Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0283
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0283, 1441 aa
1>>>pF1KSDA0283 1441 - 1441 aa - 1441 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8126+/-0.00106; mu= 21.1294+/- 0.064
mean_var=98.5751+/-19.773, 0's: 0 Z-trim(107.0): 166 B-trim: 218 in 2/47
Lambda= 0.129179
statistics sampled from 9133 (9322) to 9133 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 4.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 9756 1830.0 0
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 5928 1116.6 0
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 5922 1115.5 0
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 5906 1112.5 0
CCDS334.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1446) 5253 990.8 0
CCDS44098.2 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1440) 5156 972.7 0
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 4886 922.4 0
CCDS335.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1436) 4009 758.9 2.3e-218
CCDS53290.1 PTPRU gene_id:10076|Hs108|chr1 (1433) 3657 693.3 1.3e-198
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 3236 614.9 5.4e-175
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 3230 613.8 1.2e-174
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 3005 571.8 5e-162
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 1651 319.5 4.6e-86
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 1648 318.9 6.8e-86
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 1648 319.0 6.8e-86
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 1648 319.0 6.8e-86
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 1648 319.0 8.2e-86
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 1641 317.7 2e-85
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 1641 317.7 2e-85
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 1635 316.5 3.7e-85
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 1634 316.3 4.2e-85
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 1634 316.3 4.2e-85
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 1634 316.4 5e-85
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 1612 312.3 8.7e-84
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 1497 290.6 1.3e-77
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 1497 290.6 1.3e-77
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 1467 284.9 5.1e-76
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 1467 284.9 5.5e-76
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 902 179.9 4.7e-44
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 902 180.1 6.7e-44
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 868 173.5 3.2e-42
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 868 173.5 3.5e-42
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 836 167.6 2.2e-40
CCDS55845.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 832 167.0 4.9e-40
CCDS55846.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1907) 832 167.0 4.9e-40
CCDS44944.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (1997) 832 167.0 5.1e-40
CCDS81713.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2127) 832 167.0 5.3e-40
CCDS44943.1 PTPRB gene_id:5787|Hs108|chr12 (2215) 832 167.0 5.5e-40
CCDS2895.1 PTPRG gene_id:5793|Hs108|chr3 (1445) 808 162.4 8.8e-39
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 791 159.1 5.7e-38
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 791 159.1 6.5e-38
CCDS73501.1 PTPRQ gene_id:374462|Hs108|chr12 (2299) 779 157.2 5.3e-37
CCDS53754.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 377) 755 152.0 3e-36
CCDS44837.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 ( 405) 755 152.1 3.2e-36
CCDS8674.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1188) 755 152.4 7.2e-36
