Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0230
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0230, 1479 aa
1>>>pF1KSDA0230 1479 - 1479 aa - 1479 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8334+/-0.00157; mu= -9.9493+/- 0.092
mean_var=373.5959+/-78.049, 0's: 0 Z-trim(105.1): 323 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.066355
statistics sampled from 7933 (8267) to 7933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16
Scan time: 4.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2 (1479) 10083 981.8 0
CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8 (1463) 6186 608.7 4e-173
CCDS11602.1 EPX gene_id:8288|Hs108|chr17 ( 715) 1739 182.8 3.2e-45
CCDS11604.1 MPO gene_id:4353|Hs108|chr17 ( 745) 1721 181.1 1.1e-44
CCDS54149.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17 ( 629) 1598 169.3 3.4e-41
CCDS32689.1 LPO gene_id:4025|Hs108|chr17 ( 712) 1598 169.3 3.7e-41
CCDS1643.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2 ( 933) 1285 139.4 4.8e-32
CCDS1646.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2 ( 760) 868 99.4 4.2e-20
CCDS1644.1 TPO gene_id:7173|Hs108|chr2 ( 876) 795 92.5 6e-18
CCDS30956.1 HMCN1 gene_id:83872|Hs108|chr1 (5635) 710 84.9 7.3e-15
CCDS43109.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1378) 597 73.7 4.4e-12
CCDS54609.1 ROBO2 gene_id:6092|Hs108|chr3 (1394) 597 73.7 4.4e-12
CCDS54611.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1651) 593 73.4 6.6e-12
CCDS54610.1 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1551) 578 71.9 1.7e-11
CCDS46872.2 ROBO1 gene_id:6091|Hs108|chr3 (1606) 578 71.9 1.7e-11
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 565 70.6 3.8e-11
CCDS44755.1 ROBO3 gene_id:64221|Hs108|chr11 (1386) 557 69.9 6.2e-11
>>CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2 (1479 aa)
initn: 10083 init1: 10083 opt: 10083 Z-score: 5237.8 bits: 981.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10083; 100.0% identity (100.0% similar) in 1479 aa overlap (1-1479:1-1479)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQKPGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVPAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD APQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 APQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLYKN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTFNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTFNH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITPEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LNCERPRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LNCERPRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLDDG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGESVT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LECSATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LECSATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNIDS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDRRHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDRRHL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD VLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEVGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEVGA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD NVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARNTI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDLLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDLLAL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD INPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIGTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALSQAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 INPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIGTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALSQAR
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD FSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSVYPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSVYPR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQRSGKPLLPFATGPPTECM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQRSGKPLLPFATGPPTECM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD RDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRK
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD IVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LYRLDENFQPIAQDHLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LYRLDENFQPIAQDHLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD ERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREK
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD LKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD QLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD TRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFSTRSDAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFSTRSDAS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GTNDFREFVLEMQKTITDLRTQIKKLESRLSTTECVDAGGESHANNTKWKKDACTICECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GTNDFREFVLEMQKTITDLRTQIKKLESRLSTTECVDAGGESHANNTKWKKDACTICECK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470
pF1KSD DGQVTCFVEACPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DGQVTCFVEACPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP
1450 1460 1470
>>CCDS47855.1 PXDNL gene_id:137902|Hs108|chr8 (1463 aa)
initn: 5738 init1: 1891 opt: 6186 Z-score: 3221.6 bits: 608.7 E(32554): 4e-173
Smith-Waterman score: 6186; 60.9% identity (83.2% similar) in 1459 aa overlap (18-1470:5-1450)
10 20 30 40 50
pF1KSD MAKRSRGPGRRCLLALVLFCAWGTLAVVAQK--PGAGCPSRCLCFRTTVRCMHLLLEAVP
::: : :: ..: :: ::::::::..:::::::.:. .:
CCDS47 MEPRLFC-WTTLFLLAGWCLPGLPCPSRCLCFKSTVRCMHLMLDHIP
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD AVAPQTSILDLRFNRIREIQPGAFRRLRNLNTLLLNNNQIKRIPSGAFEDLENLKYLYLY
: ::..::::::::::: .::..:.::::::::::.:..: .::: :::: :::::
CCDS47 QVPQQTTVLDLRFNRIREIPGSAFKKLKNLNTLLLNNNHIRKISRNAFEGLENLLYLYLY
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KNEIQSIDRQAFKGLASLEQLYLHFNQIETLDPDSFQHLPKLERLFLHNNRITHLVPGTF
::::...:.:.:::: :::.::.::::.: :.:..: : .:::::::::..... :.:
CCDS47 KNEIHALDKQTFKGLISLEHLYIHFNQLEMLQPETFGDLLRLERLFLHNNKLSKIPAGSF
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NHLESMKRLRLDSNTLHCDCEILWLADLLKTYAESGNAQAAAICEYPRRIQGRSVATITP
..:.:.::::::::.: :::...::..::. .:. :..:::: ::::::..::.::..:
CCDS47 SNLDSLKRLRLDSNALVCDCDLMWLGELLQGFAQHGHTQAAATCEYPRRLHGRAVASVTV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EELNCERPRITSEPQDADVTSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWLRNNNELSMKTDSRLNLLD
::.::. :::: ::::..: :::::::::::::::::::::..::. :... :.:::..:
CCDS47 EEFNCQSPRITFEPQDVEVPSGNTVYFTCRAEGNPKPEIIWIHNNHSLDLEDDTRLNVFD
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DGTLMIQNTQETDQGIYQCMAKNVAGEVKTQEVTLRYFGSPARPTFVIQPQNTEVLVGES
::::::.::.:.:::.:::::.: :::.::: . ::: . ::.:.::::::.::::.: :
CCDS47 DGTLMIRNTRESDQGVYQCMARNSAGEAKTQSAMLRYSSLPAKPSFVIQPQDTEVLIGTS
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD VTLECSATGHPPPRISWTRGDRTPLPVDPRVNITPSGGLYIQNVVQGDSGEYACSATNNI
.:::: ::::: : :.::: . : .: ... :.:::.::..: : :...: :.:.
CCDS47 TTLECMATGHPHPLITWTRDN--GLELDGSRHVATSSGLYLQNITQRDHGRFTCHANNSH
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD DSVHATAFIIVQALPQFTVTPQDRVVIEGQTVDFQCEAKGNPPPVIAWTKGGSQLSVDRR
.:.:.: ::::: :::::::.:.::.: ..:.. ::: :::::::.::: :.:: :. .
CCDS47 GTVQAAANIIVQAPPQFTVTPKDQVVLEEHAVEWLCEADGNPPPVIVWTKTGGQLPVEGQ
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD HLVLSSGTLRISGVALHDQGQYECQAVNIIGSQKVVAHLTVQPRVTPVFASIPSDTTVEV
: :::::::::. .: :::::::::::. .: .:: ..:::.:.. ::...:.::.:::
CCDS47 HTVLSSGTLRIDRAAQHDQGQYECQAVSSLGVKKVSVQLTVKPKALAVFTQLPQDTSVEV
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GANVQLPCSSQGEPEPAITWNKDGVQVTESGKFHISPEGFLTINDVGPADAGRYECVARN
: :... : .::::.: :::::.:::.:::::::.. :: ::: :.: : :::::::::
CCDS47 GKNINISCHAQGEPQPIITWNKEGVQITESGKFHVDDEGTLTIYDAGFPDQGRYECVARN
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KSD TIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHLFDSRPRSPNDLL
..: : ..: :.:.. . . :: :: .::..:. :: :::::: :::...:.. .:::
CCDS47 SFGLAVTNMFLTVTAIQGRQAGDDFVESSILDAVQRVDSAINSTRRHLFSQKPHTSSDLL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIA
: :.::::: ::.::::::::.:::::.:.:..:: :::.: ..:::::::. :.:::
CCDS47 AQFHYPRDPLIVEMARAGEIFEHTLQLIRERVKQGLTVDLEGKEFRYNDLVSPRSLSLIA
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTP
:::::::.: . :::. ::: :::.:::::::::.: :::.:::: :::. .:..:. .:
CCDS47 NLSGCTARRPLPNCSNRCFHAKYRAHDGTCNNLQQPTWGAALTAFARLLQPAYRDGIRAP
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KSD RGIN-PHRLYNGHALPMPRLVSTTLIGTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALS
::.. : . . . :: ::::.:. . .::::...:.:::.:: ::.:::: :: :::
CCDS47 RGLGLP--VGSRQPLPPPRLVATVWARAAAVTPDHSYTRMLMHWGWFLEHDLDHTVPALS
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KSD QARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSV
::::::. ::.::.:::::: . : :. . : ::.:.::::.:.:: : ..::
CCDS47 TARFSDGRPCSSVCTNDPPCFPMNTRHADPRG-THAPCMLFARSSPACASGRPSATVDSV
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KSD YPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQR-SGKPLLPFATGPP
: :::::: :.:::.::::::.:.:....:: . ::::. :. ::::::::.::::
CCDS47 YAREQINQQTAYIDGSNVYGSSERESQALRDPSVPRGLLKTGFPWPPSGKPLLPFSTGPP
890 900 910 920 930 940
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD TECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYY
::: :.:.::: :::::::::::.:.:..:::::::::::.:::: :::::.:.:.:
CCDS47 TECARQEQESP--CFLAGDHRANEHLALAAMHTLWFREHNRMATELSALNPHWEGNTVYQ
950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD ETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTL
:.:::::::.:::::.:::::.::. : : : :.::.:..::::.:.::::::::::::
CCDS47 EARKIVGAELQHITYSHWLPKVLGDPGTRMLRGYRGYNPNVNAGIINSFATAAFRFGHTL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD VNPLLYRLDENFQPIAQDHLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLN
.::.::::. .. :.. :::.:::.::: ::..::::::.::::::::.: :.:: ::.
CCDS47 INPILYRLNATLGEISEGHLPFHKALFSPSRIIKEGGIDPVLRGLFGVAAKWRAPSYLLS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD TELTERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPE
:::.:::: :...:.: :: :::::::::::: :.::.:::.....::::.::::. :
CCDS47 PELTQRLFSAAYSAAVDSAATIIQRGRDHGIPPYVDFRVFCNLTSVKNFEDLQNEIKDSE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD IREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGV
::.::..:::: .:::.:::.::::.::.:.:::::::. :::.:::::::.:::::::
CCDS47 IRQKLRKLYGSPGDIDLWPALMVEDLIPGTRVGPTLMCLFVTQFQRLRDGDRFWYENPGV
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD FSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCC
:.::::::.::.::.:.::::.:.: .::.::: ::.:. : .:.:::.::::::::::
CCDS47 FTPAQLTQLKQASLSRVLCDNGDSIQQVQADVFVKAEYPQDYLNCSEIPKVDLRVWQDCC
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD EDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKT--RPRKIPSVGRQGEHLSNSTSAFS
:::.:::: : . . . .:: ..:: :: . . : :. .. :: : : .
CCDS47 ADCRSRGQFRAVTQESQKKRSAQYSYPVDKDMELSHLRSRQQDKI-YVGEDARNVTVLAK
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD TRSDASGTNDFREFVLEMQKTITDLRTQIKKLESRLSTTECVDAGGESHANNTKWKKDAC
:. ..:: :. :.:.::: :: ::.:::.:: . :.:. : . . .: :. :
CCDS47 TKF----SQDFSTFAAEIQETITALREQINKLEARLRQAGCTDVRGVPRKAEERWMKEDC
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1440 1450 1460 1470
pF1KSD TICECKDGQVTCFVEACPPATCAVPVNIPGACCPVCLQKRAEEKP
: : :..::::: :: :::: : : . :.:::::
CCDS47 THCICESGQVTCVVEICPPAPCPSPELVKGTCCPVCRDRGMPSDSPEKR
1420 1430 1440 1450 1460
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:.:: :: : : :. . . : ::
CCDS11 VLATLVLAQPCEGTDPASPGAVETSVLRDCIAEAKLLVDAAYNWTQKSIKQRLRSGSASP
10 20 30 40 50 60
660 670 680 690 700 710
pF1KSD NDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYL
:::. :. : : .::.. .. .: :..:..: . .: .. .:... :
CCDS11 MDLLSYFKQPV-AATRTVVRAADYMHVALGLLEEKLQP----QRSGP-FNVTDVLTEPQL
70 80 90 100 110 120
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENG
:... :::. . ... ::: :::: : ::: ..:. ::: :. : : . ::.:
CCDS11 RLLSQASGCALRDQAERCSD-----KYRTITGRCNNKRRPLLGASNQALARWLPAEYEDG
130 140 150 160 170
780 790 800 810 820 830
pF1KSD FNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLI--GTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDST
.. : : .: : :: ::. : ::. .. .: .: :. . :.::::::.::::: .
