Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0224
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0224, 1227 aa
  1>>>pF1KSDA0224 1227 - 1227 aa - 1227 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3861+/-0.0012; mu= 9.1217+/- 0.072
 mean_var=228.9592+/-45.450, 0's: 0 Z-trim(108.5): 109  B-trim: 6 in 1/51
 Lambda= 0.084761
 statistics sampled from 10156 (10257) to 10156 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.315), width:  16
 Scan time:  5.180

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16         (1227) 8205 1018.0       0
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17          (1220) 2545 325.8   4e-88
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17          (1181) 2374 304.9 7.8e-82
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6           (1041) 2331 299.6 2.7e-80
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4          ( 795) 1856 241.4 6.9e-63
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20        ( 672) 1324 176.3 2.3e-43
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20        ( 703) 1324 176.3 2.4e-43
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17        ( 707) 1257 168.1 7.1e-41
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19         (1143) 1155 155.8 5.7e-37
CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10         ( 743) 1100 148.9 4.4e-35
CCDS1949.2 DQX1 gene_id:165545|Hs108|chr2          ( 717) 1066 144.7 7.7e-34
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17        ( 702)  847 118.0 8.7e-26
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17        ( 779)  847 118.0 9.4e-26
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3         (1008)  615 89.7 3.9e-17
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1           (1270)  568 84.1 2.5e-15
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2          (1386)  543 81.1 2.2e-14
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3        ( 994)  536 80.1 3.1e-14
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5         (1430)  507 76.7 4.7e-13
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3          (1194)  496 75.3 1.1e-12
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12         (1157)  452 69.9 4.3e-11


>>CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16              (1227 aa)
 initn: 8205 init1: 8205 opt: 8205  Z-score: 5436.1  bits: 1018.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 8205; 99.9% identity (100.0% similar) in 1227 aa overlap (1-1227:1-1227)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MGDTSEDASIHRLEGTDLDCQVGGLICKSKSAASEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGDTSEDASIHRLEGTDLDCQVGGLICKSKSAASEQHVFKAPAPRPSLLGLDLLASLKRR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD EREEKDDGEDKKKSKVSSYKDWEESKDDQKDAEEEGGDQAGQNIRKDRHYRSARVETPSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EREEKDDGEDKKKSKVSSYKDWEESKDDQKDAEEEGGDQAGQNIRKDRHYRSARVETPSH
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD PGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDWKKEKSRDRDYDRKRDRDERDRSRHSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDWKKEKSRDRDYDRKRDRDERDRSRHSS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD RSERDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSERDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD DSERSHRLSTRDRDRSVRGKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DSERSHRLSTRDRDRSVRGKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREEG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD EEGISFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EEGISFDTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD KRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KRISAQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD IVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKAQHKHWELAGTKLGDIMG
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD VKKEEEPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VKKEEEPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD LLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEE
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD MGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLN
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD TDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQ
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD EDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD QLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDAL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD QIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD LGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD VSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKN
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD NNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQ
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD AAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEW
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD LAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVR
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220       
pF1KSD STKIYTPGRKEQGEPMAPRRTPARFGL
       ::::::::::::::::.::::::::::
CCDS10 STKIYTPGRKEQGEPMTPRRTPARFGL
             1210      1220       

>>CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17               (1220 aa)
 initn: 2544 init1: 1248 opt: 2545  Z-score: 1695.5  bits: 325.8 E(32554): 4e-88
Smith-Waterman score: 2617; 41.4% identity (69.5% similar) in 1084 aa overlap (133-1177:161-1210)

            110       120       130       140       150       160  
pF1KSD NIRKDRHYRSARVETPSHPGGVSEEFWERSRQRERERREHGVYASSKEEKDWKKEKSRDR
                                     .::. :.:..    ..:.... .....:::
CCDS11 RTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDR----TKKKKRSRSRDRNRDR
              140       150       160       170           180      

            170       180       190       200       210       220  
pF1KSD DYDRKRDRDERDRSRHSSRSERDGGSERSSRRNEPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGY
       : ::.:.::.  . :: :::.   .  :. .::. .: :.: .. .    .  ...:. :
CCDS11 DRDRERNRDRDHKRRHRSRSR---SRSRTRERNKVKS-RYRSRSRSQSPPKDRKDRDK-Y
        190       200          210       220        230       240  

            230             240       250       260       270      
pF1KSD GSSRRSQW-----ESPSPT-PSYRDSERSHRLSTRDRDRSVRGKYSDDTPLPTPSYKYNE
       :    ..:     . : :  :.  :   ..  :  .      : . .   :        .
CCDS11 GERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQF-----GCFVQLEGLRKRWEGLVH
             250       260       270            280       290      

        280       290         300       310        320       330   
pF1KSD WADDRRHLGSTPRLSR--GRGRREEGEEGISFDTEEERQQWED-DQRQADRDWYMMDEGY
        .. ::. : .  ..   ..:.: . .  .::   .   . .: ::. ..      : . 
CCDS11 ISELRRE-GRVANVADVVSKGQRVKVKV-LSFTGTKTSLSMKDVDQETGE------DLNP
        300        310       320        330       340              

