Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0223
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0223, 1136 aa
1>>>pF1KSDA0223 1136 - 1136 aa - 1136 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2094+/-0.000927; mu= 15.0476+/- 0.056
mean_var=152.3570+/-30.770, 0's: 0 Z-trim(111.1): 107 B-trim: 180 in 2/51
Lambda= 0.103907
statistics sampled from 12011 (12124) to 12011 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16
Scan time: 5.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32863.1 ARHGAP45 gene_id:23526|Hs108|chr19 (1136) 7490 1135.5 0
CCDS82263.1 ARHGAP45 gene_id:23526|Hs108|chr19 (1140) 7306 1107.9 0
CCDS58637.1 ARHGAP45 gene_id:23526|Hs108|chr19 (1152) 7305 1107.8 0
CCDS74242.1 ARHGAP45 gene_id:23526|Hs108|chr19 (1019) 6563 996.5 0
CCDS74243.1 ARHGAP45 gene_id:23526|Hs108|chr19 ( 771) 4908 748.3 1.6e-215
CCDS748.1 ARHGAP29 gene_id:9411|Hs108|chr1 (1261) 1024 166.2 4.2e-40
CCDS74318.1 GMIP gene_id:51291|Hs108|chr19 ( 944) 839 138.4 7.6e-32
CCDS12408.1 GMIP gene_id:51291|Hs108|chr19 ( 970) 829 136.9 2.2e-31
>>CCDS32863.1 ARHGAP45 gene_id:23526|Hs108|chr19 (1136 aa)
initn: 7490 init1: 7490 opt: 7490 Z-score: 6072.5 bits: 1135.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7490; 100.0% identity (100.0% similar) in 1136 aa overlap (1-1136:1-1136)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MFSRKKRELMKTPSISKKNRAGSPSPQPSGELPRKDGADAVFPGPSLEPPAGSSGVKATG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MFSRKKRELMKTPSISKKNRAGSPSPQPSGELPRKDGADAVFPGPSLEPPAGSSGVKATG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLKRPTSLSRHASAAGFPLSGAASWTLGRSHRSPLTAASPGELPTEGAGPDVVEDISHLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TLKRPTSLSRHASAAGFPLSGAASWTLGRSHRSPLTAASPGELPTEGAGPDVVEDISHLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ADVARFAEGLEKLKECVLRDDLLEARRPRAHECLGEALRVMHQIISKYPLLNTVETLTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADVARFAEGLEKLKECVLRDDLLEARRPRAHECLGEALRVMHQIISKYPLLNTVETLTAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GTLIAKVKAFHYESNNDLEKQEFEKALETIAVAFSSTVSEFLMGEVDSSTLLAVPPGDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GTLIAKVKAFHYESNNDLEKQEFEKALETIAVAFSSTVSEFLMGEVDSSTLLAVPPGDSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QSMESLYGPGSEGTPPSLEDCDAGCLPAEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAKNMAKYMKDLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QSMESLYGPGSEGTPPSLEDCDAGCLPAEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAKNMAKYMKDLI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SYLEKRTTLEMEFAKGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEFGHSMVQAVGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SYLEKRTTLEMEFAKGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEFGHSMVQAVGT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LQTQTFMQPLTLRRLEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYVQRCEDHDKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LQTQTFMQPLTLRRLEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYVQRCEDHDKAR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FLVAKAEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVADAKTQKQEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLVAKAEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVADAKTQKQEL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EDTKVTALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSKLYDPGQQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EDTKVTALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSKLYDPGQQY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ASHVRQLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGSPPEEGGCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ASHVRQLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGSPPEEGGCT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EGTPAKDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERTSSSGTMSSTEELVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGTPAKDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERTSSSGTMSSTEELVD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PDGGAGASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPAKCRECNSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PDGGAGASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPAKCRECNSY
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPDGVPFIVKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPDGVPFIVKK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNVLKLYLRQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNVLKLYLRQL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGRLRELLRDLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGRLRELLRDLPP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSSLVDYPHQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSSLVDYPHQA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD RVIETLIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPLQEAAADGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RVIETLIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPLQEAAADGC
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD RESRVVSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEASLEVASGSHSGSEEQLEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RESRVVSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEASLEVASGSHSGSEEQLEA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD TAREDGDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRERQPEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TAREDGDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRERQPEFV
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS82263.1 ARHGAP45 gene_id:23526|Hs108|chr19 (1140 aa)
initn: 7291 init1: 7291 opt: 7306 Z-score: 5923.4 bits: 1107.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7306; 98.8% identity (98.9% similar) in 1125 aa overlap (20-1136:16-1140)
10 20 30 40 50
pF1KSD MFSRKKRELMKTPSISKKNRAGSPSPQPSG--------ELPRKDGADAVFPGPSLEPPAG
::: .:: : ::::::::::::::::::::::
CCDS82 MLGRRLGARASYSPYRAGRQGPQQRGRDPGIQLTELPRKDGADAVFPGPSLEPPAG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SSGVKATGTLKRPTSLSRHASAAGFPLSGAASWTLGRSHRSPLTAASPGELPTEGAGPDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SSGVKATGTLKRPTSLSRHASAAGFPLSGAASWTLGRSHRSPLTAASPGELPTEGAGPDV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD VEDISHLLADVARFAEGLEKLKECVLRDDLLEARRPRAHECLGEALRVMHQIISKYPLLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VEDISHLLADVARFAEGLEKLKECVLRDDLLEARRPRAHECLGEALRVMHQIISKYPLLN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TVETLTAAGTLIAKVKAFHYESNNDLEKQEFEKALETIAVAFSSTVSEFLMGEVDSSTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TVETLTAAGTLIAKVKAFHYESNNDLEKQEFEKALETIAVAFSSTVSEFLMGEVDSSTLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD AVPPGDSSQSMESLYGPGSEGTPPSLEDCDAGCLPAEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAKNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVPPGDSSQSMESLYGPGSEGTPPSLEDCDAGCLPAEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAKNM
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AKYMKDLISYLEKRTTLEMEFAKGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEFGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AKYMKDLISYLEKRTTLEMEFAKGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEFGH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SMVQAVGTLQTQTFMQPLTLRRLEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYVQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SMVQAVGTLQTQTFMQPLTLRRLEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYVQR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CEDHDKARFLVAKAEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CEDHDKARFLVAKAEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVAD
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AKTQKQELEDTKVTALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AKTQKQELEDTKVTALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSK
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LYDPGQQYASHVRQLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LYDPGQQYASHVRQLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGS
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PPEEGGCTEGTPAKDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERTSSSGTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PPEEGGCTEGTPAKDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERTSSSGTM
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SSTEELVDPDGGAGASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SSTEELVDPDGGAGASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD KCRECNSYVYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KCRECNSYVYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPD
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD GVPFIVKKCVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GVPFIVKKCVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LKLYLRQLPEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGRLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LKLYLRQLPEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGRLR
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD ELLRDLPPENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ELLRDLPPENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSS
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LVDYPHQARVIETLIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LVDYPHQARVIETLIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPL
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD QEAAADGCRESRVVSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEASLEVASGSHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QEAAADGCRESRVVSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEASLEVASGSHS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD GSEEQLEATAREDGDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRERQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GSEEQLEATAREDGDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRERQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD PEFV
::::
CCDS82 PEFV
1140
>>CCDS58637.1 ARHGAP45 gene_id:23526|Hs108|chr19 (1152 aa)
initn: 7305 init1: 7305 opt: 7305 Z-score: 5922.5 bits: 1107.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7305; 99.7% identity (99.7% similar) in 1111 aa overlap (26-1136:42-1152)
10 20 30 40 50
pF1KSD MFSRKKRELMKTPSISKKNRAGSPSPQPSGELPRKDGADAVFPGPSLEPPAGSSG
: : :::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LGWVCTWTWAWRARLGARGCGLHVLCPRDLPLPPEELPRKDGADAVFPGPSLEPPAGSSG
