Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0287
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0287, 1464 aa
  1>>>pF1KSDA0287 1464 - 1464 aa - 1464 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1131+/-0.00158; mu= 2.3002+/- 0.093
 mean_var=383.7887+/-84.392, 0's: 0 Z-trim(108.6): 649  B-trim: 575 in 1/51
 Lambda= 0.065468
 statistics sampled from 9601 (10300) to 9601 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.629), E-opt: 0.2 (0.316), width:  16
 Scan time:  3.730

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS58684.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19          (1464) 9938 955.0       0
CCDS58685.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19          (1462) 9898 951.2       0
CCDS12948.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19          (1588) 9898 951.3       0
CCDS33123.1 ZIM2 gene_id:23619|Hs108|chr19         ( 527)  986 109.0 3.9e-23
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19        (1280)  956 106.6 5.1e-22
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3         (1029)  618 74.5 1.8e-12
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19      ( 688)  612 73.8   2e-12
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 803)  612 73.9 2.2e-12
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 809)  612 73.9 2.3e-12
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19         ( 818)  612 73.9 2.3e-12
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16       ( 869)  608 73.5 3.1e-12
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9        (1059)  598 72.7 6.7e-12
CCDS75077.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 465)  580 70.6 1.3e-11
CCDS75076.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 616)  581 70.8 1.4e-11
CCDS75075.1 ZNF595 gene_id:152687|Hs108|chr4       ( 648)  581 70.8 1.5e-11
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4       ( 923)  579 70.8 2.1e-11
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 819)  562 69.1   6e-11
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19        ( 825)  562 69.1   6e-11


>>CCDS58684.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19               (1464 aa)
 initn: 9938 init1: 9938 opt: 9938  Z-score: 5093.0  bits: 955.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9938; 100.0% identity (100.0% similar) in 1464 aa overlap (1-1464:1-1464)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHSVHSFSGDRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHSVHSFSGDRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DNMENYRKLLSLGVQLAEDDGHSHMTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DNMENYRKLLSLGVQLAEDDGHSHMTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD CEDESSHGVIMEKFIKDVSRSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CEDESSHGVIMEKFIKDVSRSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VYEGNAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VYEGNAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD AMSVSSLSSLSSPSFTESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEYGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AMSVSSLSSLSSPSFTESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEYGE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD MPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERER
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD TFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFTDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFTDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD SGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLAS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD VEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD RSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD QKSVPGEGSGEFKKDGEFSVPSSNVREYQKARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QKSVPGEGSGEFKKDGEFSVPSSNVREYQKARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD RGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQY
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD AKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQETI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQETI
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD EDPVIQGSDMEDPQKDDPDDKIYECEDCGLGFVDLTDLTDHQKVHSRKCLVDSREYTHSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EDPVIQGSDMEDPQKDDPDDKIYECEDCGLGFVDLTDLTDHQKVHSRKCLVDSREYTHSV
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD IHTHSISEYQRDYTGEQLYECPKCGESFIHSSFLFEHQRIHEQDQLYSMKGCDDGFIALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IHTHSISEYQRDYTGEQLYECPKCGESFIHSSFLFEHQRIHEQDQLYSMKGCDDGFIALL
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD PMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGFIHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGFIHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAII
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD PGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNPAELADHVTVHKNEPYEYGSSYTHTSFLTEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNPAELADHVTVHKNEPYEYGSSYTHTSFLTEP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD LKGAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELHLEEEEEDEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKGAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELHLEEEEEDEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVV
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD LRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPNGEAEGPDGEAAEPIGEAGQPNGEAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPNGEAEGPDGEAAEPIGEAGQPNGEAE
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD QPNGDADEPDGAGIEDPEERAEEPEGKAEEPEGDADEPDGVGIEDPEEGEDQEIQVEEPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QPNGDADEPDGAGIEDPEERAEEPEGKAEEPEGDADEPDGVGIEDPEEGEDQEIQVEEPY
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD YDCHECTETFTSSTAFSEHLKTHASMIIFEPANAFGECSGYIERASTSTGGANQADEKYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YDCHECTETFTSSTAFSEHLKTHASMIIFEPANAFGECSGYIERASTSTGGANQADEKYF
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460    
pF1KSD KCDVCGQLFNDRLSLARHQNTHTG
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KCDVCGQLFNDRLSLARHQNTHTG
             1450      1460    

>>CCDS58685.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19               (1462 aa)
 initn: 9694 init1: 9013 opt: 9898  Z-score: 5072.6  bits: 951.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9898; 99.9% identity (99.9% similar) in 1464 aa overlap (1-1464:1-1462)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHSVHSFSGDRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHSVHSFS-DRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRN
               10        20        30         40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQ
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DNMENYRKLLSLGVQLAEDDGHSHMTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGI
       :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DNMENYRKLLSL-VQLAEDDGHSHMTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGI
     120       130        140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD CEDESSHGVIMEKFIKDVSRSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CEDESSHGVIMEKFIKDVSRSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQR
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD VYEGNAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VYEGNAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRK
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD AMSVSSLSSLSSPSFTESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEYGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AMSVSSLSSLSSPSFTESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEYGE
      300       310       320       330       340       350        

