Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0211
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0211, 1267 aa
1>>>pF1KSDA0211 1267 - 1267 aa - 1267 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7173+/-0.00108; mu= -5.1156+/- 0.063
mean_var=474.6799+/-117.567, 0's: 0 Z-trim(115.0): 158 B-trim: 1714 in 2/51
Lambda= 0.058867
statistics sampled from 15347 (15569) to 15347 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.773), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16
Scan time: 4.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32317.1 ZNF592 gene_id:9640|Hs108|chr15 (1267) 8738 757.9 3.6e-218
CCDS11969.1 ZNF532 gene_id:55205|Hs108|chr18 (1301) 1586 150.5 2.6e-35
CCDS992.1 ZNF687 gene_id:57592|Hs108|chr1 (1237) 641 70.3 3.6e-11
>>CCDS32317.1 ZNF592 gene_id:9640|Hs108|chr15 (1267 aa)
initn: 8738 init1: 8738 opt: 8738 Z-score: 4030.3 bits: 757.9 E(32554): 3.6e-218
Smith-Waterman score: 8738; 99.9% identity (100.0% similar) in 1267 aa overlap (1-1267:1-1267)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGDMKTPDFDDLLAAFDIPDPTSLDAKEAIQTPSEENESPLKPPGICMDESVSLSHSGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MGDMKTPDFDDLLAAFDIPDPTSLDAKEAIQTPSEENESPLKPPGICMDESVSLSHSGSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PDVPAVSVIVKNTSRQESFEAEKDHITPSLLHNGFRGSDLPPDPHNCGKFDSTFMNGDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PDVPAVSVIVKNTSRQESFEAEKDHITPSLLHNGFRGSDLPPDPHNCGKFDSTFMNGDSA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RSFPGKLEPPKSEPLPTFNQFSPISSPEPEDPIKDNGFGIKPKHSDSYFPPPLGCGAVGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RSFPGKLEPPKSEPLPTFNQFSPISSPEPEDPIKDNGFGIKPKHSDSYFPPPLGCGAVGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD PVLEALAKFPVPELHMFDHFCKKEPKPEPLPLGSQQEHEQSGQNTVEPHKDPDATRFFGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVLEALAKFPVPELHMFDHFCKKEPKPEPLPLGSQQEHEQSGQNTVEPHKDPDATRFFGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ALEFNSHPSNSIGESKGLARELGTCSSVPPRQRLKPAHSKLSSCVAALVALQAKRVASVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALEFNSHPSNSIGESKGLARELGTCSSVPPRQRLKPAHSKLSSCVAALVALQAKRVASVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KEDQPGHTKDLSGPTKESSKGSPKMPKSPKSPRSPLEATRKSIKPSDSPRSICSDSSSKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KEDQPGHTKDLSGPTKESSKGSPKMPKSPKSPRSPLEATRKSIKPSDSPRSICSDSSSKG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SPSVAASSPPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRILPDPDDPSKSPVGSPLGSAIAEAPSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SPSVAASSPPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRILPDPDDPSKSPVGSPLGSAIAEAPSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD MPGDEVPVEEHFPEAGTNSGSPQGARKGDESMTKASDSSSPSCSSGPRVPKGAAPGSQTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MPGDEVPVEEHFPEAGTNSGSPQGARKGDESMTKASDSSSPSCSSGPRVPKGAAPGSQTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KKQQSTALQASTLAPANLLPKAVHLANLNLVPHSVAASVTAKSSVQRRSQPQLTQMSVPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KKQQSTALQASTLAPANLLPKAVHLANLNLVPHSVAASVTAKSSVQRRSQPQLTQMSVPL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VHQVKKAAPLIVEVFNKVLHSSNPVPLYAPNLSPPADSRIHVPASGYCCLECGDAFALEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VHQVKKAAPLIVEVFNKVLHSSNPVPLYAPNLSPPADSRIHVPASGYCCLECGDAFALEK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SLSQHYGRRSVHIEVLCTLCSKTLLFFNKCSLLRHARDHKSKGLVMQCSQLLVKPISADQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLSQHYGRRSVHIEVLCTLCSKTLLFFNKCSLLRHARDHKSKGLVMQCSQLLVKPISADQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD