Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0313
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0313, 1499 aa
1>>>pF1KSDA0313 1499 - 1499 aa - 1499 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0300+/-0.00116; mu= 2.2973+/- 0.070
mean_var=230.2315+/-45.522, 0's: 0 Z-trim(109.9): 78 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.084526
statistics sampled from 11124 (11198) to 11124 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.344), width: 16
Scan time: 5.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499) 9857 1216.3 0
CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509) 5188 646.9 1.3e-184
CCDS54899.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1504) 5084 634.2 8.8e-181
CCDS54900.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1609) 5084 634.2 9.4e-181
CCDS34225.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1601) 4629 578.7 4.7e-164
CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391) 4625 578.2 5.9e-164
CCDS54897.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 ( 827) 3242 409.5 2.2e-113
CCDS74604.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 791) 594 86.5 3.4e-16
CCDS63061.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 840) 594 86.6 3.6e-16
CCDS63060.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 858) 594 86.6 3.7e-16
CCDS42776.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 ( 867) 594 86.6 3.7e-16
CCDS42775.1 RAPGEF4 gene_id:11069|Hs108|chr2 (1011) 594 86.6 4.2e-16
CCDS55093.1 RAPGEF5 gene_id:9771|Hs108|chr7 ( 730) 576 84.3 1.5e-15
CCDS11363.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 456) 545 80.4 1.4e-14
CCDS77023.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 505) 545 80.5 1.5e-14
CCDS77022.1 RAPGEFL1 gene_id:51195|Hs108|chr17 ( 511) 545 80.5 1.5e-14
CCDS31784.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 ( 881) 532 79.0 7.1e-14
CCDS41775.1 RAPGEF3 gene_id:10411|Hs108|chr12 ( 923) 532 79.0 7.4e-14
>>CCDS43277.1 RAPGEF2 gene_id:9693|Hs108|chr4 (1499 aa)
initn: 9857 init1: 9857 opt: 9857 Z-score: 6504.7 bits: 1216.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9857; 100.0% identity (100.0% similar) in 1499 aa overlap (1-1499:1-1499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCSITSDSGSSSLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASDPLMSRDIVRDCLEKDPIDRTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDEEDIERASDPLMSRDIVRDCLEKDPIDRTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGEELDSWSVILNGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGEELDSWSVILNGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQDYCRILNQVEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQQDYCRILNQVEK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD NMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTFIEDFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHSVVDPTFIEDFLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDPAMTRFLEEFENN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKGFGIFVDSVDSGS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLFVFKELLTRLSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLFVFKELLTRLSEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTVGGRNKLKKILDKT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNPDLLQSHHRILDFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATPDQYSLCEVSVTPE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLRESQISLLQLSTVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD VATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQETFWVASEILRETN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQETFWVASEILRETN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD QLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWEKLPNKYEKLFQDL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD QDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSKVDGLVNFEKLRMI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVAQTGGHKKRVRRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVAQTGGHKKRVRRSS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD FLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPKNPGDKKPVKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTLPKNPGDKKPVKSE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD TSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLPPFGINS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRKKVPVKDLPPFGINS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD PQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPRKGYTLAPSGTVDNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPRKGYTLAPSGTVDNF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGMGRMERRTMIEPDQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGMGRMERRTMIEPDQY
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD SLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGRGSWTSCSSGSHDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGRGSWTSCSSGSHDNI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD QTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHSTKYNRQNQSRESLEQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTIQHQRSWETLPFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHSTKYNRQNQSRESLEQA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD QSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVTTEETKPVPMPAHIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVTTEETKPVPMPAHIAV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD ASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKPPDYNVALQRSRMVAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKPPDYNVALQRSRMVAR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD SSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRLAPYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRLAPYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS54901.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1509 aa)
initn: 5191 init1: 2409 opt: 5188 Z-score: 3427.6 bits: 646.9 E(32554): 1.3e-184
Smith-Waterman score: 5730; 66.5% identity (84.2% similar) in 1384 aa overlap (20-1393:165-1505)
10 20 30 40
pF1KSD MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
:::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
140 150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
:.::::::::::::::::::.::.::. ::: ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
.::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
.::::.:::::::::::: ::..:: ::::::. ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
::::::::::.::: ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
500 510 520 530 540 550
410 420 430 440 450 460
pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
:::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
560 570 580 590 600 610
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
:::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.:: . :.::. . :: .:: :::::
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
620 630 640 650 660 670
530 540 550 560 570 580
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
:::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .: . .:. ::::::.:
CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
680 690 700 710 720 730
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPD------LPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREF
:::: .:::: .:. .::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::
CCDS54 DLLQPTTSMLDFS-NPSAVGFYYIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEF
740 750 760 770 780
650 660 670 680 690 700
pF1KSD AVTATPDQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDED
..:.. : ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 GLTGASDTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDED
790 800 810 820 830 840
710 720 730 740 750 760
pF1KSD AQELLRESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFE
::::..:::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::
CCDS54 AQELVKESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFE
850 860 870 880 890 900
770 780 790 800 810 820
pF1KSD EVINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVAR
...:::::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS54 DIVNQETFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVAR
910 920 930 940 950 960
830 840 850 860 870 880
pF1KSD LRTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLH
:: ::::::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::
CCDS54 LRGTWEKLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLH
970 980 990 1000 1010 1020
890 900 910 920 930 940
pF1KSD EGNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNA
:::::::::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: :::.:::::::::::::.