           340       350          360          370         380     
pF1KSD DEFHNPLAYSSEDYVRR---REQHLHKQKQKRI---SAQRRQINE--DNERWETNRMLTS
       .. .: .. ..:.   :   :  ::   .  ..   : .:.....  : :.:: ..:...
CCDS11 NRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAA
      350       360       370       380       390       400        

         390                  400       410       420       430    
pF1KSD GVVHRLEV---DE--------DFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVK
       .:. . :    ::        : :::.  ...:. ..  :::: :.   . .  :.  ::
CCDS11 NVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEE--PPFLRGHTKQSMDMSPIKIVK
      410       420       430       440         450       460      

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pF1KSD DATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKE-RKKAQ--------HKHWELAGTKLGDIMGVKKEE
       .  ..:.  :   :  ....:: :. ...:.        .:::      : :  : .   
CCDS11 NPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWV---DPLPDAEGRQIAA
        470       480       490       500       510          520   

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pF1KSD EPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTII
       .        . .    .. :. .     .::     . ::::::. :::. ....:.  .
CCDS11 NMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGN-----KASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAV
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pF1KSD RDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNL
       .::.:.::.::::::::::.:::: : :::. : :::::::::::::::::::::.:  :
CCDS11 HDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCL
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pF1KSD GEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLF
       :.::::.:::::::: .:.:::::::.:::: : . :: .:. :..::::::...:::::
CCDS11 GQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLF
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pF1KSD GLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVE
       :::...: .:.:.::::::::.:: ::. .: ..::: :::::.::.::..: :. ::..
CCDS11 GLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLD
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pF1KSD AAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPS
       :..   .:.::.  :::::.:. :::.:... . . :... :  ..: : .::.:: :::
CCDS11 ASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPS
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pF1KSD DLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYP
       ..:..::. :: : :: ..::::::::::.:::..:.: :. : ::.: . :.: : . :
CCDS11 EMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTP
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pF1KSD ISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQ
       ::::.:.::.:::::::::.:.::::. ::..:.:::.::::::::::..:: ::..:..
CCDS11 ISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGIN
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pF1KSD DLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCD
       :::.: ::: :: ......: ::. :::::. : ::  :: :.::::.: : ::::.:  
CCDS11 DLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVH
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pF1KSD MGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYS
       .::: :.: :::::::  .::::: ..  .:: . ::   :.:::: : :: .::::..:
CCDS11 LGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFS
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pF1KSD TIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKL
       . :: ..::.:...:.....: :.  :: .......::: .   :.: ::...:..::: 
CCDS11 NPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKK
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pF1KSD KGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAEL
            : ..   .  ..::.:.::.    :...::::::.::::::. ::..: .::.:.
CCDS11 DPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFN--RQPEWVVYHELVLTTKEYMREVTTIDPRWLVEF
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pF1KSD GPMFYSVKQAGK-SRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTK
       .: :..:..  : :.:....: .   . .::  :                          
CCDS11 APAFFKVSDPTKLSKQKKQQRLEPLYNRYEEPNAWRISRAFRRR                
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          1210      1220       
pF1KSD IYTPGRKEQGEPMAPRRTPARFGL