MFVSAPVNSTAPAAPAPSSSPKHGLTSGSASPPPPALPLYPDPVRLIRYSIKCLECHKQM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MFVSAPVNSTAPAAPAPSSSPKHGLTSGSASPPPPALPLYPDPVRLIRYSIKCLECHKQM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RDYMVLAAHFQRTTEETEGLTCQVCQMLLPNQCSFCAHQRIHAHKSPYCCPECGVLCRSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RDYMVLAAHFQRTTEETEGLTCQVCQMLLPNQCSFCAHQRIHAHKSPYCCPECGVLCRSA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YFQTHVKENCLHYARKVGYRCIHCGVVHLTLALLKSHIQERHCQVFHKCAFCPMAFKTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YFQTHVKENCLHYARKVGYRCIHCGVVHLTLALLKSHIQERHCQVFHKCAFCPMAFKTAS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD STADHSATQHPTQPHRPSQLIYKCSCEMVFNKKRHIQQHFYQNVSKTQVGVFKCPECPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STADHSATQHPTQPHRPSQLIYKCSCEMVFNKKRHIQQHFYQNVSKTQVGVFKCPECPLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FVQKPELMQHVKSTHGVPRNVDELSNLQSSADTSSSRPGSRVPTEPPATSVAARSSSLPS
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FVQKPELMQHVKSTHGVPRNVDELSSLQSSADTSSSRPGSRVPTEPPATSVAARSSSLPS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GRWGRPEAHRRVEARPRLRNTGWTCQECQEWVPDRESYVSHMKKSHGRTLKRYPCRQCEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GRWGRPEAHRRVEARPRLRNTGWTCQECQEWVPDRESYVSHMKKSHGRTLKRYPCRQCEQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SFHTPNSLRKHIRNNHDTVKKFYTCGYCTEDSPSFPRPSLLESHISLMHGIRNPDLSQTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SFHTPNSLRKHIRNNHDTVKKFYTCGYCTEDSPSFPRPSLLESHISLMHGIRNPDLSQTS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD KVKPPGGHSPQVNHLKRPVSGVGDAPGTSNGATVSSTKRHKSLFQCAKCSFATDSGLEFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVKPPGGHSPQVNHLKRPVSGVGDAPGTSNGATVSSTKRHKSLFQCAKCSFATDSGLEFQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SHIPQHQVDSSTAQCLLCGLCYTSASSLSRHLFIVHKVRDQEEEEEEEAAAAEMAVEVAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SHIPQHQVDSSTAQCLLCGLCYTSASSLSRHLFIVHKVRDQEEEEEEEAAAAEMAVEVAE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD PEEGSGEEVPMETRENGLEECAGEPLSADPEARRLLGPAPEDDGGHNDHSQPQASQDQDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEEGSGEEVPMETRENGLEECAGEPLSADPEARRLLGPAPEDDGGHNDHSQPQASQDQDS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD HTLSPQV
:::::::
CCDS32 HTLSPQV
>>CCDS11969.1 ZNF532 gene_id:55205|Hs108|chr18 (1301 aa)
initn: 2758 init1: 806 opt: 1586 Z-score: 747.5 bits: 150.5 E(32554): 2.6e-35
Smith-Waterman score: 2774; 39.8% identity (64.3% similar) in 1303 aa overlap (10-1222:12-1270)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGDMKTPDFDDLLAAFDIPDPTSLDAKEAIQTPSEENESPLKPPGICMDESVSLSHSG
::::::::::: .: : ::.. ...:: .: . :.: :.
CCDS11 MTMGDMKTPDFDDLLAAFDIPD--MVDPKAAIESGHDDHESHMKQNAHGEDDS----HAP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SAPDVPAVSVIVKNTSRQESFEA-EKDHITPSL--LHNGFRGSDLPPDPHNCGKFDSTFM
:. :: .:::::::. .: :. ::: .:. ::::: .. ..:: .
CCDS11 SSSDV-GVSVIVKNVRNIDSSEGGEKDGHNPTGNGLHNGFLTAS---------SLDS--Y
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NGDSARSFPGKLEPPKSEPL---PTFNQFSPISSPEPEDPIKDNGFGIKPKHSD--SYFP
. :.:.:. : . : :: ::.::::::: : : . : . : : :
CCDS11 SKDGAKSLKGDV--PASEVTLKDSTFSQFSPISSAEEFDDDEKIEVDDPPDKEDMRSSFR
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KSD PPLGCGAVGGP---VLEALAKFPVPELHMFDHFCKKEPKPEPLPLGSQQEHEQSGQN--T
. :.. :.::. . . .. : . ..: : :. : .
