Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0359
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0359, 747 aa
1>>>pF1KSDA0359 747 - 747 aa - 747 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5555+/-0.00143; mu= -8.0120+/- 0.085
mean_var=378.5077+/-79.244, 0's: 0 Z-trim(110.6): 103 B-trim: 167 in 2/51
Lambda= 0.065923
statistics sampled from 11622 (11721) to 11622 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16
Scan time: 4.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 4778 469.3 9.6e-132
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 2192 223.3 1e-57
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 2191 223.2 1.1e-57
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 1736 180.0 1.2e-44
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 1507 158.3 5.5e-38
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 1507 158.3 5.5e-38
CCDS1719.1 KIF3C gene_id:3797|Hs108|chr2 ( 793) 1315 140.0 1.4e-32
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 1173 126.5 1.8e-28
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 955 105.8 3.5e-22
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 948 105.2 6.3e-22
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 944 104.8 8.3e-22
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 934 103.8 1.3e-21
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 927 103.5 4.4e-21
CCDS11065.1 KIF1C gene_id:10749|Hs108|chr17 (1103) 917 102.2 4.5e-21
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 909 101.8 1.5e-20
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 893 99.9 2e-20
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 873 98.1 8.5e-20
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 873 98.2 1.2e-19
CCDS55217.1 KIF13B gene_id:23303|Hs108|chr8 (1826) 858 96.8 3.2e-19
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 822 93.2 2.2e-18
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 817 92.6 2.3e-18
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 817 92.6 2.4e-18
CCDS47380.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1749) 826 93.7 2.6e-18
CCDS54967.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1757) 826 93.7 2.6e-18
CCDS54968.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1770) 826 93.7 2.6e-18
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 817 92.6 2.6e-18
CCDS47381.1 KIF13A gene_id:63971|Hs108|chr6 (1805) 826 93.7 2.6e-18
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 817 92.6 2.6e-18
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 817 92.6 2.7e-18
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 817 92.6 2.7e-18
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 816 92.5 2.8e-18
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 804 91.3 5.4e-18
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 798 90.8 9.8e-18
CCDS33744.1 KIF15 gene_id:56992|Hs108|chr3 (1388) 773 88.6 7.1e-17
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 765 87.7 8e-17
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 763 87.4 8.4e-17
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 760 87.2 1.1e-16
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 734 84.9 9.1e-16
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 690 80.5 9.7e-15
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 663 77.9 5.3e-14
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 628 74.9 1.1e-12
CCDS58949.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 686) 611 73.0 1.8e-12
CCDS3980.2 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 706) 611 73.0 1.8e-12
CCDS47216.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 744) 602 72.1 3.5e-12
CCDS6427.1 KIFC2 gene_id:90990|Hs108|chr8 ( 838) 588 70.8 9.6e-12
CCDS32685.1 KIF2B gene_id:84643|Hs108|chr17 ( 673) 571 69.2 2.5e-11
CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 671) 562 68.3 4.5e-11
CCDS512.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 725) 562 68.3 4.8e-11
>>CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 (747 aa)
initn: 4778 init1: 4778 opt: 4778 Z-score: 2478.7 bits: 469.3 E(32554): 9.6e-132
Smith-Waterman score: 4778; 100.0% identity (100.0% similar) in 747 aa overlap (1-747:1-747)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPKTFTFD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEKRGVIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD NSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVGK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTRL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDALLREFQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDALLREFQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD IVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENFIPLEEKSKIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENFIPLEEKSKIM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD NRAFFDEEEDHWKLHPITRLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMIRPEARYRAENI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NRAFFDEEEDHWKLHPITRLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMIRPEARYRAENI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VLLELDMPSRTTRDYEGPAIAPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTANKKSKARPKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLLELDMPSRTTRDYEGPAIAPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTANKKSKARPKSG
670 680 690 700 710 720
730 740
pF1KSD RKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
730 740
>>CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (699 aa)
initn: 2070 init1: 1650 opt: 2192 Z-score: 1149.9 bits: 223.3 E(32554): 1e-57
Smith-Waterman score: 2195; 50.0% identity (77.6% similar) in 706 aa overlap (3-693:8-699)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPK
: .: ..:.:::::::.: .::. : ..:.:: : ..:.. ...: ::
CCDS34 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTD-SSNEPPK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TFTFDAVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEK
:::::.:. ..::...:. : ::..::::.:.:::::::::::::::.::::.:. ::
CCDS34 TFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RGVIPNSFDHIFTHISRSQ-NQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGV
::.::::: ::: ::.... . ..:::.::::::.::.::::.::::.:::.:::::.::
CCDS34 RGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD YVKDLSSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGEN
:.::::..:.... .....:..:..::::::::::::::::::::.::::::: :.::.
