Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0380
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0380, 1522 aa
  1>>>pF1KSDA0380 1522 - 1522 aa - 1522 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7580+/-0.00108; mu= 0.8626+/- 0.066
 mean_var=316.4214+/-64.016, 0's: 0 Z-trim(114.2): 80  B-trim: 156 in 1/52
 Lambda= 0.072101
 statistics sampled from 14708 (14786) to 14708 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.454), width:  16
 Scan time:  6.150

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1        (1522) 10156 1071.2       0
CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1        (1562) 8887 939.3       0
CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11     (1441) 1687 190.3 3.7e-47
CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11     (1525) 1687 190.3 3.9e-47
CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11     (1544) 1687 190.3 3.9e-47
CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 879) 1268 146.5 3.3e-34
CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 912) 1268 146.6 3.4e-34
CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19       ( 927) 1268 146.6 3.5e-34
CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1        ( 986)  542 71.1   2e-11
CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1         ( 958)  537 70.5 2.8e-11
CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1        ( 985)  537 70.5 2.8e-11


>>CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1             (1522 aa)
 initn: 10156 init1: 10156 opt: 10156  Z-score: 5720.7  bits: 1071.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10156; 100.0% identity (100.0% similar) in 1522 aa overlap (1-1522:1-1522)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPEVQKHATQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPEVQKHATQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KSD ILRNMLRQEEKELQDILPLYGDTSQRPSEGRLSLDSQEGDSGLDSGTERFPSLSESLMNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ILRNMLRQEEKELQDILPLYGDTSQRPSEGRLSLDSQEGDSGLDSGTERFPSLSESLMNR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KSD NSVLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NSVLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD GYFNNESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GYFNNESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KSD GKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRNSEDARGVLCEAQEAAMPEIQEQIHDYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRNSEDARGVLCEAQEAAMPEIQEQIHDYR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KSD TKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLRERQVAEKQLAALGDILSKYEEDRSAPMDFALNTYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLRERQVAEKQLAALGDILSKYEEDRSAPMDFALNTYM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KSD SHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KSD GKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPGTQRLSTGSFPEDLLES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPGTQRLSTGSFPEDLLES
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KSD DSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSSLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSSLS
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KSD TRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTV
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KSD GKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KSD NLPELIEIHNSWCEAMKKLREEGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NLPELIEIHNSWCEAMKKLREEGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIAL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KSD ELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGT
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KSD SEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLD
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KSD LTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQ
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KSD TFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRN
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KSD ATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQ
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KSD GKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADS
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KSD ALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KSD EGDNTQLAGLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EGDNTQLAGLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGY
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KSD KVVRKAEVAGSKVVPALPESGQSEPGPPEVEGGTKATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KVVRKAEVAGSKVVPALPESGQSEPGPPEVEGGTKATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAP
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KSD MSPPQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPSRSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSPPQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPSRSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLK
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KSD DMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPC
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520  
pF1KSD PEDGSDAPLEDSTADAAASPGP
       ::::::::::::::::::::::
CCDS11 PEDGSDAPLEDSTADAAASPGP
             1510      1520  

>>CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1             (1562 aa)
 initn: 8880 init1: 8880 opt: 8887  Z-score: 5007.2  bits: 939.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 10015; 97.4% identity (97.4% similar) in 1554 aa overlap (9-1522:9-1562)

               10        20        30        40        50        60
pF1KSD MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFT
               ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KSD VSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KSD GSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPEVQKHATQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPEVQKHATQ
              130       140       150       160       170       180

              190                                               200
pF1KSD ILRNMLRQEEKELQ----------------------------------------DILPLY
       ::::::::::::::                                        ::::::
CCDS11 ILRNMLRQEEKELQRICEVYSRNPASLLEEQIEGARRRVTQLQLKIQQETGGSVDILPLY
              190       200       210       220       230       240

              210       220       230       240       250       260
pF1KSD GDTSQRPSEGRLSLDSQEGDSGLDSGTERFPSLSESLMNRNSVLSDPGLDSPRTSPVIMA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GDTSQRPSEGRLSLDSQEGDSGLDSGTERFPSLSESLMNRNSVLSDPGLDSPRTSPVIMA
              250       260       270       280       290       300

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pF1KSD RVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDPGYFNNESDIIFQDLEKLKSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDPGYFNNESDIIFQDLEKLKSR
              310       320       330       340       350       360

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pF1KSD PAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIP
              370       380       390       400       410       420

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pF1KSD EMLQAEIDSRLRNSEDARGVLCEAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EMLQAEIDSRLRNSEDARGVLCEAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLD
              430       440       450       460       470       480

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pF1KSD GDPLRERQVAEKQLAALGDILSKYEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GDPLRERQVAEKQLAALGDILSKYEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQ
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pF1KSD SAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEV
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pF1KSD KPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPGTQRLSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPGTQRLSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREE
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pF1KSD MKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSI
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pF1KSD ESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVIN
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pF1KSD ELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLR
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pF1KSD EEGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EEGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEA
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pF1KSD ESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYV
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pF1KSD NEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDK
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pF1KSD TLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDK
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pF1KSD RAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPR
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pF1KSD EPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEE
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pF1KSD LGVLPCPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LGVLPCPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGH
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pF1KSD TMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TMETQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDM
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pF1KSD GLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GLCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPES
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pF1KSD GQSEPGPPEVEGGTKATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPDSLPAGQTEPQPQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GQSEPGPPEVEGGTKATGNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPDSLPAGQTEPQPQL
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pF1KSD QGGNDDPRRPSRSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QGGNDDPRRPSRSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGG
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pF1KSD TTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASP
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pF1KSD GP
       ::
CCDS11 GP
         

>>CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11          (1441 aa)
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                                     :.:::. ::::::::::.::.:.:::::::
CCDS76                               MRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKL
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pF1KSD IKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKP
       ::::.:::::. :  :.:  :   ...  :.   ... .. ::  :      .:::.:  
CCDS76 IKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSPVL
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pF1KSD LQDPE--VQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----PSEGRLSLD------
       . . .  :... ..:::.::..:...:: .   :. : .::     .:..  .       
CCDS76 MGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQEAKKHIPQLQEQL
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pF1KSD SQEGDSGLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL-------------SDPGLDSPRTS
       :.   :. :..  :   :     ..::.  . ..::             :. . :::...
CCDS76 SKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDASRPSSDNADSPKSG
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pF1KSD PVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEEDYDPGYFNNESD---
       :    :.  ..  . :.. . .:  :..  ::.    : ::: :.: : :  ... .   
CCDS76 P--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD-DFGTEHEQINGQC
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pF1KSD IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIF
         ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:.... :..: .  .. ..:
CCDS76 SCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFF
        270       280       290       300       310       320      

      370       380       390          400       410       420     
pF1KSD LEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTL
       :...: :.:..:. ..:....:  .   ::  :  .   :: . ::.:....:.: ::..
CCDS76 LDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSM
        330       340       350       360       370       380      

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pF1KSD GLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SKYEEDRSAPMDFALN
       ::    .:   :: . :  :     ::  ::. .: . ..:   .  :::.:. :.... 
CCDS76 GLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVIL
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pF1KSD TYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPIL
        ::.: :....:  : :  .:          . :.:: :.:   ::.:.. :  ::  . 
CCDS76 MYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPKIKQS--MKKDKEGEEKGKRRGFP
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pF1KSD KYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP-GTQRLSTGSFPED
       . .: :.  :.         .:..  ..:.  .:. . ..  .:::  . .:  ... ..
CCDS76 SILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEPQDSAKLRQSGLANE
         500       510         520        530        540       550 

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pF1KSD LLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSA
         ..     .: : .  : : : .: .:              .:.    ..:..   .. 
CCDS76 GTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTGSKQVGETSAPGDTL
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pF1KSD SSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQ
       ...  .:.:  .. : ::.         . .. ...  .:   : . ..     ::.  .
CCDS76 DGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFE
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pF1KSD LSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQR
        .::: .:   :::. :...:. ::   :: ::::::::: :: .:.:::.::: .::::
CCDS76 -NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQR
         660         670       680       690       700       710   

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pF1KSD MKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLRE--EGPIIKEISDLMLARFDGPA
       ...:...   :: ..: :: .....: .  : :: .:.  :  .: .:.. .:. :.::.
CCDS76 VSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPG
           720       730       740       750       760       770   

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pF1KSD REELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQR
       .:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: ::::::.:.: ..:::
CCDS76 EEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQR
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pF1KSD LTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLD
       ::::::::..: :.::  : :.::. .: :.::.::.:::.:::..::..::: ::.:::
CCDS76 LTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLD
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pF1KSD ATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDE
       ...:. .  : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..:::::.::::::::.
CCDS76 TSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDD
            900       910       920       930       940       950  

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       .:.:.::::  ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.:  :  :  :::::::
CCDS76 RLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGA-QIYELVA
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pF1KSD LTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGPTPSRVELDDSDVFH
        : :.:..:..:. . .  .... .. :.:.    ::  .  .. :.  . :    .:  
CCDS76 QTVSEKTVWQDLICR-MAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVT-
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pF1KSD GEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP---CPSTSLDGENRGI
       :   :..  :  ..   ...: :   ..    :..: ..: :           ::  . .
CCDS76 GLQSPDRDLGLESTL--ISSKPQS--HSLSTSGKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEV
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pF1KSD RTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLT
          .  ..:.:    :.  :  : .::...  :..:.. .:     .  ...::   :  
CCDS76 G--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL----GLTEKSVQE---DWQ
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pF1KSD PTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRTRNS
         :   .... :    .  ..  ..:. ..  .: ::. : .   :  .  .  ::: . 
CCDS76 HFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTGDIATCY-SPRTSTE
       1180          1190      1200       1210      1220       1230

        1300       1310      1320      1330      1340              
pF1KSD GIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQ---------SEP
       ..  .:. . .:: .:.....     ...   :.   .   .: .::.         :. 
CCDS76 SF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDE
               1240      1250      1260      1270      1280        

        1350               1360      1370              1380        
pF1KSD GPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPP--DSSTDHSEA------PMSP-PQPD
       .: : .:..         . .::  :. . .  :  .::::.  :      ::.  :  .
CCDS76 NPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGN--YLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVE
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      1390      1400      1410                       1420      1430
pF1KSD SLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPPSLALRDVGMIFHTIE
       :    :  ::   . :  .:  :                  .:: : :  . ..:.. :.
CCDS76 STHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCA-DSQSQIMEYIH
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pF1KSD QLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASD
       ..   :..:: .: ..  : . :.:                                   
CCDS76 KIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS                        
        1410      1420      1430      1440                         

>>CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11          (1525 aa)
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                     10        20        30        40        50    
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CCDS55 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTGLVQRCVIIQKDD
               10        20        30        40        50        60

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pF1KSD HGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKLIKSGAY
       .:::.:::::  :.::::.  ::::.:::. ::::::::::.::.:.:::::::::::.:
CCDS55 NGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKLIKSGSY
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pF1KSD VALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPE-
       ::::. :  :.:  :   ...  :.   ... .. ::  :      .:::.:  . . . 
CCDS55 VALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSPVLMGEENN
              130       140       150       160       170       180

            180       190       200            210             220 
pF1KSD -VQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----PSEGRLSLD------SQEGDS
        :... ..:::.::..:...:: .   :. : .::     .:..  .       :.   :
CCDS55 VVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQEAKKHIPQLQEQLSKATGS
              190       200       210       220       230       240

