Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0215
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0215, 823 aa
1>>>pF1KSDA0215 823 - 823 aa - 823 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2514+/-0.00096; mu= 11.6751+/- 0.058
mean_var=113.3959+/-22.167, 0's: 0 Z-trim(108.2): 54 B-trim: 60 in 1/50
Lambda= 0.120441
statistics sampled from 10000 (10050) to 10000 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16
Scan time: 3.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX ( 823) 5667 996.1 0
CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 790) 1816 327.0 8e-89
CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 791) 1813 326.4 1.2e-88
CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 834) 1799 324.0 6.5e-88
CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 509) 1790 322.4 1.2e-87
CCDS34062.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 842) 1790 322.4 1.9e-87
CCDS75191.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 830) 1407 255.9 2.1e-67
CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119) 699 132.9 2.9e-30
CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213) 699 132.9 3.1e-30
CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1214) 699 132.9 3.1e-30
CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1220) 699 132.9 3.1e-30
CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1058) 688 131.0 1e-29
CCDS77686.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1189) 688 131.0 1.2e-29
CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6 (1205) 647 123.9 1.6e-27
CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027) 466 92.4 4.1e-18
CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1068) 466 92.4 4.3e-18
CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093) 450 89.7 3e-17
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096) 387 78.7 5.9e-14
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056) 385 78.4 7.3e-14
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064) 360 74.0 1.5e-12
>>CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX (823 aa)
initn: 5667 init1: 5667 opt: 5667 Z-score: 5324.2 bits: 996.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5667; 100.0% identity (100.0% similar) in 823 aa overlap (1-823:1-823)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPDSHHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPDSHHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCSSPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCSSPDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLERHCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLERHCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEPITKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEPITKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEVKFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEVKFKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVAAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVAAEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPRIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPLES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KNNRLLASLSHSRSEAKESSPAWRTPSSECYHGQSLGKPLVLQAALHGQSSIGNGKSQPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KNNRLLASLSHSRSEAKESSPAWRTPSSECYHGQSLGKPLVLQAALHGQSSIGNGKSQPN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SKFAKSNGLEGSWSGNVTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQGSFRKSTVEHFSRSFKETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SKFAKSNGLEGSWSGNVTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQGSFRKSTVEHFSRSFKETT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KSD DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR
790 800 810 820
>>CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 (790 aa)
initn: 2154 init1: 1279 opt: 1816 Z-score: 1708.1 bits: 327.0 E(32554): 8e-89
Smith-Waterman score: 2084; 43.9% identity (67.2% similar) in 805 aa overlap (2-786:4-772)
10 20 30 40
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPN---------EHKKPAEVFRKDLI
::.. :::.:: . : . :: : : ::.:. ..:::.:::: :::
CCDS41 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHA-TSTSASRC-SKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SAMKLPDSHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRP
.:::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : :
CCDS41 TAMKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPP-----LEGPP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLME
. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
CCDS41 AQ----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLE
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQ
...: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::
CCDS41 RVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQ
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA
::::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.
CCDS41 ACYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KSD CPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTI
:::.::::::::::: ::::: :.::: ::.:::::. ::.:::::::::.:::::.::
CCDS41 CPEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTI
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LDEGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEF
: ..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.:
CCDS41 LADNDEVKFKSFCQEHSDG----GPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDF
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KSD YSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHT
: ::. .:: .: . :::::.:::::::.: :.::. :: :: ..:.: ... ..
CCDS41 YELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNA
:...: :::::::::::::::..:::. : . :.::::: ::..:..:.. :: .
CCDS41 RLKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRGLSTSFP
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLE
.....: .... : :. : .. : : . .. : . .: .:.:
CCDS41 IDGTFFNSWLAQSVQI-----TAENMAMSEWPLNNG-HREDPAPGLLSEELLQ-DEETLL
530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD MRTKSYPRYPLESKNNRLLASLSHSRSEAKESSPA---WRTPSSECYHGQSLGKPLVLQA
:. : : .. . ...: ::.. : :.:. .. : :
CCDS41 ----SFMRDPSLRPGDPARKARGRTRLPAKKKPPPPPPQDGPGSRTTPDKA-PKKTWGQD
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KSD ALHGQSSIGNGKSQPNSKFAKSNGLEGS-WSGN--VTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQ
: :... : .: . :. : .: .:. . : . . : . ....
