FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0315, 1838 aa 1>>>pF1KSDA0315 1838 - 1838 aa - 1838 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7581+/-0.000999; mu= 22.8345+/- 0.060 mean_var=90.9358+/-17.912, 0's: 0 Z-trim(106.2): 53 B-trim: 2 in 1/49 Lambda= 0.134495 statistics sampled from 8812 (8865) to 8812 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.624), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16 Scan time: 6.210 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 12379 2413.5 0 CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 1981 396.0 7.3e-109 CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 1671 335.9 1e-90 CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 1282 260.3 4.9e-68 CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 1235 251.2 2.7e-65 CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 1128 230.5 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CCDS33 NILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLALNSEARAGDKE-SQARSLLARI 270 280 290 300 310 320 250 260 270 280 290 300 pF1KSD CRE-----DPNYY--SYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSR : : . ::... ::: .:. : . :.. . . :.::: : . CCDS33 CLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAG----GAGRGDLYSRLVSVFPARERLFAVFERPQG 330 340 350 360 370 310 320 330 340 350 pF1KSD SSGGPGA--GLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHA----- : .. .: .:: : . :.: ..: :.::. .. : :. . . .: : : CCDS33 SPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACF--VEPAPDVV-AVLDSVVQGTGPACERKL 380 390 400 410 420 430 360 370 380 390 400 410 pF1KSD --PGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDG . ... ::. :: .::. . :..: :.. :: :.:.::. ::.:..:::: .: CCDS33 NIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGL--TSVAVASVNNYTAVFLGTVNG 440 450 460 470 480 490 420 430 440 450 460 470 pF1KSD RILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLS-GDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSY :.::. :. . . : .. :.. . .. .: : :: ::. .. :. : : . CCDS33 RLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQMARVKVAACNVH 500 510 520 530 540 550 480 490 500 510 520 530 pF1KSD PTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWL-WSRSKS-CVAVTSAQPQNMS :: .: . : :::::..: ::: . .: . . : :.. : : :.: . :.... CCDS33 STCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRCPAMT-VLPSEID 560 570 580 590 600 610 540 550 560 570 580 pF1KSD RRAQ--GEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEA-----VICNS-P-SSIP : . : . . ::.:: :. : .:.. ::: : : . :: : ...: CCDS33 VRQEYPGMILQISGSLPSLSGM-EMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAYCNLLPRDQFP 620 630 640 650 660 670 590 600 610 620 630 640 pF1KSD VTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDL ::.:::: :... .: .. ... .. .::: .. .. . : ::.: .: : : CCDS33 PFPPNQDHV--TVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSAQWPCFWCS 680 690 700 710 720 650 660 670 680 690 pF1KSD RYHECR------EASPNPEDGIVRAHMEDSCPQFLGPSPLV-IPMNHETDVNFQGKNLDT . : : :::::: . ..::. : :::. .: . .. : CCDS33 QQHSCVSNQSRCEASPNPTS-------PQDCPRTLL-SPLAPVPTGGSQNILVPLANTAF 730 740 750 760 770 780 700 710 720 730 740 750 pF1KSD VKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTPKLSHDANETLPLHLYVKSY-GKNIDSK- .:..:. . : ...: : ..:: . .. . ....:: : .:. .. .:: CCDS33 FQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPE 790 800 810 820 830 840 760 770 780 790 800 pF1KSD -LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANP-DYRCAWCGGQSRCVYEA-LCNTTSECPPPVITRIQ . : .:::..: ::: : . . . : : : : .. : .. :: : : :. CCDS33 PMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDG---CRLRGPLQPMAGTCPAPEIHAIE 850 860 870 880 890 810 820 830 840 850 860 pF1KSD PETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQR-ISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETP : .::: :: .:: : ::: . .:. . . ..: : :.::.:: .:::: : : CCDS33 PLSGPLDGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGP 900 910 920 930 940 950 870 880 890 900 910 920 pF1KSD FTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDV ..: : :.. .: :.: .:.. : :.:: .::.:::: .::::. : .::. .: CCDS33 LSGVVTVNA-SKEGKSRD--RFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQV 960 970 980 990 1000 1010 930 940 950 960 970 980 pF1KSD RVTLNGVPC-KVTKFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRA :. . :: .. . ... :. : . . . : . . .. : : .:::. : CCDS33 LVN-DTDPCTELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITA 1020 1030 1040 1050 1060 1070 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KSD FEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQP--MTVVGTDY . : :: .::::.:.:.:. : ..: .:.: . . : . :. .: . CCDS33 ISPRRSPVSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAV----HHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGA 1080 1090 1100 1110 1120 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD VFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENFTGGVK . . .. : :. . . : ...: :. . : ..:.:.: : :. . CCDS33 LSNASAPVDFF---INGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFS--TAKRE 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KSD KQVNK--------LIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPP : ... .:: . .: .. .: .. .: : .. ... ..: : CCDS33 KWIKHHPGEPLTLVIHKEQDSL--GLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSVNESLGA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD PKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVIVPMVVVIAVSV .. .:: . .. :. . ... .. . . .:... :.. .. :.:. : CCDS33 --------AVGQLP-ITIQVGNFNQTIATLQLGGSETAIIVSIVICSVLL-LLSVVALFV 1250 1260 1270 1280 1290 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD YCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEA-GIPVLD .: ::..::: ..: :.: .: ..:.. .: :..:. .: : :...... ::: :. CCDS33 FC--TKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIREEIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLE 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1280 1290 1300 1310 pF1KSD YKTYTDRVFF------------LPSK----DGDKDVMIT----GKLDIPEPRRPVVEQAL :: .. :.:: :::. .:..... : :. ::: :: .:... CCDS33 YKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNSQGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGI 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KSD YQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLEL ::.:::.: ::: :.:.::.:..:..: . .:::::.::::::::::.::. :...: CCDS33 SLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRDRCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDL 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KSD LEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGP .. . ::::::::::.:.:::.::.::::::.:. :....:::.. :. :::.:..:: CCDS33 IDASA-AKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGS 1480 1490 1500 1510 1520 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KSD VDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIID .::. ::.:::.. :: ...: : ...: : :.:.. :.... ::..::::::.. CCDS33 IDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNVSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILE 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KSD QVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGST-AQILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGAT .. : : ::: ..: ::: .:: . :: ::: :: : :..::: ::.. .::. CCDS33 AFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYILRDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGAS 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KSD LILSKVGVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKERTK : .: . ... .:: :.. .::: ::::. : :. : ....: : CCDS33 LAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKY---------FHLVLPTDELAEPKK---SHRQSHRKK 1650 1660 1670 1680 1690 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KSD AITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPP-AVKYFFDFLDEQAEKHNIQDED .. :::::::::.:::::.:.:..:...:. . :: :::::::::.:::::..:.: : CCDS33 VLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPD 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KSD TIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDS :.::::::::::::::::::::.:.::. . .:: ::::::.:.:::. .. .:..:: CCDS33 TLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDS 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KSD PSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQL :.::::::::: :.:.:. ::: :..:. .:.:.::.:::: :: . . .:: ::. .. CCDS33 PTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEI 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1800 1810 1820 1830 pF1KSD YQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL :.:...: .:. ::: .:.:.. :: ...:..: .:... CCDS33 YKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA 1880 1890 1900 1910 1920 >>CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135 aa) initn: 3300 init1: 1036 opt: 1671 Z-score: 1742.2 bits: 335.9 E(32554): 1e-90 Smith-Waterman score: 3913; 39.3% identity (62.0% similar) in 1872 aa overlap (276-1838:273-2135) 250 260 270 280 290 pF1KSD LARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAP---GSGRVLYAVFSR--- .: ::.::. . :.::.:.:: CCDS27 AFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYGLIQAAAVATSREVAHGEVLFAAFSSAAP 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 pF1KSD ------DSRSSGGPGAG-LCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARD---IFYKPFHGDI : ..:. ::. :: ::::.: . .:.:::: .:.: . : . . CCDS27 PTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVAYIEYDVNS 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KSD QCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLG .:. . ..::::.: : :..:: :..: .:. :..::::.:. :..::.:::: CCDS27 DCAQLPVDTLDAYPCGSDHTPSPMASRVPLEATPILEWPGIQLTAVAVTMEDGHTIAFLG 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KSD TSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQEC :.:.. .::: : . . :.. .. .. :.:::...: . ::.:::. ....:: : CCDS27 DSQGQLHRVYLGPGSDGHPYSTQSIQQGSAVSRDLTFDGTFEHLYVMTQSTLLKVPVASC 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KSD LSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSK--SCVAVTSAQPQ .. :..: .::::::::. :::.:..:: :.. .:::: . .:. :.. .: CCDS27 AQHLDCASCLAHRDPYCGWCVLLGRCSRRSECSRGQGPEQWLWSFQPELGCLQVAAMSPA 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KSD NMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSP--SSIPVTPP :.::. :: :.: :: : . : ::: :: . : .:.: :: : :: : CCDS27 NISREETREVFLSVPDLPPLWPGESYSCHFGEHQS-PALLTGSGVMCPSPDPSEAPVLPR 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KSD GQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHE : :.:.:... :: : . ... . :::: . :. . : .:::.:: :.: . : CCDS27 GADYVSVSVE--LRFGAVVIAKTSLSFYDCVAVTELRPSAQCQACVSSRWGCNWCVWQHL 610 620 630 640 650 650 pF1KSD CRE---------------------------------------ASPNPE------------ : . :.: :. CCDS27 CTHKASCDAGPMVASHQSPLVSPDPPARGGPSPSPPTAPKALATPAPDTLPVEPGAPSTA 660 670 680 690 700 710 660 pF1KSD ----------------------DGIVRA--------HMEDSCPQ---------------- .: . . : : : :. CCDS27 TASDISPGASPSLLSPWGPWAGSGSISSPGSTGSPLHEEPSPPSPQNGPGTAVPAPTDFR 720 730 740 750 760 770 670 pF1KSD ------------------------------------------------FLG--------- : : CCDS27 PSATPEDLLASPLSPSEVAAVPPADPGPEALHPTVPLDLPPATVPATTFPGAMGSVKPAL 780 790 800 810 820 830 680 pF1KSD ------------------------------------------PSPLVIPMNHETDVNFQG :.::..: . . . . : CCDS27 DWLTREGGELPEADEWTGGDAPAFSTSTLLSGDGDSAELEGPPAPLILPSSLDYQYDTPG 840 850 860 870 880 890 690 700 710 720 pF1KSD --------------KNLDTVKGSSL---HV-------GSDLLKFME-P----VTMQESGT ...:.::.: :: : .: :.. : .:. : CCDS27 LWELEEATLGASSCPCVESVQGSTLMPVHVEREIRLLGRNLHLFQDGPGDNECVMELEGL 900 910 920 930 940 950 730 740 750 pF1KSD FAF-------RTP------------KLSHDA-NETLPLHLYVKSYGK-NIDSK--LHVTL . . : .::..: . : . :... :. .:: :::.: CCDS27 EVVVEARVECEPPPDTQCHVTCQQHQLSYEALQPELRVGLFLRRAGRLRVDSAEGLHVVL 960 970 980 990 1000 1010 760 770 780 790 800 810 pF1KSD YNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQS-RCVYEALCN----TTSECPPPVITRIQPET :.:: :..::: :..: :.: :.:: :. ::: . :. ....:: :.: ..: : CCDS27 YDCSVGHGDCSRCQTAMPQYGCVWCEGERPRCVTREACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLT 1020 1030 1040 1050 1060 1070 820 830 840 850 860 870 pF1KSD GPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQ-RISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTG ::. :: :.:: ::::: .. :. ..::: :. . ..: ::. .::. :. .: CCDS27 GPVDGGTRVTIRGSNLGQHVQDVLGMVTVAGVPCAVDAQEYEVSSSLVCITGASGEEVAG 1080 1090 1100 1110 1120 1130 880 890 900 910 920 930 pF1KSD GVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVT .. :.: :. ::. . .:..:.:: :. : .::.:::: ::..:..: :: ::.::. CCDS27 ATAVEVPGR-GRGVSEHDFAYQDPKVHSIFPARGPRAGGTRLTLNGSKLLTGRLEDIRVV 1140 1150 1160 1170 1180 1190 940 950 960 970 980 pF1KSD LNGVPCKVT--KFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFE .. ::.. . . ::.: :.:. : . . . : .:.. : : .: . . CCDS27 VGDQPCHLLPEQQSEQLRCETSPRPTPATLPVAVWFGATERRLQRGQFKYTLDPNITSAG 1200 1210 1220 1230 1240 1250 990 1000 1010 1020 1030 pF1KSD PLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQ--RFAMVVIAEPLQSWQP--------PREAESLQPM- : .:: :::: : : ::.....: :. ..:... :: : :. : :: : CCDS27 PTKSFLSGGREICVRGQNLDVVQTPRIRVTVVSRMLQPSQGLGRRRRVVPETACSLGPSC 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KSD TVVGTDYVFH-NDTKVVFL-SPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRT-EAGAFEYVPDP . . : :..... .::.: :: . : . .:. . : . : : :: CCDS27 SSQQFEEPCHVNSSQLITCRTPALPGLPEDPWVRVEFILDNLVFDFATLNPTPFSYEADP 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KSD TF-----ENFTGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCE :. :. : ... .... ..: ::. ::. .:. :..: :..::::. :::: CCDS27 TLQPLNPEDPTMPFRHKPGSVFSVEGENLDLAMSKEEVVAMIGDGPCVVKTLTRHHLYCE 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KSD PPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDV-PLSLILPLVIVPM :: :: :... :.. .:::: :..:. .. ::.:.:: . . :.. . : . CCDS27 PPVEQPLPRHHALREAPDSLPEFTVQMGNLRFSLGHVQYDGESPGAFPVAAQVGLGVGTS 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KSD VVVIAVSVYC--YWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDV .....: . : :::.:: :.:.:.. :::.:: :::::::::::::: :: : :.:. CCDS27 LLALGVIIIVLMYRRKSKQALRDYKKVQIQLENLESSVRDRCKKEFTDLMTEMTDLTSDL 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KSD HEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKS .::: ::::.:..:.:: : : .. . : .:: :::.:::.: :.::::::: CCDS27 LGSGIPFLDYKVYAERIFF-P---GHRESPLHRDLGVPESRRPTVEQGLGQLSNLLNSKL 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KSD FLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKNPK :: .::::::.:: :::: ..: ::::::::::::::.:::..::. .:. ::: ::::: CCDS27 FLTKFIHTLESQRTFSARDRAYVASLLTVALHGKLEYFTDILRTLLSDLVAQYV-AKNPK 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KSD LMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYT :::::.:::::..:.:::::::: ...::.::::: ::..:::::.:::::.: ::::: CCDS27 LMLRRTETVVEKLLTNWMSICLYTFVRDSVGEPLYMLFRGIKHQVDKGPVDSVTGKAKYT 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KSD LNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQ-DEGV---DAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQP :::. :: .:::: :::..... :. ...:::::.::::::.:::..::.:.: : CCDS27 LNDNRLLREDVEYRPLTLNALLAVGPGAGEAQGVPVKVLDCDTISQAKEKMLDQLYKGVP 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KSD CSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQ-ILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLILSKVG . : : .. .::: : ... :::: :.::. .: :.:.:::.::.: ::::. : CCDS27 LTQRPDPRTLDVEWRSGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCL 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KSD VSQQPEDSQQDLPGERHALLEEEN----RVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVK--EKERTKA ... ...:. .:::: .::. . : ::::.:.:: . . .:::.. :.::.:: CCDS27 TKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKPSDEPEPPRPRRGSLRGGERERAKA 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KSD ITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTI : :::::::::.:::::.:::..:: .:. .. :: :::::::.:::::..:.:.:.::: CCDS27 IPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILSTSRPVPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTI 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KSD HIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPS :::::::::::::.::.:::.:.:::.. . .:: : ::::::::::: ..:::.:::: CCDS27 HIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMDAVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPI 1980 1990 2000 2010 2020 2030 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KSD NKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQ ::::::..: ::.::: :: ::: : .:::.::. :::.: .. .:.. ::::.::. CCDS27 NKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQEMNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYK 2040 2050 2060 2070 2080 2090 1800 1810 1820 1830 pF1KSD YTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL : .::::.::.::::: .::::::..::::::::.::::::: CCDS27 YINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAAAVENKVTDL 2100 2110 2120 2130 >-- initn: 437 init1: 260 opt: 572 Z-score: 589.7 bits: 122.6 E(32554): 1.6e-26 Smith-Waterman score: 572; 40.4% identity (66.0% similar) in 265 aa overlap (10-266:8-268) 10 20 30 40 50 pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLD---FFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQL :: : :: : . : : . :.::: : .::..::::.: :.:: CCDS27 MPALGPALLQALWAGWVLTLQPLPPTAFTPNGTYLQHLARDPTSGTLYLGATNFLFQL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD DAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFK . :::: :.:::.::.. : ::. ..: .:. :.: :::::..: :: :::. . CCDS27 SPGLQLEATVSTGPVLDSRDCLPPVMPDECPQAQPTNNPNQLLLVSPG--ALVVCGSVHQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD GICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKGNGPH :.: : :... :. . :. ..::.:: .:.:::::.. : .:. .::::.: . CCDS27 GVCEQRRLGQLEQLLLRPERPGDTQYVAANDPAVSTVGLVAQ-GLAGEPLLFVGRGYTSR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KSD D--NGII-VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQ .:: ..:: : : . :: .: . : .: :: ...::.:: : ..:.: . CCDS27 