               230            240                    250       260 
pF1KSD GLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL-------------SDPGLDSPRTSPVIMAR
       . :..  :   :     ..::.  . ..::             :. . :::...:    :
CCDS55 AQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDASRPSSDNADSPKSGP--KER
              250       260       270       280       290          

             270       280           290       300          310    
pF1KSD VAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEEDYDPGYFNNESD---IIFQDL
       .  ..  . :.. . .:  :..  ::.    : ::: :.: : :  ... .     ::..
CCDS55 IYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD-DFGTEHEQINGQCSCFQSI
      300       310        320       330        340       350      

          320       330       340       350       360       370    
pF1KSD EKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIFLEKNAP
       : ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:.... :..: .  .. ..::...: 
CCDS55 ELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAH
        360       370       380       390       400       410      

          380       390          400       410       420       430 
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       :.:..:. ..:....:  .   ::  :  .   :: . ::.:....:.: ::..::    
CCDS55 LKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAE
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pF1KSD GENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SKYEEDRSAPMDFALNTYMSHA
       .:   :: . :  :     ::  ::. .: . ..:   .  :::.:. :....  ::.: 
CCDS55 SELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHL
        480       490       500       510       520       530      

           490       500       510       520       530       540   
pF1KSD GIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYIGKP
       :....:  : :  .:      . . . :.:: :.:   ::.:.. :  ::  . . .: :
CCDS55 GVKVKE--PRNLEHK------RGR-IGFLPKIKQSM--KKDKEGEEKGKRRGFPSILGPP
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           550       560       570       580        590       600  
pF1KSD KSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP-GTQRLSTGSFPEDLLESD-
       .  :.         .:..  ..:.  .:. . ..  .:::  . .:  ... ..  ..  
CCDS55 RRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY
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pF1KSD ---SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSS
          .: : .  : : : .: .:              .:.    ..:..   .. ...  .
CCDS55 LPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRT
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pF1KSD LSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEP
       :.:  .. : ::.         . .. ...  .:   : . ..     ::.  . .::: 
CCDS55 LNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFE-NDLET
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pF1KSD EPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENL
       .:   :::. :...:. ::   :: ::::::::: :: .:.:::.::: .::::...:..
CCDS55 DPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGI
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       .   :: ..: :: .....: .  : :: .:.  :  .: .:.. .:. :.::..:.:..
CCDS55 LSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKH
           810       820       830       840       850       860   

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pF1KSD VAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPL
       .:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: ::::::.:.: ..:::::::::
CCDS55 AAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPL
           870       880       890       900       910       920   

       890       900       910       920       930       940       
pF1KSD LLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALER
       ::..: :.::  : :.::. .: :.::.::.:::.:::..::..::: ::.:::...:. 
CCDS55 LLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKL
           930        940       950       960       970       980  

       950       960       970       980       990      1000       
pF1KSD ASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKC
       .  : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..:::::.::::::::..:.:.:
CCDS55 SEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRC
            990      1000      1010      1020      1030      1040  

      1010      1020      1030      1040      1050      1060       
pF1KSD HSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDK
       :::  ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.:  :  :  ::::::: : :.:
CCDS55 HSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGA-QIYELVAQTVSEK
           1050      1060      1070      1080       1090      1100 

      1070      1080      1090      1100      1110      1120       
pF1KSD NTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPE
       ..:..:. . .  .... .. :.:.    ::  .  .. :.  . :    .:  :   :.
CCDS55 TVWQDLICR-MAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVT-GLQSPD
            1110       1120      1130      1140      1150          

      1130      1140      1150      1160         1170      1180    
pF1KSD ELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP---CPSTSLDGENRGIRTRNPI
       .  :  ..   ...: :   ..    :..: ..: :           ::  . .   .  
CCDS55 RDLGLESTL--ISSKPQS--HSLSTSGKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVG--EDY
    1160        1170        1180      1190      1200      1210     

         1190         1200      1210      1220      1230      1240 
pF1KSD HLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVI
       ..:.:    :.  :  : .::...  :..:.. .:  : :   ...::   :    :   
CCDS55 QIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL--GLT--EKSVQE---DWQHFPRYR
          1220      1230      1240        1250           1260      

            1250      1260      1270      1280      1290      1300 
pF1KSD SVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESP
       .... :    .  ..  ..:. ..  .: ::. : .   :  .  .  ::: . ..  .:
CCDS55 TASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTGDIATCY-SPRTSTESF--AP
       1270          1280      1290       1300       1310          

             1310      1320      1330      1340               1350 
pF1KSD ELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQ---------SEPGPPEVE
       . . .:: .:.....     ...   :.   .   .: .::.         :. .: : .
CCDS55 RDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENPSEGD
     1320      1330      1340      1350      1360      1370        

                     1360      1370              1380       1390   
pF1KSD GGT---------KATGNCFYVSMPSGPP--DSSTDHSEA------PMSP-PQPDSLPAGQ
       :..         . .::  :. . .  :  .::::.  :      ::.  :  .:    :
CCDS55 GAVNKEEKDVNLRISGN--YLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQQQ
     1380      1390        1400      1410      1420      1430      

          1400      1410                       1420      1430      
pF1KSD TEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKL
         ::   . :  .:  :                  .:: : :  . ..:.. :...   :
CCDS55 HSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ-SQIMEYIHKIEADL
       1440      1450      1460      1470      1480       1490     

       1440      1450      1460      1470      1480      1490      
pF1KSD NRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHE
       ..:: .: ..  : . :.:                                         
CCDS55 EHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS                              
        1500      1510      1520                                   

>>CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11          (1544 aa)
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                                       10        20        30      
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                                     :...:..:     :  :  .: .. .. :.
CCDS41 TQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIAS----HDFDPTDSSSKKTKSSSE
            10        20        30        40            50         