CCDS8675.1 PTPRO gene_id:5800|Hs108|chr12 (1216) 755 152.5 7.3e-36
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 669 136.2 2.9e-31
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 669 136.2 2.9e-31
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 669 136.2 3e-31
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 660 134.6 1.1e-30
>>CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441 aa)
initn: 9756 init1: 9756 opt: 9756 Z-score: 9822.1 bits: 1830.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9756; 99.9% identity (99.9% similar) in 1441 aa overlap (1-1441:1-1441)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASLAALALSLLLRLQLPPLPGARAQSAPGGCSFDEHYSNCGYSVALGTNGFTWEQINTW
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MASLAALALSLLLRLQLPPLPGARAQSAAGGCSFDEHYSNCGYSVALGTNGFTWEQINTW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EKPMLDQAVPTGSFMMVNSSGRASGQKAHLLLPTLKENDTHCIDFHYYFSSRDRSSPGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EKPMLDQAVPTGSFMMVNSSGRASGQKAHLLLPTLKENDTHCIDFHYYFSSRDRSSPGAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NVYVKVNGGPQGNPVWNVSGVVTEGWVKAELAISTFWPHFYQVIFESVSLKGHPGYIAVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NVYVKVNGGPQGNPVWNVSGVVTEGWVKAELAISTFWPHFYQVIFESVSLKGHPGYIAVD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EVRVLAHPCRKAPHFLRLQNVEVNVGQNATFQCIAGGKWSQHDKLWLQQWNGRDTALMVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EVRVLAHPCRKAPHFLRLQNVEVNVGQNATFQCIAGGKWSQHDKLWLQQWNGRDTALMVT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RVVNHRRFSATVSVADTAQRSVSKYRCVIRSDGGSGVSNYAELIVKEPPTPIAPPELLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RVVNHRRFSATVSVADTAQRSVSKYRCVIRSDGGSGVSNYAELIVKEPPTPIAPPELLAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GATYLWIKPNANSIIGDGPIILKEVEYRTTTGTWAETHIVDSPNYKLWHLDPDVEYEIRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GATYLWIKPNANSIIGDGPIILKEVEYRTTTGTWAETHIVDSPNYKLWHLDPDVEYEIRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LLTRPGEGGTGPPGPPLTTRTKCADPVHGPQNVEIVDIRARQLTLQWEPFGYAVTRCHSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLTRPGEGGTGPPGPPLTTRTKCADPVHGPQNVEIVDIRARQLTLQWEPFGYAVTRCHSY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NLTVQYQYVFNQQQYEAEEVIQTSSHYTLRGLRPFMTIRLRLLLSNPEGRMESEELVVQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NLTVQYQYVFNQQQYEAEEVIQTSSHYTLRGLRPFMTIRLRLLLSNPEGRMESEELVVQT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EEDVPGAVPLESIQGGPFEEKIYIQWKPPNETNGVITLYEINYKAVGSLDPSADLSSQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEDVPGAVPLESIQGGPFEEKIYIQWKPPNETNGVITLYEINYKAVGSLDPSADLSSQRG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD KVFKLRNETHHLFVGLYPGTTYSFTIKASTAKGFGPPVTTRIATKISAPSMPEYDTDTPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KVFKLRNETHHLFVGLYPGTTYSFTIKASTAKGFGPPVTTRIATKISAPSMPEYDTDTPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NETDTTITVMLKPAQSRGAPVSVYQLVVKEERLQKSRRAADIIECFSVPVSYRNASSLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NETDTTITVMLKPAQSRGAPVSVYQLVVKEERLQKSRRAADIIECFSVPVSYRNASSLDS
610 620 630 640 650 660
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pF1KSD LHYFAAELKPANLPVTQPFTVGDNKTYNGYWNPPLSPLKSYSIYFQALSKANGETKINCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LHYFAAELKPANLPVTQPFTVGDNKTYNGYWNPPLSPLKSYSIYFQALSKANGETKINCV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RLATKGASTQNSNTVEPEKQVDNTVKMAGVIAGLLMFIIILLGVMLTIKRRRNAYSYSYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLATKGASTQNSNTVEPEKQVDNTVKMAGVIAGLLMFIIILLGVMLTIKRRRNAYSYSYY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LKLAKKQKETQSGAQREMGPVASADKPTTKLSASRNDEGFSSSSQDVNGFTDGSRGELSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LKLAKKQKETQSGAQREMGPVASADKPTTKLSASRNDEGFSSSSQDVNGFTDGSRGELSQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PTLTIQTHPYRTCDPVEMSYPRDQFQPAIRVADLLQHITQMKRGQGYGFKEEYEALPEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PTLTIQTHPYRTCDPVEMSYPRDQFQPAIRVADLLQHITQMKRGQGYGFKEEYEALPEGQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD