Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0277
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0277, 580 aa
1>>>pF1KSDA0277 580 - 580 aa - 580 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9642+/-0.00103; mu= 15.4940+/- 0.062
mean_var=76.7923+/-15.365, 0's: 0 Z-trim(104.0): 78 B-trim: 361 in 1/51
Lambda= 0.146358
statistics sampled from 7586 (7664) to 7586 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7 ( 730) 3360 719.5 3.5e-207
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 791) 1582 344.1 3.9e-94
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 840) 1582 344.1 4.1e-94
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 858) 1582 344.1 4.2e-94
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 867) 1582 344.1 4.2e-94
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (1011) 1582 344.1 4.9e-94
CCDS77022.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 511) 1224 268.4 1.5e-71
CCDS77023.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 505) 1221 267.8 2.3e-71
CCDS11363.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 456) 1168 256.6 5e-68
CCDS31784.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 ( 881) 1134 249.5 1.3e-65
CCDS41775.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 ( 923) 1134 249.5 1.3e-65
CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499) 576 131.8 6e-30
CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391) 551 126.5 2.2e-28
CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1504) 551 126.5 2.3e-28
CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509) 551 126.5 2.3e-28
CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1601) 551 126.5 2.5e-28
CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1609) 551 126.5 2.5e-28
CCDS48047.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1077) 391 92.7 2.6e-18
CCDS78450.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1094) 391 92.7 2.6e-18
CCDS48048.1 RAPGEF1 gene_id:2889|Hs108|chr9 (1095) 391 92.7 2.6e-18
CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237) 390 92.5 3.4e-18
CCDS42065.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 ( 489) 381 90.4 5.6e-18
CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257) 381 90.6 1.3e-17
CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273) 381 90.6 1.3e-17
CCDS55344.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 305) 310 75.3 1.2e-13
CCDS55346.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 529) 310 75.4 2e-13
CCDS55345.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 537) 310 75.4 2e-13
CCDS35143.1 RALGPS1 gene_id:9649|Hs108|chr9 ( 557) 310 75.4 2e-13
CCDS65733.1 RALGPS2 gene_id:55103|Hs108|chr1 ( 557) 306 74.6 3.7e-13
CCDS1325.1 RALGPS2 gene_id:55103|Hs108|chr1 ( 583) 306 74.6 3.8e-13
CCDS76733.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 597) 280 69.1 1.8e-11
CCDS45221.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 762) 280 69.2 2.2e-11
CCDS45222.1 RASGRP1 gene_id:10125|Hs108|chr15 ( 797) 280 69.2 2.3e-11
CCDS1802.1 SOS1 gene_id:6654|Hs108|chr2 (1333) 281 69.5 3.1e-11
>>CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7 (730 aa)
initn: 3359 init1: 3359 opt: 3360 Z-score: 3833.0 bits: 719.5 E(32554): 3.5e-207
Smith-Waterman score: 3360; 95.4% identity (96.9% similar) in 542 aa overlap (40-580:189-730)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD DPHLERKDSAAALSDRELPLPTFDVPYFKYIDEEDEDDEWSSRSQSSTEDDSVDSLLSD-
. :.:.. .. : .. : :
CCDS55 LAKENYQFLQTDKKEQEKSEHQDDEVTTVQVKEQDQSVLVLKKVQCCGPAPTAGSAESHW
160 170 180 190 200 210
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RYVVVSGTPEKILEHLLNDLHLEEVQDKETETLLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RYVVVSGTPEKILEHLLNDLHLEEVQDKETETLLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSA
220 230 240 250 260 270
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KKYQGKEENSDVPRRKRKVLHLVSQWIALYKDWLPEDEHSKMFLKTIYRNVLDDVYEYPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KKYQGKEENSDVPRRKRKVLHLVSQWIALYKDWLPEDEHSKMFLKTIYRNVLDDVYEYPI
280 290 300 310 320 330
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LEKELKEFQKILGMHRRHTVDEYSPQKKNKALFHQFSLKENWLQHRGTVTETEEIFCHVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LEKELKEFQKILGMHRRHTVDEYSPQKKNKALFHQFSLKENWLQHRGTVTETEEIFCHVY
340 350 360 370 380 390
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ITEHSYVSVKAKVSSIAQEILKVVAEKIQYAEEDLALVAITFSGEKHELQPNDLVISKSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ITEHSYVSVKAKVSSIAQEILKVVAEKIQYAEEDLALVAITFSGEKHELQPNDLVISKSL
400 410 420 430 440 450
310 320 330 340 350 360
pF1KSD EASGRIYVYRKDLADTLNPFAENEESQQRSMRILGMNTWDLALELMNFDWSLFNSIHEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EASGRIYVYRKDLADTLNPFAENEESQQRSMRILGMNTWDLALELMNFDWSLFNSIHEQE
460 470 480 490 500 510
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LIYFTFSRQGSGEHTANLSLLLQRCNEVQLWVATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LIYFTFSRQGSGEHTANLSLLLQRCNEVQLWVATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCK
520 530 540 550 560 570
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AQRNLNSFFAIVMGLNTASVSRLSQTWEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQRNLNSFFAIVMGLNTASVSRLSQTWEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKK
580 590 600 610 620 630
490 500 510 520 530 540
pF1KSD MKPPKIPFMPLLLKDVTFIHEGNKTFLDNLVNFEKLHMIADTVRTLRHCRTNQFGDLSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MKPPKIPFMPLLLKDVTFIHEGNKTFLDNLVNFEKLHMIADTVRTLRHCRTNQFGDLSPK
640 650 660 670 680 690
550 560 570 580
pF1KSD EHQELKSYVNHLYVIDSQQALFELSHRIEPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EHQELKSYVNHLYVIDSQQALFELSHRIEPRV
700 710 720 730
>>CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (791 aa)
initn: 1309 init1: 975 opt: 1582 Z-score: 1803.5 bits: 344.1 E(32554): 3.9e-94
Smith-Waterman score: 1582; 47.2% identity (76.9% similar) in 523 aa overlap (63-579:271-789)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DVPYFKYIDEEDEDDEWSSRSQSSTEDDSVDSLLSDRYVVVSGTPEKILEHLLNDLHLEE
.: ...:.:.::::::::::.:. ..::
CCDS74 EANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTPEKILEHFLETIRLEA
250 260 270 280 290 300
100 110 120 130 140 150
pF1KSD VQDKETETLLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSAKKYQGKE-ENSDVP-RRKRKVLHL
. .. :...:.::.. . ::: . .:: ::. :: :. :: : :. : ::.:..:
CCDS74 TLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQEKMDYALNNKRRVIRL
310 320 330 340 350 360
160 170 180 190 200 210
pF1KSD VSQWIALYKDWLPEDEHSKMFLKTIYRNVLDDVYEYPILEKELKEFQKILGMHRRHTVDE
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CCDS74 VLQWAAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEKIV---KQISEDA
370 380 390 400 410
220 230 240 250 260 270
pF1KSD YSPQKKNKALFHQFSLKENWLQHRGTVTETEEIFCHVYITEHSYVSVKAKVSSIAQEILK
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CCDS74 KAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQPIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVIS
420 430 440 450 460 470
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VVAEKIQYAEEDLALVAITFSGEKHELQPNDLVISKSLEASGRIYVYRKDLADTLNPFAE
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CCDS74 AVADKLGSGE-GLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPE
480 490 500 510 520 530
340 350 360 370 380
pF1KSD NEESQQRSMRILG-MNTWDLALELMNFDWSLFNSIHEQELIYFTFSRQGSGEHTANLSLL
.: .. . :.. ::: .. .:: ::: .:: :::: ::.:.. . ::::.:.
