Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0289
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0289, 1294 aa
1>>>pF1KSDA0289 1294 - 1294 aa - 1294 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0598+/-0.000406; mu= 19.3012+/- 0.025
mean_var=101.0030+/-19.710, 0's: 0 Z-trim(113.3): 60 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.127617
statistics sampled from 22590 (22634) to 22590 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 15.080
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004310 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform 1 p (1294) 8869 1644.8 0
XP_016856829 (OMIM: 600904) PREDICTED: astrotactin (1302) 8843 1640.0 0
NP_996991 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform 2 p (1216) 8340 1547.3 0
NP_001273093 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform (1228) 8340 1547.3 0
XP_016856830 (OMIM: 600904) PREDICTED: astrotactin (1236) 8314 1542.6 0
NP_054729 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform a p (1288) 3619 678.2 1e-193
NP_937829 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform b [ ( 440) 1322 254.9 8.9e-67
NP_937830 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform c [ ( 402) 1314 253.4 2.3e-66
NP_937831 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform d [ ( 395) 1293 249.5 3.3e-65
NP_001171663 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform ( 375) 1247 241.1 1.1e-62
NP_001171664 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform ( 194) 591 120.1 1.5e-26
>>NP_004310 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform 1 precu (1294 aa)
initn: 8869 init1: 8869 opt: 8869 Z-score: 8822.8 bits: 1644.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8869; 99.8% identity (100.0% similar) in 1294 aa overlap (1-1294:1-1294)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSALPFLRENDLSIMHSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSALPFLRENDLSIMHSPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASEPKLLFSVRNDFPGEMVVVDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ASEPKLLFSVRNDFPGEMVVVDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GYEYDITDLRHHLQRECMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GYEYDITDLRHHLQRECMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YKDNIIATSPVDSNHQQATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YKDNIIATSPVDSNHQQATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FYTDPSRSRRRSRVGSPRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FYTDPSRSRRRSRVGSPRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IADGSRFILLEGSQLDASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IADGSRFILLEGSQLDASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ECLCYEGYMKDPVHKHLCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIFRFTYTLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ECLCYEGYMKDPVHKHLCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIFRFTYTLGE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GMWLPLSKSFVIPPAELAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLEVLLDSFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GMWLPLSKSFVIPPAELAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLEVLLDSFGP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VRDCSKDNGGCSKNFRCISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDCSDGFNGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VRDCSKDNGGCSKNFRCISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDCSDGFNGGC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EQLCLQQMAPFPDDPTLYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDCGESRELPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EQLCLQQMAPFPDDPTLYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDCGESRELPM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NQTLFGEMFFGYNNHSKEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVPLENQCLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NQTLFGEMFFGYNNHSKEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVPLENQCLEE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ISEPTPDPDFLTGMVNFSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNALHSLDGAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ISEPTPDPDFLTGMVNFSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNALHSLDGAT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SRADFVALLDQFGNHYIQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGNSPSDESEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SRADFVALLDQFGNHYIQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGNSPSDESEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RERDPKVLTFPEYITSLSDSGTKRMAAGVRMECQSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVL
:::::::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RERDPKVLTFPEYITSLSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LEVTKAAPIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LEVTKAAPIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LPQPVLRLSTVHEPSSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LPQPVLRLSTVHEPSSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD FVDDIISGAKSPCAMPSQVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FVDDIISGAKSPCAMPSQVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD VKTPCPVVDDVKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VKTPCPVVDDVKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD SFGEFTWRCEDELGPRKAGLILSQLGDLSSWCNGLLQEPKISLRRSSLKYLGCRYSEIKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SFGEFTWRCEDELGPRKAGLILSQLGDLSSWCNGLLQEPKISLRRSSLKYLGCRYSEIKP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290
pF1KSD YGLDWAELSRDLRKTCEEQTLSIPYNDYGDSKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 YGLDWAELSRDLRKTCEEQTLSIPYNDYGDSKEI
1270 1280 1290
>>XP_016856829 (OMIM: 600904) PREDICTED: astrotactin-1 i (1302 aa)
initn: 5644 init1: 5644 opt: 8843 Z-score: 8796.9 bits: 1640.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8843; 99.2% identity (99.4% similar) in 1302 aa overlap (1-1294:1-1302)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSALPFLRENDLSIMHSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSALPFLRENDLSIMHSPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASEPKLLFSVRNDFPGEMVVVDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASEPKLLFSVRNDFPGEMVVVDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GYEYDITDLRHHLQRECMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GYEYDITDLRHHLQRECMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YKDNIIATSPVDSNHQQATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YKDNIIATSPVDSNHQQATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD FYTDPSRSRRRSRVGSPRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FYTDPSRSRRRSRVGSPRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IADGSRFILLEGSQLDASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IADGSRFILLEGSQLDASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KSD --------ECLCYEGYMKDPVHKHLCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RREHRAAGECLCYEGYMKDPVHKHLCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD RFTYTLGEGMWLPLSKSFVIPPAELAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFTYTLGEGMWLPLSKSFVIPPAELAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLE
