Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0315
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0315, 1838 aa
  1>>>pF1KSDA0315 1838 - 1838 aa - 1838 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7581+/-0.000999; mu= 22.8345+/- 0.060
 mean_var=90.9358+/-17.912, 0's: 0 Z-trim(106.2): 53  B-trim: 2 in 1/49
 Lambda= 0.134495
 statistics sampled from 8812 (8865) to 8812 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.272), width:  16
 Scan time:  6.210

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22       (1838) 12379 2413.5       0
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3        (1925) 1981 396.0 7.3e-109
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3          (2135) 1671 335.9   1e-90
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3         (1896) 1282 260.3 4.9e-68
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX        (1871) 1235 251.2 2.7e-65
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1         (1894) 1128 230.5 4.8e-59
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12        (1568) 1126 230.0 5.4e-59
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7        (1894) 1114 227.7 3.2e-58
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX         (1909) 1005 206.6 7.4e-52
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX         (1932) 1005 206.6 7.5e-52
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7            (1390)  378 84.8 2.4e-15
CCDS43647.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7        ( 492)  365 82.0 6.2e-15
CCDS5826.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7         ( 522)  365 82.0 6.5e-15


>>CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22            (1838 aa)
 initn: 12379 init1: 12379 opt: 12379  Z-score: 12972.1  bits: 2413.5 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 12379; 100.0% identity (100.0% similar) in 1838 aa overlap (1-1838:1-1838)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD LQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGIC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGIC
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD ALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKGNGPHDNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKGNGPHDNG
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD IIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQDKHPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQDKHPA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD RNRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RNRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD SRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD SFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD TPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD VSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRR
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD GNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNPEDGIVRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNPEDGIVRA
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD HMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD FAFRTPKLSHDANETLPLHLYVKSYGKNIDSKLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FAFRTPKLSHDANETLPLHLYVKSYGKNIDSKLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD WCGGQSRCVYEALCNTTSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRISV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WCGGQSRCVYEALCNTTSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRISV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD AGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSV
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD EPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVTKFGAQLQCVTGPQATRGQML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVTKFGAQLQCVTGPQATRGQML
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD LEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIA
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD EPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRA
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD LLRTEAGAFEYVPDPTFENFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAERCTMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LLRTEAGAFEYVPDPTFENFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAERCTMK
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD TLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSL
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD ILPLVIVPMVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILPLVIVPMVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEM
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD EDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFS
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD NLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQY
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD VVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAV
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD QKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYR
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KSD GQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLILSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLILSK
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KSD VGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKERTKAITEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKERTKAITEI
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KSD YLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWK
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KSD TNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLL
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KSD YAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQK
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
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CCDS33 FC--TKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLE
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       :: .. :.::            :::.    .:..... :    :.  :::  :: .:...
CCDS33 YKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGI
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CCDS33 SLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDL
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CCDS33 IDASA-AKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGS
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pF1KSD VDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIID
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CCDS33 IDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNVSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILE
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pF1KSD QVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGST-AQILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGAT
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CCDS33 AFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGAS
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pF1KSD LILSKVGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKERTK
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CCDS33 LAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKY---------FHLVLPTDELAEPKK---SHRQSHRKK
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CCDS33 VLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPD
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       :.::::::::::::::::::::.:.::.   . .:: ::::::.:.:::. .. .:..::
CCDS33 TLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDS
      1760      1770      1780      1790      1800      1810       

         1740      1750      1760      1770      1780      1790    
pF1KSD PSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQL
       :.:::::::::  :.:.:. ::: :..:. .:.:.::.:::: :: . . .:: ::. ..
CCDS33 PTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEI
      1820      1830      1840      1850      1860      1870       

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pF1KSD YQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL    
       :.:...:  .:. ::: .:.:.. ::  ...:..: .:...       
CCDS33 YKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA
      1880      1890      1900      1910      1920     

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       .:.     .  ..::::.: : :..::  :..: .:.  :..::::.:. :..::.::::
CCDS27 DCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLG
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pF1KSD TSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQEC
        :.:.. .::: : . .  :..  .. .. :.:::...: .  ::.:::. ....::  :
CCDS27 DSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASC
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     470       480       490       500       510         520       
pF1KSD LSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSK--SCVAVTSAQPQ
        ..  :..:   .::::::::. :::.:..:: :..   .:::: .   .:. :.. .: 
CCDS27 AQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPA
            490       500       510       520       530       540  

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pF1KSD NMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSP--SSIPVTPP
       :.::.   :: :.:  :: :   .   : :::    :: . : .:.: ::  :  :: : 
CCDS27 NISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQS-PALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPR
            550       560       570        580       590       600 

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pF1KSD GQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHE
       : :.:.:...  :: : . ... .  ::::  .  :. .  : .:::.:: :.: .  : 
CCDS27 GADYVSVSVE--LRFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHL
             610         620       630       640       650         

                                                650                
pF1KSD CRE---------------------------------------ASPNPE------------
       : .                                       :.: :.            
CCDS27 CTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTA
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pF1KSD ----------------------DGIVRA--------HMEDSCPQ----------------
                             .: . .        : : : :.                
CCDS27 TASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFR
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                                                       : :         
CCDS27 PSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPAL
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pF1KSD ------------------------------------------PSPLVIPMNHETDVNFQG
                                                 :.::..: . . . .  :
CCDS27 DWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPG
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pF1KSD --------------KNLDTVKGSSL---HV-------GSDLLKFME-P----VTMQESGT
                       ...:.::.:   ::       : .:  :.. :     .:.  : 
CCDS27 LWELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGL
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pF1KSD FAF-------RTP------------KLSHDA-NETLPLHLYVKSYGK-NIDSK--LHVTL
        .        . :            .::..: .  : . :...  :.  .::   :::.:
CCDS27 EVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVL
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pF1KSD YNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQS-RCVYEALCN----TTSECPPPVITRIQPET
       :.:: :..::: :..: :.: :.:: :.  ::: .  :.    ....:: :.:  ..: :
CCDS27 YDCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLT
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pF1KSD GPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQ-RISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTG
       ::. :: :.:: ::::: .. :.   ..:::  :. . ..: ::. .::.  :.    .:
CCDS27 GPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAG
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pF1KSD GVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVT
       .. :.: :. ::.  . .:..:.::  :. : .::.:::: ::..:..: ::  ::.::.
CCDS27 ATAVEVPGR-GRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVV
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pF1KSD LNGVPCKVT--KFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFE
       ..  ::..   . . ::.: :.:. : . . . : .:..        : :  .: . .  
CCDS27 VGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAG
     1200      1210      1220      1230      1240      1250        

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pF1KSD PLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQ--RFAMVVIAEPLQSWQP--------PREAESLQPM-
       : .:: :::: : : ::.....:  :. ..:... ::  :         :. : :: :  
CCDS27 PTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSC
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pF1KSD TVVGTDYVFH-NDTKVVFL-SPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRT-EAGAFEYVPDP
       .    .   : :.....   .::.:  ::   . : . .:.    . : .   : :  ::
CCDS27 SSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTPFSYEADP
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pF1KSD TF-----ENFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCE
       :.     :. :   ... .... ..: ::. ::. .:. :..:   :..::::.  ::::
CCDS27 TLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCE
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       ::  :: :...  :..  .:::: :..:. .. ::.:.:: .   . :..  . : .   
CCDS27 PPVEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAAQVGLGVGTS
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       .....: .    : :::.:: :.:.:.. :::.:: :::::::::::::: :: : :.:.
CCDS27 LLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDL
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pF1KSD HEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKS
         .::: ::::.:..:.:: :   : ..  .   : .:: :::.:::.: :.::::::: 
CCDS27 LGSGIPFLDYKVYAERIFF-P---GHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQLSNLLNSKL
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       :: .::::::.:: :::: ..: ::::::::::::::.:::..::. .:. ::: :::::
CCDS27 FLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYV-AKNPK
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       :::::.:::::..:.:::::::: ...::.::::: ::..:::::.:::::.:  :::::
CCDS27 LMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYT
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pF1KSD LNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQ-DEGV---DAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQP
       :::. :: .:::: :::.....    :.   ...:::::.::::::.:::..::.:.: :
CCDS27 LNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVP
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pF1KSD CSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQ-ILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLILSKVG
        .  : : .. .::: : ... :::: :.::. .: :.:.:::.::.: ::::. :    
CCDS27 LTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCL
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pF1KSD VSQQPEDSQQDLPGERHALLEEEN----RVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVK--EKERTKA
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CCDS27 TKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKA
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pF1KSD ITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTI
       : :::::::::.:::::.:::..:: .:. .. :: :::::::.:::::..:.:.:.:::
CCDS27 IPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTI
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pF1KSD HIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPS
       :::::::::::::.::.:::.:.:::.. . .:: : ::::::::::: ..:::.:::: 
CCDS27 HIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPI
          1980      1990      2000      2010      2020      2030   