CCDS41 AGSGKGGQGPPTRKPPRR--TSSHLPSSPAAGDCPILATPESPPPLAPETPDEAASVAAD
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KSD GSFRKSTVEHFSRSF-KETTNRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAP
.. . . . . : : :. : ..: .:.: : .:
CCDS41 SDVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRRLPG-ARPDAGMGPPS-----AVAERPKVSLH
700 710 720 730 740
770 780 790 800 810
pF1KSD YQ-ENDGYCPDLELSDSEAES-DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSH
.. :.::: : :.:::..:. ::. ..
CCDS41 FDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAEEVVRMGVLAS
750 760 770 780 790
>>CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 (791 aa)
initn: 2137 init1: 1279 opt: 1813 Z-score: 1705.3 bits: 326.4 E(32554): 1.2e-88
Smith-Waterman score: 2081; 43.9% identity (67.2% similar) in 806 aa overlap (2-786:4-773)
10 20 30 40
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPN---------EHKKPAEVFRKDLI
::.. :::.:: . : . :: : : ::.:. ..:::.:::: :::
CCDS75 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHA-TSTSASRC-SKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SAMKLPDSHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRP
.:::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : :
CCDS75 TAMKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPP-----LEGPP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLME
. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
CCDS75 AQ----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLE
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQ
...: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::
CCDS75 RVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQ
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA
::::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.
CCDS75 ACYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KSD CPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTI
:::.::::::::::: ::::: :.::: ::.:::::. ::.:::::::::.:::::.::
CCDS75 CPEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTI
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LDEGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEF
: ..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.:
CCDS75 LADNDEVKFKSFCQEHSDG----GPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDF
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KSD YSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHT
: ::. .:: .: . :::::.:::::::.: :.::. :: :: ..:.: ... ..
CCDS75 YELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEI-DAGLPLTN
:...: :::::::::::::::..:::. : . :.::::: ::..:..:.. ::: .
CCDS75 RLKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRAGLSTSF
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD ALENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESL
.....: .... : :. : .. : : . .. : . .: .:.:
CCDS75 PIDGTFFNSWLAQSVQI-----TAENMAMSEWPLNNG-HREDPAPGLLSEELLQ-DEETL
530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD EMRTKSYPRYPLESKNNRLLASLSHSRSEAKESSPA---WRTPSSECYHGQSLGKPLVLQ
:. : : .. . ...: ::.. : :.:. .. : :
CCDS75 L----SFMRDPSLRPGDPARKARGRTRLPAKKKPPPPPPQDGPGSRTTPDKA-PKKTWGQ
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KSD AALHGQSSIGNGKSQPNSKFAKSNGLEGS-WSGN--VTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVS
: :... : .: . :. : .: .:. . : . . : . ...
CCDS75 DAGSGKGGQGPPTRKPPRR--TSSHLPSSPAAGDCPILATPESPPPLAPETPDEAASVAA
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750
pF1KSD QGSFRKSTVEHFSRSF-KETTNRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRA
... . . . . : : :. : ..: .:.: : .:
CCDS75 DSDVQVPGPAASPKPLGRLRPPRESKVTRRLPG-ARPDAGMGPPS-----AVAERPKVSL
700 710 720 730 740
760 770 780 790 800 810
pF1KSD PYQ-ENDGYCPDLELSDSEAES-DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLS
.. :.::: : :.:::..:. ::. ..
CCDS75 HFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAEEVVRMGVLAS
750 760 770 780 790
>>CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 (834 aa)
initn: 2137 init1: 1279 opt: 1799 Z-score: 1691.8 bits: 324.0 E(32554): 6.5e-88
Smith-Waterman score: 2053; 56.6% identity (78.6% similar) in 528 aa overlap (2-518:4-515)
10 20 30 40
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPN---------EHKKPAEVFRKDLI
::.. :::.:: . : . :: : : ::.:. ..:::.:::: :::
CCDS78 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHA-TSTSASRC-SKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SAMKLPDSHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRP
.:::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : :
CCDS78 TAMKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPP-----LEGPP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLME
. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
CCDS78 AQ----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLE
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQ
...: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::
CCDS78 RVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQ
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA
::::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.
