Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0315
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0315, 1838 aa
1>>>pF1KSDA0315 1838 - 1838 aa - 1838 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7581+/-0.000999; mu= 22.8345+/- 0.060
mean_var=90.9358+/-17.912, 0's: 0 Z-trim(106.2): 53 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.134495
statistics sampled from 8812 (8865) to 8812 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16
Scan time: 6.210
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 12379 2413.5 0
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 1981 396.0 7.3e-109
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 1671 335.9 1e-90
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 1282 260.3 4.9e-68
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 1235 251.2 2.7e-65
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 1128 230.5 4.8e-59
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568) 1126 230.0 5.4e-59
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894) 1114 227.7 3.2e-58
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909) 1005 206.6 7.4e-52
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932) 1005 206.6 7.5e-52
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 378 84.8 2.4e-15
CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 ( 492) 365 82.0 6.2e-15
CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 ( 522) 365 82.0 6.5e-15
>>CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838 aa)
initn: 12379 init1: 12379 opt: 12379 Z-score: 12972.1 bits: 2413.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12379; 100.0% identity (100.0% similar) in 1838 aa overlap (1-1838:1-1838)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAK
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CCDS43 MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGIC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKGNGPHDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKGNGPHDNG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQDKHPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQDKHPA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RNRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RNRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNPEDGIVRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNPEDGIVRA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD HMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD FAFRTPKLSHDANETLPLHLYVKSYGKNIDSKLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FAFRTPKLSHDANETLPLHLYVKSYGKNIDSKLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD WCGGQSRCVYEALCNTTSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRISV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WCGGQSRCVYEALCNTTSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRISV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVTKFGAQLQCVTGPQATRGQML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVTKFGAQLQCVTGPQATRGQML
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LLRTEAGAFEYVPDPTFENFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAERCTMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLRTEAGAFEYVPDPTFENFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAERCTMK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD TLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ILPLVIVPMVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEM
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CCDS43 ILPLVIVPMVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEM
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD EDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD NLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQY
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD VVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAV
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD QKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYR
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD GQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLILSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLILSK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD VGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKERTKAITEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKERTKAITEI
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD YLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWK
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD TNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD YAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQK
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830
pF1KSD YYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
1810 1820 1830
>>CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925 aa)
initn: 2133 init1: 725 opt: 1981 Z-score: 2067.9 bits: 396.0 E(32554): 7.3e-109
Smith-Waterman score: 3328; 34.7% identity (62.6% similar) in 1931 aa overlap (28-1835:53-1918)
10 20 30 40 50
pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQL
: : :..:.: :.:.:::.::: ::::
CCDS33 FQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTNNFALDGAAGTVYLAAVNRLYQL
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KSD D-AKLQLEQQVATGPALDNKKC-TPPIEASQC-HEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGS
. :.:.:: ..:.::. :. : .: . ..: : ..::: :..: ::: . .: :::
CCDS33 SGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRLTDNYNKILQLDPGQGLVVVCGS
90 100 110 120 130 140
120 130 140 150 160
pF1KSD LFKGICALRALSNIS---LRLFYEDGSGEKSFV-------ASNDEGVATVGLV--SSTGP
...:.: :: .::: .:. .: : :.: ...::::: ..:
CCDS33 IYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSMLNVAANHPNASTVGLVLPPAAGA
150 160 170 180 190 200
170 180 190 200
pF1KSD GGDRVL----FVGKGNG--PHD---------NGIIVSTRLLD-RTDSREAF----EAYTD
::.:.: ..: :.. :.. : .. : :: : : . : . :
CCDS33 GGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIAIRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDD
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240
pF1KSD HAT-YKAGYLSTNTQQFVAAF---EDGP-----YVFFVFNQQ----DKHPARNRTLLARM
. : : . ::.:: : : :.....:.. ::. .. :.::::.
CCDS33 NILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLALNSEARAGDKE-SQARSLLARI
270 280 290 300 310 320
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CRE-----DPNYY--SYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSR
: : . ::... ::: .:. : . :.. . . :.::: : .
CCDS33 CLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAG----GAGRGDLYSRLVSVFPARERLFAVFERPQG
330 340 350 360 370
310 320 330 340 350
pF1KSD SSGGPGA--GLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHA-----
: .. .: .:: : . :.: ..: :.::. .. : :. . . .: : :
CCDS33 SPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACF--VEPAPDVV-AVLDSVVQGTGPACERKL
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400 410
pF1KSD --PGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDG
. ... ::. :: .::. . :..: :.. :: :.:.::. ::.:..:::: .:
CCDS33 NIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGL--TSVAVASVNNYTAVFLGTVNG
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLS-GDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSY
:.::. :. . . : .. :.. . .. .: : :: ::. .. :. : : .
CCDS33 RLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARVKVAACNVH
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWL-WSRSKS-CVAVTSAQPQNMS
:: .: . : :::::..: ::: . .: . . : :.. : : :.: . :....