GVGGGIPPITTRALWPPDPQAAF-SYEETAKLAVGRLSEYSHHFVSAFARGASAYFLFLR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KSD QD-KHPARN-RTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRV .: . .: :. ..:.: .: .::::.:. : : CCDS27 RDLQAQSRAFRAYVSRVCLRDQHYYSYVELPLACEGGRYGLIQAAAVATSREVAHGEVLF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KSD LYAVFSRDSRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCG CCDS27 AAFSSAAPPTVGRPPSAAAGASGASALCAFPLDEVDRLANRTRDACYTREGRAEDGTEVA 300 310 320 330 340 350 >>CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896 aa) initn: 1966 init1: 708 opt: 1282 Z-score: 1335.0 bits: 260.3 E(32554): 4.9e-68 Smith-Waterman score: 3312; 33.8% identity (62.5% similar) in 1937 aa overlap (16-1831:33-1892) 10 20 30 40 pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGV ::.. .: : :. :.::.: : .: CCDS33 LPPRSLQVLLLLLLLLLLLPGMWAEAGLPRAGGGSQPPFRTFSASDWGLTHLVVHEQTGE 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KSD VYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQC-HEAEMTDNVNQLLLLDP ::.:::: .:.:...: : . .:::. ::.:: :: ...: : :::::.::::: CCDS33 VYVGAVNRIYKLSGNLTLLRAHVTGPVEDNEKCYPPPSVQSCPHGLGSTDNVNKLLLLDY 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KSD PRKRLVECGSLFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPG- .::. ::: .::: . :... ..: : .. ...: .:. . .:.. . :: CCDS33 AANRLLACGSASQGICQFLRLDDL-FKL-GEPHHRKEHYLSSVQEAGSMAGVLIAGPPGQ 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KSD GDRVLFVGKG-NGPHDN-GIIVSTRLLDRTDSREAFE-AYTDHATYKAGYLSTNTQQ--- :. :::: .: . . : ::. .. . : .: :. . . . ..: . CCDS33 GQAKLFVGTPIDGKSEYFPTLSSRRLMANEEDADMFGFVYQDEFVSSQLKIPSDTLSKFP 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 pF1KSD -----FVAAFEDGPYVFFVFNQQDKH---PARN-----RTLLARMCREDPNYYSYLEMDL .: .:.. .:... : : . : . ..:.: .::..:::.:. . CCDS33 AFDIYYVYSFRSEQFVYYLTLQLDTQLTSPDAAGEHFFTSKIVRLCVDDPKFYSYVEFPI 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 pF1KSD QCRDP--------DIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGPG--AGLCLF :.. : . . : :: ... . ::..::.. ... : ..:::: CCDS33 GCEQAGVEYRLVQDAYLSRPGRALAHQLGLAEDEDVLFTVFAQGQKNRVKPPKESALCLF 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KSD PLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLG : .. :.. ..:: : :.. . .. .. : . . .: ::.. . ::: CCDS33 TLRAIKEKIKERIQSCYRG--EGKLSLPWLLNKELGCINSPLQIDDDF-CGQD-FNQPLG 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KSD SRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYL---TPDGTSS-EYD . ..:: .. .::::.. ..::.: :: .::: :. . .: : . :. CCDS33 GTVTIEGTPLFVDKDDGLTAVAAYDYRGRTVVFAGTRSGRIRKILVDLSNPGGRPALAYE 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KSD SILVEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCV :.... .. . :::::: . :::::. .: :.::. :..: .: : :.::.::::: CCDS33 SVVAQEGSPILRDLVLSPNHQYLYAMTEKQVTRVPVESCVQYTSCELCLGSRDPHCGWCV 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 pF1KSD VEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMS-RRAQGEVQLTVSPLPALSE ... :.:. : ::.: ... . .:: .: .::.:.: .: . : . .: :: CCDS33 LHSICSRRDACERADEPQRFA-ADLLQCVQLT-VQPRNVSVTMSQVPLVLQAWNVPDLSA 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 pF1KSD EDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSSIPVTPP--GQ-DHVAVTIQLLLRRGNIFLT . : : . . .: . : :::. :.: :: :. .: . : .. . .. CCDS33 --GVNCSFEDFTESESVLEDGRIHCRSPSAREVAPITRGQGDQRVVKLYLKSKETGKKFA 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 pF1KSD SYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNPEDGIVRAHMEDSC : .. ::.: :.... :.:::.. . :.: : : . . :... ..: CCDS33 SVDFVFYNC----SVHQS--CLSCVNGSFPCHWCKYRHVCTHNVADCAFLEGRVNVSEDC 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 pF1KSD PQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTP ::.: . . .:.. ... ..:: . .: . : . : : : . . .. : . CCDS33 PQILPSTQIYVPVGVVKPITLAARNLP--QPQSGQRGYECL-FHIPGSPARVTALRFNSS 710 720 730 740 750 760 730 740 750 760 770 pF1KSD KL-------SHDANET--LPLHLYVKSYGK-NIDSKLHVT--LYNCSFGRSDCSLCRAAN .: :...:.. ::..: : :. ::. .. ::.: : .:.:: :. CCDS33 SLQCQNSSYSYEGNDVSDLPVNLSVVWNGNFVIDNPQNIQAHLYKCPALRESCGLCLKAD 770 780 790 800 810 820 780 790 800 810 820 pF1KSD PDYRCAWCGGQSRCVYEALCNT------------TSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRIT : ..:.:: .. :: . : . .:.: : : ...::::: :: :.: CCDS33 PRFECGWCVAERRCSLRHHCAADTPASWMHARHGSSRCTDPKILKLSPETGPRQGGTRLT 830 840 850 860 870 880 830 840 850 860 870 880 pF1KSD ILGSNLGVQAGDIQRISV-AGRN-CSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGK : : :::.. :. :..: .:. :: .: . .::: : : . . . :.: . CCDS33 ITGENLGLRFEDV-RLGVRVGKVLCSPVESEYISAEQIVCEIGDASSVRAHDALVEVCVR 890 900 910 920 930 940 890 900 910 920 930 pF1KSD LGRSP------PNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNG :: :. .::: : : :..:: .::: . :.:.::..:: :: :...: CCDS33 -DCSPHYRALSPK-RFTFVTPTFYRVSPSRGPLSGGTWIGIEGSHLNAGS--DVAVSVGG 950 960 970 980 990 940 950 960 970 980 990 pF1KSD VPCKVT-KFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRS ::. . . . ...:.: : . :. . .. . . . :: . ..: :.:.. ..: : CCDS33 RPCSFSWRNSREIRCLTPPGQSPGSAPIIININRAQLTNPEVKYNYTEDPTILRIDPEWS 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD FASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEP-LQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTK . ::: ..::: ... .. :: ... : :. : . .::: CCDS33 INSGGTLLTVTGTNLATVR--------EPRIRAKYGGIEREN-------GC--LVYNDTT 1060 1070 1080 1090 1100 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD VVFLSPAV-------PEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENF--TGG .: .:.: :: : . .. ::. :.:: .. .: : :::..: . :: CCDS33 MVCRAPSVANPVRSPPELGERPDELGFV-MDNVRSLLVLNSTSFLYYPDPVLEPLSPTGL 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KSD VKKQVNKLIHARGTNL---NKAMTLQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKR .. . .. . .: :: . . . ...:. ::. :..::.: :: :.. CCDS33 LELKPSSPLILKGRNLLPPAPGNSRLNYTVLIGSTPCTL-TVSETQLLCEAPNLTG---- 1170 1180 1190 1200 1210 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD RQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVI-------VPMVVVI :.. : :. :. :. : .. :: :.: : .. . ..:.. CCDS33 -QHKVT--------VRAGGFEFSPGTLQV---YSDSLLTL--PAIVGIGGGGGLLLLVIV 1220 1230 1240 1250 1260 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD AVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIP :: . : :::..:.: .... :...:: : .::. :..:. .... :::. :::: CCDS33 AVLI-AYKRKSRDADRTLKRLQLQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTNDLDGAGIP 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KSD VLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFI :::.::. ::.: : : .: . .... . ::..: :..::..: ::..:: CCDS33 FLDYRTYAMRVLF-P---GIEDHPVLKEMEV----QANVEKSLTLFGQLLTKKHFLLTFI 1330 1340 1350 1360 1370 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KSD HTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PKLMLRR .::: :: :: : . :::. .::.:..:: : ... :. .:.:. . .:: :::.::: CCDS33 RTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLESKNHPKLLLRR 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KSD SETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTG .:.:.:.::.::... ::..::. :::::. :. :::.:.::::.::. .:.:.:.. CCDS33 TESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDK 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KSD LLGDDVEYAPLTVSVIV-QDEGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPD :. ....: ::.. . ..:.. .::: :.:::..:.:::..: .:.: : : :. CCDS33 LIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAKEKLLDAAYKGVPYSQRPKAA 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KSD SVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL-----SKVGVSQ .. :::: : :.: :.: :.:.. .. :::.::: ::.: ::... : : ..:. CCDS33 DMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVPKQTSAYNISN 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1570 1580 1590 1600 pF1KSD QPE--------------DSQQDLPGERHAL----LEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGS . :. : : . :: ...::::. :..:. .. ::: CCDS33 SSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDHLDQREGDRGS 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KSD VKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGH---AVPPAVKYFFDFLDEQ : ..::::::::..:::::.:::..:..... .: :.: :.::.::::::: CCDS33 -------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQ 1680 1690 1700 1710 1720 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KSD AEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACT :.::.:.: :. : ::.: ::::::::..:::.:.::.: . ..:: :::.::::::.:. CCDS33 ADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCS 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KSD RTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDS .::::..:::::::::::.: .::. :: :: : .: .:::::...::: :: : .. CCDS33 TSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRLHLSQ 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KSD LNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL .:.. :::..:.: :: :::. :::.: :....: .:.:.. .. CCDS33 FNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS 1850 1860 1870 1880 1890 >>CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871 