CCDS78 ACYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KSD CPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTI
:::.::::::::::: ::::: :.::: ::.:::::. ::.:::::::::.:::::.::
CCDS78 CPEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTI
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LDEGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEF
: ..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.:
CCDS78 LADNDEVKFKSFCQEHSDG----GPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDF
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KSD YSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHT
: ::. .:: .: . :::::.:::::::.: :.::. :: :: ..:.: ... ..
CCDS78 YELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNA
:...: :::::::::::::::..:::. : . :.::::: ::..:..:..
CCDS78 RLKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRERSGRRA
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLE
CCDS78 KGKKSDSKRKGCEGSKGSTEKKEKVKAGPDSVLGQLAGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQI
530 540 550 560 570 580
>>CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 (509 aa)
initn: 1829 init1: 1427 opt: 1790 Z-score: 1686.7 bits: 322.4 E(32554): 1.2e-87
Smith-Waterman score: 2113; 60.0% identity (81.7% similar) in 503 aa overlap (1-482:1-502)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFT----SGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPD
::: : :::..::.. : : : : :..: .: .: .::.:::: :::.:::: :
CCDS47 MKRGRLPSSSEDSDDNGSLSTTWSQNSRSQHRRSSCSRHEDRKPSEVFRTDLITAMKLHD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCS
:...::: ::..:: :..:::::::::.:: :.::: :...:. :...::::.::: :
CCDS47 SYQLNPDEYYVLADPWRQEWEKGVQVPVSPGTIPQPVARVVSEE-KSLMFIRPKKYIVSS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLE
. . : ::..: :: :::::::.::: ::. ::.. ::: .:: ::...: .:
CCDS47 GSEPPELGYVDIRTLADSVCRYDLNDMDAAWLELTNEEFKEMGMPELDEYTMERVLEEFE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILK
..:..::::::::::::::::::::.::::.:::.:.::.::::::::.:::::::::::
CCDS47 QRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNICVHQACYGILK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEP
:::::::::.:.::. :.:.::::::::.: :..::::.:::::::::::::. ::.:::
CCDS47 VPEGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGSPEKMEP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEV
:::.:::: :::::::.::. : :: ::::.:.: :::::::::..:::::::: :.:::
CCDS47 ITKVSHIPSSRWALVCSLCNEKFGASIQCSVKNCRTAFHVTCAFDRGLEMKTILAENDEV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KSD KFKSYCLKHSQNRQ---KLGEAEYPHHRAKE--------------QSQAKSEKTSLRAQK
:::::: :::..:. .::.. .. : : :.. .....:.: ::
CCDS47 KFKSYCPKHSSHRKPEESLGKGAAQENGAPECSPRNPLEPFASLEQNREEAHRVSVRKQK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LRELEEEFYSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQ
:..::.:::..: . ::: : .: .:::.:.::::::: ::::::. ::.:::..:..