>>CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17               (1181 aa)
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CCDS77 RTMLDEDDVKVAVDVLKELEALMPSAAGQEKQRDAEHRDR----TKKKKRSRSRDRNRDR
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       : ::.:.::.  . :: :::.   .  :. .::. .: :.: .. .    .  ...:. :
CCDS77 DRDRERNRDRDHKRRHRSRSR---SRSRTRERNKVKS-RYRSRSRSQSPPKDRKDRDK-Y
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pF1KSD GSSRRSQW-----ESPSPT-PSYRDSERSHRLSTRDRDRSVRGKYSDDTPLPTPSYKYNE
       :    ..:     . : :  :.  :   ..  :  .      : . .   :        .
CCDS77 GERNLDRWRDKHVDRPPPEEPTIGDIYNGKVTSIMQF-----GCFVQLEGLRKRWEGLVH
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pF1KSD WADDRRHLGSTPRLSR--GRGRREEGEEGISFDTEEERQQWED-DQRQADRDWYMMDEGY
        .. ::. : .  ..   ..:.: .  . .::   .   . .: ::. ..      : . 
CCDS77 ISELRRE-GRVANVADVVSKGQRVK-VKVLSFTGTKTSLSMKDVDQETGE------DLNP
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pF1KSD DEFHNPLAYSSEDYVRR---REQHLHKQKQKRI---SAQRRQINE--DNERWETNRMLTS
       .. .: .. ..:.   :   :  ::   .  ..   : .:.....  : :.:: ..:...
CCDS77 NRRRNLVGETNEETSMRNPDRPTHLSLVSAPEVEDDSLERKRLTRISDPEKWEIKQMIAA
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pF1KSD GVVHRLEV---DE--------DFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVK
       .:. . :    ::        : :::.  ...:. ..  :::: :.   . .  :.  ::
CCDS77 NVLSKEEFPDFDEETGILPKVDDEEDEDLEIELVEEE--PPFLRGHTKQSMDMSPIKIVK
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pF1KSD DATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKE-RKKAQ--------HKHWELAGTKLGDIMGVKKEE
       .  ..:.  :   :  ....:: :. ...:.        .:::      : :  : .   
CCDS77 NPDGSLSQAAMMQSALAKERRELKQAQREAEMDSIPMGLNKHWV---DPLPDAEGRQIAA
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CCDS77 NMRGIGMMPNDIPEWKKHAFGGN-----KASYGKKTQMSILEQRESLPIYKLKEQLVQAV
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pF1KSD RDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNL
       .::.:.::.::::::::::.:::: : :::. : :::::::::::::::::::::.:  :
CCDS77 HDNQILIVIGETGSGKTTQITQYLAEAGYTSRGKIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEFGCCL
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       :.::::.:::::::: .:.:::::::.:::: : . :: .:. :..::::::...:::::
CCDS77 GQEVGYTIRFEDCTSPETVIKYMTDGMLLRECLIDPDLTQYAIIMLDEAHERTIHTDVLF
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CCDS77 GLLKKTVQKRQDMKLIVTSATLDAVKFSQYFYEAPIFTIPGRTYPVEILYTKEPETDYLD
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CCDS77 ASLITVMQIHLTEPPGDILVFLTGQEEIDTACEILYERMKSLGPDVPELIILPVYSALPS
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CCDS77 EMQTRIFDPAPPGSRKVVIATNIAETSLTIDGIYYVVDPGFVKQKVYNSKTGIDQLVVTP
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CCDS77 ISQAQAKQRAGRAGRTGPGKCYRLYTERAYRDEMLTTNVPEIQRTNLASTVLSLKAMGIN
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CCDS77 DLLSFDFMDAPPMETLITAMEQLYTLGALDDEGLLTRLGRRMAEFPLEPMLCKMLIMSVH
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CCDS77 LGCSEEMLTIVSMLSVQNVFYRPKDKQALADQKKAKFHQTEGDHLTLLAVYNSWKNNKFS
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pF1KSD TIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKL
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CCDS77 NPWCYENFIQARSLRRAQDIRKQMLGIMDRHKLDVVSCGKSTVRVQKAICSGFFRNAAKK
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CCDS77 DPQEGYRTLIDQQVVYIHPSSALFNRQPECPKHFL--PVVAVAVSLEQCLSKFE-DLNKE
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          1150      1160      1170      1180      1190      1200   
pF1KSD LGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTK
       ::                                                          
CCDS77 LGLVTC                                                      
        1180                                                       

>>CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6                (1041 aa)
 initn: 2308 init1: 871 opt: 2331  Z-score: 1555.0  bits: 299.6 E(32554): 2.7e-80
Smith-Waterman score: 2353; 41.0% identity (70.0% similar) in 970 aa overlap (226-1153:72-1020)

         200       210       220       230       240       250     
pF1KSD EPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYRDSERSHRLSTRDRDR
                                     :..  :.:.     : .::  : .  ...:
CCDS46 EFVQRLRDTDTLDLSGPARDFALRLWNKVPRKAVVEKPA-----RAAEREAR-ALLEKNR
              50        60        70        80              90     

             260       270       280       290       300       310 
pF1KSD SVR----GKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGSTPRLSRGRGRREEGEEGISFDTEE-
       : :    .. :..  .   . . ..    :.:: .  .  . .   :.:..  . . .. 
CCDS46 SYRLLEDSEESSEETVSRAGSSLQKKRKKRKHLRKKREEEEEEEASEKGKKKTGGSKQQT
         100       110       120       130       140       150     

              320       330       340           350       360      
pF1KSD ERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVR----RREQHLHKQKQKRI--S
       :. . ::. ....:.  .  :  : : . .   ..: .:    : ... ... :::.  .
CCDS46 EKPESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMA
         160       170       180       190       200       210     

          370       380       390       400       410       420    
pF1KSD AQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFT
        . :.    . : .. :   .   .. :  ::.: . : .           :: : . ..
CCDS46 EEDRKAMVPELRKKSRREYLAK--REREKLEDLEAELADE----------EFLFGDVELS
         220       230         240       250                 260   

          430       440             450       460                  
pF1KSD KQPEPVIPVKDATSDLAIIARK-GSQ-----TVRKHREQKERKKA---------------
       .. .  .  :  . :::   :  : :     : : :  .. : .                
CCDS46 RHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPG
           270       280       290       300       310       320   

                 470       480       490        500       510      
pF1KSD -QHKHWE-----LAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDY-RTEQKFADHMKRKSEAS
        ....::      :. :.:   ....: . . .. :.  ... :. :  .:.      .:
CCDS46 EEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTS
           330       340       350       360       370       380   

        520       530       540       550       560       570      
pF1KSD SEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTD
       ..  .:.::   :. ::.:  ..:::. : .....:. ::::::::::. ::: :.:::.
CCDS46 TQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTN
           390       400       410       420       430       440   

         580       590       600       610       620       630     
pF1KSD YGM-IGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLR
        :: :.::::::::::::: ::..::: .::.::::.::::::::: :...:::::.:::
CCDS46 KGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLR
           450       460       470       480       490       500   

         640       650       660       670       680       690     
pF1KSD ESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAF
       : : : ::  ::....::::::.:.::.::::...:.  : .::..:.:::::. .:..:
CCDS46 EFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTF
           510       520       530       540       550       560   