CCDS54 EGNDSKVDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD TVLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCE
..::: : :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: :
CCDS54 NMLDV-QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD PATNTLPKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVS
:: .:: :: ..:. .:: : ::: :...: : :: :...: ::::::.
CCDS54 PAYGTLTKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD LYPSRKKVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTS
:.: ::: .:: : .. . :: :.:. .:: : ::..::::: ::: ::::.:
CCDS54 LHPIRKKGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPAS
1210 1220 1230 1240 1250
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD PQSSPRKGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIV
::.::.::::: ::. ::.:::.::::::::::::: : ::. ..:.::: . .....
CCDS54 PQGSPHKGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVP
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD ETNLGMGRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLD
:.. .. . :. . : :. . : . . .: .: :: :.::.::.. ..
CCDS54 ESTGALEKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIE
1320 1330 1340 1350 1360
1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD AADSGRGSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETL-PFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIM
::::::::::::::.::::.:.. . .::. : . :::.: :: : :.
CCDS54 AADSGRGSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEP
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KSD FSDHSTKYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESS
.: .. .: . ::: : ::.::.. .. : . ::.:.: . : ::::
CCDS54 YSCSKSCSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKQRVLE--STPAESS
1430 1440 1450 1460 1470
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD SLTSVTTEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHS
. : . :.. .:.::: :::: ..
CCDS54 E-----GLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV
1480 1490 1500
1420 1430 1440 1450 1460 1470
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CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
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.::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
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::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
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230 240 250 260 270 280
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
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.::::.:::::::::::: ::..:: ::::::. ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
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CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
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:::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
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:::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.:: . :.::. . :: .:: :::::
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
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CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
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pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
:::: .:::: :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:..
CCDS54 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
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: ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::..
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pF1KSD ESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQE
:::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::...:::
CCDS54 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
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::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::
CCDS54 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
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pF1KSD KLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSK
:::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::::::::
CCDS54 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
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CCDS54 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDV-
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pF1KSD QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
: :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: ::: .::
CCDS54 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD PKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRK
:: ..:. .:: : ::: :...: : :: :...: ::::::.:.: ::
CCDS54 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
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1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD KVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPR
: .:: : .. . :: :.:. .:: : ::..::::: ::: ::::.:::.::.
CCDS54 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
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1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
::::: ::. ::.:::.::::::::::::: : ::. ..:.::: . ..... :.. ..
CCDS54 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
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pF1KSD GRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGR
. :. . : :. . : . . .: .: :: :.::.::.. ..::::::
CCDS54 EKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIEAADSGR
1320 1330 1340 1350 1360 1370
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pF1KSD GSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETL-PFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHST
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CCDS54 GSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEPYSCSKS
1380 1390 1400 1410 1420
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD KYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVT
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CCDS54 CSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKQRVLE--STPAESSE-----
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pF1KSD TEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIARKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEGHSHPARKP
. : . :.. .:.::: :::: ..
CCDS54 GLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIENEQVSAV
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pF1KSD MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
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CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
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CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
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pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
.::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
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170 180 190 200 210 220
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
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CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
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CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
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pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
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CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
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CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
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CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
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pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
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CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
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CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
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:::: .:::: :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:..