       1740      1750      1760      1770      1780      1790      
pF1KSD NKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQ
       ::::::..:  ::.::: ::  ::: : .:::.::. :::.:  .. .:.. ::::.::.
CCDS27 NKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYK
          2040      2050      2060      2070      2080      2090   

       1800      1810      1820      1830        
pF1KSD YTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
       : .::::.::.::::: .::::::..::::::::.:::::::
CCDS27 YINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL
          2100      2110      2120      2130     

>--
 initn: 437 init1: 260 opt: 572  Z-score: 589.7  bits: 122.6 E(32554): 1.6e-26
Smith-Waterman score: 572; 40.4% identity (66.0% similar) in 265 aa overlap (10-266:8-268)

               10        20           30        40        50       
pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLD---FFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQL
                ::  : ::  :  . :    :  .   :.::: : .::..::::.: :.::
CCDS27   MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQL
                 10        20        30        40        50        

        60        70        80        90       100       110       
pF1KSD DAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFK
       .  ::::  :.:::.::.. : ::.  ..: .:. :.: :::::..:    :: :::. .
CCDS27 SPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPG--ALVVCGSVHQ
       60        70        80        90       100         110      

       120       130       140       150       160       170       
pF1KSD GICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKGNGPH
       :.:  : :...   :.  .  :. ..::.:: .:.:::::.. : .:. .::::.:   .
CCDS27 GVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQ-GLAGEPLLFVGRGYTSR
        120       130       140       150        160       170     

         180        190       200       210       220       230    
pF1KSD D--NGII-VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQ
          .::  ..:: :   : . :: .: . :   .: ::  ...::.::  :  ..:.: .
CCDS27 GVGGGIPPITTRALWPPDPQAAF-SYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLR
         180       190        200       210       220       230    

           240        250       260       270       280       290  
pF1KSD QD-KHPARN-RTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRV
       .: .  .:  :. ..:.: .: .::::.:. : :                          
CCDS27 RDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYGLIQAAAVATSREVAHGEVLF
          240       250       260       270       280       290    

            300       310       320       330       340       350  
pF1KSD LYAVFSRDSRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCG
                                                                   
CCDS27 AAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVA
          300       310       320       330       340       350    

>>CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3              (1896 aa)
 initn: 1966 init1: 708 opt: 1282  Z-score: 1335.0  bits: 260.3 E(32554): 4.9e-68
Smith-Waterman score: 3312; 33.8% identity (62.5% similar) in 1937 aa overlap (16-1831:33-1892)

                              10        20        30        40     
pF1KSD                MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGV
                                     ::.. .:    :  :.  :.::.: : .: 
CCDS33 LPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFRTFSASDWGLTHLVVHEQTGE
             10        20        30        40        50        60  

          50        60        70        80         90       100    
pF1KSD VYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQC-HEAEMTDNVNQLLLLDP
       ::.:::: .:.:...: : .  .:::. ::.:: ::  ...: :    :::::.::::: 
CCDS33 VYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPSVQSCPHGLGSTDNVNKLLLLDY
             70        80        90       100       110       120  

          110       120       130       140       150       160    
pF1KSD PRKRLVECGSLFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPG-
         .::. :::  .::: .  :... ..:  :    .. ...: .:. . .:.. .  :: 
CCDS33 AANRLLACGSASQGICQFLRLDDL-FKL-GEPHHRKEHYLSSVQEAGSMAGVLIAGPPGQ
            130       140         150       160       170       180

           170         180       190        200       210          
pF1KSD GDRVLFVGKG-NGPHDN-GIIVSTRLLDRTDSREAFE-AYTDHATYKAGYLSTNTQQ---
       :.  ::::   .:  .    . : ::.   .. . :  .: :. . .   . ..: .   
CCDS33 GQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVYQDEFVSSQLKIPSDTLSKFP
              190       200       210       220       230       240

            220       230          240            250       260    
pF1KSD -----FVAAFEDGPYVFFVFNQQDKH---PARN-----RTLLARMCREDPNYYSYLEMDL
            .: .:..  .:...  : : .   :         . ..:.: .::..:::.:. .
CCDS33 AFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKIVRLCVDDPKFYSYVEFPI
              250       260       270       280       290       300

                  270       280       290       300         310    
pF1KSD QCRDP--------DIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGPG--AGLCLF
        :..         : . .  :  :: ...   .  ::..::.. ...   :   ..::::
CCDS33 GCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFAQGQKNRVKPPKESALCLF
              310       320       330       340       350       360

          320       330       340       350       360       370    
pF1KSD PLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLG
        :  .. :..   ..:: :  :..  .   .. .. : .     . .: ::.. .  :::
CCDS33 TLRAIKEKIKERIQSCYRG--EGKLSLPWLLNKELGCINSPLQIDDDF-CGQD-FNQPLG
              370         380       390       400        410       

          380       390       400       410       420           430
pF1KSD SRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYL---TPDGTSS-EYD
       .   ..:: ..     .::::..    ..::.: :: .::: :. .   .: :  .  :.
CCDS33 GTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRKILVDLSNPGGRPALAYE
        420       430       440       450       460       470      

              440       450       460       470       480       490
pF1KSD SILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCV
       :.... .. . :::::: .   :::::. .: :.::. :..: .:  :  :.::.:::::
CCDS33 SVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQYTSCELCLGSRDPHCGWCV
        480       490       500       510       520       530      

              500       510       520       530        540         
pF1KSD VEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMS-RRAQGEVQLTVSPLPALSE
       ... :.:.  : ::.: ...  .   .:: .: .::.:.:   .:  . : .  .: :: 
CCDS33 LHSICSRRDACERADEPQRFA-ADLLQCVQLT-VQPRNVSVTMSQVPLVLQAWNVPDLSA
        540       550        560        570       580       590    

     550       560       570       580          590       600      
pF1KSD EDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSSIPVTPP--GQ-DHVAVTIQLLLRRGNIFLT
          . : : .     . .:   . : :::.  :.:   :: :. .: . :  .. .  ..
CCDS33 --GVNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVVKLYLKSKETGKKFA
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        610       620       630       640       650       660      
pF1KSD SYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNPEDGIVRAHMEDSC
       : .. ::.:    :....  :.:::.. . :.:    : : .   .      :... ..:
CCDS33 SVDFVFYNC----SVHQS--CLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEGRVNVSEDC
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        670       680       690       700       710       720      
pF1KSD PQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTP
       ::.:  . . .:..    ... ..::   . .: . : . : :  : .  .  .. : . 
CCDS33 PQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLP--QPQSGQRGYECL-FHIPGSPARVTALRFNSS
        710       720       730         740        750       760   

               730         740        750         760       770    
pF1KSD KL-------SHDANET--LPLHLYVKSYGK-NIDSKLHVT--LYNCSFGRSDCSLCRAAN
       .:       :...:..  ::..: :   :.  ::.  ..   ::.:   : .:.::  :.
CCDS33 SLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGLCLKAD
           770       780       790       800       810       820   

          780       790                   800       810       820  
pF1KSD PDYRCAWCGGQSRCVYEALCNT------------TSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRIT
       : ..:.:: .. ::  .  : .            .:.:  : : ...:::::  :: :.:
CCDS33 PRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPASWMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQGGTRLT
           830       840       850       860       870       880   

            830       840         850       860       870       880
pF1KSD ILGSNLGVQAGDIQRISV-AGRN-CSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGK
       : : :::..  :. :..: .:.  ::    .:  . .::: :  : .  .  . :.:  .
CCDS33 ITGENLGLRFEDV-RLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALVEVCVR
           890        900       910       920       930       940  

                    890       900       910       920       930    
pF1KSD LGRSP------PNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNG
          ::      :. .:::  :    : :..:: .::: . :.:.::..::  :: :...:
CCDS33 -DCSPHYRALSPK-RFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGS--DVAVSVGG
             950        960       970       980       990          

          940        950       960       970       980       990   
pF1KSD VPCKVT-KFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRS
        ::. . . . ...:.: :  . :.  . .. . . . :: . ..: :.:..  ..:  :
CCDS33 RPCSFSWRNSREIRCLTPPGQSPGSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPEWS
     1000      1010      1020      1030      1040      1050        

          1000      1010      1020       1030      1040      1050  
pF1KSD FASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEP-LQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTK
       . :::  ..::: ... ..        :: ...     : :.       :   . .::: 
CCDS33 INSGGTLLTVTGTNLATVR--------EPRIRAKYGGIEREN-------GC--LVYNDTT
     1060      1070              1080      1090               1100 

           1060             1070      1080      1090      1100     
pF1KSD VVFLSPAV-------PEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENF--TGG
       .:  .:.:       ::  :  .   .. ::. :.::  .. .: : :::..: .  :: 
CCDS33 MVCRAPSVANPVRSPPELGERPDELGFV-MDNVRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSPTGL
            1110      1120       1130      1140      1150      1160