         700       710       720       730       740       750     
pF1KSD FGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEV
       : ..:.:.:::: :::::...:.:. ::.:: : . ::.:..  :::::.:. :::.::.
CCDS46 FDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEA
           570       580       590       600       610       620   

         760        770       780       790       800       810    
pF1KSD TSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTV
       . ... .. ..:  .   : :::::..::::.::.::: .: :.:: .:::::::::::.
CCDS46 ACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTI
           630       640       650       660       670       680   

          820       830       840       850       860       870    
pF1KSD DGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAY
       .::..:.: :.:: : .::: ::..: . : :.:.::::.:::::.. :.::::::  ::
CCDS46 EGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAY
           690       700       710       720       730       740   

          880       890       900       910       920       930    
pF1KSD KNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALD
       ..::  :::::::::.:.::::::::::..::..: :.:::: ...: .. ::. ::::.
CCDS46 QHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALN
           750       760       770       780       790       800   

          940       950       960       970       980        990   
pF1KSD NTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVP-AIFYRPKGREEE
       . : ::..:: :.:.:.:: ::::...:  ..:: ::: ...::::  .:::::: .  .
CCDS46 HLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVH
           810       820       830       840       850       860   

          1000      1010      1020      1030      1040      1050   
pF1KSD SDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMV
       .:. : .: .: .:::. :::: :: ...::. :: ..:.. ..::..:.:: ::. .. 
CCDS46 ADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLE
           870       880       890       900       910       920   

          1060      1070      1080      1090      1100      1110   
pF1KSD QQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYT
       . ...:.::  :.  ::: : :.::...:.:   : : ...  .   .::.:::: .   
CCDS46 RVEVGLSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQ--Q
           930       940       950        960       970         980

          1120      1130      1140      1150      1160      1170   
pF1KSD PDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAME
       : ...:::::.::::.:. :  ... :: :..: .:..:.                    
CCDS46 PRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREEL
              990      1000      1010      1020      1030      1040

          1180      1190      1200      1210      1220       
pF1KSD EEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMAPRRTPARFGL
                                                             
CCDS46 G                                                     
                                                             

>>CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4               (795 aa)
 initn: 1930 init1: 908 opt: 1856  Z-score: 1242.6  bits: 241.4 E(32554): 6.9e-63
Smith-Waterman score: 1959; 42.0% identity (71.9% similar) in 769 aa overlap (434-1166:25-786)

           410       420       430       440       450       460   
pF1KSD KVHLMVHNLVPPFLDGRIVFTKQPEPVIPVKDATSDLAIIARKGSQTVRKHREQKERKKA
                                     ::   :     :. ..  .. : ..::.. 
CCDS33       MSKRHRLDLGEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDRERERE
                     10        20        30        40        50    

           470       480       490            500       510        
pF1KSD QHKHWELAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAV-----TEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEAS--
       ..:. :: ..   . : ..    : ::      :....  . :..  . :  . ...:  
CCDS33 KEKEKELRAST--NAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSTHAGHAGHTSLP
           60          70        80        90       100       110  

           520             530       540       550       560       
pF1KSD ---SEFA------KKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQ
          . :.      .  .::..:  ::..  ....  :.  ..  ..:::::::::::. :
CCDS33 QCINPFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQ
            120       130       140       150       160       170  

       570          580       590       600       610       620    
pF1KSD YLHEDGYTDYGM---IGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTL
       .  :   .  :    ..:::::::::::::.::..::   ::.::::.::::::.: .:.
CCDS33 WCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTI
            180       190       200       210       220       230  

          630       640       650       660       670       680    
pF1KSD IKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTS
       .::::::.::::.. .  :..:..::.::::::.: ::.:.:.:.::: .:::::.:: :
CCDS33 LKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMS
            240       250       260       270       280       290  

          690       700       710       720       730       740    
pF1KSD ATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAP-GDI
       ::.:: ::  .: : :.. ::::: ::.:...  :..::.:::..  .:.:.     ::.
CCDS33 ATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDL
            300       310       320       330       340       350  

           750       760        770       780       790            
pF1KSD LIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAP----DGV
       :.:. :::.:. .  .: .....:  ..  . ..:.:: :: . : .::.  :    .:.
CCDS33 LLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYSTLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGA
            360       370       380       390       400       410  

        800       810       820       830       840       850      
pF1KSD --RKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGR
         :: .:.:::::::::.::..:::: :. : ::.:::: ...: .  ::.:.:.::.::
CCDS33 IGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESLLVTAISKASAQQRAGR
            420       430       440       450       460       470  

        860       870       880       890       900       910      
pF1KSD AGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPP
       :::: ::.::::::..:::.:.  .: ::: :.::..::: ::.::..::..: ::::: 
CCDS33 AGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPA
            480       490       500       510       520       530  

        920       930       940       950       960       970      
pF1KSD EDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVS
        .... ..  :  :.::.. : ::  : .:.:::::: :.::.:.:::..::.:.: :..
CCDS33 PETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSNEVLSITA
            540       550       560       570       580       590  

        980       990      1000      1010      1020      1030      
pF1KSD MLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAK
       :::::  : ::   .. .:. . .::  ..:::: ::::  .:.:. :. :: :.::. .
CCDS33 MLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFINYR
            600       610       620       630       640       650  