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KSD VKATGTLKRPTSLSRHASAAGFPLSGAASWTLGRSHRSPLTAASPGELPTEGAGPDVVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VKATGTLKRPTSLSRHASAAGFPLSGAASWTLGRSHRSPLTAASPGELPTEGAGPDVVED
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ISHLLADVARFAEGLEKLKECVLRDDLLEARRPRAHECLGEALRVMHQIISKYPLLNTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ISHLLADVARFAEGLEKLKECVLRDDLLEARRPRAHECLGEALRVMHQIISKYPLLNTVE
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TLTAAGTLIAKVKAFHYESNNDLEKQEFEKALETIAVAFSSTVSEFLMGEVDSSTLLAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLTAAGTLIAKVKAFHYESNNDLEKQEFEKALETIAVAFSSTVSEFLMGEVDSSTLLAVP
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KSD PGDSSQSMESLYGPGSEGTPPSLEDCDAGCLPAEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAKNMAKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGDSSQSMESLYGPGSEGTPPSLEDCDAGCLPAEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAKNMAKY
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KSD MKDLISYLEKRTTLEMEFAKGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEFGHSMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MKDLISYLEKRTTLEMEFAKGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEFGHSMV
320 330 340 350 360 370
360 370 380 390 400 410
pF1KSD QAVGTLQTQTFMQPLTLRRLEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYVQRCED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QAVGTLQTQTFMQPLTLRRLEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYVQRCED
380 390 400 410 420 430
420 430 440 450 460 470
pF1KSD HDKARFLVAKAEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVADAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HDKARFLVAKAEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVADAKT
440 450 460 470 480 490
480 490 500 510 520 530
pF1KSD QKQELEDTKVTALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSKLYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QKQELEDTKVTALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSKLYD
500 510 520 530 540 550
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PGQQYASHVRQLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGSPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGQQYASHVRQLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGSPPE
560 570 580 590 600 610
600 610 620 630 640 650
pF1KSD EGGCTEGTPAKDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERTSSSGTMSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EGGCTEGTPAKDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERTSSSGTMSST
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KSD EELVDPDGGAGASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPAKCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EELVDPDGGAGASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPAKCR
680 690 700 710 720 730
720 730 740 750 760 770
pF1KSD ECNSYVYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPDGVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ECNSYVYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPDGVP
740 750 760 770 780 790
780 790 800 810 820 830
pF1KSD FIVKKCVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNVLKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FIVKKCVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNVLKL
800 810 820 830 840 850
840 850 860 870 880 890
pF1KSD YLRQLPEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGRLRELL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YLRQLPEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGRLRELL
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900 910 920 930 940 950
pF1KSD RDLPPENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSSLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDLPPENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSSLVD
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD YPHQARVIETLIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPLQEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YPHQARVIETLIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPLQEA
980 990 1000 1010 1020 1030
1020 1030 1040 1050 1060 1070
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AADGCRESRVVSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEASLEVASGSHSGSE
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EQLEATAREDGDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRERQPEF
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pF1KSD V
:
CCDS58 V
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::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LNTVETLTAAGTLIAKVKAFHYESNNDLEKQEFEKALETIAVAFSSTVSEFLMGEVDSST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLAVPPGDSSQSMESLYGPGSEGTPPSLEDCDAGCLPAEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NMAKYMKDLISYLEKRTTLEMEFAKGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GHSMVQAVGTLQTQTFMQPLTLRRLEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QRCEDHDKARFLVAKAEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ADAKTQKQELEDTKVTALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCES
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SKLYDPGQQYASHVRQLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GSPPEEGGCTEGTPAKDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERTSSSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TMSSTEELVDPDGGAGASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PAKCRECNSYVYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSA
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pF1KSD PDGVPFIVKKCVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PDGVPFIVKKCVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDIS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NVLKLYLRQLPEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LRELLRDLPPENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSLVDYPHQARVIETLIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PLQEAAADGCRESRVVSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEASLEVASGS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 HSGSEEQLEATAREDGDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRE
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pF1KSD RQPEFV
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CCDS74 RQPEFV
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::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MGVGRKGGAGETESHPRIGLELASWLPHPQQEAESNLRKAKQGYVQRCEDHDKARFLVAK
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pF1KSD AEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVADAKTQKQELEDTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVADAKTQKQELEDTKV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSKLYDPGQQYASHVR
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pF1KSD QLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGSPPEEGGCTEGTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QLQRDQEPDVHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGSPPEEGGCTEGTPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERTSSSGTMSSTEELVDPDGGA
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pF1KSD GASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPAKCRECNSYVYFQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPAKCRECNSYVYFQG
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pF1KSD AECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPDGVPFIVKKCVCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPDGVPFIVKKCVCEI
370 380 390 400 410 420
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pF1KSD ERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNVLKLYLRQLPEPLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNVLKLYLRQLPEPLI
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pF1KSD SFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGRLRELLRDLPPENRAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALAGRLRELLRDLPPENRAS
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pF1KSD LQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSSLVDYPHQARVIET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSSLVDYPHQARVIET
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pF1KSD LIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPLQEAAADGCRESRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPLQEAAADGCRESRV
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pF1KSD VSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEASLEVASGSHSGSEEQLEATARED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEASLEVASGSHSGSEEQLEATARED
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pF1KSD GDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRERQPEFV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 GDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRERQPEFV
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>>CCDS748.1 ARHGAP29 gene_id:9411|Hs108|chr1 (1261 aa)
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pF1KSD SGAASWTLGRSHRSPLTAASPGELPTEGAGPDVVEDISHLLADVARFAEGLEKLKECVLR
:: ... :. :. .:.. : ::: ..
CCDS74 KRAWASGQLSTDITTSEMGLKSLSSNSIFDPDYIKE---LVNDIRKFSHMLLYLKEAIFS
20 30 40 50 60
140 150 160 170 180 190
pF1KSD DDLLEARRPRAHECLGEALRVMHQIISKYPLLNTVETLTAAGTLIAKVKAFHY-----ES
: . :. : : : :::...:..:. ::.:. .:: : ::::: .. :.
CCDS74 DCFKEV----IHIRLEELLRVLKSIMNKHQNLNSVDLQNAAEMLTAKVKAVNFTEVNEEN
70 80 90 100 110 120
200 210 220 230 240 250
pF1KSD NNDLEKQEFEKALETIAVAFSSTVSEFLMGEVDSSTLLAVPPGDSSQSMESLYGPGSEGT
.::: .. : ...::.: .:.. ...::::.: ...:: .: . ..:.:.. . :..
CCDS74 KNDLFQEVF-SSIETLAFTFGNILTNFLMGDVGNDSLLRLPVSRETKSFENV---SVESV
130 140 150 160 170 180
260 270 280 290 300 310
pF1KSD PPSLEDCDAGCLPAEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAKNMAKYMKDLISYLEKRTTLEMEFA
: : : . :.: .: . ... :: :::. .:: :...:..::. .::.: .
CCDS74 DSSSE---KGNFSPLELDNVLLKNTDSIELALSYAKTWSKYTKNIVSWVEKKLNLELEST
190 200 210 220 230
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pF1KSD KGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEFGHSMVQAVGTLQTQTFMQPLTLRR
... :.:. : .. . ::: :... :: .:.: .: . :....::.. :.::: :.
CCDS74 RNMVKLAEATRTNIGIQEFMPLQSLFTNALLNDIESSHLLQQTIAALQANKFVQPLLGRK
240 250 260 270 280 290
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYVQRCEDHDKARFLVAKAEEEQAGSA
: ::.:::::: :.. : :. :::. :.::: .:: ....::. . .::::. .:.
CCDS74 NEMEKQRKEIKELWKQEQNKMLEAENALKKAKLLCMQRQDEYEKAKSSMFRAEEEHLSSS
300 310 320 330 340 350
440 450 460 470 480 490
pF1KSD PGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVADAKTQKQELEDTKVTALRQIQEV
: ... .: :.:.::::::: .:.::: :..::.... ....::.:: : :.. .