CCDS11 LSLPFGWTPSRRRNGFLLPLVRAVSNQIVRFPNERLTSDRGRALMFMQWGQFIDHDLDFS
180 190 200 210 220 230
840 850 860 870 880 890
pF1KSD VVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSL
. ... :. : : .:.. :::: . ::::: : .. :. : ::.: : .
CCDS11 PESPARVAFTAGVDCERTCAQLPPCFPIKIPPNDPRIKNQRDCIPFFRSAPSCPQ-----
240 250 260 270 280 290
900 910 920 930 940
pF1KSD LMNSVYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQR---SGKPLL
:. :.::: :::..::: :::: . .:. ... ::: .: :: .:. ::
CCDS11 --NKNRVRNQINALTSFVDASMVYGSEVSLSLRLRNRTNYLGLL--AINQRFQDNGRALL
300 310 320 330 340
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pF1KSD PFATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHW
:: . :. . . :::::::: :..: :..::::..:::::.:::: .:::.:
CCDS11 PFDNLHDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSTETPKLAAMHTLFMREHNRLATELRRLNPRW
350 360 370 380 390 400
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD DGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEV-GMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFATA
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CCDS11 NGDKLYNEARKIMGAMVQIITYRDFLPLVLGKARARRTLGHYRGYCSNVDPRVANVF-TL
410 420 430 440 450 460
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD AFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQD-HLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGK
:::::::...:...::: ... : . :.:: .:::. .::: ::::::.::::... .:
CCDS11 AFRFGHTMLQPFMFRLDSQYRASAPNSHVPLSSAFFASWRIVYEGGIDPILRGLMATPAK
470 480 490 500 510 520
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD MRVPSQLLNTELTERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFED
. . .: :: .::: ... ..:::::.:.::.::::.: :. .: .:.:: ... .
CCDS11 LNRQDAMLVDELRDRLFRQVRRIGLDLAALNMQRSRDHGLPGYNAWRRFCGLSQPRNLAQ
530 540 550 560 570 580
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD LKNEIKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGD
:. .:: .. .:. :::. :::.. . ..: :.::.:.:: : ::. .::.: ::::
CCDS11 LSRVLKNQDLARKFLNLYGTPDNIDIWIGAIAEPLLPGARVGPLLACLFENQFRRARDGD
590 600 610 620 630 640
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD RLWYENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRV
:.:... :::. : ... ::.::.:::. .:: :. :.::. .:.:. .:..:::.
CCDS11 RFWWQKRGVFTKRQRKALSRISLSRIICDNT-GITTVSRDIFRANIYPRGFVNCSRIPRL
650 660 670 680 690 700
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD DLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLS
.: .:.
CCDS11 NLSAWRGT
710
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560 570 580 590 600 610
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CCDS11 MGVPFFSSLRCMVDLGPCWAGGLTAEMKLLLALAGLLAILA--
10 20 30 40
620 630 640 650 660
pF1KSD VPDVSRNGDP---------FVATSIVEAIATVDRAINSTRTHL---FDSRPRSPNDLLAL
.:. :... : .: .:. :: ::.: . : . . : :: .::.
CCDS11 TPQPSEGAAPAVLGEVDTSLVLSSMEEAKQLVDKAYKERRESIKQRLRSGSASPMELLSY
50 60 70 80 90 100
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVSPQYLNLIANL
:. : : .::.. .. .:.:...... .: .. .:...: ::....