       1040      1050      1060            1070      1080      1090
pF1KSD AMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDW---DI---VRKCICAAYFHQAAKLKGIGEY
       .. .. .:: ::. ::  .:..:   .::.   :    .:: . ..:: :.:.:.  :.:
CCDS33 SLMSADNVRQQLSRIM--DRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHY
            660         670       680       690       700       710

             1100      1110      1120      1130      1140      1150
pF1KSD VNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYS
       .... ..  .:::.. :    . :....:.:.:.:::.:..  : .  :::....:..:.
CCDS33 LTVKDNQVVQLHPSTVL---DHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYD
              720          730       740       750       760       

                1160      1170      1180      1190      1200       
pF1KSD VK---QAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTP
       ..   :   .:: .:  ::                                         
CCDS33 MSNFPQCEAKRQLDRIIAKLQSKEYSQY                                
       770       780       790                                     

>>CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20             (672 aa)
 initn: 1630 init1: 776 opt: 1324  Z-score: 891.9  bits: 176.3 E(32554): 2.3e-43
Smith-Waterman score: 1764; 42.1% identity (73.6% similar) in 656 aa overlap (533-1166:18-668)

            510       520       530       540       550       560  
pF1KSD QKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKT
                                     :  ....:  .. .... ..: .  .. . 
CCDS54              MAAPVGPVKFWRPGTEGPGVSISEERQSLAENSGTTVVYNPYAALSI
                            10        20        30        40       

                  570        580       590       600       610     
pF1KSD TQLTQ------YLHEDGYTDYG-MIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRF
        :  :      :: : :.:  : ..: ::::::::..:: ::.:: :. ::.:::: :::
CCDS54 EQQRQKLPVFKYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYCIRF
        50        60        70        80        90       100       

         620        630       640       650       660       670    
pF1KSD EDCTSE-NTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVAR
       .:::..  : ::..:::.:.:: . .  : .::.:..::::::.: ::. .:::...  .
CCDS54 DDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIGLLKKIQKK
       110       120       130       140       150       160       

          680       690           700             710       720    
pF1KSD RSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNV----P------IFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYV
       :.::.:::.:::.::.::  ::..     :      :. . ::::::::.. ..:  ::.
CCDS54 RGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFPVDIFYLQSPVPDYI
       170       180       190       200       210       220       

          730       740       750       760       770          780 
pF1KSD EAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPA---LAVLPIYSQ
       ...:.  ...: . . ::.: :. :::..:.. ....:. . :  .     : :::.:. 
CCDS54 KSTVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPMYAG
       230       240       250       260       270       280       

             790       800       810       820       830       840 
pF1KSD LPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQ
       :::  : :.:...  .::: :::::.::::.:..::..::: :. ::...::: ... : 
CCDS54 LPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIECLV
       290       300       310       320       330       340       

             850       860       870       880       890       900 
pF1KSD IYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSL
       . :.:::.::::.::.::.  :.:.::::. :. ..:  .::::.::.::: :.: ::.:
CCDS54 VVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRLYTEEAF-DKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQLKAL
       350       360       370       380        390       400      

             910       920       930       940        950       960
pF1KSD GVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTST-GRLMVEFPLDPALSKMLI
       :....:.::::.::: ..:....  :. ::.::.   ::   :  ..::::.: ..:::.
CCDS54 GIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAKMLL
        410       420       430       440       450       460      

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD VSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKN
        : ..:::.::: :..:...  ::  : ... .. ....:::: :.::::.::.:  . .
CCDS54 ESGNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVVPPNQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIYEAFIK
        470       480       490       500       510       520      

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD NNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQ
       .: .. ::..::.. :.. ..  :: ::: ..:. ..   :   : :.: .:: ...: .
CCDS54 HNKDSKWCQEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQVPRKSSEGDPDLVLRCIVSGFFAN
        530       540       550       560       570       580      

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD AAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEW
       ::.... : : .::     :.::.: :..    : ...:.:...:.: ::. :::... :
CCDS54 AARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEK-PPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAIESAW
        590       600       610        620       630       640     

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD LAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVR
       : ::.: ::   : :   . . .:::                                  
CCDS54 LLELAPHFY---QQGTHLSLKAKRAKVQDP                              
         650          660       670                                

>>CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20             (703 aa)
 initn: 1589 init1: 776 opt: 1324  Z-score: 891.6  bits: 176.3 E(32554): 2.4e-43
Smith-Waterman score: 1904; 44.3% identity (75.6% similar) in 659 aa overlap (524-1166:46-699)

           500       510       520       530       540       550   
pF1KSD DGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIV
                                     :: .::: ::.: .....: .:.. . :..
CCDS13 EGPGVSISEERQSLAENSGTTVVYNPYAALSIEQQRQKLPVFKLRNHILYLIENYQTVVI
          20        30        40        50        60        70     

           560       570        580       590       600       610  
pF1KSD VGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYG-MIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYA
       ::::: ::.::. ::: : :.:  : ..: ::::::::..:: ::.:: :. ::.:::: 
CCDS13 VGETGCGKSTQIPQYLAEAGWTAEGRVVGVTQPRRVAAVTVAGRVAEERGAVLGHEVGYC
          80        90       100       110       120       130     