CCDS34 YIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HIRVGKLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRD
:.:.:::.::::::::::::::: :.:::::::::::::.:::::::::::::::.:::.
CCDS34 HVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDAL
::::::::::::::.::.: ::.:::.:: .::..:::::::::::::: :.::::::::
CCDS34 SKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDAL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD LREFQEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEE-------EG
::.::.:: .:: .::. :.. :. .:. :...:::: ::. .:
CCDS34 LRQFQKEIEELKKKLEE---GEEIS------GSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRRG
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD DDK--DDYWREQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGA
: : :.: :.. :..:. .. ::. . : ::. .:: . .. . :
CCDS34 KKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQSLLE
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETLELKE
:..:.:.:..::: ... ...::.:.::.. .:. :...: .......: ...: :...:
CCDS34 KLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAEQLRRELEEKEQERLDIEE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KSD TYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHL
:.:::.:.. :::::::... :.:.:.:. :::.:: .: . : .. .:.:::.:. :
CCDS34 KYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELRLQML
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KSD IIENFIPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWKLHPITRLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARM
::.:::: . . : : . ..:. .:.:. .. :.. . :: : :.
CCDS34 IIDNFIPRDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEVDLSH
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KSD SMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSRTTRDYEGPAI-----APKVQAALDAALQDEDEIQV
.. : : :..:. : ::.. : . : ....:. ::
CCDS34 VYLAYTEESLRQS---LMKLERP-RTSKGKARPKTGRRKRSAKPETVIDSLLQ
660 670 680 690
710 720 730 740
pF1KSD DASSFESTANKKSKARPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
>>CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 (702 aa)
initn: 2093 init1: 1194 opt: 2191 Z-score: 1149.3 bits: 223.2 E(32554): 1.1e-57
Smith-Waterman score: 2192; 49.6% identity (77.5% similar) in 710 aa overlap (3-693:8-702)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSKLKSSESVRVVVRCRPMNGKEKAASYDKVVDVDVKLGQVSVKNPKGTAHEMPK
: .: ..:.:::::::.: .::. : ..:.:: : ..:.. ...: ::
CCDS75 MPINKSEKPESCDNVKVVVRCRPLNEREKSMCYKQAVSVDEMRGTITVHKTD-SSNEPPK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TFTFDAVYDWNAKQFELYDETFRPLVDSVLQGFNGTIFAYGQTGTGKTYTMEGIRGDPEK
:::::.:. ..::...:. : ::..::::.:.:::::::::::::::.::::.:. ::
CCDS75 TFTFDTVFGPESKQLDVYNLTARPIIDSVLEGYNGTIFAYGQTGTGKTFTMEGVRAIPEL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RGVIPNSFDHIFTHISRSQ-NQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGV
::.::::: ::: ::.... . ..:::.::::::.::.::::.::::.:::.:::::.::
CCDS75 RGIIPNSFAHIFGHIAKAEGDTRFLVRVSYLEIYNEEVRDLLGKDQTQRLEVKERPDVGV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD YVKDLSSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGEN
:.::::..:.... .....:..:..::::::::::::::::::::.::::::: :.::.
CCDS75 YIKDLSAYVVNNADDMDRIMTLGHKNRSVGATNMNEHSSRSHAIFTITIECSEKGIDGNM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HIRVGKLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRD
:.:.:::.::::::::::::::: :.:::::::::::::.:::::::::::::::.:::.
CCDS75 HVRMGKLHLVDLAGSERQAKTGATGQRLKEATKINLSLSTLGNVISALVDGKSTHVPYRN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD SKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDAL
::::::::::::::.::.: ::.:::.:: .::..:::::::::::::: :.::::::::
CCDS75 SKLTRLLQDSLGGNSKTMMCANIGPADYNYDETISTLRYANRAKNIKNKARINEDPKDAL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LREFQEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEE----GEEGEEEGDDK
::.::.:: .:: .:: : .. .:.. .:.::...: ::.::.. .