CCDS11 FKQPVAA-TRTAVRAADYLHVALDLLERKLR-----SLWRRPFNVTDVLTPAQLNVLSKS
110 120 130 140 150
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pF1KSD SGCTAHRRVN-NCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPR
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CCDS11 SGC-AYQDVGVTCPE---QDKYRTITGMCNNRRSPTLGASNRAFVRWLPAEYEDGFSLPY
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD GINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLI--GTETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHDLDSTVVALS
: .: :: . . : ::. .. :. .:::.. . :.:::::.:::::: : .
CCDS11 GWTPGVKRNGFPVALARAVSNEIVRFPTDQLTPDQERSLMFMQWGQLLDHDLDFTPEPAA
220 230 240 250 260 270
840 850 860 870 880 890
pF1KSD QARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVC-GSGMTSLLMNS
.: : : .: . : ..:::: . ::::: : .. : :. : :: :.: ::..:
CCDS11 RASFVTGVNCETSCVQQPPCFPLKIPPNDPRIKNQADCIPFFRSCPACPGSNITI-----
280 290 300 310 320
900 910 920 930 940 950
pF1KSD VYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGIVQR---SGKPLLPFAT
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CCDS11 ---RNQINALTSFVDASMVYGSEEPLARNLRNMSNQLGLL--AVNQRFQDNGRALLPFDN
330 340 350 360 370 380
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD GPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDT
:. . . :::::::: :..:. ::::::: .:::::.:::: .:::.:::.
CCDS11 LHDDPCLLTNRSARIPCFLAGDTRSSEMPELTSMHTLLLREHNRLATELKSLNPRWDGER
390 400 410 420 430 440
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRT-LGEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRF
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CCDS11 LYQEARKIVGAMVQIITYRDYLPLVLGPTAMRKYLPTYRSYNDSVDPRIANVF-TNAFRY
450 460 470 480 490 500
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD GHTLVNPLLYRLDENFQPIAQD-HLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVP
::::..:...:::. .::. . ..:: ..::. .:.: ::::::.::::... .:.
CCDS11 GHTLIQPFMFRLDNRYQPMEPNPRVPLSRVFFASWRVVLEGGIDPILRGLMATPAKLNRQ
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD SQLLNTELTERLFSMAHTVALDLAAINIQRGRDHGIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNE
.:. :. :::: .. ..::: :.:.::.::::.: :. .: .:.: .: .: .
CCDS11 NQIAVDEIRERLFEQVMRIGLDLPALNMQRSRDHGLPGYNAWRRFCGLPQPETVGQLGTV
570 580 590 600 610 620
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD IKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPGSRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWY
..: .. .:: . ::. :::.. . : : : .:.:: : :...:::..::::::.:.
CCDS11 LRNLKLARKLMEQYGTPNNIDIWMGGVSEPLKRKGRVGPLLACIIGTQFRKLRDGDRFWW
630 640 650 660 670 680
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD ENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQSDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRV
:: :::: : . : :: ::.:::. : ....: .:. . .:. .: ..:
CCDS11 ENEGVFSMQQRQALAQISLPRIICDNTGITTVSKNNIFMSNSYPRDFVNCSTLPALNLAS
690 700 710 720 730 740
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD WQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQEDKPTKKTRPRKIPSVGRQGEHLSNSTS
:..
CCDS11 WREAS
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CCDS54 ALLASLILLQAAASTTRDPSLDLTSLSLEVGCGAPAPVVRC-DPC--SPYRTITGDCNNR
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pF1KSD QHPMWGASLTAFERLLKSVYENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIG--TETVT
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CCDS54 RKPALGAANRALARWLPAEYEDGLSLPFGWTPGKTRNGFPLPLAREVSNKIVGYLNEEGV
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pF1KSD PDEQFTHMLMQWGQFLDHDLD-STVVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSR
:.. . ..:::::..::::: . . :.....: .: :.. : . :: .:.:::: .
CCDS54 LDQNRSLLFMQWGQIVDHDLDFAPDTELGSSEYSKAQ-CDEYCIQGDNCFPIMFPPNDPK
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD ARSGARCMFFVRSSPVCGSGMTSLLMNSVYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRD
: . ..:: : :.. :: . . : ::::: :::..::: ::.: : .:.