CCDS74 QEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLF
540 550 560 570 580 590
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LQRCNEVQLWVATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCKAQRNLNSFFAIVMGLNTASVS
:.: ::.:.::.::: :::::.:::::.::::::::::: .::::::::::::....::
CCDS74 LRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVS
600 610 620 630 640 650
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RLSQTWEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKKMKPPKIPFMPLLLKDVTFIHE
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CCDS74 RLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYRLTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHE
660 670 680 690 700 710
510 520 530 540 550 560
pF1KSD GNKTFLDNLVNFEKLHMIADTVRTLRHCRTNQFG-DLSP--KEHQELKSYVNHLYVIDSQ
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CCDS74 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ
720 730 740 750 760 770
570 580
pF1KSD QALFELSHRIEPRV
..: ..:::.:::
CCDS74 RTLSQMSHRLEPRRP
780 790
>>CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (840 aa)
initn: 1309 init1: 975 opt: 1582 Z-score: 1803.1 bits: 344.1 E(32554): 4.1e-94
Smith-Waterman score: 1582; 47.2% identity (76.9% similar) in 523 aa overlap (63-579:320-838)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DVPYFKYIDEEDEDDEWSSRSQSSTEDDSVDSLLSDRYVVVSGTPEKILEHLLNDLHLEE
.: ...:.:.::::::::::.:. ..::
CCDS63 EANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTPEKILEHFLETIRLEA
290 300 310 320 330 340
100 110 120 130 140 150
pF1KSD VQDKETETLLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSAKKYQGKE-ENSDVP-RRKRKVLHL
. .. :...:.::.. . ::: . .:: ::. :: :. :: : :. : ::.:..:
CCDS63 TLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQEKMDYALNNKRRVIRL
350 360 370 380 390 400
160 170 180 190 200 210
pF1KSD VSQWIALYKDWLPEDEHSKMFLKTIYRNVLDDVYEYPILEKELKEFQKILGMHRRHTVDE
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CCDS63 VLQWAAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEKIV---KQISEDA
410 420 430 440 450 460
220 230 240 250 260 270
pF1KSD YSPQKKNKALFHQFSLKENWLQHRGTVTETEEIFCHVYITEHSYVSVKAKVSSIAQEILK
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CCDS63 KAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQPIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVIS
470 480 490 500 510 520
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VVAEKIQYAEEDLALVAITFSGEKHELQPNDLVISKSLEASGRIYVYRKDLADTLNPFAE
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CCDS63 AVADKLGSGE-GLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPE
530 540 550 560 570 580
340 350 360 370 380
pF1KSD NEESQQRSMRILG-MNTWDLALELMNFDWSLFNSIHEQELIYFTFSRQGSGEHTANLSLL
.: .. . :.. ::: .. .:: ::: .:: :::: ::.:.. . ::::.:.