            620        630       640       650       660       670 
pF1KSD IRFEDCTSE-NTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREV
       :::.:::..  : ::..:::.:.:: . .  : .::.:..::::::.: ::. .:::...
CCDS13 IRFDDCTDQLATRIKFLTDGMLVREMMVDPLLTKYSVIMLDEAHERTLYTDIAIGLLKKI
         140       150       160       170       180       190     

             680       690           700             710       720 
pF1KSD VARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNV----P------IFHIPGRTFPVDILFSKTPQE
         .:.::.:::.:::.::.::  ::..     :      :. . ::::::::.. ..:  
CCDS13 QKKRGDLRLIVASATLDADKFRDFFNQNETSDPARDTCVILTVEGRTFPVDIFYLQSPVP
         200       210       220       230       240       250     

             730       740       750       760       770           
pF1KSD DYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPA---LAVLPI
       ::....:.  ...: . . ::.: :. :::..:.. ....:. . :  .     : :::.
CCDS13 DYIKSTVETVVKIHQTEGDGDVLAFLTGQEEVETVVSMLIEQARALARTGMKRHLRVLPM
         260       270       280       290       300       310     

      780       790       800       810       820       830        
pF1KSD YSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMD
       :. :::  : :.:...  .::: :::::.::::.:..::..::: :. ::...::: ...
CCDS13 YAGLPSFEQMKVFERVSRSVRKVIVATNVAETSITISGIVYVIDCGFVKLRAYNPRTAIE
         320       330       340       350       360       370     

      840       850       860       870       880       890        
pF1KSD ALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLL
        : . :.:::.::::.::.::.  :.:.::::. :. ..:  .::::.::.::: :.: :
CCDS13 CLVVVPVSQASANQRAGRGGRSRSGKCYRLYTEEAF-DKLPQSTVPEMQRSNLAPVILQL
         380       390       400       410        420       430    

      900       910       920       930       940        950       
pF1KSD KSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTST-GRLMVEFPLDPALSK
       :.::....:.::::.::: ..:....  :. ::.::.   ::   :  ..::::.: ..:
CCDS13 KALGIDNVLRFHFMSPPPAQSMVQALELLYALGGLDKDCRLTEPLGMRIAEFPLNPMFAK
          440       450       460       470       480       490    

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KSD MLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQ
       ::. : ..:::.::: :..:...  ::  : ... .. ....:::: :.::::.::.:  
CCDS13 MLLESGNFGCSQEILSIAAMMQIQNIFVVPPNQKSHAIRVHRKFAVEEGDHLTMLNIYEA
          500       510       520       530       540       550    

      1020      1030      1040      1050      1060      1070       
pF1KSD WKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAY
       . ..: .. ::..::.. :.. ..  :: ::: ..:. ..   :   : :.: .:: ...
CCDS13 FIKHNKDSKWCQEHFLNYKGLVRAATVREQLKKLLVKFQVPRKSSEGDPDLVLRCIVSGF
          560       570       580       590       600       610    

      1080      1090      1100      1110      1120      1130       
pF1KSD FHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVD
       : .::.... : : .::     :.::.: :..    : ...:.:...:.: ::. :::..
CCDS13 FANAARFHSTGAYRTIRDDHELHIHPASVLYAEK-PPRWVIYNEVIQTSKYYMRDVTAIE
          620       630       640        650       660       670   

      1140      1150      1160      1170      1180      1190       
pF1KSD GEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLG
       . :: ::.: ::   : :   . . .:::                               
CCDS13 SAWLLELAPHFY---QQGTHLSLKAKRAKVQDP                           
           680          690       700                              

>>CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17             (707 aa)
 initn: 1698 init1: 532 opt: 1257  Z-score: 847.3  bits: 168.1 E(32554): 7.1e-41
Smith-Waterman score: 1790; 44.0% identity (73.4% similar) in 638 aa overlap (528-1152:70-701)

       500       510       520       530       540       550       
pF1KSD DYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGET
                                     ::. :::: .. .::. .:. . ....:::
CCDS11 SGGRGGGGGRRQQPPLAQPSASPYPEAVELQRRSLPIFQARGQLLAQLRNLDNAVLIGET
      40        50        60        70        80        90         

       560       570       580       590       600       610       
pF1KSD GSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRFED
       :::::::. :::.: : .  :.:. ::::::::.:.: :::.:   .::. :::..::.:
CCDS11 GSGKTTQIPQYLYEGGISRQGIIAVTQPRRVAAISLATRVSDEKRTELGKLVGYTVRFDD
     100       110       120       130       140       150         

       620       630       640       650       660       670       
pF1KSD CTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSD
        :::.: ::..:::.::::.. .. : .:: .:.::::::...::::::... .  ::..
CCDS11 VTSEDTRIKFLTDGMLLREAISDSLLRKYSCVILDEAHERTIHTDVLFGVVKAAQKRRKE
     160       170       180       190       200       210         

            680       690       700       710       720       730  
pF1KSD L-----KLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSL
       :     :.:: :::::.. :. .:...:.... ::  :......: ::.::..::. . .
CCDS11 LGKLPLKVIVMSATMDVDLFSQYFNGAPVLYLEGRQHPIQVFYTKQPQNDYLHAALVSVF
     220       230       240       250       260       270         

