Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0360
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0360, 1007 aa
1>>>pF1KSDA0360 1007 - 1007 aa - 1007 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9345+/-0.00106; mu= -14.0248+/- 0.063
mean_var=722.6801+/-174.558, 0's: 0 Z-trim(117.3): 59 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.047709
statistics sampled from 17975 (18024) to 17975 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.804), E-opt: 0.2 (0.554), width: 16
Scan time: 6.200
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32045.1 SALL2 gene_id:6297|Hs108|chr14 (1007) 6810 484.7 4.1e-136
CCDS76656.1 SALL2 gene_id:6297|Hs108|chr14 ( 906) 4729 341.4 5e-93
CCDS12013.1 SALL3 gene_id:27164|Hs108|chr18 (1300) 1173 96.8 3e-19
CCDS45483.1 SALL1 gene_id:6299|Hs108|chr16 (1227) 1128 93.7 2.5e-18
CCDS10747.1 SALL1 gene_id:6299|Hs108|chr16 (1324) 1128 93.7 2.6e-18
>>CCDS32045.1 SALL2 gene_id:6297|Hs108|chr14 (1007 aa)
initn: 6810 init1: 6810 opt: 6810 Z-score: 2557.2 bits: 484.7 E(32554): 4.1e-136
Smith-Waterman score: 6810; 99.9% identity (99.9% similar) in 1007 aa overlap (1-1007:1-1007)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRRKQRKPQQLISDCEGPSASENGDASEEDHPQVCAKCCAQFTDPTEFLAHQNACSTDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MSRRKQRKPQQLISDCEGPSASENGDASEEDHPQVCAKCCAQFTDPTEFLAHQNACSTDP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PVMVIIGGQENPNNSSASSEPRPEGHNNPQVMDTEHSNPPDSGSSVPTDPTWGPERRGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PVMVIIGGQENPNNSSASSEPRPEGHNNPQVMDTEHSNPPDSGSSVPTDPTWGPERRGEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SSGHFLVAATGTAAGGGGGLILASPKLGATPLPPESTPAPPPPPPPPPPPGVGSGHLNIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SSGHFLVAATGTAAGGGGGLILASPKLGATPLPPESTPAPPPPPPPPPPPGVGSGHLNIP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LILEELRVLQQRQIHQMQMTEQICRQVLLLGSLGQTVGAPASPSELPGTGTASSTKPLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LILEELRVLQQRQIHQMQMTEQICRQVLLLGSLGQTVGAPASPSELPGTGTASSTKPLLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LFSPIKPVQTSKTLASSSSSSSSSSGAETPKQAFFHLYHPLGSQHPFSAGGVGRSHKPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LFSPIKPVQTSKTLASSSSSSSSSSGAETPKQAFFHLYHPLGSQHPFSAGGVGRSHKPTP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD APSPALPGSTDQLIASPHLAFPSTTGLLAAQCLGAARGLEATASPGLLKPKNGSGELSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 APSPALPGSTDQLIASPHLAFPSTTGLLAAQCLGAARGLEATASPGLLKPKNGSGELSYG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EVMGPLEKPGGRHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPYKCNVCGNRFTTRGNLKVHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EVMGPLEKPGGRHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPYKCNVCGNRFTTRGNLKVHF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HRHREKYPHVQMNPHPVPEHLDYVITSSGLPYGMSVPPEKAEEEAATPGGGVERKPLVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HRHREKYPHVQMNPHPVPEHLDYVITSSGLPYGMSVPPEKAEEEAATPGGGVERKPLVAS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TTALSATESLTLLSTSAGTATAPGLPAFNKFVLMKAVEPKNKADENTPPGSEGSAISGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TTALSATESLTLLSTSAGTATAPGLPAFNKFVLMKAVEPKNKADENTPPGSEGSAISGVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ESSTATRMQLSKLVTSLPSWALLTNHFKSTGSFPFPYVLEPLGASPSETSKLQQLVEKID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESSTATRMQLSKLVTSLPSWALLTNHFKSTGSFPFPYVLEPLGASPSETSKLQQLVEKID