CCDS74 GGLAKNLNKQLEKKRRLEEEALQKVEEANELYKVCVTNVEERRNDLENTKREILAQLRTL
360 370 380 390 400 410
500 510 520 530 540 550
pF1KSD IRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSKLYDPGQQYASHVRQLQRDQEPD
. : : :.:..:.. ..:.:.:.: : .: ::.:.:::::::.:. :. . .:
CCDS74 VFQCDLTLKAVTVNLFHMQHLQAASLADSLQSLCDSAKLYDPGQEYSEFVKATNSTEEEK
420 430 440 450 460 470
560 570 580 590 600 610
pF1KSD VHYDFEPHVSANAWSPVMRARKSSFNVSDVARPEAAGSPPEEGGCTEGTPAKDHRAGRGH
: . . :. :. .: . .:.. ::.: ... :: :.... :
CCDS74 VDGNVNKHL--NSSQPSGFGPANSLE--DVVRLPDSSNKIEEDRCSNSADIT------GP
480 490 500 510 520
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pF1KSD QVHKSWPLSI-SDSDS--------GLDP-GPGAGDF-KKFERTSSSGTMSSTEELVDPDG
. .:: ... :::.: .:: . . ::: .:. :: :::::::..
CCDS74 SFIRSWTFGMFSDSESTGGSSESRSLDSESISPGDFHRKLPRTPSSGTMSSAD-------
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD GAGASAFEQADLNGMTPELPVAV-PS--GPFRHEGLSKAARTHRLRKLRTPAKCRECNSY
::. : : . :. : :.. .:::: ::..::::.:.:::.:..
CCDS74 ----------DLDEREPPSPSETGPNSLGTFKKTLMSKAALTHKFRKLRSPTKCRDCEGI
590 600 610 620 630
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAARSAPDGVPFIVKK
: :::.::::: :.::.::::.:.: :::.:: :...::: .:...:.. :::.:::.:
CCDS74 VVFQGVECEECLLVCHRKCLENLVIICGHQKLPGKIHLFGAEFTQVAKKEPDGIPFILKI
640 650 660 670 680 690
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHDISNVLKLYLRQL
:. ::: ::: .::::: : : ..::::::.::: .::..:. : ::: .:::::::::
CCDS74 CASEIENRALCLQGIYRVCGNKIKTEKLCQALENGMHLVDISEFSSHDICDVLKLYLRQL
700 710 720 730 740 750
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pF1KSD PEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGS-ESEAVAVA-LAGRLRELLRDL
:::.: ::::.:.. :::. ... : .. . . .: . . . . . . ..:::.:
CCDS74 PEPFILFRLYKEFIDLAKEIQHVNEEQETKKNSLEDKKWPNMCIEINRILLKSKDLLRQL
760 770 780 790 800 810
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pF1KSD PPENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPRPTEATVSLSSLVDYPH
: : ::..:. ::.:.:. ..:::. :::..:::.:.::::: : ...:::..: .
CCDS74 PASNFNSLHFLIVHLKRVVDHAEENKMNSKNLGVIFGPSLIRPRPTTAPITISSLAEYSN
820 830 840 850 860 870
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pF1KSD QARVIETLIVHYGLVFEEEPEETPGGQDESSNQRAEVVVQVPYLEAGEAVVYPLQEAAAD
:::..: ::.. .:. .: : .:. .. .. : :. :
CCDS74 QARLVEFLITYSQKIFD------------GSLQPQDVMCSIGVVDQGCFPKPLLSPEERD
880 890 900 910
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD GCRESRVVSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGH-LSFLEQQQSEASLEVASGSHSGSEEQ
: . . .: :.. : ::.. . . :: :..... .: .. : . .
