Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0307
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0307, 706 aa
1>>>pF1KSDA0307 706 - 706 aa - 706 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5652+/-0.00106; mu= 0.2509+/- 0.063
mean_var=202.6589+/-42.590, 0's: 0 Z-trim(110.1): 54 B-trim: 297 in 1/51
Lambda= 0.090093
statistics sampled from 11320 (11364) to 11320 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 3.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32307.1 ARNT2 gene_id:9915|Hs108|chr15 ( 717) 4760 631.8 1.1e-180
CCDS971.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 774) 2156 293.3 8.8e-79
CCDS65642.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 787) 2156 293.3 9e-79
CCDS970.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 789) 2149 292.4 1.7e-78
CCDS65641.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 ( 775) 2105 286.7 8.8e-77
CCDS76387.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 583) 1095 155.4 2.3e-37
CCDS73259.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 626) 1095 155.4 2.4e-37
CCDS44543.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 582) 1081 153.6 8e-37
CCDS31430.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 ( 625) 1081 153.6 8.5e-37
CCDS58222.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 540) 595 90.4 7.7e-18
CCDS58220.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 588) 595 90.4 8.3e-18
CCDS58221.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 599) 595 90.4 8.5e-18
CCDS8712.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 636) 594 90.3 9.8e-18
CCDS58219.1 ARNTL2 gene_id:56938|Hs108|chr12 ( 622) 585 89.1 2.2e-17
>>CCDS32307.1 ARNT2 gene_id:9915|Hs108|chr15 (717 aa)
initn: 4760 init1: 4760 opt: 4760 Z-score: 3357.5 bits: 631.8 E(32554): 1.1e-180
Smith-Waterman score: 4760; 99.7% identity (100.0% similar) in 706 aa overlap (1-706:12-717)
10 20 30 40
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MATPAAVNPPEMASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEGP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD SKFSRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTG
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SKFSRENHSEIERRRRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD NKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFG
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD STLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD MRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEED
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGY
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD QPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTF
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD QNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELEVHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QNPYSDEIEYIICTNTNVKQLQQQQAELEVHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSV
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFPSGHSGKAFSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFPSGHSGKAFSSS
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD VVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVAWTGSRPPFPGQQIPSQSSKTQSSPFGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVAWTGSRPPFPGQQIPSQSSKTQSSPFGI
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD GTSHTYPADPSSYSPLSSPATSSPSGNAYSSLANRTPGFAESGQSSGQFQGRPSEVWSQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GTSHTYPADPSSYSPLSSPATSSPSGNAYSSLANRTPGFAESGQSSGQFQGRPSEVWSQW
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KSD QSQHHGQQSGEQHSHQQPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QSQHHGQQSGEQHSHQQPGQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
670 680 690 700 710
>>CCDS971.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 (774 aa)
initn: 2396 init1: 2153 opt: 2156 Z-score: 1527.8 bits: 293.3 E(32554): 8.8e-79
Smith-Waterman score: 2832; 59.8% identity (78.5% similar) in 763 aa overlap (1-689:10-760)
10 20 30 40
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQ----VRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGE
:.::.:. ..: :.:. .. .::. :. ::: :.:::: :::
CCDS97 MAATTANPEMTSDVPS-----LGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGE
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KSD GPSKF---------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKL
: ::: .::::::::::.::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS97 GNSKFLRCDDDQMSNDKERFARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALARKPDKL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD TILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYV
::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.:. :::::.::
CCDS97 TILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCETGRVVYV
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGTVKKEGQ
:::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..:::::::::::::::::
CCDS97 SDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGTVKKEGQ
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD QSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCT
:::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.:: ...:::::
CCDS97 QSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHFVVVHCT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNS
::::::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::... ::::.::::
CCDS97 GYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEFISRHNI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD DGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRF
.::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::::::::::::::.::
CCDS97 EGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVLSVMFRF
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430
pF1KSD RTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVK-----------------QL-----
:.::.::. .:::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS97 RSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQRPQLGPTAN
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470
pF1KSD --------------QQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEKADAI
::::.::. : ::::.::. ::: : .: : .: .::.:..
CCDS97 LPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PEHSKPLEKSDGL
480 490 500 510 520 530
480 490 500 510 520 530
pF1KSD FSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSGKAFSSSVVHVP
:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::..:::. :: . . .. : .: . .:
CCDS97 FAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENFRNSGL-AP
540 550 560 570 580 590
540 550 560 570 580
pF1KSD GVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQSS-KTQSSPFGI
:. .: :.:.:: ..::::. : .: : :: . : : .::. .:.. ::..: ::.