CCDS54 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
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CCDS54 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
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CCDS54 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
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CCDS54 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
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CCDS54 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQRKKRWRSLGSLSQGSTNSNMLDV-
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pF1KSD QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
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CCDS54 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
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CCDS54 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
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CCDS54 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
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pF1KSD KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
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CCDS54 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
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pF1KSD GRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGR
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CCDS54 EKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIEAADSGR
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CCDS54 GSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEPYSCSKS
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CCDS54 CSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKQRVLE--STPAESSE-----
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pF1KSD TEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIA------RKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEG-H
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CCDS54 GLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCVTSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPH
1480 1490 1500 1510 1520 1530
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pF1KSD SHPARKPPDYNVALQRSRMVARSSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRL
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CCDS54 TH--LKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPASLSSNLVACVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKL
1540 1550 1560 1570 1580 1590
1480 1490
pF1KSD APYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
. . ..: ::.::::::
CCDS54 GDVTDA--DSEADENEQVSAV
1600
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10 20 30 40
pF1KSD MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
:::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS34 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
140 150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
:.::::::::::::::::::.::.::. ::: ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS34 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
.::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS34 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS34 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS34 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
.::::.:::::::::::: ::..:: ::::::. ::::::::.::::::::::::::::
CCDS34 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
::::::::::.::: ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS34 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
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410 420 430 440 450 460
pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
:::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS34 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
560 570 580 590 600 610
470 480 490 500 510 520
pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
:::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.:: . :.::. . :: .:: :::::
CCDS34 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
620 630 640 650 660 670
530 540 550 560 570 580
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
:::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .: . .:. ::::::.:
CCDS34 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
680 690 700 710 720 730
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
:::: .:::: :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:..
CCDS34 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
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pF1KSD DQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLR
: ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::..
CCDS34 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVK
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pF1KSD ESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQE
:::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::...:::
CCDS34 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
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pF1KSD TFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWE
::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::
CCDS34 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
920 930 940 950 960 970
830 840 850 860 870 880
pF1KSD KLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSK
:::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::::::::
CCDS34 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
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pF1KSD VDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVA
:::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: : ::::::::...:::
CCDS34 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQGSTNSNMLDV-
1040 1050 1060 1070 1080
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
: :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: ::: .::
CCDS34 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD PKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRK
:: ..:. .:: : ::: :...: : :: :...: ::::::.:.: ::
CCDS34 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
1150 1160 1170 1180 1190
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD KVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPR
: .:: : .. . :: :.:. .:: : ::..::::: ::: ::::.:::.::.
CCDS34 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
1200 1210 1220 1230 1240
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
::::: ::. ::.:::.::::::::::::: : ::. ..:.::: . ..... :.. ..
CCDS34 KGYTLIPSAKSDNLSDSSHSEISSRSSIVSNCSVDSMSAALQDERCSSQALAVPESTGAL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD GRMERRTMIEPDQYSLGSYAPMSEGRGLYATATVISSPSTEELSQDQGDRASLDAADSGR
. :. . : :. . : . . .: .: :: :.::.::.. ..::::::
CCDS34 EKTEHASGI-GDHSQHGPGWTLLKP-SLIKCLAVSSSVSNEEISQEH---IIIEAADSGR
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD GSWTSCSSGSHDNIQTIQHQRSWETL-PFGHTHFDYSGDPAGLWASSSHMDQIMFSDHST
::::::::.::::.:.. . .::. : . :::.: :: : :. .: ..