CCDS11 SNVLTGSAPQQDYDKLKALGGENSSKTGLSTSGNVEKNK------AVKRETEASSINLSV
170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KSD VEPHKDPDATRFFGEALEFNSHP--SNSIGESKGLARELGTCS--SVPPRQRLKPAHSKL
:: : .: . :. .: : . ..: :. : . : :: : . . :::
CCDS11 YEPFK----VRKAEDKLKESSDKVLENRVLDGK-LSSEKNDTSLPSVAPSK--TKSSSKL
220 230 240 250 260
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SSCVAALVALQAKRVASVTKEDQPGHTKDLSGPTKESSKGSPKMP-KSPKSPRSPLEATR
:::.::..::.::..:: . .. ..... :.: . . ::. :::.: .. ...:.
CCDS11 SSCIAAIAALSAKKAASDSCKEPVANSRE-SSPLPKEVNDSPRAADKSPES-QNLIDGTK
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KSD K-SIKPSDSPRSICSDSSSKGSPSVAASSPPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRILPDPD
: :.: :::::: :..::::::: :.: ::::::::::::::::::::::::.::. :
CCDS11 KPSLKQPDSPRSISSENSSKGSPSSPAGSTPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRVLPEVD
330 340 350 360 370 380
400 410 420
pF1KSD -----DPSK-----------------------SPVGSPLGSAI---AEAPSEMPGDEV--
::. :: .:: ::. : .:.:. .:
CCDS11 LDSGKKPSEQTASVMASVTSLLSSPASAAVLSSPPRAPLQSAVVTNAVSPAELTPKQVTI
390 400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KSD -PVEEHF-PEAGTNSGSPQ--GARKGDESMTKASDSSSPSCSSGPRVPKGAAPGSQTGKK
:: : : ....... : . . .... .::. :. : .:. . :: . :
CCDS11 KPVATAFLPVSAVKTAGSQVINLKLANNTTVKATVISAASVQSASSAIIKAANAIQ----
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530
pF1KSD QQSTALQASTLAPANLLPKAVHLANLNLVPHSVAASVTAKSSVQRRSQPQLTQM------
::.... ::.:: :.:.::.::::::::.:... :. .. : . : :. :
CCDS11 QQTVVVPASSLANAKLVPKTVHLANLNLLPQGAQATSELRQ-VLTKPQQQIKQAIINAAA
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KSD SVP--LVHQVKKAAPL---IVEVFNKVLHSSNPVPLYAPNLSPPADSRIHVPASGYCCLE
: : : .:. .. : .::.::::: : ::::.: :::::::.. : .:. :: :::
CCDS11 SQPPKKVSRVQVVSSLQSSVVEAFNKVLSSVNPVPVYIPNLSPPANAGITLPTRGYKCLE
570 580 590 600 610 620
600 610 620 630 640 650
pF1KSD CGDAFALEKSLSQHYGRRSVHIEVLCTLCSKTLLFFNKCSLLRHARDHKSKGLVMQCSQL
:::.:::::::.::: ::::.::: :. :.:.:.:.:::::: ::: :: ::.:::::.:
CCDS11 CGDSFALEKSLTQHYDRRSVRIEVTCNHCTKNLVFYNKCSLLSHARGHKEKGVVMQCSHL
630 640 650 660 670 680
660 670 680 690
pF1KSD LVKPISADQMFVSAPVNSTAPAAP--APSSSPKHGLT---SG---------SASPPPPAL
..::. ::::.:: :... .. .: .. : .: :: :..: ::.
CCDS11 ILKPVPADQMIVSPSSNTSTSTSTLQSPVGAGTHTVTKIQSGITGTVISAPSSTPITPAM
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KSD PLYPDPVRLIRYSIKCLECHKQMRDYMVLAAHFQRTTEETEGLTCQVCQMLLPNQCSFCA
:: :: .: :.:.:::::.. ..: ::.:::.... . :: .::::::::::. .
