Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0293
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0293, 1486 aa
1>>>pF1KSDA0293 1486 - 1486 aa - 1486 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.7211+/-0.000413; mu= -1.9451+/- 0.026
mean_var=429.3381+/-88.167, 0's: 0 Z-trim(124.4): 37 B-trim: 1594 in 1/60
Lambda= 0.061898
statistics sampled from 46049 (46092) to 46049 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.54), width: 16
Scan time: 20.800
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_056082 (OMIM: 610648) homeobox protein cut-like (1486) 9830 893.1 0
XP_011536363 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox pr (1542) 9694 881.0 0
XP_016874569 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox pr (1424) 9427 857.1 0
XP_011536371 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox pr (1424) 9427 857.1 0
XP_011536372 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox pr (1424) 9427 857.1 0
XP_016874570 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox pr (1424) 9427 857.1 0
XP_011536365 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox pr (1497) 8885 808.8 0
XP_016867249 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS (1492) 1707 167.8 6e-40
XP_006715917 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS (1583) 1236 125.7 2.9e-27
NP_001189472 (OMIM: 116896) protein CASP isoform d (1516) 1208 123.2 1.6e-26
XP_011514127 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS (1414) 1190 121.6 4.5e-26
NP_001904 (OMIM: 116896) protein CASP isoform b [H ( 678) 1162 118.8 1.5e-25
NP_852477 (OMIM: 116896) protein CASP isoform c [H ( 676) 1161 118.7 1.6e-25
XP_005250211 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS ( 767) 1041 108.0 2.9e-22
XP_011514125 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS (1503) 1048 108.9 3.1e-22
NP_853530 (OMIM: 116896) protein CASP isoform a [H (1505) 1048 108.9 3.1e-22
XP_006715918 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS ( 765) 1040 107.9 3.1e-22
XP_016867248 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS (1514) 1048 108.9 3.1e-22
XP_005250208 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS (1603) 1048 108.9 3.3e-22
XP_005250207 (OMIM: 116896) PREDICTED: protein CAS (1604) 1048 108.9 3.3e-22
NP_001189475 (OMIM: 116896) protein CASP isoform g ( 639) 889 94.4 3.1e-18
NP_001189473 (OMIM: 116896) protein CASP isoform e ( 662) 828 88.9 1.4e-16
NP_001189474 (OMIM: 116896) protein CASP isoform f ( 632) 472 57.1 5.1e-07
>>NP_056082 (OMIM: 610648) homeobox protein cut-like 2 [ (1486 aa)
initn: 9830 init1: 9830 opt: 9830 Z-score: 4758.5 bits: 893.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9830; 99.9% identity (100.0% similar) in 1486 aa overlap (1-1486:1-1486)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 REMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVYKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSPAGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 NEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD AALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 AALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFYGAKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 FPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFYGAKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQRVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQRGSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQRGSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAIKSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAIKSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGGPAQAPLPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 RSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGGPAQAPLPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSSGYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSSGYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYVPRTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYVPRTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD LTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSDMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DQLGQAVGQQPGASQASPTEPRSSPSPPPSPTEPEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DQLGQAVGQQPGASQASPTEPRSSPSPPPSPTEPEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSITKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDPHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLIST
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GSDSESPATRSECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GSDSESPATRSECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRVVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIEL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD LSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQDKAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQDKAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD LDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPGGSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPGGSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSF
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD KSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 KSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPVPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTAD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480
pF1KSD MAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRLERAANREEALEWEF
:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_056 MAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRVERAANREEALEWEF
1450 1460 1470 1480
>>XP_011536363 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox protei (1542 aa)
initn: 9684 init1: 9684 opt: 9694 Z-score: 4692.7 bits: 881.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9694; 98.9% identity (99.5% similar) in 1483 aa overlap (6-1486:60-1542)
10 20 30
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRL--QKELNSVASELSA
: ... : .. :. .::::::::::::
XP_011 FIAAFRFYFCTFAFYLPVVLLTGPRSGAVSGHFWEPWTALERRQELPRKELNSVASELSA
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KSD RQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEIREMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEIREMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVY
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPSFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPSFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSP
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KSD AGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSA
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSS
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KSD IRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASAN
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPED
390 400 410 420 430 440
400 410 420 430 440 450
pF1KSD SLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPED
450 460 470 480 490 500