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pF1KSD AS--ETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNG
        :  :  ::::::::::::..:::.:::::  :.::::.  ::::.:::. :::::::::
CCDS41 ESRSEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNG
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pF1KSD TMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPP
       :.::.:.:::::::::::.:::::. :  :.:  :   ...  :.   ... .. ::  :
CCDS41 TLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSP
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KSD PPLPPPQRITGPKPLQDPE--VQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----P
             .:::.:  . . .  :... ..:::.::..:...:: .   :. : .::     
CCDS41 GASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEI
     180       190       200       210       220       230         

       210             220         230            240              
pF1KSD SEGRLSLD------SQEGDSGLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL----------
       .:..  .       :.   :. :..  :   :     ..::.  . ..::          
CCDS41 QEAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDA
     240       250       260       270       280       290         

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pF1KSD ---SDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEED
          :. . :::...:    :.  ..  . :.. . .:  :..  ::.    : ::: :.:
CCDS41 SRPSSDNADSPKSGP--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD
     300       310         320        330       340       350      

       300          310       320       330       340       350    
pF1KSD YDPGYFNNESD---IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASP
        : :  ... .     ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:.... 
CCDS41 -DFGTEHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNS
         360       370       380       390       400       410     

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pF1KSD KDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLCEAQEAAMPE
       :..: .  .. ..::...: :.:..:. ..:....:  .   ::  :  .   :: . ::
CCDS41 KETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPE
         420       430       440       450       460       470     

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pF1KSD IQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SK
       .:....:.: ::..::    .:   :: . :  :     ::  ::. .: . ..:   . 
CCDS41 VQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQA
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pF1KSD YEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKK
        :::.:. :....  ::.: :....:  : :  .:          . :.:: :.:   ::
CCDS41 VEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPKIKQS--MKK
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pF1KSD EKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP
       .:.. :  ::  . . .: :.  :.         .:..  ..:.  .:. . ..  .:::
CCDS41 DKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEP
          590       600       610       620          630        640

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pF1KSD -GTQRLSTGSFPEDLLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVD
         . .:  ... ..  ..     .: : .  : : : .: .:              .:. 
CCDS41 QDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTG
              650       660       670       680                    

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pF1KSD MDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCT
          ..:..   .. ...  .:.:  .. : ::.         . .. ...  .:   : .
CCDS41 SKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDS
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     690       700       710       720       730       740         
pF1KSD DTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASH
        ..     ::.  . .::: .:   :::. :...:. ::   :: ::::::::: :: .:
CCDS41 VAFGESQSEDEQFE-NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAH
         750        760         770       780       790       800  

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pF1KSD LRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLRE--EGPIIK
       .:::.::: .::::...:...   :: ..: :: .....: .  : :: .:.  :  .: 
CCDS41 VRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVID
            810       820       830       840       850       860  

       810       820       830       840       850       860       
pF1KSD EISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCR
       .:.. .:. :.::..:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: ::
CCDS41 QIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCR
            870       880       890       900       910       920  

       870       880       890       900       910       920       
pF1KSD RLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQT
       ::::.:.: ..:::::::::::..: :.::  : :.::. .: :.::.::.:::.:::..
CCDS41 RLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEA
            930       940       950        960       970       980 

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pF1KSD ENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVL
       ::..::: ::.:::...:. .  : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..:
CCDS41 ENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTL
             990      1000      1010      1020      1030      1040 

       990      1000      1010      1020      1030      1040       
pF1KSD LLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIIC
       ::::.::::::::..:.:.::::  ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.: 
CCDS41 LLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVIS
            1050      1060      1070      1080      1090      1100 

      1050      1060      1070      1080      1090      1100       
pF1KSD TSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGP
        :  :  ::::::: : :.:..:..:. . .  .... .. :.:.    ::  .  .. :
CCDS41 MSDNGA-QIYELVAQTVSEKTVWQDLICR-MAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDP
             1110      1120       1130      1140      1150         

      1110      1120      1130      1140      1150      1160       
pF1KSD TPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP--
       .  . :    .:  :   :..  :  ..    . . . :       :..: ..: :    
CCDS41 SKLKEEQHGISVT-GLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSL----STSGKSEVRDLFVAERQ
    1160      1170       1180      1190          1200      1210    

         1170      1180      1190         1200      1210      1220 
pF1KSD -CPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHT
              ::  . .   .  ..:.:    :.  :  : .::...  :..:.. .:  : :
CCDS41 FAKEQHTDGTLKEVG--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL--GLT
         1220        1230      1240      1250      1260        1270

            1230      1240      1250      1260      1270      1280 
pF1KSD METQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDMG
          ...::   :    :   .... :    .  ..  ..:. ..  .: ::. : .   :
CCDS41 --EKSVQE---DWQHFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTG
                  1280      1290          1300       1310      1320

            1290      1300       1310      1320      1330      1340
pF1KSD LCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPES
         .  .  ::: . ..  .:. . .:: .:.....     ...   :.   .   .: .:
CCDS41 DIATCY-SPRTSTESF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDS
              1330        1340      1350      1360      1370       

                      1350               1360      1370            
pF1KSD GQ---------SEPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPP--DSSTDHSEA-
       :.         :. .: : .:..         . .::  :. . .  :  .::::.  : 
CCDS41 GEHFFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGN--YLILDGYDPVQESSTDEEVAS
      1380      1390      1400      1410        1420      1430     

         1380       1390      1400      1410                       
pF1KSD -----PMSP-PQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPPS
            ::.  :  .:    :  ::   . :  .:  :                  .:: :
CCDS41 SLTLQPMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSS
        1440      1450      1460      1470      1480      1490     

       1420      1430      1440      1450      1460      1470      
pF1KSD LALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTD
        :  . ..:.. :...   :..:: .: ..  : . :.:                     
CCDS41 CA-DSQSQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS          
         1500      1510      1520      1530      1540              