CCDS75 LRQFQKEIEELKKKLE----------EGEEISGSDISGSEEDDDEEGEVGEDGEKRKKRR
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KSD D---------DYWREQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAE
: : :.: :.. :..:. .. ::. . : ::. .:: . .. .
CCDS75 DQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELEKREKDLLKAQQEHQ
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD MLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETL
: :..:.:.:..::: ... ...::.:.::.. .:. :...: .......: ...: :
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pF1KSD ELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELK
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CCDS75 DIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIEGLLENIRQLSRELR
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CCDS75 LQMLIIDNFIPRDYQEMIENYVHWNEDIGEWQLKCVAYTGNNMRKQTPVPDKKEKDPFEV
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CCDS75 TCSVIEKPLDKFLPNQAGKKKVSPDKMIEMQAKIDEERKALETKLDMEEEERNKARAELE
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CCDS75 KREKDLLKAQQEHQSLLEKLSALEKKVIVGGVDLLAKAEEQEKLLEESNMELEERRKRAE
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pF1KSD EIQQQMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKAEIHDLQEEHIKERQ
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CCDS75 QLRRELEEKEQERLDIEEKYTSLQEEAQGKTKKLKKVWTMLMAAKSEMADLQQEHQREIE
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CCDS75 KPETVIDSLLQ
720
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CCDS21 RAFEHVFESVQCAENTKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLS
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CCDS21 MHTVHSVAQCEHIMETGWKNRSVGYTLMNKDSSRSHSIFTISIEMSAVDERGKDHLRAGK
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pF1KSD NKKSKARPKSGRKSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
CCDS21 ATAGVKRESVGMEVAVLTDDPLPVVDQQQVLARLQLLEQQVVGGEQAKNKDLKEKHKRRK
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CCDS17 MASKTKASEALKVVARCRPLSRKEEAAGHEQILTMDVKLGQVTLRNPRAAPGELPKTFTF
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CCDS17 DAVYDASSKQADLYDETVRPLIDSVLQGFNGTVFAYGQTGTGKTYTMQGTWVEPELRGVI
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CCDS17 PNAFEHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKEPGKRLELKENPETGVYIKDL
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pF1KSD SSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVG
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CCDS17 SSFVTKNVKEIEHVMNLGNQTRAVGSTHMNEVSSRSHAIFIITVECSERGSDGQDHIRVG
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pF1KSD KLNLVDLAGSERQAKTG------------------------AQGERLKEATKINLSLSAL
::::::::::::: :.: : ::: :::.:::::::::
CCDS17 KLNLVDLAGSERQNKAGPNTAGGAATPSSGGGGGGGGSGGGAGGERPKEASKINLSLSAL
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CCDS17 GNVIAALAGNRSTHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNAKTIMVATLGPASHSYDESLSTLRFAN
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CCDS17 RAKNIKNKPRVNEDPKDTLLREFQEEIARLKAQLEKRGMLGKRPRRKSSRRKKAVSAPPG
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pF1KSD EEEEE--EGEEGEEEGDDKDD------------------YWREQQEKLEIEKRAIVEDHS
: :. .::: :.... : .::.:.:: :: :: .:.:
CCDS17 YPEGPVIEAWVAEEEDDNNNNHRPPQPILESALEKNMENYLQEQKERLEEEKAAIQDDRS
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pF1KSD LVAEEKMRLLKEKEKKMEDLRREKDAAEMLGAKIKAMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILE
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CCDS17 LVSEEKQKLLEEKEKMLEDLRREQQATELLAAKYKAMESKLLIGGRNIMDHTNEQQKMLE
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pF1KSD QKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFSKLQAVKA
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pF1KSD EIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIENFIPLEEKSKIMNRAFFDEEEDHWK
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CCDS17 EIQDQHDEYIRVRQDLEEAQNEQTRELKLKYLIIENFIPPEEKNKIMNRLFLDCEEEQWK
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620 630 640 650 660 670
pF1KSD LHPITR--LENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSRT
..:.. . ..:: :::.::::::::.::.::..: . . :::::::..::::. .