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAF
      360       370       380       390       400       410        

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD MPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERER
      420       430       440       450       460       470        

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEE
      480       490       500       510       520       530        

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pF1KSD TFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFTDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFTDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIH
      540       550       560       570       580       590        

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pF1KSD SGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLAS
      600       610       620       630       640       650        

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pF1KSD VEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPP
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pF1KSD RSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKP
      720       730       740       750       760       770        

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD QKSVPGEGSGEFKKDGEFSVPSSNVREYQKARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QKSVPGEGSGEFKKDGEFSVPSSNVREYQKARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRP
      780       790       800       810       820       830        

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD RGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQY
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              910       920       930       940       950       960
pF1KSD AKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQETI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQETI
      900       910       920       930       940       950        

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pF1KSD EDPVIQGSDMEDPQKDDPDDKIYECEDCGLGFVDLTDLTDHQKVHSRKCLVDSREYTHSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EDPVIQGSDMEDPQKDDPDDKIYECEDCGLGFVDLTDLTDHQKVHSRKCLVDSREYTHSV
      960       970       980       990      1000      1010        

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pF1KSD IHTHSISEYQRDYTGEQLYECPKCGESFIHSSFLFEHQRIHEQDQLYSMKGCDDGFIALL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IHTHSISEYQRDYTGEQLYECPKCGESFIHSSFLFEHQRIHEQDQLYSMKGCDDGFIALL
     1020      1030      1040      1050      1060      1070        

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pF1KSD PMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGFIHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGFIHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAII
     1080      1090      1100      1110      1120      1130        

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pF1KSD PGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNPAELADHVTVHKNEPYEYGSSYTHTSFLTEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNPAELADHVTVHKNEPYEYGSSYTHTSFLTEP
     1140      1150      1160      1170      1180      1190        

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD LKGAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELHLEEEEEDEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKGAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELHLEEEEEDEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVV
     1200      1210      1220      1230      1240      1250        

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pF1KSD LRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPNGEAEGPDGEAAEPIGEAGQPNGEAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPNGEAEGPDGEAAEPIGEAGQPNGEAE
     1260      1270      1280      1290      1300      1310        

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD QPNGDADEPDGAGIEDPEERAEEPEGKAEEPEGDADEPDGVGIEDPEEGEDQEIQVEEPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QPNGDADEPDGAGIEDPEERAEEPEGKAEEPEGDADEPDGVGIEDPEEGEDQEIQVEEPY
     1320      1330      1340      1350      1360      1370        

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD YDCHECTETFTSSTAFSEHLKTHASMIIFEPANAFGECSGYIERASTSTGGANQADEKYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YDCHECTETFTSSTAFSEHLKTHASMIIFEPANAFGECSGYIERASTSTGGANQADEKYF
     1380      1390      1400      1410      1420      1430        

             1450      1460    
pF1KSD KCDVCGQLFNDRLSLARHQNTHTG
       ::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KCDVCGQLFNDRLSLARHQNTHTG
     1440      1450      1460  

>>CCDS12948.1 PEG3 gene_id:5178|Hs108|chr19               (1588 aa)
 initn: 9694 init1: 9013 opt: 9898  Z-score: 5072.2  bits: 951.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 9898; 99.9% identity (99.9% similar) in 1464 aa overlap (1-1464:127-1588)

                                             10        20        30
pF1KSD                               MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IIPEKLKPWVRAKKPENCEKLVTLLENYKEMYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHS
        100       110       120       130       140       150      

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VHSFSGDRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRNPRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDS
       ::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VHSFS-DRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRNPRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDS
        160        170       180       190       200       210     

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD RAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQDNMENYRKLLSLGVQLAEDDGHSHMTQGHS
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
CCDS12 RAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQDNMENYRKLLSL-VQLAEDDGHSHMTQGHS
         220       230       240       250        260       270    

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD SRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGICEDESSHGVIMEKFIKDVSRSSKSGRARES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGICEDESSHGVIMEKFIKDVSRSSKSGRARES
          280       290       300       310       320       330    

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD SDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQRVYEGNAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQRVYEGNAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRY
          340       350       360       370       380       390    

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD HFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRKAMSVSSLSSLSSPSFTESQPIDFGAMPYVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRKAMSVSSLSSLSSPSFTESQPIDFGAMPYVC
          400       410       420       430       440       450    

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD DECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEYGESFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEYGESFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETF
          460       470       480       490       500       510    

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD NKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAFMPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAFMPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLH
          520       530       540       550       560       570    

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD SSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERERGETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERERGETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGE
          580       590       600       610       620       630    

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD TFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFTDGRDAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFTDGRDAF
          640       650       660       670       680       690    

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD MQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIHSGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIHSGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISS
          700       710       720       730       740       750    

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD NPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAIN
          760       770       780       790       800       810    

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD HQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQK
          820       830       840       850       860       870    

              760       770       780       790       800       810
pF1KSD IPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKPQKSVPGEGSGEFKKDGEFSVPSSNVREYQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKPQKSVPGEGSGEFKKDGEFSVPSSNVREYQK
          880       890       900       910       920       930    

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD ARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDRE
          940       950       960       970       980       990    