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD VLLDSFGPVRDCSKDNGGCSKNFRCISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLLDSFGPVRDCSKDNGGCSKNFRCISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDC
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SDGFNGGCEQLCLQQMAPFPDDPTLYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDGFNGGCEQLCLQQMAPFPDDPTLYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDC
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD GESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHSKEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHSKEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVP
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVNFSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVNFSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNA
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LHSLDGATSRADFVALLDQFGNHYIQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHSLDGATSRADFVALLDQFGNHYIQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGN
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD SPSDESEERERDPKVLTFPEYITSLSDSGTKRMAAGVRMECQSKGRCPSSCPLCHVTSSP
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::
XP_016 SPSDESEERERDPKVLTFPEYITSLSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSP
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD DTPAEPVLLEVTKAAPIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DTPAEPVLLEVTKAAPIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGA
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEPSSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEPSSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD VETETVLSFVDDIISGAKSPCAMPSQVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VETETVLSFVDDIISGAKSPCAMPSQVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD RSRPSDVIVKTPCPVVDDVKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSRPSDVIVKTPCPVVDDVKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD YHYNQHYESFGEFTWRCEDELGPRKAGLILSQLGDLSSWCNGLLQEPKISLRRSSLKYLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YHYNQHYESFGEFTWRCEDELGPRKAGLILSQLGDLSSWCNGLLQEPKISLRRSSLKYLG
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290
pF1KSD CRYSEIKPYGLDWAELSRDLRKTCEEQTLSIPYNDYGDSKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CRYSEIKPYGLDWAELSRDLRKTCEEQTLSIPYNDYGDSKEI
1270 1280 1290 1300
>>NP_996991 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform 2 precu (1216 aa)
initn: 8340 init1: 8340 opt: 8340 Z-score: 8296.8 bits: 1547.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8340; 99.8% identity (100.0% similar) in 1216 aa overlap (1-1216:1-1216)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSALPFLRENDLSIMHSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSALPFLRENDLSIMHSPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ASEPKLLFSVRNDFPGEMVVVDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 ASEPKLLFSVRNDFPGEMVVVDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 HIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 CKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GYEYDITDLRHHLQRECMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 GYEYDITDLRHHLQRECMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YKDNIIATSPVDSNHQQATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 YKDNIIATSPVDSNHQQATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLT
310 320 330 340 350 360
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NP_996 SFGEFTWRCEDELGPR
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NP_001 SFGEFTWRCEDELGPRLPACWDSQRSCR
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XP_016 HIHHQDGAPSLPGQDPTEEPQHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CKRRRVPQPQKSASAEAANEIHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILD
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XP_016 GYEYDITDLRHHLQRECMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNK
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pF1KSD YKDNIIATSPVDSNHQQATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLT
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XP_016 YKDNIIATSPVDSNHQQATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLT
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pF1KSD FYTDPSRSRRRSRVGSPRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FYTDPSRSRRRSRVGSPRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHL
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pF1KSD IADGSRFILLEGSQLDASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IADGSRFILLEGSQLDASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETG
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pF1KSD --------ECLCYEGYMKDPVHKHLCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RFTYTLGEGMWLPLSKSFVIPPAELAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VLLDSFGPVRDCSKDNGGCSKNFRCISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDGFNGGCEQLCLQQMAPFPDDPTLYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDC
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pF1KSD GESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHSKEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHSKEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVP
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pF1KSD LENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVNFSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVNFSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNA
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pF1KSD LHSLDGATSRADFVALLDQFGNHYIQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LHSLDGATSRADFVALLDQFGNHYIQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGN
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pF1KSD SPSDESEERERDPKVLTFPEYITSLSDSGTKRMAAGVRMECQSKGRCPSSCPLCHVTSSP
:::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::
XP_016 SPSDESEERERDPKVLTFPEYITSLSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSP
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pF1KSD DTPAEPVLLEVTKAAPIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DTPAEPVLLEVTKAAPIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGA
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pF1KSD DGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEPSSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEPSSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSK
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pF1KSD VETETVLSFVDDIISGAKSPCAMPSQVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VETETVLSFVDDIISGAKSPCAMPSQVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGR
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pF1KSD RSRPSDVIVKTPCPVVDDVKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RSRPSDVIVKTPCPVVDDVKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVL
