDTSTDLEQVHQFTNTETATLIESCTNTCLSTLDKQTSTQTVETRTVAVGEGRVKDIN
520 530 540 550 560 570
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SSTKTRSIGVGTLLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIACGPPQLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 SSTKTRSIGVGTLLSGHSGFDRPSAVKTKESGVGQININDNYLVGLKMRTIACGPPQLTV
580 590 600 610 620 630
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQAPLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 GLTASRRSVGVGDDPVGESLENPQPQAPLGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSEL
640 650 660 670 680 690
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNPDFQKTSLGKITGNYLGYTCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSVMKSASTEELRNPDFQKTSLGKITGNYLGYTCK
700 710 720 730 740 750
910 920 930 940 950 960
pF1KSD CGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQIAAGLYACT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 CGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQIAAGLYACT
760 770 780 790 800 810
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD NNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSSSDESSSSESDDECDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYETTSSDDSSSDESSSSESDDECDVI
820 830 840 850 860 870
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EYPLEEEEEEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIRERYELSEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EYPLEEEEEEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIRERYELSEK
880 890 900 910 920 930
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD MLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISP
940 950 960 970 980 990
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD DVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 DVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLDADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD EAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD TALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAK
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1330 1340 1350
pF1KSD AQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
::::::::::::::::::::::::
CCDS64 AQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
1180 1190
>>CCDS12255.1 KANK2 gene_id:25959|Hs108|chr19 (851 aa)
initn: 1707 init1: 1028 opt: 1100 Z-score: 743.8 bits: 149.3 E(32554): 4.2e-35
Smith-Waterman score: 1100; 44.6% identity (73.5% similar) in 419 aa overlap (917-1332:422-837)
890 900 910 920 930 940
pF1KSD NPDFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQ
: :..: : .::. : .: .: :::
CCDS12 PAAATSNVHMVKKISITERSCDGAAGLPEVPAESSSSPPGSEVA-SLTQPEKSTGRVPTQ
400 410 420 430 440 450
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD EGTLS-PVNLTDDQIAAGLYACTNNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFVGINGGYET
: : :. . .: . . . . ..::::.:. : .. ...:::::.:::::.
CCDS12 EPTHREPTRQAASQESEEAGGTGGPPAGVRSIMKRKEEVADPTAHRRSLQFVGVNGGYES
460 470 480 490 500 510
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD TSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEEEEE-EEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARVE
::.:::. :. :.... : .. : : :. : . : . . .. . . .:
CCDS12 -SSEDSSTAENISDNDSTENEAPE-PRERVPSVAEAPQLRPAGTAAAKTSRQECQLSRES
520 530 540 550 560
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD DEMQVQE-CEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRFCLNTLQHEWF
... . : ..: . :.::: ..::: :.. ...:.::: .... .:. .::.
CCDS12 QHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSPDLISACLALEKYLDNPNALTERELKVAYTTVLQEWL
570 580 590 600 610 620
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD RVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNFEIVKLLLD
:.. ...: : .: ....:.:.: .: ::.:.::.::::::::::::.:: .:. :::
CCDS12 RLACRSDAHPELVRRHLVTFRAMSARLLDYVVNIADSNGNTALHYSVSHANFPVVQQLLD
630 640 650 660 670 680
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD ADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQTALMLAVS
. ::.::.::.:::.::::.:::..... :.. : .:: :..:::::::::::::::::
CCDS12 SGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALATLKTQDDIETVLQLFRLGNINAKASQAGQTALMLAVS
690 700 710 720 730 740
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD HGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGST
:::.:.::.:::: ::::.:::.:::::::: :::: ::. :::: :.:. : : ::::
CCDS12 HGRVDVVKALLACEADVNVQDDDGSTALMCACEHGHKEIAGLLLAVPSCDISLTDRDGST
750 760 770 780 790 800
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD ALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
:: .::.::...:: .::...:. . .:
CCDS12 ALMVALDAGQSEIASMLYSRMNIKCSFAPMSDDESPTSSSAEE
810 820 830 840 850
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890 900 910 920 930 940
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CCDS54 PAAATSNVHMVKKISITERSCDGAAGLPEVPAESSSSPPGSEVA-SLTQPEKSTGRVPTQ
400 410 420 430 440 450
950 960 970 980 990
pF1KSD EGTLS-PVNLTDDQIA--AGLYACT------NNESTLKSIMKKKDGNKDSNGAKKNLQFV
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CCDS54 EPTHREPTRQAASQESEEAGGTAPPLSSPPGGPPAGVRSIMKRKEEVADPTAHRRSLQFV
460 470 480 490 500 510
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD GINGGYETTSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEEEEE-EEDEDTRGMAEGHHAVNIE
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CCDS54 GVNGGYES-SSEDSSTAENISDNDSTENEAPE-PRERVPSVAEAPQLRPAGTAAAKTSRQ
520 530 540 550 560
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD GLKSARVEDEMQVQE-CEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRFCL
. .: ... . : ..: . :.::: ..::: :.. ...:.::: ....