          1110         1120      1130      1140      1150      1160
pF1KSD VKKQVNKLIHARGTNL---NKAMTLQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKR
       .. . .. .  .: ::     . .  .  ...:.  ::. :..::.: :: :..      
CCDS33 LELKPSSPLILKGRNLLPPAPGNSRLNYTVLIGSTPCTL-TVSETQLLCEAPNLTG----
             1170      1180      1190       1200      1210         

             1170      1180      1190      1200             1210   
pF1KSD RQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVI-------VPMVVVI
        :.. :        :. :. :.  : ..     ::  :.:  : ..       . ..:..
CCDS33 -QHKVT--------VRAGGFEFSPGTLQV---YSDSLLTL--PAIVGIGGGGGLLLLVIV
         1220              1230         1240        1250      1260 

          1220      1230      1240      1250      1260      1270   
pF1KSD AVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIP
       :: .  : :::..:.:  .... :...::  :  .::. :..:. .... :::.  ::::
CCDS33 AVLI-AYKRKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTNDLDGAGIP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KSD VLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFI
        :::.::. ::.: :   : .:  .  ....    .  ::..:  :..::..: ::..::
CCDS33 FLDYRTYAMRVLF-P---GIEDHPVLKEMEV----QANVEKSLTLFGQLLTKKHFLLTFI
             1330          1340          1350      1360      1370  

          1340      1350      1360      1370      1380       1390  
pF1KSD HTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PKLMLRR
       .::: :: :: : .   :::. .::.:..:: : ... :. .:.:. . .:: :::.:::
CCDS33 RTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLESKNHPKLLLRR
           1380      1390      1400      1410      1420      1430  

           1400      1410      1420      1430      1440      1450  
pF1KSD SETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTG
       .:.:.:.::.::... ::..::. :::::. :. :::.:.::::.::.  .:.:.:..  
CCDS33 TESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDK
           1440      1450      1460      1470      1480      1490  

           1460       1470      1480      1490      1500      1510 
pF1KSD LLGDDVEYAPLTVSVIV-QDEGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPD
       :. ....:  ::.. .  ..:..  .::: :.:::..:.:::..: .:.: : :  :.  
CCDS33 LIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAKEKLLDAAYKGVPYSQRPKAA
           1500      1510      1520      1530      1540      1550  

            1520       1530      1540      1550           1560     
pF1KSD SVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL-----SKVGVSQ
       .. :::: :  :.: :.: :.:.. .. :::.::: ::.: ::... :     :  ..:.
CCDS33 DMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVPKQTSAYNISN
           1560      1570      1580      1590      1600      1610  

                      1570      1580          1590      1600       
pF1KSD QPE--------------DSQQDLPGERHAL----LEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGS
       .                 :. :    :  .    ::  ...::::.  :..:. .. :::
CCDS33 SSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDHLDQREGDRGS
           1620      1630      1640      1650      1660      1670  

      1610      1620      1630      1640         1650      1660    
pF1KSD VKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGH---AVPPAVKYFFDFLDEQ
              : ..::::::::..:::::.:::..:..... .:   :.: :.::.:::::::
CCDS33 -------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQ
                  1680      1690      1700      1710      1720     

         1670      1680      1690      1700      1710      1720    
pF1KSD AEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACT
       :.::.:.: :. : ::.: ::::::::..:::.:.::.: . ..:: :::.::::::.:.
CCDS33 ADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCS
        1730      1740      1750      1760      1770      1780     

         1730      1740      1750      1760      1770      1780    
pF1KSD RTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDS
        .::::..:::::::::::.: .::. :: ::  : .:  .:::::...::: :: : ..
CCDS33 TSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLHLSQ
        1790      1800      1810      1820      1830      1840     

         1790      1800      1810      1820      1830        
pF1KSD LNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
       .:.. :::..:.:  :: :::. :::.:  :....:  .:.:.. ..       
CCDS33 FNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS   
        1850      1860      1870      1880      1890         

>>CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX             (1871 aa)
 initn: 2013 init1: 712 opt: 1235  Z-score: 1285.8  bits: 251.2 E(32554): 2.7e-65
Smith-Waterman score: 3236; 33.0% identity (62.3% similar) in 1928 aa overlap (8-1827:6-1863)

               10        20          30        40        50        
pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASL--RPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLD
              : :: .:..:..:  :: .  :  ..  :.:::: ...: :..:::: ...: 
CCDS14   MPSVCLLLLLFLAVGGALGNRPFRA-FVVTDTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLA
                 10        20         30        40        50       

       60        70        80         90       100       110       
pF1KSD AKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQC-HEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFK
        .:   .  .:::. :: .: ::     : :.   .::.:.:::.:   .::: :::...
CCDS14 PNLTELRAHVTGPVEDNARCYPPPSMRVCAHRLAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQ
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pF1KSD GICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKG-NGP
       ::: .  :... ..:  :    .. .... .:  . .:..   : : .. :::: . .: 
CCDS14 GICQFLRLDDL-FKL-GEPHHRKEHYLSGAQEPDSMAGVIVEQGQGPSK-LFVGTAVDGK
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pF1KSD HDNGIIVSTR-LLDRTDSREAFE-AYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFE--------DGP
        .    .:.: :..  :: . :  .: :. . .   . ..: ..  ::.        .. 
CCDS14 SEYFPTLSSRKLISDEDSADMFSLVYQDEFVSSQIKIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSAS
          180       190       200       210       220       230    

        230       240               250       260       270        
pF1KSD YVFFVFNQQDKHPARNRTL--------LARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDI-------
       .:.:.  : : . .   :         ..:::  : ..:::.:. . :    .       
CCDS14 FVYFLTLQLDTQQTLLDTAGEKFFTSKIVRMCAGDSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQS
          240       250       260       270       280       290    

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pF1KSD -HAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGPGAG--LCLFPLDKVHAKMEANRN
        : :  :  :: ....:..  ::...::. ... ..:     :::: :....:...   .
CCDS14 AHLAKPGLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQGQKNRASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQ
          300       310       320       330       340       350    

      330       340       350       360       370       380        
pF1KSD ACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRG
       .:: :  :.   .   .. .. : .     . .: ::   :  :::.   ..:  .:  .
CCDS14 SCYRG--EGTLALPWLLNKELPCINTPMQINGNF-CGLV-LNQPLGGLHVIEGLPLLADS
            360       370       380        390        400       410

      390       400       410       420       430       440        
pF1KSD GLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSG
         ....:.. .  .:.:.:.:: .: . :: .     .  :... :  .. . :::..: 
CCDS14 TDGMASVAAYTYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVDGFQDAHLYETVPVVDGSPILRDLLFSP
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      450       460       470       480       490       500        
pF1KSD DLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEAS
       :   .: ... .: .:::. : .: .:. :  : ::.:::::.. :: :.. :  :  : 
CCDS14 DHRHIYLLSEKQVSQLPVETCEQYQSCAACLGSGDPHCGWCVLRHRCCREGACLGAS-AP
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pF1KSD HWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVS--PLPALSEEDELLCLFGESPPHPAR
       : .  . ..:: :  ..:.:.:  . : :::::.   .: ::    . : :  .  . : 
CCDS14 HGFAEELSKCVQVR-VRPNNVSVTSPG-VQLTVTLHNVPDLSA--GVSCAFEAAAENEAV
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pF1KSD V--EGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVA---VTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSL
       .   :: ..: :::   .    . : :   : .::: .. .. ... .. ::.:   .: 
CCDS14 LLPSGE-LLCPSPSLQELRALTRGHGATRTVRLQLLSKETGVRFAGADFVFYNCSVLQS-
         590        600       610       620       630       640    

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pF1KSD EENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHEC--REASPNPEDGIVRAHMEDSCPQFLGPSPLVIPM
            :.:::.. . :.:    : :  :    . ..:  :.:  ..::..:  . :.::.
CCDS14 -----CMSCVGSPYPCHWCKYRHTCTSRPHECSFQEG--RVHSPEGCPEILPSGDLLIPV
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     680       690       700           710       720       730     
pF1KSD NHETDVNFQGKNLDTVKGSSLH----VGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTPKLSHDANE-
       .    .....:::   .... .    :  .  .   :..  .:..   .. . :....: 
CCDS14 GVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYECVVRVQGRQQRVPAVRFNSSSVQCQNASYSYEGDEH
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pF1KSD -TLPLHLYVKSYGK-NIDS--KLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQSRCVY
           : . :   :   ::.  .... ::.:   : .:.::  :.: . :.:: .. ::  
CCDS14 GDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFRALLYKCWAQRPSCGLCLKADPRFNCGWCISEHRCQL
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pF1KSD EALCNTT-----------SECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRIS
       .. : .            ..:  : ::.:.: .::  :: :.::.: :::. . ..  . 
CCDS14 RTHCPAPKTNWMHLSQKGTRCSHPRITQIHPLVGPKEGGTRVTIVGENLGLLSREVG-LR
        820       830       840       850       860       870      