            740         750          760       770       780       
pF1KSD QVHLSGAPG--DILIFMPGQEDIEVTSD---QIVEHLEELENAPALAVLPIYSQLPSDLQ
       :.: . ::.  :::.:. :::.::. :    .:..::   .. ::. :::.:..::   :
CCDS11 QIH-QEAPSSQDILVFLTGQEEIEAMSKTCRDIAKHLP--DGCPAMLVLPLYASLPYAQQ
     280        290       300       310         320       330      

       790       800       810       820       830       840       
pF1KSD AKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQ
        ..:: :: : :: :..:::::::.:. :: .:.:.:. : : .::  :...: .  .:.
CCDS11 LRVFQGAPKGYRKVIISTNIAETSITITGIKYVVDTGMVKAKKYNPDSGLEVLAVQRVSK
        340       350       360       370       380       390      

       850       860       870       880       890       900       
pF1KSD ANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLL
       ..: ::.:::::   : :.::::.. .. ..   ::::::: :::.:.: : .. : ..:
CCDS11 TQAWQRTGRAGREDSGICYRLYTEDEFE-KFDKMTVPEIQRCNLASVMLQLLAMKVPNVL
        400       410       420        430       440       450     

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pF1KSD QFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGAL---DNTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCD
        : ::. :  :..  .. :: .::::   :.   ::  :: :. :::.: ..: ...:  
CCDS11 TFDFMSKPSPDHIQAAIAQLDLLGALEHKDDQLTLTPMGRKMAAFPLEPKFAKTILMSPK
         460       470       480       490       500       510     

          970       980       990      1000      1010      1020    
pF1KSD MGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYS
       . :. ::: :::.::: .... : .:.:: . .:.::   :.::.: ::.:  .:: . .
CCDS11 FHCTEEILTIVSLLSVDSVLHNPPSRREEVQGVRKKFISSEGDHMTLLNIYRTFKNLGGN
         520       530       540       550       560       570     

         1030      1040      1050      1060      1070      1080    
pF1KSD TIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKL
         ::...:...: :  : ::::::.:: ... : .::   : . ::.:.  . : ..:.:
CCDS11 KDWCKENFVNSKNMTLVAEVRAQLRDICLKMSMPIASSRGDVESVRRCLAHSLFMSTAEL
         580       590       600       610       620       630     

         1090      1100      1110      1120      1130      1140    
pF1KSD KGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAEL
       .  : :..  : .:  .::.: ::     :  .:: ::..:.: ::. . ..:..:: : 
CCDS11 QPDGTYATTDTHQPVAIHPSSVLFHC--KPACVVYTELLYTNKCYMRDLCVIDAQWLYEA
         640       650       660         670       680       690   

         1150      1160      1170      1180      1190      1200    
pF1KSD GPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAMEEEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKI
       .: ..  :                                                    
CCDS11 APEYFRRKLRTARN                                              
           700                                                     

>>CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19              (1143 aa)
 initn: 1199 init1: 433 opt: 1155  Z-score: 777.3  bits: 155.8 E(32554): 5.7e-37
Smith-Waterman score: 1205; 36.8% identity (66.3% similar) in 552 aa overlap (519-1052:149-691)

      490       500       510       520       530       540        
pF1KSD KAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDN
                                     :..  .. ..:  :::    ...:  ....
CCDS12 QGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRILQTLKEH
      120       130       140       150       160       170        

      550       560       570       580       590       600        
pF1KSD SIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEE
       ..:.:.:.:: ::.::. :::   :..    ..::::::.: .:.::::. :  .. : .
CCDS12 QVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLAAGFSH---VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQ
      180       190       200          210       220       230     

      610       620       630       640       650       660        
pF1KSD VGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLL
       ::: ::::.  :  : : ..: :.:::.  :: .: .: ..:.::.::: :..: :.:.:
CCDS12 VGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVL
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pF1KSD REVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAV
       ....  : :::.:. :::..   :...:.:.:. ..::: ::. ....  :::    .. 
CCDS12 QRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVVYQ--PQEAEPTTSK
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pF1KSD KQSLQ----------VHLSGAP---GDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAV
       ...:.          .  .  :   ::.:.:. :. .: .. .    .  . .     .:
CCDS12 SEKLDPRPFLRVLESIDHKYPPEERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQR---WVV
           360       370       380       390       400          410

         780       790       800       810       820       830     
pF1KSD LPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRI
       ::..: :    : :.:. :: ::::::..:::::::.:.::: ::.:::  :   ..:. 
CCDS12 LPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQA
              420       430       440       450       460       470

         840       850       860       870       880       890     
pF1KSD GMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVV
        .. :: . ::::.:.::.::::::::: :::::..: : . .    ::::.:. : ..:
CCDS12 KLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDY-DAFAPYPVPEIRRVALDSLV
              480       490       500        510       520         

         900       910       920       930       940       950     
pF1KSD LLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPAL
       : .::..: :   : :..:::  .. ...  :   ::::.. .::  : :....:.: ..
CCDS12 LQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVI
     530       540       550       560       570       580         

