Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0215
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0215, 823 aa
1>>>pF1KSDA0215 823 - 823 aa - 823 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7960+/-0.000389; mu= 8.5943+/- 0.024
mean_var=128.7432+/-24.721, 0's: 0 Z-trim(115.9): 151 B-trim: 141 in 3/52
Lambda= 0.113035
statistics sampled from 26587 (26745) to 26587 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.314), width: 16
Scan time: 12.390
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055550 (OMIM: 300618) protein Jade-3 [Homo sapi ( 823) 5667 936.1 0
NP_001070913 (OMIM: 300618) protein Jade-3 [Homo s ( 823) 5667 936.1 0
NP_056103 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform 3 ( 790) 1816 308.1 1e-82
NP_001276913 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform ( 791) 1813 307.6 1.4e-82
XP_016864771 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 833) 1799 305.3 7.2e-82
XP_005272002 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 834) 1799 305.3 7.2e-82
XP_005272003 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 834) 1799 305.3 7.2e-82
XP_005272005 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 834) 1799 305.3 7.2e-82
NP_001295072 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform ( 834) 1799 305.3 7.2e-82
XP_011541593 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jad ( 834) 1799 305.3 7.2e-82
NP_001276914 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform ( 850) 1799 305.3 7.4e-82
NP_001274370 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 509) 1790 303.8 1.3e-81
NP_079176 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform 2 ( 509) 1790 303.8 1.3e-81
XP_016864116 (OMIM: 610514) PREDICTED: protein Jad ( 529) 1790 303.8 1.3e-81
XP_016864115 (OMIM: 610514) PREDICTED: protein Jad ( 529) 1790 303.8 1.3e-81
NP_001274371 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 842) 1790 303.8 2e-81
NP_001274372 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 842) 1790 303.8 2e-81
XP_005263289 (OMIM: 610514) PREDICTED: protein Jad ( 842) 1790 303.8 2e-81
NP_001274369 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 842) 1790 303.8 2e-81
NP_001274368 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 842) 1790 303.8 2e-81
NP_955352 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform 1 ( 842) 1790 303.8 2e-81
NP_001274366 (OMIM: 610514) protein Jade-1 isoform ( 830) 1407 241.4 1.3e-62
NP_001305978 (OMIM: 602410) peregrin isoform 3 [Ho (1119) 699 126.0 9.4e-28
XP_005265509 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1125) 699 126.0 9.4e-28
NP_001305979 (OMIM: 602410) peregrin isoform 4 [Ho (1213) 699 126.0 1e-27
NP_004625 (OMIM: 602410) peregrin isoform 2 [Homo (1214) 699 126.0 1e-27
XP_005265507 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1219) 699 126.0 1e-27
NP_001003694 (OMIM: 602410) peregrin isoform 1 [Ho (1220) 699 126.0 1e-27
XP_005265506 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1247) 699 126.0 1e-27
XP_011532404 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1248) 699 126.0 1e-27
XP_011532403 (OMIM: 602410) PREDICTED: peregrin is (1248) 699 126.0 1e-27
XP_016884210 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 941) 688 124.2 2.8e-27
XP_016884209 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 955) 688 124.2 2.8e-27
XP_016884208 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain ( 958) 688 124.2 2.8e-27
XP_016884207 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1023) 688 124.2 3e-27
NP_001291738 (OMIM: 604589) bromodomain-containing (1058) 688 124.2 3.1e-27
XP_016884203 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1187) 688 124.2 3.4e-27
XP_016884204 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 688 124.2 3.4e-27
NP_001291737 (OMIM: 604589) bromodomain-containing (1189) 688 124.2 3.4e-27
XP_016884206 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 688 124.2 3.4e-27
XP_016884205 (OMIM: 604589) PREDICTED: bromodomain (1189) 688 124.2 3.4e-27
XP_011512794 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain ( 832) 647 117.5 2.6e-25
XP_016866231 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1088) 647 117.5 3.3e-25
XP_011512793 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1131) 647 117.5 3.4e-25
XP_011512792 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1144) 647 117.5 3.4e-25
XP_005249067 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 647 117.5 3.6e-25
NP_056510 (OMIM: 616856) bromodomain and PHD finge (1205) 647 117.5 3.6e-25
XP_011512791 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 647 117.5 3.6e-25
XP_005249068 (OMIM: 616856) PREDICTED: bromodomain (1205) 647 117.5 3.6e-25
NP_004632 (OMIM: 602409) protein AF-10 isoform a [ (1027) 466 88.0 2.4e-16
>>NP_055550 (OMIM: 300618) protein Jade-3 [Homo sapiens] (823 aa)