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RQGAVAVTSAASGAPTTSAPAPSSSASSGPNQCVICLRVLSCPRALRLHYGQHGGERPFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RQGAVAVTSAASGAPTTSAPAPSSSASSGPNQCVICLRVLSCPRALRLHYGQHGGERPFK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD CKVCGRAFSTRGNLRAHFVGHKASPAARAQNSCPICQKKFTNAVTLQQHVRMHLGGQIPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CKVCGRAFSTRGNLRAHFVGHKASPAARAQNSCPICQKKFTNAVTLQQHVRMHLGGQIPN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GGTALPEGGGAAQENGSEQSTVSGAGSFPQQQSQQPSPEEELSEEEEEEDEEEEEDVTDE
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GGTALPEGGGAAQENGSEQSTVSGARSFPQQQSQQPSPEEELSEEEEEEDEEEEEDVTDE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DSLAGRGSESGGEKAISVRGDSEEASGAEEEVGTVAAAATAGKEMDSNEKTTQQSSLPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSLAGRGSESGGEKAISVRGDSEEASGAEEEVGTVAAAATAGKEMDSNEKTTQQSSLPPP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PPPDSLDQPQPMEQGSSGVLGGKEEGGKPERSSSPASALTPEGEATSVTLVEELSLQEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PPPDSLDQPQPMEQGSSGVLGGKEEGGKPERSSSPASALTPEGEATSVTLVEELSLQEAM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RKEPGESSSRKACEVCGQAFPSQAALEEHQKTHPKEGPLFTCVFCRQGFLERATLKKHML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RKEPGESSSRKACEVCGQAFPSQAALEEHQKTHPKEGPLFTCVFCRQGFLERATLKKHML
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KSD LAHHQVQPFAPHGPQNIAALSLVPGCSPSITSTGLSPFPRKDDPTIP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LAHHQVQPFAPHGPQNIAALSLVPGCSPSITSTGLSPFPRKDDPTIP
970 980 990 1000
>>CCDS76656.1 SALL2 gene_id:6297|Hs108|chr14 (906 aa)
initn: 5827 init1: 4697 opt: 4729 Z-score: 1783.7 bits: 341.4 E(32554): 5e-93
Smith-Waterman score: 5208; 81.3% identity (83.0% similar) in 1013 aa overlap (1-1006:1-875)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSRRKQRKPQQLISDCEGPSASENGDASEEDHPQVCAKCCAQFTDPTEFLAHQNACSTDP
:.....:. ..: : : : .::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 MAHESERS-SRLGVPC-GEPAELGGDASEEDHPQVCAKCCAQFTDPTEFLAHQNACSTDP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PVMVIIGGQENPNNSSASSEPRPEGHNNPQVMDTEHSNPPDSGSSVPTDPTWGPERRGEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PVMVIIGGQENPNNSSASSEPRPEGHNNPQVMDTEHSNPPDSGSSVPTDPTWGPERRGEE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SSGHFLVAATGTAAGGGGGLILASPKLGATPLPPESTPAPPPPPPPPPPPGVGSGHLNIP
:::::::::::
CCDS76 SSGHFLVAATG-------------------------------------------------
120
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LILEELRVLQQRQIHQMQMTEQICRQVLLLGSLGQTVGAPASPSELPGTGTASSTKPLLP
CCDS76 ------------------------------------------------------------