       1480      1490      1500      1510      1520  
pF1KSD GSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP

>>CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19            (879 aa)
 initn: 806 init1: 712 opt: 1268  Z-score: 727.5  bits: 146.5 E(32554): 3.3e-34
Smith-Waterman score: 1447; 35.4% identity (60.6% similar) in 923 aa overlap (273-1165:8-824)

            250       260       270       280       290       300  
pF1KSD VLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDPGY
                                     :: :. .  :.   :  .: . .::..   
CCDS12                        MEDFARGAASPGPSRPGL--VPVSIIGAEDEDFENEL
                                      10          20        30     

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FNN--ESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSL
        .:  :..  ::.::..: ::::: ..:...  : .:.::.                   
CCDS12 ETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLV-------------------
          40        50        60        70                         

              370       380       390           400       410      
pF1KSD GKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN---SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQI
                     ::: .:  .  :.: : :    :::. :  . :. .. .  . .:.
CCDS12 --------------LRVPVPPNVAFELD-RTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQL
                       80        90        100       110       120 

        420       430             440       450       460          
pF1KSD HDYRTKRTLGLGSLYGENDLL------DLDGDPLRERQVAEKQLAALGDILSKY--EEDR
       .:.:.:: .:.     :   :      :  .   :::.:::. :  : ..      .:..
CCDS12 EDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEK
             130       140       150       160       170       180 

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pF1KSD SAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDAL
       :: .  :.. :: : :.: . .             :: .   :: : :  .: .... : 
CCDS12 SAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG-------------DKKSGRNFFRK-KVMGNRRSDEPAK
             190       200                    210        220       

      530       540       550       560       570       580        
pF1KSD EDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPG-TQR
         :  . ::      ..  :    .:         . :..      . . :: .:: :.:
CCDS12 TKKGLSSILDAARWNRGEPQ----VP---------DFRHL------KAEVDAEKPGATDR
       230       240                    250             260        

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD LSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATR
        .  ..:        ::.     :. .  :..    : .    : : .. : . .:.:  
CCDS12 KGGVGMP--------SRD-----RNIGAPGQDTPGVSLH----PLSLDSPDREPGADAP-
      270                    280       290           300       310 

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pF1KSD LHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDL
       :. . ::  . .: .::   .:: .   : .. :::  :   :       : . :. : :
CCDS12 LELGDSSPQGPMSLESL---APPESTDEGAET-ESPEPG---D-------EGEPGR-SGL
              320          330        340                 350      

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pF1KSD EPEPDAQ-NWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKK
       : ::.   .:.. :  :.. .: . .. :::::.::.::::.:.: ::::  .:.: : .
CCDS12 ELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAE
         360       370       380       390       400       410     

        770       780       790       800        810       820     
pF1KSD ENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREE-GPIIKEISDLMLARFDGPAREEL
         ..: :::  .::.: ::::.:. . . . : :.: : .:.::.:..::::::     .
CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMKRRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWF
         420       430       440       450       460       470     

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pF1KSD QQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKY
       :.....::: ::.::: .:.::::. ::  :.:::::.:.::::::.:.: .::::::::
CCDS12 QKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKY
         480       490       500       510       520       530     

         890       900       910       920       930       940     
pF1KSD PLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATAL
       ::::.:: ..::  : :.::.  : . :::::..::.::.. :.  ::. ::.::: . :
CCDS12 PLLLQSIGQNTEEPT-EREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHL
         540       550        560       570       580       590    

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pF1KSD ERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLL
       ...:.:. .:::.::.: .:..::::::::..:::....:::::.:::.:::.:::.:::
CCDS12 RQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLL
          600       610       620       630       640       650    

        1010      1020      1030      1040      1050      1060     
pF1KSD KCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSS
       : ::.: . . :.:  . :::.:.... : ::::..::... :      ::::::: : :
CCDS12 KSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQ-EAQIYELVAQTVS
          660       670       680       690       700        710   

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pF1KSD DKNTWMELLEEAVRN-ATRHPGAAPMPVHPPPPGPREP----AQQG-------PTPSRVE
       ....:  :. :.. .  .  :.. : : .: : . :::    ...:       :. .:.:
CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKP-RPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTE
           720       730       740        750       760       770  

          1120       1130      1140      1150      1160      1170  
pF1KSD LDDSDVF-HGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLD
          ::..   .: ::   ..: . ..: . .:.:.   :..:..  ..   .:       
CCDS12 RILSDLLPFCRPGPEGQLAAT-ALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSP
            780       790        800       810       820       830 

           1180      1190      1200      1210      1220      1230  
pF1KSD GENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPED
                                                                   
CCDS12 ARTQEIQENLLSLEETMKQLEELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT            
             840       850       860       870                     

>>CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19            (912 aa)
 initn: 897 init1: 712 opt: 1268  Z-score: 727.3  bits: 146.6 E(32554): 3.4e-34
Smith-Waterman score: 1575; 36.6% identity (62.9% similar) in 923 aa overlap (273-1165:8-857)

            250       260       270       280       290       300  
pF1KSD VLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDPGY
                                     :: :. .  :.   :  .: . .::..   
CCDS12                        MEDFARGAASPGPSRPGL--VPVSIIGAEDEDFENEL
                                      10          20        30     

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FNN--ESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSL
        .:  :..  ::.::..: ::::: ..:...  : .:.:::  : :..  . .::.... 
CCDS12 ETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKA
          40        50        60        70        80        90     

              370       380       390           400       410      
pF1KSD GKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN---SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQI
         :... ::::.: ::: .:  .  :.: : :    :::. :  . :. .. .  . .:.
CCDS12 FLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAFELD-RTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQL
         100       110       120        130       140       150    