CCDS74 IERSMKSLFFSSKEDIHT-----SESESKIFERATSFEESERKQNALGKCDACLSDKAQL
920 930 940 950 960 970
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD L-EATAREDGDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLPPMRLRGGRMTLGSCRERQPEFV
: . :. .. ::: . . ......:.: .. : ..:
CCDS74 LLDQEAESASQKIEDGKTPKPLSLKSDRSTNNVERHTPRTKIRPVSLPVDRLLLASPPNE
980 990 1000 1010 1020 1030
CCDS74 RNGRNMGNVNLDKFCKNPAFEGVNRKDAATTVCSKFNGFDQQTLQKIQDKQYEQNSLTAK
1040 1050 1060 1070 1080 1090
>>CCDS74318.1 GMIP gene_id:51291|Hs108|chr19 (944 aa)
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180 190 200 210 220 230
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..:... ....... :.: :. ::.
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240 250 260 270 280 290
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: .. .. . .: . :: : : .: .::.:. : : .::::::: :::.
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..: :.:... :::.. :.::::. .:::. . :..:. :::: ::.: ::.:: .:
CCDS74 SRYAKELLAWTEKRASYELEFAKSTMKIAEAGKVSIQQQSHMPLQYIYTLFLEHDLSLGT
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...:. : . ..:::. .: : :: :::.:: : . :....:: . ::.:. ::::
CCDS74 LAMETVAQ-QKRDYYQPLAAKRTEIEKWRKEFKEQWMKEQKRMNEAVQALRRAQLQYVQR
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:: : :... ::: :. .: ..::: .:::. ::.:: : :..:: .
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:....:.:: .: . ...... :.:.... .:.: . . :. : : : :
CCDS74 ANARQQDLEIAKQRIVSHVRKLVFQGDEVLRRVTLSLFGLRGAQAERGPRAFAALAECCA
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..:::.: :: :. . : : : . . : :.: : :. . ..
CCDS74 PFEPGQRYQEFVRALRPEAPPPP----PPAFSFQEFLP-------SLNSSPLDIRKKLSG
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::. . . .: : .: : : . : . ::: : : . :
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: ...: .:: : : .: ::. ..:: . ::.::.::.::.:
CCDS74 SRSLDSPTS--SPDLGDG---LE----NGL---------GSPFGKWTLSSAAQTHQLRRL
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pF1KSD RTPAKCRECNSYVYFQGAECEECCLACHKKCLETLAIQCGHKKLQGRLQLFGQDFSHAAR
: :::::::.... .:.::::: :.:::.::::: : :::..: .: ::: :: . :
CCDS74 RGPAKCRECEAFMV-SGTECEECFLTCHKRCLETLLILCGHRRLPARTPLFGVDFLQLPR
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pF1KSD SAPDGVPFIVKKCVCEIERRALRTKGIYRVNGVKTRVEKLCQAFENGKELVELSQASPHD
. :. :::.: ::. :::.::: ..:::::.: ..:::.::::::::. ::::: ::::
CCDS74 DFPEEVPFVVTKCTAEIEHRALDVQGIYRVSGSRVRVERLCQAFENGRALVELSGNSPHD
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD ISNVLKLYLRQLPEPLISFRLYHELVGLAKDSLKAEAEAKAASRGRQDGSESEAVAVALA
.:.::: .:..: ::.: :.:: ...::: .:.:. : . :. : . : .
CCDS74 VSSVLKRFLQELTEPVIPFHLYDAFISLAK-TLHADP-------GDDPGTPSPSPEVIRS
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pF1KSD GRLRELLRDLPPENRASLQYLLRHLRRIVEVEQDNKMTPGNLGIVFGPTLLRPR--PTEA
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CCDS74 --LKTLLVQLPDSNYNTLRHLVAHLFRVAARFMENKMSANNLGIVFGPTLLRPPDGPRAA
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pF1KSD T-VSLSSLVDYPHQARVIETLIVHYGLVF--EEEPEET-PGGQDESSNQRAEVVVQVPYL
. . .. :.: :::...: ::::: .: .: :. : : :: : .. . :
CCDS74 SAIPVTCLLDSGHQAQLVEFLIVHYEQIFGMDELPQATEPPPQDSSPAPGPLTTSSQP--
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pF1KSD EAGEAVVYPLQEAAADGCRESRVVSNDSDSDLEEASELLSSSEASALGHLSFLEQQQSEA
: . :. . :...: : . : : :::. . .