CCDS63 QEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLF
590 600 610 620 630 640
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LQRCNEVQLWVATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCKAQRNLNSFFAIVMGLNTASVS
:.: ::.:.::.::: :::::.:::::.::::::::::: .::::::::::::....::
CCDS63 LRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVS
650 660 670 680 690 700
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RLSQTWEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKKMKPPKIPFMPLLLKDVTFIHE
::. ::::.:.::::...:.::: ::: ::.::: . :..:: :::::::.::.:: ::
CCDS63 RLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYRLTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHE
710 720 730 740 750 760
510 520 530 540 550 560
pF1KSD GNKTFLDNLVNFEKLHMIADTVRTLRHCRTNQFG-DLSP--KEHQELKSYVNHLYVIDSQ
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CCDS63 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ
770 780 790 800 810 820
570 580
pF1KSD QALFELSHRIEPRV
..: ..:::.:::
CCDS63 RTLSQMSHRLEPRRP
830 840
>>CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (858 aa)
initn: 1309 init1: 975 opt: 1582 Z-score: 1802.9 bits: 344.1 E(32554): 4.2e-94
Smith-Waterman score: 1582; 47.2% identity (76.9% similar) in 523 aa overlap (63-579:338-856)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD DVPYFKYIDEEDEDDEWSSRSQSSTEDDSVDSLLSDRYVVVSGTPEKILEHLLNDLHLEE
.: ...:.:.::::::::::.:. ..::
CCDS63 EANTVRLKEHDQDVLVLEKVPAGNRASNQGNSQPQQKYTVMSGTPEKILEHFLETIRLEA
310 320 330 340 350 360
100 110 120 130 140 150
pF1KSD VQDKETETLLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSAKKYQGKE-ENSDVP-RRKRKVLHL
. .. :...:.::.. . ::: . .:: ::. :: :. :: : :. : ::.:..:
CCDS63 TLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLCPALVAHYHAQPSQGTEQEKMDYALNNKRRVIRL
370 380 390 400 410 420
160 170 180 190 200 210
pF1KSD VSQWIALYKDWLPEDEHSKMFLKTIYRNVLDDVYEYPILEKELKEFQKILGMHRRHTVDE
: :: :.: : : ::. : ::. .: .: ::. :...: :..::. .. . :
CCDS63 VLQWAAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEKIV---KQISEDA
430 440 450 460 470 480
220 230 240 250 260 270
pF1KSD YSPQKKNKALFHQFSLKENWLQHRGTVTETEEIFCHVYITEHSYVSVKAKVSSIAQEILK
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CCDS63 KAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQPIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVIS
490 500 510 520 530 540
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VVAEKIQYAEEDLALVAITFSGEKHELQPNDLVISKSLEASGRIYVYRKDLADTLNPFAE
.::.:. .: : .: .. .::: :.:::. . .: .::... .. :.:.:. :
CCDS63 AVADKLGSGE-GLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPE
550 560 570 580 590 600
340 350 360 370 380
pF1KSD NEESQQRSMRILG-MNTWDLALELMNFDWSLFNSIHEQELIYFTFSRQGSGEHTANLSLL
.: .. . :.. ::: .. .:: ::: .:: :::: ::.:.. . ::::.:.
CCDS63 QEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLF
610 620 630 640 650 660
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LQRCNEVQLWVATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCKAQRNLNSFFAIVMGLNTASVS
:.: ::.:.::.::: :::::.:::::.::::::::::: .::::::::::::....::
CCDS63 LRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVS
670 680 690 700 710 720
450 460 470 480 490 500
pF1KSD RLSQTWEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKKMKPPKIPFMPLLLKDVTFIHE
::. ::::.:.::::...:.::: ::: ::.::: . :..:: :::::::.::.:: ::
CCDS63 RLALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYRLTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHE
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..: ..:::.:::
CCDS63 RTLSQMSHRLEPRRP
850
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.: ...:.:.::::::::::.:. ..::
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.::::.:.:..::. .. :.: . ..:.. .:: .:.:..... :.. ..:...