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pF1KSD VAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAA--ETPFTGGVEVDVFGKLG---RSPPNVQFTFQQ
       :::  :.  : .:  . :::: .: .   .:  : ::. : :  .   :.  .  ..:  
CCDS14 VAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEESLVPSPPPGPVELCV-GDCSADFRTQSEQVYSFVT
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pF1KSD PKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVTKFGAQ-LQCVTGPQ
       :   .: :..:: .::: ::: :. ::.::.  : ::.    :. ..  :. . :.. : 
CCDS14 PTFDQVSPSRGPASGGTRLTISGSSLDAGSR--VTVTVRDSECQFVRRDAKAIVCIS-PL
          940       950       960         970       980        990 

             960       970       980       990      1000      1010 
pF1KSD ATRG--QMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLI
       .: :  :  . ..   . . .::...:: ..:..  .::  :. .:. .:.:.:  .  .
CCDS14 STLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYTQDPTVTRLEPTWSIINGSTAITVSGTHLLTV
            1000      1010      1020      1030      1040      1050 

            1020      1030      1040      1050      1060           
pF1KSD QRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSPAVP----EEPEAY
       :        :: .     :  :. .   :.. : ..   .  .::.   :    :.:. .
CCDS14 Q--------EP-RVRAKYRGIETTNTCQVIN-DTAMLCKAPGIFLGRPQPRAQGEHPDEF
                     1060      1070       1080      1090      1100 

      1070      1080      1090      1100        1110      1120     
pF1KSD NLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENF--TGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAM--
       .. .: ...  :.: :.   .: : :::.:: .  .: .  . .. .  .: ::  :   
CCDS14 GF-LLDHVQTARSLNRS---SFTYYPDPSFEPLGPSGVLDVKPGSHVVLKGKNLIPAAAG
             1110         1120      1130      1140      1150       

           1130      1140      1150      1160      1170      1180  
pF1KSD -TLQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREW
        .  .  ...:.. :.. :...:.: :.    .:    ::        : ...  : . :
CCDS14 SSRLNYTVLIGGQPCSL-TVSDTQLLCD----SPSQTGRQ--------PVMVLVGGLEFW
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pF1KSD VLGRVEYDT-RVSDVPLSLILPLVIVPMVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGL
        :: .. .. :.  .:  . :      ....:.. .  : ::.:.:.:  .... :...:
CCDS14 -LGTLHISAERALTLPAMMGLAAGGGLLLLAITAVLVAYKRKTQDADRTLKRLQLQMDNL
          1210      1220      1230      1240      1250      1260   

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pF1KSD EESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGK
       :  :  .::. :..:. .... :: . :. :: :::.::. ::.: :. ..     .  .
CCDS14 ESRVALECKEAFAELQTDINELTNHMDEVQIPFLDYRTYAVRVLF-PGIEAHP---VLKE
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pF1KSD LDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGK
       :: :    : ::.::  :..::.:..:...:::::: :  :: : .   :::  :::...
CCDS14 LDTP----PNVEKALRLFGQLLHSRAFVLTFIHTLEAQSSFSMRDRGTVASLTMVALQSR
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pF1KSD LEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEP
       :.: : ... :. .:.:. . .:: :::.:::.:.:.:.::.::... :...::. ::::
CCDS14 LDYATGLLKQLLADLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLHKFLKECAGEP
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pF1KSD LYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIV-QDEGVDAIPV
       :. :. :::.:.::::.::.  .:.:.:..  :. ....:  ::.  .  ..::   .::
CCDS14 LFLLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCVCPENEGSAQVPV
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pF1KSD KVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQREGR
       ::::::.:.:.:.:..: ::.: : :  :. ... :::: :  ..: :.: :.:.. :  
CCDS14 KVLNCDSITQAKDKLLDTVYKGIPYSQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECD
        1500      1510      1520      1530      1540      1550     

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pF1KSD WKRVNTLMHYNVRDGATLILSKVGVS--------------QQPED-----SQQDLPGERH
       :::.:.: ::.: ::. . :    ::              .. :.     :. :    : 
CCDS14 WKRLNSLAHYQVTDGSLVALVPKQVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLRTASSPDSLRSRA
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pF1KSD ALL----EEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQF
        ..    :  ...::::.  :..:. .. :::       : ..::::::::..:::::.:
CCDS14 PMITPDQETGTKLWHLVKNHDHADHREGDRGS-------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKF
        1620      1630      1640             1650      1660        

        1640         1650      1660      1670      1680      1690  
pF1KSD VDNFFQSVLAPGH---AVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNI
       ::..:..:.. .:   :.: :.::.::::::::....:.: :. : ::.: ::::::::.
CCDS14 VDDLFETVFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNV
     1670      1680      1690      1700      1710      1720        

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pF1KSD LKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMV
       .:::.:.::.: . ..:: :::.::::::.:. .::.:..:::::::::::.: .::. :
CCDS14 IKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWV
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           1760      1770      1780      1790      1800      1810  
pF1KSD EDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEED
       : ::. : .:...:::::...:.: :: :......: ::..:: :. :: .::..::..:
CCDS14 ERYYRDIAKMASISDQDMDAYLVEQSRLHASDFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRD
     1790      1800      1810      1820      1830      1840        

           1820      1830        
pF1KSD PAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
        . .: .:  .:.::           
CCDS14 ASCRKHKLRQKLEQIISLVSSDS   
     1850      1860      1870    

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CCDS31 WPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQGTGAVYVGA
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pF1KSD VNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEA-EMTDNVNQLLLLDPPRKRL
       .: .:.: ..: ..    :::  :::.: ::. .. : :.  .:.:::.::..:  ..::
CCDS31 INRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLLIIDYSENRL
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pF1KSD VECGSLFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVAS-NDEGVATVGLVSSTGPGGDRVL
       . ::::..:.: :  :..  : .. : .  .. ...: :  :.    .: : :  :   :
CCDS31 LACGSLYQGVCKLLRLDD--LFILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTMYGVIVRSEGEDGK--L
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pF1KSD FVGKG-NGPHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLS--TNTQQFVAAFE--
       :.: . .: .:    .:.: : :     :.  :  :. . .. ..  ..:  .:. :.  
CCDS31 FIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDTLALVSHFDIF
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pF1KSD ------DGPYVFFVFNQQDKHP--ARNR-------TLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRD
             .: .:.:.  : .     : :        . ..:.:..::...::. . . :  
CCDS31 YIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSLPFGCTR
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pF1KSD PDIH----AAAF----GTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGP--GAGLCLFPLDK
         ..     ::.    :  :: .    ..  ::.:.::. ...   :   ..:: ::.  
CCDS31 AGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALCAFPIRA
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pF1KSD VHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDG
       .. ...   ..:: :  :.   .   .  :.::  .::    .  :: . .  :::.   
CCDS31 INLQIKERLQSCYQG--EGNLELNWLLGKDVQCT-KAPVPIDDNFCGLD-INQPLGGSTP
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pF1KSD LRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLT-PDGTSSEYDSILV-EI
       ..: ..   .   .:.:.  . :...:.:.::..:.. :.    :   . .:. . : . 
CCDS31 VEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVLKD
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pF1KSD NKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCT
       .. . ::...: :   ::.:.. .: :.::. : .: :: .: .: ::.::::.... :.
CCDS31 GSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALHNMCS
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pF1KSD RKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEV-QLTVSPLPALSEEDELLC
       :. .: .: : ...  : :. ::.. ...:...:   .... .:.::  : ::    . :
CCDS31 RRDKCQQAWEPNRFAASISQ-CVSL-AVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDAPDLSAG--IAC
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        ::.     ..: :  ::: ::.  ..:: :  ::  .. .::  .. :.::... .. :
CCDS31 AFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKIFVST-EFKF
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pF1KSD YDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNP---EDGIVRAHMEDSCPQF
       :.: .: .:     :.:::.. . :.:    . : . .:.    ..:  : .. ..:::.
CCDS31 YNC-SAHQL-----CLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTH-DPTTCSFQEG--RINISEDCPQL
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pF1KSD LGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSS------LHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAF
       .    ..::...   ......::   ....      :.. . . .   :.   .:..   
CCDS31 VPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRV--PALRFNSSSVQC
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pF1KSD RTPKLSHDANETLPLHL-YVKSYGKN--IDSK--LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYR
       .. . ..:. .   : . ..  .. :  ::.   :.: ::.:.  : .:.::  :.  ..
CCDS31 QNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFE
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pF1KSD CAWCGGQSRCVYEALCNTTS-----------ECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSN
       :.::.:. ::. .  :.. :           .:  : ::.:   .::  :: :.:: : :
CCDS31 CGWCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVN
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pF1KSD LGVQAGDI-QRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPP
       ::.. ..: ....:::  :.  : .: .. .::: .  : .  :.:    :   .:.  :
CCDS31 LGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSG---PVRLCIGECKP
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pF1KSD NV------QFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVT
       .       :.:: .:. ::..: .::..::: .:: : .: .::.  : : :..  :.  
CCDS31 EFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSS--VAVYLGNQTCEFY
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pF1KSD -KFGAQLQCVTGPQATR-GQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGG
        .  ... ::. :...  : . . ::   . : . .. : : ..: .. .::  :.::: 
CCDS31 GRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHV-DSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGH
      1000      1010      1020       1030      1040      1050      