CCDS33 STCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRCPAMT-VLPSEID
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580
pF1KSD RRAQ--GEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEA-----VICNS-P-SSIP
: . : . . ::.:: :. : .:.. ::: : : . :: : ...:
CCDS33 VRQEYPGMILQISGSLPSLSGM-EMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLLPRDQFP
620 630 640 650 660 670
590 600 610 620 630 640
pF1KSD VTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDL
::.:::: :... .: .. ... .. .::: .. .. . : ::.: .: : :
CCDS33 PFPPNQDHV--TVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWPCFWCS
680 690 700 710 720
650 660 670 680 690
pF1KSD RYHECR------EASPNPEDGIVRAHMEDSCPQFLGPSPLV-IPMNHETDVNFQGKNLDT
. : : :::::: . ..::. : :::. .: . .. :
CCDS33 QQHSCVSNQSRCEASPNPTS-------PQDCPRTLL-SPLAPVPTGGSQNILVPLANTAF
730 740 750 760 770 780
700 710 720 730 740 750
pF1KSD VKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTPKLSHDANETLPLHLYVKSY-GKNIDSK-
.:..:. . : ...: : ..:: . .. . ....:: : .:. .. .::
CCDS33 FQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPE
790 800 810 820 830 840
760 770 780 790 800
pF1KSD -LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANP-DYRCAWCGGQSRCVYEA-LCNTTSECPPPVITRIQ
. : .:::..: ::: : . . . : : : : .. : .. :: : : :.
CCDS33 PMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDG---CRLRGPLQPMAGTCPAPEIHAIE
850 860 870 880 890
810 820 830 840 850 860
pF1KSD PETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQR-ISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETP
: .::: :: .:: : ::: . .:. . . ..: : :.::.:: .:::: : :
CCDS33 PLSGPLDGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGP
900 910 920 930 940 950
870 880 890 900 910 920
pF1KSD FTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDV
..: : :.. .: :.: .:.. : :.:: .::.:::: .::::. : .::. .:
CCDS33 LSGVVTVNA-SKEGKSRD--RFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQV
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890 900 910 920 930
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CCDS33 -------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQ
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CCDS33 ADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCS
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CCDS33 TSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLHLSQ
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CCDS33 FNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS
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CCDS14 MPSVCLLLLLFLAVGGALGNRPFRA-FVVTDTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLA
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CCDS14 PNLTELRAHVTGPVEDNARCYPPPSMRVCAHRLAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQ
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CCDS14 SEYFPTLSSRKLISDEDSADMFSLVYQDEFVSSQIKIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSAS
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CCDS14 FVYFLTLQLDTQQTLLDTAGEKFFTSKIVRMCAGDSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQS
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CCDS14 AHLAKPGLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQGQKNRASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQ
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CCDS14 SCYRG--EGTLALPWLLNKELPCINTPMQINGNF-CGLV-LNQPLGGLHVIEGLPLLADS
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CCDS14 TDGMASVAAYTYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVDGFQDAHLYETVPVVDGSPILRDLLFSP
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CCDS14 DHRHIYLLSEKQVSQLPVETCEQYQSCAACLGSGDPHCGWCVLRHRCCREGACLGAS-AP
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CCDS14 HGFAEELSKCVQVR-VRPNNVSVTSPG-VQLTVTLHNVPDLSA--GVSCAFEAAAENEAV
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. :: ..: ::: . . : : : .::: .. .. ... .. ::.: .:
CCDS14 LLPSGE-LLCPSPSLQELRALTRGHGATRTVRLQLLSKETGVRFAGADFVFYNCSVLQS-
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CCDS14 -----CMSCVGSPYPCHWCKYRHTCTSRPHECSFQEG--RVHSPEGCPEILPSGDLLIPV
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. .....::: .... . : . . :.. .:.. .. . :....:
CCDS14 GVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYECVVRVQGRQQRVPAVRFNSSSVQCQNASYSYEGDEH
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CCDS14 GDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFRALLYKCWAQRPSCGLCLKADPRFNCGWCISEHRCQL
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pF1KSD EALCNTT-----------SECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRIS
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CCDS14 RTHCPAPKTNWMHLSQKGTRCSHPRITQIHPLVGPKEGGTRVTIVGENLGLLSREVG-LR
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CCDS14 VAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEESLVPSPPPGPVELCV-GDCSADFRTQSEQVYSFVT
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pF1KSD PKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVTKFGAQ-LQCVTGPQ
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CCDS14 PTFDQVSPSRGPASGGTRLTISGSSLDAGSR--VTVTVRDSECQFVRRDAKAIVCIS-PL
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pF1KSD ATRG--QMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLI
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CCDS14 STLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYTQDPTVTRLEPTWSIINGSTAITVSGTHLLTV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KSD QRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSPAVP----EEPEAY
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CCDS14 Q--------EP-RVRAKYRGIETTNTCQVIN-DTAMLCKAPGIFLGRPQPRAQGEHPDEF
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:: .. .. :. .: . : ....:.. . : ::.:.:.: .... :...:
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CCDS31 HRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNM
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CCDS90 ASGSCLDQLD--YSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLL--PYREG
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1610 1620 1630 1640 1650 1660
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1670 1680 1690 1700 1710 1720
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1730 1740 1750 1760 1770 1780
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1790 1800 1810 1820 1830
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CCDS14 HLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVN
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pF1KSD HAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEV
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CCDS14 RPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDN
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pF1KSD VDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSD
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CCDS14 VDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASY
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pF1KSD QDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQI
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CCDS14 QEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQV
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pF1KSD AAALENKVTDL
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CCDS14 AALVENKVTDL
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CCDS55 EAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETR
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CCDS55 PESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQ-PVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKV
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CCDS55 HCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQFYPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLDNT
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CCDS55 HALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPPGAVELLCPAPSID
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CCDS55 AALVENKVTDL
1930
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]