CCDS11 PLDEDPSKLCRHSLKCLECNEVFQDETSLATHFQQAADTSGQKTCTICQMLLPNQCSYAS
750 760 770 780 790 800
760 770 780 790 800 810
pF1KSD HQRIHAHKSPYCCPECGVLCRSAYFQTHVKENCLHYARKVGYRCIHCGVVHLTLALLKSH
::::: ::::: :::::..:::..::::: .:::::.:.::.::.::.::. .: ::::
CCDS11 HQRIHQHKSPYTCPECGAICRSVHFQTHVTKNCLHYTRRVGFRCVHCNVVYSDVAALKSH
810 820 830 840 850 860
820 830 840 850 860 870
pF1KSD IQERHCQVFHKCAFCPMAFKTASSTADHSATQHPTQPHRPSQLIYKCS-CEMVFNKKRHI
:: ::.::.:: .::::::.: :: .:. :::: ..::::: :. ::. . .
CCDS11 IQGSHCEVFYKCPICPMAFKSAPSTHSHAYTQHPGIKIGEPKIIYKCSMCDTVFTLQTLL
870 880 890 900 910 920
880 890 900 910 920 930
pF1KSD QQHFYQNVSKTQVGVFKCPECPLLFVQKPELMQHVKSTHGVPRNVDELSNLQSSADTSSS
.:: :.. . .:.:::::.: ::..:: .:.:.:: ::. .... :: . :
CCDS11 YRHFDQHIENQKVSVFKCPDCSLLYAQKQLMMDHIKSMHGTLKSIEGPPNLGINLPLSI-
930 940 950 960 970
940 950 960 970 980 990
pF1KSD RPGSRVPTEPPATSVAARSSSLPSGRWGRPEAHRRVEARPRLRNTGWTCQECQEWVPDRE
.:... .. .. . ... . . ... .:.. .. . :::: ::. .:.
CCDS11 KPATQNSANQNKEDTKSMNGKEKLEKKSPSPVKKSMETK-KVASPGWTCWECDCLFMQRD
980 990 1000 1010 1020 1030
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD SYVSHMKKSHGRTLKRYPCRQCEQSFHTPNSLRKHIRNNHDTVKKFYTCGYCTEDSPSFP
:.::..: ::. .:..:::::..:: . .:: .: : .: ..: :.:..: .. .:
CCDS11 VYISHVRKEHGKQMKKHPCRQCDKSFSSSHSLCRHNRIKHKGIRKVYACSHCPDSRRTFT
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD RPSLLESHISLMHGIRNPDLSQ----TSKVKPPGGHSPQVNHLKRPVSGVGDAPGTSNGA
. .::.:..:::::..:::.. :.. . .. .: :: . ::
CCDS11 KRLMLEKHVQLMHGIKDPDLKEMTDATNEEETEIKEDTKVPSPKRKLEEPVLEFRPPRGA
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD TVSSTKRHK-SLFQ---CAKCSFATDSGLEFQSHIPQHQVDSSTAQCLLCGLCYTSASSL
.. :. : ..:. :: :.:.:.. :.:. :::::. :.:. :: ::::::: ::
CCDS11 ITQPLKKLKINVFKVHKCAVCGFTTENLLQFHEHIPQHKSDGSSYQCRECGLCYTSHVSL
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD SRHLFIVHKVRDQEEEEEEEAAAAEMAVEVAEPEEGSGEEVPMETRENGLEECAGEPLSA
:::::::::... . ....:. . : .: . . . :. . ::
CCDS11 SRHLFIVHKLKEPQPVSKQNGAGEDNQQENKPSHEDESPDGAVSDRKCKV--CAKTFETE
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1230 1240 1250 1260
pF1KSD DPEARRLLGPAPEDDGGHNDHSQPQASQDQDSHTLSPQV
CCDS11 AALNTHMRTHGMAFIKSKRMSSAEK
1280 1290 1300
>>CCDS992.1 ZNF687 gene_id:57592|Hs108|chr1 (1237 aa)
initn: 2075 init1: 519 opt: 641 Z-score: 314.0 bits: 70.3 E(32554): 3.6e-11
Smith-Waterman score: 2174; 36.1% identity (59.2% similar) in 1254 aa overlap (1-1179:1-1161)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGDMKTPDFDDLLAAFDIPDPTSLDAKEAIQTPSEENESPLKP----PGICMD-ESVSLS
:::::::::::::::::::: .::.:::.. ::::.: : ::. . :... .
