Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0207
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0207, 588 aa
1>>>pF1KSDA0207 588 - 588 aa - 588 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4848+/-0.00088; mu= 9.7418+/- 0.053
mean_var=145.7844+/-30.509, 0's: 0 Z-trim(110.8): 57 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.106223
statistics sampled from 11844 (11898) to 11844 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 2.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 594) 3918 612.3 5.4e-175
CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 536) 3637 569.2 4.6e-162
CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2 ( 540) 1954 311.3 2e-84
CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 ( 548) 1803 288.2 1.9e-77
CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 532) 1756 280.9 2.7e-75
CCDS56028.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 555) 1756 281.0 2.8e-75
CCDS82116.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 ( 447) 1207 196.8 5e-50
CCDS2359.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2 (1250) 523 92.2 4.1e-18
CCDS2360.1 RAPH1 gene_id:65059|Hs108|chr2 ( 644) 502 88.8 2.2e-17
CCDS31167.1 APBB1IP gene_id:54518|Hs108|chr10 ( 666) 392 72.0 2.7e-12
>>CCDS43582.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 (594 aa)
initn: 3918 init1: 3918 opt: 3918 Z-score: 3255.1 bits: 612.3 E(32554): 5.4e-175
Smith-Waterman score: 3918; 99.7% identity (99.8% similar) in 578 aa overlap (11-588:17-594)
10 20 30 40 50
pF1KSD MQAAGPLFRSKDKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMN
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MALAGCPDSFLHHPYYQDKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSK
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDH
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHP
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD STLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 STLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIK
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580
pF1KSD NFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
550 560 570 580 590
>>CCDS43583.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 (536 aa)
initn: 3637 init1: 3637 opt: 3637 Z-score: 3023.1 bits: 569.2 E(32554): 4.6e-162
Smith-Waterman score: 3637; 99.8% identity (99.8% similar) in 536 aa overlap (53-588:1-536)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD DPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KSD QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KSD GSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KSD WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVT
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KSD WCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSK
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KSD EPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRT
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KSD CWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPFSTPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENP
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KSD AEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIK
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KSD QQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLI
460 470 480 490 500 510
570 580
pF1KSD QLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
520 530
>>CCDS2222.1 GRB14 gene_id:2888|Hs108|chr2 (540 aa)
initn: 1751 init1: 610 opt: 1954 Z-score: 1629.1 bits: 311.3 E(32554): 2e-84
Smith-Waterman score: 1954; 54.7% identity (78.6% similar) in 543 aa overlap (53-588:1-540)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD DPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARS
:..::.. :: : . : . .
CCDS22 MTTSLQDGQSAASRAAARDSPLAAQVCGAA
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KSD QPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAVRRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGP
: :... . : . : . . .. :. : ...: . . .:.:::::::::
CCDS22 QGRGDAHDLAPAPWLHARALLPLPDGTRGCAADRRKKKD--LDVPEMPSIPNPFPELCCS
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KSD GSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNS
.::. .: ... :: .::.::: ::..... .:.::::.::::. :.: .::.:
CCDS22 PFTSVLSADLFPKANSRKKQVIKVYSEDETSRALDVPSDITARDVCQLLILKNHYIDDHS
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KSD WTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQM
::: :: ::.:.:: .::::::..: :. . :.:. ::::::::::::::: ::::.:
CCDS22 WTLFEHLPHIGVERTIEDHELVIEVLSNWGIEEENKLYFRKNYAKYEFFKNPMYFFPEHM
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310
pF1KSD VTWCQQSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTK
:.. ..:: : ::.:: ::.::. :::.::::.:: :::::::.: ::::::: :::
CCDS22 VSFATETNGEISPTQILQMFLSSSTYPEIHGFLHAKEQGKKSWKKIYFFLRRSGLYFSTK
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KSD GTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDE
::::::::::..... .:.:. .::.:...:::..:.:.::::. . ..:..::::.:
CCDS22 GTSKEPRHLQFFSEFGNSDIYVSLAGKKKHGAPTNYGFCFKPNKAGGP-RDLKMLCAEEE
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KSD QTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPFS-TPVRSVSENSLVAMDFSGQTGR
:.::::.::.::::::: ::::: : : .. : : .:.::.::::::::::::: .:
CCDS22 QSRTCWVTAIRLLKYGMQLYQNYMHPYQGRSGCSSQSISPMRSISENSLVAMDFSGQKSR
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VIENPAEAQSAALEEGHAWRKRST-RMNILGSQSPLHPSTLSTV-IHRTQHWFHGRISRE
:::::.:: :.:.::: ::::.. :.. :: . :. ... :::.: ::: .:::.