CCDS74 --------PPPHLDPDS--QPPVLASDPGPDPQ---------------HHSTLEQHPTAT
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pF1KSD SLEVASGSHSGSEEQLEATAREDGDGDEDGPAQQLSGFNTNQSNNVLQAPLP-PMRLRGG
:. . . . :. : : :. . .:: ..: : :.. .. . :. : :::
CCDS74 PTEIPTPQSDQREDVAEDTKDGGGEVSSQGPEDSLLG--TQSRGHFSRQPVKYP---RGG
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1130
pF1KSD RMTLGSCRERQPEFV
CCDS74 VRPVTHQLSSLALVASKLCEETPITSVPRGSLRGRGPSPAAASPEGSPLRRTPLPKHFEI
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CCDS12 MDAAEPGLPPGPEGRKRYSDIFRSLDNLEISLGNVTLEMLAGD----PLLSE
10 20 30 40
240 250 260 270 280 290
pF1KSD PPGDSSQSMESLYGPGSEGTPPSLEDCDAGCLP--AEEVDVLLQRCEGGVDAALLYAKNM
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CCDS12 DPEPDKTPTATVTNEASCWSGPSPE----GPVPLTGEELDLRLIRTKGGVDAALEYAKTW
50 60 70 80 90 100
300 310 320 330 340 350
pF1KSD AKYMKDLISYLEKRTTLEMEFAKGLQKIAHNCRQSVMQEPHMPLLSIYSLALEQDLEFGH
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CCDS12 SRYAKELLAWTEKRASYELEFAKSTMKIAEAGKVSIQQQSHMPLQYIYTLFLEHDLSLGT
110 120 130 140 150 160
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SMVQAVGTLQTQTFMQPLTLRRLEHEKRRKEIKEAWHRAQRKLQEAESNLRKAKQGYVQR
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CCDS12 LAMETVAQ-QKRDYYQPLAAKRTEIEKWRKEFKEQWMKEQKRMNEAVQALRRAQLQYVQR
170 180 190 200 210 220
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CEDHDKARFLVAKAEEEQAGSAPGAGSTATKTLDKRRRLEEEAKNKAEEAMATYRTCVAD
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CCDS12 SED------LRARSQGSPEDSAPQASPGPSKQQERRRRSREEAQAKAQEAEALYQACVRE
230 240 250 260 270
480 490 500 510 520 530
pF1KSD AKTQKQELEDTKVTALRQIQEVIRQSDQTIKSATISYYQMMHMQTAPLPVHFQMLCESSK
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CCDS12 ANARQQDLEIAKQRIVSHVRKLVFQGDEVLRRVTLSLFGLRGAQAERGPRAFAALAECCA
280 290 300 310 320 330
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CCDS12 PFEPGQRYQEFVRALRPEAPPPPPPAFSFQEFLPSLNSSPLDIRKKLSGPLPPRLDENSA
340 350 360 370 380 390
590 600 610 620 630 640
pF1KSD AGSPPEEGGCT---EGTPAKDHRAGRGHQVHKSWPLSISDSDSGLDPGPGAGDFKKFERT
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CCDS12 EPGPWEDPGTGWRWQGTPGPTP----GSDVDSVGGGSESRSLDSPTSSPGAGT-RQLVKA
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pF1KSD SSSGTMSSTE-ELVDPDGGAGASAFEQADLNGMTPELPVAVPSGPFRHEGLSKAARTHRL
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CCDS12 SSTGTESSDDFEERDPDLGDG---LE----NGL---------GSPFGKWTLSSAAQTHQL
460 470 480 490
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CCDS12 RRLRGPAKCRECEAFMV-SGTECEECFLTCHKRCLETLLILCGHRRLPARTPLFGVDFLQ
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CCDS12 LPRDFPEEVPFVVTKCTAEIEHRALDVQGIYRVSGSRVRVERLCQAFENGRALVELSGNS
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CCDS12 IRS--LKTLLVQLPDSNYNTLRHLVAHLFRVAARFMENKMSANNLGIVFGPTLLRPPDGP
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:::
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