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LFSPIKPVQTSKTLASSSSSSSSSSGAETPKQAFFHLYHPLGSQHPFSAGGVGRSHKPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 --------------------------AETPKQAFFHLYHPLGSQHPFSAGGVGRSHKPTP
130 140 150 160
310 320 330 340 350 360
pF1KSD APSPALPGSTDQLIASPHLAFPSTTGLLAAQCLGAARGLEATASPGLLKPKNGSGELSYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 APSPALPGSTDQLIASPHLAFPSTTGLLAAQCLGAARGLEATASPGLLKPKNGSGELSYG
170 180 190 200 210 220
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EVMGPLEKPGGRHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPYKCNVCGNRFTTRGNLKVHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 EVMGPLEKPGGRHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPYKCNVCGNRFTTRGNLKVHF
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HRHREKYPHVQMNPHPVPEHLDYVITSSGLPYGMSVPPEKAEEEAATPGGGVERKPLVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 HRHREKYPHVQMNPHPVPEHLDYVITSSGLPYGMSVPPEKAEEEAATPGGGVERKPLVAS
290 300 310 320 330 340
490 500 510 520 530 540
pF1KSD TTALSATESLTLLSTSAGTATAPGLPAFNKFVLMKAVEPKNKADENTPPGSEGSAISGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 TTALSATESLTLLSTSAGTATAPGLPAFNKFVLMKAVEPKNKADENTPPGSEGSAISGVA
350 360 370 380 390 400
550 560 570 580 590 600
pF1KSD ESSTATRMQLSKLVTSLPSWALLTNHFKSTGSFPFPYVLEPLGASPSETSKLQQLVEKID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 ESSTATRMQLSKLVTSLPSWALLTNHFKSTGSFPFPYVLEPLGASPSETSKLQQLVEKID
410 420 430 440 450 460
610 620 630 640 650 660
pF1KSD RQGAVAVTSAASGAPTTSAPAPSSSASSGPNQCVICLRVLSCPRALRLHYGQHGGERPFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RQGAVAVTSAASGAPTTSAPAPSSSASSGPNQCVICLRVLSCPRALRLHYGQHGGERPFK
470 480 490 500 510 520
670 680 690 700 710 720
pF1KSD CKVCGRAFSTRGNLRAHFVGHKASPAARAQNSCPICQKKFTNAVTLQQHVRMHLGGQIPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 CKVCGRAFSTRGNLRAHFVGHKASPAARAQNSCPICQKKFTNAVTLQQHVRMHLGGQIPN
530 540 550 560 570 580
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GGTALPEGGGAAQENGSEQSTVSGAGSFPQQQSQQPSPEEELSEEEEEEDEEEEEDVTDE
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 GGTALPEGGGAAQENGSEQSTVSGARSFPQQQSQQPSPEEELSEEEEEEDEEEEEDVTDE
590 600 610 620 630 640
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DSLAGRGSESGGEKAISVRGDSEEASGAEEEVGTVAAAATAGKEMDSNEKTTQQSSLPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 DSLAGRGSESGGEKAISVRGDSEEASGAEEEVGTVAAAATAGKEMDSNEKTTQQSSLPPP
650 660 670 680 690 700
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PPPDSLDQPQPMEQGSSGVLGGKEEGGKPERSSSPASALTPEGEATSVTLVEELSLQEAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 PPPDSLDQPQPMEQGSSGVLGGKEEGGKPERSSSPASALTPEGEATSVTLVEELSLQEAM
710 720 730 740 750 760
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RKEPGESSSRKACEVCGQAFPSQAALEEHQKTHPKEGPLFTCVFCRQGFLERATLKKHML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS76 RKEPGESSSRKACEVCGQAFPSQAALEEHQKTHPKEGPLFTCVFCRQGFLERATLKKHML
770 780 790 800 810 820
970 980 990 1000
pF1KSD LAHHQVQPFA------PHGPQNIAALSLV-PGCSPSITSTGLSPFPRKDDPTIP
::::: : : : : : .. : . :. .: . ::. : ::.