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pF1KSD HDYRTKRTLGLGSLYGENDLL------DLDGDPLRERQVAEKQLAALGDILSKY--EEDR
       .:.:.:: .:.     :   :      :  .   :::.:::. :  : ..      .:..
CCDS12 EDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEK
          160       170       180       190       200       210    

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD SAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDAL
       :: .  :.. :: : :.: . .             :: .   :: : :  .: .... : 
CCDS12 SAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG-------------DKKSGRNFFRK-KVMGNRRSDEPAK
          220       230                    240        250       260

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pF1KSD EDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPG-TQR
         :  . ::      ..  :    .:         . :..      . . :: .:: :.:
CCDS12 TKKGLSSILDAARWNRGEPQ----VP---------DFRHL------KAEVDAEKPGATDR
              270       280                          290       300 

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pF1KSD LSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATR
        .  ..:        ::.     :. .  :..    : .    : : .. : . .:.:  
CCDS12 KGGVGMP--------SRD-----RNIGAPGQDTPGVSLH----PLSLDSPDREPGADAP-
                     310            320           330       340    

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDL
       :. . ::  . .: .::   .:: .   : .. :::  :   :       : . :. : :
CCDS12 LELGDSSPQGPMSLESL---APPESTDEGAET-ESPEPG---D-------EGEPGR-SGL
           350       360          370                  380         

       710        720       730       740       750       760      
pF1KSD EPEPDAQ-NWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKK
       : ::.   .:.. :  :.. .: . .. :::::.::.::::.:.: ::::  .:.: : .
CCDS12 ELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAE
      390       400       410       420       430       440        

        770       780       790       800        810       820     
pF1KSD ENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREE-GPIIKEISDLMLARFDGPAREEL
         ..: :::  .::.: ::::.:. . . . : :.: : .:.::.:..::::::     .
CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMKRRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWF
      450       460       470       480       490       500        

         830       840       850       860       870       880     
pF1KSD QQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKY
       :.....::: ::.::: .:.::::. ::  :.:::::.:.::::::.:.: .::::::::
CCDS12 QKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKY
      510       520       530       540       550       560        

         890       900       910       920       930       940     
pF1KSD PLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATAL
       ::::.:: ..::  : :.::.  : . :::::..::.::.. :.  ::. ::.::: . :
CCDS12 PLLLQSIGQNTEEPT-EREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHL
      570       580        590       600       610       620       

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KSD ERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLL
       ...:.:. .:::.::.: .:..::::::::..:::....:::::.:::.:::.:::.:::
CCDS12 RQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLL
       630       640       650       660       670       680       

        1010      1020      1030      1040      1050      1060     
pF1KSD KCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSS
       : ::.: . . :.:  . :::.:.... : ::::..::... :      ::::::: : :
CCDS12 KSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQ-EAQIYELVAQTVS
       690       700       710       720       730        740      

        1070      1080       1090      1100                 1110   
pF1KSD DKNTWMELLEEAVRN-ATRHPGAAPMPVHPPPPGPREP----AQQG-------PTPSRVE
       ....:  :. :.. .  .  :.. : : .: : . :::    ...:       :. .:.:
CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKP-RPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTE
        750       760       770        780       790       800     

          1120       1130      1140      1150      1160      1170  
pF1KSD LDDSDVF-HGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLD
          ::..   .: ::   ..: . ..: . .:.:.   :..:..  ..   .:       
CCDS12 RILSDLLPFCRPGPEGQLAAT-ALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSP
         810       820        830       840       850       860    

           1180      1190      1200      1210      1220      1230  
pF1KSD GENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPED
                                                                   
CCDS12 ARTQEIQENLLSLEETMKQLEELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT            
          870       880       890       900       910              

>>CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19            (927 aa)
 initn: 897 init1: 712 opt: 1268  Z-score: 727.2  bits: 146.6 E(32554): 3.5e-34
Smith-Waterman score: 1575; 36.6% identity (62.9% similar) in 923 aa overlap (273-1165:23-872)

            250       260       270       280       290       300  
pF1KSD VLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDPGY
                                     :: :. .  :.   :  .: . .::..   
CCDS12         MASLSTWSSPAEPREMEDFARGAASPGPSRPGL--VPVSIIGAEDEDFENEL
                       10        20        30          40        50

              310       320       330       340       350       360
pF1KSD FNN--ESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSL
        .:  :..  ::.::..: ::::: ..:...  : .:.:::  : :..  . .::.... 
CCDS12 ETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKA
               60        70        80        90       100       110

              370       380       390           400       410      
pF1KSD GKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN---SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQI
         :... ::::.: ::: .:  .  :.: : :    :::. :  . :. .. .  . .:.
CCDS12 FLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAFELD-RTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQL
              120       130        140       150       160         

        420       430             440       450       460          
pF1KSD HDYRTKRTLGLGSLYGENDLL------DLDGDPLRERQVAEKQLAALGDILSKY--EEDR
       .:.:.:: .:.     :   :      :  .   :::.:::. :  : ..      .:..
CCDS12 EDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEK
     170       180       190       200       210       220         

      470       480       490       500       510       520        
pF1KSD SAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDAL
       :: .  :.. :: : :.: . .             :: .   :: : :  .: .... : 
CCDS12 SAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG-------------DKKSGRNFFRK-KVMGNRRSDEPAK
     230       240       250                    260        270     

      530       540       550       560       570       580        
pF1KSD EDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPG-TQR
         :  . ::      ..  :    .:         . :..      . . :: .:: :.:
CCDS12 TKKGLSSILDAARWNRGEPQ----VP---------DFRHL------KAEVDAEKPGATDR
         280       290                    300             310      

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD LSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATR
        .  ..:        ::.     :. .  :..    : .    : : .. : . .:.:  
CCDS12 KGGVGMP--------SRD-----RNIGAPGQDTPGVSLH----PLSLDSPDREPGADAP-
        320                    330       340           350         