initn: 5667 init1: 5667 opt: 5667 Z-score: 4999.8 bits: 936.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5667; 100.0% identity (100.0% similar) in 823 aa overlap (1-823:1-823)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPDSHHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPDSHHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCSSPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCSSPDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLERHCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLERHCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEPITKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEPITKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEVKFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEVKFKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVAAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 YCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVAAEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPRIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPLES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KNNRLLASLSHSRSEAKESSPAWRTPSSECYHGQSLGKPLVLQAALHGQSSIGNGKSQPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KNNRLLASLSHSRSEAKESSPAWRTPSSECYHGQSLGKPLVLQAALHGQSSIGNGKSQPN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SKFAKSNGLEGSWSGNVTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQGSFRKSTVEHFSRSFKETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SKFAKSNGLEGSWSGNVTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQGSFRKSTVEHFSRSFKETT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KSD DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR
790 800 810 820
>>NP_001070913 (OMIM: 300618) protein Jade-3 [Homo sapie (823 aa)
initn: 5667 init1: 5667 opt: 5667 Z-score: 4999.8 bits: 936.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5667; 100.0% identity (100.0% similar) in 823 aa overlap (1-823:1-823)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPDSHHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPNEHKKPAEVFRKDLISAMKLPDSHHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCSSPDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRPRKYIHCSSPDT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLERHCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLMEKTVEVLERHCH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD ENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQACYGILKVPEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD SWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEPITKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIACPERMEPITKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEVKFKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTILDEGDEVKFKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVAAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKSEKTSLRAQKLRELEEEFYSLVRVEDVAAEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHTRMRMFMHLRQDLE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPRIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNALENSLFYPPPRIT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLEMRTKSYPRYPLES
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KNNRLLASLSHSRSEAKESSPAWRTPSSECYHGQSLGKPLVLQAALHGQSSIGNGKSQPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNNRLLASLSHSRSEAKESSPAWRTPSSECYHGQSLGKPLVLQAALHGQSSIGNGKSQPN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SKFAKSNGLEGSWSGNVTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQGSFRKSTVEHFSRSFKETT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SKFAKSNGLEGSWSGNVTQKDSSSEMFCDQEPVFSPHLVSQGSFRKSTVEHFSRSFKETT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NRWVKNTEDLQCYVKPTKNMSPKEQFWGRQVLRRSAGRAPYQENDGYCPDLELSDSEAES
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KSD DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGNKEKVRVRKDSSDRENPPHDSRRDCHGKSKTHPLSHSSMQR
790 800 810 820
>>NP_056103 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform 3 [Hom (790 aa)
initn: 2154 init1: 1279 opt: 1816 Z-score: 1606.1 bits: 308.1 E(85289): 1e-82
Smith-Waterman score: 2084; 43.9% identity (67.2% similar) in 805 aa overlap (2-786:4-772)
10 20 30 40
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPN---------EHKKPAEVFRKDLI
::.. :::.:: . : . :: : : ::.:. ..:::.:::: :::
NP_056 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHA-TSTSASRC-SKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLI
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SAMKLPDSHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRP
.:::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : :
NP_056 TAMKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPP-----LEGPP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLME
. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
NP_056 AQ----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLE
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQ
...: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::
NP_056 RVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQ
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA
::::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.