TASWDTAKEDENRNKNRYGNIISYDHSRVRLLVLDGDPHSDYINANYIDGYHRPRHYIAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TASWDTAKEDENRNKNRYGNIISYDHSRVRLLVLDGDPHSDYINANYIDGYHRPRHYIAT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD QGPMQETVKDFWRMIWQENSASIVMVTNLVEVGRVKCVRYWPDDTEVYGDIKVTLIETEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QGPMQETVKDFWRMIWQENSASIVMVTNLVEVGRVKCVRYWPDDTEVYGDIKVTLIETEP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LAEYVIRTFTVQKKGYHEIRELRLFHFTSWPDHGVPCYATGLLGFVRQVKFLNPPEAGPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LAEYVIRTFTVQKKGYHEIRELRLFHFTSWPDHGVPCYATGLLGFVRQVKFLNPPEAGPI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VVHCSAGAGRTGCFIAIDTMLDMAENEGVVDIFNCVRELRAQRVNLVQTEEQYVFVHDAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VVHCSAGAGRTGCFIAIDTMLDMAENEGVVDIFNCVRELRAQRVNLVQTEEQYVFVHDAI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LEACLCGNTAIPVCEFRSLYYNISRLDPQTNSSQIKDEFQTLNIVTPRVRPEDCSIGLLP
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CCDS42 LEACLCGNTAIPVCEFRSLYYNISRLDPQTNSSQIKDEFQTLNIVTPRVRPEDCSIGLLP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD RNHDKNRSMDVLPLDRCLPFLISVDGESSNYINAALMDSHKQPAAFVVTQHPLPNTVADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RNHDKNRSMDVLPLDRCLPFLISVDGESSNYINAALMDSHKQPAAFVVTQHPLPNTVADF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD WRLVFDYNCSSVVMLNEMDTAQFCMQYWPEKTSGCYGPIQVEFVSADIDEDIIHRIFRIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WRLVFDYNCSSVVMLNEMDTAQFCMQYWPEKTSGCYGPIQVEFVSADIDEDIIHRIFRIC
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD NMARPQDGYRIVQHLQYIGWPAYRDTPPSKRSLLKVVRRLEKWQEQYDGREGRTVVHCLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NMARPQDGYRIVQHLQYIGWPAYRDTPPSKRSLLKVVRRLEKWQEQYDGREGRTVVHCLN
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD GGGRSGTFCAICSVCEMIQQQNIIDVFHIVKTLRNNKSNMVETLEQYKFVYEVALEYLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GGGRSGTFCAICSVCEMIQQQNIIDVFHIVKTLRNNKSNMVETLEQYKFVYEVALEYLSS
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD F
:
CCDS42 F
>>CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440 aa)
initn: 6089 init1: 2987 opt: 5928 Z-score: 5966.6 bits: 1116.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5928; 58.3% identity (82.6% similar) in 1450 aa overlap (1-1440:1-1439)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASLAALAL----SLLLRLQLPPLPGARAQSAPGGCSFDEHYSNCGYSVALGTNGFTWEQ
: . :: :: .::: : : .:..: . :::.::. . : : : . : : .
CCDS51 MDTTAAAALPAFVALLLLSPWPLLGSAQGQFSAGGCTFDDGPGACDYHQDL-YDDFEWVH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD INTWEKPMLDQAVPTGSFMMVNSSGRASGQKAHLLLPTLKENDTHCIDFHYYFSSRDRSS
... : .: .: ::.:.:.:: . :.::.: :::.:::::::::: : . :. .
CCDS51 VSAQEPHYLPPEMPQGSYMIVDSSDHDPGEKARLQLPTMKENDTHCIDFSYLLYSQKGLN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD PGALNVYVKVNGGPQGNPVWNVSGVVTEGWVKAELAISTFWPHFYQVIFESVSLKGHPGY
::.::. :.:: :: .::.:::.: . . :..::::.:::::. ::::::. :. ::
CCDS51 PGTLNILVRVNKGPLANPIWNVTGFTGRDWLRAELAVSTFWPNEYQVIFEAEVSGGRSGY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD IAVDEVRVLAHPCRKAPHFLRLQNVEVNVGQNATFQCIAGGKWSQHDKLWLQQWNGRDTA
::.:...::..:: :.:::::: .::::.:::::::::: :. . :.:::::. ::.:
CCDS51 IAIDDIQVLSYPCDKSPHFLRLGDVEVNAGQNATFQCIATGRDAVHNKLWLQRRNGEDIP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LMVTRVVNHRRFSATVSVADTAQRSVSKYRCVIRSDGGSGVSNYAELIVKEPPTPIAPPE
. :. .:::::.:. . .... . . :::: .:. ::::::.:.:::.::: :::::.