aa) initn: 2013 init1: 712 opt: 1235 Z-score: 1285.8 bits: 251.2 E(32554): 2.7e-65 Smith-Waterman score: 3236; 33.0% identity (62.3% similar) in 1928 aa overlap (8-1827:6-1863) 10 20 30 40 50 pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASL--RPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLD : :: .:..:..: :: . : .. :.:::: ...: :..:::: ...: CCDS14 MPSVCLLLLLFLAVGGALGNRPFRA-FVVTDTTLTHLAVHRVTGEVFVGAVNRVFKLA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD AKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQC-HEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFK .: . .:::. :: .: :: : :. .::.:.:::.: .::: :::... CCDS14 PNLTELRAHVTGPVEDNARCYPPPSMRVCAHRLAPVDNINKLLLIDYAARRLVACGSIWQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KSD GICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKG-NGP ::: . :... ..: : .. .... .: . .:.. : : .. :::: . .: CCDS14 GICQFLRLDDL-FKL-GEPHHRKEHYLSGAQEPDSMAGVIVEQGQGPSK-LFVGTAVDGK 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KSD HDNGIIVSTR-LLDRTDSREAFE-AYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFE--------DGP . .:.: :.. :: . : .: :. . . . ..: .. ::. .. CCDS14 SEYFPTLSSRKLISDEDSADMFSLVYQDEFVSSQIKIPSDTLSLYPAFDIYYIYGFVSAS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KSD YVFFVFNQQDKHPARNRTL--------LARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDI------- .:.:. : : . . : ..::: : ..:::.:. . : . CCDS14 FVYFLTLQLDTQQTLLDTAGEKFFTSKIVRMCAGDSEFYSYVEFPIGCSWRGVEYRLVQS 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 pF1KSD -HAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGPGAG--LCLFPLDKVHAKMEANRN : : : :: ....:.. ::...::. ... ..: :::: :....:... . CCDS14 AHLAKPGLLLAQALGVPADEDVLFTIFSQGQKNRASPPRQTILCLFTLSNINAHIRRRIQ 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KSD ACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRG .:: : :. . .. .. : . . .: :: : :::. ..: .: . CCDS14 SCYRG--EGTLALPWLLNKELPCINTPMQINGNF-CGLV-LNQPLGGLHVIEGLPLLADS 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KSD GLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSG ....:.. . .:.:.:.:: .: . :: . . :... : .. . :::..: CCDS14 TDGMASVAAYTYRQHSVVFIGTRSGSLKKVRVDGFQDAHLYETVPVVDGSPILRDLLFSP 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KSD DLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEAS : .: ... .: .:::. : .: .:. : : ::.:::::.. :: :.. : : : CCDS14 DHRHIYLLSEKQVSQLPVETCEQYQSCAACLGSGDPHCGWCVLRHRCCREGACLGAS-AP 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 pF1KSD HWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVS--PLPALSEEDELLCLFGESPPHPAR : . . ..:: : ..:.:.: . : :::::. .: :: . : : . . : CCDS14 HGFAEELSKCVQVR-VRPNNVSVTSPG-VQLTVTLHNVPDLSA--GVSCAFEAAAENEAV 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 pF1KSD V--EGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVA---VTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSL . :: ..: ::: . . : : : .::: .. .. ... .. ::.: .: CCDS14 LLPSGE-LLCPSPSLQELRALTRGHGATRTVRLQLLSKETGVRFAGADFVFYNCSVLQS- 590 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 pF1KSD EENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHEC--REASPNPEDGIVRAHMEDSCPQFLGPSPLVIPM :.:::.. . :.: : : : . ..: :.: ..::..: . :.::. CCDS14 -----CMSCVGSPYPCHWCKYRHTCTSRPHECSFQEG--RVHSPEGCPEILPSGDLLIPV 650 660 670 680 690 680 690 700 710 720 730 pF1KSD NHETDVNFQGKNLDTVKGSSLH----VGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTPKLSHDANE- . .....::: .... . : . . :.. .:.. .. . :....: CCDS14 GVMQPLTLRAKNLPQPQSGQKNYECVVRVQGRQQRVPAVRFNSSSVQCQNASYSYEGDEH 700 710 720 730 740 750 740 750 760 770 780 790 pF1KSD -TLPLHLYVKSYGK-NIDS--KLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQSRCVY : . : : ::. .... ::.: : .:.:: :.: . :.:: .. :: CCDS14 GDTELDFSVVWDGDFPIDKPPSFRALLYKCWAQRPSCGLCLKADPRFNCGWCISEHRCQL 760 770 780 790 800 810 800 810 820 830 pF1KSD EALCNTT-----------SECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRIS .. : . ..: : ::.:.: .:: :: :.::.: :::. . .. . CCDS14 RTHCPAPKTNWMHLSQKGTRCSHPRITQIHPLVGPKEGGTRVTIVGENLGLLSREVG-LR 820 830 840 850 860 870 840 850 860 870 880 890 pF1KSD VAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAA--ETPFTGGVEVDVFGKLG---RSPPNVQFTFQQ ::: :. : .: . :::: .: . .: : ::. : : . :. . ..: CCDS14 VAGVRCNSIPAEYISAERIVCEMEESLVPSPPPGPVELCV-GDCSADFRTQSEQVYSFVT 880 890 900 910 920 930 900 910 920 930 940 950 pF1KSD PKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVTKFGAQ-LQCVTGPQ : .: :..:: .::: ::: :. ::.::. : ::. :. .. :. . :.. : CCDS14 PTFDQVSPSRGPASGGTRLTISGSSLDAGSR--VTVTVRDSECQFVRRDAKAIVCIS-PL 940 950 960 970 980 990 960 970 980 990 1000 1010 pF1KSD ATRG--QMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLI .: : : . .. . . .::...:: ..:.. .:: :. .:. .:.:.: . . CCDS14 STLGPSQAPITLAIDRANISSPGLIYTYTQDPTVTRLEPTWSIINGSTAITVSGTHLLTV 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD QRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSPAVP----EEPEAY : :: . : :. . :.. : .. . .::. : :.:. . CCDS14 Q--------EP-RVRAKYRGIETTNTCQVIN-DTAMLCKAPGIFLGRPQPRAQGEHPDEF 1060 1070 1080 1090 1100 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KSD NLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENF--TGGVKKQVNKLIHARGTNLNKAM-- .. .: ... :.: :. .: : :::.:: . .: . . .. . .: :: : CCDS14 GF-LLDHVQTARSLNRS---SFTYYPDPSFEPLGPSGVLDVKPGSHVVLKGKNLIPAAAG 1110 1120 1130 1140 1150 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KSD -TLQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREW . . ...:.. :.. :...:.: :. .: :: : ... : . : CCDS14 SSRLNYTVLIGGQPCSL-TVSDTQLLCD----SPSQTGRQ--------PVMVLVGGLEFW 1160 1170 1180 1190 1200 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KSD VLGRVEYDT-RVSDVPLSLILPLVIVPMVVVIAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGL :: .. .. :. .: . : ....:.. . : ::.:.:.: .... :...: CCDS14 -LGTLHISAERALTLPAMMGLAAGGGLLLLAITAVLVAYKRKTQDADRTLKRLQLQMDNL 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD EESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGK : : .::. :..:. .... :: . :. :: :::.::. ::.: :. .. . . CCDS14 ESRVALECKEAFAELQTDINELTNHMDEVQIPFLDYRTYAVRVLF-PGIEAHP---VLKE 1270 1280 1290 1300 1310 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KSD LDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGK :: : : ::.:: :..::.:..:...:::::: : :: : . ::: :::... CCDS14 LDTP----PNVEKALRLFGQLLHSRAFVLTFIHTLEAQSSFSMRDRGTVASLTMVALQSR 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KSD LEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEP :.: : ... :. .:.:. . .:: :::.:::.:.:.:.::.::... :...::. :::: CCDS14 LDYATGLLKQLLADLIEKNLESKNHPKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLHKFLKECAGEP 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KSD LYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIV-QDEGVDAIPV :. :. :::.:.::::.::. .:.:.:.. :. ....: ::. . ..:: .:: CCDS14 LFLLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQIDYKTLTLHCVCPENEGSAQVPV 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KSD KVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQREGR ::::::.:.:.:.:..: ::.: : : :. ... :::: : ..: :.: :.:.. : CCDS14 KVLNCDSITQAKDKLLDTVYKGIPYSQRPKAEDMDLEWRQGRMTRIILQDEDVTTKIECD 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1540 1550 1560 1570 pF1KSD WKRVNTLMHYNVRDGATLILSKVGVS--------------QQPED-----SQQDLPGERH :::.:.: ::.: ::. . : :: .. :. :. : : CCDS14 WKRLNSLAHYQVTDGSLVALVPKQVSAYNMANSFTFTRSLSRYESLLRTASSPDSLRSRA 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KSD ALL----EEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQF .. : ...::::. :..:. .. ::: : ..::::::::..:::::.: CCDS14 PMITPDQETGTKLWHLVKNHDHADHREGDRGS-------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKF 1620 1630 1640 1650 1660 1640 1650 1660 1670 1680 1690 pF1KSD VDNFFQSVLAPGH---AVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNI ::..:..:.. .: :.: :.::.::::::::....:.: :. : ::.: ::::::::. CCDS14 VDDLFETVFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADQRQISDPDVRHTWKSNCLPLRFWVNV 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1700 1710 1720 1730 1740 1750 pF1KSD LKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMV .:::.:.::.: . ..:: :::.::::::.:. .::.:..:::::::::::.: .::. : CCDS14 IKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWV 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1760 1770 1780 1790 1800 1810 pF1KSD EDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEED : ::. : .:...:::::...:.: :: :......: ::..:: :. :: .::..::..: CCDS14 ERYYRDIAKMASISDQDMDAYLVEQSRLHASDFSVLSALNELYFYVTKYRQEILTALDRD 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1820 1830 pF1KSD PAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL . .: .: .:.:: CCDS14 ASCRKHKLRQKLEQIISLVSSDS 1850 1860 1870 >>CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894 aa) initn: 2251 init1: 718 opt: 1128 Z-score: 1173.5 bits: 230.5 E(32554): 4.8e-59 Smith-Waterman score: 3315; 33.3% identity (62.8% similar) in 1934 aa overlap (24-1831:37-1890) 10 20 30 40 50 pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKE---LNHLAVDEASGVVYLGA ... :.::.. .:::.: ...:.::.:: CCDS31 WPRALEVDSRSVVLLSVVWVLLAPPAAGMPQFSTFHSENRDWTFNHLTVHQGTGAVYVGA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KSD VNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEA-EMTDNVNQLLLLDPPRKRL .: .:.: ..: .. ::: :::.: ::. .. : :. .:.:::.::..: ..:: CCDS31 INRVYKLTGNLTIQVAHKTGPEEDNKSCYPPLIVQPCSEVLTLTNNVNKLLIIDYSENRL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KSD VECGSLFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVAS-NDEGVATVGLVSSTGPGGDRVL . ::::..:.: : :.. : .. : . .. ...: : :. .: : : : : CCDS31 LACGSLYQGVCKLLRLDD--LFILVEPSHKKEHYLSSVNKTGTMYGVIVRSEGEDGK--L 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KSD FVGKG-NGPHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLS--TNTQQFVAAFE-- :.: . .: .: .:.: : : :. : :. . .. .. ..: .:. :. CCDS31 FIGTAVDGKQDYFPTLSSRKLPRDPESSAMLDYELHSDFVSSLIKIPSDTLALVSHFDIF 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 pF1KSD ------DGPYVFFVFNQQDKHP--ARNR-------TLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRD .: .:.:. : . : : . ..:.:..::...::. . . : CCDS31 YIYGFASGGFVYFLTVQPETPEGVAINSAGDLFYTSRIVRLCKDDPKFHSYVSLPFGCTR 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 pF1KSD PDIH----AAAF----GTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGP--GAGLCLFPLDK .. ::. : :: . .. ::.:.::. ... : ..:: ::. CCDS31 AGVEYRLLQAAYLAKPGDSLAQAFNITSQDDVLFAIFSKGQKQYHHPPDDSALCAFPIRA 310 320 330 340 350 360 320 330 340 350 360 370 pF1KSD VHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDG .. ... ..:: : :. . . :.:: .:: . :: . . :::. CCDS31 INLQIKERLQSCYQG--EGNLELNWLLGKDVQCT-KAPVPIDDNFCGLD-INQPLGGSTP 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KSD LRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLT-PDGTSSEYDSILV-EI ..: .. . .:.:. . :...:.:.::..:.. :. : . .:. . : . CCDS31 VEGLTLYTTSRDRMTSVASYVYNGYSVVFVGTKSGKLKKIRADGPPHGGVQYEMVSVLKD 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KSD NKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCT .. . ::...: : ::.:.. .: :.::. : .: :: .: .: ::.::::.... :. CCDS31 GSPILRDMAFSIDQRYLYVMSERQVTRVPVESCEQYTTCGECLSSGDPHCGWCALHNMCS 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 550 pF1KSD RKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEV-QLTVSPLPALSEEDELLC :. .: .: : ... : :. ::.. ...:...: .... .:.:: : :: . : CCDS31 RRDKCQQAWEPNRFAASISQ-CVSL-AVHPSSISVSEHSRLLSLVVSDAPDLSAG--IAC 540 550 560 570 580 590 560 570 580 590 600 610 pF1KSD LFGESPPHPARVEGEAVICNSPS--SIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRR-GNIFLTSYQYPF ::. ..: : ::: ::. ..:: : :: .. .:: .. :.::... .. : CCDS31 AFGNLTEVEGQVSGSQVICISPGPKDVPVIPLDQDWFGLELQLRSKETGKIFVST-EFKF 600 610 620 630 640 650 620 630 640 650 660 pF1KSD YDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNP---EDGIVRAHMEDSCPQF :.: .: .: :.:::.. . :.: . : . .:. ..: : .. ..:::. CCDS31 YNC-SAHQL-----CLSCVNSAFRCHWCKYRNLCTH-DPTTCSFQEG--RINISEDCPQL 660 670 680 690 700 670 680 690 700 710 720 pF1KSD LGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSS------LHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAF . ..::... ......:: .... :.. . . . :. .:.. CCDS31 VPTEEILIPVGEVKPITLKARNLPQPQSGQRGYECVLNIQGAIHRV--PALRFNSSSVQC 710 720 730 740 750 760 730 740 750 760 770 pF1KSD RTPKLSHDANETLPLHL-YVKSYGKN--IDSK--LHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYR .. . ..:. . : . .. .. : ::. :.: ::.:. : .:.:: :. .. CCDS31 QNSSYQYDGMDISNLAVDFAVVWNGNFIIDNPQDLKVHLYKCAAQRESCGLCLKADRKFE 770 780 790 800 810 820 780 790 800 810 820 pF1KSD CAWCGGQSRCVYEALCNTTS-----------ECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSN :.::.:. ::. . :.. : .: : ::.: .:: :: :.:: : : CCDS31 CGWCSGERRCTLHQHCTSPSSPWLDWSSHNVKCSNPQITEILTVSGPPEGGTRVTIHGVN 830 840 850 860 870 880 830 840 850 860 870 880 pF1KSD LGVQAGDI-QRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPP ::.. ..: ....::: :. : .: .. .::: . : . :.: : .:. : CCDS31 LGLDFSEIAHHVQVAGVPCTPLPGEYIIAEQIVCEMGHALVGTTSG---PVRLCIGECKP 890 900 910 920 930 890 900 910 920 930 940 pF1KSD NV------QFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLNGVPCKVT . :.:: .:. ::..: .::..::: .:: : .: .::. : : :.. :. CCDS31 EFMTKSHQQYTFVNPSVLSLNPIRGPESGGTMVTITGHYLGAGSS--VAVYLGNQTCEFY 940 950 960 970 980 990 950 960 970 980 990 pF1KSD -KFGAQLQCVTGPQATR-GQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLRSFASGG . ... ::. :... : . . :: . : . .. : : ..: .. .:: :.::: CCDS31 GRSMSEIVCVSPPSSNGLGPVPVSVSVDRAHV-DSNLQFEYIDDPRVQRIEPEWSIASGH 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KSD RSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGTDYVFHNDTKVVFLSP ...:: : . :: :: . . ::.. :: : : .. :.: CCDS31 TPLTITG--------FNLDVIQEPRIRVKFNGK-ESVNVCKVV-------NTTTLTCLAP 1060 1070 1080 1090 1100 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD AV-----P-----EEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENF--TGGVKK .. : :.:. .... ... ..:: . : : :.:::: . :: . . CCDS31 SLTTDYRPGLDTVERPDEFGFV----FNNVQSLLIYNDTKFIYYPNPTFELLSPTGVLDQ 1110 1120 1130 1140 1150 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KSD QVNKLIHARGTNLNKAMT---LQEAEAFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPPPKRRQK . .. : .: :: . . ...: :.. :..::.: ::::.. : CCDS31 KPGSPIILKGKNLCPPASGGAKLNYTVLIGETPCAV-TVSETQLLCEPPNLTGQHK---- 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD RDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVIVP----MVVVIAVSVYC .:. :. . : : . .:: :.: . :. ..... . . CCDS31 ---------VMVHVGGMVFSPGSV---SVISDSLLTLPAIVSIAAGGSLLLIIVIIVLIA 1220 1230 1240 1250 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD YWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKT : :::.. . .... :...:: : .::. :..:. .... :.:. ..::: :::.: CCDS31 YKRKSRENDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDINELTSDLDRSGIPYLDYRT 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KSD YTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQ :. ::.: : : .: . .:.. . ::.:: :..:.:.: ::..::.::: : CCDS31 YAMRVLF-P---GIEDHPVLRELEVQGNGQQHVEKALKLFAQLINNKVFLLTFIRTLELQ 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KSD REFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PKLMLRRSETVVE : :: : . :::. ..:.:.::: ::... :. .:... . :: :::.:::.:.:.: CCDS31 RSFSMRDRGNVASLIMTGLQGRLEYATDVLKQLLSDLIDKNLENKNHPKLLLRRTESVAE 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KSD RMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDV .::.::... :...::. :::::. :. :::.:.::::.::. .:.:.:.. :. ... CCDS31 KMLTNWFAFLLHKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDKLIRQQI 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KSD EYAPLTVSVIVQD-EGVDAIPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEW :: : .. . : :. :::::::::::.::::::.: ::.. : : :: .. ::: CCDS31 EYKTLILNCVNPDNENSPEIPVKVLNCDTITQVKEKILDAVYKNVPYSQRPRAVDMDLEW 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KSD RPGSTAQI-LSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL----------------SK : : :.. :.: :.:.. :: :::.::::::.: : ... : :. CCDS31 RQGRIARVVLQDEDITTKIEGDWKRLNTLMHYQVSDRSVVALVPKQTSSYNIPASASISR 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KSD VGVSQQPEDSQQDLPGERHAL----------LEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRGSVKE ...:. ::. : .: :: .:::::. :. :. .. ::: CCDS31 TSISRY--DSSFRYTGSPDSLRSRAPMITPDLESGVKVWHLVKNHDHGDQKEGDRGS--- 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KSD KERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAP---GHAVPPAVKYFFDFLDEQAEK : ..::::::::..:::::.:::..:..... : :.: :.::.::::::::.. CCDS31 ----KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETLFSTVHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADR 1680 1690 1700 1710 1720 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KSD HNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTE :.:.: :. : ::.: ::::::::..:::.:.::.: ..:: :::.::::::.:. .: CCDS31 HSIHDTDVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKGSITDACLSVVAQTFMDSCSTSE 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KSD HKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNT :.:..:::::::::::.: .::. :: :: : .. .::::::..::: :: :. .: CCDS31 HRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKSWVERYYADIAKLPAISDQDMNAYLAEQSRLHAVEFNM 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KSD LVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL : ::...:.:..:: .:.:.:::.: :....::....:. :. CCDS31 LSALNEIYSYVSKYSEELIGALEQDEQARRQRLAYKVEQLINAMSIES 1850 1860 1870 1880 1890 >>CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568 aa) initn: 1407 init1: 606 opt: 1126 Z-score: 1172.6 bits: 230.0 E(32554): 5.4e-59 Smith-Waterman score: 1458; 26.4% identity (53.3% similar) in 1864 aa overlap (8-1819:19-1549) 10 20 30 40 pF1KSD MALQLWALTLLG-LLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYL : ::. ::. .: : .:::. .. .:... .:: .. CCDS90 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWRSEQAIGAIAASQEDGV-FV 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KSD GAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKR .. . : ::: .::.... . .:: :. . . . .. ..::: : :. CCDS90 ASGSCLDQLD--YSLEHSLSRLYRDQAGNCTEPVSLAPPARPRPGSSFSKLLL--PYREG 