FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0245, 515 aa
1>>>pF1KSDA0245 515 - 515 aa - 515 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1618+/-0.000985; mu= 19.1740+/- 0.060
mean_var=65.1611+/-13.138, 0's: 0 Z-trim(103.9): 31 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.158884
statistics sampled from 7634 (7655) to 7634 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32470.1 SLC7A6 gene_id:9057|Hs108|chr16 ( 515) 3394 787.1 0
CCDS9574.1 SLC7A7 gene_id:9056|Hs108|chr14 ( 511) 2522 587.2 1.4e-167
CCDS9590.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 535) 1665 390.8 2e-108
CCDS10964.1 SLC7A5 gene_id:8140|Hs108|chr16 ( 507) 1621 380.7 2.1e-105
CCDS12431.1 SLC7A10 gene_id:56301|Hs108|chr19 ( 523) 1544 363.1 4.4e-100
CCDS3742.1 SLC7A11 gene_id:23657|Hs108|chr4 ( 501) 1509 355.0 1.1e-97
CCDS12425.1 SLC7A9 gene_id:11136|Hs108|chr19 ( 487) 1365 322.0 9.4e-88
CCDS58305.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 430) 1086 258.0 1.5e-68
CCDS41924.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 332) 952 227.3 2.2e-59
CCDS34917.1 SLC7A13 gene_id:157724|Hs108|chr8 ( 470) 881 211.1 2.3e-54
CCDS58304.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 ( 311) 809 194.5 1.5e-49
>>CCDS32470.1 SLC7A6 gene_id:9057|Hs108|chr16 (515 aa)
initn: 3394 init1: 3394 opt: 3394 Z-score: 4202.1 bits: 787.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3394; 100.0% identity (100.0% similar) in 515 aa overlap (1-515:1-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAREPGRPTPTYHLVPNTSQSQVEEDVSSPPQRSSETMQLKKEISLLNGVSLVVGNMIG
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CCDS32 MEAREPGRPTPTYHLVPNTSQSQVEEDVSSPPQRSSETMQLKKEISLLNGVSLVVGNMIG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SGIFVSPKGVLVHTASYGMSLIVWAIGGLFSVVGALCYAELGTTITKSGASYAYILEAFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGIFVSPKGVLVHTASYGMSLIVWAIGGLFSVVGALCYAELGTTITKSGASYAYILEAFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GFIAFIRLWVSLLVVEPTGQAIIAITFANYIIQPSFPSCDPPYLACRLLAAACICLLTFV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NCAYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEHFQDAFEGSSWDMGNLSLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NCAYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEHFQDAFEGSSWDMGNLSLAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD YSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNISDVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNISDVLS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDLLSMIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDLLSMIH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD IERFTPIPALLFNCTMALIYLIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWKEPKRPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IERFTPIPALLFNCTMALIYLIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWKEPKRPR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLFTDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESRRPLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLFTDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESRRPLFI
430 440 450 460 470 480
490 500 510
pF1KSD RNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
490 500 510
>>CCDS9574.1 SLC7A7 gene_id:9056|Hs108|chr14 (511 aa)
initn: 2530 init1: 2503 opt: 2522 Z-score: 3121.9 bits: 587.2 E(32554): 1.4e-167
Smith-Waterman score: 2522; 73.6% identity (89.2% similar) in 500 aa overlap (20-515:11-507)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAREPGRPTPTYHLVPNTSQSQVEE----DVSSPPQRSSETMQLKKEISLLNGVSLVVG
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CCDS95 MVDSTEYEVASQPEVETSPLGDGASP---GPEQVKLKKEISLLNGVCLIVG
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD NMIGSGIFVSPKGVLVHTASYGMSLIVWAIGGLFSVVGALCYAELGTTITKSGASYAYIL
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CCDS95 NMIGSGIFVSPKGVLIYSASFGLSLVIWAVGGLFSVFGALCYAELGTTIKKSGASYAYIL
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EAFGGFIAFIRLWVSLLVVEPTGQAIIAITFANYIIQPSFPSCDPPYLACRLLAAACICL
::::::.::::::.:::..:::.:::::::::::..:: :::: :: : ::::::::::
CCDS95 EAFGGFLAFIRLWTSLLIIEPTSQAIIAITFANYMVQPLFPSCFAPYAASRLLAAACICL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LTFVNCAYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEHFQDAFEGSSWDMGNL
:::.::::::::: ::: ::::::.::::.:: :.:.: :: : ::...:::::. .:..