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD LHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDL
       :. . ::  . .: .::   .:: .   : .. :::  :   :       : . :. : :
CCDS12 LELGDSSPQGPMSLESL---APPESTDEGAET-ESPEPG---D-------EGEPGR-SGL
      360       370          380        390                 400    

       710        720       730       740       750       760      
pF1KSD EPEPDAQ-NWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKK
       : ::.   .:.. :  :.. .: . .. :::::.::.::::.:.: ::::  .:.: : .
CCDS12 ELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAE
           410       420       430       440       450       460   

        770       780       790       800        810       820     
pF1KSD ENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREE-GPIIKEISDLMLARFDGPAREEL
         ..: :::  .::.: ::::.:. . . . : :.: : .:.::.:..::::::     .
CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMKRRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWF
           470       480       490       500       510       520   

         830       840       850       860       870       880     
pF1KSD QQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKY
       :.....::: ::.::: .:.::::. ::  :.:::::.:.::::::.:.: .::::::::
CCDS12 QKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKY
           530       540       550       560       570       580   

         890       900       910       920       930       940     
pF1KSD PLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATAL
       ::::.:: ..::  : :.::.  : . :::::..::.::.. :.  ::. ::.::: . :
CCDS12 PLLLQSIGQNTEEPT-EREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHL
           590        600       610       620       630       640  

         950       960       970       980       990      1000     
pF1KSD ERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLL
       ...:.:. .:::.::.: .:..::::::::..:::....:::::.:::.:::.:::.:::
CCDS12 RQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLL
            650       660       670       680       690       700  

        1010      1020      1030      1040      1050      1060     
pF1KSD KCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSS
       : ::.: . . :.:  . :::.:.... : ::::..::... :      ::::::: : :
CCDS12 KSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQ-EAQIYELVAQTVS
            710       720       730       740        750       760 

        1070      1080       1090      1100                 1110   
pF1KSD DKNTWMELLEEAVRN-ATRHPGAAPMPVHPPPPGPREP----AQQG-------PTPSRVE
       ....:  :. :.. .  .  :.. : : .: : . :::    ...:       :. .:.:
CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKP-RPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTE
             770       780        790       800       810       820

          1120       1130      1140      1150      1160      1170  
pF1KSD LDDSDVF-HGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLD
          ::..   .: ::   ..: . ..: . .:.:.   :..:..  ..   .:       
CCDS12 RILSDLLPFCRPGPEGQLAAT-ALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSP
              830       840        850       860       870         

           1180      1190      1200      1210      1220      1230  
pF1KSD GENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPED
                                                                   
CCDS12 ARTQEIQENLLSLEETMKQLEELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT            
     880       890       900       910       920                   

>>CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1             (986 aa)
 initn: 591 init1: 268 opt: 542  Z-score: 318.7  bits: 71.1 E(32554): 2e-11
Smith-Waterman score: 667; 25.0% identity (54.1% similar) in 913 aa overlap (611-1442:106-970)

              590       600       610       620       630       640
pF1KSD PEPGTQRLSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMD
                                     .: ::...  ...  ..   :   :: .. 
CCDS53 HNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYP---SD-SFR
          80        90       100       110       120           130 

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pF1KSD AAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPS---LGFCTDTLLPHLL
        .  ..:  .:. : ..:.:: .. .     .: .: : : : :   :.. . ::  . :
CCDS53 QSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESP-LGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESL
             140       150       160        170       180       190

       700             710         720       730       740         
pF1KSD EDDLG-----QLSDLE-PEPD--AQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASH
        :.        .::.:  : :  :..:. .: .. .    .. . .:.:: ::. ::  :
CCDS53 IDEAEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHH
              200       210       220       230       240       250

     750       760       770       780       790       800         
pF1KSD LRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREEG--P---
       .:::...  .:   : .:  .    .  ::: . :: .::. .   . . :...  :   
CCDS53 VRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGST
              260       270       280       290       300       310

             810       820       830       840       850       860 
pF1KSD ---IIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAE
          .:....::....:.::. :.. .. ..::: .: ::.: :    ...::: :.... 
CCDS53 RNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQFIRKVT
              320       330       340       350       360       370

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pF1KSD SHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVN
            .:  ... :.   ::.::::::.  :..:..:   :.. :  :    .:.:. :.
CCDS53 RPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKELLSNVD
              380       390       400       410       420       430

             930       940       950         960       970         
pF1KSD EAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAE--FKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKD
       :.. : :.  ::.   .:.:     ::..:. ..  :   .:  ::.::.: : :. .  
CCDS53 EGIYQLEKGARLQEIYNRMDP----RAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGCLLWKTATG
              440       450           460       470       480      

     980       990      1000      1010      1020      1030         
pF1KSD KTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATD
       .  :. :::. :.::.::..:.: ..   .: .:            ..:. ...:..:..
CCDS53 RFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSV------------VSLQNLIVRDIANQ
        490       500       510       520                   530    

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pF1KSD KRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGP
       ....:.: ..   ::..::. . . .:..::.......::.    :.   .:.       
CCDS53 EKGMFLISAA---PPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTC---PSREDFPLIETEDEA
          540          550       560       570          580        

      1100      1110          1120                  1130      1140 
pF1KSD --REPAQQGPTPSR--VEL--DDSDVF----HGEPEPE--------ELPGGTGSQQRVQG
         :.  ..    .:  :::  .   .:    : . : .         :: :   .. ...
CCDS53 YLRRIKMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLES
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pF1KSD -KHQVLLEDP--EQEGSAEEE-----ELGVLP-CPSTSLDGENRGIR----TRNPIHLAF
        . . ::.:   : ::  .       :: . :  :.  :. .. :      : :    .:
CCDS53 PRGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTF
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pF1KSD PGPLFM-EGLADSALEDV----------ENLRHLI-LWSLLPGHTMETQAAQEP---EDD
        : . . .. .::. .:           : :..:. :..::  : ... .::.    :  
CCDS53 NGSIELCRADSDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLL--HGLQAAVAQQDTLMEAR
      710       720       730       740         750       760      