     1000      1010      1020      1030      1040      1050        
pF1KSD RSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSP
         ...::        : . :: ::    .   . ::..   ::       : : .. :.:
CCDS31 TPLTITG--------FNLDVIQEPRIRVKFNGK-ESVNVCKVV-------NTTTLTCLAP
       1060              1070      1080       1090             1100

     1060                1070      1080      1090      1100        
pF1KSD AV-----P-----EEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENF--TGGVKK
       ..     :     :.:. ....    ... ..::  .   : : :.:::: .  :: . .
CCDS31 SLTTDYRPGLDTVERPDEFGFV----FNNVQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQ
             1110      1120          1130      1140      1150      

       1110      1120         1130      1140      1150      1160   
pF1KSD QVNKLIHARGTNLNKAMT---LQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQK
       . .. :  .: ::    .     .  ...:   :.. :..::.: ::::..    :    
CCDS31 KPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLIGETPCAV-TVSETQLLCEPPNLTGQHK----
       1160      1170      1180      1190       1200      1210     

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pF1KSD RDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVIVP----MVVVIAVSVYC
                 .:. :.  .  : :   . .::  :.:   . :.     ..... . .  
CCDS31 ---------VMVHVGGMVFSPGSV---SVISDSLLTLPAIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIA
                     1220         1230      1240      1250         

    1220      1230      1240      1250      1260      1270         
pF1KSD YWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKT
       : :::.. .   .... :...::  :  .::. :..:. .... :.:. ..::: :::.:
CCDS31 YKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPYLDYRT
    1260      1270      1280      1290      1300      1310         

    1280      1290      1300      1310      1320      1330         
pF1KSD YTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQ
       :. ::.: :   : .:  .  .:..    .  ::.::  :..:.:.: ::..::.::: :
CCDS31 YAMRVLF-P---GIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQ
    1320          1330      1340      1350      1360      1370     

    1340      1350      1360      1370      1380       1390        
pF1KSD REFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PKLMLRRSETVVE
       : :: : .   :::. ..:.:.::: ::... :. .:... .  :: :::.:::.:.:.:
CCDS31 RSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAE
        1380      1390      1400      1410      1420      1430     

     1400      1410      1420      1430      1440      1450        
pF1KSD RMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDV
       .::.::... :...::. :::::. :. :::.:.::::.::.  .:.:.:..  :. ...
CCDS31 KMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQI
        1440      1450      1460      1470      1480      1490     

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pF1KSD EYAPLTVSVIVQD-EGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEW
       ::  : .. .  : :.   :::::::::::.::::::.: ::.. : :  ::  .. :::
CCDS31 EYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEW
        1500      1510      1520      1530      1540      1550     

      1520       1530      1540      1550                      1560
pF1KSD RPGSTAQI-LSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL----------------SK
       : :  :.. :.: :.:.. :: :::.::::::.: : ... :                :.
CCDS31 RQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISR
        1560      1570      1580      1590      1600      1610     

             1570      1580                1590      1600      1610
pF1KSD VGVSQQPEDSQQDLPGERHAL----------LEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKE
       ...:.   ::.    :   .:          ::   .:::::.  :. :. .. :::   
CCDS31 TSISRY--DSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKEGDRGS---
        1620        1630      1640      1650      1660      1670   

             1620      1630      1640         1650      1660       
pF1KSD KERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAP---GHAVPPAVKYFFDFLDEQAEK
           : ..::::::::..:::::.:::..:.....    : :.: :.::.::::::::..
CCDS31 ----KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADR
                 1680      1690      1700      1710      1720      

      1670      1680      1690      1700      1710      1720       
pF1KSD HNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTE
       :.:.: :. : ::.: ::::::::..:::.:.::.:   ..:: :::.::::::.:. .:
CCDS31 HSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSE
       1730      1740      1750      1760      1770      1780      

      1730      1740      1750      1760      1770      1780       
pF1KSD HKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNT
       :.:..:::::::::::.: .::. :: ::  : ..  .::::::..::: :: :.  .: 
CCDS31 HRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNM
       1790      1800      1810      1820      1830      1840      

      1790      1800      1810      1820      1830        
pF1KSD LVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
       : ::...:.:..:: .:.:.:::.:  :....::....:.  :.       
CCDS31 LSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES   
       1850      1860      1870      1880      1890       

>>CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12             (1568 aa)
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pF1KSD            MALQLWALTLLG-LLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYL
                         : ::. ::. .:  :      .:::. .. .:... .:: ..
CCDS90 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGV-FV
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pF1KSD GAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKR
       .. . : :::   .::....     .  .:: :.  .   . .  .. ..:::  : :. 
CCDS90 ASGSCLDQLD--YSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLL--PYREG
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pF1KSD LVECGSLF-------KGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTG
        .  :.:.       .: : .: :.:.: :   ..:.     :. . .: .:.:.:  .:
CCDS90 AAGLGGLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLS-RNSLRNGT---EVVSCHPQG-STAGVVYRAG
         120       130       140        150          160        170

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pF1KSD PGGDRVLFVGKGNG-PHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDH--ATYKAGYLS----TN
        ..   : :.     :. .     .   .  :.  :..    .  :: . : :.    ..
CCDS90 RNNRWYLAVAATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAG
              180       190       200       210       220       230

          220       230         240       250       260         270
pF1KSD TQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQD--KHPARNRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRD--PD
       . .:: ::  .  ..: .   .  .  : .   .::. .     ..  . .:.:    ::
CCDS90 SLHFVDAFLWNGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQG-QASLDCGHGHPD
              240       250       260       270        280         

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pF1KSD IHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNAC
        .   ... :. .. . ..  :. :. .. ..  .   ..:::: .....:. .      
CCDS90 GRRLLLSSSLVEALDVWAG--VFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAK------
     290       300         310       320       330       340       

              340       350        360       370       380         
pF1KSD YTGTREARDIFYKPFHGDIQCG-GHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGG
           : . :.     :    :  :  :   .  : .:  : .  ..  .. ::.:..:  
CCDS90 ----RVSWDFKTAESH----CKEGDQPERVQ--PIASSTLIH--SDLTSVYGTVVMNR--
                 350           360         370         380         

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pF1KSD LNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGD
                     :: ::::.::..::: :  . ::.  . .. ::....     :  :
CCDS90 --------------TVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPE-VIYEIKEETPVFYKLVPD
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pF1KSD -LGSLYA-MTQDK-VFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEE
        . ..:  .:  : : :. : .: .. .:..:  . ::.::::    ::: ...: ..:.
CCDS90 PVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQRCTFQGDCVHSEN
            440       450       460       470       480       490  

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pF1KSD ASHWL--WSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHP
         .::   : .:.:       :.         .:.  :     :.:   . . :   :  
CCDS90 LENWLDISSGAKKC-------PK---------IQIIRS-----SKEKTTVTMVGSFSP--
            500                       510            520           

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pF1KSD ARVEGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEEN
                                                          :..  . .:
CCDS90 ---------------------------------------------------RHSKCMVKN
                                                        530        

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pF1KSD LPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNPEDGIVRAHMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETD
       .      :.:  ::         ...::      :.    .:          ::    : 
CCDS90 VD-----SSRELCQ--------NKSQPN------RTC---TCS---------IP----TR
      540                    550                         560       

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pF1KSD VNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTPKLSHDANETLPLHLYVKS
       ...  :....:.                 .:     :.: . .::   : :         
CCDS90 ATY--KDVSVVN-----------------VM-----FSFGSWNLSDRFNFT---------
             570                             580       590         

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pF1KSD YGKNIDSKLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQSRCVYEALCNTTSECPPPV
                     ::: . ..:  :  ..    :::: .  ::..       . : :  
CCDS90 --------------NCS-SLKECPACVETG----CAWCKSARRCIHP-----FTACDPSD
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pF1KSD ITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEA
         : : :  :..                  ... : .::    . .: .         .:
CCDS90 YERNQ-EQCPVA------------------VEKTSGGGRPKENKGNRTN---------QA
        630                          640       650                 