CCDS95 LTFINCAYVKWGTLVQDIFTYAKVLALIAVIVAGIVRLGQGASTHFENSFEGSSFAVGDI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SLALYSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNIS
.:::::::::::::::::.::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::..
CCDS95 ALALYSALFSYSGWDTLNYVTEEIKNPERNLPLSIGISMPIVTIIYILTNVAYYTVLDMR
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DVLSSDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDLL
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CCDS95 DILASDAVAVTFADQIFGIFNWIIPLSVALSCFGGLNASIVAASRLFFVGSREGHLPDAI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SMIHIERFTPIPALLFNCTMALIYLIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWKEP
:::.:::::.:.:::: :::::: :::.::::::.:::::::::::.:::::::::::
CCDS95 CMIHVERFTPVPSLLFNGIMALIYLCVEDIFQLINYYSFSYWFFVGLSIVGQLYLRWKEP
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KRPRPLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLFTDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESRR
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CCDS95 DRPRPLKLSVFFPIVFCLCTIFLVAVPLYSDTINSLIGIAIALSGLPFYFLIIRVPEHKR
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510
pF1KSD PLFIRNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
::..: .... :: : ::. : .:.:. . . .. :
CCDS95 PLYLRRIVGSATRYLQVLCMSVAAEMDLEDGGEMPKQRDPKSN
470 480 490 500 510
>>CCDS9590.1 SLC7A8 gene_id:23428|Hs108|chr14 (535 aa)
initn: 1626 init1: 885 opt: 1665 Z-score: 2060.0 bits: 390.8 E(32554): 2e-108
Smith-Waterman score: 1665; 49.2% identity (81.2% similar) in 484 aa overlap (25-503:20-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAREPGRPTPTYHLVPNTSQSQVEEDVSSPPQRSSETMQLKKEISLLNGVSLVVGNMIG
: :.: .. . :::::.:... ...:::.::
CCDS95 MEEGARHRNNTEKKHPGGGESDASPEAGSGGGGVALKKEIGLVSACGIIVGNIIG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SGIFVSPKGVLVHTASYGMSLIVWAIGGLFSVVGALCYAELGTTITKSGASYAYILEAFG
::::::::::: ...: :..:::: . :...:::::::::::.:: :::..:.:. . ::
CCDS95 SGIFVSPKGVLENAGSVGLALIVWIVTGFITVVGALCYAELGVTIPKSGGDYSYVKDIFG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GFIAFIRLWVSLLVVEPTGQAIIAITFANYIIQPSFPSCDPPYLACRLLAAACICLLTFV
:. .:.:::...::. ::.::.::.::.::..:: ::.: :: . ::::: :. :::.:
CCDS95 GLAGFLRLWIAVLVIYPTNQAVIALTFSNYVLQPLFPTCFPPESGLRLLAAICLLLLTWV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KSD NCAYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEHF----QDAFEG-SSWDMGN
::. :.:.::::: :: .:..:: ::.::.:..:.: :.: ..:::. . :.:
CCDS95 NCSSVRWATRVQDIFTAGKLLALALIIIMGIVQICKG--EYFWLEPKNAFENFQEPDIGL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LSLALYSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNI
..::. .. :.:.::. ::.::::. .: .::: :: ::.:.::..:...:::: :...
CCDS95 VALAFLQGSFAYGGWNFLNYVTEELVDPYKNLPRAIFISIPLVTFVYVFANVAYVTAMSP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SDVLSSDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDL
...:.:.::::::... .:...: .::.:::: :::.:.:.:.::::::.:.::::::..
CCDS95 QELLASNAVAVTFGEKLLGVMAWIMPISVALSTFGGVNGSLFTSSRLFFAGAREGHLPSV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LSMIHIERFTPIPALLFNCTMALIYLIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWKE
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CCDS95 LAMIHVKRCTPIPALLFTCISTLLMLVTSDMYTLINYVGFINYLFYGVTVAGQIVLRWKK
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD PKRPRPLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLFTDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESR
: :::.:....:::.. . .::.. :... . ::..: :.::: ::.::: ..