CCDS34 GSWTSCSSSSHDNFQSLPNPKSWDFLNSYRHTHLD---DPI---AEVEPTDSEPYSCSKS
1370 1380 1390 1400 1410
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD KYNRQNQSRESLEQAQSRASWASSTGYWGEDSEGDTGTIKRRGGKDVSIEAESSSLTSVT
.: . ::: : ::.::.. .. : . ::.:.: . : ::::
CCDS34 CSRTCGQCKGSLE----RKSWTSSSSL-SDTYEPNYGTVKQRVLE--STPAESSE-----
1420 1430 1440 1450 1460
1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD TEETKPVPMPAHIAVASSTTKGLIA------RKEGRYREPPPTPPGYIGIPITDFPEG-H
. : . :.. .:.::: ::::. .:. ::::::::::::.:: ..:. :: :
CCDS34 GLDPKDATDPVYKTVTSSTEKGLIVYCVTSPKKDDRYREPPPTPPGYLGISLADLKEGPH
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD SHPARKPPDYNVALQRSRMVARSSDTAGPSSVQQPHGHPTSSRPVNKPQWHKPNESDPRL
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CCDS34 TH--LKPPDYSVAVQRSKMMHNSLSRLPPASLSSNLVACVPSKIVTQPQRHNLQPFHPKL
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1480 1490
pF1KSD APYQSQGFSTEEDEDEQVSAV
. . ..: ::.::::::
CCDS34 GDVTDA--DSEADENEQVSAV
1590 1600
>>CCDS54898.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (1391 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
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CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
140 150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
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CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
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pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
.::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
.::::.:::::::::::: ::..:: ::::::. ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
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350 360 370 380 390 400
pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
::::::::::.::: ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
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pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
:::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
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pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
:::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.:: . :.::. . :: .:: :::::
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
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530 540 550 560 570 580
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
:::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .: . .:. ::::::.:
CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
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pF1KSD DLLQSHHRILDFSATPDLPDQVLRVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVTATP
:::: .:::: :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:..
CCDS54 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
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pF1KSD DQYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQLSKLADRIQLSGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELLR
: ::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::..
CCDS54 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGRYYLKNNMETETLCSDEDAQELVK
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pF1KSD ESQISLLQLSTVEVATQLSMRNFELFRNIEPTEYIDDLFKLRSKTSCANLKRFEEVINQE
:::.:.:::::.:::::::::.:.::::::::::::::::: :::. ..:::::...:::
CCDS54 ESQLSMLQLSTIEVATQLSMRDFDLFRNIEPTEYIDDLFKLNSKTGNTHLKRFEDIVNQE
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pF1KSD TFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARLRTTWE
::::::::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::
CCDS54 TFWVASEILTEANQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLASVARLRGTWE
920 930 940 950 960 970
830 840 850 860 870 880
pF1KSD KLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHEGNDSK
:::.:::: .:::::.::::::::::::.:.::..::::::::::.:::.::::::::::
CCDS54 KLPSKYEKHLQDLQDIFDPSRNMAKYRNILSSQSMQPPIIPLFPVVKKDMTFLHEGNDSK
980 990 1000 1010 1020 1030
890 900 910 920 930 940
pF1KSD VDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNATVLDVA
:::::::::::::.::::.: ::.:.:::::.::: : ::::::::...:::
CCDS54 VDGLVNFEKLRMISKEIRQVVRMTSANMDPAMMFRQR--------SLSQGSTNSNMLDV-
1040 1050 1060 1070 1080
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pF1KSD QTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEPATNTL
: :.::::.::::.:::::::::::::::::::::.:..: :::..: .::: ::: .::
CCDS54 QGGAHKKRARRSSLLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSSLDVETDEEKFQMMSLQWEPAYGTL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD PKNPGDKKPVKS-ETSPVAPRAGSQQKAQSLPQPQQQPPPAHKINQGLQVPAVSLYPSRK
:: ..:. .:: : ::: :...: : :: :...: ::::::.:.: ::
CCDS54 TKNLSEKRSAKSSEMSPVPMRSAGQTTKAHLHQP-------HRVSQVLQVPAVNLHPIRK
1150 1160 1170 1180 1190
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD KVPVKDLPPFGINSPQALKKILSLSEEGSLERHKKQAEDTISNASSQLSSPPTSPQSSPR
: .:: : .. . :: :.:. .:: : ::..::::: ::: ::::.:::.::.
CCDS54 KGQTKD-PALNTSLPQ---KVLGTTEEIS---GKKHTEDTISVASSLHSSPPASPQGSPH
1200 1210 1220 1230 1240
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD KGYTLAPSGTVDNFSDSGHSEISSRSSIVSNSSFDSVPVSLHDERRQRHSVSIVETNLGM
:
CCDS54 KVGSIISDHSSKISGQSCPGIGGAYLQKKILQITRSTAKRTDSTEKATEENRDRTSCENT
1250 1260 1270 1280 1290 1300
>>CCDS54897.1 RAPGEF6 gene_id:51735|Hs108|chr5 (827 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MKPLAIPANHGVMGQQEKHSLPADFTKLHLTDSLHPQVTHVSSSHSGCS
:::::.::.:::.. ::::::::::.::::
CCDS54 ARQSRRRFRKINYKGERQTITDDVEVNSYLSLPADLTKMHLTENPHPQVTHVSSSQSGCS
140 150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KSD ITSDSGSSSLSDIYQATESEAGDMDLSGLPETAVDSEDDDDE-EDIERASDPLMSRDIVR
:.::::::::::::::::::.::.::. ::: ::::::..: :.:.: .:::..::.::
CCDS54 IASDSGSSSLSDIYQATESEVGDVDLTRLPEGPVDSEDDEEEDEEIDR-TDPLQGRDLVR
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KSD DCLEKDPIDRTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCAVMVFAVVERAGTIVLNDGE
.::::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::.::.: :::.::.:.:.::.