CCDS54 AGTQGKCMPFFRAGFVCPTPPYKSLA-----REQINALTSFLDASFVYSSEPSLASRLRN
190 200 210 220 230
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pF1KSD LASHRGLLRQGI-VQRSGKPLLPFATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSM
:.: ::. . :. : : ::. . :. : .. . .::::::: ::.:.. :..
CCDS54 LSSPLGLMAVNQEVSDHGLPYLPYDSKKPSPCEFINTTARVPCFLAGDSRASEHILLATS
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD HTLWFREHNRIATELLKLNPHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTL
:::..:::::.: :: .:::.:::. .: :.:::.:: .: ::.. .:: .::. .. .
CCDS54 HTLFLREHNRLARELKRLNPQWDGEKLYQEARKILGAFVQIITFRDYLPILLGDHMQKWI
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pF1KSD GEYHGYDPGINAGIFNAFATAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQD-HLPLHKAFFSPF
:.::. ... : :.: : :::::: : ..:::::.:: . . .:::: ::. .
CCDS54 PPYQGYSESVDPRISNVF-TFAFRFGHLEVPSSMFRLDENYQPWGPEPELPLHTLFFNTW
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD RIVNEGGIDPLLRGLFGVAGKMRVPSQLLNTELTERLFSMAHTV-ALDLAAINIQRGRDH
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CCDS54 RMVKDGGIDPLVRGLLAKKSKLMKQNKMMTGELRNKLFQPTHRIHGFDLAAINTQRCRDH
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD GIPPYHDYRVYCNLSAAHTFEDLKNEIKNPEIREKLKRLYGSTLNIDLFPALVVEDLVPG
: : :...:..:.:: .:.:.:.. .:. . .:: :::. :::.. . ..: ::
CCDS54 GQPGYNSWRAFCDLSQPQTLEELNTVLKSKMLAKKLLGLYGTPDNIDIWIGAIAEPLVER
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pF1KSD SRLGPTLMCLLSTQFKRLRDGDRLWYENPGVFSPAQLTQIKQTSLARILCDNADNITRVQ
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CCDS54 GRVGPLLACLLGKQFQQIRDGDRFWWENPGVFTNEQKDSLQKMSFSRLVCDNT-RITKVP
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD SDVFRVAEFPHGYGSCDEIPRVDLRVWQDCCEDCRTRGQFNAFSYHFRGRRSLEFSYQED
: : . .:. . .:. : ..:: :
CCDS54 RDPFWANSYPYDFVDCSAIDKLDLSPWASVKN
600 610 620
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pF1KSD CVARNTIGSASVSMVLSVNVPDVSRNGDPFVATSIVEAIATVDRAINSTRTHL---FDSR
.. .. .: . :..:. ..::.: ..:.
CCDS32 LLHLPALLASLILLQAAASTTRAQTTRTSAISDTVSQAKVQVNKAFLDSRTRLKTAMSSE
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD PRSPNDLLALFRYPRDPYTVEQARAGEIFERTLQLIQEHVQHGLMVDLNGTSYHYNDLVS
. .: ... . : : :...:..:. .. :.. ..... : ::.:
CCDS32 TPTSRQLSEYLKHAKG-RTRTAIRNGQVWEESLKRLR---QKASLTNVTDPSL---DLTS
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pF1KSD PQYLNLIANLSGCTAHRRVNNCSDMCFHQKYRTHDGTCNNLQHPMWGASLTAFERLLKSV
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CCDS32 ---LSLEV---GCGAPAPVVRC-DPC--SPYRTITGDCNNRRKPALGAANRALARWLPAE
120 130 140 150 160
780 790 800 810 820
pF1KSD YENGFNTPRGINPHRLYNGHALPMPRLVSTTLIG--TETVTPDEQFTHMLMQWGQFLDHD
::.:.. : : .: . :: ::. : ::. ..: .: . :.. . ..:::::..:::
CCDS32 YEDGLSLPFGWTPGKTRNGFPLPLAREVSNKIVGYLNEEGVLDQNRSLLFMQWGQIVDHD
170 180 190 200 210 220
830 840 850 860 870 880
pF1KSD LD-STVVALSQARFSDGQHCSNVCSNDPPCFSVMIPPNDSRARSGARCMFFVRSSPVCGS
:: . . :.....: .: :.. : . :: .:.:::: .: . ..:: : :.. :: .