CCDS51 VAQTKNINHRRFAASFRLQEVTKTDQDLYRCVTQSERGSGVSNFAQLIVREPPRPIAPPQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LLAVGATYLWIKPNANSIIGDGPIILKEVEYRTTTGTWAETHIVDSPNYKLWHLDPDVEY
::.:: ::: :. ::::::::::::::::::: :.:.:.::: :..:.:::::::::.::
CCDS51 LLGVGPTYLLIQLNANSIIGDGPIILKEVEYRMTSGSWTETHAVNAPTYKLWHLDPDTEY
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EIRVLLTRPGEGGTGPPGPPLTTRTKCADPVHGPQNVEIVDIRARQLTLQWEPFGYAVTR
::::::::::::::: ::::: ::::::.:.. :....:..:.::.....:: .:: .::
CCDS51 EIRVLLTRPGEGGTGLPGPPLITRTKCAEPMRTPKTLKIAEIQARRIAVDWESLGYNITR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CHSYNLTVQYQYVFNQQQYEAE--EVIQTSSHYTLRGLRPFMTIRLRLLLSNPEGRMESE
::..:.:. :.: .... .:. .. . .... : :. .. :...:.::::: :::
CCDS51 CHTFNVTICYHYFRGHNESKADCLDMDPKAPQHVVNHLPPYTNVSLKMILTNPEGRKESE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD ELVVQTEEDVPGAVPLESIQGGPFEEKIYIQWKPPNETNGVITLYEINYKAVGSLDPSAD
: ..::.::::: ::..:.:: ::.::...:: : . ::.:: :::.:... :.::..
CCDS51 ETIIQTDEDVPGPVPVKSLQGTSFENKIFLNWKEPLDPNGIITQYEISYSSIRSFDPAVP
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD LSSQRGKVFKLRNETHHLFVGLYPGTTYSFTIKASTAKGFGPPVTTRIATKISAPSMPEY
... : .: : :::.:. :.:::::.: :.:::.::::: .. ..:.::::..:.:
CCDS51 VAGPPQTVSNLWNSTHHVFMHLHPGTTYQFFIRASTVKGFGPATAINVTTNISAPTLPDY
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600 610 620 630 640 650
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CCDS75 DVALEYLESS
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CCDS47 AFIVTQYPLPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLNEVDLSQGCPQYWPEEGMLRYGPIQVECM
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CCDS47 EECEEGEGRTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVVEMVKRQNVVDVFHAVKTLRNSKPNMVEAP
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CCDS47 EQYRFCYDVALEYLESS
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CCDS44 RIHPGTRAPADLPHGSYLMVNTSQHAPGQRAHVIFQSLSENDTHCVQFSYFLYSRDGHSP
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CCDS44 GLDDILLLSYPCAKAPHFSRLGDVEVNAGQNASFQCMAAGRAAEAERFLLQRQSGALVPA
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pF1KSD MVTRVVNHRRFSATVSVADTAQRSVSKYRCVIRSDGGSGVSNYAELIVKEPPTPIAPPEL
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CCDS44 AGVRHISHRRFLATFPLAAVSRAEQDLYRCVSQAPRGAGVSNFAELIVKEPPTPIAPPQL
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CCDS44 PVNMT---------KATVNYRQEKTHMMSAVDRSFTDQSTLQEDERLGLSFMDTHGYSTR
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CCDS44 GDQRSGGVTEASSLLGGSPRRPCGRKGSPYHTGQLHPAVRVADLLQHINQMKTAEGYGFK
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pF1KSD EEYEALPEGQTASWDTAKEDENRNKNRYGNIISYDHSRVRLLVLDGDPHSDYINANYID-
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CCDS44 QEYESFFEG----WDATKKKDKVKGSRQEPMPAYDRHRVKLHPMLGDPNADYINANYIDI
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pF1KSD -----GYHRPRHYIATQGPMQETVKDFWRMIWQENSASIVMVTNLVEVGRVKCVRYWPDD
:::: :.:::::: : : :::::.:::. .::::.:.::::::::: ::::.:
CCDS44 RINREGYHRSNHFIATQGPKPEMVYDFWRMVWQEHCSSIVMITKLVEVGRVKCSRYWPED
950 960 970 980 990 1000
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pF1KSD TEVYGDIKVTLIETEPLAEYVIRTFTVQKKGYHEIRELRLFHFTSWPDHGVPCYATGLLG
...:::::. :..:: :::::.:::.....:: .:.: ::::.::.:::: .:::::.