          870       880       890       900       910       920    
pF1KSD AETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGS
        .. .  ..: .  . ::.:  ::           :   .  .:.. :. ..::  .: .
CCDS90 LQVFYIKSIEPQKVSTLGKS--NVI----------VTGANFTRASNITMILKGT--STCD
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pF1KSD QEDVRVT--LNGVPCKVTKFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYREN
       .. ..:.  :: .  : .           :.. . .  . ... :.   . : . .:   
CCDS90 KDVIQVSHVLNDTHMKFSL----------PSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSL-SYIAL
          710       720                 730       740        750   

            990      1000      1010      1020      1030      1040  
pF1KSD PVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVG
       :    . :  .. :::..:.. :..:..:. .   .:.. :..             ..  
CCDS90 PHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFDVIDNL---IISHELKG-------------NINV
           760       770       780          790                    

           1050      1060      1070      1080      1090      1100  
pF1KSD TDYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENFT-
       ..:     :   ::.:..       :.:: ....        . :...:  :: : ..  
CCDS90 SEYCVA--TYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQD----TYLDCGTLQYREDPRFTGYRV
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pF1KSD -GGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAE---RCTMKTLTE----TDLYCEPPE
        . :  ...  :. .. :.: .    :   : : .    :.....:.    : . :.   
CCDS90 ESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQDLTTILCKIKG
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pF1KSD VQPPPKRRQKRDTTHNLPEFI-VKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVIVPMVVV
       ..         .:  :  . . ::.:. :     :: ..  :   . ..::...: .:. 
CCDS90 IKTA-------STIANSSKKVRVKLGNLELY---VEQESVPSTWYFLIVLPVLLV-IVIF
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pF1KSD IAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAG-
        ::.:  .  ::..  :   : ..::: ::  .: . .  :..:..   :. . :   : 
CCDS90 AAVGVTRH--KSKELSR---KQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQM---DKLDVVDSFGT
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pF1KSD IPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLIN
       .: :::: .. :.:: : . :   ..     :. .      ...:  .. :. .::::..
CCDS90 VPFLDYKHFALRTFF-PESGGFTHIFTE---DMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVT
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        :::::.:..::.. .  :::.::.::. :: : :.:...:  .:.::     .::::::
CCDS90 VIHTLEKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQ-CSNMQPKLMLR
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pF1KSD RSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDT
       :.:.:::..:.::::.::  .:....:::.: :  .......:::::..  :: ::::. 
CCDS90 RTESVVEKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNED
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pF1KSD GLLGDDVEYAPLTVSVIVQ----DEGVDA---IPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPC
        :: .  :.. ....:. .    .:..:.   : :.::.::::.:.::::. :.. ..  
CCDS90 WLLWQVPEFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIF-QAFLSKNG
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pF1KSD SCWP-RPDSVVLEWRPGSTAQILSDLDLTSQ-REGRWKRVNTLMHYNVRDGATL-ILSKV
       : .  . . . :: . :.  . : :.: .:   :    ..::. ::.. .:.:. ...:.
CCDS90 SPYGLQLNEIGLELQMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKI
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pF1KSD GVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEV--D-EGKSKRGSVKEKERTKAIT
       .   .  . ..:     :          ::. : .:.  : .:: .::  :.: ..:   
CCDS90 ANFTSDVEYSDD-----HC---------HLILPDSEAFQDVQGKRHRG--KHKFKVK---
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pF1KSD EIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLA-PGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIH
       :.:::.:::.: .... ....:.:. . :.  .: :.:::::::: :::...: : :..:
CCDS90 EMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVH
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pF1KSD IWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSN
       :::::::::::::::::::.:.::..    .:. ::::::.:::: . ::..:....:.:
CCDS90 IWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTN
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pF1KSD KLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQY
       ::::::.: :::. :..:::.::..  .:...:.  :.. :. : . .:  ::: ..:.:
CCDS90 KLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKY
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pF1KSD TQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
         ::.:::.: ::.. . .. :                   
CCDS90 IVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFDEKKKCKWM
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>>CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7             (1894 aa)
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CCDS43 MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSFVTFRGEPAEGFNHLVVDERT
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pF1KSD GVVYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEA-EMTDNVNQLLLL
       : .:::::: .:.:.. :..     :::  :: :: ::  .. :.:    :.:::..::.
CCDS43 GHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRIVQTCNEPLTTTNNVNKMLLI
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pF1KSD DPPRKRLVECGSLFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGP
       :  ..::. ::::..::: :  : .. ..:  :    .. .... .:. .. :.. : . 
CCDS43 DYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDL-FKL-GEPYHKKEHYLSGVNESGSVFGVIVSYSN
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pF1KSD GGDRVLFVGKGNGPHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQF----
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CCDS43 LDDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTIIP
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pF1KSD ------VAAFEDGPYVFFVFNQQDK-HPARNRTL-------LARMCREDPNYYSYLEMDL
             : .: .: .:.:.  : .   :  . :        :.:.:.::  . ::.:. .
CCDS43 DFDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPGSTTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEVPI
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pF1KSD QCRDPDIH----AAAF----GTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSS--GGPGAGLCLF
        :.   ..     ::.    :. :. ....  .  .:..:::. .. .  .   ..::.:
CCDS43 GCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFSKGQKRKMKSLDESALCIF
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pF1KSD PLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLG
        : ... ...   ..:: : . . :. .   . :: :..     . .: :: . .  :::
CCDS43 ILKQINDRIKERLQSCYRG-EGTLDLAWLKVK-DIPCSSALLTIDDNF-CGLD-MNAPLG
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         : .::  :. .    .:.: . . .::..::.::..:.. :. .  : :.. .:... 
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       :     : ::...: :  .:: :.. .. :.::. : .: .: .:  : ::.:::::...
CCDS43 VVDPGPVLRDMAFSKDHEQLYIMSERQLTRVPVESCGQYQSCGECLGSGDPHCGWCVLHN
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pF1KSD RCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSP--LPALSEED
        :::: .: :..:  ..  :. :.:: .: ..:.:.:  .: .: :..    .: ::   
CCDS43 TCTRKERCERSKEPRRFA-SEMKQCVRLT-VHPNNISV-SQYNVLLVLETYNVPELSAG-
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pF1KSD ELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSS--IP--VTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTS
        . : : .     . : :. . : ::..  .:  .:  : :: .: .::  .. .. ..:
CCDS43 -VNCTFEDLSEMDGLVVGNQIQCYSPAAKEVPRIITENG-DHHVVQLQLKSKETGMTFAS
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pF1KSD YQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNP---EDGIVRAHMED
        .. ::.:    :....  :.::: . . :.:    : : . .:.    ..:  :... .
CCDS43 TSFVFYNC----SVHNS--CLSCVESPYRCHWCKYRHVCTH-DPKTCSFQEG--RVKLPE
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pF1KSD SCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFME------PVTMQES
       .:::.:  . ...:..    .....:::   . .: . : . .  ..      :.   .:
CCDS43 DCPQLLRVDKILVPVEVIKPITLKAKNLP--QPQSGQRGYECILNIQGSEQRVPALRFNS
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pF1KSD GTFAFRTPKLSHDANE--TLPLHLYVKSYGK-NIDSKLH--VTLYNCSFGRSDCSLCRAA
       ..   .. . :... :  .::..: :   :. :::.  .  : ::.:.  : .:.::  :
CCDS43 SSVQCQNTSYSYEGMEINNLPVELTVVWNGHFNIDNPAQNKVHLYKCGAMRESCGLCLKA
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pF1KSD NPDYRCAWCGGQSRCVYEALC-----------NTTSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRIT
       .::. :.:: : ..:. .  :           .. :.:  : ::.: : :::  :: ..:
CCDS43 DPDFACGWCQGPGQCTLRQHCPAQESQWLELSGAKSKCTNPRITEIIPVTGPREGGTKVT
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pF1KSD ILGSNLGVQAGDI-QRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVI-EAAETPFTGGVEVDV---
       : : :::..  :: ....::: .::   . :  . .::: . ::  .  .: ::. :   
CCDS43 IRGENLGLEFRDIASHVKVAGVECSPLVDGYIPAEQIVCEMGEAKPSQHAGFVEICVAVC
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pF1KSD ---FGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLS-VEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLN
          :  ..::    :. . .   :: ..:..::..::: .:: ::.:..::  .: : ..
CCDS43 RPEF--MARSS---QLYYFMTLTLSDLKPSRGPMSGGTQVTITGTNLNAGS--NVVVMFG
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pF1KSD GVPCKVTKFG-AQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLR
         ::   . . . . : :  .    .: . :.   . . .  . : : :.:..  .::  
CCDS43 KQPCLFHRRSPSYIVCNTTSSDEVLEMKVSVQVDRAKI-HQDLVFQYVEDPTIVRIEPEW
             1000      1010      1020       1030      1040         