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSPFPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSPFPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFYG
510 520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KSD AKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQ
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KSD RVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR
630 640 650 660 670 680
640 650 660 670 680 690
pF1KSD GSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKKEIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKKEIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAI
690 700 710 720 730 740
700 710 720 730 740 750
pF1KSD KSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRGRSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRGRSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGG
750 760 770 780 790 800
760 770 780 790 800 810
pF1KSD PAQAPLPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAQAPLPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSS
810 820 830 840 850 860
820 830 840 850 860 870
pF1KSD GYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAAGAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAAGAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYVP
870 880 890 900 910 920
880 890 900 910 920 930
pF1KSD RTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVSD
930 940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KSD MLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLSDQLGQAVGQQPGASQASPTEPRSSPSPPPSPTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLSDQLGQAVGQQPGASQASPTEPRSSPSPPPSPTE
990 1000 1010 1020 1030 1040
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD PEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSSSSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSSSSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSIT
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD KRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLNDP
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD HNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLISTGSDSESPATRSECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLISTGSDSESPATRSECPSPCLQPQDLSLLQIKKPRV
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD VLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGTQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQDK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 STPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSPV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
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XP_011 RAANREEALEWEF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
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XP_016 ERAANREEALEWEF
1420
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XP_011 MVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSV
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XP_011 YKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPSFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IKSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRGRSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GPAQAPLPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAAGAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DMLSRPKPWSKLTQKGREPFIRMQLWLSDQLGQAVGQQPGASQASPTEPRSSPSPPPSPT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSSSSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLND
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pF1KSD VVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGT
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pF1KSD QDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQD
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pF1KSD KAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
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pF1KSD GSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSP
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD VPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_011 VPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRV
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1480
pF1KSD ERAANREEALEWEF
::::::::::::::
XP_011 ERAANREEALEWEF
1420
>>XP_011536372 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox protei (1424 aa)
initn: 9427 init1: 9427 opt: 9427 Z-score: 4564.3 bits: 857.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9427; 99.9% identity (100.0% similar) in 1424 aa overlap (63-1486:1-1424)
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pF1KSD ARQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEIREMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSV
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XP_011 MVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSV
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pF1KSD YKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPSFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPSFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTS
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD PAGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHS
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220 230 240 250 260 270
pF1KSD ALKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DPLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSPFPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GAKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IKSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRGRSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAAGAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PRTLKPTVPPLTPEQYELYMYREVDTLELTRQVKEKLAKNGICQRIFGEKVLGLSQGSVS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EPEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSSSSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TKRVKEVLTDNNLGQRLFGESILGLTQGSVSDLLSRPKPWHKLSLKGREPFVRMQLWLND
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHNVEKLRDMKKLEKKAYLKRRYGLISTGSDSESPATRSECPSPCLQPQDLSLLQIKKPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSP
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_011 VPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRV
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1480
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::::::::::::::
XP_011 ERAANREEALEWEF
1420
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Smith-Waterman score: 9427; 99.9% identity (100.0% similar) in 1424 aa overlap (63-1486:1-1424)
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YKQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPSFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTS
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XP_016 PAGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNS
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pF1KSD SIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SIRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASA
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XP_016 NQIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SGYSGQPNGRAWPRGDEAPVPPEDEAAAGAEDEPPRTGELKAEGATAEAGARLPYYPAYV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EPEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSSSSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VVLAPEEKEALRKAYQLEPYPSQQTIELLSFQLNLKTNTVINWFHNYRSRMRREMLVEGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QDEPDLDPSGGPGILPPGHSHPDPTPQSPDSETEDQKPTVKELELQEGPEENSTPLTTQD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KAQVRIKQEQMEEDAEEEAGSQPQDSGELDKGQGPPKEEHPDPPGNDGLPKVAPGPLLPG
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pF1KSD GSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GSTPDCPSLHPQQESEAGERLHPDPLSFKSASESSRCSLEVSLNSPSAASSPGLMMSVSP
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pF1KSD VPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_016 VPSSSAPISPSPPGAPPAKVPSASPTADMAGALHPSAKVNPNLQRRHEKMANLNNIIYRV
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1480
pF1KSD ERAANREEALEWEF
::::::::::::::
XP_016 ERAANREEALEWEF
1420
>>XP_011536365 (OMIM: 610648) PREDICTED: homeobox protei (1497 aa)
initn: 8883 init1: 8883 opt: 8885 Z-score: 4302.4 bits: 808.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 9270; 95.9% identity (96.4% similar) in 1483 aa overlap (6-1486:60-1497)
10 20 30
pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRL--QKELNSVASELSA
: ... : .. :. .::::::::::::
XP_011 FIAAFRFYFCTFAFYLPVVLLTGPRSGAVSGHFWEPWTALERRQELPRKELNSVASELSA
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD RQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEIREMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RQEESEHSHKHLIELRREFKKNVPEEIREMVAPVLKSFQAEVVALSKRSQEAEAAFLSVY
90 100 110 120 130 140
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pF1KSD KQLIEAPDPVPVFEAARSLDDRLQPPSFDPSGQPRRDLHTSWKRNPELLSPKEQREGTSP
::::::: ::::::::
XP_011 KQLIEAP---------------------------------------------EQREGTSP
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160 170 180 190 200 210
pF1KSD AGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AGPTLTEGSRLPGIPGKALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSA
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KSD LKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LKATQAELLELRRKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSS
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD IRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IRLACCSPQGPSGDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASAN
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD QIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QIADLERQLTAKSEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPED
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD SLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLLIAKEAFFPTQKFLLEKPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPED
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD PLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSPFPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLSPSPGQPLLGPSLGPDGTRTFSLSPFPSLASGERLMMPPAAFKGEAGGLLVFPPAFYG
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pF1KSD AKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AKPPTAPATPAPGPEPLGGPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHNIGQ
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pF1KSD RVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RVFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWRKLTVKGKEPFIKMKQFLSDEQNVLALRTIQVRQR
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pF1KSD GSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKKEIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSITPRIRTPETGSDDAIKSILEQAKKEIESQKGGEPKTSVAPLSIANGTTPASTSEDAI
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pF1KSD KSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRGRSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KSILEQARREMQAQQQALLEMEVAPRGRSVPPSPPERPSLATASQNGAPALVKQEEGSGG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PAQAPLPVLSPAAFVQSIIRKVKSEIGDAGYFDHHWASDRGLLSRPYASVSPSLSSSSSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 PEKSSQEPLSLSLESSKENQQPEGRSSSSLSGKMYSGSQAPGGIQEIVAMSPELDTYSIT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
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1480
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XP_011 RAANREEALEWEF
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:: . :::.. :::.:.. ...: :::.:.. :..::. :..::..:. :::::...:::
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.. . ..:. . :. . : :.::: :: . : . : ..:. :. : .
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:: .: ..: .: .: :. :::. ..: . :... .. .
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:::::::::::::::: ::::.::::: :::::::::::.::::.:: ::::.:: :::.
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:::::.::::::::::.:.. :: .:: : : :.:. ..:.:::.:::.::::
XP_016 SETGSDEAIKSILEQAKRELQVQKTAEP----AQPSSASGS---GNSDDAIRSILQQARR
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::.::: :: :.. ..:. :. : : : :: .: . ::
XP_016 EMEAQQAALDPALKQAPLSQSDITILTPKLLSTSPMPTVSSYPPLAISLKKPSAAPEAGA
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:: . . .:: : . : .:...:.::.:.: .: . :: : :
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. ::. . .. :: : :: . ::.::::::::::.:::.::::.::::::::
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.:.::... :: :.:. . . .... .:::.::::::::::.::::
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XP_016 VEKLMDMKRMEKKAYMKRRHSSVSDSQPCEPPSVGTEYSQGASP--QPQH----QLKKPR
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:::::::::::..::: .:::: .::: :. ::::::.::::::::::::.:::...:
XP_016 VVLAPEEKEALKRAYQQKPYPSPKTIEDLATQLNLKTSTVINWFHNYRSRIRRELFIEEI
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1240 1250 1260 1270 1280 1290
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: .:. : : : .:. .: . .. . .: ::: .. : .
XP_016 Q-------AGSQG--QAGASD-SPSARSGRAAPSSEGDSCDGVEATEGP---GSADTEEP
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1300 1310 1320 1330 1340 1350
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:.: . ..:.. . ::. ..: :: :: . : ..: : .::::
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:: : . . .. :. . ..:. .. .:.: :: .:
XP_016 ------PS--PASATATAAPAAPEDAATSAAAAPGE--------GPAAPSS-------AP
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::.:. : : : : ... : . ::: ... :: :..: ::::.::.::
XP_016 PPSNSS--SSSAPRRP-SSLQSLFGLPEAAGAR--DSRDNP---LRKKKAANLNSIIHRL
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1480
pF1KSD ERAANREEALEWEF
:.::.::: .::::
XP_016 EKAASREEPIEWEF
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pF1KSD MAANVGSMFQYWKRFDLRRLQKELNSVASELSARQEESEHSHKHLIEL
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pF1KSD PGK--ALLTETLLQRNEAEKQKGLQEVQITLAARLGEAEEKIKVLHSALKATQAELLELR
.. :: : :: . :::.. :::.:.. ...: :::.:.. :..::. :..::..:.