CCDS54 ECQLSRESQHIPTAEGASGSNTEEEIRMELSPDLISACLALEKYLDNPNALTERELKVAY
570 580 590 600 610 620
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD NTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHSNF
.:. .::.:.. ...: : .: ....:.:.: .: ::.:.::.::::::::::::.::
CCDS54 TTVLQEWLRLACRSDAHPELVRRHLVTFRAMSARLLDYVVNIADSNGNTALHYSVSHANF
630 640 650 660 670 680
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD EIVKLLLDADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQAGQ
.:. :::. ::.::.::.:::.::::.:::..... :.. : .:: :..:::::::::
CCDS54 PVVQQLLDSGVCKVDKQNRAGYSPIMLTALATLKTQDDIETVLQLFRLGNINAKASQAGQ
690 700 710 720 730 740
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD TALMLAVSHGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGH
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CCDS54 TALMLAVSHGRVDVVKALLACEADVNVQDDDGSTALMCACEHGHKEIAGLLLAVPSCDIS
750 760 770 780 790 800
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD LEDNDGSTALSIALEAGHKDIAVLLYAHVNFAKAQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
: : :::::: .::.::...:: .::...:. . .:
CCDS54 LTDRDGSTALMVALDAGQSEIASMLYSRMNIKCSFAPMSDDESPTSSSAEE
810 820 830 840 850
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770 780 790 800 810
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..:.. .: . .. .: :.: :..:
CCDS62 STELRIEEAGTEQEGGPQGGTRGAGGFLWGSDRKTPPAGREETSSNLPGKEHPGRPPSSP
500 510 520 530 540 550
820 830 840 850 860 870
pF1KSD LGMMTGLDHYIERIQKLLAEQQTLLAENYSELAEAFGEPHSQMGSLNSQLISTLSSINSV
: .:...::.:: :: . : ..: ::: :. .: :...:..::: :::.: .
CCDS62 TDATIG--QYVKKIQELLQEQWNCLEHGYPELASAIKQPASKLSSIQSQL---LSSLNLL
560 570 580 590 600 610
880 890 900 910 920 930
pF1KSD MKSASTEELRNPDFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKP
. : :.:. :.. ..: . :
CCDS62 L--------------------------------------SAYSAQAHPPKEPPASSSSPP
620 630
940 950 960 970 980 990
pF1KSD ISSLDAFPTQEGTLSPVNLTDDQIAAGLYACTNNESTLKSIMKKKD-GNK-DSNGAKKNL
. .:: ..::::::::: : . .::.::::
CCDS62 VE-----------ISP------------------STSLKSIMKKKDYGFRAGGNGTKKNL
640 650 660
1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD QFVGINGGYETTSSDDSSSDES-----SSSESDDECDVIEYPLEEEEEEEDEDTRGMAEG
::::.:::::::::...:...: :.::.. .:: .. .. . : .:. ::
CCDS62 QFVGVNGGYETTSSEETSGEDSTPEDLSDSEAEKKCDGPDHKHVKDAHLTCEAGQGIPEG
670 680 690 700 710 720
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD H-HAVNIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTS
::.. : .: :.: ::. ::..:.:: :.. . . . :.