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pF1KSD SFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAM---------VVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGT
       :..::.  : : :  ..:::   .         . : : :..     :     :  ..: 
CCDS43 SIVSGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIRAKHGGKEHINICEVLNA----TEMTCQAPALALGP
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pF1KSD DYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENF--T
       :.  ..:         . :.:: ...     .:. ..::  .   : : :.:.:: :  .
CCDS43 DH--QSD---------LTERPEEFGFI----LDNVQSLLILNKTNFTYYPNPVFEAFGPS
          1110               1120          1130      1140      1150

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pF1KSD GGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAE----AFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPP
       : .. . .  :  .: ::   ..  ...    ..:: . ::. :.....: :: :..   
CCDS43 GILELKPGTPIILKGKNLIPPVAGGNVKLNYTVLVGEKPCTV-TVSDVQLLCESPNLIG-
             1160      1170      1180      1190       1200         

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pF1KSD PKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSL--ILPLVIVP--MVVVI
          :.:          ... :. :.  : :     . : ::::  :. ....   ... :
CCDS43 ---RHK---------VMARVGGMEYSPGMVYI---APDSPLSLPAIVSIAVAGGLLIIFI
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pF1KSD AVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIP
       .. .  : :::....   .... :...::  :  .::. :..:. .... :.:.  ::::
CCDS43 VAVLIAYKRKSRESDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTSDLDGAGIP
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pF1KSD VLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFI
        :::.::: ::.: :   : .:  .   :..:  :.  ::..:  :..:.:.: ::..::
CCDS43 FLDYRTYTMRVLF-P---GIEDHPVLRDLEVPGYRQERVEKGLKLFAQLINNKVFLLSFI
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pF1KSD HTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PKLMLRR
       .:::.:: :: : .   :::. ..:..:::: ::... :. .:... . .:: :::.:::
CCDS43 RTLESQRSFSMRDRGNVASLIMTVLQSKLEYATDVLKQLLADLIDKNLESKNHPKLLLRR
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pF1KSD SETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTG
       .:.:.:.::.::... ::..::. :::::..:: :::.:.::::.::.  .:.:.:..  
CCDS43 TESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFSLFCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDK
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pF1KSD LLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDA-IPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPD
       :. ....:  :..: .  :.. .  .:::.::::::.::::::.: .... :::  :.  
CCDS43 LIRQQIDYKTLVLSCVSPDNANSPEVPVKILNCDTITQVKEKILDAIFKNVPCSHRPKAA
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pF1KSD SVVLEWRPGSTAQ-ILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL-SK---------
       .. :::: :: :. ::.: :.:.. :. :::.::: ::.: ::... : ::         
CCDS43 DMDLEWRQGSGARMILQDEDITTKIENDWKRLNTLAHYQVPDGSVVALVSKQVTAYNAVN
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pF1KSD -VGVSQQPEDSQQDL---PGERHAL----------LEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRG
          ::.   .. ...    :   .:          ::   ..::::.  .. :. .. ::
CCDS43 NSTVSRTSASKYENMIRYTGSPDSLRSRTPMITPDLESGVKMWHLVKNHEHGDQKEGDRG
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pF1KSD SVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGH---AVPPAVKYFFDFLDE
       :       : ..::::::::..:::::.:::..:..... .:   :.: :.::.::::::
CCDS43 S-------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDE
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pF1KSD QAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDAC
       ::.::.:.:  . : ::.: ::::::::..:::.:.::.: . ..:: :::.::::::.:
CCDS43 QADKHGIHDPHVRHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSC
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pF1KSD TRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTD
       . .::.:..:::::::::::.: .::. :: ::. : .:  .::::::..::: :: : .
CCDS43 STSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIGKMPAISDQDMNAYLAEQSRMHMN
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pF1KSD SLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL
        .::. :: ....:. :: .::.. :..:    :..::..:.:.           
CCDS43 EFNTMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS   
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>>CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX              (1909 aa)
 initn: 3090 init1: 948 opt: 1005  Z-score: 1044.5  bits: 206.6 E(32554): 7.4e-52
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pF1KSD QLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQL
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CCDS14 PFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQL
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pF1KSD EQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGICALR
       :  ..:::..:.  :.:  . ..: .:..:::.:::::..   ..:: ::.. .:.:  :
CCDS14 EAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETR
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pF1KSD ALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKG-NGPHDNGII
        :....  :.  .  :. .:::.:  ::::::::    :: : .:.:..:  :  . :  
CCDS14 RLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPL-PGRD-LLLVARGLAGKLSAG--
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pF1KSD VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQD-KHPAR
       :    . .  . . : .    .   .: .:  ....:.:: :.  ..::: ..  .  :.
CCDS14 VPPLAIRQLAGSQPFSS-EGLGRLVVGDFSDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE
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pF1KSD NRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDS
        :. .::.:  : : :::.:. : :.   .  :::         :::.   : .::.   
CCDS14 YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQGLIQAAF--------LAPGT---LLGVFAAGP
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pF1KSD RSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYT-GTREARDIFYKPFHGDI--QCGGHAPGS
       :   :  :.:: ::. .. :.::  :  ::: : :          .  .  .:      :
CCDS14 R---GTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDS
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pF1KSD SKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKV
        .:.:::.:: : :...:. :.   .:. :   ..::..   ..: .:::: ..:.. ::
CCDS14 PESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQ-PVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKV
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pF1KSD YLTPDGTSSE-YDSILV-EINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCT
       .:   :.... : :  :   .. .. ::.:... . ::..:  .: :.::  : ..: :.
CCDS14 FL--HGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCA
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pF1KSD QCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKS--CVAVTSAQPQNMSRRAQ
       .: ..::: :::::..::::::..: :: . ..::::  ..  :. . :  : .  :. :
CCDS14 SCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQEQ
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       :.: :.:  :: :. .. . : ::.     :.:::  : : .:  ...:..::: :::.:
CCDS14 GQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSL-AHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTV
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pF1KSD TIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECR--EAS
        . :...  .. ... .. ::::  ...::   :: .::.. : :.:  .  .:   :  
CCDS14 PLALMFE--DVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHC
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       :. :  :  :.  :       .:::  :  .: ..:.. :. . .. .::.  .:  .:.
CCDS14 PEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPASF
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       :   .:   ..  :.:..:    :: .  .. ..  . ..  ::. .:: .. .. .:. 
CCDS14 HCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQFYPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLDNT
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pF1KSD --LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCG-GQSRCVYEALCNTTSE---CPPPVIT
         :.: ::.:..:. ::: :.::: .  : ::. ::  : :  ::   .    :: : : 
CCDS14 HALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPPGAVELLCPAPSID
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pF1KSD RIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQR-ISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAA
        ..: :::  ::. .::::::::   .:.:  .:::.: :. .:  : .:.:::::   :
CCDS14 AVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPA
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        .  :: :.: . ..    ::..   .::.:.:  ::. :. ::::::: :::.: ::.:
CCDS14 PNGTTGPVRVAIKSQ----PPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQLTIRGQHLQT
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pF1KSD GSQEDVRVTLNGVPCKVTK--FGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYR
       :.. .. :  .: :: . .      . : : :::. :.  . : .: .     .  : : 
CCDS14 GGNTSAFV--GGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYT
          960         970       980       990      1000      1010  

              990      1000      1010                 1020         
pF1KSD ENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVI-----------AEPLQSWQPP
        :: : : ::  :: .::: : : : :....::  . :            :.: :. :: 
CCDS14 ANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQASRAQP-QDPQPR
           1020      1030      1040      1050      1060       1070 

    1030        1040             1050        1060      1070        
pF1KSD RE--AESLQPMTVVGT-------DYVFHNDTKVVFL--SPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGH
       :   : . .:.. .         . :   ... ..:  :::::.  .:.   :.. .:. 
CCDS14 RSCGAPAADPQACIQLGGGLLQCSTVCSVNSSSLLLCRSPAVPD--RAHPQRVFFTLDNV
            1080      1090      1100      1110        1120         

     1080        1090      1100           1110      1120      1130 
pF1KSD RALLRTEAGA--FEYVPDPTFENFT--GGVKK---QVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAF
       .. . . .:.  : : :.: .  ..  : ..    . .... ..: .:: ... .:... 
CCDS14 QVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGHVLDVEGEGLNLGISKEEVRVH
    1130      1140      1150      1160      1170      1180         

            1140      1150      1160      1170      1180      1190 
pF1KSD VGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDT
       .:  .: .::::.: ::::::   : :       .  .::.:.:..:. . .:: :.:..
CCDS14 IGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPA------NGSGLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEA
    1190      1200      1210            1220      1230      1240   

              1200      1210        1220      1230      1240       
pF1KSD R--VSDVPLSLILPLVIVPMVVVIAVSVYC--YWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRD
       .  .:  :.     . .   :.. :: .    : .::.:: :.:.:.  :::.:: .: :
CCDS14 EPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLETGVGD
          1250      1260      1270      1280      1290      1300   

      1250      1260      1270      1280      1290      1300       
pF1KSD RCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIP--
       .:.::::::: :: : ..:.. .::: :::.::..:.:: :.. :     .  : . :  
CCDS14 QCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFF-PGHGG---CPLQPKPEGPGE
          1310      1320      1330      1340          1350         