CCDS22 VIENPTEALSVAVEEGLAWRKKGCLRLGTHGSPTASSQSSATNMAIHRSQPWFHHKISRD
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGN
:..:.: :::::::.::.::::::::.:::.. : ::::.:::.: ::::. : .::::.
CCDS22 EAQRLIIQQGLVDGVFLVRDSQSNPKTFVLSMSHGQKIKHFQIIPVEDDGEMFHTLDDGH
450 460 470 480 490 500
560 570 580
pF1KSD TKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
:.:.::::::.:::::::::::::::.: :.::
CCDS22 TRFTDLIQLVEFYQLNKGVLPCKLKHYCARIAL
510 520 530 540
>>CCDS47586.1 GRB10 gene_id:2887|Hs108|chr7 (548 aa)
initn: 1802 init1: 1802 opt: 1803 Z-score: 1504.0 bits: 288.2 E(32554): 1.9e-77
Smith-Waterman score: 3499; 91.7% identity (91.9% similar) in 578 aa overlap (11-588:17-548)
10 20 30 40 50
pF1KSD MQAAGPLFRSKDKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMN
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MALAGCPDSFLHHPYYQDKVEQTPRSQQDPAGPGLPAQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQPQVSPRQRVQRSQPVHILAV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPAVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSK
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGSPPVLTPGSLPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEHHPHLGLERCLEDHELVVQVESTMASE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKFLFRKNYAKYEFFKNPMNFFPEQMVTWCQQSNGSQTQLLQ------------------
250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDH
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ----------------------------EPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDH
290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KSD GLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KSD STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHP
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KSD STLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 STLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIK
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580
pF1KSD NFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
500 510 520 530 540
>>CCDS11345.1 GRB7 gene_id:2886|Hs108|chr17 (532 aa)
initn: 1817 init1: 587 opt: 1756 Z-score: 1465.2 bits: 280.9 E(32554): 2.7e-75
Smith-Waterman score: 1906; 53.7% identity (79.6% similar) in 538 aa overlap (66-588:1-532)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD LANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSACSMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASGPPRSIQP
:. : : ... : . :: . .:
CCDS11 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRP
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KSD QVSPR-QRVQRSQPVHILAV-RRLQEEDQQFRTSSLPAIPNPFPELCGPGS--PAVLTPG
.: ..:.::::. : .. :.:.::.. :..:::.:::::::::.: : : . :.
CCDS11 PDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPS
40 50 60 70 80
160 170 180 190 200
pF1KSD S---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEH
: : : .:. . :::.::::. . ::. : ::: .:..:: ..: ..:..: :::
CCDS11 SARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVEC
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KSD HPHLGLERCLEDHELVVQVEST--MASESKFLFRKNYAKYEFFKN-PMNFFPEQMVTWCQ
::::.::: ::::: ::.:... ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. :
CCDS11 HPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCL
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KSD QSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKE
... :. .:.:::::..: :::::::... :.: ::... ::::::: :::::::.
CCDS11 DAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKD
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KSD PRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTC
::::: .::...::.. . ::: :. ::: :.:.::::.:: : ::..:.::::.:::
CCDS11 PRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTC
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KSD WMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF---STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGRVIE
:..::::.:::. ::.::. :.:. : : : :.::.:.:.::::::::..:::::
CCDS11 WLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRH--LHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIE
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KSD NPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRI
:: :: :.::::..::::.... :. : ..::..::::: :::::::::::.:.