XP_006 QAETIALEKEQKLQNDFAEKERKLQETQMSTTSKLEEAEHKVQSLQTALEKTRTELFDLK
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pF1KSD RKYDEEAASKADEVGLIMTNLEKANQRAEAAQREVESLREQLASVNSSIRLACCSPQGPS
:::::...::::. .:::.::.::::::.::::.:.:::::.:.: :..:: ..:.
XP_006 TKYDEETTAKADEIEMIMTDLERANQRAEVAQREAETLREQLSSANHSLQLASQIQKAPD
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pF1KSD GDKVNFTLCSGPRLEAALASKDREILRLLKDVQHLQSSLQELEEASANQIADLERQLTAK
... .: . ::. ::.:.::: .:..:::.::.:: .:.: ::.::..::.::.::
XP_006 VEQAIEVL-TRSSLEVELAAKEREIAQLVEDVQRLQASLTKLRENSASQISQLEQQLSAK
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pF1KSD SEAIEKLEEKLQAQSDYEEIKTELSILKAMKLASSTCSLPQGMAKPEDSLLIAKEAFFPT
. ....:::::..:.::::.: ::.:::.:..: : . : ::: . ::. :. . .
XP_006 NSTLKQLEEKLKGQADYEEVKKELNILKSMEFAPSEGAGTQDAAKPLEVLLLEKNRSLQS
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pF1KSD QKFLLE-KPSLLASPEEDPSEDDSIKDSLGTEQSYPSPQQLPPPPGPEDPLSPSPGQPLL
.. :. . : :.. . ..:. . :. . : :.::: :: . : . : .
XP_006 ENAALRISNSDLSGSARRKGKDQPESRRPGSLPA-PPPSQLPRNPGEQA--SNTNGTHQF
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pF1KSD GPS-LGPDGTRTFSLSP-FPSLASG--------ERLMMPPAAFKG--EAGGL-LVFPPAF
.:. :. : . :: .: ..: .: .: :. :::. ..: .
XP_006 SPAGLSQDFFSSSLASPSLPLASTGKFALNSLLQRQLMQSFYSKAMQEAGSTSMIFSTGP
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pF1KSD YGAKPPTAPATPAPGPEPLG-GPEPADGGGGGAAGPGAEEEQLDTAEIAFQVKEQLLKHN
:... .. . .:. : .: :... ..:... : :..:::::: ::::::.:::
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::::.::::::::::::::::::::::: ::::.::::: :::::::::::.::::.::
XP_006 IGQRIFGHYVLGLSQGSVSEILARPKPWNKLTVRGKEPFHKMKQFLSDEQNILALRSIQG
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::::.:: :::. :::::.::::::::::.:.. :: .:: : : :.:. ..:.
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.: . :: :: . . .:: : . : .:...:.::.:.: .: . :
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: : : :: . . ...: :: .: . ::.... . : .:
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.::. ...::. ::. . .. :: : :: . ::.::::::::::.:::.:
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::::. .:::.: ::: : .: .: . :..: : :.: : .
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::. ::. .:.::... :: :.:. . . .... .:::.:::
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: :.:::::::::::::::..::: .:::: .::: :. ::::::.::::::::::
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::.:::...: : .:. : : : .:. .: . .. . .: ::
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: .. : . :.: . ..:.. . ::. ..: :: :: . : ..:
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: .:::: :: : . . .. :. . ..:. .. .:.:
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:: .: ::.:. : : : : ... : . ::: ... :: :..
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: ::::.::.:::.::.::: .::::
XP_006 KAANLNSIIHRLEKAASREEPIEWEF
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:::::::::::::::::..::.::...:. :. ::.:::.:.:.::: ::::::.::..
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:..:::.:::::.:. ::::::.:::::::.:::.::..:::::... ...:. ..:
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:: . :::.. :::.:.. ...: :::.:.. :..::. :..::..:. :::::...:::
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:. .:::.::.::::::.::::.:.:::::.:.: :..:: ..:. ... .: .
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.. . ..:. . :. . : :.::: :: . : . : ..:. :. : .
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.:. ..:.:::.:::.::::::.::: :: :.. ..:. :. : :
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1486 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:11:03 2016 done: Thu Nov 3 01:11:06 2016
Total Scan time: 20.800 Total Display time: 0.660
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]