CCDS47 LQQLEDEFYTFVNLLDVARALRLPEEVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLITPKKDEEDNLAK
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PKEESIHTRMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEID
... . :...: :::::::::
CCDS47 REQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVMIDTDTL
480 490 500
>>CCDS34062.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 (842 aa)
initn: 2108 init1: 1427 opt: 1790 Z-score: 1683.3 bits: 322.4 E(32554): 1.9e-87
Smith-Waterman score: 2316; 46.6% identity (70.3% similar) in 835 aa overlap (1-784:1-820)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFT----SGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPD
::: : :::..::.. : : : : :..: .: .: .::.:::: :::.:::: :
CCDS34 MKRGRLPSSSEDSDDNGSLSTTWSQNSRSQHRRSSCSRHEDRKPSEVFRTDLITAMKLHD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCS
:...::: ::..:: :..:::::::::.:: :.::: :...:. :...::::.::: :
CCDS34 SYQLNPDEYYVLADPWRQEWEKGVQVPVSPGTIPQPVARVVSEE-KSLMFIRPKKYIVSS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLE
. . : ::..: :: :::::::.::: ::. ::.. ::: .:: ::...: .:
CCDS34 GSEPPELGYVDIRTLADSVCRYDLNDMDAAWLELTNEEFKEMGMPELDEYTMERVLEEFE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILK
..:..::::::::::::::::::::.::::.:::.:.::.::::::::.:::::::::::
CCDS34 QRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNICVHQACYGILK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEP
:::::::::.:.::. :.:.::::::::.: :..::::.:::::::::::::. ::.:::
CCDS34 VPEGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGSPEKMEP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEV
:::.:::: :::::::.::. : :: ::::.:.: :::::::::..:::::::: :.:::
CCDS34 ITKVSHIPSSRWALVCSLCNEKFGASIQCSVKNCRTAFHVTCAFDRGLEMKTILAENDEV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KSD KFKSYCLKHSQNRQ---KLGEAEYPHHRAKE--------------QSQAKSEKTSLRAQK
:::::: :::..:. .::.. .. : : :.. .....:.: ::
CCDS34 KFKSYCPKHSSHRKPEESLGKGAAQENGAPECSPRNPLEPFASLEQNREEAHRVSVRKQK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LRELEEEFYSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQ
:..::.:::..: . ::: : .: .:::.:.::::::: ::::::. ::.:::..:..
CCDS34 LQQLEDEFYTFVNLLDVARALRLPEEVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLITPKKDEEDNLAK
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PKEESIHTRMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEID
... . :...: :::::::::::: ::..::::.: : :.:::::.: ..::.::
CCDS34 REQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVRNLTYMVTRREKIKRSVCKVQEQIFNLYTKLLEQERV
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD AGLPLT---NALENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSI
.:.: . ..::: :.. : . :: :: . :. .: ..: :::.
CCDS34 SGVPSSCSSSSLENMLLFNSPSVGPD--APKI--EDLKWHSAFFRKQM----GTSLVHSL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD R--NMQVP-QESLEMRTKSYPRYP-LESKNNRLLA-----SLSHSRSEAKESSPAWRTPS
. . . : :.: . :. . : : .. . ... .: .. .::. : ..
CCDS34 KKPHKRDPLQNSPGSEGKTLLKQPDLCGRREGMVVPESFLGLEKTFAEARLISAQQKNGV
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670
pF1KSD SECYHGQSLGKPL---VLQAALHGQSSIGNGK-------SQ---PNSKFAKSNGLEGSWS
::. . . .... :. .: . : :: :.. : : :. :
CCDS34 VMPDHGKRRDNRFHCDLIKGDLKDKSFKQSHKPLRSTDVSQRHLDNTRAATSPGVGQSAP
660 670 680 690 700 710
680 690 700 710 720
pF1KSD GNVTQKDSSSEMFCDQEPV---FSPHLVSQGSFRKSTVEHFS--RSFKETTNRWVKNTED
: :.:. . :. . .. :. . : :.... : :. . ...:
CCDS34 G--TRKEIVPK--CNGSLIKVNYNQTAVKVPTTPASPVKNWGGFRIPKKGERQQQGEAHD
720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAESDGNKEKVRV
:. . . . ... : .. .::::: ::.:.::::.:.. .:
CCDS34 GACHQHSDYPYLGLGRVPAKE--RAKSKLKSDNENDGYVPDVEMSDSESEASEKKCIHTS
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820
pF1KSD RKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR
CCDS34 STISRRTDIIRRSILAS
830 840
>>CCDS75191.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 (830 aa)