CCDS44 SDTYGDIKIMLVKTETLAEYVVRTFALERRGYSARHEVRQFHFTAWPEHGVPYHATGLLA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD FVRQVKFLNPPEAGPIVVHCSAGAGRTGCFIAIDTMLDMAENEGVVDIFNCVRELRAQRV
:.:.:: .::.:::::.:::::.:::::.:..:.:::::: ::::::.:::. : ..::
CCDS44 FIRRVKASTPPDAGPIVIHCSAGTGRTGCYIVLDVMLDMAECEGVVDIYNCVKTLCSRRV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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pF1KSD NLVQTEEQYVFVHDAILEACLCGNTAIPVCEFRSLYYNISRLDPQTNSSQIKDEFQTLNI
:..::::::.:.:::::::::::.:.::: ::.. : .. :.:::.::::...::::::
CCDS44 NMIQTEEQYIFIHDAILEACLCGETTIPVSEFKATYKEMIRIDPQSNSSQLREEFQTLNS
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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pF1KSD VTPRVRPEDCSIGLLPRNHDKNRSMDVLPLDRCLPFLISVDGESSNYINAALMDSHKQPA
::: . :.:::.:::::.:::::::::: :::::::::.::.:.::::::: ::. . :
CCDS44 VTPPLDVEECSIALLPRNRDKNRSMDVLPPDRCLPFLISTDGDSNNYINAALTDSYTRSA
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pF1KSD AFVVTQHPLPNTVADFWRLVFDYNCSSVVMLNEMD---TAQFCMQYWPEKTSGCYGPIQV
::.:: ::: .:. ::::::.::.:.:.::::... .: :.::::: :: ..:
CCDS44 AFIVTLHPLQSTTPDFWRLVYDYGCTSIVMLNQLNQSNSAWPCLQYWPEPGRQQYGLMEV
1250 1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KSD EFVSADIDEDIIHRIFRICNMARPQDGYRIVQHLQYIGWPAYRDTPPSKRSLLKVVRRLE
::.:. :::.. :.::. :..: .:. .:.:.:.. : :::::: ::...:... ...
CCDS44 EFMSGTADEDLVARVFRVQNISR--EGHLLVRHFQFLRWSAYRDTPDSKKAFLHLLAEVD
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pF1KSD KWQEQYDGREGRTVVHCLNGGGRSGTFCAICSVCEMIQQQNIIDVFHIVKTLRNNKSNMV
::: . .: .:::.::::::::::::::: .: :::. .:..::: .::::: : :::
CCDS44 KWQAE-SG-DGRTIVHCLNGGGRSGTFCACATVLEMIRCHNLVDVFFAAKTLRNYKPNMV
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::..::.: :.::::::
CCDS44 ETMDQYHFCYDVALEYLEGLESR
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CCDS68 EKPMLDQAVPTGSFMMVNSSGRASGQKAHLLLPTLKENDTHCIDFHYYFSSRDRSSPGAL
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CCDS68 NVYVKVNGGPQGNPVWNVSGVVTEGWVKAELAISTFWPHFYQVIFESVSLKGHPGYIAVD
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CCDS68 EVRVLAHPCRKAPHFLRLQNVEVNVGQNATFQCIAGGKWSQHDKLWLQQWNGRDTALMVT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 RVVNHRRFSATVSVADTAQRSVSKYRCVIRSDGGSGVSNYAELIVKEPPTPIAPPELLAV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GATYLWIKPNANSIIGDGPIILKEVEYRTTTGTWAETHIVDSPNYKLWHLDPDVEYEIRV
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CCDS68 NLTVQYQYVFNQQQYEAEEVIQTSSHYTLRGLRPFMTIRLRLLLSNPEGRMESEELVVQT
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CCDS68 EEDVPGAVPLESIQGGPFEEKIYIQWKPPNETNGVITLYEINYKAVGSLDPSADLSSQRG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KVFKLRNETHHLFVGLYPGTTYSFTIKASTAKGFGPPVTTRIATKISAPSMPEYDTDTPL
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CCDS68 NETDTTITVMLKPAQSRGAPVSVYQLVVKEERLQKSRRAADIIECFSVPVSYRNASSLDS
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CCDS68 LHYFAAELKPANLPVTQPFTVGDNKTYNGYWNPPLSPLKSYSIYFQALSKANGETKINCV
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CCDS68 LGVMLTIKRRRNAYSYSYYLKLAKKQKETQSGAQREMGPVASADKPTTKLSASRNDEGFS
