FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0287, 1464 aa 1>>>pF1KSDA0287 1464 - 1464 aa - 1464 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1131+/-0.00158; mu= 2.3002+/- 0.093 mean_var=383.7887+/-84.392, 0's: 0 Z-trim(108.6): 649 B-trim: 575 in 1/51 Lambda= 0.065468 statistics sampled from 9601 (10300) to 9601 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16 Scan time: 3.730 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS58684.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19 (1464) 9938 955.0 0 CCDS58685.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19 (1462) 9898 951.2 0 CCDS12948.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19 (1588) 9898 951.3 0 CCDS33123.1 ZIM2 gene_id:23619|Hs108|chr19 ( 527) 986 109.0 3.9e-23 CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 956 106.6 5.1e-22 CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 618 74.5 1.8e-12 CCDS12498.1 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CCDS58 PMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGFIHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAII 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KSD PGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNPAELADHVTVHKNEPYEYGSSYTHTSFLTEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 PGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNPAELADHVTVHKNEPYEYGSSYTHTSFLTEP 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KSD LKGAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELHLEEEEEDEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LKGAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELHLEEEEEDEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVV 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD LRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPNGEAEGPDGEAAEPIGEAGQPNGEAE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 LRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPNGEAEGPDGEAAEPIGEAGQPNGEAE 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KSD QPNGDADEPDGAGIEDPEERAEEPEGKAEEPEGDADEPDGVGIEDPEEGEDQEIQVEEPY 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>>CCDS33123.1 ZIM2 gene_id:23619|Hs108|chr19 (527 aa) initn: 1352 init1: 925 opt: 986 Z-score: 528.8 bits: 109.0 E(32554): 3.9e-23 Smith-Waterman score: 1120; 40.3% identity (61.3% similar) in 568 aa overlap (1-532:1-523) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHSVHSFSGDRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHSVHSFSGDRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD PRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 PRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD DNMENYRKLLSLGVQLAEDDGHSHMTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGI ::::::::::::: ::.:. . . . . ::.. . .:. :. . CCDS33 DNMENYRKLLSLGF-LAQDS----VPAEKRNTEMLDNLPSAG---SQFPDFKH-LGTFLV 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KSD CEDESSHGVIMEKFIKDVSRSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQR :. : .: . : : : : . .:: . .... :.. ..... CCDS33 FEEL----VTFEDVLVDFSPEELS-----SLSAAQR------NLYREVMLENYRNLVSL- 180 190 200 210 250 260 270 280 290 pF1KSD VYEGNAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSI------HDQKGCPRKKPFE- :. : . ..:: ::... : ..::.. .. ::. :.. : CCDS33 ---GHQFS-----KPDIISR---LEEEESYAMETDSRHTVICQGESHDDPLEPHQGNQEK 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KSD --CGSEMRKAMSVSSLSSLSSPSFTES-----QPID-FGAMPYVCDECGRSFSVISEFVE : ... : .: : .: : : .: : : : : : CCDS33 LLTPITMNDPKTLTPERSYGSDEFERSSNLSKQSKDPLGKDPQEGTAPGICTSPQSASQE 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KSD HQIMHTRENLYEYGESFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHAR .. :.: .. . ..: .::. . .. ..: : .:::.:.:.: : .:.: :. CCDS33 NK--HNRCEFCK--RTFSTQVALRRHERIHTGKKPYECKQCAEAFYLMPHLNRHQKTHS- 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KSD GYLVECKNQECEEAFMPS---PTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIH- : :.. :.:. :: .. : .:.... ..:: : ..::.. :..: : : CCDS33 GR----KTSGCNEGRKPSVQCANLCERVRIHSQEDYFECFQCGKAFLQNVHLLQHLKAHE 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 pF1KSD --------FGDDKDN----EREHERERER-----ERGETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYE .. .: .:.:. :: . :..: . : . . . .:. :. CCDS33 AARVLPPGLSHSKTYLIRYQRKHDYVGERACQCCDCGRVFSRNSYLIQHYRTHTQERPYQ 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KSD CKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFT :..::. : . : : .: ..:.. . : CCDS33 CQLCGKCFGRPSYLTQHYQLHSQEKTVECDHC 500 510 520 >>CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280 aa) initn: 728 init1: 221 opt: 956 Z-score: 508.9 bits: 106.6 E(32554): 5.1e-22 Smith-Waterman score: 1115; 25.3% identity (54.4% similar) in 1168 aa overlap (112-1234:22-1139) 90 100 110 120 130 140 pF1KSD MDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQDNM-ENYRKLLSLGVQLAEDD : .: .. : ::::.:. ::. . : CCDS54 MGSLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAAFKPD 10 20 30 40 50 150 160 170 180 190 pF1KSD GHSHMTQGHSSRS-KRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGICEDESSHGVIMEKFIKDVS . .:. : . :: . : . . :. ..:: :: : . ::.... : CCDS54 LIIFLEEGKESWNMKRHEMVEESPVICSH-FAQDLWPEQGI-ED-SFQKVILRRYEKCGH 60 70 80 90 100 200 210 220 230 240 250 pF1KSD RSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQRVYEGNAFR---GGFRFNST .. . . . :. . . : . ::. .: . :: .:.:. .. : . CCDS54 ENLHLKIGYTNVDECKVHKE--GYNKLNQSLTTTQSKVFQRGKYANVFHKCSNSNRHKIR 110 120 130 140 150 160 260 270 280 290 300 310 pF1KSD LVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRKAMSVSSLSSLSSPSFT ...:.. .. : .. : : .. :.. ..: : ::.. :: ..: CCDS54 HTGKKHLQCKEYVRSFCMLSHLSQH-KRIYTRENSYKC-EEGGKAFNWSS-------TLT 170 180 190 200 210 320 330 340 350 360 370 pF1KSD ESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLY---EYGESFIHSVAVSEVQK . : :: : :::..:: .: ...:...:: :. : : :..: .:. ... . CCDS54 YYKSAHTGEKPYRCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKSYKCEECGKAFNQSAILTKHKI 220 230 240 250 260 270 380 390 400 410 420 430 pF1KSD SQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAFMPSPTFSELQKIY ..: : .:..::..:.: ..:. :. ::: .:: :: .:: :. . :. CCDS54 IHTGEKPNKCEECGKAFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCK--ECGKAFSKVSTLITHKAIH 280 290 300 310 320 330 440 450 460 470 480 490 pF1KSD GKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERERGETFRPSPALNEF . .: :.:. : ..: . : : .:. :: : :. .. : : :.... .:. CCDS54 AGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTG-----EKPYKCE---ECGKAYKWPSTLSYH 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KSD QKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQK .:.. :: :.:. ::. : : : .:. ::: .:. : . : ..: ...: ...: CCDS54 KKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPY--KCEECGKAFNWSSNLMEHKK 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 pF1KSD TYNKEKLCDFTDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIHSG--PFT------ .. : . .: . : :..:. ::. .. .. . .:.. :.: :. CCDS54 IHTGETPYKCEECGKGFSMFSILTKHKVIHNGEKPYKCEECDKAT-HAGEKPYKCEECGK 450 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 pF1KSD ---------ESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIH : .. :: .: . .: :.:. : ... : : :. :. . .. CCDS54 AFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKW 510 520 530 540 550 560 660 670 680 690 700 710 pF1KSD SLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSR--SVIHSL : . .: :.: : : . ... :: :.:.:...: . . .: .. : . .: CCDS54 SSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNQSAILIKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFSKVSTL 570 580 590 600 610 620 720 730 740 750 760 770 pF1KSD VASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQS .. : : :.. . .: :.. : .: :. .. : : :.: . .. . : CCDS54 TTHKA--IHAGEKPYKCKECGKTFIKVSTLTTHKA-IHAGEKPYKCKECGKAF------S 630 640 650 660 670 780 790 800 810 820 830 pF1KSD VFRAKPQKSVPGEGSGEFKKD--GEFSVPSSNVREYQKARA-KKKYIEHRSNETSVIHSL : ...: : .: . :. :::. :... .. .: : .. ... :. CCDS54 KFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSV 680 690 700 710 720 730 840 850 860 870 880 890 pF1KSD PFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDP ..... :.:.:::. . :: :. :.::: ::: .. . :: CCDS54 LTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKH 740 750 760 770 780 790 900 910 920 930 940 pF1KSD QTSYAQEQYAKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSHGEESQGEN-------T . ...:. : :.. . :. :.:.. :. :: . . :. : CCDS54 KRIHTDEKPYK------CEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILT 800 810 820 830 840 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD DGEETHS-EETHGQETIEDPVIQGSDMEDPQKDDPDDKIYECEDCGLGFVDLTDLTDHQK . :. :. . : : . .: .: :.::.:: :: .. :: :. CCDS54 KHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEV 850 860 870 880 890 900 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD VHSRKCLVDSREYTHSVIHTHSISEYQRDYTGEQLYECPKCGESFIHSSFLFEHQRIHEQ .:. . .: .. .:.... ..::..:.: ::... :: : :..:: . CCDS54 IHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKTHAGEKFYKCEACGKAYKSSSTLSYHKKIHTE 910 920 930 940 950 960 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KSD DQLYSMKGCDDGFIALLPMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGFIHSSALNEHMRLH .. :... : :: .. . .. . ..: .: ::..: :: : :: ..: CCDS54 EKPYKYEECGKGFSTFSILTKHKVIHTGEKP------YKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIH 970 980 990 1000 1010 1020 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KSD REDDLLEQSQMAEEAIIPGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNPAELADHVTVHKNE . . . ..:. .::: . ... :. ..: ::..: :..:..: ..: .: CCDS54 T-GETPYKCEECDKAFSWPSSLTEHKATHAGEKPYKCEECGKAFSWPSRLTEHKATHAGE 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD -PY---EYGSSYTHTSFLTEPLK---GAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELHLEEEEE :: : :.... .: : : . : : :.:..::::: ..::::: .: :. CCDS54 EPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKP-YKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPY 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KSD DEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVVLRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPNG CCDS54 KCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKCEE 1150 1160 1170 1180 1190 1200 >>CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029 aa) initn: 1147 init1: 230 opt: 618 Z-score: 337.4 bits: 74.5 E(32554): 1.8e-12 Smith-Waterman score: 749; 26.0% identity (52.6% similar) in 772 aa overlap (357-1123:346-1008) 330 340 350 360 370 380 pF1KSD PYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEYGESFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDC : :.:. . :.:: . : : ..: : CCDS27 ERADTVKKVSLCERDKKKRTPPEKQGQKWKELGDSLTFGSAISESLIGTEGKKFYKCDMC 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 pF1KSD GETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAFMPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKE . ::: . : .::.::. .:: :: ..:. .. . .. .: :.: : . CCDS27 CKHFNKISHLINHRRIHTGEKPHKCK--ECGKGFIQRSSLLMHLRNHSGEKPYKCNECGK 380 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KSD TFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERERGETF-RPSPALNEFQKMYGKEKMYEC .: .:. :..::.:: : :. . . .: :. : : : . .... : :. :.: CCDS27 AFSQSAYLLNHQRIHTG-----EKPY---KCKECGKGFYRHSGLIIHLRRHSG-ERPYKC 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KSD KVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQKTYNKEK--LCDF . ::..: ... : .::..: .:. : . :...:: .:: .:. .. :: :: CCDS27 NECGKVFSQNAYLIDHQRLHKGEEPY--KCNKCQKAFILKKSLILHQRIHSGEKPYKCDE 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KSD TDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIHSGPFTESQKSHTITRPLESDEDE :. .: :.. : .::..:: .: .. . : :.: . :. :: . . . CCDS27 C-GK-TFAQTTYLIDHQRLHSAENPYKCKECGKVFIRSKSLLLHQRVHTEKKTFGCKKCG 550 560 570 580 590 600 630 640 650 660 670 680 pF1KSD KAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTI : :. .:: ..... ..:. :. .. .: . :. :. : . . .. : CCDS27 KIFSSKSNFIDHKRMHSREKPYKCTECGKAFTQSAYLFDHQRLHNGEKPYECNECGKVFI 610 620 630 640 650 660 690 700 710 720 730 740 pF1KSD QSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISD . . : ::: ..: : : .. .. . : :::.. : : :.. :. .. CCDS27 LKKSLILHQRFHTGENLYECKDCGKVFGSNRNLIDHERLHNGEKPYECRECGKTFIMSKS 670 680 690 700 710 720 750 760 770 780 790 800 pF1KSD LNDKRQKIPARENP--CEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKPQKSVPGEGSGEFKKDGEFSVP . .::. ..:. :: .: .:..:.. : : . :: : .. : CCDS27 FM-VHQKLHTQEKAYKCEDCGKAFSYNSSLL--VHR----RIHTGEKPFECSECG----- 730 740 750 760 810 820 830 840 850 860 pF1KSD SSNVREYQKARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLT : ... : . :::. ::: :: .: :::.:::.:: ...: CCDS27 ----RAFSSNR---NLIEHKR-----IHS---GE---KP----YECDECGKCFILKKSLI 770 780 790 800 870 880 890 900 