initn: 2084 init1: 1403 opt: 1407 Z-score: 1323.7 bits: 255.9 E(32554): 2.1e-67
Smith-Waterman score: 2249; 46.1% identity (69.1% similar) in 835 aa overlap (1-784:1-808)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFT----SGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPD
::: : :::..::.. : : : : :..: .: .: .::.:::: :::.:::: :
CCDS75 MKRGRLPSSSEDSDDNGSLSTTWSQNSRSQHRRSSCSRHEDRKPSEVFRTDLITAMKLHD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCS
:...::: ::..:: :..:::::::::.:: :.::: .: ::.::: :
CCDS75 SYQLNPDEYYVLADPWRQEWEKGVQVPVSPGTIPQP----VA---------RPKKYIVSS
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLE
. . : ::..: :: :::::::.::: ::. ::.. ::: .:: ::...: .:
CCDS75 GSEPPELGYVDIRTLADSVCRYDLNDMDAAWLELTNEEFKEMGMPELDEYTMERVLEEFE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD RHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILK
..:..::::::::::::::::::::.::::.:::.:.::.::::::::.:::::::::::
CCDS75 QRCYDNMNHAIETEEGLGIEYDEDVVCDVCQSPDGEDGNEMVFCDKCNICVHQACYGILK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEP
:::::::::.:.::. :.:.::::::::.: :..::::.:::::::::::::. ::.:::
CCDS75 VPEGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKKGGAMKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIGSPEKMEP
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEV
:::.:::: :::::::.::. : :: ::::.:.: :::::::::..:::::::: :.:::
CCDS75 ITKVSHIPSSRWALVCSLCNEKFGASIQCSVKNCRTAFHVTCAFDRGLEMKTILAENDEV
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KSD KFKSYCLKHSQNRQ---KLGEAEYPHHRAKE--------------QSQAKSEKTSLRAQK
:::::: :::..:. .::.. .. : : :.. .....:.: ::
CCDS75 KFKSYCPKHSSHRKPEESLGKGAAQENGAPECSPRNPLEPFASLEQNREEAHRVSVRKQK
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LRELEEEFYSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQ
:..::.:::..: . ::: : .: .:::.:.::::::: ::::::. ::.:::..:..
CCDS75 LQQLEDEFYTFVNLLDVARALRLPEEVVDFLYQYWKLKRKVNFNKPLITPKKDEEDNLAK
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PKEESIHTRMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEID
... . :...: :::::::::::: ::..::::.: : :.:::::.: ..::.::
CCDS75 REQDVLFRRLQLFTHLRQDLERVRNLTYMVTRREKIKRSVCKVQEQIFNLYTKLLEQERV
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KSD AGLPLT---NALENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSI
.:.: . ..::: :.. : . :: :: . :. .: ..: :::.
CCDS75 SGVPSSCSSSSLENMLLFNSPSVGPD--APKI--EDLKWHSAFFRKQM----GTSLVHSL
530 540 550 560 570
580 590 600 610 620
pF1KSD R--NMQVP-QESLEMRTKSYPRYP-LESKNNRLLA-----SLSHSRSEAKESSPAWRTPS
. . . : :.: . :. . : : .. . ... .: .. .::. : ..
CCDS75 KKPHKRDPLQNSPGSEGKTLLKQPDLCGRREGMVVPESFLGLEKTFAEARLISAQQKNGV
580 590 600 610 620 630
630 640 650 660 670
pF1KSD SECYHGQSLGKPL---VLQAALHGQSSIGNGK-------SQ---PNSKFAKSNGLEGSWS
::. . . .... :. .: . : :: :.. : : :. :
CCDS75 VMPDHGKRRDNRFHCDLIKGDLKDKSFKQSHKPLRSTDVSQRHLDNTRAATSPGVGQSAP
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720
pF1KSD GNVTQKDSSSEMFCDQEPV---FSPHLVSQGSFRKSTVEHFS--RSFKETTNRWVKNTED
: :.:. . :. . .. :. . : :.... : :. . ...:
CCDS75 G--TRKEIVPK--CNGSLIKVNYNQTAVKVPTTPASPVKNWGGFRIPKKGERQQQGEAHD
700 710 720 730 740 750
730 740 750 760 770 780
pF1KSD LQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAESDGNKEKVRV
:. . . . ... : .. .::::: ::.:.::::.:.. .:
CCDS75 GACHQHSDYPYLGLGRVPAKE--RAKSKLKSDNENDGYVPDVEMSDSESEASEKKCIHTS
760 770 780 790 800 810
790 800 810 820
pF1KSD RKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR
CCDS75 STISRRTDIIRRSILAS
820 830
>>CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119 aa)
initn: 770 init1: 234 opt: 699 Z-score: 656.8 bits: 132.9 E(32554): 2.9e-30
Smith-Waterman score: 792; 33.3% identity (60.0% similar) in 423 aa overlap (138-511:215-630)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RPRKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENL
::.:. : .::. .:: : .:. ...