              880       890       900       910       920       930
pF1KSD KPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQYAKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQYAKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYD
         1000      1010      1020      1030      1040      1050    

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD QEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQETIEDPVIQGSDMEDPQKDDPDDKIYECEDCGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQETIEDPVIQGSDMEDPQKDDPDDKIYECEDCGL
         1060      1070      1080      1090      1100      1110    

             1000      1010      1020      1030      1040      1050
pF1KSD GFVDLTDLTDHQKVHSRKCLVDSREYTHSVIHTHSISEYQRDYTGEQLYECPKCGESFIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GFVDLTDLTDHQKVHSRKCLVDSREYTHSVIHTHSISEYQRDYTGEQLYECPKCGESFIH
         1120      1130      1140      1150      1160      1170    

             1060      1070      1080      1090      1100      1110
pF1KSD SSFLFEHQRIHEQDQLYSMKGCDDGFIALLPMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SSFLFEHQRIHEQDQLYSMKGCDDGFIALLPMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGF
         1180      1190      1200      1210      1220      1230    

             1120      1130      1140      1150      1160      1170
pF1KSD IHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAIIPGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 IHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAIIPGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNP
         1240      1250      1260      1270      1280      1290    

             1180      1190      1200      1210      1220      1230
pF1KSD AELADHVTVHKNEPYEYGSSYTHTSFLTEPLKGAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AELADHVTVHKNEPYEYGSSYTHTSFLTEPLKGAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELH
         1300      1310      1320      1330      1340      1350    

             1240      1250      1260      1270      1280      1290
pF1KSD LEEEEEDEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVVLRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEEEEEDEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVVLRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVE
         1360      1370      1380      1390      1400      1410    

             1300      1310      1320      1330      1340      1350
pF1KSD AAEPNGEAEGPDGEAAEPIGEAGQPNGEAEQPNGDADEPDGAGIEDPEERAEEPEGKAEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AAEPNGEAEGPDGEAAEPIGEAGQPNGEAEQPNGDADEPDGAGIEDPEERAEEPEGKAEE
         1420      1430      1440      1450      1460      1470    

             1360      1370      1380      1390      1400      1410
pF1KSD PEGDADEPDGVGIEDPEEGEDQEIQVEEPYYDCHECTETFTSSTAFSEHLKTHASMIIFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PEGDADEPDGVGIEDPEEGEDQEIQVEEPYYDCHECTETFTSSTAFSEHLKTHASMIIFE
         1480      1490      1500      1510      1520      1530    

             1420      1430      1440      1450      1460    
pF1KSD PANAFGECSGYIERASTSTGGANQADEKYFKCDVCGQLFNDRLSLARHQNTHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PANAFGECSGYIERASTSTGGANQADEKYFKCDVCGQLFNDRLSLARHQNTHTG
         1540      1550      1560      1570      1580        

>>CCDS33123.1 ZIM2 gene_id:23619|Hs108|chr19              (527 aa)
 initn: 1352 init1: 925 opt: 986  Z-score: 528.8  bits: 109.0 E(32554): 3.9e-23
Smith-Waterman score: 1120; 40.3% identity (61.3% similar) in 568 aa overlap (1-532:1-523)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHSVHSFSGDRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MYQPEDDNNSDVTSDDDMTRNRRESSPPHSVHSFSGDRDWDRRGRSRDMEPRDRWSHTRN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD PRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PRSRMPPRDLSLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD DNMENYRKLLSLGVQLAEDDGHSHMTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGI
       :::::::::::::  ::.:.    .   . .    .  ::..   . .:. :.      .
CCDS33 DNMENYRKLLSLGF-LAQDS----VPAEKRNTEMLDNLPSAG---SQFPDFKH-LGTFLV
              130            140       150          160        170 

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD CEDESSHGVIMEKFIKDVSRSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQR
        :.     : .:  . : :    :     : . .::      . .... :.. .....  
CCDS33 FEEL----VTFEDVLVDFSPEELS-----SLSAAQR------NLYREVMLENYRNLVSL-
                 180       190                  200       210      

              250       260       270       280             290    
pF1KSD VYEGNAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSI------HDQKGCPRKKPFE-
          :. :      .  ..::   ::... : ..::.. ..      ::.   :..   : 
CCDS33 ---GHQFS-----KPDIISR---LEEEESYAMETDSRHTVICQGESHDDPLEPHQGNQEK
            220               230       240       250       260    

             300       310            320        330       340     
pF1KSD --CGSEMRKAMSVSSLSSLSSPSFTES-----QPID-FGAMPYVCDECGRSFSVISEFVE
             :    ...   : .:  : .:     :  : .:  :      :   :  :   :
CCDS33 LLTPITMNDPKTLTPERSYGSDEFERSSNLSKQSKDPLGKDPQEGTAPGICTSPQSASQE
          270       280       290       300       310       320    

         350       360       370       380       390       400     
pF1KSD HQIMHTRENLYEYGESFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHAR
       ..  :.: .. .  ..:  .::. . .. ..: : .:::.:.:.:     : .:.: :. 
CCDS33 NK--HNRCEFCK--RTFSTQVALRRHERIHTGKKPYECKQCAEAFYLMPHLNRHQKTHS-
            330         340       350       360       370          