        1310      1320      1330      1340      1350      1360     
pF1KSD EPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYY
       . .  .:.:.: :.::::::: ::...:::::.:  :: : . . ::::..:::::::: 
CCDS14 DGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEYL
    1360      1370      1380      1390      1400      1410         

        1370      1380      1390      1400      1410      1420     
pF1KSD TDIMHTLFLELLEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLF
       ::::.::. .:  .::  .::::::::.::.::..:.::.::::: .:.. :::::: ::
CCDS14 TDIMRTLLGDLAAHYV-HRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYMLF
    1420      1430       1440      1450      1460      1470        

        1430      1440      1450      1460      1470               
pF1KSD KAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDA--------I
       .::..::.:::::::  ::: ::::. :: .:::. :::. :.:   .  :        .
CCDS14 RAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVLVGPGAGGAAGSSEMQRV
     1480      1490      1500      1510      1520      1530        

      1480      1490      1500      1510      1520       1530      
pF1KSD PVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQRE
       :..::. :::.:::::..::::.: : :  :   .. :::: : .... ::: ::::  .
CCDS14 PARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLAGHLTLSDEDLTSVTQ
     1540      1550      1560      1570      1580      1590        

       1540      1550       1560      1570        1580             
pF1KSD GRWKRVNTLMHYNVRDGATL-ILSKVGVSQQPEDS-QQDLP-GERHALLE--EENRV--W
       ..:::.:::.::.: ::::. .. ..  ..   .:  :  : ::    ::  ::. :  :
CCDS14 NHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQLHRGSTISQSLAQRCPLGENIPTLEDGEEGGVCLW
     1600      1610      1620      1630      1640      1650        

    1590      1600      1610        1620      1630      1640       
pF1KSD HLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKE--RTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPG
       :::. :.: . .: . .:..:.:  :.::: :::::::::.:::::.:::. ::..:. .
CCDS14 HLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVN
     1660      1670      1680      1690      1700      1710        

      1650      1660      1670      1680      1690      1700       
pF1KSD HAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEV
       . .: ::::.::.::: ::::.:.:  :.:::::::: :::::: ::::..::::.: . 
CCDS14 RPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDN
     1720      1730      1740      1750      1760      1770        

      1710      1720      1730      1740      1750      1760       
pF1KSD VDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSD
       ::: :.::::::.:.:: .:::..:::: ::::::.::  ::.::: ::  :::   .: 
CCDS14 VDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASY
     1780      1790      1800      1810      1820      1830        

      1770      1780      1790      1800      1810      1820       
pF1KSD QDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQI
       :.::. :::.:  .:.. . : ::..::.. ..:::.::.::::::..::.::: ::::.
CCDS14 QEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQV
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      1830        
pF1KSD AAALENKVTDL
       :: .:::::::
CCDS14 AALVENKVTDL
     1900         

>>CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX              (1932 aa)
 initn: 3090 init1: 948 opt: 1005  Z-score: 1044.4  bits: 206.6 E(32554): 7.5e-52
Smith-Waterman score: 4277; 40.8% identity (66.3% similar) in 1901 aa overlap (34-1838:77-1932)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KSD QLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQL
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CCDS55 PFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQL
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pF1KSD EQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGICALR
       :  ..:::..:.  :.:  . ..: .:..:::.:::::..   ..:: ::.. .:.:  :
CCDS55 EAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETR
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pF1KSD ALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKG-NGPHDNGII
        :....  :.  .  :. .:::.:  ::::::::    :: : .:.:..:  :  . :  
CCDS55 RLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPL-PGRD-LLLVARGLAGKLSAG--
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pF1KSD VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQD-KHPAR
       :    . .  . . : .    .   .: .:  ....:.:: :.  ..::: ..  .  :.
CCDS55 VPPLAIRQLAGSQPFSS-EGLGRLVVGDFSDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE
            230        240       250       260       270       280 

             250       260       270       280       290       300 
pF1KSD NRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDS
        :. .::.:  : : :::.:. : :.   .  :::         :::.   : .::.   
CCDS55 YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQGLIQAAF--------LAPGT---LLGVFAAGP
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pF1KSD RSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYT-GTREARDIFYKPFHGDI--QCGGHAPGS
       :   :  :.:: ::. .. :.::  :  ::: : :          .  .  .:      :
CCDS55 R---GTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDS
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pF1KSD SKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKV
        .:.:::.:: : :...:. :.   .:. :   ..::..   ..: .:::: ..:.. ::
CCDS55 PESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQ-PVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKV
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pF1KSD YLTPDGTSSE-YDSILV-EINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCT
       .:   :.... : :  :   .. .. ::.:... . ::..:  .: :.::  : ..: :.
CCDS55 FL--HGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCA
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pF1KSD QCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKS--CVAVTSAQPQNMSRRAQ
       .: ..::: :::::..::::::..: :: . ..::::  ..  :. . :  : .  :. :
CCDS55 SCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQEQ
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       :.: :.:  :: :. .. . : ::.     :.:::  : : .:  ...:..::: :::.:
CCDS55 GQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSL-AHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTV
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pF1KSD TIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECR--EAS
        . :...  .. ... .. ::::  ...::   :: .::.. : :.:  .  .:   :  
CCDS55 PLALMFE--DVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHC
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pF1KSD PNPEDGIVRAHMED-------SCPQFLG-PSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKG--SSL
       :. :  :  :.  :       .:::  :  .: ..:.. :. . .. .::.  .:  .:.
CCDS55 PEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPASF
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pF1KSD HVGSDLLKFME--PVTMQE----SGTFAFRTPKLSHDANET-LPLHLYV-KSYGKNIDSK
       :   .:   ..  :.:..:    :: .  .. ..  . ..  ::. .:: .. .. .:. 
CCDS55 HCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQFYPSMSQRELPVPIYVTQGEAQRLDNT
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pF1KSD --LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCG-GQSRCVYEALCNTTSE---CPPPVIT
         :.: ::.:..:. ::: :.::: .  : ::. ::  : :  ::   .    :: : : 
CCDS55 HALYVILYDCAMGHPDCSHCQAANRSLGCLWCADGQPACRYGPLCPPGAVELLCPAPSID
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pF1KSD RIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQR-ISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAA
        ..: :::  ::. .::::::::   .:.:  .:::.: :. .:  : .:.:::::   :
CCDS55 AVEPLTGPPEGGLALTILGSNLGRAFADVQYAVSVASRPCNPEPSLYRTSARIVCVTSPA
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pF1KSD ETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNV---QFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDT
        .  :: :.: . ..    ::..   .::.:.:  ::. :. ::::::: :::.: ::.:
CCDS55 PNGTTGPVRVAIKSQ----PPGISSQHFTYQDPVLLSLSPRWGPQAGGTQLTIRGQHLQT
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pF1KSD GSQEDVRVTLNGVPCKVTK--FGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYR
       :.. .. :  .: :: . .      . : : :::. :.  . : .: .     .  : : 
CCDS55 GGNTSAFV--GGQPCPILEPVCPEAIVCRTRPQAAPGEAAVLVVFGHAQRTLLASPFRYT
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pF1KSD ENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVI-----------AEPLQSWQPP
        :: : : ::  :: .::: : : : :....::  . :            :.: :. :: 
CCDS55 ANPQLVAAEPSASFRGGGRLIRVRGTGLDVVQRPLLSVWLEADAEVQASRAQP-QDPQPR
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       :   : . .:.. .         . :   ... ..:  :::::.  .:.   :.. .:. 
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       .. . . .:.  : : :.: .  ..  : ..    . .... ..: .:: ... .:... 
CCDS55 QVDFASASGGQGFLYQPNPRLAPLSREGPARPYRLKPGHVLDVEGEGLNLGISKEEVRVH
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       .:  .: .::::.: ::::::   : :       .  .::.:.:..:. . .:: :.:..
CCDS55 IGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPA------NGSGLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEA
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       .  .:  :.     . .   :.. :: .    : .::.:: :.:.:.  :::.:: .: :
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       .:.::::::: :: : ..:.. .::: :::.::..:.:: :.. :     .  : . :  
CCDS55 QCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFF-PGHGG---CPLQPKPEGPGE
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       . .  .:.:.: :.::::::: ::...:::::.:  :: : . . ::::..:::::::: 
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pF1KSD TDIMHTLFLELLEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLF
       ::::.::. .:  .::  .::::::::.::.::..:.::.::::: .:.. :::::: ::
CCDS55 TDIMRTLLGDLAAHYV-HRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYMLF
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CCDS55 RAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVLVGPGAGGAAGSSEMQRV
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CCDS55 PARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLAGHLTLSDEDLTSVTQ
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CCDS55 HLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVN
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pF1KSD HAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEV
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CCDS55 RPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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