CCDS76 LAHHQNQYVAFLSNGLPMKPWNSSSTSTTTPSLAPPVL-FGLGTVAGKVPPTMGSREAKE
830 840 850 860 870 880
CCDS76 KTAPLLFQPPAPKAVPEKPIIDKK
890 900
>>CCDS12013.1 SALL3 gene_id:27164|Hs108|chr18 (1300 aa)
initn: 1321 init1: 575 opt: 1173 Z-score: 459.0 bits: 96.8 E(32554): 3e-19
Smith-Waterman score: 1646; 34.4% identity (54.9% similar) in 1109 aa overlap (17-990:32-1060)
10 20 30 40
pF1KSD MSRRKQRKPQQLISDCEGPSASENGDASEE--DHPQVCAKCCAQFT
:: ...: :. .. .:: ::::.:
CCDS12 SRRKQAKPQHLKSDEELLPPDGAPEHAAPGEGAEDADSGPESRSGGEETSVCEKCCAEFF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD DPTEFLAHQNACSTDPPVMVIIGGQENPNNSSASSEPRPEGHNNPQVMDTEHSNPPDSGS
..:: :: .:. :::... .. : : :: .: .: .:
CCDS12 KWADFLEHQRSCTKLPPVLIV--HEDAPA-------PPPEDFPEP--------SPASS--
70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KSD SVPTDPTWGPERRGEESSGHFLVAATGTAAGGGGGLILASPKLGATPLPPESTPAPPPPP
:. : .. : .: : : : : . . . . : : .: :::
CCDS12 -----PSERAESEAAEEAG-----AEG-AEGEARPVEKEAEPMDAEPAGDTRAPRPPPAA
110 120 130 140 150
170 180
pF1KSD PPPPPPGVGSGHLNI------------------------------------PLILEELRV
: :: :. :. :. :::::.: .
CCDS12 PAPPTPAYGAPSTNVTLEALLSTKVAVAQFSQGARAAGGSGAGGGVAAAAVPLILEQLMA
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230
pF1KSD LQQRQIHQMQMTEQICRQVLLLG------SLGQTVG--APA-SPSELPGTG----TASST
:::.::::.:. ::: :: :. ::. ... ::. .::.::: . .:..
CCDS12 LQQQQIHQLQLIEQIRSQVALMQRPPPRPSLSPAAAPSAPGPAPSQLPGLAALPLSAGAP
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KSD KPLLPLFSPIKPV--QTSKTLASSSSSSSSSSGAETPKQAFFHLYHPL-GSQHPFSAGGV
. .: :. . .. :. :..:. .: :. : .. : :
CCDS12 AAAIAGSGPAAPAAFEGAQPLSRPESGASTPGGPAEPSAPAAPSAAPAPAAPAPAPAPQS
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340
pF1KSD GRSHKPTPAPSP-AL-PGSTDQLIASPHLAFP-----STTGLLAAQCLGAARGLEATASP
. : .: : .: :: ::: : :.: : : :..:.. . : . . . .:
CCDS12 AASSQPQSASTPPALAPGSL--LGAAPGLPSPLLPQTSASGVIFPNPLVSIAATANALDP
340 350 360 370 380
350 360 370 380 390 400
pF1KSD --GLLKPKNGSG-ELSYGEVMGPLEKPGGRHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPYK
.:.: ..:. ..: : . : : .::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS12 LSALMKHRKGKPPNVSVFEPKASAEDPFFKHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPFK
390 400 410 420 430 440
410 420 430 440 450 460
pF1KSD CNVCGNRFTTRGNLKVHFHRHREKYPHVQMNPHPVPEHLDYVITSSGLPYGMSVPPEKA-
::.:::::.:.:::::::.::.:::::.::::.::::.:: : : ::.:::::.::::
CCDS12 CNICGNRFSTKGNLKVHFQRHKEKYPHIQMNPYPVPEYLDNVPTCSGIPYGMSLPPEKPV
450 460 470 480 490 500
470 480 490 500
pF1KSD ----EEEAATP----GGGVERKPLVASTTALSATESLTLLSTS------AGTATA---PG
. . . : . :.. : : .. . . . : : : : :.. : ::
CCDS12 TTWLDSKPVLPTVPTSVGLQLPPTVPGAHGYADSPSATPASRSPQRPSPASSECASLSPG
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550
pF1KSD LPAFNKFVLMKAVEPKN--------KADENTPPGSE---GSAISGVAESSTATRMQLSKL
: .. : : :.. ::. . : .. :.: :. :.. : .. .