CCDS11 NPREALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREESQRL
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KSD IKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSD
: ::::::::::.:.:: ::..:::.::: ::.:.. ::: :..:. .::.:::.:.:.:
CCDS11 IGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTRFTD
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570 580
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:.:::.:.:::.:.::: :.: : ::::
CCDS11 LLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
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::.. : . : :.:. : : :: .
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.: .: ..:.::::. : .. :.:.::.. :..:::.:::::::::.: : : .
CCDS56 PRPPDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILG
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:.: : : .:. . :::.::::. . ::. : ::: .:..:: ..: ..:..: :
CCDS56 GPSSARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGL
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:: ::::.::: ::::: ::.:... ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::.
CCDS56 VECHPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVS
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: ... :. .:.:::::..: :::::::... :.: ::... ::::::: :::::
CCDS56 SCLDAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGT
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pF1KSD SKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQT
::.::::: .::...::.. . ::: :. ::: :.:.::::.:: : ::..:.::::.
CCDS56 SKDPRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQS
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pF1KSD RTCWMTAFRLLKYGMLLYQNYRIPQQRKALLSPF---STPVRSVSENSLVAMDFSGQTGR
::::..::::.:::. ::.::. :.:. : : : :.::.:.:.::::::::..::
CCDS56 RTCWLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRH--LHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGR
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pF1KSD VIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREES
::::: :: :.::::..::::.... :. : ..::..::::: :::::::::::
CCDS56 VIENPREALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAAIHRTQLWFHGRISREES
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pF1KSD HRIIKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTK
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CCDS56 QRLIGQQGLVDGLFLVRESQRNPQGFVLSLCHLQKVKHYLILPSEEEGRLYFSMDDGQTR
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pF1KSD FSDLIQLVDFYQLNKGVLPCKLKHHCIRVAL
:.::.:::.:.:::.:.::: :.: : ::::
CCDS56 FTDLLQLVEFHQLNRGILPCLLRHCCTRVAL
530 540 550
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CCDS82 MELDLSPPHLSSSPEDLCPAPGTPPGTPRP
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CCDS82 PDTPLPEEVKRSQPLLIPTTGRKLREEER--RATSLPSIPNPFPELCSPPSQSPILGGPS
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pF1KSD S---LPPSQAAAKQDVKVFSEDGTSKVVEILADMTARDLCQLLVYKSHCVDDNSWTLVEH
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CCDS82 SARGLLPRDASRPHVVKVYSEDGACRSVEVAAGATARHVCEMLVQRAHALSDETWGLVEC
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::::.::: ::::: ::.:... ....:.:.::::.::::.::. : ..:::.::. :
CCDS82 HPHLALERGLEDHESVVEVQAAWPVGGDSRFVFRKNFAKYELFKSSPHSLFPEKMVSSCL
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pF1KSD QSNG--SQTQLLQNFLNSSSCPEIQGFLHVKELGKKSWKKLYVCLRRSGLYCSTKGTSKE
... :. .:.:::::..: :::::::... :.: ::... ::::::: :::::::.
CCDS82 DAHTGISHEDLIQNFLNAGSFPEIQGFLQLRGSGRKLWKRFFCFLRRSGLYYSTKGTSKD
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pF1KSD PRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQTRTC
::::: .::...::.. . ::: :. ::: :.:.::::.:: : ::..:.::::.:::
CCDS82 PRHLQYVADVNESNVYVVTQGRKLYGMPTDFGFCVKPNKLRNGHKGLRIFCSEDEQSRTC
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CCDS82 WLAAFRLFKYGVQLYKNYQQAQSRH--LHPSCLGSPPLRSASDNTLVAMDFSGHAGRVIE
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD NPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRI
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CCDS82 NPREALSVALEEAQAWRKKTNHR--LSLPMPASGTSLSAACS----W-SGRVSGTPRALS
390 400 410 420 430
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pF1KSD IKQQGLVDGLFLLRDSQSNPKAFVLTLCHHQKIKNFQILPCEDDGQTFFSLDDGNTKFSD
CCDS82 SLCATCRK
440
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10 20 30
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CCDS23 LNQGETVDLDALMADLCSIEQELSSIGSGNSKRQITETKATQKLPVSRHTLKHGTLKGLS
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pF1KSD AQSDRLANHQEDDVDLEALVNDMNASLESLYSAC--SMQSDTVPLLQNGQHARSQPRASG
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CCDS23 SSSNRIAKPSHASYSLDDVTAQLEQASLSMDEAAQQSVLEDTKPLVTN-QHRRTASAGTV
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.. . : . .. . . : : : :: : . . : : .
