FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0360, 1007 aa 1>>>pF1KSDA0360 1007 - 1007 aa - 1007 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6795+/-0.000426; mu= -7.5293+/- 0.027 mean_var=700.6003+/-165.445, 0's: 0 Z-trim(125.2): 65 B-trim: 5605 in 2/60 Lambda= 0.048455 statistics sampled from 48350 (48480) to 48350 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.81), E-opt: 0.2 (0.568), width: 16 Scan time: 19.850 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005398 (OMIM: 216820,602219) sal-like protein 2 (1007) 6810 492.1 6.5e-138 XP_011535366 (OMIM: 216820,602219) PREDICTED: sal- (1043) 6540 473.2 3.2e-132 XP_011535367 (OMIM: 216820,602219) PREDICTED: sal- (1041) 6388 462.6 5e-129 NP_001278376 (OMIM: 216820,602219) sal-like protei ( 906) 4729 346.5 3.8e-94 NP_001278375 (OMIM: 216820,602219) sal-like protei ( 908) 4729 346.5 3.8e-94 NP_741996 (OMIM: 605079) sal-like protein 3 [Homo (1300) 1173 98.1 3.2e-19 NP_001121364 (OMIM: 107480,602218) sal-like protei (1227) 1128 95.0 2.7e-18 NP_002959 (OMIM: 107480,602218) sal-like protein 1 (1324) 1128 95.0 2.9e-18 XP_006721304 (OMIM: 107480,602218) PREDICTED: sal- (1324) 1128 95.0 2.9e-18 XP_011521556 (OMIM: 107480,602218) PREDICTED: sal- (1324) 1128 95.0 2.9e-18 XP_005260524 (OMIM: 147750,607323,607343) PREDICTE ( 951) 525 52.7 1.1e-05 XP_011527223 (OMIM: 147750,607323,607343) PREDICTE ( 951) 525 52.7 1.1e-05 XP_011527224 (OMIM: 147750,607323,607343) PREDICTE ( 951) 525 52.7 1.1e-05 NP_065169 (OMIM: 147750,607323,607343) sal-like pr (1053) 525 52.7 1.2e-05 >>NP_005398 (OMIM: 216820,602219) sal-like protein 2 iso (1007 aa) initn: 6810 init1: 6810 opt: 6810 Z-score: 2597.0 bits: 492.1 E(85289): 6.5e-138 Smith-Waterman score: 6810; 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NP_741 LNHVESGVSATAESPQSLLGGPPLTKAEPVSLPCTNARAGDAPVGAQASAAPTSVDGAPT 570 580 590 600 610 620 560 570 580 590 600 610 pF1KSD VTSLPSWALLTNHFKSTGSFPFPYVLEPLGASPSETSKLQQLVEKIDRQGAVAVTSAASG . :. ....::. .::: .:. . . :::::::::::.::.. NP_741 SLGSPGLPAVSEQFKA--QFPFGGLLDSM--QTSETSKLQQLVENIDKK----------- 630 640 650 660 670 620 630 640 650 660 670 pF1KSD APTTSAPAPSSSASSGPNQCVICLRVLSCPRALRLHYGQHGGERPFKCKVCGRAFSTRGN . ::::::: ::::: ::..:: : ::::::::.:::::.:.:: NP_741 -------------MTDPNQCVICHRVLSCQSALKMHYRTHTGERPFKCKICGRAFTTKGN 680 690 700 710 720 680 690 700 710 720 730 pF1KSD LRAHFVGHKASPAARAQNSCPICQKKFTNAVTLQQHVRMHLGGQIPNGGTALPEGGGAAQ :..:: :.:.: :.:.:::::::::::::.::::.:::.:::::: : :::: :. NP_741 LKTHFGVHRAKPPLRVQHSCPICQKKFTNAVVLQQHIRMHMGGQIPN--TPLPEGFQDAM 730 740 750 760 770 740 750 760 pF1KSD ----------------------ENGSEQST-VSGAGSFPQQQ------SQQPSPEEELSE ::. :... .. :.. : . : ::: .: NP_741 DSELAYDDKNAETLSSYDDDMDENSMEDDAELKDAATDPAKPLLSYAGSCPPSPPSVISS 780 790 800 810 820 830 770 780 790 800 810 820 pF1KSD EEEEEDEEEEED-VTDEDSLAG-RGSESGGEKAISVRGDSEEASGAEEEVGTVAAAATAG :.. . : : . ..:.: .. :.:. .. . .:: : : : . .:: NP_741 IAALENQMKMIDSVMSCQQLTGLKSVENGSGESDRLSNDSSSAVGDLE-------SRSAG 840 850 860 870 880 890 830 840 850 860 870 pF1KSD KEMDSNEKTTQQSSLPPPPPPDSLDQPQPMEQGSSGVLGGKEEGG----KPERSSSPASA . : :....:. : : .:. . .: : ::. :: : :: .:::.: NP_741 SPALS-ESSSSQALSPAPSNGESFRSKSP---G----LGAPEEPQEIPLKTERPDSPAAA 900 910 920 930 940 880 890 900 910 920 930 pF1KSD LTPEGEATSVTLVEELSLQEA-MRKEPGESSSRKACEVCGQAFPSQAALEEHQKTHPKEG : . . :: .. . .: :. : .: :::. : ..::: : ..: :: NP_741 PGSGGAPGRAGIKEEAPFSLLFLSRERGKCPST-VCGVCGKPFACKSALEIHYRSHTKER 950 960 970 980 990 1000 940 950 960 970 980 990 pF1KSD PLFTCVFCRQGFLERATLKKHMLLAHHQVQP---FAPH---GPQNIAALSLVPGCSPSIT : :.:..::.: ..::.:.: . . : : :. ::.. .. ::. . .:.. NP_741 P-FVCALCRRGCSTMGNLKQHLLTHRLKELPSQLFDPNFALGPSQ-STPSLISSAAPTMI 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1000 pF1KSD STGLSPFPRKDDPTIP NP_741 KMEVNGHGKAMALGEGPPLPAGVQVPAGPQTVMGPGLAPMLAPPPRRTPKQHNCQSCGKT 1070 1080 1090 1100 1110 1120 >>NP_001121364 (OMIM: 107480,602218) sal-like protein 1 (1227 aa) initn: 1321 init1: 588 opt: 1128 Z-score: 449.3 bits: 95.0 E(85289): 2.7e-18 Smith-Waterman score: 1487; 35.3% identity (60.2% similar) in 937 aa overlap (171-1005:121-1008) 150 160 170 180 190 200 pF1KSD ILASPKLGATPLPPESTPAPPPPPPPPPPPGVGSGHLNIPLILEELRVLQQRQIHQMQMT :...:.: .: ..:.: .:::.::::.:. NP_001 FSVINSNVIIENLQSTKVAVAQFSQEARCGGASGGKLAVPALMEQLLALQQQQIHQLQLI 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 pF1KSD EQICRQVLLLGSLGQTVGAPASPSELPGTGTA-SSTKPLLPLFSPI-KPVQTSKTLASSS ::: .:.:::.: :.. :.: : :. :: .:..:: : : . . . .. ::.: NP_001 EQIRHQILLLAS--QNADLPTSSS--PSQGTLRTSANPLSTLSSHLSQQLAAAAGLAQSL 160 170 180 190 200 260 270 280 290 pF1KSD SSSSSS-SGA------ETPKQAFFHLYHPLGSQH-------------PFS---AGGVGRS .:.:.: ::. . :... . : .: : : :...: : NP_001 ASQSASISGVKQLPPIQLPQSSSGNTIIPSNSGSSPNMNILAAAVTTPSSEKVASSAGAS 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 pF1KSD