         410       420          430       440       450       460  
pF1KSD GYLVECKNQECEEAFMPS---PTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIH-
       :     :.. :.:.  ::    .. :  .:.... ..::  : ..::..  :..: : : 
CCDS33 GR----KTSGCNEGRKPSVQCANLCERVRIHSQEDYFECFQCGKAFLQNVHLLQHLKAHE
     380           390       400       410       420       430     

                         470            480       490       500    
pF1KSD --------FGDDKDN----EREHERERER-----ERGETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYE
               .. .:      .:.:.   ::     . :..:  .  : .  . . .:. :.
CCDS33 AARVLPPGLSHSKTYLIRYQRKHDYVGERACQCCDCGRVFSRNSYLIQHYRTHTQERPYQ
         440       450       460       470       480       490     

          510       520       530       540       550       560    
pF1KSD CKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQKTYNKEKLCDFT
       :..::. : . : : .: ..:.. .  :                                
CCDS33 CQLCGKCFGRPSYLTQHYQLHSQEKTVECDHC                            
         500       510       520                                   

>>CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19             (1280 aa)
 initn: 728 init1: 221 opt: 956  Z-score: 508.9  bits: 106.6 E(32554): 5.1e-22
Smith-Waterman score: 1115; 25.3% identity (54.4% similar) in 1168 aa overlap (112-1234:22-1139)

              90       100       110       120        130       140
pF1KSD MDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQDNM-ENYRKLLSLGVQLAEDD
                                     :   .:  .. : ::::.:. ::.   . :
CCDS54          MGSLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFLGIAAFKPD
                        10        20        30        40        50 

              150        160       170       180       190         
pF1KSD GHSHMTQGHSSRS-KRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGICEDESSHGVIMEKFIKDVS
           . .:. : . ::  .   :  . .   :.    ..:: :: : . ::.... :   
CCDS54 LIIFLEEGKESWNMKRHEMVEESPVICSH-FAQDLWPEQGI-ED-SFQKVILRRYEKCGH
              60        70        80         90         100        

     200       210       220       230       240          250      
pF1KSD RSSKSGRARESSDRSQRFPRMSDDNWKDISLNKRESVIQQRVYEGNAFR---GGFRFNST
       .. .   .  . :. .   .    :  . ::.  .: . ::   .:.:.   .. : .  
CCDS54 ENLHLKIGYTNVDECKVHKE--GYNKLNQSLTTTQSKVFQRGKYANVFHKCSNSNRHKIR
      110       120         130       140       150       160      

        260       270       280       290       300       310      
pF1KSD LVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRKAMSVSSLSSLSSPSFT
        ...:..  ..    :   .. : : ..   :.. ..:  :  ::.. ::       ..:
CCDS54 HTGKKHLQCKEYVRSFCMLSHLSQH-KRIYTRENSYKC-EEGGKAFNWSS-------TLT
        170       180       190        200        210              

        320       330       340       350          360       370   
pF1KSD ESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLY---EYGESFIHSVAVSEVQK
         .    :  :: : :::..:: .: ...:...:: :. :   : :..: .:. ... . 
CCDS54 YYKSAHTGEKPYRCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTGEKSYKCEECGKAFNQSAILTKHKI
       220       230       240       250       260       270       

           380       390       400       410       420       430   
pF1KSD SQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAFMPSPTFSELQKIY
        ..: :  .:..::..:.: ..:. :. :::     .::  :: .::    :.   . :.
CCDS54 IHTGEKPNKCEECGKAFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCK--ECGKAFSKVSTLITHKAIH
       280       290       300       310         320       330     

           440       450       460       470       480       490   
pF1KSD GKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERERGETFRPSPALNEF
       . .: :.:. : ..: . : : .:. :: :     :. .. :   : :....   .:.  
CCDS54 AGEKPYKCKECGKAFSKFSILTKHKVIHTG-----EKPYKCE---ECGKAYKWPSTLSYH
         340       350       360            370          380       

           500       510       520       530       540       550   
pF1KSD QKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQK
       .:..  :: :.:. ::. :   : : .:. :::  .:.  : . : ..:  ...: ...:
CCDS54 KKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEVIHTGEKPY--KCEECGKAFNWSSNLMEHKK
       390       400       410       420         430       440     

           560       570       580       590       600             
pF1KSD TYNKEKLCDFTDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIHSG--PFT------
        .. :      .   .: . : :..:. ::. .. .. .  .:.. :.:  :.       
CCDS54 IHTGETPYKCEECGKGFSMFSILTKHKVIHNGEKPYKCEECDKAT-HAGEKPYKCEECGK
         450       460       470       480       490        500    

                  610       620       630       640       650      
pF1KSD ---------ESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIH
                : .. ::  .: . .:  :.:.  :   ... : : :. :. .   ..   
CCDS54 AFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKW
          510       520       530       540       550       560    

        660       670       680       690       700         710    
pF1KSD SLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSR--SVIHSL
       : .    .: :.:  : : .  ...  ::   :.:.:...: .  . .: ..  : . .:
CCDS54 SSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNQSAILIKHKRIHTGEKPYKCEECGKTFSKVSTL
          570       580       590       600       610       620    