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CCDS68 SSSQDVNGFTDGSRGELSQPTLTIQTHPYRTCDPVEMSYPRDQFQPAIRVADLLQHITQM
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CCDS68 KRGQGYGFKEEYEALPEGQTASWDTAKEDENRNKNRYGNIISYDHSRVRLLVLDGDPHSD
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CCDS68 YINANYIDGYHRPRHYIATQGPMQETVKDFWRMIWQENSASIVMVTNLVEVGRVKCVRYW
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CCDS68 PDDTEVYGDIKVTLIETEPLAEYVIRTFTVQKKGYHEIRELRLFHFTSWPDHGVPCYATG
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CCDS68 LLGFVRQVKFLNPPEAGPIVVHCSAGAGRTGCFIAIDTMLDMAENEGVVDIFNCVRELRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QRVNLVQTEEQYVFVHDAILEACLCGNTAIPVCEFRSLYYNISRLDPQTNSSQIKDEFQT
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CCDS68 LNIVTPRVRPEDCSIGLLPRNHDKNRSMDVLPLDRCLPFLISVDGESSNYINAALMDSHK
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CCDS68 QPAAFVVTQHPLPNTVADFWRLVFDYNCSSVVMLNEMDTAQFCMQYWPEKTSGCYGPIQV
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CCDS68 EFVSADIDEDIIHRIFRICNMARPQDGYRIVQHLQYIGWPAYRDTPPSKRSLLKVVRRLE
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CCDS68 KWQEQYDGREGRTVVHCLNGGGRSGTFCAICSVCEMIQQQNIIDVFHIVKTLRNNKSNMV
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1430 1440
pF1KSD ETLEQYKFVYEVALEYLSSF
::::::::::::::::::::
CCDS68 ETLEQYKFVYEVALEYLSSF
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CCDS33 RIHPGTRAPADLPHGSYLMVNTSQHAPGQRAHVIFQSLSENDTHCVQFSYFLYSRDGHSP
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CCDS33 GTLGVYVRVNGGPLGSAVWNMTGSHGRQWHQAELAVSTFWPNEYQVLFEALISPDRRGYM
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pF1KSD AVDEVRVLAHPCRKAPHFLRLQNVEVNVGQNATFQCIAGGKWSQHDKLWLQQWNGRDTAL
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CCDS33 GLDDILLLSYPCAKAPHFSRLGDVEVNAGQNASFQCMAAGRAAEAERFLLQRQSGALVPA
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pF1KSD MVTRVVNHRRFSATVSVADTAQRSVSKYRCVIRSDGGSGVSNYAELIVKEPPTPIAPPEL
.: ..:::: :: .: ... . :::: .. :.::::.:::::::::::::::.:
CCDS33 AGVRHISHRRFLATFPLAAVSRAEQDLYRCVSQAPRGAGVSNFAELIVKEPPTPIAPPQL
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CCDS33 LRAGPTYLIIQLNTNSIIGDGPIVRKEIEYRMARGPWAEVHAVSLQTYKLWHLDPDTEYE
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pF1KSD IRVLLTRPGEGGTGPPGPPLTTRTKCADPVHGPQNVEIVDIRARQLTLQWEPFGYAVTRC
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CCDS33 ISVLLTRPGDGGTGRPGPPLISRTKCAEPMRAPKGLAFAEIQARQLTLQWEPLGYNVTRC
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pF1KSD HSYNLTVQYQYVF----NQQQYEAEEVIQTSSHYTLRGLRPFMTIRLRLLLSNPEGRMES
:.:.... :.:.. :: : .. : :.::...: :. ....::.:.::::: :.
CCDS33 HTYTVSLCYHYTLGSSHNQTIRECVKTEQGVSRYTIKNLLPYRNVHVRLVLTNPEGRKEG
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pF1KSD EELVVQTEEDVPGAVPLESIQGGPFEEKIYIQWKPPNETNGVITLYEINYKAVGSLDPSA
.:.. ::.::::... ::. :.:. :...:. :.: ::.:: :::.:... : ::..
CCDS33 KEVTFQTDEDVPSGIAAESLTFTPLEDMIFLKWEEPQEPNGLITQYEISYQSIESSDPAV
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pF1KSD DLSSQRGKVFKLRNETHHLFVGLYPGTTYSFTIKASTAKGFGPPVTTRIATKISAPSMPE
.. . : . ::::::.:.: .:.::::: :...: :.:::: . :.:.:.:::::.
