FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0380, 1522 aa 1>>>pF1KSDA0380 1522 - 1522 aa - 1522 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7580+/-0.00108; mu= 0.8626+/- 0.066 mean_var=316.4214+/-64.016, 0's: 0 Z-trim(114.2): 80 B-trim: 156 in 1/52 Lambda= 0.072101 statistics sampled from 14708 (14786) to 14708 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.454), width: 16 Scan time: 6.150 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1522) 10156 1071.2 0 CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1562) 8887 939.3 0 CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1441) 1687 190.3 3.7e-47 CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1525) 1687 190.3 3.9e-47 CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1544) 1687 190.3 3.9e-47 CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 879) 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PEDGSDAPLEDSTADAAASPGP 1510 1520 >>CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1562 aa) initn: 8880 init1: 8880 opt: 8887 Z-score: 5007.2 bits: 939.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 10015; 97.4% identity (97.4% similar) in 1554 aa overlap (9-1522:9-1562) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSDASETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD VSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD GSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPEVQKHATQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 GSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPEVQKHATQ 130 140 150 160 170 180 190 200 pF1KSD 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1495 aa overlap (79-1455:1-1430) 50 60 70 80 90 100 pF1KSD IIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKL :.:::. ::::::::::.::.:.::::::: CCDS76 MRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKL 10 20 30 110 120 130 140 150 160 pF1KSD IKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKP ::::.:::::. : :.: : ... :. ... .. :: : .:::.: CCDS76 IKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSPVL 40 50 60 70 80 90 170 180 190 200 210 pF1KSD LQDPE--VQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----PSEGRLSLD------ . . . :... ..:::.::..:...:: . :. : .:: .:.. . CCDS76 MGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQEAKKHIPQLQEQL 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 pF1KSD SQEGDSGLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL-------------SDPGLDSPRTS :. :. :.. : : ..::. . ..:: :. . :::... CCDS76 SKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDASRPSSDNADSPKSG 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 pF1KSD PVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEEDYDPGYFNNESD--- : :. .. . :.. . .: :.. ::. : ::: :.: : : ... . CCDS76 P--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD-DFGTEHEQINGQC 220 230 240 250 260 310 320 330 340 350 360 pF1KSD IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIF ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:.... :..: . .. ..: CCDS76 SCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFF 270 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KSD LEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTL :...: :.:..:. ..:....: . :: : . :: . ::.:....:.: ::.. CCDS76 LDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSM 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 pF1KSD GLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SKYEEDRSAPMDFALN :: .: :: . : : :: ::. .: . ..: . :::.:. :.... CCDS76 GLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVIL 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KSD TYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPIL ::.: :....: : : .: . :.:: :.: ::.:.. : :: . CCDS76 MYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPKIKQS--MKKDKEGEEKGKRRGFP 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KSD KYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP-GTQRLSTGSFPED . .: :. :. .:.. ..:. .:. . .. .::: . .: ... .. CCDS76 SILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEPQDSAKLRQSGLANE 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KSD LLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSA .. .: : . : : : .: .: .:. ..:.. .. CCDS76 GTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTGSKQVGETSAPGDTL 560 570 580 590 660 670 680 690 700 pF1KSD SSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQ ... .:.: .. : ::. . .. ... .: : . .. ::. . CCDS76 DGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFE 600 610 620 630 640 650 710 720 730 740 750 760 pF1KSD LSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQR .::: .: :::. :...:. :: :: ::::::::: :: .:.:::.::: .:::: CCDS76 -NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQR 660 670 680 690 700 710 770 780 790 800 810 820 pF1KSD MKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLRE--EGPIIKEISDLMLARFDGPA ...:... :: ..: :: .....: . : :: .:. : .: .:.. .:. :.::. CCDS76 VSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPG 720 730 740 750 760 770 830 840 850 860 870 880 pF1KSD REELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQR .:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: ::::::.:.: ..::: CCDS76 EEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQR 780 790 800 810 820 830 890 900 910 920 930 940 pF1KSD LTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLD ::::::::..: :.:: : :.::. .: :.::.::.:::.:::..::..::: ::.::: CCDS76 LTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLD 840 850 860 870 880 890 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD ATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDE ...:. . : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..:::::.::::::::. CCDS76 TSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDD 900 910 920 930 940 950 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD KLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVA .:.:.:::: ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.: : : ::::::: CCDS76 RLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGA-QIYELVA 960 970 980 990 1000 1010 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KSD LTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGPTPSRVELDDSDVFH : :.:..:..:. . . .... .. :.:. :: . .. :. . : .: CCDS76 QTVSEKTVWQDLICR-MAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVT- 1020 1030 1040 1050 1060 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD GEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP---CPSTSLDGENRGI : :.. : .. ...: : .. :..: ..: : :: . . CCDS76 GLQSPDRDLGLESTL--ISSKPQS--HSLSTSGKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEV 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD RTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLT . ..:.: :. : : .::... :..:.. .: . ...:: : CCDS76 G--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL----GLTEKSVQE---DWQ 1130 1140 1150 1160 1170 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KSD PTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRTRNS : .... : . .. ..:. .. .: ::. : . : . . ::: . CCDS76 HFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTGDIATCY-SPRTSTE 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KSD GIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQ---------SEP .. .:. . .:: .:..... ... :. . .: .::. :. CCDS76 SF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDE 1240 1250 1260 1270 1280 1350 1360 1370 1380 pF1KSD GPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPP--DSSTDHSEA------PMSP-PQPD .: : .:.. . .:: :. . . : .::::. : ::. : . CCDS76 NPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGN--YLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVE 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KSD SLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPPSLALRDVGMIFHTIE : : :: . : .: : .:: : : . ..:.. :. CCDS76 STHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCA-DSQSQIMEYIH 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KSD QLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASD .. :..:: .: .. : . :.: CCDS76 KIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS 1410 1420 1430 1440 >>CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1525 aa) initn: 1741 init1: 621 opt: 1687 Z-score: 959.7 bits: 190.3 E(32554): 3.9e-47 Smith-Waterman score: 2307; 33.5% identity (61.8% similar) in 1558 aa overlap (16-1455:22-1514) 10 20 30 40 50 pF1KSD MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSDASETTGLVQRCVIIQKDQ : :. .: :. . .: : . :::::::::::::. CCDS55 MSGTQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIASHDFDPTGLVQRCVIIQKDD 