CCDS97 PVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTRTSQFGV
600 610 620 630 640 650
590 600 610 620 630 640
pF1KSD GTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSGQFQGRPSE--
:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .:: :.::..:::: : .:
CCDS97 GSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQTRTAEGV
660 670 680 690 700
650 660 670 680 690
pF1KSD -VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYNIEDFAD
:: :::.: :: ..:.::: .: ::.: ::::.:: : :: ... .:
CCDS97 GVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQSNSYNNEEFPDLTM
710 720 730 740 750 760
700
pF1KSD LGMFPPFSE
CCDS97 FPPFSE
770
>>CCDS65642.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 (787 aa)
initn: 2332 init1: 2143 opt: 2156 Z-score: 1527.7 bits: 293.3 E(32554): 9e-79
Smith-Waterman score: 2798; 58.6% identity (76.9% similar) in 778 aa overlap (1-689:10-773)
10 20 30 40
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQ----VRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGE
:.::.:. ..: :.:. .. .::. :. ::: :.:::: :::
CCDS65 MAATTANPEMTSDVPS-----LGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGE
10 20 30 40 50
50 60 70
pF1KSD GPSKF------------------------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSD
: ::: .::::::::::.::::: :::::::
CCDS65 GNSKFLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSD
60 70 80 90 100 110
80 90 100 110 120 130
pF1KSD MVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADG
:::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.:::::::::::::
CCDS65 MVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADG
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KSD FLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTG
:::.:. :::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..::
CCDS65 FLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTG
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KSD RILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: :::::
CCDS65 RILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLG
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KSD PVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDM
::.:: ...:::::::::::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::
CCDS65 SVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDM
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KSD NGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQ
... ::::.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::
CCDS65 SNVCQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQ
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KSD VVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVK---------
::::::::::::.:::.::.::. .::::::::::::::::::::::::::
CCDS65 VVKLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPT
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460
pF1KSD --------QL-------------------QQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPA
:: ::::.::. : ::::.::. ::: : .
CCDS65 LSNTIQRPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTT
480 490 500 510 520 530
470 480 490 500 510
pF1KSD GVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-S
: : .: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::..:::. :: .
CCDS65 G-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPT
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQI
. .. ::. .: :. .: :.:.:: ..::::. : .: : :: . : : .::.
CCDS65 PRPAENFSG---LAPPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQV
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KSD PSQSS-KTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ES
.:.. ::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .:: :.
CCDS65 ATQATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPET
660 670 680 690 700
640 650 660 670 680
pF1KSD GQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTEVFQDMLPMPGD
::..:::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .: ::.: ::::.:: : ::
CCDS65 GQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGD
710 720 730 740 750 760
690 700
pF1KSD PTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
... .:
CCDS65 QSNSYNNEEFPDLTMFPPFSE
770 780
>>CCDS970.1 ARNT gene_id:405|Hs108|chr1 (789 aa)
initn: 2386 init1: 2143 opt: 2149 Z-score: 1522.8 bits: 292.4 E(32554): 1.7e-78
Smith-Waterman score: 2802; 58.6% identity (77.0% similar) in 778 aa overlap (1-689:10-775)
10 20 30 40
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQ----VRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGE
:.::.:. ..: :.:. .. .::. :. ::: :.:::: :::
CCDS97 MAATTANPEMTSDVPS-----LGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGE
10 20 30 40 50
50 60 70
pF1KSD GPSKF------------------------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSD
: ::: .::::::::::.::::: :::::::
CCDS97 GNSKFLRCDDDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSD
60 70 80 90 100 110
80 90 100 110 120 130
pF1KSD MVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADG
:::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.:::::::::::::
CCDS97 MVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADG
120 130 140 150 160 170
140 150 160 170 180 190
pF1KSD FLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTG
:::.:. :::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..::
CCDS97 FLFIVSCETGRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTG
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KSD RILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: :::::
CCDS97 RILDLKTGTVKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLG
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KSD PVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDM
::.:: ...:::::::::::::::...:..: ..:::::.:::::::::::::: : ::
CCDS97 SVKDGEPHFVVVHCTGYIKAWPPAGVSLPDDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDM
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KSD NGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQ
... ::::.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.::::
CCDS97 SNVCQPTEFISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQ
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420
pF1KSD VVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVK---------
::::::::::::.:::.::.::. .::::::::::::::::::::::::::
CCDS97 VVKLKGQVLSVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPT
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460
pF1KSD --------QL-------------------QQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPA
:: ::::.::. : ::::.::. ::: : .