910 920 pF1KSD EHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQYAKEQARNKCKDFRQFFATSED ::.:: ::: :: ::.: . :. . CCDS27 GHQRIHTREK----------------------SY------------KCNDCGKVFSYRSN 810 820 830 930 940 950 960 970 980 pF1KSD LNTNQKIYDQEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQETIEDPVIQGSDMEDPQKDDPDDK : ..:.:. :: .. :.. :.... :: :. .: CCDS27 LIAHQRIHTGEKPYACSECGKGF---------TYNRNLIEH-----------QRIHSGEK 840 850 860 870 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KSD IYECEDCGLGFVDLTDLTDHQKVHSRKCLVDSREYTHSVIHTHSISEYQRDYTGEQLYEC :::. : ... .: ::..:. . : .. ..... .:: .:::. ::: CCDS27 TYECHVCRKVLTSSRNLMVHQRIHTGEKPYKCNECGKDFSQNKNLVVHQRMHTGEKPYEC 880 890 900 910 920 930 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD PKCGESFIHSSFLFEHQRIHEQDQLYSMKGCDDGFIALLPMKPRRNRAAERNPALAGSAI :: .:: . : ::::: .. : ::.: .. . :.: ..... . CCDS27 DKCRKSFTSKRNLVGHQRIHTGEKPY---GCNDCSKVF---RQRKNLTVHQKIHTDEKPC 940 950 960 970 980 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KSD RCLLCGQGFIHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAIIPGLALTEFQRSQTEERLFECA .: . . : ..: :. ....: CCDS27 ECDVSEKEFSQTSNLHLQQKIHTIEEFSWLQNTNESKIEIQKI 990 1000 1010 1020 >>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 (688 aa) initn: 967 init1: 277 opt: 612 Z-score: 336.5 bits: 73.8 E(32554): 2e-12 Smith-Waterman score: 840; 29.2% identity (59.6% similar) in 602 aa overlap (275-871:91-669) 250 260 270 280 290 300 pF1KSD NAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRKAMSV ..::... :. .:. :. : . ::. CCDS12 NTYETELSQWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKGKMEKQQEN-QKEYFRQGMIIYDKMSI 70 80 90 100 110 310 320 330 340 350 360 pF1KSD -SSLSSLSSPSFTESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEY---GE .. . ::. : .: :: : :::..: :....:: .:: :. :: :. CCDS12 FNQHTYLSQHSRCHSTE-----KPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGEKPYECKQCGK 120 130 140 150 160 170 370 380 390 400 410 420 pF1KSD SFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAF .: .. .: :. ..: : . ::.::..:..:. : :..::. .: .:: .:: CCDS12 AFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKC--EECGKAF 180 190 200 210 220 230 430 440 450 460 470 480 pF1KSD MPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERER . : ... ::.. .: :::. : ..: ..: : ::..: : :. .: .. :. CCDS12 IRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTG-----EKLYECKECRK- 240 250 260 270 280 490 500 510 520 530 540 pF1KSD GETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEE .: : .... :: :::: ::..:. .:.:..:::::. .:.: : : . CCDS12 --VFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECK--ECGR 290 300 310 320 330 340 550 560 570 580 590 600 pF1KSD TFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFTDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIH .:: :. : ..:. .. :: . ::...:.:..::.::. .. .: . : : CCDS12 AFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSH 350 360 370 380 390 400 610 620 630 640 650 660 pF1KSD SGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLAS .. .:. :. :: .: . : :::. .: ..:.: : :. :: : .. .. CCDS12 GSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSEL 410 420 430 440 450 460 670 680 690 700 710 720 pF1KSD VEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPP .. .. :. : . : ..: :.. . .:::...: . : .: . .: :. CCDS12 TQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQ 470 480 490 500 510 520 730 740 750 760 770 780 pF1KSD RSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKP : :.:.. :: :.. . : ..:.: . :.: . .. . :.. .. CCDS12 RLHTGEKPYVCNECGKAFAR-GLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAF----IRGSQLTQH 530 540 550 560 570 790 800 810 820 830 840 pF1KSD QKSVPGEGSGEFKKDGEFSVPSSNVREYQKARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRP :. :: : :. :. .:.. .:. .. .: : : . . .: .... CCDS12 QRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIH 580 590 600 610 620 630 850 860 870 880 890 pF1KSD RGML-YECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQ : :.:.:::. :...:.::.::.:: :: CCDS12 TGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM 640 650 660 670 680 900 910 920 930 940 950 pF1KSD YAKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQET >>CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 (803 aa) initn: 847 init1: 213 opt: 612 Z-score: 335.7 bits: 73.9 E(32554): 2.2e-12 Smith-Waterman score: 756; 25.2% identity (56.4% similar) in 807 aa overlap (101-872:10-755) 80 90 100 110 120 130 pF1KSD SLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQDNMENYRKLL : .: .:.:.. .:.. .::::.:. CCDS59 MDVAIEFCLEEWQ-CLDIAQQNLYRNVM---LENYRNLV 10 20 30 140 150 160 170 180 190 pF1KSD SLGVQLAEDDGHSHMTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGICEDESSHGVI ::. ... : . . : :. : . . . : . .: .. .. CCDS59 FLGIAVSKPDLITCLEQ-----EKEPWEPMRRHEMVAKPPV--------MC-SHFTQDFW 40 50 60 70 80 200 210 220 230 240 250 pF1KSD MEKFIKDVSRSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQRVYEGNAFRGG :. ::: ... . :... . :.. :.: .. : : .. ::: CCDS59 PEQHIKDPFQKAT-------------LRRYKNCEHKNVHLKKD----HKSVDECKVHRGG 90 100 110 120 260 270 280 290 300 pF1KSD FR-FNSTL-VSRKRV-LERK--RRYH-FDTDGKGSI-HDQKGCPRKKPFECGSE--MRKA . ::. : ...... : : . .: :..... .: : .: . : :::. : CCDS59 YNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCK--ECGKSFCMLPH 130 140 150 160 170 180 310 320 330 340 pF1KSD MSVSSL--------------SSLSSPSF-TESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEH .. .. .... ::. :. . :. : ::.:.:::. :. :... : CCDS59 LAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFNWSSRLTTH 190 200 210 220 230 240 350 360 370 380 390 400 pF1KSD QIMHTRENLY---EYGESFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIH . .:: .:: : :..: .: .. . ..: : ..::.:...::.:. :.::.::: CCDS59 KKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIH 250 260 270 280 290 300 410 420 430 440 450 460 pF1KSD ARGYLVECKNQECEEAFMPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFG .: .:: .:: :... ..:. .: : :. : ..: . : : :..:: . CCDS59 PGEKPYKC--EECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTA 310 320 330 340 350 360 470 480 490 500 510 520 pF1KSD DDKDNEREHERERERERGETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQK . . . : ::.: : :.. .:.. ..: :.:. ::..: ::.: ::. CCDS59 E--------KFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKL 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 580 pF1KSD IHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQKTYNKEK--LCDFTDGRDAFMQSSELSEHQK :: .:. : . : ..: ..: .... .. :: :. :. :: : :.:. :.. CCDS59 THTGEKPY--KCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVC-GK-AFNQFSNLTTHKR 420 430 440 450 460 590 600 610 620 630 640 pF1KSD IHSRKNLFEGRGYEKSVIHSGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTK ::. .. .. . :. .:. .:. .: : .: . .: ::: ::. :.. : CCDS59 IHTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTG 470 480 490 500 510 520 650 660 670 680 690 700 pF1KSD ENVYEAKSYERSVIHSLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTS :. :. . .. : .. .. :. : : . ... :: . .:.....: . CCDS59 EKPYKCEECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFY 530 540 550 560 570 580 710 720 730 740 750 pF1KSD EGREYSRSVIHSLVASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENP--CE . .: ... .: . . :.:.. . .: :.. .: :. :.. : ..:.: :: CCDS59 KCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLT-KHKIIHTEEKPYKCE 590 600 610 620 630 640 760 770 780 790 800 810 pF1KSD GGSKNRNYEDSVIQSVFRAKPQKSVPGEGSGE-FKKDGEFS---VPSSNVREYQKARAKK .: .. ... . . .: : :. :: .. .: . .. . :. . : CCDS59 ECGKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGK 650 660 670 680 690 700 820 830 840 850 860 870 pF1KSD KYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGS . .::.. ... ::: : :.:.:::. : .:: :. :..:: .:.: CCDS59 AF--NRSSNLIEHKKIHTGEQ---P----YKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKC 710 720 730 740 750 880 890 900 910 920 930 pF1KSD RNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQYAKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSH CCDS59 KECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK 760 770 780 790 800 >>CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 (809 aa) initn: 847 init1: 213 opt: 612 Z-score: 335.6 bits: 73.9 E(32554): 2.3e-12 Smith-Waterman score: 756; 25.2% identity (56.4% similar) in 807 aa overlap (101-872:16-761) 80 90 100 110 120 130 pF1KSD SLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQDNMENYRKLL : .: .:.:.. .:.. .::::.:. 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