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pF1KSD YHYNQHYESFGEFTWRCEDELGPRKAGLILSQLGDLSSWCNGLLQEPKISLRRSSLKYLG
::::::::::::::::::::::::
XP_016 YHYNQHYESFGEFTWRCEDELGPRLPACWDSQRSCR
1210 1220 1230
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10 20 30 40
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NP_054 LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL
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50 60 70 80
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90 100 110 120 130 140
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150 160 170 180 190 200
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: .::...:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.: :::::.::..:
NP_054 PSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIP--QKSASTEATHE
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210 220 230 240 250
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::::::::.: ..:::.:..:.: ::: . :::::::: : : : : .:..::
NP_054 IHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEEPPRRANHVSRE
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260 270 280 290 300 310
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..:.::::.::::: : :: .
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320 330 340 350 360 370
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... . ..: .: .: ::.::... ::::::. ::::::. :
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.::::::.::::...::....::.:...:::.::.:::::::.::::: :.. ::: ::
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::.:..:: ..:::::: ..::.::: ::: .::.: :..::.:.:::.:::::.::.:
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..:. :::..:.:.::: .:..::. .... ...:.:. : .:: .........:.::
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pF1KSD --LSDSGTKRMAAGVRMECQSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVT
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NP_054 QMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQ
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:::.: ::: .: ::... ::.:...:: . : . . : :::.::..:: . :.
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NP_054 AAGRSHGEVP--EVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDD
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pF1KSD VKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYESFGEFTWRCE
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NP_054 NKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSE
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NP_054 DELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILK
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pF1KSD DLRKTCEEQTLSIPYNDYGDSKEI
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NP_054 DTKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
1270 1280
>>NP_937829 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform b [Homo (440 aa)
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NP_937 LCKGMFCLLSWEADSRGRLGEYTLQPLSLQTEETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTAQM
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NP_937 LSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTK
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NP_937 SLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRS
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NP_937 RKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKDTKIT
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pF1KSD CEEQTLSIPYNDYGDSKEI
:::. .:. : ::.::
NP_937 CEEKMVSMARNTYGESKGR
430 440
>>NP_937830 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform c [Homo (402 aa)
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NP_937 MPFITYLSGLLTAQMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLC
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NP_937 RRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCD
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NP_937 YTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKF
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NP_937 TLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLME
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NP_937 VSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQ
280 290 300 310 320 330
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NP_937 SRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKDTKITCEEKMVSMARNTYGESKGRYYLTLSKV
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NP_937 SPF
400
>>NP_937831 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform d [Homo (395 aa)
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NP_937 MPFITYLSGLLTAQMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLC
10 20 30 40
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pF1KSD HVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCD
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NP_937 RRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCD
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NP_937 LSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDE
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NP_937 YTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVP--EVSIYSVIFKCLEPDGLYKF
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NP_937 TLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLME
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NP_937 VSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQ
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NP_937 SRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKDTKITCEEKMVSMARNTYYLTLSKVSPF
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>>NP_001171663 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform e [H (375 aa)
initn: 1229 init1: 629 opt: 1247 Z-score: 1246.2 bits: 241.1 E(85289): 1.1e-62
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NP_001 MPFITYLSGLLTAQMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLC
10 20 30 40
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pF1KSD HVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCD
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NP_001 RRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCD
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pF1KSD STAFGADGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEPSSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTD
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NP_001 LSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDE
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pF1KSD RMDHSKVETETVLSFVDDIISGAKSPCAMPS----QVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMF
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NP_001 YTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKF
170 180 190 200 210
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pF1KSD TLWGVDNTGRRSRPSDVIVKTPCPVVDDVKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLD
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NP_001 TLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLME
220 230 240 250 260 270
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