CCDS95 PDIPRPIKINLLFPIIYLLFWAFLLVFSLWSEPVVCGIGLAIMLTGVPVYFLGVYW--QH
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KSD RPLFIRNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
.: . . . .: .:..: : :..
CCDS95 KPKCFSDFIELLTLVSQKMCVVVYPEVERGSGTEEANEDMEEQQQPMYQPTPTKDKDVAG
480 490 500 510 520 530
>>CCDS10964.1 SLC7A5 gene_id:8140|Hs108|chr16 (507 aa)
initn: 1643 init1: 940 opt: 1621 Z-score: 2005.8 bits: 380.7 E(32554): 2.1e-105
Smith-Waterman score: 1621; 51.9% identity (83.1% similar) in 443 aa overlap (30-470:35-477)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAREPGRPTPTYHLVPNTSQSQVEEDVSSPPQRSSETMQLKKEISLLNGVSLVVGNMI
: : .: . :...:.:::::...::..:
CCDS10 GPKRRALAAPAAEEKEEAREKMLAAKSADGSAPAGEGEGVTLQRNITLLNGVAIIVGTII
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GSGIFVSPKGVLVHTASYGMSLIVWAIGGLFSVVGALCYAELGTTITKSGASYAYILEAF
::::::.: ::: ...: :..:.::: :.::.:::::::::::::.:::..:::.::..
CCDS10 GSGIFVTPTGVLKEAGSPGLALVVWAACGVFSIVGALCYAELGTTISKSGGDYAYMLEVY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GGFIAFIRLWVSLLVVEPTGQAIIAITFANYIIQPSFPSCDPPYLACRLLAAACICLLTF
:.. ::..::. ::...:..: :.:..::.:...: ::.: : : .:.: :. :::
CCDS10 GSLPAFLKLWIELLIIRPSSQYIVALVFATYLLKPLFPTCPVPEEAAKLVACLCVLLLTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VNCAYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEHFQD--AFEGSSWDMGNLS
::: :: .:::::.:. ::..:: ::..:.:.. .: ... .:::.. :.::.
CCDS10 VNCYSVKAATRVQDAFAAAKLLALALIILLGFVQIGKGDVSNLDPNFSFEGTKLDVGNIV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LALYSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNISD
:::::.::.:.::. :::::::. :: ::::::: ::.:::::.:.:::.::.:.:. .
CCDS10 LALYSGLFAYGGWNYLNFVTEEMINPYRNLPLAIIISLPIVTLVYVLTNLAYFTTLSTEQ
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VLSSDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDLLS
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CCDS10 MLSSEAVAVDFGNYHLGVMSWIIPVFVGLSCFGSVNGSLFTSSRLFFVGSREGHLPSILS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD MIHIERFTPIPALLFNCTMALIYLIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWKEPK
::: . .::.:.:.:.:.:.:.: . .:.:..::.::: :. :.:...:...:: ..:.
CCDS10 MIHPQLLTPVPSLVFTCVMTLLYAFSKDIFSVINFFSFFNWLCVALAIIGMIWLRHRKPE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RPRPLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLFTDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESRRP
::.:... .:. : . .::. : .. .. ::. : :::.: ::.::.