CCDS17 FQPLVPAGVSSSQMKKRPTSAVGYKRPISQYARVAMAMGSHPRYRAENIMFLELDVSPPA
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680 690 700 710 720 730
pF1KSD TRDYEGPAIAPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTANKKSKARPKSGRKSGSSSSSSG
. ..: . : ::. : ...: : .: ...: . . .: .: . :
CCDS17 VFEME----FSHDQEQDPRALHMERLMRLD-SFLERPSTSKVR-KSRSWCQSPQRPPPST
730 740 750 760 770
740
pF1KSD TPASQLYPQSRGLVPK
: ::
CCDS17 THASLASASLRPATVADHE
780 790
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CCDS72 TKFLVRASYLEIYNEDVRDLLGADTKQKLELKEHPEKGVYVKGLSMHTVHSVAQCEHIME
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CCDS72 CLSPADNNYDETLSTLRYANRAKNIRNKPRINEDPKDALLREYQEEIKKLKAILTQQMSP
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pF1KSD RRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYWREQQE----KLEIEKRAIVED
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CCDS72 SSLSALLSRQVPPDPVQVEEKLLPQPVIQHDVEAEKQLIREEYEERLARLKADYKAEQES
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.. . :. . . . .. :.::.: .:. ..:. :: . :. ... .
CCDS72 RARLEEDITAMRNSYDVRLSTLEENLRKETEAVLQVGVLYKAEVMSRAEFASSAEYPPAF
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pF1KSD EQQKILEQKRQEIAEQKRREREIQQQMESRDEETLELKETYSSLQQEVDIKTKKLKKLFS
. . ... : .. . . :. :: : ... . : .. . ... . :
CCDS72 QYETVVKPKVFSTTDTLPSDDVSKTQVSSRFAELPKVEPSKSEISLGSSESSSLEETSVS
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pF1KSD KLQAVKAEIHDLQEEHIKERQELEQTQNELTRELKLKHLIIE-NFIPLEEKSKIMNRAFF
. : ... :... . .: . ::. : :..: :: ... ....
CCDS72 EAFPGPEEPSNVEVSMPTEESRSRYFLDECLGQEAAGHLLGEQNYLPQEEPQEVPLQGLL
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pF1KSD DEEEDHWKLHP-ITRLENQQMMKRPVSAVGYKRPLSQHARMSMMIRPEARYRAENIVLLE
.. ... ..:: . .: : :.. : ... .:: .::
CCDS72 GLQDPFAEVEAKLARLSSTVARTDAPQADVPKVPVQVPAPTDLLEPSDARPEAEA----A
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pF1KSD LDMPSRTTRDYEGPAIAPKVQAALDAALQDEDEIQVDASSFESTANKKSKARPKSGRKSG
:.: : : . . :..:
CCDS72 DDFPPRPEVDLASEVALEVVRTAEPGVWLEAQAPVALVAQPEPLPATAGVKRESVGMEVA
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CCDS89 RVFPPNTTQEQVYHACAMQIVKDVLAGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPQLMGIIP
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pF1KSD NSFDHIFTHI-SRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTKRLELKERPDTGVYVKDL
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CCDS89 RIARDIFNHIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVTKTN-LSVHEDKNRVPFVKGC
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pF1KSD SSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENHIRVG
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CCDS89 TERFVSSPEEILDVIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINIK--QENMETEQKLS-G
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pF1KSD KLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKSTHIPYRDSKLTR
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CCDS89 KLYLVDLAGSEKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGTKSYVPYRDSKMTR
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.:::::::: .:.: .:.::: :: .:: ...:::.::: :: : . ...
CCDS89 ILQDSLGGNCRTTMFICCSPSSYNDAETKSTLMFGQRAKTIKNTASVNLELTAEQWKKKY
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..: . ::: :..:.. . . .: ..: . : :. :::. .. .. ...
CCDS89 EKEKEKTKAQ--KETIAKLEAELSRWRNGENVP--ETERLAGEEAALGAELCEETPVNDN
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.. . : :... :: :: :. . : ... .... : : .. .: .:::.
CCDS89 SSIVV--RIAPEERQKYEEEIRRLYKQLDDKDDEINQQSQLIEKLKQQMLDQE-ELLVST
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CCDS89 RG----DNEKVQRELSHLQSENDAAKDEVKEVLQALEELAVNYDQKSQEVEEKSQQNQLL
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CCDS89 VDELSQKVATMLS----LESELQRLQEVSGHQRKRIAEVLNGLMKDLSEFSVIVGNGEIK
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CCDS89 LPVEISGAIEEEFTVARLYISKIKSEVKSVVKRCRQLENLQVECHRKMEVTG--RELSSC
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pF1KSD ARMSMMIRPEARYRAENIVLLELDMPSR---TTRDYEGPAIAPKVQA---ALDAALQDED
. .. . ::. :. . . ... .: . : . .: :.:: . ..::.:..