NP_056 ACYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KSD CPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTI
:::.::::::::::: ::::: :.::: ::.:::::. ::.:::::::::.:::::.::
NP_056 CPEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTI
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LDEGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEF
: ..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.:
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350 360 370 380 390 400
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: ::. .:: .: . :::::.:::::::.: :.::. :: :: ..:.: ... ..
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:...: :::::::::::::::..:::. : . :.::::: ::..:..:.. :: .
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.....: .... : :. : .. : : . .. : . .: .:.:
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:. : : .. . ...: ::.. : :.:. .. : :
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: :... : .: . :. : .: .:. . : . . : . ....
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.. . . . . : : :. : ..: .:.: : .:
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.. :.::: : :.:::..:. ::. ..
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.:::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : :
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. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
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...: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::
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pF1KSD CPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTI
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: ..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.:
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pF1KSD YSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHT
: ::. .:: .: . :::::.:::::::.: :.::. :: :: ..:.: ... ..
NP_001 YELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYR
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.....: .... : :. : .. : : . .. : . .: .:.:
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: :... : .: . :. : .: .:. . : . . : . ...
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... . . . . : : :. : ..: .:.: : .:
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NP_001 HFDTETDGYFSDGEMSDSDVEAEDGGVQRGPREAGAEEVVRMGVLAS
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10 20 30 40
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPN---------EHKKPAEVFRKDLI
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.:::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : :
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pF1KSD RKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLME
. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
XP_016 AQ----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLE
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...: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::
XP_016 RVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQ
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pF1KSD ACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA
::::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.
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pF1KSD CPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTI
:::.::::::::::: ::::: :.::: ::.:::::. ::.:::::::::.:::::.::
XP_016 CPEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTI
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pF1KSD LDEGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEF
: ..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.:
XP_016 LADNDEVKFKSFCQEHSDG----GPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDF
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KSD YSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHT
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XP_016 YELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYR
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pF1KSD RMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNA
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XP_016 RLKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRERSGRRA
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pF1KSD LENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLE
XP_016 KGKKSDSKRKGCEGSKGSTEKKEKVKAGPDSVLGQLGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQIT
530 540 550 560 570 580
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10 20 30 40
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPN---------EHKKPAEVFRKDLI
::.. :::.:: . : . :: : : ::.:. ..:::.:::: :::
XP_005 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHA-TSTSASRC-SKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLI
10 20 30 40 50
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pF1KSD SAMKLPDSHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRP
.:::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : :
XP_005 TAMKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPP-----LEGPP
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pF1KSD RKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLME
. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
XP_005 AQ----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLE
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pF1KSD KTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQ
...: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::
XP_005 RVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQ
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA
::::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.