          720       730       740       750       760       770    
pF1KSD VASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQS
       .. :    : :..  . .: :.. : .: :. ..  : : :.: .    .. .      :
CCDS54 TTHKA--IHAGEKPYKCKECGKTFIKVSTLTTHKA-IHAGEKPYKCKECGKAF------S
            630       640       650        660       670           

          780       790         800       810        820       830 
pF1KSD VFRAKPQKSVPGEGSGEFKKD--GEFSVPSSNVREYQKARA-KKKYIEHRSNETSVIHSL
        :    ...:   :   .: .  :.    :::. :... .. .: :  .. ...    :.
CCDS54 KFSILTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKPYKCEECGKSFSTFSV
         680       690       700       710       720       730     

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pF1KSD PFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDP
          .....     :.:.:::. .  :: :. :.:::  :::   ..   .  ::      
CCDS54 LTKHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKAFNRSAILIKH
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pF1KSD QTSYAQEQYAKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSHGEESQGEN-------T
       .  ...:.  :      :..  . :.    :.:.. :.  :: .  .  :.        :
CCDS54 KRIHTDEKPYK------CEECGKTFSKVSTLTTHKAIHAGEKPYKCKECGKAFSKFSILT
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pF1KSD DGEETHS-EETHGQETIEDPVIQGSDMEDPQKDDPDDKIYECEDCGLGFVDLTDLTDHQK
         .  :. :. .  :         : .   .:    .: :.::.:: ::  .. :: :. 
CCDS54 KHKVIHTGEKPYKCEECGKAYKWPSTLSYHKKIHTGEKPYKCEECGKGFSMFSILTKHEV
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pF1KSD VHSRKCLVDSREYTHSVIHTHSISEYQRDYTGEQLYECPKCGESFIHSSFLFEHQRIHEQ
       .:. .     .:  ..      .:.... ..::..:.:  ::...  :: :  :..:: .
CCDS54 IHTGEKPYKCEECGKAFSWLSVFSKHKKTHAGEKFYKCEACGKAYKSSSTLSYHKKIHTE
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pF1KSD DQLYSMKGCDDGFIALLPMKPRRNRAAERNPALAGSAIRCLLCGQGFIHSSALNEHMRLH
       .. :... :  :: ..  .  ..   . ..:       .:  ::..:  :: : :: ..:
CCDS54 EKPYKYEECGKGFSTFSILTKHKVIHTGEKP------YKCEECGKAFNWSSNLMEHKKIH
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pF1KSD REDDLLEQSQMAEEAIIPGLALTEFQRSQTEERLFECAVCGESFVNPAELADHVTVHKNE
          .   . .  ..:.    .::: . ... :. ..:  ::..:  :..:..: ..: .:
CCDS54 T-GETPYKCEECDKAFSWPSSLTEHKATHAGEKPYKCEECGKAFSWPSRLTEHKATHAGE
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pF1KSD -PY---EYGSSYTHTSFLTEPLK---GAIPFYECKDCGKSFIHSTVLTKHKELHLEEEEE
        ::   : :.... .: : :  .   :  : :.:..:::::   ..::::: .:  :.  
CCDS54 EPYKCEECGKAFNWSSNLMEHKRIHTGEKP-YKCEECGKSFSTFSILTKHKVIHTGEKPY
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pF1KSD DEAAAAAAAAAQEVEANVHVPQVVLRIQGLNVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPEVEAAEPNG
                                                                   
CCDS54 KCEECGKAYKWSSTLSYHKKIHTVEKPYKCEECGKGFVMFSILAKHKVIHTGEKLYKCEE
            1150      1160      1170      1180      1190      1200 

>>CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3              (1029 aa)
 initn: 1147 init1: 230 opt: 618  Z-score: 337.4  bits: 74.5 E(32554): 1.8e-12
Smith-Waterman score: 749; 26.0% identity (52.6% similar) in 772 aa overlap (357-1123:346-1008)

        330       340       350       360       370       380      
pF1KSD PYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEYGESFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDC
                                     : :.:.  . :.::   .  : : ..:  :
CCDS27 ERADTVKKVSLCERDKKKRTPPEKQGQKWKELGDSLTFGSAISESLIGTEGKKFYKCDMC
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pF1KSD GETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAFMPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKE
        . ::: . : .::.::.     .::  :: ..:.   ..    . .. .: :.:  : .
CCDS27 CKHFNKISHLINHRRIHTGEKPHKCK--ECGKGFIQRSSLLMHLRNHSGEKPYKCNECGK
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pF1KSD TFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERERGETF-RPSPALNEFQKMYGKEKMYEC
       .: .:. :..::.:: :     :. .   . .: :. : : :  . ....  : :. :.:
CCDS27 AFSQSAYLLNHQRIHTG-----EKPY---KCKECGKGFYRHSGLIIHLRRHSG-ERPYKC
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pF1KSD KVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQKTYNKEK--LCDF
       . ::..: ... : .::..:   .:.  : . :...::  .::  .:. .. ::   :: 
CCDS27 NECGKVFSQNAYLIDHQRLHKGEEPY--KCNKCQKAFILKKSLILHQRIHSGEKPYKCDE
          490       500       510         520       530       540  