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KSD HGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNGTMVTNSSHLEVVKLIKSGAY .:::.::::: :.::::. ::::.:::. ::::::::::.::.:.:::::::::::.: CCDS55 NGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKLIKSGSY 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KSD VALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPPPPLPPPQRITGPKPLQDPE- ::::. : :.: : ... :. ... .. :: : .:::.: . . . CCDS55 VALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSPGASGNMERITSPVLMGEENN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 pF1KSD -VQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----PSEGRLSLD------SQEGDS :... ..:::.::..:...:: . :. : .:: .:.. . :. : CCDS55 VVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEIQEAKKHIPQLQEQLSKATGS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 pF1KSD GLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL-------------SDPGLDSPRTSPVIMAR . :.. : : ..::. . ..:: :. . :::...: : CCDS55 AQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDASRPSSDNADSPKSGP--KER 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KSD VAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEEDYDPGYFNNESD---IIFQDL . .. . :.. . .: :.. ::. : ::: :.: : : ... . ::.. CCDS55 IYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD-DFGTEHEQINGQCSCFQSI 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KSD EKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSLGKDIWNIFLEKNAP : ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:.... :..: . .. ..::...: CCDS55 ELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAH 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KSD LRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQIHDYRTKRTLGLGSLY :.:..:. ..:....: . :: : . :: . ::.:....:.: ::..:: CCDS55 LKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPEVQRHLEDFRQKRSMGLTLAE 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 pF1KSD GENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SKYEEDRSAPMDFALNTYMSHA .: :: . : : :: ::. .: . ..: . :::.:. :.... ::.: CCDS55 SELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQAVEEDKSSTMQYVILMYMKHL 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 pF1KSD GIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDALEDKKRNPILKYIGKP :....: : : .: . . . :.:: :.: ::.:.. : :: . . .: : CCDS55 GVKVKE--PRNLEHK------RGR-IGFLPKIKQSM--KKDKEGEEKGKRRGFPSILGPP 540 550 560 570 580 550 560 570 580 590 600 pF1KSD KSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP-GTQRLSTGSFPEDLLESD- . :. .:.. ..:. .:. . .. .::: . .: ... .. .. CCDS55 RRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEPQDSAKLRQSGLANEGTDAGY 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 650 pF1KSD ---SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATRLHQSASSSTSS .: : . : : : .: .: .:. ..:.. .. ... . CCDS55 LPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRT 650 660 670 680 660 670 680 690 700 pF1KSD LSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDLEP :.: .. : ::. . .. ... .: : . .. ::. . .::: CCDS55 LNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFE-NDLET 690 700 710 720 730 740 710 720 730 740 750 760 pF1KSD EPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKKENL .: :::. :...:. :: :: ::::::::: :: .:.:::.::: .::::...:.. CCDS55 DPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAHVRTLKVLDQVFYQRVSREGI 750 760 770 780 790 800 770 780 790 800 810 820 pF1KSD MPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLRE--EGPIIKEISDLMLARFDGPAREELQQ . :: ..: :: .....: . : :: .:. : .: .:.. .:. :.::..:.:.. CCDS55 LSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVIDQIGEDLLTWFSGPGEEKLKH 810 820 830 840 850 860 830 840 850 860 870 880 pF1KSD VAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPL .:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: ::::::.:.: ..::::::::: CCDS55 AAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPL 870 880 890 900 910 920 890 900 910 920 930 940 pF1KSD LLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALER ::..: :.:: : :.::. .: :.::.::.:::.:::..::..::: ::.:::...:. CCDS55 LLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKL 930 940 950 960 970 980 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD ASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKC . : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..:::::.::::::::..:.:.: CCDS55 SEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRC 990 1000 1010 1020 1030 1040 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD HSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDK ::: ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.: : : ::::::: : :.: CCDS55 HSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVISMSDNGA-QIYELVAQTVSEK 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KSD NTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGPTPSRVELDDSDVFHGEPEPE ..:..:. . . .... .. :.:. :: . .. :. . : .: : :. CCDS55 TVWQDLICR-MAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVT-GLQSPD 1110 1120 1130 1140 1150 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KSD ELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP---CPSTSLDGENRGIRTRNPI . : .. ...: : .. :..: ..: : :: . . . CCDS55 RDLGLESTL--ISSKPQS--HSLSTSGKSEVRDLFVAERQFAKEQHTDGTLKEVG--EDY 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KSD HLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPEDDLTPTPSVI ..:.: :. : : .::... :..:.. .: : : ...:: : : CCDS55 QIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL--GLT--EKSVQE---DWQHFPRYR 1220 1230 1240 1250 1260 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KSD SVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDMGLCSLEHLPPRTRNSGIWESP .... : . .. ..:. .. .: ::. : . : . . ::: . .. .: CCDS55 TASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTGDIATCY-SPRTSTESF--AP 1270 1280 1290 1300 1310 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KSD ELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQ---------SEPGPPEVE . . .:: .:..... ... :. . .: .::. :. .: : . CCDS55 RDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDSGEHFFDAREAHSDENPSEGD 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1360 1370 1380 1390 pF1KSD GGT---------KATGNCFYVSMPSGPP--DSSTDHSEA------PMSP-PQPDSLPAGQ :.. . .:: :. . . : .::::. : ::. : .: : CCDS55 GAVNKEEKDVNLRISGN--YLILDGYDPVQESSTDEEVASSLTLQPMTGIPAVESTHQQQ 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1400 1410 1420 1430 pF1KSD TEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPPSLALRDVGMIFHTIEQLTLKL :: . : .: : .:: : : . ..:.. :... : CCDS55 HSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSSCADSQ-SQIMEYIHKIEADL 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KSD NRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTDGSLSPPAKEPLASDSRNSHE ..:: .: .. : . :.: CCDS55 EHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS 1500 1510 1520 >>CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1544 aa) initn: 1744 init1: 621 opt: 1687 Z-score: 959.6 bits: 190.3 E(32554): 3.9e-47 Smith-Waterman score: 2308; 33.3% identity (61.5% similar) in 1569 aa overlap (7-1455:34-1533) 10 20 30 pF1KSD MSVRLPQSIDRLSSLSSLGDSAPERKSPSHHRQPSD :...:..: : : .: .. .. :. CCDS41 TQSTITDRFPLKKPIRHGSILNRESPTDKKQKVERIAS----HDFDPTDSSSKKTKSSSE 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KSD AS--ETTGLVQRCVIIQKDQHGFGFTVSGDRIVLVQSVRPGGAAMKAGVKEGDRIIKVNG : : ::::::::::::..:::.::::: :.::::. ::::.:::. ::::::::: CCDS41 ESRSEIYGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNG 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KSD TMVTNSSHLEVVKLIKSGAYVALTLLGSSPSSMGISGLQQDPSPAGAPRITSVIPSPPPP :.::.:.:::::::::::.:::::. : :.: : ... :. ... .. :: : CCDS41 TLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVALTVQGRPPGSPQIPLADSEVEPSVIGHMSPIMTSPHSP 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 pF1KSD PPLPPPQRITGPKPLQDPE--VQKHATQILRNMLRQEEKELQDILPLYGDT-SQR----P .:::.: . . . :... ..:::.::..:...:: . :. : .:: CCDS41 GASGNMERITSPVLMGEENNVVHNQKVEILRKMLQKEQERLQLLQEDYNRTPAQRLLKEI 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 pF1KSD SEGRLSLD------SQEGDSGLDSG--TERFP-----SLSESLMNRNSVL---------- .:.. . :. :. :.. : : ..::. . ..:: CCDS41 QEAKKHIPQLQEQLSKATGSAQDGAVVTPSRPLGDTLTVSEAETDPGDVLGRTDCSSGDA 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 pF1KSD ---SDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPK----PLIIGPEED :. . :::...: :. .. . :.. . .: :.. ::. : ::: :.: CCDS41 SRPSSDNADSPKSGP--KERIYLEENPEKSET-IQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDD 300 310 320 330 340 350 300 310 320 330 340 350 pF1KSD