CCDS32 LDFAPDTELGSSEYSKAQ-CDEYCIQGDNCFPIMFPPNDPKAGTQGKCMPFFRAGFVCPT
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD GMTSLLMNSVYPREQINQLTSYIDASNVYGSTEHEARSIRDLASHRGLLRQGI-VQRSGK
. : ::::: :::..::: ::.: : .:.:.: ::. . :. :
CCDS32 PPYKSLA-----REQINALTSFLDASFVYSSEPSLASRLRNLSSPLGLMAVNQEVSDHGL
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950 960 970 980 990 1000
pF1KSD PLLPFATGPPTECMRDENESPIPCFLAGDHRANEQLGLTSMHTLWFREHNRIATELLKLN
: ::. . :. : .. . .::::::: ::.:.. :.. :::..:::::.: :: .::
CCDS32 PYLPYDSKKPSPCEFINTTARVPCFLAGDSRASEHILLATSHTLFLREHNRLARELKRLN
350 360 370 380 390 400
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD PHWDGDTIYYETRKIVGAEIQHITYQHWLPKILGEVGMRTLGEYHGYDPGINAGIFNAFA
:.:::. .: :.:::.:: .: ::.. .:: .::. .. . :.::. ... : :.:
CCDS32 PQWDGEKLYQEARKILGAFVQIITFRDYLPILLGDHMQKWIPPYQGYSESVDPRISNVF-
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD TAAFRFGHTLVNPLLYRLDENFQPIAQD-HLPLHKAFFSPFRIVNEGGIDPLLRGLFGVA
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CCDS32 TFAFRFGHLEVPSSMFRLDENYQPWGPEPELPLHTLFFNTWRMVKDGGIDPLVRGLLAKK
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
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CCDS32 LEELNTVLKSKMLAKKLLGLYGTPDNIDIWIGAIAEPLVERGRVGPLLACLLGKQFQQIR
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..:: :
CCDS32 DKLDLSPWASVKN
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CCDS16 CEESGRRVLVYSCRHGYELQGREQLTCTQEGWDFQPPLCKDVNECADGAHPPCHASARCR
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CCDS16 --HPDLPGLWLHQAFFSPWT---------LLRG--G------------------------
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CCDS16 ----------------------YNEWREFCGLPRLETPADLSTAIASRSVADKILDLYKH
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CCDS16 PDNIDVWLGGLAENFLPRARTGPLFACLIGKQMKALRDGDWFWWENSHVFTDAQRRELEK
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CCDS16 HSLSRVICDNT-GLTRVPMDAFQVGKFPEDFESCDSITGMNLEAWRETFPQDDKCGFPES
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CCDS16 VENGDFVHCEESGRRVLVYSCRHGYELQGREQLTCTQEGWDFQPPLCKDVNECADGAHPP
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CCDS30 SRPFSVSSISQLRTGALFILNLWASDKGTYICEAENQFGKIQSETTVTVT----GLVAPL
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CCDS30 IGISPSVANVIEGQQLTLPCTLLAGNPIPERRWIKNSAMLLQ--NPYITVRSDGSLHIER
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CCDS30 VQLQDGGEYTCVASNVAGTNNKTTSVVVHVL-----PTIQHGQQILSTIEGIPVTLPCKA
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CCDS30 SGNPKPSVIWSKKGELISTSSAKFSAGADGSLYVVSPGGEESGEYVCTATNTAGYAKRKV
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CCDS30 QLTVYVRPRVFGDQRGLSQDKPVEISVLAGEEVTLPCEVKSLPPPIITWAKETQLISPFS
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CCDS30 PRHTFLPSGSMKITETRTSDSGMYLCVATNIAGNVTQAVKLNVH--VPPKIQRGPKHLKV
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CCDS30 QVGQRVDIPCNAQGTPLPVITWSKGGSTMLVDGEHHVSNPDGTLSIDQATPSDAGIYTCV
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