CCDS10 LERPIKVNLALPVFFILACLFLIAVSFWKTPVECGIGFTIILSGLPVYFFGVWWKNKPKW
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510
pF1KSD LFIRNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
CCDS10 LLQGIFSTTVLCQKLMQVVPQET
490 500
>>CCDS12431.1 SLC7A10 gene_id:56301|Hs108|chr19 (523 aa)
initn: 1505 init1: 777 opt: 1544 Z-score: 1910.2 bits: 363.1 E(32554): 4.4e-100
Smith-Waterman score: 1544; 44.0% identity (76.5% similar) in 511 aa overlap (4-510:6-505)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAREP-GRPTPTYHLVPNTSQSQVEEDVSSPPQRSSETMQLKKEISLLNGVSLVVGN
..: :: .: : : : : : . .:: . :::::.::.. ....::
CCDS12 MAGHTQQPSGRGNPR----PAPSPSPVPGTVPG----ASERVALKKEIGLLSACTIIIGN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD MIGSGIFVSPKGVLVHTASYGMSLIVWAIGGLFSVVGALCYAELGTTITKSGASYAYILE
.::::::.:::::: :..: :..:.::..:: ...:.:::::::..: :::..:::. :
CCDS12 IIGSGIFISPKGVLEHSGSVGLALFVWVLGGGVTALGSLCYAELGVAIPKSGGDYAYVTE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AFGGFIAFIRLWVSLLVVEPTGQAIIAITFANYIIQPSFPSCDPPYLACRLLAAACICLL
:::. .:. :: ..:.. ::. :.:..::.::..:: ::.: :: : :.:. ::. ::
CCDS12 IFGGLAGFLLLWSAVLIMYPTSLAVISMTFSNYVLQPVFPNCIPPTTASRVLSMACLMLL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD TFVNCAYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEHFQDAFEGSSW---DMG
:.:: . :.:.::.:: :: .:..:: :: .::... ::: :... . . : ..:
CCDS12 TWVNSSSVRWATRIQDMFTGGKLLALSLIIGVGLLQIFQGHFEELRPSNAFAFWMTPSVG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NLSLALYSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLN
.:.::. .. :..:::. ::.::::. . ..::: :: ::.:.::..: .::.::.:...
CCDS12 HLALAFLQGSFAFSGWNFLNYVTEEMVDARKNLPRAIFISIPLVTFVYTFTNIAYFTAMS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ISDVLSSDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPD
...:::.::::::... .:.:::..:..:::: :::.:. .:. ::: : :.::::::.
CCDS12 PQELLSSNAVAVTFGEKLLGYFSWVMPVSVALSTFGGINGYLFTYSRLCFSGAREGHLPS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LLSMIHIERFTPIPALLFNCTMALIYLIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWK
::.:::... ::::::: : . . ..: :.. :::: :: .. :....: : :::.
CCDS12 LLAMIHVRHCTPIPALLVCCGATAVIMLVGDTYTLINYVSFINYLCYGVTILGLLLLRWR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EPKRPRPLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLFTDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPES
.: ::.:.....:... . .::.. .... . .:. : :.:::..:.::.
CCDS12 RPALHRPIKVNLLIPVAYLVFWAFLLVFSFISEPMVCGVGVIIILTGVPIFFLGVFW--R
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510
pF1KSD RRPLFIRNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
.: .. . ..:. :.::: : . :. ::...
CCDS12 SKPKCVHRLTESMTHWGQELCFVVYPQ-DAPEEEENGPCPPSLLPATDKPSKPQ
480 490 500 510 520
>>CCDS3742.1 SLC7A11 gene_id:23657|Hs108|chr4 (501 aa)
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Smith-Waterman score: 1509; 46.5% identity (79.9% similar) in 473 aa overlap (31-503:32-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAREPGRPTPTYHLVPNTSQSQVEEDVSSPPQRSSETMQLKKEISLLNGVSLVVGNMIG
:: ..: .:::....:: :::...:..::
CCDS37 VRKPVVSTISKGGYLQGNVNGRLPSLGNKEPP--GQEKVQLKRKVTLLRGVSIIIGTIIG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
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CCDS37 AGIFISPKGVLQNTGSVGMSLTIWTVCGVLSLFGALSYAELGTTIKKSGGHYTYILEVFG
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD GFIAFIRLWVSLLVVEPTGQAIIAITFANYIIQPSFPSCDPPYLACRLLAAACICLLTFV
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CCDS37 PLPAFVRVWVELLIIRPAATAVISLAFGRYILEPFFIQCEIPELAIKLITAVGITVVMVL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NCAYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEHFQDAFEGSSWDMGNLSLAL
: :.:..:.: .:. :..:.. ::: :...: .:....:.::: : . .. : ::.