CCDS33 NVPGPRRTISKLRNETYHVFSNLHPGTTYLFSVRARTGKGFGQAALTEITTNISAPSFDY
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pF1KSD YDTDTPLNETDTTITVMLKPAQSRGAPVSVYQLVVKEERLQKSRRAADIIECFSVPVSYR
: .::.:...::::.:.:::.::::.::::..:.::: .. :: .:: ::....
CCDS33 ADMPSPLGESENTITVLLRPAQGRGAPISVYQVIVEEERARRLRREPGGQDCFPVPLTFE
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pF1KSD NASSLDSLHYFAAELKPANLPVTQPFTVGDNKTYNGYWNPPLSPLKSYSIYFQALSKANG
: . .:::.::: ..:: ..:::::::.:: :.::::: : :.: ::::: :. .:
CCDS33 AALARGLVHYFGAELAASSLPEAMPFTVGDNQTYRGFWNPPLEPRKAYLIYFQAASHLKG
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pF1KSD ETKINCVRLATKGASTQNSNTVEPEKQVDNTVKMAGVIAGLLMFIIILLGVMLTIKRRRN
::..::.:.: :.: ... .: .. .. . :. :: : .:.:::....: :. .
CCDS33 ETRLNCIRIARKAACKESKRPLEVSQRSEEMGLILGICAGGLAVLILLLGAIIVIIRKGK
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... : : . :.. ....:. : :. ..:: .. : .:..:..
CCDS33 PVNMT---------KATVNYRQEKTHMMSAVDRSFTDQSTLQEDERLGLSFMDTHGYSTR
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pF1KSD -DGSRGELSQPTLTIQTHPYRTCDPVEMSYPRDQFQPAIRVADLLQHITQMKRGQGYGFK
: : ... . . : : : : :..::.:::::::::.::: ..:::::
CCDS33 GDQRSGGVTEASSLLGGSPRRPCGRKGSPYHTGQLHPAVRVADLLQHINQMKTAEGYGFK
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CCDS33 QEYESFFEG----WDATKKKDKVKGSRQEPMPAYDRHRVKLHPMLGDPNADYINANYIDG
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pF1KSD YHRPRHYIATQGPMQETVKDFWRMIWQENSASIVMVTNLVEVGRVKCVRYWPDDTEVYGD
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CCDS33 YHRSNHFIATQGPKPEMVYDFWRMVWQEHCSSIVMITKLVEVGRVKCSRYWPEDSDTYGD
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pF1KSD IKVTLIETEPLAEYVIRTFTVQKKGYHEIRELRLFHFTSWPDHGVPCYATGLLGFVRQVK
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CCDS33 IKIMLVKTETLAEYVVRTFALERRGYSARHEVRQFHFTAWPEHGVPYHATGLLAFIRRVK
1010 1020 1030 1040 1050 1060
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CCDS33 ASTPPDAGPIVIHCSAGTGRTGCYIVLDVMLDMAECEGVVDIYNCVKTLCSRRVNMIQTE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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CCDS33 EQYIFIHDAILEACLCGETTIPVSEFKATYKEMIRIDPQSNSSQLREEFQTLNSVTPPLD
1130 1140 1150 1160 1170 1180
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CCDS53 ADEDLVARVFRVQNISRLQEGHLLVRHFQFLRWSAYRDTPDSKKAFLHLLAEVDKWQAE-
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CCDS53 HFCYDVALEYLEGLESR
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CCDS11 -----KLAKKRKETMSSTRQEMTVMVNSMDKSYAE-QGTNCDEAFSFMDTHNLNGRSVSS
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CCDS11 LQTIEGDTNSDYINGNYIDGYHRPNHYIATQGPMQETIYDFWRMVWHENTASIIMVTNLV
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CCDS11 DIYNCVRELRSRRVNMVQTEEQYVFIHDAILEACLCGDTSVPASQVRSLYYDMNKLDPQT
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CCDS11 NSSQIKEEFRTLNMVTPTLRVEDCSIALLPRNHEKNRCMDILPPDRCLPFLITIDGESSN
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CCDS11 NGVHRHGPIQVEFVSADLEEDIISRIFRIYNAARPQDGYRMVQQFQFLGWPMYRDTPVSK
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