CCDS12 LNHVESGVSATAESPQSLLGGPPLTKAEPVSLPCTNARAGDAPVGAQASAAPTSVDGAPT
570 580 590 600 610 620
560 570 580 590 600 610
pF1KSD VTSLPSWALLTNHFKSTGSFPFPYVLEPLGASPSETSKLQQLVEKIDRQGAVAVTSAASG
. :. ....::. .::: .:. . . :::::::::::.::..
CCDS12 SLGSPGLPAVSEQFKA--QFPFGGLLDSM--QTSETSKLQQLVENIDKK-----------
630 640 650 660 670
620 630 640 650 660 670
pF1KSD APTTSAPAPSSSASSGPNQCVICLRVLSCPRALRLHYGQHGGERPFKCKVCGRAFSTRGN
. ::::::: ::::: ::..:: : ::::::::.:::::.:.::
CCDS12 -------------MTDPNQCVICHRVLSCQSALKMHYRTHTGERPFKCKICGRAFTTKGN
680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KSD LRAHFVGHKASPAARAQNSCPICQKKFTNAVTLQQHVRMHLGGQIPNGGTALPEGGGAAQ
:..:: :.:.: :.:.:::::::::::::.::::.:::.:::::: : :::: :.
CCDS12 LKTHFGVHRAKPPLRVQHSCPICQKKFTNAVVLQQHIRMHMGGQIPN--TPLPEGFQDAM
730 740 750 760 770
740 750 760
pF1KSD ----------------------ENGSEQST-VSGAGSFPQQQ------SQQPSPEEELSE
::. :... .. :.. : . : ::: .:
CCDS12 DSELAYDDKNAETLSSYDDDMDENSMEDDAELKDAATDPAKPLLSYAGSCPPSPPSVISS
780 790 800 810 820 830
770 780 790 800 810 820
pF1KSD EEEEEDEEEEED-VTDEDSLAG-RGSESGGEKAISVRGDSEEASGAEEEVGTVAAAATAG
:.. . : : . ..:.: .. :.:. .. . .:: : : : . .::
CCDS12 IAALENQMKMIDSVMSCQQLTGLKSVENGSGESDRLSNDSSSAVGDLE-------SRSAG
840 850 860 870 880 890
830 840 850 860 870
pF1KSD KEMDSNEKTTQQSSLPPPPPPDSLDQPQPMEQGSSGVLGGKEEGG----KPERSSSPASA
. : :....:. : : .:. . .: : ::. :: : :: .:::.:
CCDS12 SPALS-ESSSSQALSPAPSNGESFRSKSP---G----LGAPEEPQEIPLKTERPDSPAAA
900 910 920 930 940
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LTPEGEATSVTLVEELSLQEA-MRKEPGESSSRKACEVCGQAFPSQAALEEHQKTHPKEG
: . . :: .. . .: :. : .: :::. : ..::: : ..: ::
CCDS12 PGSGGAPGRAGIKEEAPFSLLFLSRERGKCPST-VCGVCGKPFACKSALEIHYRSHTKER
950 960 970 980 990 1000
940 950 960 970 980 990
pF1KSD PLFTCVFCRQGFLERATLKKHMLLAHHQVQP---FAPH---GPQNIAALSLVPGCSPSIT
: :.:..::.: ..::.:.: . . : : :. ::.. .. ::. . .:..
CCDS12 P-FVCALCRRGCSTMGNLKQHLLTHRLKELPSQLFDPNFALGPSQ-STPSLISSAAPTMI
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1000
pF1KSD STGLSPFPRKDDPTIP
CCDS12 KMEVNGHGKAMALGEGPPLPAGVQVPAGPQTVMGPGLAPMLAPPPRRTPKQHNCQSCGKT
1070 1080 1090 1100 1110 1120
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. . . : . :. : . : . :: . . : .... :: ..