CCDS37 NSMSVSWSARIQIFLTFCKLTAILIIIVPGVMQLIKGQTQNFKDAFSGRDSSITRLPLAF
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pF1KSD YSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNISDVLS
: ....:.:: :::::::..:::...:::: ::: :::. :.::::::.:..: ..:
CCDS37 YYGMYAYAGWFYLNFVTEEVENPEKTIPLAICISMAIVTIGYVLTNVAYFTTINAEELLL
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pF1KSD SDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDLLSMIH
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CCDS37 SNAVAVTFSERLLGNFSLAVPIFVALSCFGSMNGGVFAVSRLFYVASREGHLPEILSMIH
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... ::.::.. ...:.:. :. .:.:..::. :.:.::.:.: .:::.: : :
CCDS37 VRKHTPLPAVIVLHPLTMIMLFSGDLDSLLNFLSFARWLFIGLAVAGLIYLRYKCPDMHR
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pF1KSD PLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLFTDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESRRPLFI
:.:. .:.: .: . .:.: . :..: ... ::. :.:.::: :.. .. ...: ..
CCDS37 PFKVPLFIPALFSFTCLFMVALSLYSDPFSTGIGFVITLTGVPAYYL--FIIWDKKPRWF
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490 500 510
pF1KSD RNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
: . ::: : :. . :. : :
CCDS37 RIMSEKITR-TLQIILEVVPEEDKL
480 490 500
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10 20 30 40 50 60
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.:. . .:: .: .. .: .:.::..:..:.:..::..::
CCDS12 MGDTGLRKRREDEKSIQSQEPKTTSLQKELGLISGISIIVGTIIG
10 20 30 40
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pF1KSD SGIFVSPKGVLVHTASYGMSLIVWAIGGLFSVVGALCYAELGTTITKSGASYAYILEAFG
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CCDS12 SGIFVSPKSVLSNTEAVGPCLIIWAACGVLATLGALCFAELGTMITKSGGEYPYLMEAYG
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD GFIAFIRLWVSLLVVEPTGQAIIAITFANYIIQPSFPSCDPPYLACRLLAAACICLLTFV
. :.. :.::.:..::. ::: ..:..:. : . .: :: .. . :::: : ... :
CCDS12 PIPAYLFSWASLIVIKPTSFAIICLSFSEYVCAPFYVGCKPPQIVVKCLAAAAILFISTV
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pF1KSD NCAYVKWGTRVQDTFTYAKVVALIAIIVMGLVKLCQGHSEHFQDAFEGSSWDMGNLSLAL
: :. :. ::. :: ::.: . ::. ::: : ::....:...:::.. ..: .:::.
CCDS12 NSLSVRLGSYVQNIFTAAKLVIVAIIIISGLVLLAQGNTKNFDNSFEGAQLSVGAISLAF
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD YSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNISDVLS
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CCDS12 YNGLWAYDGWNQLNYITEELRNPYRNLPLAIIIGIPLVTACYILMNVSYFTVMTATELLQ
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD SDAVAVTFADQTFGMFSWTIPIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDLLSMIH
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CCDS12 SQAVAVTFGDRVLYPASWIVPLFVAFSTIGAANGTCFTAGRLIYVAGREGHMLKVLSYIS
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD IERFTPIPALLFNCTMALIYLIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWKEPKRPR
..:.:: ::..: .: ::.: :. .:.:::::. :.: ::...: . .:. . . :
CCDS12 VRRLTPAPAIIFYGIIATIYIIPGDINSLVNYFSFAAWLFYGLTILGLIVMRFTRKELER
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD PLKLSVFFPIVFCICSVFLVIVPLFTD-TINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESRRPLF
:.:. : .:... . :::::..:... : . : . . :::. :::. :.
CCDS12 PIKVPVVIPVLMTLISVFLVLAPIISKPTWEYLYCVLFILSGLLFYFLFVHYKFGWAQKI
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510
pF1KSD IRNVLAAITRGTQQLCFCVLTELDVAEEKKDERKTD
CCDS12 SKPITMHLQMLMEVVPPEEDPE
470 480
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150 160 170 180 190 200
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CCDS58 WCVLGRERPFRKAQSTSSPLEGVPRFLKRLLLTWVNCSSVRWATRVQDIFTAGKLLALAL
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::.::.:..:.: :.: ..:::. . :.: ..::. .. :.:.::. ::.::::.