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pF1KSD TDGRDAFMQSSELSEHQKIHSRKNLFEGRGYEKSVIHSGPFTESQKSHTITRPLESDEDE
         :. .: :.. : .::..:: .: .. .   :  :.:  .   :. ::  . .   .  
CCDS27 C-GK-TFAQTTYLIDHQRLHSAENPYKCKECGKVFIRSKSLLLHQRVHTEKKTFGCKKCG
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pF1KSD KAFTISSNPYENQKIPTKENVYEAKSYERSVIHSLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTI
       : :. .::  ..... ..:. :.     ..  .:    . :. :.   : . .  ..  :
CCDS27 KIFSSKSNFIDHKRMHSREKPYKCTECGKAFTQSAYLFDHQRLHNGEKPYECNECGKVFI
              610       620       630       640       650       660

           690       700       710       720       730       740   
pF1KSD QSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISD
        . . : ::: ..: :  : .. ..    .       : :::..  :  : :.. :. ..
CCDS27 LKKSLILHQRFHTGENLYECKDCGKVFGSNRNLIDHERLHNGEKPYECRECGKTFIMSKS
              670       680       690       700       710       720

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pF1KSD LNDKRQKIPARENP--CEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKPQKSVPGEGSGEFKKDGEFSVP
       .   .::. ..:.   ::  .:  .:..:..  : :    .   ::   : .. :     
CCDS27 FM-VHQKLHTQEKAYKCEDCGKAFSYNSSLL--VHR----RIHTGEKPFECSECG-----
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             810       820       830       840       850       860 
pF1KSD SSNVREYQKARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLT
           : ... :   . :::.      :::   ::   .:    :::.:::.::  ...: 
CCDS27 ----RAFSSNR---NLIEHKR-----IHS---GE---KP----YECDECGKCFILKKSLI
          770          780                      790       800      

             870       880       890       900       910       920 
pF1KSD EHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQYAKEQARNKCKDFRQFFATSED
        ::.:: :::                      ::            ::.:  . :.   .
CCDS27 GHQRIHTREK----------------------SY------------KCNDCGKVFSYRSN
        810                                         820       830  

             930       940       950       960       970       980 
pF1KSD LNTNQKIYDQEKSHGEESQGENTDGEETHSEETHGQETIEDPVIQGSDMEDPQKDDPDDK
       : ..:.:.  :: ..    :..          :.... ::            :.    .:
CCDS27 LIAHQRIHTGEKPYACSECGKGF---------TYNRNLIEH-----------QRIHSGEK
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pF1KSD IYECEDCGLGFVDLTDLTDHQKVHSRKCLVDSREYTHSVIHTHSISEYQRDYTGEQLYEC
        :::. :   ...  .:  ::..:. .      :  ..  .....  .:: .:::. :::
CCDS27 TYECHVCRKVLTSSRNLMVHQRIHTGEKPYKCNECGKDFSQNKNLVVHQRMHTGEKPYEC
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pF1KSD PKCGESFIHSSFLFEHQRIHEQDQLYSMKGCDDGFIALLPMKPRRNRAAERNPALAGSAI
        :: .::  .  :  :::::  .. :   ::.:   ..   . :.: .....     .  
CCDS27 DKCRKSFTSKRNLVGHQRIHTGEKPY---GCNDCSKVF---RQRKNLTVHQKIHTDEKPC
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            1110      1120      1130      1140      1150      1160 
pF1KSD RCLLCGQGFIHSSALNEHMRLHREDDLLEQSQMAEEAIIPGLALTEFQRSQTEERLFECA
       .: .  . : ..: :. ....:                                      
CCDS27 ECDVSEKEFSQTSNLHLQQKIHTIEEFSWLQNTNESKIEIQKI                 
        990      1000      1010      1020                          

>>CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19           (688 aa)
 initn: 967 init1: 277 opt: 612  Z-score: 336.5  bits: 73.8 E(32554): 2e-12
Smith-Waterman score: 840; 29.2% identity (59.6% similar) in 602 aa overlap (275-871:91-669)

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pF1KSD NAFRGGFRFNSTLVSRKRVLERKRRYHFDTDGKGSIHDQKGCPRKKPFECGSEMRKAMSV
                                     ..::... :.   .:. :. :  .   ::.
CCDS12 NTYETELSQWEMSDRLENCDLEESNSRDYLEAKGKMEKQQEN-QKEYFRQGMIIYDKMSI
               70        80        90       100        110         

           310       320       330       340       350          360
pF1KSD -SSLSSLSSPSFTESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEHQIMHTRENLYEY---GE
        .. . ::. :  .:        :: : :::..:   :....:: .:: :. ::    :.
CCDS12 FNQHTYLSQHSRCHSTE-----KPYKCKECGKAFRRASHLTQHQSIHTGEKPYECKQCGK
     120       130            140       150       160       170    

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pF1KSD SFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIHARGYLVECKNQECEEAF
       .: ..  .:  :. ..: : . ::.::..:..:. :  :..::.     .:  .:: .::
CCDS12 AFSRDSQLSLHQRLHTGEKPYACKECGKAFTQSSQLILHHRIHTGEKPYKC--EECGKAF
          180       190       200       210       220         230  