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KSD LVECGSLF-------KGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTG . :.:. .: : .: :.:.: : ..:. :. . .: .:.:.: .: CCDS90 AAGLGGLLLTGWTFDRGACEVRPLGNLS-RNSLRNGT---EVVSCHPQG-STAGVVYRAG 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KSD PGGDRVLFVGKGNG-PHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDH--ATYKAGYLS----TN .. : :. :. . . . :. :.. . :: . : :. .. CCDS90 RNNRWYLAVAATYVLPEPETASRCNPAASDHDTAIALKDTEGRSLATQELGRLKLCEGAG 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KSD TQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQD--KHPARNRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRD--PD . .:: :: . ..: . . . : . .::. . .. . .:.: :: CCDS90 SLHFVDAFLWNGSIYFPYYPYNYTSGAATGWPSMARIAQSTEVLFQG-QASLDCGHGHPD 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KSD IHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNAC . ... :. .. . .. :. :. .. .. . ..:::: .....:. . CCDS90 GRRLLLSSSLVEALDVWAG--VFSAAAGEGQERRSPTTTALCLFRMSEIQARAK------ 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 pF1KSD YTGTREARDIFYKPFHGDIQCG-GHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGG : . :. : : : : . : .: : . .. .. ::.:..: CCDS90 ----RVSWDFKTAESH----CKEGDQPERVQ--PIASSTLIH--SDLTSVYGTVVMNR-- 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KSD LNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLSGD :: ::::.::..::: : . ::. . .. ::.... : : CCDS90 --------------TVLFLGTGDGQLLKVILGENLTSNCPE-VIYEIKEETPVFYKLVPD 390 400 410 420 430 450 460 470 480 490 500 pF1KSD -LGSLYA-MTQDK-VFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEE . ..: .: : : :. : .: .. .:..: . ::.:::: ::: ...: ..:. CCDS90 PVKNIYIYLTAGKEVRRIRVANCNKHKSCSECLTATDPHCGWCHSLQRCTFQGDCVHSEN 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KSD ASHWL--WSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHP .:: : .:.: :. .:. : :.: . . : : CCDS90 LENWLDISSGAKKC-------PK---------IQIIRS-----SKEKTTVTMVGSFSP-- 500 510 520 570 580 590 600 610 620 pF1KSD ARVEGEAVICNSPSSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEEN :.. . .: CCDS90 ---------------------------------------------------RHSKCMVKN 530 630 640 650 660 670 680 pF1KSD LPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNPEDGIVRAHMEDSCPQFLGPSPLVIPMNHETD . :.: :: ...:: :. .: :: : CCDS90 VD-----SSRELCQ--------NKSQPN------RTC---TCS---------IP----TR 540 550 560 690 700 710 720 730 740 pF1KSD VNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTPKLSHDANETLPLHLYVKS ... :....:. .: :.: . .:: : : CCDS90 ATY--KDVSVVN-----------------VM-----FSFGSWNLSDRFNFT--------- 570 580 590 750 760 770 780 790 800 pF1KSD YGKNIDSKLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANPDYRCAWCGGQSRCVYEALCNTTSECPPPV ::: . ..: : .. :::: . ::.. . : : CCDS90 --------------NCS-SLKECPACVETG----CAWCKSARRCIHP-----FTACDPSD 600 610 620 810 820 830 840 850 860 pF1KSD ITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVIEA : : : :.. ... : .:: . .: . .: CCDS90 YERNQ-EQCPVA------------------VEKTSGGGRPKENKGNRTN---------QA 630 640 650 870 880 890 900 910 920 pF1KSD AETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGS .. . ..: . . ::.: :: : . .:.. :. ..:: .: . CCDS90 LQVFYIKSIEPQKVSTLGKS--NVI----------VTGANFTRASNITMILKGT--STCD 660 670 680 690 700 930 940 950 960 970 980 pF1KSD QEDVRVT--LNGVPCKVTKFGAQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYREN .. ..:. :: . : . :.. . . . ... :. . : . .: CCDS90 KDVIQVSHVLNDTHMKFSL----------PSSRKEMKDVCIQFDGGNCSSVGSL-SYIAL 710 720 730 740 750 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KSD PVLRAFEPLRSFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAMVVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVG : . : .. :::..:.. :..:..:. . .:.. :.. .. CCDS90 PHCSLIFPATTWISGGQNITMMGRNFDVIDNL---IISHELKG-------------NINV 760 770 780 790 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD TDYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENFT- ..: : ::.:.. :.:: .... . :...: :: : .. CCDS90 SEYCVA--TYCGFLAPSLKSSKVRTNVTVKLRVQD----TYLDCGTLQYREDPRFTGYRV 800 810 820 830 840 850 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KSD -GGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAEAFVGAE---RCTMKTLTE----TDLYCEPPE . : ... :. .. :.: . : : : . :.....:. : . :. CCDS90 ESEVDTELEVKIQKENDNFNISKKDIEITLFHGENGQLNCSFENITRNQDLTTILCKIKG 860 870 880 890 900 910 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD VQPPPKRRQKRDTTHNLPEFI-VKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSLILPLVIVPMVVV .. .: : . . ::.:. : :: .. : . ..::...: .:. CCDS90 IKTA-------STIANSSKKVRVKLGNLELY---VEQESVPSTWYFLIVLPVLLV-IVIF 920 930 940 950 960 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD IAVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAG- ::.: . ::.. : : ..::: :: .: . . :..:.. :. . : : CCDS90 AAVGVTRH--KSKELSR---KQSQQLELLESELRKEIRDGFAELQM---DKLDVVDSFGT 970 980 990 1000 1010 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KSD IPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLIN .: :::: .. :.:: : . : .. :. . ...: .. :. .::::.. CCDS90 VPFLDYKHFALRTFF-PESGGFTHIFTE---DMHNRDANDKNESLTALDALICNKSFLVT 1020 1030 1040 1050 1060 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KSD FIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKNPKLMLR :::::.:..::.. . :::.::.::. :: : :.:...: .:.:: .:::::: CCDS90 VIHTLEKQKNFSVKDRCLFASFLTIALQTKLVYLTSILEVLTRDLMEQ-CSNMQPKLMLR 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KSD RSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDT :.:.:::..:.::::.:: .:....:::.: : .......:::::.. :: ::::. CCDS90 RTESVVEKLLTNWMSVCLSGFLRETVGEPFYLLVTTLNQKINKGPVDVITCKALYTLNED 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KSD GLLGDDVEYAPLTVSVIVQ----DEGVDA---IPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPC :: . :.. ....:. . .:..:. : :.::.::::.:.::::. :.. .. CCDS90 WLLWQVPEFSTVALNVVFEKIPENESADVCRNISVNVLDCDTIGQAKEKIF-QAFLSKNG 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KSD SCWP-RPDSVVLEWRPGSTAQILSDLDLTSQ-REGRWKRVNTLMHYNVRDGATL-ILSKV : . . . . :: . :. . : :.: .: : ..::. ::.. .:.:. ...:. CCDS90 SPYGLQLNEIGLELQMGTRQKELLDIDSSSVILEDGITKLNTIGHYEISNGSTIKVFKKI 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KSD GVSQQPEDSQQDLPGERHALLEEENRVWHLVRPTDEV--D-EGKSKRGSVKEKERTKAIT . . . ..: : ::. : .:. : .:: .:: :.: ..: CCDS90 ANFTSDVEYSDD-----HC---------HLILPDSEAFQDVQGKRHRG--KHKFKVK--- 1310 1320 1330 1340 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KSD EIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLA-PGHAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIH :.:::.:::.: .... ....:.:. . :. .: :.:::::::: :::...: : :..: CCDS90 EMYLTKLLSTKVAIHSVLEKLFRSIWSLPNSRAPFAIKYFFDFLDAQAENKKITDPDVVH 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KSD IWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSN :::::::::::::::::::.:.::.. .:. ::::::.:::: . ::..:....:.: CCDS90 IWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIKKTPHIDGCLSVIAQAFMDAFSLTEQQLGKEAPTN 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KSD KLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQY ::::::.: :::. :..:::.::.. .:...:. :.. :. : . .: ::: ..:.: CCDS90 KLLYAKDIPTYKEEVKSYYKAIRDLPPLSSSEMEEFLTQESKKHENEFNEEVALTEIYKY 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1800 1810 1820 1830 pF1KSD TQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL ::.:::.: ::.. . .. : CCDS90 IVKYFDEILNKLERERGLEEAQKQLLHVKVLFDEKKKCKWM 1530 1540 1550 1560 >>CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894 aa) initn: 2010 init1: 701 opt: 1114 Z-score: 1158.8 bits: 227.7 E(32554): 3.2e-58 Smith-Waterman score: 3351; 33.7% identity (63.2% similar) in 1934 aa overlap (16-1827:31-1886) 10 20 30 40 pF1KSD MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKE--LNHLAVDEAS : : . :.. ::.: .:::.::: . CCDS43 MKAMPWNWTCLLSHLLMVGMGSSTLLTRQPAPLSQKQRSFVTFRGEPAEGFNHLVVDERT 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KSD GVVYLGAVNALYQLDAKLQLEQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEA-EMTDNVNQLLLL : .:::::: .:.:.. :.. ::: :: :: :: .. :.: :.:::..::. CCDS43 GHIYLGAVNRIYKLSSDLKVLVTHETGPDEDNPKCYPPRIVQTCNEPLTTTNNVNKMLLI 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KSD DPPRKRLVECGSLFKGICALRALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGP : ..::. ::::..::: : : .. ..: : .. .... .:. .. :.. : . CCDS43 DYKENRLIACGSLYQGICKLLRLEDL-FKL-GEPYHKKEHYLSGVNESGSVFGVIVSYSN 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KSD GGDRVLFVGKGNGPHDNGIIVSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQF---- :..... .: . .:.: : ... ... ::. : . :.... .. : CCDS43 LDDKLFIATAVDGKPEYFPTISSRKLTKNSEADGMFAYVFHDEFVASMIKIPSDTFTIIP 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 pF1KSD ------VAAFEDGPYVFFVFNQQDK-HPARNRTL-------LARMCREDPNYYSYLEMDL : .: .: .:.:. : . : . : :.:.:.:: . ::.:. . CCDS43 DFDIYYVYGFSSGNFVYFLTLQPEMVSPPGSTTKEQVYTSKLVRLCKEDTAFNSYVEVPI 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KSD QCRDPDIH----AAAF----GTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDSRSS--GGPGAGLCLF :. .. ::. :. :. .... . .:..:::. .. . . ..::.: CCDS43 GCERSGVEYRLLQAAYLSKAGAVLGRTLGVHPDDDLLFTVFSKGQKRKMKSLDESALCIF 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KSD PLDKVHAKMEANRNACYTGTREARDIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSKSFPCGSEHLPYPLG : ... ... ..:: : . . :. . . :: :.. . .: :: . . ::: CCDS43 ILKQINDRIKERLQSCYRG-EGTLDLAWLKVK-DIPCSSALLTIDDNF-CGLD-MNAPLG 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KSD SRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLT-PDGTSSEYDSIL : .:: :. . .:.: . . .::..::.::..:.. :. . : :.. .:... CCDS43 VSDMVRGIPVFTEDRDRMTSVIAYVYKNHSLAFVGTKSGKLKKIRVDGPRGNALQYETVQ 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KSD VEINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEG : : ::...: : .:: :.. .. :.::. : .: .: .: : ::.:::::... CCDS43 VVDPGPVLRDMAFSKDHEQLYIMSERQLTRVPVESCGQYQSCGECLGSGDPHCGWCVLHN 480 490 500 510 520 530 500 510 520 530 540 550 pF1KSD RCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKSCVAVTSAQPQNMSRRAQGEVQLTVSP--LPALSEED :::: .: :..: .. :. :.:: .: ..:.:.: .: .: :.. .: :: CCDS43 TCTRKERCERSKEPRRFA-SEMKQCVRLT-VHPNNISV-SQYNVLLVLETYNVPELSAG- 540 550 560 570 580 590 560 570 580 590 600 pF1KSD ELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSPSS--IP--VTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTS . : : . . : :. . : ::.. .: .: : :: .: .:: .. .. ..: CCDS43 -VNCTFEDLSEMDGLVVGNQIQCYSPAAKEVPRIITENG-DHHVVQLQLKSKETGMTFAS 600 610 620 630 640 610 620 630 640 650 660 pF1KSD YQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECREASPNP---EDGIVRAHMED .. ::.: :.... :.::: . . :.: : : . .:. ..: :... . CCDS43 TSFVFYNC----SVHNS--CLSCVESPYRCHWCKYRHVCTH-DPKTCSFQEG--RVKLPE 650 660 670 680 690 670 680 690 700 710 pF1KSD SCPQFLGPSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFME------PVTMQES .:::.: . ...:.. .....::: . .: . : . . .. :. .: CCDS43 DCPQLLRVDKILVPVEVIKPITLKAKNLP--QPQSGQRGYECILNIQGSEQRVPALRFNS 700 710 720 730 740 750 720 730 740 750 760 770 pF1KSD GTFAFRTPKLSHDANE--TLPLHLYVKSYGK-NIDSKLH--VTLYNCSFGRSDCSLCRAA .. .. . :... : .::..: : :. :::. . : ::.:. : .:.:: : CCDS43 SSVQCQNTSYSYEGMEINNLPVELTVVWNGHFNIDNPAQNKVHLYKCGAMRESCGLCLKA 760 770 780 790 800 810 780 790 800 810 820 pF1KSD NPDYRCAWCGGQSRCVYEALC-----------NTTSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRIT .::. :.:: : ..:. . : .. :.: : ::.: : ::: :: ..: CCDS43 DPDFACGWCQGPGQCTLRQHCPAQESQWLELSGAKSKCTNPRITEIIPVTGPREGGTKVT 820 830 840 850 860 870 830 840 850 860 870 pF1KSD ILGSNLGVQAGDI-QRISVAGRNCSFQPERYSVSTRIVCVI-EAAETPFTGGVEVDV--- : : :::.. :: ....::: .:: . : . .::: . :: . .: ::. : CCDS43 IRGENLGLEFRDIASHVKVAGVECSPLVDGYIPAEQIVCEMGEAKPSQHAGFVEICVAVC 880 890 900 910 920 930 880 890 900 910 920 930 pF1KSD ---FGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLS-VEPQQGPQAGGTTLTIHGTHLDTGSQEDVRVTLN : ..:: :. . . :: ..:..::..::: .:: ::.:..:: .: : .. CCDS43 RPEF--MARSS---QLYYFMTLTLSDLKPSRGPMSGGTQVTITGTNLNAGS--NVVVMFG 940 950 960 970 980 990 940 950 960 970 980 990 pF1KSD GVPCKVTKFG-AQLQCVTGPQATRGQMLLEVSYGGSPVPNPGIFFTYRENPVLRAFEPLR :: . . . . : : . .: . :. . . . . : : :.:.. .:: CCDS43 KQPCLFHRRSPSYIVCNTTSSDEVLEMKVSVQVDRAKI-HQDLVFQYVEDPTIVRIEPEW 1000 1010 1020 1030 1040 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KSD SFASGGRSINVTGQGFSLIQRFAM---------VVIAEPLQSWQPPREAESLQPMTVVGT :..::. : : : ..::: . . : : :.. : : ..: CCDS43 SIVSGNTPIAVWGTHLDLIQNPQIRAKHGGKEHINICEVLNA----TEMTCQAPALALGP 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD DYVFHNDTKVVFLSPAVPEEPEAYNLTVLIEMDGHRALLRTEAGAFEYVPDPTFENF--T :. ..: . :.:: ... .:. ..:: . : : :.:.:: : . CCDS43 DH--QSD---------LTERPEEFGFI----LDNVQSLLILNKTNFTYYPNPVFEAFGPS 1110 1120 1130 1140 1150 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KSD GGVKKQVNKLIHARGTNLNKAMTLQEAE----AFVGAERCTMKTLTETDLYCEPPEVQPP : .. . . : .: :: .. ... ..:: . ::. :.....: :: :.. CCDS43 GILELKPGTPIILKGKNLIPPVAGGNVKLNYTVLVGEKPCTV-TVSDVQLLCESPNLIG- 1160 1170 1180 1190 1200 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KSD PKRRQKRDTTHNLPEFIVKFGSREWVLGRVEYDTRVSDVPLSL--ILPLVIVP--MVVVI :.: ... :. :. : : . : :::: :. .... ... : CCDS43 ---RHK---------VMARVGGMEYSPGMVYI---APDSPLSLPAIVSIAVAGGLLIIFI 1210 1220 1230 1240 1250 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KSD AVSVYCYWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRDRCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIP .. . : :::.... .... :...:: : .::. :..:. .... :.:. :::: CCDS43 VAVLIAYKRKSRESDLTLKRLQMQMDNLESRVALECKEAFAELQTDIHELTSDLDGAGIP 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KSD VLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIPEPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFI :::.::: ::.: : : .: . :..: :. ::..: :..:.:.: ::..:: CCDS43 FLDYRTYTMRVLF-P---GIEDHPVLRDLEVPGYRQERVEKGLKLFAQLINNKVFLLSFI 1320 1330 1340 1350 1360 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KSD HTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYYTDIMHTLFLELLEQYVVAKN-PKLMLRR .:::.:: :: : . :::. ..:..:::: ::... :. .:... . .:: :::.::: CCDS43 RTLESQRSFSMRDRGNVASLIMTVLQSKLEYATDVLKQLLADLIDKNLESKNHPKLLLRR 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KSD SETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLFKAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTG .:.:.:.::.::... ::..::. :::::..:: :::.:.::::.::. .:.:.:.. CCDS43 TESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFSLFCAIKQQMEKGPIDAITGEARYSLSEDK 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KSD LLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDA-IPVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPD :. ....: :..: . :.. . .:::.::::::.::::::.: .... ::: :. CCDS43 LIRQQIDYKTLVLSCVSPDNANSPEVPVKILNCDTITQVKEKILDAIFKNVPCSHRPKAA 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KSD SVVLEWRPGSTAQ-ILSDLDLTSQREGRWKRVNTLMHYNVRDGATLIL-SK--------- .. :::: :: :. ::.: :.:.. :. :::.::: ::.: ::... : :: CCDS43 DMDLEWRQGSGARMILQDEDITTKIENDWKRLNTLAHYQVPDGSVVALVSKQVTAYNAVN 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1570 1580 1590 1600 pF1KSD -VGVSQQPEDSQQDL---PGERHAL----------LEEENRVWHLVRPTDEVDEGKSKRG ::. .. ... : .: :: ..::::. .. :. .. :: CCDS43 NSTVSRTSASKYENMIRYTGSPDSLRSRTPMITPDLESGVKMWHLVKNHEHGDQKEGDRG 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KSD SVKEKERTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPGH---AVPPAVKYFFDFLDE : : ..::::::::..:::::.:::..:..... .: :.: :.::.:::::: CCDS43 S-------KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDE 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KSD QAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEVVDASLSVIAQTFMDAC ::.::.:.: . : ::.: ::::::::..:::.:.::.: . ..:: :::.::::::.: CCDS43 QADKHGIHDPHVRHTWKSNCLPLRFWVNMIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSC 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KSD TRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSDQDMNTHLAEISRAHTD . .::.:..:::::::::::.: .::. :: ::. : .: .::::::..::: :: : . CCDS43 STSEHRLGKDSPSNKLLYAKDIPSYKNWVERYYSDIGKMPAISDQDMNAYLAEQSRMHMN 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KSD SLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQIAAALENKVTDL .::. :: ....:. :: .::.. :..: :..::..:.:. CCDS43 EFNTMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS 1850 1860 1870 1880 1890 >>CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909 aa) initn: 3090 init1: 948 opt: 1005 Z-score: 1044.5 bits: 206.6 E(32554): 7.4e-52 Smith-Waterman score: 4277; 40.8% identity (66.3% similar) in 1901 aa overlap (34-1838:54-1909) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD QLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQL :::::. . :..:.:::: :.::. .::: CCDS14 PFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQL 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 120 pF1KSD EQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGICALR : ..:::..:. :.: . ..: .:..:::.:::::.. ..:: ::.. .:.: : CCDS14 EAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETR 90 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KSD ALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKG-NGPHDNGII :.... :. . :. .:::.: :::::::: :: : .:.:..: : . : CCDS14 RLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPL-PGRD-LLLVARGLAGKLSAG-- 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KSD VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQD-KHPAR : . . . . : . . .: .: ....:.:: :. ..::: .. . :. CCDS14 VPPLAIRQLAGSQPFSS-EGLGRLVVGDFSDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 pF1KSD NRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDS :. .::.: : : :::.:. : :. . ::: :::. : .::. CCDS14 YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQGLIQAAF--------LAPGT---LLGVFAAGP 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KSD RSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYT-GTREARDIFYKPFHGDI--QCGGHAPGS : : :.:: ::. .. :.:: : ::: : : . . .: : CCDS14 R---GTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDS 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KSD SKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKV .:.:::.:: : :...:. :. .:. : ..::.. ..: .:::: ..:.. :: CCDS14 PESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQ-PVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKV 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KSD YLTPDGTSSE-YDSILV-EINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCT .: :.... : : : .. .. ::.:... . ::..: .: :.:: : ..: :. 