CCDS89 --QLLISQHEAKIRSLTEYMQSVELKKRHLEESYDSLSDELA-KLQAQETVHEVALKDKE
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::
CCDS89 PDTQDADEVKKALELQMESHREAHHRQLARLRDEINEKQKTIDELKDLNQKLQLELEKLQ
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CCDS14 MKEEVKGIPVRVALRCRPLVPKEISEGCQMCLSFVPGEPQVVV----GT----DKSFTYD
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CCDS14 FVFDPSTEQEEVFNTAVAPLIKGVFKGYNATVLAYGQTGSGKTYSMGGAYTAEQENEPTV
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pF1KSD GVIPNSFDHIFTHISRSQNQQYLVRASYLEIYQEEIRDLLSKDQTK-RLELKERPDTGVY
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CCDS14 GVIPRVIQLLFKEIDKKSDFEFTLKVSYLEIYNEEILDLLCPSREKAQINIREDPKEGIK
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD VKDLSSFVTKSVKEIEHVMNVGNQNRSVGATNMNEHSSRSHAIFVITIECSEVGLDGENH
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CCDS14 IVGLTEKTVLVALDTVSCLEQGNNSRTVASTAMNSQSSRSHAIFTISLEQRKKS-DKNSS
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pF1KSD IRVGKLNLVDLAGSERQAKTGAQGERLKEATKINLSLSALGNVISALVDGKST-HIPYRD
.: .::.:::::::::: :: :.:.::::. .:: .: :::::::: : :. .::::
CCDS14 FR-SKLHLVDLAGSERQKKTKAEGDRLKEGININRGLLCLGNVISALGDDKKGGFVPYRD
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pF1KSD SKLTRLLQDSLGGNAKTVMVANVGPASYNVEETLTTLRYANRAKNIKNKPRVNEDPKDAL
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CCDS14 SKLTRLLQDSLGGNSHTLMIACVSPADSNLEETLNTLRYADRARKIKNKPIVNIDPQTAE
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pF1KSD LREFQEEIARLKAQLEKRSIGRRKRREKRREGGGSGGGGEEEEEEGEEGEEEGDDKDDYW
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CCDS14 LNHLKQQVQQLQVLLLQA------------HGGTLPGSITVEPSENLQSLME---KNQSL
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pF1KSD REQQEKLEIEKRAIVEDHSLVAE--EKMRLLKEKEKKM----EDLRREKDAAEMLGAKIK
:..::: .:.. : . .:. :.. : .. ..:: :.::.. : ..
CCDS14 VEENEKL---SRGLSEAAGQTAQMLERIILTEQANEKMNAKLEELRQHAACKLDLQKLVE
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pF1KSD AMESKLLVGGKNIVDHTNEQQKILEQKRQEIA----------EQKRREREIQQQMESRDE
..:.. : . .:. : :: : . . . .: ::. . . . .: :
CCDS14 TLEDQELKENVEII--CNLQQLITQLSDETVACMAAAIDTAVEQEAQVETSPETSRSSDA
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pF1KSD ETLE--LKETYSS-----LQQEVDIK---TKKLKKLFSKLQAVKAEIHD----LQEEHI-
: . :... : :.. . .: ..:. . :.:: .. . .: :. : :
CCDS14 FTTQHALRQAQMSKELVELNKALALKEALARKMTQNDSQLQPIQYQYQDNIKELELEVIN
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CCDS14 LQKEKEELVLELQTAKKDANQAKLSERRRKRLQELEGQIADLKKKLNEQSKLLKLKESTE
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CCDS14 RTVSKLNQEIRMMKNQRVQLMRQMKEDAEKFRQWKQKKDKEVIQLKERDRKRQYELLKLE
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CCDS14 RNFQKQSNVLRRKTEEAAAANK---RLKDALQKQREVADKRKETQSRGMEGTAARVKNWL
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pF1KSD KSGSSSSSSGTPASQLYPQSRGLVPK
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]