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pF1KSD MPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFGDDKDNEREHERERERER
       . :  ... ::..  .: :::. : ..: ..: :  ::..: :     :. .: .. :. 
CCDS12 IRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRLHTG-----EKLYECKECRK-
            240       250       260       270            280       

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD GETFRPSPALNEFQKMYGKEKMYECKVCGETFLHSSSLKEHQKIHTRGNPFENKGKVCEE
         .:     :   ....  :: :::: ::..:. .:.:..:::::.  .:.: :   : .
CCDS12 --VFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGEKPYECK--ECGR
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       .:: :. : ..:. .. ::     .   ::...:.:..::.::. .. .: .   :   :
CCDS12 AFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYECKECGKMFSH
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       .. .:. :. ::  .: .  :  :::. .:   ..:.: : :. :: :   ..  ..   
CCDS12 GSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKECGKTFSRGSEL
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pF1KSD VEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTSEGREYSRSVIHSLVASKPP
       .. .. :.   : . :  ..: :.. .  .:::...: .  : .:   .  .:   :.  
CCDS12 TQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAFTQSSHLSQHQ
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pF1KSD RSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENPCEGGSKNRNYEDSVIQSVFRAKP
       : :.:..    :: :..    . :  ..:.: . :.: .    .. .    :..   .. 
CCDS12 RLHTGEKPYVCNECGKAFAR-GLLLIQHQRIHTGEKPYQCKECGKAF----IRGSQLTQH
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pF1KSD QKSVPGEGSGEFKKDGEFSVPSSNVREYQKARAKKKYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRP
       :.   ::   : :. :.    .:..  .:. .. .:  : :  . .  .:  ....    
CCDS12 QRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSRHQRIH
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pF1KSD RGML-YECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGSRNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQ
        :   :.:.:::. :...:.::.::.::  ::                            
CCDS12 TGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM         
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CCDS59                      MDVAIEFCLEEWQ-CLDIAQQNLYRNVM---LENYRNLV
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        ::. ... :  . . :      :.   :   . . . : .        .: .. ..   
CCDS59 FLGIAVSKPDLITCLEQ-----EKEPWEPMRRHEMVAKPPV--------MC-SHFTQDFW
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        :. :::  ...              . :... . :.. :.:     .. : : .. :::
CCDS59 PEQHIKDPFQKAT-------------LRRYKNCEHKNVHLKKD----HKSVDECKVHRGG
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       .  ::. : ...... :  :  . .: :..... .: : .:   . :  :::.   :   
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       .  .:: .::   : :..: .:  ..  .  ..: : ..::.:...::.:. :.::.:::
CCDS59 KKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIH
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pF1KSD ARGYLVECKNQECEEAFMPSPTFSELQKIYGKDKFYECRVCKETFLHSSALIEHQKIHFG
             .:  .:: .::    :... ..:.  .: : :. : ..: . : :  :..:: .
CCDS59 PGEKPYKC--EECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTA
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       .        .  .  : ::.:  :  :.. .:.. ..: :.:. ::..:  ::.: ::. 
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        ::  .:.  : . : ..:   ..: .... .. ::   :.   :. :: : :.:. :..
CCDS59 THTGEKPY--KCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVC-GK-AFNQFSNLTTHKR
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       ::. .. .. .   :.  .:. .:. .: :   .: . .:  :::  ::.  :..   : 
CCDS59 IHTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTG
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pF1KSD ENVYEAKSYERSVIHSLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTS
       :. :. .   ..  :    .. .. :.   : : .  ...  :: .  .:.....: .  
CCDS59 EKPYKCEECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFY
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pF1KSD EGREYSRSVIHSLVASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENP--CE
       . .: ...  .:   .   . :.:..  . .: :..   .: :. :.. : ..:.:  ::
CCDS59 KCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLT-KHKIIHTEEKPYKCE
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pF1KSD GGSKNRNYEDSVIQSVFRAKPQKSVPGEGSGE-FKKDGEFS---VPSSNVREYQKARAKK
         .:  .. ... .  .    .:    :  :. :: .. .:   .  .. . :.  .  :
CCDS59 ECGKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGK
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pF1KSD KYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGS
        .  .::..    ...  :::   :    :.:.:::. : .:: :. :..:: .:.:   
CCDS59 AF--NRSSNLIEHKKIHTGEQ---P----YKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKC
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pF1KSD RNYEWSVIRSLAPTDPQTSYAQEQYAKEQARNKCKDFRQFFATSEDLNTNQKIYDQEKSH
                                                                   