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:::::.::::::::..:::.:.::.:. :.. :. : . :.::...::: .: :::.:
CCDS42 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ
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..: ..:::.:::
CCDS42 RTLSQMSHRLEPRRP
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pF1KSD VQDKETETLLDDFLLTYTVFMTTDDLCQALLRHYSAKKYQGKE-ENSDVP-RRKRKVLHL
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CCDS42 VLQWAAMYGDLLQEDDVSMAFLEEFYVSVSDDARMIAALKEQLPELEKIV---KQISEDA
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pF1KSD YSPQKKNKALFHQFSLKENWLQHRGTVTETEEIFCHVYITEHSYVSVKAKVSSIAQEILK
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CCDS42 KAPQKKHKVLLQQFNTGDERAQKRQPIRGSDEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEVIS
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pF1KSD VVAEKIQYAEEDLALVAITFSGEKHELQPNDLVISKSLEASGRIYVYRKDLADTLNPFAE
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CCDS42 AVADKLGSGE-GLIIVKMSSGGEKVVLKPNDVSVFTTLTINGRLFACPREQFDSLTPLPE
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CCDS42 QEGPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLF
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pF1KSD LQRCNEVQLWVATEILLCSQLGKRVQLVKKFIKIAAHCKAQRNLNSFFAIVMGLNTASVS
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CCDS42 LRRFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVS
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pF1KSD RLSQTWEKIPGKFKKLFSELESLTDPSLNHKAYRDAFKKMKPPKIPFMPLLLKDVTFIHE
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CCDS42 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ
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pF1KSD QALFELSHRIEPRV
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CCDS42 RTLSQMSHRLEPRRP
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CCDS77 IMKDESLYQGLREDTLRLHQLVETVELKIPEENQPPSKQVKPLFRHFRRIDSCLQTRVAF
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CCDS77 GEKVLLQPTEDCVFTALGINSHLFACTRDSYEALVPLPEEIQVSPGDTEIHRVEPEDVAN
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CCDS77 MMLRPGYPLSQESFPIDILLDDIVLTHSLFLPTEKFLQELHQYFV-
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CCDS77 YMPDHSYVTIRSRLSASVQDILGSVTEKLQYSEEPAGREDSLILVAVSSSGEKVLLQPTE
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CCDS77 DCVFTALGINSHLFACTRDSYEALVPLPEEIQVSPGDTEIHRVEPEDVANHLTAFHWELF
230 240 250 260 270 280
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CCDS77 KIAALCKQNQDLLSFYAVVMGLDNAAVSRLRLTWEKLPGKFKNLFRKFENLTDPCRNHKS
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pF1KSD YRDAFKKMKPPKIPFMPLLLKDVTFIHEGNKTFLDNLVNFEKLHMIADTVRTLRHCRTNQ
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CCDS77 YREVISKMKPPVIPFVPLILKDLTFLHEGSKTLVDGLVNIEKLHSVAEKVRTIRKYRSRP
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pF1KSD FG-DL--SPKEHQELKSYVNHLYVIDSQQALFELSHRIEPRV
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CCDS77 LCLDMEASPN-HLQTKAYVRQFQVIDNQNLLFELSYKLEANSQ
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CCDS11 MEGPEGLGRKQACLAMLLHFLDTYQGLLQEEEGAGHII
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pF1KSD KTIYRNVLDDVYEYPIL-EKELKEFQKILGMHRRHTVDEYSPQKKNKALFHQFSLKENWL
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CCDS11 KDLYLLIMKDESLYQGLREDTLRLHQLVETVELKIPEENQPPSKQVKPLFRHFRRIDSCL
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CCDS11 QTRVAFRGSDEIFCRVYMPDHSYVTIRSRLSASVQDILGSVTEKLQYSEEPAGREDSLIL
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CCDS11 VAVSSSGEKVLLQPTEDCVFTALGINSHLFACTRDSYEALVPLPEEIQVSPGDTEIHRVE
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CCDS11 PEDVANHLTAFHWELFRCVHELEFVDYVFHGERGRRETANLELLLQRCSEVTHWVATEVL
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CCDS11 LCEAPGKRAQLLKKFIKIAALCKQNQDLLSFYAVVMGLDNAAVSRLRLTWEKLPGKFKNL
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CCDS11 FRKFENLTDPCRNHKSYREVISKMKPPVIPFVPLILKDLTFLHEGSKTLVDGLVNIEKLH
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CCDS11 SVAEKVRTIRKYRSRPLCLDMEASPN-HLQTKAYVRQFQVIDNQNLLFELSYKLEANSQ
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CCDS31 MRLEEHGKVVLVLERASQGAGPSRPPTPGRNRYTVMSGTPEKILELLLEAMGPDSSAHDP
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CCDS31 TETFLSDFLLTHRVFMPSAQLCAALLHHFHVEPAGGSEQERSTYVCNKRQQILRLVSQWV
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