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: :....::. .::: .:. .:. :::::::::::.::..
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:: .... . .: ...... :: . . . : .. . . .:.:.
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.. .: . ... : : .. : .: : ....: .:.: .:.:...
CCDS45 NQMKMINAGLAEQLQASLKSVENGSIEGDVLT-NDSSSVGGDMESQSAGSPAISESTSSM
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..: : . . . :. :. . .: . .: .: .. : :: ..: .. .
CCDS45 QALSPSNSTQEFHKSPSIEEKPQRAVPSEFANGLSPTPVNGGALDLTS-SHAEKIIKEDS
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pF1KSD LSLQEAMRKEPGESSSRKACEVCGQAFPSQAALEEHQKTHPKEGPLFTCVFCRQGFLERA
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CCDS45 LGILFPFRDR-GKFKNT-ACDICGKTFACQSALDIHYRSHTKERP-FICTVCNRGFSTKG
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pF1KSD TLKKHMLLAHHQV-----QPFAPH---GPQNIAALSLVPGCS-PSITST---GL---SPF
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CCDS45 NLKQHMLT--HQMRDLPSQLFEPSSNLGPNQNSA--VIPANSLSSLIKTEVNGFVHVSPQ
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1000
pF1KSD PRKDDPTIP
:: ::
CCDS45 DSKDTPTSHVPSGPLSSSATSPVLLPALPRRTPKQHYCNTCGKTFSSSSALQIHERTHTG
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10 20 30 40 50 60
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CCDS10 DPEVASLPRRDGDTEKGQPSRPTKSKDAHVCGRCCAEFFELSDLLLHKKNCTKNQLVLIV
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CCDS10 ---NENPASPPETFSPSPPPDNPDEQMNDTVNKTDQVDCSDLSEH-NGLDREESMEVEAP
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pF1KSD TWGPERRGEESSGHFLVA----ATGTAAGGGGG--------LILASPKLGA-TPLPP---
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CCDS10 VANKSGSGTSSGSHSSTAPSSSSSSSSSSGGGGSSSTGTSAITTSLPQLGDLTTLGNFSV
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160 170 180 190 200
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CCDS10 INSNVIIENLQSTKVAVAQFSQEARCGGASGGKLAVPALMEQLLALQQQQIHQLQLIEQI
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CCDS10 RHQILLLAS--QNADLPTSSS--PSQGTLRTSANPLSTLSSHLSQQLAAAAGLAQSLASQ
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270 280 290
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CCDS10 SASISGVKQLPPIQLPQSSSGNTIIPSNSGSSPNMNILAAAVTTPSSEKVASSAGASHVS
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CCDS10 NPAVSSSSSPAFAISSLLSPASNPLLPQQASANSVFPSPLPNIGTTAEDLN-SLSALAQQ
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CCDS10 RKSKPPN----VTAFEAKSTSDEAFFKHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPFKCNI
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CCDS10 CGNRFSTKGNLKVHFQRHKEKYPHIQMNPYPVPEHLDNIPTSTGIPYGMSIPPEKPVTSW
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CCDS10 LDTKPVLPTLTTSVGLPLPPTLPSLIPFIKTEEPAPIPISHSATSPPGSVKSDSGGPESA
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CCDS10 TRNLGGLPEEAEGSTLPPSGGKSEESGMVTNSVPTASSSVLSSPAADCGPAGSATTFTNP
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CCDS10 LLPLMSEQFKA--KFPFGGLLD--SAQASETSKLQQLVENIDKK----------------
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CCDS10 --------ATDPNECIICHRVLSCQSALKMHYRTHTGERPFKCKICGRAFTTKGNLKTHY
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CCDS10 SFDEKNFDDLDNF-SDENMEDCPEGSIPDTPKSADASQDSLSSSPLPLEMSSIAALENQM
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]