CCDS62 TCHAAQESG----------PGEEVPHSKAE---RYKPSEEFLNACRALSQHLPETGTTTD
730 740 750 760 770
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD KDMRFCLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHY
. .: :::...:::::::.::. ::.:..:. . :: :. ..:::: ::::::::
CCDS62 QLLRQSLNTISQEWFRVSSRKSSSPAVVASYLHEVQPHSPHFLKLLVNLADHNGNTALHY
780 790 800 810 820 830
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD SVSHSNFEIVKLLLDADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNA
::::::: ::::::.. ::::::::::::: .:.. ::..:...:: .: .:. :.::
CCDS62 SVSHSNFSIVKLLLETGVCNVDHQNKAGYTAVMITPLASAETNEDMAVVWKLLREGNVNI
840 850 860 870 880 890
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD KASQAGQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLA
.:.:.:::::::.::: : :::..::.: ::::.:: .::.::: : .::.:..:.::::
CCDS62 QATQGGQTALMLGVSHDREDMVQALLSCQADVNLQDHDGSSALMVACHHGNVDLVRLLLA
900 910 920 930 940 950
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KSD QPGCNGHLEDNDGSTALSIALEAG-HKDIAVLLYAHVNFAKAQSPGTPRLGRKTSPGPTH
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CCDS62 HPACDSSLTDKAGRTALSIALKSPTHMEIAGLLRAHAEQGRSLGL
960 970 980 990
1350
pF1KSD RGSFD
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pF1KSD AFPTQEGTLSPVNLTDDQIAAGLYACTNNESTLKSIMKKKD-GNK-DSNGAKKNLQFVGI
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CCDS81 MEKTDEISPSTSLKSIMKKKDYGFRAGGNGTKKNLQFVGV
10 20 30 40
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD NGGYETTSSDDSSSDES-----SSSESDDECDVIEYPLEEEEEEEDEDTRGMAEGH-HAV
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CCDS81 NGGYETTSSEETSGEDSTPEDLSDSEAEKKCDGPDHKHVKDAHLTCEAGQGIPEGTCHAA
50 60 70 80 90 100
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD NIEGLKSARVEDEMQVQECEPEKVEIRERYELSEKMLSACNLLKNTINDPKALTSKDMRF
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CCDS81 QESG----------PGEEVPHSKAE---RYKPSEEFLNACRALSQHLPETGTTTDQLLRQ
110 120 130 140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD CLNTLQHEWFRVSSQKSAIPAMVGDYIAAFEAISPDVLRYVINLADGNGNTALHYSVSHS
:::...:::::::.::. ::.:..:. . :: :. ..:::: :::::::::::::
CCDS81 SLNTISQEWFRVSSRKSSSPAVVASYLHEVQPHSPHFLKLLVNLADHNGNTALHYSVSHS
150 160 170 180 190 200
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pF1KSD NFEIVKLLLDADVCNVDHQNKAGYTPIMLAALAAVEAEKDMRIVEELFGCGDVNAKASQA
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CCDS81 NFSIVKLLLETGVCNVDHQNKAGYTAVMITPLASAETNEDMAVVWKLLREGNVNIQATQG
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD GQTALMLAVSHGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCN
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CCDS81 GQTALMLGVSHDREDMVQALLSCQADVNLQDHDGSSALMVACHHGNVDLVRLLLAHPACD
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD GHLEDNDGSTALSIALEAG-HKDIAVLLYAHVNFAKAQSPGTPRLGRKTSPGPTHRGSFD
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CCDS81 SSLTDKAGRTALSIALKSPTHMEIAGLLRAHAEQGRSLGL
330 340 350 360
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initn: 1352 init1: 491 opt: 903 Z-score: 613.1 bits: 125.1 E(32554): 7.9e-28
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890 900 910 920 930 940
pF1KSD PDFQKTSLGKITGNYLGYTCKCGGLQSGSPLSSQTSQPEQEVGTSEGKPISSLDAFPTQE
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CCDS12 GVSELLRGRLRELEEAREAAEEAAAGARAQLREATTQTPWSCAEKAAQTESPAEA-PSLT
370 380 390 400 410 420
950 960 970 980 990 1000
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CCDS12 QESSPGSMDGDRAVAP-------AGILKSIMKKRDGTPGAQPSSGPK-SLQFVGVLNGEY
430 440 450 460 470
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pF1KSD ETTSSDDSSSDESSSSESDDECDVIEYPLEEEEEEEDEDTRGMAEGHHAVNIEGLKSARV
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CCDS12 ESSSSEDASD-----SDGDSENGGAEPP--GSSSGSGDDSGGGSDSGTPGPPSG---GDI
480 490 500 510 520
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CCDS12 RDPEPEAEAEPQQVA-QGRCELSPRLREACVALQRQLSRPRGVASDGGAVRL--VAQEWF
530 540 550 560 570 580
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CCDS12 RVSSQRRSQAEPVARMLEGVRRLGPELLAHVVNLADGNGNTALHYSVSHGNLAIASLLLD
590 600 610 620 630 640
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CCDS12 TGACEVNRQNRAGYSALMLAALTSVRQEEEDMAVVQRLFCMGDVNAKASQTGQTALMLAI
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pF1KSD SHGRIDMVKGLLACGADVNIQDDEGSTALMCASEHGHVEIVKLLLAQPGCNGHLEDNDGS
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CCDS12 SHGRQDMVATLLACGADVNAQDADGATALMCASEYGRLDTVRLLLTQPGCDPAILDNEGT
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CCDS12 SALAIALEAEQDEVAALLHAHLSSGQPDTQSESPP--GSQTATPGEGECGDNGENPQVQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]