CCDS59 KECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK               
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pF1KSD SLPVVAKTSFEMDREDDRDSRAYESRSQDAESYQNVVDLAEDRKPHNTIQDNMENYRKLL
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CCDS12                MGPLTFMDVAIEFCLEEWQ-CLDIAQQNLYRNVM---LENYRNLV
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pF1KSD SLGVQLAEDDGHSHMTQGHSSRSKRSAYPSTSRGLKTMPEAKKSTHRRGICEDESSHGVI
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CCDS12 FLGIAVSKPDLITCLEQ-----EKEPWEPMRRHEMVAKPPV--------MC-SHFTQDFW
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CCDS12 PEQHIKDPFQKAT-------------LRRYKNCEHKNVHLKKD----HKSVDECKVHRGG
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pF1KSD MSVSSL--------------SSLSSPSF-TESQPIDFGAMPYVCDECGRSFSVISEFVEH
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CCDS12 LAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFNWSSRLTTH
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pF1KSD QIMHTRENLY---EYGESFIHSVAVSEVQKSQVGGKRFECKDCGETFNKSAALAEHRKIH
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CCDS12 KKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIH
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CCDS12 PGEKPYKC--EECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTA
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CCDS12 E--------KFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKL
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pF1KSD IHTRGNPFENKGKVCEETFIPGQSLKRRQKTYNKEK--LCDFTDGRDAFMQSSELSEHQK
        ::  .:.  : . : ..:   ..: .... .. ::   :.   :. :: : :.:. :..
CCDS12 THTGEKPY--KCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVC-GK-AFNQFSNLTTHKR
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pF1KSD IHSRKNLFEGRGYEKSVIHSGPFTESQKSHTITRPLESDEDEKAFTISSNPYENQKIPTK
       ::. .. .. .   :.  .:. .:. .: :   .: . .:  :::  ::.  :..   : 
CCDS12 IHTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTG
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pF1KSD ENVYEAKSYERSVIHSLASVEAQKSHSVAGPSKPKVMAESTIQSFDAINHQRVRAGGNTS
       :. :. .   ..  :    .. .. :.   : : .  ...  :: .  .:.....: .  
CCDS12 EKPYKCEECGKAFNHFSILTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGEKFY
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pF1KSD EGREYSRSVIHSLVASKPPRSHNGNELVESNEKGESSIYISDLNDKRQKIPARENP--CE
       . .: ...  .:   .   . :.:..  . .: :..   .: :. :.. : ..:.:  ::
CCDS12 KCEECGKAFTQSSNLTTHKKIHTGGKPYKCEECGKAFNQFSTLT-KHKIIHTEEKPYKCE
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pF1KSD GGSKNRNYEDSVIQSVFRAKPQKSVPGEGSGE-FKKDGEFS---VPSSNVREYQKARAKK
         .:  .. ... .  .    .:    :  :. :: .. .:   .  .. . :.  .  :
CCDS12 ECGKAFKWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKLSSTLSTHKIIHTGEKPYKCEKCGK
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pF1KSD KYIEHRSNETSVIHSLPFGEQTFRPRGMLYECQECGECFAHSSDLTEHQKIHDREKPSGS
        .  .::..    ...  :::   :    :.:.:::. : .:: :. :..:: .:.:   
CCDS12 AF--NRSSNLIEHKKIHTGEQ---P----YKCEECGKAFNYSSHLNTHKRIHTKEQPYKC
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CCDS12 KECGKAFNQYSNLTTHNKIHTGEKLYKPEDVTVILTTPQTFSNIK               
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CCDS74       MPGHPGSWEMGPLTFMDVAIEFCLEEWQ-CLDIAQQNLYRNVM---LENYRNLV
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        ::. ... :  . . :      :.   :   . . . : .        .: .. ..   
CCDS74 FLGIAVSKPDLITCLEQ-----EKEPWEPMRRHEMVAKPPV--------MC-SHFTQDFW
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        :. :::  ...              . :... . :.. :.:     .. : : .. :::
CCDS74 PEQHIKDPFQKAT-------------LRRYKNCEHKNVHLKKD----HKSVDECKVHRGG
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       .  ::. : ...... :  :  . .: :..... .: : .:   . :  :::.   :   
CCDS74 YNGFNQCLPATQSKIFLFDKCVKAFHKFSNSNRHKISHTEKKLFKCK--ECGKSFCMLPH
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       ..  ..              .... ::. :. . :. :  ::.:.:::. :.  :... :
CCDS74 LAQHKIIHTRVNFCKCEKCGKAFNCPSIITKHKRINTGEKPYTCEECGKVFNWSSRLTTH
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       .  .:: .::   : :..: .:  ..  .  ..: : ..::.:...::.:. :.::.:::
CCDS74 KKNYTRYKLYKCEECGKAFNKSSILTTHKIIRTGEKFYKCKECAKAFNQSSNLTEHKKIH
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             .:  .:: .::    :... ..:.  .: : :. : ..: . : :  :..:: .
CCDS74 PGEKPYKC--EECGKAFNWPSTLTKHKRIHTGEKPYTCEECGKAFNQFSNLTTHKRIHTA
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       .        .  .  : ::.:  :  :.. .:.. ..: :.:. ::..:  ::.: ::. 
CCDS74 E--------KFYKCTECGEAFSRSSNLTKHKKIHTEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKL
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        ::  .:.  : . : ..:   ..: .... .. ::   :.   :. :: : :.:. :..
CCDS74 THTGEKPY--KCEECGKAFNWPSTLTKHNRIHTGEKPYKCEVC-GK-AFNQFSNLTTHKR
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CCDS74 IHTAEKPYKCEECGKAFSRSSNLTKHKKIHIEKKPYKCEECGKAFKWSSKLTEHKITHTG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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