HKPTPA----PSPAL-------PGSTDQLI--ASPHLAFPSTTGLLAAQCLGAARGLEAT : .:: :::. :.:. : :: . .::: ... .: : NP_001 HVSNPAVSSSSSPAFAISSLLSPASNPLLPQQASANSVFPSPLPNIGTTAEDLN-SLSAL 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KSD ASPGLLKPKNGSGELSYGEVMGPLEKPGGRHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPYK :. :: : .. :. . .. .::::::::::::::::::::::::::::.: NP_001 AQQRKSKPPN----VTAFEAKSTSDEAFFKHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPFK 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KSD CNVCGNRFTTRGNLKVHFHRHREKYPHVQMNPHPVPEHLDYVITSSGLPYGMSVPPEKA- ::.:::::.:.:::::::.::.:::::.::::.::::::: . ::.:.:::::.:::: NP_001 CNICGNRFSTKGNLKVHFQRHKEKYPHIQMNPYPVPEHLDNIPTSTGIPYGMSIPPEKPV 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 pF1KSD ----EEEAATP----GGGVERKPLVASTTALSATESLTLLSTSAGTATAPGLPAFNKFVL . . . : . :. : . : . :: . . : .... :: .. NP_001 TSWLDTKPVLPTLTTSVGLPLPPTLPSLIPFIKTEEPAPIPISHSATSPPGSVKSDSGGP 450 460 470 480 490 500 520 530 540 550 pF1KSD MKAVE-----PKNKADENTPPGSEGSAISGVAESS--TATRMQLSK---------LVTSL .:.. :.. . ::.. : ::.. .: ::. ::. .:.. NP_001 ESATRNLGGLPEEAEGSTLPPSGGKSEESGMVTNSVPTASSSVLSSPAADCGPAGSATTF 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 pF1KSD --PSWALLTNHFKSTGSFPFPYVLEPLGASPSETSKLQQLVEKIDRQGAVAVTSAASGAP : :....::. .::: .:. .:. :::::::::::.::.. NP_001 TNPLLPLMSEQFKA--KFPFGGLLD--SAQASETSKLQQLVENIDKK------------- 570 580 590 600 620 630 640 650 660 670 pF1KSD TTSAPAPSSSASSGPNQCVICLRVLSCPRALRLHYGQHGGERPFKCKVCGRAFSTRGNLR .. ::.:.:: ::::: ::..:: : ::::::::.:::::.:.:::. NP_001 -----------ATDPNECIICHRVLSCQSALKMHYRTHTGERPFKCKICGRAFTTKGNLK 610 620 630 640 650 680 690 700 710 720 730 pF1KSD AHFVGHKASPAARAQNSCPICQKKFTNAVTLQQHVRMHLGGQIPNGGTALPEGGGAAQEN .:. :.: : :.:.:::::::::::::.::::.:::.:::::: : .:.. . ..:. NP_001 THYSVHRAMPPLRVQHSCPICQKKFTNAVVLQQHIRMHMGGQIPN--TPVPDSYSESMES 660 670 680 690 700 710 740 750 760 770 780 pF1KSD --GS-EQSTVSGAGSFPQQQSQQPSPEEELSEEEEEEDEEEEEDVT-----DEDSLAGRG :: .... . .: ...... :: . . . : .. . . .:.:. NP_001 DTGSFDEKNFDDLDNF-SDENMEDCPEGSIPDTPKSADASQDSLSSSPLPLEMSSIAALE 720 730 740 750 760 770 790 800 810 820 830 pF1KSD SE-----SGGEKAISVRGDSEEASGAEEEVGTVAAAATAGKEMDS--------NEKTTQQ .. .: . ... : : .. : .: : ....: .:.: .:.:... NP_001 NQMKMINAGLAEQLQASLKSVENGSIEGDVLT-NDSSSVGGDMESQSAGSPAISESTSSM 780 790 800 810 820 840 850 860 870 880 890 pF1KSD SSLPPPPPPDSLDQ-PQPMEQGSSGVLGGKEEGGKPERSSSPASALTPEGEATSVTLVEE ..: : . . . :. :. . .: . .: .: .. : :: ..: .. . NP_001 QALSPSNSTQEFHKSPSIEEKPQRAVPSEFANGLSPTPVNGGALDLTS-SHAEKIIKEDS 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 pF1KSD LSLQEAMRKEPGESSSRKACEVCGQAFPSQAALEEHQKTHPKEGPLFTCVFCRQGFLERA :.. .: . :. .. ::..::..: :.::. : ..: :: : : :. : .:: .. NP_001 LGILFPFRDR-GKFKNT-ACDICGKTFACQSALDIHYRSHTKERP-FICTVCNRGFSTKG 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 pF1KSD TLKKHMLLAHHQV-----QPFAPH---GPQNIAALSLVPGCS-PSITST---GL---SPF .::.::: ::. : : : ::.. .: ..:. : :. .: :. :: NP_001 NLKQHMLT--HQMRDLPSQLFEPSSNLGPNQNSA--VIPANSLSSLIKTEVNGFVHVSPQ 950 960 970 980 990 1000 1000 pF1KSD PRKDDPTIP :: :: NP_001 DSKDTPTSHVPSGPLSSSATSPVLLPALPRRTPKQHYCNTCGKTFSSSSALQIHERTHTG 1010 1020 1030 1040 1050 1060 >>NP_002959 (OMIM: 107480,602218) sal-like protein 1 iso (1324 aa) initn: 1321 init1: 588 opt: 1128 Z-score: 449.0 bits: 95.0 E(85289): 2.9e-18 Smith-Waterman score: 1561; 33.3% identity (57.6% similar) in 1114 aa overlap (36-1005:45-1105) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD QRKPQQLISDCEGPSASENGDASEEDHPQVCAKCCAQFTDPTEFLAHQNACSTDPPVMVI :..:::.: . ...: :.. :. . :... NP_002 DPEVASLPRRDGDTEKGQPSRPTKSKDAHVCGRCCAEFFELSDLLLHKKNCTKNQLVLIV 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 pF1KSD IGGQENPNNSSASSEPRPEGHN-NPQVMDT-------------EHSNPPDSGSSVPTD-P .::: . . : : : . :. :: :: : : :. .. : NP_002 ---NENPASPPETFSPSPPPDNPDEQMNDTVNKTDQVDCSDLSEH-NGLDREESMEVEAP 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 pF1KSD TWGPERRGEESSGHFLVA----ATGTAAGGGGG--------LILASPKLGA-TPLPP--- . . : :..: .: .......:::: . . :.:: : : NP_002 VANKSGSGTSSGSHSSTAPSSSSSSSSSSGGGGSSSTGTSAITTSLPQLGDLTTLGNFSV 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 pF1KSD ----------ESTP-APPPPPPPPPPPGVGSGHLNIPLILEELRVLQQRQIHQMQMTEQI .:: : :...:.: .: ..:.: .:::.::::.:. ::: NP_002 INSNVIIENLQSTKVAVAQFSQEARCGGASGGKLAVPALMEQLLALQQQQIHQLQLIEQI 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KSD CRQVLLLGSLGQTVGAPASPSELPGTGTA-SSTKPLLPLFSPI-KPVQTSKTLASSSSSS .:.:::.: :.. :.: : :. :: .:..:: : : . . . .. ::.: .:. NP_002 RHQILLLAS--QNADLPTSSS--PSQGTLRTSANPLSTLSSHLSQQLAAAAGLAQSLASQ 260 270 280 290 300 270 280 290 pF1KSD SSS-SGA------ETPKQAFFHLYHPLGSQH-------------PFS---AGGVGRSHKP :.: ::. . :... . : .: : : :...: :: NP_002 SASISGVKQLPPIQLPQSSSGNTIIPSNSGSSPNMNILAAAVTTPSSEKVASSAGASHVS 310 320 330 340 350 360 300 310 320 330 340 pF1KSD TPA----PSPAL-------PGSTDQLI--ASPHLAFPSTTGLLAAQCLGAARGLEATASP .:: :::. :.:. : :: . .::: ... .: : :. NP_002 NPAVSSSSSPAFAISSLLSPASNPLLPQQASANSVFPSPLPNIGTTAEDLN-SLSALAQQ 370 380 390 400 410 420 350 360 370 380 390 400 pF1KSD GLLKPKNGSGELSYGEVMGPLEKPGGRHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPYKCNV :: : .. :. . .. .::::::::::::::::::::::::::::.:::. NP_002 RKSKPPN----VTAFEAKSTSDEAFFKHKCRFCAKVFGSDSALQIHLRSHTGERPFKCNI 430 440 450 460 470 480 410 420 430 440 450 460 pF1KSD CGNRFTTRGNLKVHFHRHREKYPHVQMNPHPVPEHLDYVITSSGLPYGMSVPPEKA---- :::::.:.:::::::.::.:::::.::::.::::::: . ::.:.:::::.:::: NP_002 CGNRFSTKGNLKVHFQRHKEKYPHIQMNPYPVPEHLDNIPTSTGIPYGMSIPPEKPVTSW 490 500 510 520 530 540 470 480 490 500 510 pF1KSD -EEEAATP----GGGVERKPLVASTTALSATESLTLLSTSAGTATAPGLPAFNKFVLMKA . . . : . :. : . : . :: . . : .... :: .. .: NP_002 LDTKPVLPTLTTSVGLPLPPTLPSLIPFIKTEEPAPIPISHSATSPPGSVKSDSGGPESA 550 560 570 580 590 600 520 530 540 550 pF1KSD VE-----PKNKADENTPPGSEGSAISGVAESS--TATRMQLSK---------LVTSL--P .. :.. . ::.. : ::.. .: ::. ::. .:.. : NP_002 TRNLGGLPEEAEGSTLPPSGGKSEESGMVTNSVPTASSSVLSSPAADCGPAGSATTFTNP 610 620 630 640 650 660 560 570 580 590 600 610 pF1KSD SWALLTNHFKSTGSFPFPYVLEPLGASPSETSKLQQLVEKIDRQGAVAVTSAASGAPTTS :....::. .::: .:. .:. :::::::::::.::.. NP_002 LLPLMSEQFKA--KFPFGGLLD--SAQASETSKLQQLVENIDKK---------------- 670 680 690 700 620 630 640 650 660 670 pF1KSD APAPSSSASSGPNQCVICLRVLSCPRALRLHYGQHGGERPFKCKVCGRAFSTRGNLRAHF .. ::.:.:: ::::: ::..:: : ::::::::.:::::.:.:::..:. NP_002 --------ATDPNECIICHRVLSCQSALKMHYRTHTGERPFKCKICGRAFTTKGNLKTHY 710 720 730 740 750 680 690 700 710 720 730 pF1KSD VGHKASPAARAQNSCPICQKKFTNAVTLQQHVRMHLGGQIPNGGTALPEGGGAAQEN--G :.: : :.:.:::::::::::::.::::.:::.:::::: : .:.. . ..:. : NP_002 SVHRAMPPLRVQHSCPICQKKFTNAVVLQQHIRMHMGGQIPN--TPVPDSYSESMESDTG 760 770 780 790 800 810 740 750 760 770 780 pF1KSD S-EQSTVSGAGSFPQQQSQQPSPEEELSEEEEEEDEEEEEDVT-----DEDSLAGRGSE- : .... . .: ...... :: . . . : .. . . .:.:. .. NP_002 SFDEKNFDDLDNF-SDENMEDCPEGSIPDTPKSADASQDSLSSSPLPLEMSSIAALENQM 820 830 840 850 860 870 790 800 810 820 830 pF1KSD ----SGGEKAISVRGDSEEASGAEEEVGTVAAAATAGKEMDS--------NEKTTQQSSL .: . ... : : .. : .: : ....: .:.: .:.:.....: NP_002 KMINAGLAEQLQASLKSVENGSIEGDVLT-NDSSSVGGDMESQSAGSPAISESTSSMQAL 880 890 900 910 920 840 850 860 870 880 890 pF1KSD PPPPPPDSLDQ-PQPMEQGSSGVLGGKEEGGKPERSSSPASALTPEGEATSVTLVEELSL : . . . :. :. . .: . .: .: .. : :: ..: .. . :.. 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