XP_005 ACYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIG
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pF1KSD CPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTI
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XP_005 CPEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTI
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pF1KSD LDEGDEVKFKSYCLKHSQNRQKLGEAEYPHHRAKEQSQAKS--EKTSLRAQKLRELEEEF
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XP_005 LADNDEVKFKSFCQEHSDG----GPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDF
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410 420 430 440 450 460
pF1KSD YSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHT
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XP_005 YELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYR
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XP_005 RLKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRERSGRRA
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pF1KSD LENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLE
XP_005 KGKKSDSKRKGCEGSKGSTEKKEKVKAGPDSVLGQLAGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQI
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>>XP_005272003 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jade-2 (834 aa)
initn: 2137 init1: 1279 opt: 1799 Z-score: 1590.8 bits: 305.3 E(85289): 7.2e-82
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10 20 30 40
pF1KSD MKRHRPVSSSDSSDESPSTSFTSGSMYRIKSKIPN---------EHKKPAEVFRKDLI
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XP_005 MEEKRRKYSISSDNSDTTDSHA-TSTSASRC-SKLPSSTKSGWPRQNEKKPSEVFRTDLI
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pF1KSD SAMKLPDSHHINPDSYYLFADTWKEEWEKGVQVPASPDTVPQPSLRIIAEKVKDVLFIRP
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XP_005 TAMKIPDSYQLSPDDYYILADPWRQEWEKGVQVPAGAEAIPEPVVRILPP-----LEGPP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RKYIHCSSPDTTEPGYINIMELAASVCRYDLDDMDIFWLQELNEDLAEMGCGPVDENLME
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XP_005 AQ----ASPSSTMLGEGSQPDWPGG-SRYDLDEIDAYWLELINSELKEMERPELDELTLE
120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KTVEVLERHCHENMNHAIETEEGLGIEYDEDVICDVCRSPDSEEGNDMVFCDKCNVCVHQ
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XP_005 RVLEELETLCHQNMARAIETQEGLGIEYDEDVVCDVCRSPEGEDGNEMVFCDKCNVCVHQ
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230 240 250 260 270 280
pF1KSD ACYGILKVPEGSWLCRSCVLGIYPQCVLCPKKGGALKTTKTGTKWAHVSCALWIPEVSIA
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XP_005 ACYGILKVPTGSWLCRTCALGVQPKCLLCPKRGGALKPTRSGTKWVHVSCALWIPEVSIG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KSD CPERMEPITKISHIPPSRWALVCNLCKLKTGACIQCSIKSCITAFHVTCAFEHGLEMKTI
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XP_005 CPEKMEPITKISHIPASRWALSCSLCKECTGTCIQCSMPSCVTAFHVTCAFDHGLEMRTI
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XP_005 LADNDEVKFKSFCQEHSDG----GPRNEPTSEPTEPSQAGEDLEKVTLRKQRLQQLEEDF
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD YSLVRVEDVAAELGMPTLAVDFIYNYWKLKRKSNFNKPLFPPKEDEENGLVQPKEESIHT
: ::. .:: .: . :::::.:::::::.: :.::. :: :: ..:.: ... ..
XP_005 YELVEPAEVAERLDLAEALVDFIYQYWKLKRKANANQPLLTPKTDEVDNLAQQEQDVLYR
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD RMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNA
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XP_005 RLKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRERSGRRA
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD LENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLE
XP_005 KGKKSDSKRKGCEGSKGSTEKKEKVKAGPDSVLGQLAGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQI
530 540 550 560 570 580
>>XP_005272005 (OMIM: 610515) PREDICTED: protein Jade-2 (834 aa)
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10 20 30 40
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::.. :::.:: . : . :: : : ::.:. ..:::.:::: :::
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.:::.:::....::.::..:: :..::::::::::. ...:.: .::. : :
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. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
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...: :: ::.:: .::::.:::::::::::.:::::::..:.::.:::::::::::::
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::::::::: ::::::.:.::. :.:.::::.::::: :..::::.:::::::::::::.
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: ..:::::::.: .::.. : . : . : ::: ::..:: :.:..:::.:
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>>NP_001295072 (OMIM: 610515) protein Jade-2 isoform 4 [ (834 aa)
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10 20 30 40
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. .::..: : . . .. :::::..: .::. .: .: :: .:: .:
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110 120 130 140 150 160
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170 180 190 200 210 220
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410 420 430 440 450 460
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pF1KSD RMRMFMHLRQDLERVRNLCYMISRREKLKLSHNKIQEQIFGLQVQLLNQEIDAGLPLTNA
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XP_011 RLKLFTHLRQDLERVRNLCYMVTRRERTKHAICKLQEQIFHLQMKLIEQDLCRERSGRRA
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD LENSLFYPPPRITLKLKMPKSTPEDHRNSSTETDQQPHSPDSSSSVHSIRNMQVPQESLE
XP_011 KGKKSDSKRKGCEGSKGSTEKKEKVKAGPDSVLGQLAGLSTSFPIDGTFFNSWLAQSVQI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]