CCDS54 ECLEKEPADKTDDDIEQLLEFMHQLPAFANMTMSVRRELCSVMIFEVVEQAGAIILEDGQ
260 270 280 290 300 310
170 180 190 200 210 220
pF1KSD ELDSWSVILNGSVEVTYPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCIAQ
::::: :::::.::...::::.: : ::::::..::.::.::.:..::::::::::::::
CCDS54 ELDSWYVILNGTVEISHPDGKVENLFMGNSFGITPTLDKQYMHGIVRTKVDDCQFVCIAQ
320 330 340 350 360 370
230 240 250 260 270 280
pF1KSD QDYCRILNQVEKNMQKVEEEGEIVMVKEHRELDRTGTRKGHIVIKGTSERLTMHLVEEHS
::: ::::.:::: .:::::::::::.:::::::.::::::::::.: ::: :::.::::
CCDS54 QDYWRILNHVEKNTHKVEEEGEIVMVHEHRELDRSGTRKGHIVIKATPERLIMHLIEEHS
380 390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KSD VVDPTFIEDFLLTYRTFLSSPMEVGKKLLEWFNDPSLRDKVTRVVLLWVNNHFNDFEGDP
.::::.:::::::::::: ::..:: ::::::. ::::::::.::::::::::::::::
CCDS54 IVDPTYIEDFLLTYRTFLESPLDVGIKLLEWFKIDSLRDKVTRIVLLWVNNHFNDFEGDP
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390 400
pF1KSD AMTRFLEEFENNLEREKMGGHLRLLNIACAAKAKRRLMTLTKPSREAPLPFILLGGSEKG
::::::::::.::: ::.::::::::::::::: : ..: : :::.:: : : ::::::
CCDS54 AMTRFLEEFEKNLEDTKMNGHLRLLNIACAAKAKWRQVVLQKASRESPLQFSLNGGSEKG
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410 420 430 440 450 460
pF1KSD FGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKTNLF
:::::..:. ::::...::::::::.:::::::::: . ::.:::::::::..:::::.:
CCDS54 FGIFVEGVEPGSKAADSGLKRGDQIMEVNGQNFENITFMKAVEILRNNTHLALTVKTNIF
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pF1KSD VFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKANTV-
:::::: : .:....:.::.:::.. ::..:.:: . :.::. . :: .:: :::::
CCDS54 VFKELLFR-TEQEKSGVPHIPKIAE-KKSNRHSIQHVPGDIEQT-SQEKGSKKVKANTVS
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530 540 550 560 570 580
pF1KSD GGRNKLKKILDKTRISILPQKPYNDIGIGQSQDDSIVGLRQTKHIPTALPVSGTLSSSNP
:::::..:::::::.:::: : ..: :..::::::::: :. .: . .:. ::::::.:
CCDS54 GGRNKIRKILDKTRFSILPPKLFSDGGLSQSQDDSIVGTRHCRHSLAIMPIPGTLSSSSP
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:::: .:::: :.::::.::::.:::: ::.:::::::::::..:..::..:..
CCDS54 DLLQPTTSMLDFSNPSDIPDQVIRVFKVDQQSCYIIISKDTTAKEVVFHAVHEFGLTGAS
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: ::::::::::::::::::::::.:::::::::.::
CCDS54 DTYSLCEVSVTPEGVIKQRRLPDQFSKLADRIQLNGR
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: :.: : .:: ::.: . : . .. :..... .:.::: .:..: ..::...:.:
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: . ..: :: : : . :. .: : : . .. :...
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::.. .. . .. :.::: : . :::.. :. : . .
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:: . : ......
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..:. . .:.. : : : . ..:.: :... ..... .::
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:.:: .:. :. : . :..::: :.:. .