CCDS23 SDAEVHSISNSSHSSITSAASSMDSLDIDKVTRPQELDLTHQGQ-----PITEEEQAAKL
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. . . ..: .:. : .: : .::.. . .:.:.. . :. :::: . .
CCDS23 KAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTVRQVLDNLMDKSHCGYSLD
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210 220 230 240 250 260
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:.::: .: .:: .:::: .:. .. : :..:..: . :: .::::.:.. .
CCDS23 WSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFKNPQNYLLGKK
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: . . .... : . : .:: . :::.: : .:. ::::::: : :: ::.: ::
CCDS23 ETAEMADRNKEVLLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFLLRASGIYYVPKG
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pF1KSD TSKEPRHLQLLADLEDSNIFSLIAGRKQYNAPTDHGLCIKPNKVRNETKELRLLCAEDEQ
.: : : . .:. :.. :..:.::::. : .: ....... .. :: .: .
CCDS23 KAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKSQYIKYLCCDDVR
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: :....:. ::: ::.::. .: : :. ..: : .: . . :...
CCDS23 TLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSSSSSIPESQSNHS
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pF1KSD GRVIENPAEAQSAALEEGHAWRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISRE
.. . ...: : ::. :..:
CCDS23 NQSDSGVSDTQPA----GHV-RSQSIVSSVFSEAWKRGTQLEESSKARMESMNRPYTSLV
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CCDS23 TKEEQAAKLKAEKIRVALEKIKEAQVKKLVIRVHMSDDSSKTMMVDERQTVRQVLDNLMD
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:::: . .:.::: .: .:: .:::: .:. .. : :..:..: . :: .:::
CCDS23 KSHCGYSLDWSLVETVSELQMERIFEDHENLVENLLNWTRDSQNKLIFMERIEKYALFKN
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CCDS23 PQNYLLGKKETAEMADRNKEVLLEECFCGSSVTVPEIEGVLWLKDDGKKSWKKRYFLLRA
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CCDS23 SGIYYVPKGKAKVSRDLVCFLQLDHVNVYYGQDYRNKYKAPTDYCLVLKHPQIQKKSQYI
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CCDS23 KYLCCDDVRTLHQWVNGIRIAKYGKQLYMNYQEALKRTESAYDWTSLSSSSIKSGSSSSS
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CCDS31 TLPPPDPNPPRAEFNYSVGFKDLNESLNALEDQDLDALMADLVADISEAEQRTIQAQKES
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CCDS31 ---LQNQHHSAS----------LQASIFSGA-ASLGYGTNVAATGISQYEDDLPPPPADP
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CCDS31 VLDLPLP----PPPPE---PLSQEEEEAQAKADKIKLALEKLKEAKVKKLVVKVHMNDNS
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CCDS31 TKSLMVDERQLARDVLDNLFEKTHCDCNVDWCLYEIYPELQIERFFEDHENVVEVLSDWT
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CCDS31 RDTENKILFLEKEEKYAVFKNPQNFYLDNRGKKESKETNEKMNAKNKESLLEESFCGTSI
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CCDS31 RAVAKAGLASRW-TNLGTVNAAAPAQPSTGPKTGTTQPNGQIPQATHSVSAVLQEAQRHA
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pF1KSD WRKRSTRMNILGSQSPLHPSTLSTVIHRTQHWFHGRISREESHRIIKQQGLVDGLFLLRD
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CCDS31 ETSKDKKPALGNHHDPAVPRAPHAPKSSLPPPPPVRRSSDTSGSPATPLKAKGTGGGGLP
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588 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 00:39:49 2016 done: Thu Nov 3 00:39:49 2016
Total Scan time: 2.210 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]