CCDS99 MGDMKTPDFDDLLAAFDIPD---IDANEAIHSGPEENEGPGGPGKPEPGVGSESEDTAAA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KSD HSGSAPDVPA--------------VSVIVKNTSRQESFEAEKDHITPSLLHNGFRGSDLP
.:..: ::: :::::::: :. :: . . . . .. :
CCDS99 SAGDGPGVPAQASDHGLPPPDISVVSVIVKNTVCPEQSEALAGGSAGDGAQAAGVTKEGP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD PDPHNCGKFDSTFMNGDSARSFPGKLEPPKSEPLPTFNQFSPISSPEPEDPIKDNGFGIK
:: .... : :. :.:: . : :... . . . : : . :: .
CCDS99 VGPH---RMQNGF--GSPEPSLPGTPHSPAPPSGGTWKE-KGMEGKTPLDLFAH--FGPE
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210
pF1KSD P-KHSDSYFPPPLGCGAVGGPVLE-ALAKFPVP---ELHMFDHFCKKEPKPEPLPLGSQQ
: ::: .:: .. .:. : ::. : : :: . . . : : :::. .
CCDS99 PGDHSDP-LPP-----SAPSPTREGALTPPPFPSSFELAQENGPGMQPPVSSP-PLGALK
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EHEQSGQNTVEPHKDPDATRFFGEALEFNSHPSNSIGESKGLARELGTCSSVPPRQRLKP
:.. ::. :.. : . : :. : .. . .: :: . :
CCDS99 ------QESCSPHH-PQVLAQQGSG----SSPK---------ATDIPASASPPPVAGV-P
230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AHSKLSSCVAALVALQAKRVASVTKEDQPGHTKDLSGPTKESSKGSPKMPKSPKSPRSPL
.. . . :.. .. . .:: : ::. .:: : ::.:: :
CCDS99 FFKQSPGHQSPLASPKVPVCQPLKEED------DDEGPVDKSS------PGSPQSPSSGA
270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EATRKSIKPSDSPRSICSDSSSKGSPSVAASSPPAIPKVRIKTIKTSSGEIKRTVTRILP
:: .: .:. ::. ..: : :::::::::: :.: ::::..
CCDS99 EA---------------ADEDSNDSPASSSSRPL---KVRIKTIKTSCGNITRTVTQVPS
310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KSD DPDDPSKSPVGSPLGSAIAEAPSEMPGDEVPVEEHFPEAGTNSGSPQGAR-KGDESMTKA
::: :. :.. :. .::: . .:. : .... :. :.: :: . .
CCDS99 DPDPPA--PLAE--GAFLAEASLLKLSPATPTSEGPKVVSVQLGD--GTRLKGTVLPVAT
360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SDSSSPSCSSGPRVPKGAA--PGSQTGKKQQSTALQASTLAPANLLPKAVHLANLNLVPH
...: . . : . :. ::. :. . . : .. :.: . :::: :.:. .
CCDS99 IQNASTAMLMAASVARKAVVLPGG-TATSPKMIAKNVLGLVP-QALPKADGRAGLGTGGQ
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KSD SV-AASVTAKSSVQRRSQPQLTQMSVPLVHQVKKAAPLIVEVFNKVLHSSNPVPLYAPNL
.: .:::. . . . :. .: .... .::.:::.:.:.: .: : :::
CCDS99 KVNGASVVMVQPSKTATGPSTGGGTV-----ISRTQSSLVEAFNKILNSKNLLPAYRPNL
470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SPPADSRIHVPASGYCCLECGDAFALEKSLSQHYGRRSVHIEVLCTLCSKTLLFFNKCSL
::::.. . .: .:: ::::::::.:::::..:: :::..::: :. :.. :.:::::::
CCDS99 SPPAEAGLALPPTGYRCLECGDAFSLEKSLARHYDRRSMRIEVTCNHCARRLVFFNKCSL
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680
pF1KSD LRHARDHKSKGLVMQCSQLLVKPISADQMFVSAPVNSTAPAAPAPSSSP--------KHG
: :::.::.::::::::.:...:.. ::: . .. :.: : :.: .:
CCDS99 LLHAREHKDKGLVMQCSHLVMRPVALDQMVGQPDITPLLPVAVPPVSGPLALPALGKGEG
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730
pF1KSD LTSGSA----SPPPPALPLYPDPVRLIRYS----IKCLECHKQMRDYMVLAAHFQRTTEE
..:: . :.::: .: : ..::::..: :: .:::::.