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.. . . ..: : :. . :...: .. . ..:: . . ..: . ::
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. .. ..: :. ..: :... ..::: .. : : : .. : . ::: : .
CCDS74 GPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLFLR
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pF1KSD VINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARL
.:. :::..:: .. ::....:.::::: ::.: ::.::.:::. ::. . :.::
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pF1KSD RTTWEKLPNKYEKLFQDLQDLFDPSRNMAKYRNVLNSQNLQPPIIPLFPVIKKDLTFLHE
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:: . .:.::::::.::::. : : . : ..:
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CCDS74 RTLSQMSHRLEPRRP
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110 120 130 140 150 160
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230 240 250 260 270 280
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290 300 310 320 330 340
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:: . : ......
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..:. . .:.. : : : . ..:.: :... ..... .::
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:.:: .:. :. : . :..::: :.:. .
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.. . . ..: : :. . :...: .. . ..:: . . ..: . ::
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. .. ..: :. ..: :... ..::: .. : : : .. : . ::: : .
CCDS63 GPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLFLR
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.:. :::..:: .. ::....:.::::: ::.: ::.::.:::. ::. . :.::
CCDS63 RFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVSRL
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::::::.:..:.. ....:.::::: :: :. .:.::.::..:.. ::.:: ::
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:: . .:.::::::.::::. : : . : ..:
CCDS63 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ
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pF1KSD VLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEP
CCDS63 RTLSQMSHRLEPRRP
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pF1KSD EELDSWSVILNGSVEVT-YPDGKAEILCMGNSFGVSPTMDKEYMKGVMRTKVDDCQFVCI
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CCDS63 DKEDFNRILRDVEANTVRLKEHDQDVLVLEKVP---AGNRASN---QGNSQPQQKYTV--
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290 300 310 320 330 340
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CCDS63 MSGTPEKILEHFLETIRL---------EATLNEATDSVLNDFIMMHCVFMPNTQLC----
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CCDS63 -PALVAHYHAQPSQGTEQEKMDY---------ALNNKRRVIRLV-------LQWAAM---
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pF1KSD EKGFGIFVDSVDSGSKATEAGLKRGDQILEVNGQNFENIQLSKAMEILRNNTHLSITVKT
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CCDS63 -----------------------YGDLLQE------DDVSMA------------------
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pF1KSD NLFVFKELLTRLSEEKRNGAPHLPKIGDIKKASRYSIPDLAVDVEQVIGLEKVNKKSKAN
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CCDS63 ---FLEEFYVSVSDDARMIA-----------ALKEQLPEL----EKIV--KQISEDAKA-
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pF1KSD NPDLLQSHHRILDFSATPDLPDQVL-RVFKADQQSRYIMISKDTTAKEVVIQAIREFAVT
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CCDS63 ---------------------DEVLFKVYCMDHTYTTIRVPVATSVKEV-ISAVAD--KL
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CCDS63 GSGEGLIIVKMSSGGEKVVLK---PNDVSVFTT-LTINGRLFACPREQFDSL-TPLPEQE
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CCDS63 GPTVGTVGTFELMSSKDLAYQMTIYDWELFNCVHELELIYHTFGRHNFKKTTANLDLFLR
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pF1KSD VINQETFWVASEILRETNQLKRMKIIKHFIKIALHCRECKNFNSMFAIISGLNLAPVARL
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CCDS63 RFNEIQFWVVTEICLCSQLSKRVQLLKKFIKIAAHCKEYKNLNSFFAIVMGLSNVAVSRL
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CCDS63 ALTWEKLPSKFKKFYAEFESLMDPSRNHRAYR--LTVAKLEPPLIPFMPLLIKDMTFTHE
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pF1KSD GNDSKVDGLVNFEKLRMIAKEIRHVGRMASVNMDPALMFRTRKKKWRSLGSLSQGSTNAT
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CCDS63 GNKTFIDNLVNFEKMRMIANTARTVRYYRSQPFNPDAAQANKNHQDVRSYVRQLNVIDNQ
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pF1KSD VLDVAQTGGHKKRVRRSSFLNAKKLYEDAQMARKVKQYLSNLELEMDEESLQTLSLQCEP
CCDS63 RTLSQMSHRLEPRRP
850
1499 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:12:40 2016 done: Thu Nov 3 01:12:41 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]