CCDS97 LSNTIQRPQLGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTT
480 490 500 510 520 530
470 480 490 500 510
pF1KSD GVHEAGKSVEKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-S
: : .: .::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::..:::. :: .
CCDS97 G-PEHSKPLEKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPT
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQI
. .. : .: . .: :. .: :.:.:: ..::::. : .: : :: . : : .::.
CCDS97 PRPAENFRNSGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQV
600 610 620 630 640 650
580 590 600 610 620 630
pF1KSD PSQSS-KTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ES
.:.. ::..: ::.:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .:: :.
CCDS97 ATQATAKTRTSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPET
660 670 680 690 700
640 650 660 670 680
pF1KSD GQSSGQFQGRPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTEVFQDMLPMPGD
::..:::: : .: :: :::.: :: ..:.::: .: ::.: ::::.:: : ::
CCDS97 GQTAGQFQTRTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGD
710 720 730 740 750 760
690 700
pF1KSD PTQGTGNYNIEDFADLGMFPPFSE
... .:
CCDS97 QSNSYNNEEFPDLTMFPPFSE
770 780
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10 20 30 40 50
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:.::.:. ..: :.:. .. .::. :. ::: :.:::: :::: :::
CCDS65 MTSDVPS-----LGPAIASGNSGPGIQGGGAIVQRAIKRRPGLDFDD-DGEGNSKFLRCD
10 20 30 40 50
60 70 80
pF1KSD --------------------------SRENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALA
.::::::::::.::::: ::::::::::::::::
CCDS65 DDQMSNDKERFARSDDEQSSADKERLARENHSEIERRRRNKMTAYITELSDMVPTCSALA
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KSD RKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAET
::::::::::::::::::.::::: ::::.:::::::.::::::::::::::::.:. ::
CCDS65 RKPDKLTILRMAVSHMKSLRGTGNTSTDGSYKPSFLTDQELKHLILEAADGFLFIVSCET
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KSD GRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGT
:::.:::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: ::::..:::::::::::
CCDS65 GRVVYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYDQVHPDDVDKLREQLSTSENALTGRILDLKTGT
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD VKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQY
:::::::::::::::::::::::::::.. .: . .::.. .:.: ::::: ::.:: ..
CCDS65 VKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGSSSVDPVSVNRLSFVRNRCRNGLGSVKDGEPHF
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KSD AVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKYCLVAIGRLQVTSSPVCMDMNGMSVPTEF
.:::::::::::::: ..: ..:::::.:::::::::::::: : ::... ::::
CCDS65 VVVHCTGYIKAWPPA-----DDDPEAGQGSKFCLVAIGRLQVTSSPNCTDMSNVCQPTEF
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVL
.:::: .::.:::: ::....:::::.::::.:.::::::::. ::.:::::::::::::
CCDS65 ISRHNIEGIFTFVDHRCVATVGYQPQELLGKNIVEFCHPEDQQLLRDSFQQVVKLKGQVL
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420
pF1KSD SVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVK-----------------Q
:::.:::.::.::. .:::::::::::::::::::::::::: :
CCDS65 SVMFRFRSKNQEWLWMRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNVKNSSQEPRPTLSNTIQRPQ
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460
pF1KSD L-------------------QQQQAELE-VHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSV
: ::::.::. : ::::.::. ::: : .: : .: .
CCDS65 LGPTANLPLEMGSGQLAPRQQQQQTELDMVPGRDGLASYNHSQVVQPVTTTG-PEHSKPL
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EKADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSSASAAGTQQIYSQGSPFP-SGHSGKAFSS
::.:..:.:.:::::.:.. .:.:...: .::... .:::..:::. :: . . .. : .
CCDS65 EKSDGLFAQDRDPRFSEIYHNINADQSKGISSSTVPATQQLFSQGNTFPPTPRPAENFRN
530 540 550 560 570 580
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVA---WTGS-RPPFPGQQIPSQSS-KTQ
: . .: :. .: :.:.:: ..::::. : .: : :: . : : .::. .:.. ::.