CCDS99 AITSSAITTVAAEAPVLPLSTEPPAAPATSAYTCFRCLECKEQCRDKAGMAAHFQQLGPP
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KSD TEGLT---CQVCQMLLPNQCSFCAHQRIHAHKSPYCCPECGVLCRSAYFQTHVKENCLHY
. : : : .: :.:::.::: ::::.: .. :. ::::: .: ::::..: :::
CCDS99 APGATSNVCPTCPMMLPNRCSFSAHQRMHKNRPPHVCPECGGNFLQANFQTHLREACLHV
700 710 720 730 740 750
800 810 820 830 840 850
pF1KSD ARKVGYRCIHCGVVHLTLALLKSHIQERHCQVFHKCAFCPMAFKTASSTADHSATQHPTQ
.:.::::: :.:: . .::::: ::.::::: .::::::.. :. : .:::.
CCDS99 SRRVGYRCPSCSVVFGGVNSIKSHIQTSHCEVFHKCPICPMAFKSGPSAHAHLYSQHPSF
760 770 780 790 800 810
860 870 880 890 900 910
pF1KSD PHRPSQLIYKCS-CEMVFNKKRHIQQHFYQNVSKTQVGVFKCPECPLLFVQKPELMQHVK
. ..:::::. :. ::..: ...:: :.. .:.::::: :::::.:: ...:.:
CCDS99 QTQQAKLIYKCAMCDTVFTHKPLLSSHFDQHLLPQRVSVFKCPSCPLLFAQKRTMLEHLK
820 830 840 850 860 870
920 930 940 950 960
pF1KSD STHGVPRNVDELSNLQSSAD--TSSSRPGSRVPTE---PPATSVAARSSS---LPSG-RW
.:: : ..: .. ... : ...: . .. ::: .. :: .::. .
CCDS99 NTHQSGR-LEETAGKGAGGALLTPKTEPEELAVSQGGAAPATEESSSSSEEEEVPSSPEP
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010
pF1KSD GRPEAHRRVEARPR-LRNTG-----WTCQECQEWVPDRESYVSHMKKSHGRTLKRYPCRQ
:: . : : . :.. : ::: :. : :.:. ::.:::: ::...:..:::
CCDS99 PRPAKRPRRELGSKGLKGGGGGPGGWTCGLCHSWFPERDEYVAHMKKEHGKSVKKFPCRL
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD CEQSFHTPNSLRKHIRNNHDTVKKFYTCGYCTEDSPSFPRPSLLESHISLMHGI------
::.:: . :::.:.: ::. .:. : : :::: . .: .::.:... ::.
CCDS99 CERSFCSAPSLRRHVRVNHEGIKRVYPCRYCTEGKRTFSSRLILEKHVQVRHGLQLGAQS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD --RNPDLSQTS--KVKPPGGHSPQVNHL--KRPVSGVGDAPGTSNGATVSSTKRHKSLFQ
:. :.. : ... :: . : . ..: : . : . .: .. : :
CCDS99 PGRGTTLARGSSARAQGPGRKRRQSSDSCSEEPDSTTPPAKSPRGG---PGSGGHGPL--
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD CAKCSFATDSGLEFQSHIPQHQVDSSTAQCLLCGLCYTSASSLSRHLFIVHKVRDQEEEE
. ..:. : :: . .:.... ::: ::::..: .::::: :: :: :
CCDS99 ----RYRSSSSTE-QSLMMGLRVEDGAQQCLDCGLCFASPGSLSRHRFISHKKRRGVGKA
1120 1130 1140 1150 1160
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD EEEAAAAEMAVEVAEPEEGSGEEVPMETRENGLEECAGEPLSADPEARRLLGPAPEDDGG
CCDS99 SALGLGDGEEEAPPSRSDPDGGDSPLPASGGPLTCKVCGKSCDSPLNLKTHFRTHGMAFI
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1267 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 00:41:43 2016 done: Thu Nov 3 00:41:44 2016
Total Scan time: 4.860 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]