         960       970       980       990      1000      1010     
pF1KSD SKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIFYRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNVY
       .::::..  ..    .: :.. ::: . : :      :    :. .   ..: .: .::.
CCDS12 GKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLESDQGDPFTLFNVF
     590       600       610       620       630       640         

             1020      1030      1040      1050      1060      1070
pF1KSD LQW-----KNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLASCGTDWDIVR
         :     . .  :  ::  . :. . . .. ..: :.:...                  
CCDS12 NAWVQVKSERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQVGDSY
     650       660       670       680       690       700         

             1080      1090      1100      1110      1120      1130
pF1KSD KCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHELVMTTKEYM
                                                                   
CCDS12 SRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASDGVDIQ
     710       720       730       740       750       760         

>>CCDS7652.1 DHX32 gene_id:55760|Hs108|chr10              (743 aa)
 initn: 985 init1: 411 opt: 1100  Z-score: 743.3  bits: 148.9 E(32554): 4.4e-35
Smith-Waterman score: 1214; 30.7% identity (66.1% similar) in 657 aa overlap (516-1149:49-697)

         490       500       510       520       530       540     
pF1KSD EPDKAVTEDGKVDYRTEQKFADHMKRKSEASSEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTII
                                     ::.. :   .:..:. :::.  .  ..  .
CCDS76 PESLDSSDGDEEEVLACEDLELNPFDGLPYSSRYYK---LLKEREDLPIWKEKYSFMENL
       20        30        40        50           60        70     

         550       560       570          580       590       600  
pF1KSD RDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHE---DGYTDYGMIGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMG
        .:.:::: :..  ::..:. :.  :   . . ..: . ::: .. .....: ::..:: 
CCDS76 LQNQIVIVSGDAKCGKSAQVPQWCAEYCLSIHYQHGGVICTQVHKQTVVQLALRVADEMD
          80        90       100       110       120       130     

            610       620       630       640       650       660  
pF1KSD GNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLRESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTD
        :.:.::::.: ::.: ...:...: :: .: :: . .  :  :..::.:. ::::. ::
CCDS76 VNIGHEVGYVIPFENCCTNETILRYCTDDMLQREMMSNPFLGSYGVIILDDIHERSIATD
         140       150       160       170       180       190     

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pF1KSD VLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAFFGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQED
       ::.:::..:.  : .::::..:.     :. ...::::.... ..  ::.... .  :.:
CCDS76 VLLGLLKDVLLARPELKLIINSSPHLISKLNSYYGNVPVIEVKNK-HPVEVVYLSEAQKD
         200       210       220       230       240        250    

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pF1KSD YVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEVTSDQIVEHLEELENAPALAVLPIYSQL
         :. ..  ...: ::  :::..:.  ..::: . . . .  .   .   :.:.:.:   
CCDS76 SFESILRLIFEIHHSGEKGDIVVFLACEQDIEKVCETVYQGSNLNPDLGELVVVPLY---
          260       270       280       290       300       310    

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pF1KSD PSDLQAKIFQKAPDGVRKC-------IVATNIAETSLTVDGIMFVIDSGYCKLKVFNPRI
       :.. . ..:.   .  ..:       ...:. .:  .  ... :::: :  . ::.::::
CCDS76 PKE-KCSLFKPLDETEKRCQVYQRRVVLTTSSGEFLIWSNSVRFVIDVGVERRKVYNPRI
              320       330       340       350       360       370

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pF1KSD GMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAYKNELLTTTVPEIQRTNLANVV
         ..: . ::::..:. :.   : .. :. : :::.   ....      :.:..::...:
CCDS76 RANSLVMQPISQSQAEIRKQILGSSSSGKFFCLYTEEFASKDMTPLKPAEMQEANLTSMV
              380       390       400       410       420       430

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pF1KSD LLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALDNTGGLTSTGRLMVEFPLDPAL
       :..: . .  : .  ::. :  ....... .:  :.:::: :.:.  : .: :::::: :
CCDS76 LFMKRIDIAGLGHCDFMNRPAPESLMQALEDLDYLAALDNDGNLSEFGIIMSEFPLDPQL
              440       450       460       470       480       490

         960       970       980        990      1000      1010    
pF1KSD SKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVPAIF-YRPKGREEESDQIREKFAVPESDHLTYLNV
       :: ...::.. : .:.: :..:...:  : . :.: :: .    . :  ::.::.: ...
CCDS76 SKSILASCEFDCVDEVLTIAAMVTAPNCFSHVPHGAEEAALTCWKTFLHPEGDHFTLISI
              500       510       520       530       540       550

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pF1KSD YLQWKNNNYSTI-------WCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMVQQRMSLA--SCGTD
       :  ..... ..        :: :.:.. .:.: .  .::.: .:. . ..  :  . :. 
CCDS76 YKAYQDTTLNSSSEYCVEKWCRDYFLNCSALRMADVIRAELLEIIKRIELPYAEPAFGSK
              560       570       580       590       600       610

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pF1KSD WDI--VRKCICAAYFHQAAK-LKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYTPDYIVYHEL
        .   ..: . ..:: : :. . : :.:. .   .  .::: :.       :.....:..
CCDS76 ENTLNIKKALLSGYFMQIARDVDGSGNYLMLTHKQVAQLHPLSGYSITKKMPEWVLFHKF
              620       630       640       650       660       670

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