CCDS82 EQDTPDAPPRPTSYYRYIEKSAEELDEEVEYDMDEEDYIWLDIMNERRKTEGVSPIPQEI
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KSD MEKTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCV
.: .. ::.. . . .: ..: :::..: .: . . ...: ..::: ::. :
CCDS82 FEYLMDRLEKESYFE-SHNKGDPNAL---VDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDMCNLAV
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KSD HQACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQ----CVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWI
:: :::. .:::.:::: :. . :. :.:::.::::.: : : .:::: :::::
CCDS82 HQECYGVPYIPEGQWLCRRCLQS--PSRAVDCALCPNKGGAFKQTDDG-RWAHVVCALWI
310 320 330 340 350
290 300 310 320 330 340
pF1KSD PEVSIACPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLK-TGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEH
::: .: .::: .: ::::.:: :.: .:: . .:::::: .: :::::::: .
CCDS82 PEVCFANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTCYICKQRGSGACIQCHKANCYTAFHVTCAQQA
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380
pF1KSD GLEMKT--ILDEGDE-----VKFKSYC--------------LKHSQNRQKLGEAEYPHHR
:: :: . . : . :. .:: :.::.... : : .
CCDS82 GLYMKMEPVRETGANGTSFSVRKTAYCDIHTPPGSARRLPALSHSEGEEDEDEEEDEGKG
420 430 440 450 460 470
390 400 410 420
pF1KSD -AKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLV-----------RVEDVAAELGMPTLA--V
..:. . . :. .. .: :.. : . . :. .. .: . . .
CCDS82 WSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKSQFM
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470
pF1KSD DFIYNYWKLKRKSNFNKPLF--------PPKEDEENGL-VQPKEESIHTRMRMFMHLRQD
. ...:: :::.: . ::. .. .. : . :. ... ... ...::.:
CCDS82 QRLHSYWTLKRQSRNGVPLLRRLQTHLQSQRNCDQVGRDSEDKNWALKEQLKSWQRLRHD
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPR
:::.: : .: .::::: :.:. . .:.
CCDS82 LERARLLVELIRKREKLKRETIKVQQIAMEMQLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPV
600 610 620 630 640 650
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPL
CCDS82 PLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRA
660 670 680 690 700 710
>>CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213 aa)
initn: 765 init1: 234 opt: 699 Z-score: 656.3 bits: 132.9 E(32554): 3.1e-30
Smith-Waterman score: 792; 33.3% identity (60.0% similar) in 423 aa overlap (138-511:215-630)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RPRKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENL
::.:. : .::. .:: : .:. ...
CCDS82 EQDTPDAPPRPTSYYRYIEKSAEELDEEVEYDMDEEDYIWLDIMNERRKTEGVSPIPQEI
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KSD MEKTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCV
.: .. ::.. . . .: ..: :::..: .: . . ...: ..::: ::. :
CCDS82 FEYLMDRLEKESYFE-SHNKGDPNAL---VDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDMCNLAV
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KSD HQACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQ----CVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWI
:: :::. .:::.:::: :. . :. :.:::.::::.: : : .:::: :::::
CCDS82 HQECYGVPYIPEGQWLCRRCLQS--PSRAVDCALCPNKGGAFKQTDDG-RWAHVVCALWI
310 320 330 340 350
290 300 310 320 330 340
pF1KSD PEVSIACPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLK-TGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEH
::: .: .::: .: ::::.:: :.: .:: . .:::::: .: :::::::: .
CCDS82 PEVCFANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTCYICKQRGSGACIQCHKANCYTAFHVTCAQQA
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380
pF1KSD GLEMKT--ILDEGDE-----VKFKSYC--------------LKHSQNRQKLGEAEYPHHR
:: :: . . : . :. .:: :.::.... : : .