              1240      1250      1260      1270       1280        
pF1KSD LTPTP----SVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPE-QEDMGLCSLEHL
       .   :    ..  ..:.  . :  : :: . : . :.:: :. ..   ::..  :     
CCDS53 FPEGPERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCR----
        770       780       790       800       810       820      

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pF1KSD PPRTRNSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQSEPGPP
         :  .    :.  :.  : :    .: : .  . :.:: :  . . ::   ::.:: : 
CCDS53 --RLGEERATEAGSLEARLRE----SEQARAL-LEREAEEA-RRQLAAL---GQTEPLPA
              830       840            850        860          870 

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pF1KSD EVEGGTKAT---------GNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPDSLPAGQTEPQPQ
       :.  . . .         :. .:.:.    :. .::. . :..  .       . : . .
CCDS53 EAPWARRPVDPRRRSLPAGDALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTRSVHR----NFEDRER
             880       890       900       910       920           

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pF1KSD LQGGNDDPRRPSRSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSG
        . :. . :  . : :. . .. :    .  .    ..:..:.                 
CCDS53 QELGSPEERLQDSSDPDTGSEEEGSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETESRDGEAVASES 
       930       940       950       960       970       980       

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pF1KSD GTTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAAS

>>CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1              (958 aa)
 initn: 591 init1: 268 opt: 537  Z-score: 316.0  bits: 70.5 E(32554): 2.8e-11
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pF1KSD PEPGTQRLSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMD
                                     .: ::...  ...  ..   :   :: .. 
CCDS11 HNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYP---SD-SFR
       50        60        70        80        90          100     

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pF1KSD AAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPS---LGFCTDTL-LPHL
        .  ..:  .:. : ..:.:: .. .     .: .: : : : :   :.. . :: .  :
CCDS11 QSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESP-LGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESL
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pF1KSD LEDDLGQ---LSDLE-PEPD--AQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHL
       .....     .::.:  : :  :..:. .: .. .    .. . .:.:: ::. ::  :.
CCDS11 IDEEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHHV
           170       180       190       200       210       220   

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pF1KSD RTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREEG--P----
       :::...  .:   : .:  .    .  ::: . :: .::. .   . . :...  :    
CCDS11 RTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGSTR
           230       240       250       260       270       280   

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pF1KSD --IIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAES
         .:....::....:.::. :.. .. ..::: .: ::.: :    ...::: :....  
CCDS11 NFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQFIRKVTR
           290       300       310       320       330       340   

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pF1KSD HPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNE
           .:  ... :.   ::.::::::.  :..:..:   :.. :  :    .:.:. :.:
CCDS11 PAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKELLSNVDE
           350       360       370       380       390       400   

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pF1KSD AVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAE--FKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDK
       .. : :.  ::.   .:.:     ::..:. ..  :   .:  ::.::.: : :. .  .
CCDS11 GIYQLEKGARLQEIYNRMDP----RAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGCLLWKTATGR
           410       420           430       440       450         

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pF1KSD TLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDK
         :. :::. :.::.::..:.: ..   .: .:            ..:. ...:..:...
CCDS11 FKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSV------------VSLQNLIVRDIANQE
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pF1KSD RAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGP-
       ...:.: ..   ::..::. . . .:..::.......::.    :.   .:.        
CCDS11 KGMFLISAA---PPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTC---PSREDFPLIETEDEAY
       510          520       530       540          550       560 

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pF1KSD -REPAQQGPTPSR--VEL--DDSDVF----HGEPEPE--------ELPGGTGSQQRVQG-
        :.  ..    .:  :::  .   .:    : . : .         :: :   .. ... 
CCDS11 LRRIKMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLESP
             570       580       590       600       610       620 

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pF1KSD KHQVLLEDP--EQEGSAEEE-----ELGVLP-CPSTSLDGENRGIR----TRNPIHLAFP
       . . ::.:   : ::  .       :: . :  :.  :. .. :      : :    .: 
CCDS11 RGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTFN
             630       640       650       660       670       680 

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pF1KSD GPLFM-EGLADSALEDV----------ENLRHLI-LWSLLPGHTMETQAAQEP---EDDL
       : . . .. .::. .:           : :..:. :..::  : ... .::.    :  .
CCDS11 GSIELCRADSDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLL--HGLQAAVAQQDTLMEARF
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pF1KSD TPTP----SVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPE-QEDMGLCSLEHLP
          :    ..  ..:.  . :  : :: . : . :.:: :. ..   ::..  :      
CCDS11 PEGPERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCR-----
     740       750       760       770       780       790         

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pF1KSD PRTRNSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQSEPGPPE
        :  .    :.  :.  : :    .: : .  . :.:: :  . . ::   ::.:: : :
CCDS11 -RLGEERATEAGSLEARLRE----SEQARAL-LEREAEEA-RRQLAAL---GQTEPLPAE
           800       810           820         830          840    

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pF1KSD VEGGTKAT---------GNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPDSLPAGQTEPQPQL
       .  . . .         :. .:.:.    :. .::. . :..  .       . : . . 
CCDS11 APWARRPVDPRRRSLPAGDALYLSFNPPQPSRGTDRLDLPVTTRSVHR----NFEDRERQ
          850       860       870       880       890           900

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pF1KSD QGGNDDPRRPSRSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGG
       . :. . :  . : :. . .. :    .  .    ..:..:.                  
CCDS11 ELGSPEERLQDSSDPDTGSEEEGSSRLSPPHSPRDFTRMQDIPEETESRDGEAVASES  
              910       920       930       940       950          

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pF1KSD TTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASP




1522 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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