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CCDS14 IGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPA------NGSGLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEA 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KSD R--VSDVPLSLILPLVIVPMVVVIAVSVYC--YWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRD . .: :. . . :.. :: . : .::.:: :.:.:. :::.:: .: : CCDS14 EPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLETGVGD 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD RCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIP-- .:.::::::: :: : ..:.. .::: :::.::..:.:: :.. : . : . : CCDS14 QCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFF-PGHGG---CPLQPKPEGPGE 1310 1320 1330 1340 1350 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KSD EPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYY . . .:.:.: :.::::::: ::...:::::.: :: : . . ::::..:::::::: CCDS14 DGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEYL 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KSD TDIMHTLFLELLEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLF ::::.::. .: .:: .::::::::.::.::..:.::.::::: .:.. :::::: :: CCDS14 TDIMRTLLGDLAAHYV-HRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYMLF 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KSD KAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDA--------I .::..::.::::::: ::: ::::. :: .:::. :::. :.: . : . CCDS14 RAIQYQVDKGPVDAVTGKAKRTLNDSRLLREDVEFQPLTLMVLVGPGAGGAAGSSEMQRV 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KSD PVKVLNCDTISQVKEKIIDQVYRGQPCSCWPRPDSVVLEWRPGSTAQI-LSDLDLTSQRE :..::. :::.:::::..::::.: : : : .. :::: : .... ::: :::: . CCDS14 PARVLDTDTITQVKEKVLDQVYKGTPFSQRPSVHALDLEWRSGLAGHLTLSDEDLTSVTQ 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KSD GRWKRVNTLMHYNVRDGATL-ILSKVGVSQQPEDS-QQDLP-GERHALLE--EENRV--W ..:::.:::.::.: ::::. .. .. .. .: : : :: :: ::. : : CCDS14 NHWKRLNTLQHYKVPDGATVGLVPQLHRGSTISQSLAQRCPLGENIPTLEDGEEGGVCLW 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KSD HLVRPTDEVDEGKSKRGSVKEKE--RTKAITEIYLTRLLSVKGTLQQFVDNFFQSVLAPG :::. :.: . .: . .:..:.: :.::: :::::::::.:::::.:::. ::..:. . CCDS14 HLVKATEEPEGAKVRCSSLREREPARAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDTFQAILSVN 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KSD HAVPPAVKYFFDFLDEQAEKHNIQDEDTIHIWKTNSLPLRFWVNILKNPHFIFDVHVHEV . .: ::::.::.::: ::::.:.: :.:::::::: :::::: ::::..::::.: . CCDS14 RPIPIAVKYLFDLLDELAEKHGIEDPGTLHIWKTNSLLLRFWVNALKNPQLIFDVRVSDN 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KSD VDASLSVIAQTFMDACTRTEHKLSRDSPSNKLLYAKEISTYKKMVEDYYKGIRQMVQVSD ::: :.::::::.:.:: .:::..:::: ::::::.:: ::.::: :: ::: .: CCDS14 VDAILAVIAQTFIDSCTTSEHKVGRDSPVNKLLYAREIPRYKQMVERYYADIRQSSPASY 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KSD QDMNTHLAEISRAHTDSLNTLVALHQLYQYTQKYYDEIINALEEDPAAQKMQLAFRLQQI :.::. :::.: .:.. . : ::..::.. ..:::.::.::::::..::.::: ::::. CCDS14 QEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQV 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1830 pF1KSD AAALENKVTDL :: .::::::: CCDS14 AALVENKVTDL 1900 >>CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932 aa) initn: 3090 init1: 948 opt: 1005 Z-score: 1044.4 bits: 206.6 E(32554): 7.5e-52 Smith-Waterman score: 4277; 40.8% identity (66.3% similar) in 1901 aa overlap (34-1838:77-1932) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD QLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKELNHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLDAKLQL :::::. . :..:.:::: :.::. .::: CCDS55 PFGLCLLLLLLSPPPLPLTGAHRFSAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLSPELQL 50 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 120 pF1KSD EQQVATGPALDNKKCTPPIEASQCHEAEMTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGICALR : ..:::..:. :.: . ..: .:..:::.:::::.. ..:: ::.. .:.: : CCDS55 EAVAVTGPVIDSPDCVPFRDPAECPQAQLTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETR 110 120 130 140 150 160 130 140 150 160 170 180 pF1KSD ALSNISLRLFYEDGSGEKSFVASNDEGVATVGLVSSTGPGGDRVLFVGKG-NGPHDNGII :.... :. . :. .:::.: :::::::: :: : .:.:..: : . : CCDS55 RLGDVAEVLYQAEDPGDGQFVAANTPGVATVGLVVPL-PGRD-LLLVARGLAGKLSAG-- 170 180 190 200 210 220 190 200 210 220 230 240 pF1KSD VSTRLLDRTDSREAFEAYTDHATYKAGYLSTNTQQFVAAFEDGPYVFFVFNQQD-KHPAR : . . . . : . . .: .: ....:.:: :. ..::: .. . :. CCDS55 VPPLAIRQLAGSQPFSS-EGLGRLVVGDFSDYNNSYVGAFADARSAYFVFRRRGARAQAE 230 240 250 260 270 280 250 260 270 280 290 300 pF1KSD NRTLLARMCREDPNYYSYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTCLAASVAAPGSGRVLYAVFSRDS :. .::.: : : :::.:. : :. . ::: :::. : .::. CCDS55 YRSYVARVCLGDTNLYSYVEVPLACQGQGLIQAAF--------LAPGT---LLGVFAAGP 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 pF1KSD RSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYT-GTREARDIFYKPFHGDI--QCGGHAPGS : : :.:: ::. .. :.:: : ::: : : . . .: : CCDS55 R---GTQAALCAFPMVELGASMEQARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRCVTLPLDS 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 pF1KSD SKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGGLNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKV .:.:::.:: : :...:. :. .:. : ..::.. ..: .:::: ..:.. :: CCDS55 PESYPCGDEHTPSPIAGRQPLEVQPLLKLGQ-PVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKV 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 pF1KSD YLTPDGTSSE-YDSILV-EINKRVKRDLVLSGDLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCT .: :.... : : : .. .. ::.:... . ::..: .: :.:: : ..: :. CCDS55 FL--HGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGSHLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCA 450 460 470 480 490 500 480 490 500 510 520 530 pF1KSD QCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEASHWLWSRSKS--CVAVTSAQPQNMSRRAQ .: ..::: :::::..::::::..: :: . ..:::: .. :. . : : . :. : CCDS55 SCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYEEDSHCLHIQSLLPGHHPRQEQ 510 520 530 540 550 560 540 550 560 570 580 590 pF1KSD GEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHPARVEGEAVICNSP--SSIPVTPPGQDHVAV :.: :.: :: :. .. . : ::. :.::: : : .: ...:..::: :::.: CCDS55 GQVTLSVPRLPILDADEYFHCAFGDYDSL-AHVEGPHVACVTPPQDQVPLNPPGTDHVTV 570 580 590 600 610 620 600 610 620 630 640 650 pF1KSD TIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQAMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHECR--EAS . :... .. ... .. :::: ...:: :: .::.. : :.: . .: : CCDS55 PLALMFE--DVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAPCRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHC 630 640 650 660 670 680 660 670 680 690 700 pF1KSD PNPEDGIVRAHMED-------SCPQFLG-PSPLVIPMNHETDVNFQGKNLDTVKG--SSL :. : : :. : .::: : .: ..:.. :. . .. .::. .: .:. CCDS55 PEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHLVPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPASF 690 700 710 720 730 740 710 720 730 740 750 pF1KSD HVGSDLLKFME--PVTMQE----SGTFAFRTPKLSHDANET-LPLHLYV-KSYGKNIDSK : .: .. :.:..: :: . .. .. . .. ::. .:: .. .. .:. 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CCDS55 IGRGECLVKTLTRTHLYCEPPAHAPQPA------NGSGLPQFVVQMGNVQLALGPVQYEA 1220 1230 1240 1250 1260 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KSD R--VSDVPLSLILPLVIVPMVVVIAVSVYC--YWRKSQQAEREYEKIKSQLEGLEESVRD . .: :. . . :.. :: . : .::.:: :.:.:. :::.:: .: : CCDS55 EPPLSAFPVEAQAGVGMGAAVLIAAVLLLTLMYRHKSKQALRDYQKVLVQLESLETGVGD 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD RCKKEFTDLMIEMEDQTNDVHEAGIPVLDYKTYTDRVFFLPSKDGDKDVMITGKLDIP-- .:.::::::: :: : ..:.. .::: :::.::..:.:: :.. : . : . : CCDS55 QCRKEFTDLMTEMTDLSSDLEGSGIPFLDYRTYAERAFF-PGHGG---CPLQPKPEGPGE 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KSD EPRRPVVEQALYQFSNLLNSKSFLINFIHTLENQREFSARAKVYFASLLTVALHGKLEYY . . .:.:.: :.::::::: ::...:::::.: :: : . . ::::..:::::::: CCDS55 DGHCATVRQGLTQLSNLLNSKLFLLTLIHTLEEQPSFSQRDRCHVASLLSLALHGKLEYL 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KSD TDIMHTLFLELLEQYVVAKNPKLMLRRSETVVERMLSNWMSICLYQYLKDSAGEPLYKLF ::::.::. .: .:: .::::::::.::.::..:.::.::::: .:.. :::::: :: CCDS55 TDIMRTLLGDLAAHYV-HRNPKLMLRRTETMVEKLLTNWLSICLYAFLREVAGEPLYMLF 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KSD KAIKHQVEKGPVDAVQKKAKYTLNDTGLLGDDVEYAPLTVSVIVQDEGVDA--------I .::..::.::::::: ::: ::::. :: .:::. :::. :.: . : . 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CCDS55 QEMNSALAELSGNYTSAPHCLEALQELYNHIHRYYDQIISALEEDPVGQKLQLACRLQQV 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1830 pF1KSD AAALENKVTDL :: .::::::: CCDS55 AALVENKVTDL 1930 1838 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 01:13:32 2016 done: Thu Nov 3 01:13:33 2016 Total Scan time: 6.210 Total Display time: 1.690 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]