CCDS82 GLYMKMEPVRETGANGTSFSVRKTAYCDIHTPPGSARRLPALSHSEGEEDEDEEEDEGKG
420 430 440 450 460 470
390 400 410 420
pF1KSD -AKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLV-----------RVEDVAAELGMPTLA--V
..:. . . :. .. .: :.. : . . :. .. .: . . .
CCDS82 WSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKSQFM
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470
pF1KSD DFIYNYWKLKRKSNFNKPLF--------PPKEDEENGL-VQPKEESIHTRMRMFMHLRQD
. ...:: :::.: . ::. .. .. : . :. ... ... ...::.:
CCDS82 QRLHSYWTLKRQSRNGVPLLRRLQTHLQSQRNCDQVGRDSEDKNWALKEQLKSWQRLRHD
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPR
:::.: : .: .::::: :.:. . .:.
CCDS82 LERARLLVELIRKREKLKRETIKVQQIAMEMQLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPV
600 610 620 630 640 650
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPL
CCDS82 PLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRA
660 670 680 690 700 710
>>CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1214 aa)
initn: 770 init1: 234 opt: 699 Z-score: 656.3 bits: 132.9 E(32554): 3.1e-30
Smith-Waterman score: 792; 33.3% identity (60.0% similar) in 423 aa overlap (138-511:215-630)
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RPRKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENL
::.:. : .::. .:: : .:. ...
CCDS25 EQDTPDAPPRPTSYYRYIEKSAEELDEEVEYDMDEEDYIWLDIMNERRKTEGVSPIPQEI
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
pF1KSD MEKTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCV
.: .. ::.. . . .: ..: :::..: .: . . ...: ..::: ::. :
CCDS25 FEYLMDRLEKESYFE-SHNKGDPNAL---VDEDAVCCICNDGECQNSNVILFCDMCNLAV
250 260 270 280 290 300
230 240 250 260 270 280
pF1KSD HQACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQ----CVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWI
:: :::. .:::.:::: :. . :. :.:::.::::.: : : .:::: :::::
CCDS25 HQECYGVPYIPEGQWLCRRCLQS--PSRAVDCALCPNKGGAFKQTDDG-RWAHVVCALWI
310 320 330 340 350
290 300 310 320 330 340
pF1KSD PEVSIACPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLK-TGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEH
::: .: .::: .: ::::.:: :.: .:: . .:::::: .: :::::::: .
CCDS25 PEVCFANTVFLEPIDSIEHIPPARWKLTCYICKQRGSGACIQCHKANCYTAFHVTCAQQA
360 370 380 390 400 410
350 360 370 380
pF1KSD GLEMKT--ILDEGDE-----VKFKSYC--------------LKHSQNRQKLGEAEYPHHR
:: :: . . : . :. .:: :.::.... : : .
CCDS25 GLYMKMEPVRETGANGTSFSVRKTAYCDIHTPPGSARRLPALSHSEGEEDEDEEEDEGKG
420 430 440 450 460 470
390 400 410 420
pF1KSD -AKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLV-----------RVEDVAAELGMPTLA--V
..:. . . :. .. .: :.. : . . :. .. .: . . .
CCDS25 WSSEKVKKAKAKSRIKMKKARKILAEKRAAAPVVSVPCIPPHRLSKITNRLTIQRKSQFM
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470
pF1KSD DFIYNYWKLKRKSNFNKPLF--------PPKEDEENGL-VQPKEESIHTRMRMFMHLRQD
. ...:: :::.: . ::. .. .. : . :. ... ... ...::.:
CCDS25 QRLHSYWTLKRQSRNGVPLLRRLQTHLQSQRNCDQVGRDSEDKNWALKEQLKSWQRLRHD
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KSD LERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPR
:::.: : .: .::::: :.:. . .:.
CCDS25 LERARLLVELIRKREKLKRETIKVQQIAMEMQLTPFLILLRKTLEQLQEKDTGNIFSEPV
600 610 620 630 640 650
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPL
CCDS25 PLSEVPDYLDHIKKPMDFFTMKQNLEAYRYLNFDDFEEDFNLIVSNCLKYNAKDTIFYRA
660 670 680 690 700 710
823 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 00:43:45 2016 done: Thu Nov 3 00:43:45 2016
Total Scan time: 3.910 Total Display time: 0.250
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]