CCDS65 SGL-APPVTIVQPSASAGQMLAQISRHSNPTQGATPTWTPTTRSGFSAQQVATQATAKTR
590 600 610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KSD SSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPA--TSSPSGNAYSSLANRTPGFA-ESGQSSGQFQG
.: ::.:. .: :::.: .: :. :.::.. :: ::.:: .:: :.::..::::
CCDS65 TSQFGVGSFQT----PSSFSSMSLPGAPTASPGAAAYPSLTNRGSNFAPETGQTAGQFQT
650 660 670 680 690 700
650 660 670 680 690
pF1KSD RPSE---VWSQWQSQ--HHGQQSGEQHSHQ----QPSQTEVFQDMLPMPGDPTQGTGNYN
: .: :: :::.: :: ..:.::: .: ::.: ::::.:: : :: ...::
CCDS65 RTAEGVGVWPQWQGQQPHHRSSSSEQHVQQPPAQQPGQPEVFQEMLSMLGDQ---SNSYN
710 720 730 740 750 760
700
pF1KSD IEDFADLGMFPPFSE
:.: :
CCDS65 NEEFPDLTMFPPFSE
770
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD TLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDG-------EGPSKFSRENHSEIER
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CCDS76 MINIESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEK
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD RKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFL
:.:.::...: ::...::::.:..:: ::::.:::::.:::..::. : :.. :::.::
CCDS76 RRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFL
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130 140 150 160 170 180
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...:::::::.:::::::::. . :....::.:: .:: :.. .:..:.. .:: :.
CCDS76 SDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KLREQLCTSENSMTGRILDLKTGT-VKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLP
:..::: .:... :..: ::: :: . . :.: :.::::.:::.: : :
CCDS76 KVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKC-NRP-----
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD LNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKY-CL
. . : : . . : . .. ..: :::.:.:::. : . :.. ..: . ::
CCDS76 --SVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KSD VAIGRLQ--VTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKD
::::::. :. .:: .. :. :..::: :: ..::: : ....: ::.::: .
CCDS76 VAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSM--EYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTS
280 290 300 310 320
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pF1KSD ILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIE
:. : .: .:: : .::.. . .. . :.:. :. .. .:. :.:.::.. :.:
CCDS76 CYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVE
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460
pF1KSD YIICTNTNV------------KQLQQQQAELEVHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAG
::. ::: : :: . .. .: .. .. ::..:.:.. ..
CCDS76 YIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGA
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KSD KSVEK--ADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSS----ASAAGTQQIYSQGSP-FPS
.. . :. :. .: . : .: .. :. ::. : ..: . :.: .::
CCDS76 GKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCG--SSPLNITSTPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPS
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVAWTGSRPPFPGQQIPSQS
:: .:... . :: .::: :.:
CCDS76 --SG-LLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLL
510 520 530 540 550 560
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10 20 30 40
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEG
:: . : . ....: : . . . .:: : .: .:
CCDS73 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSG-VDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KSD PSKFS---------RENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAV
... :: ::.::.:.:.::...: ::...::::.:..:: ::::.:::::
CCDS73 RLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAV
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100 110 120 130 140 150
pF1KSD SHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPV
.:::..::. : :.. :::.::...:::::::.:::::::::. . :....::.:: .
CCDS73 QHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKI
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVEKLREQLCTSENSMTGRILDLKTGT-VKKEGQQSSMRM
:: :.. .:..:.. .:: :. :..::: .:... :..: ::: :: . . :.
CCDS73 LNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIAKVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD CMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLPLNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAW
: :.::::.:::.: : : . . : : . . : . .. ..: :::.:.:
CCDS73 CSGARRSFFCRMKC-NRP-------SVKVEDKDFPSTCSKKKADRKSFCTIHSTGYLKSW
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PPAGMTIPEEDADVGQGSKY-CLVAIGRLQ--VTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGI
::. : . :.. ..: . ::::::::. :. .:: .. :. :..::: ::
CCDS73 PPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCLVAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSM--EYVSRHAIDGK
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KSD ITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKDILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTK
..::: : ....: ::.::: . :. : .: .:: : .::.. . .. . :.:. :
CCDS73 FVFVDQRATAILAYLPQELLGTSCYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIK
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440
pF1KSD NREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIEYIICTNTNV------------KQLQQQQAELEVHQRD
. .. .:. :.:.::.. :.:::. ::: : :: . .. .
CCDS73 DGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVEYIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPS
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KSD GLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAGKSVEK--ADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSS
: .. .. ::..:.:.. .. .. . :. :. .: . : .: .. :.
CCDS73 GEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGAGKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCG--SSPLNITST
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550
pF1KSD ----ASAAGTQQIYSQGSP-FPSGHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQL
::. : ..: . :.: .:: :: .:... . :: .::: :.:
CCDS73 PPPDASSPGGKKILNGGTPDIPS--SG-LLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMI
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KSD NQSQVAWTGSRPPFPGQQIPSQSSKTQSSPFGIGTSHTYPADPSSYSPLSSPATSSPSGN
CCDS73 DNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLLEADAGLGGPVDFSDLPWPL
590 600 610 620
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD TLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDG-------EGPSKFSRENHSEIER
: :: : .: : .:: ::.::.