CCDS58 IIIMGIVQICKG--EYFWLEPKNAFENFQEPDIGLVALAFLQGSFAYGGWNFLNYVTEEL
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pF1KSD KNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVLNISDVLSSDAVAVTFADQTFGMFSWTI
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CCDS58 VDPYKNLPRAIFISIPLVTFVYVFANVAYVTAMSPQELLASNAVAVTFGEKLLGVMAWIM
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pF1KSD PIAVALSCFGGLNASIFASSRLFFVGSREGHLPDLLSMIHIERFTPIPALLFNCTMALIY
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CCDS58 PISVALSTFGGVNGSLFTSSRLFFAGAREGHLPSVLAMIHVKRCTPIPALLFTCISTLLM
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD LIVEDVFQLINYFSFSYWFFVGLSVVGQLYLRWKEPKRPRPLKLSVFFPIVFCICSVFLV
:.. :.. :::: .: ..: :..:.::. ::::.: :::.:....:::.. . .::.
CCDS58 LVTSDMYTLINYVGFINYLFYGVTVAGQIVLRWKKPDIPRPIKINLLFPIIYLLFWAFLL
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD IVPLFTDTINSLIGIGIALSGVPFYFMGVYLPESRRPLFIRNVLAAITRGTQQLCFCVLT
. :... . ::..: :.::: ::.::: ...: . . . .: .:..: :
CCDS58 VFSLWSEPVVCGIGLAIMLTGVPVYFLGVYW--QHKPKCFSDFIELLTLVSQKMCVVVYP
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510
pF1KSD ELDVAEEKKDERKTD
:..
CCDS58 EVERGSGTEEANEDMEEQQQPMYQPTPTKDKDVAGQPQP
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CCDS41 MGIVQICKG--EYFWLEPKNAFENFQEPDI
10 20
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pF1KSD GNLSLALYSALFSYSGWDTLNFVTEEIKNPERNLPLAIGISMPIVTLIYILTNVAYYTVL
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CCDS41 GLVALAFLQGSFAYGGWNFLNYVTEELVDPYKNLPRAIFISIPLVTFVYVFANVAYVTAM
30 40 50 60 70 80
300 310 320 330 340 350
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. ...:.:.::::::... .:...: .::.:::: :::.:.:.:.::::::.:.::::::
CCDS41 SPQELLASNAVAVTFGEKLLGVMAWIMPISVALSTFGGVNGSLFTSSRLFFAGAREGHLP
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..:.:::..: ::::::::.: .:..:.. :.. :::: .: ..: :..:.::. :::
CCDS41 SVLAMIHVKRCTPIPALLFTCISTLLMLVTSDMYTLINYVGFINYLFYGVTVAGQIVLRW
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:.: :::.:....:::.. . .::.. :... . ::..: :.::: ::.:::
CCDS41 KKPDIPRPIKINLLFPIIYLLFWAFLLVFSLWSEPVVCGIGLAIMLTGVPVYFLGVYW--
210 220 230 240 250 260
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...: . . . .: .:..: : :..
CCDS41 QHKPKCFSDFIELLTLVSQKMCVVVYPEVERGSGTEEANEDMEEQQQPMYQPTPTKDKDV
270 280 290 300 310 320
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CCDS34 MDRGEKIQLKRVFGYWWGTSFLLINIIGAGIFVS
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CCDS34 PKGVLAYSCMNVGVSLCVWAGCAILAMTSTLCSAEISISFPCSGAQYYFLKRYFGSTVAF
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. ::.::.. :....: . .:.: ::: ::::. : : . :: : . .. ...
CCDS34 LNLWTSLFL----GSGVVAGQALLLAEYSIQPFFPSCSVPKLPKKCLALAMLWIVGILTS
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CCDS34 RGVKEVTWLQIASSVLKVSILSFISLTGVVFLIRGKKENVERFQNAFDAELPDISHLIQA
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.... :.::: ..... :.:.:. ..: : ..:.::..:.:.:..: :::. ..:
CCDS34 IFQGYFAYSGGACFTLIAGELKKPRTTIPKCIFTALPLVTVVYLLVNISYLTVLTPREIL
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CCDS34 EKMTCYLQLLFNICLPDVSEE
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]