CCDS44 MINIESMDTDKDDPHGRLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEK
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAVSHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFL
:.:.::...: ::...::::.:..:: ::::.:::::.:::..::. : :.. :::.::
CCDS44 RRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAVQHMKTLRGATNPYTEANYKPTFL
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPVLNQPQSEWFGSTLYEQVHPDDVE
...:::::::.:::::::::. . :....::.:: .:: :.. .:..:.. .:: :.
CCDS44 SDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKILNYSQNDLIGQSLFDYLHPKDIA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KLREQLCTSENSMTGRILDLKTGT-VKKEGQQSSMRMCMGSRRSFICRMRCGNAPLDHLP
:..::: .:... :..: ::: :: . . :.: :.::::.:::.: : :
CCDS44 KVKEQLSSSDTAPRERLIDAKTGLPVKTDITPGPSRLCSGARRSFFCRMKC-NRP-----
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LNRITTMRKRFRNGLGPVKEGEAQYAVVHCTGYIKAWPPAGMTIPEEDADVGQGSKY-CL
. . : : . . :. . .. ..: :::.:.:::. : . :.. ..: . ::
CCDS44 --SVKVEDKDFPSTCSK-KKDRKSFCTIHSTGYLKSWPPTKMGLDEDNEPDNEGCNLSCL
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD VAIGRLQ--VTSSPVCMDMNGMSVPTEFLSRHNSDGIITFVDPRCISVIGYQPQDLLGKD
::::::. :. .:: .. :. :..::: :: ..::: : ....: ::.::: .
CCDS44 VAIGRLHSHVVPQPVNGEIRVKSM--EYVSRHAIDGKFVFVDQRATAILAYLPQELLGTS
280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ILEFCHPEDQSHLRESFQQVVKLKGQVLSVMYRFRTKNREWMLIRTSSFTFQNPYSDEIE
:. : .: .:: : .::.. . .. . :.:. :. .. .:. :.:.::.. :.:
CCDS44 CYEYFHQDDIGHLAECHRQVLQTREKITTNCYKFKIKDGSFITLRSRWFSFMNPWTKEVE
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460
pF1KSD YIICTNTNV------------KQLQQQQAELEVHQRDGLSSYDLSQVPVPNLPAGVHEAG
::. ::: : :: . .. .: .. .. ::..:.:.. ..
CCDS44 YIVSTNTVVLANVLEGGDPTFPQLTASPHSMDSMLPSGEGGPKRTHPTVPGIPGGTRAGA
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510
pF1KSD KSVEK--ADAIFSQERDPRFAEMFAGISASEKKMMSS----ASAAGTQQIYSQGSP-FPS
.. . :. :. .: . : .: .. :. ::. : ..: . :.: .::
CCDS44 GKIGRMIAEEIMEIHRIRGSSPSSCG--SSPLNITSTPPPDASSPGGKKILNGGTPDIPS
450 460 470 480 490 500
520 530 540 550 560 570
pF1KSD GHSGKAFSSSVVHVPGVNDIQSSSSTGQNMSQISRQLNQSQVAWTGSRPPFPGQQIPSQS
:: .:... . :: .::: :.:
CCDS44 --SG-LLSGQAQENPGYPYSDSSSILGENPHIGIDMIDNDQGSSSPSNDEAAMAVIMSLL
510 520 530 540 550 560
>>CCDS31430.1 ARNTL gene_id:406|Hs108|chr11 (625 aa)
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Smith-Waterman score: 1114; 35.1% identity (64.3% similar) in 575 aa overlap (6-548:18-575)
10 20 30 40
pF1KSD MASDIPGSVTLPVAPMAATGQVRMAGAMPARGGKRRSGMDFDDEDGEG
:: . : . ....: : . . . .:: : .: .:
CCDS31 MADQRMDISSTISDFMSPGPTDLLSSSLGTSG-VDCNRKRKGSSTDYQESMDTDKDDPHG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KSD PSKFS---------RENHSEIERRKRNKMTQYITELSDMVPTCSALARKPDKLTILRMAV
... :: ::.::.:.:.::...: ::...::::.:..:: ::::.:::::
CCDS31 RLEYTEHQGRIKNAREAHSQIEKRRRDKMNSFIDELASLVPTCNAMSRKLDKLTVLRMAV
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KSD SHMKSMRGTGNKSTDGAYKPSFLTEQELKHLILEAADGFLFVVAAETGRVIYVSDSVTPV
.:::..::. : :.. :::.::...:::::::.:::::::::. . :....::.:: .
CCDS31 QHMKTLRGATNPYTEANYKPTFLSDDELKHLILRAADGFLFVVGCDRGKILFVSESVFKI
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160 170 180 190 200 210
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