YDPGYFNNESD---IIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASP : : ... . ::..: ::::::::.:::... :: ::. :: :: ...:.... CCDS41 -DFGTEHEQINGQCSCFQSIELLKSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNS 360 370 380 390 400 410 360 370 380 390 400 410 pF1KSD KDSRSLGKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN--SEDA-RGVLCEAQEAAMPE :..: . .. ..::...: :.:..:. ..:....: . :: : . :: . :: CCDS41 KETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKVSVPDEMSADLEKRRPELIPEDLHRHYIQTMQERVHPE 420 430 440 450 460 470 420 430 440 450 460 pF1KSD IQEQIHDYRTKRTLGLGSLYGENDLLDLDGDPLR-----ERQVAEKQLAALGDIL---SK .:....:.: ::..:: .: :: . : : :: ::. .: . ..: . CCDS41 VQRHLEDFRQKRSMGLTLAESELTKLDAERDKDRLTLEKERTCAEQIVAKIEEVLMTAQA 480 490 500 510 520 530 470 480 490 500 510 520 pF1KSD YEEDRSAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKK :::.:. :.... ::.: :....: : : .: . :.:: :.: :: CCDS41 VEEDKSSTMQYVILMYMKHLGVKVKE--PRNLEHKRGR-------IGFLPKIKQS--MKK 540 550 560 570 580 530 540 550 560 570 580 pF1KSD EKDALEDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEP .:.. : :: . . .: :. :. .:.. ..:. .:. . .. .::: CCDS41 DKEGEEKGKRRGFPSILGPPRRPSRHDNSAIGRAMELQ--KARHP-KHLSTPSSV-SPEP 590 600 610 620 630 640 590 600 610 620 630 pF1KSD -GTQRLSTGSFPEDLLESD----SSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVD . .: ... .. .. .: : . : : : .: .: .:. CCDS41 QDSAKLRQSGLANEGTDAGYLPANSMSSVASGASFSQEGGKE--------------NDTG 650 660 670 680 640 650 660 670 680 pF1KSD MDAAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPF---------TPKMGRRSIESPSLGFCT ..:.. .. ... .:.: .. : ::. . .. ... .: : . CCDS41 SKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNT-VFDFPPPPLDQVQEEECEVERVTEHGTPKPFRKFDS 690 700 710 720 730 740 690 700 710 720 730 740 pF1KSD DTLLPHLLEDDLGQLSDLEPEPDAQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASH .. ::. . .::: .: :::. :...:. :: :: ::::::::: :: .: CCDS41 VAFGESQSEDEQFE-NDLETDPP--NWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQEVINELFYTERAH 750 760 770 780 790 800 750 760 770 780 790 800 pF1KSD LRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLRE--EGPIIK .:::.::: .::::...:... :: ..: :: .....: . : :: .:. : .: CCDS41 VRTLKVLDQVFYQRVSREGILSPSELRKIFSNLEDILQLHIGLNEQMKAVRKRNETSVID 810 820 830 840 850 860 810 820 830 840 850 860 pF1KSD EISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCR .:.. .:. :.::..:.:...:: ::: : .:::.::..:.:.:::: :.:.:::.: :: CCDS41 QIGEDLLTWFSGPGEEKLKHAAATFCSNQPFALEMIKSRQKKDSRFQTFVQDAESNPLCR 870 880 890 900 910 920 870 880 890 900 910 920 pF1KSD RLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQT ::::.:.: ..:::::::::::..: :.:: : :.::. .: :.::.::.:::.:::.. CCDS41 RLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPT-EREKVKKAADHCRQILNYVNQAVKEA 930 940 950 960 970 980 930 940 950 960 970 980 pF1KSD ENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVL ::..::: ::.:::...:. . : . :...:::: :::::::::.:....:::.::..: CCDS41 ENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVWKVNRDKTIDLYTL 990 1000 1010 1020 1030 1040 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KSD LLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIIC ::::.::::::::..:.:.:::: ....:::.:::::.::..::.:.::::..:.:.: CCDS41 LLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVRQVATDNKALFVIS 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KSD TSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGPREPAQQGP : : ::::::: : :.:..:..:. . . .... .. :.:. :: . .. : CCDS41 MSDNGA-QIYELVAQTVSEKTVWQDLICR-MAASVKEQSTKPIPLPQSTPGEGDNDEEDP 1110 1120 1130 1140 1150 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KSD TPSRVELDDSDVFHGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLP-- . . : .: : :.. : .. . . . : :..: ..: : CCDS41 SKLKEEQHGISVT-GLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSL----STSGKSEVRDLFVAERQ 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KSD -CPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFPG---PLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHT :: . . . ..:.: :. : : .::... :..:.. .: : : CCDS41 FAKEQHTDGTLKEVG--EDYQIAIPDSHLPVSEERWALDALRNLGLLKQLLVQQL--GLT 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KSD METQAAQEPEDDLTPTPSVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPEQEDMG ...:: : : .... : . .. ..:. .. .: ::. : . : CCDS41 --EKSVQE---DWQHFPRYRTASQGP----QTDSVIQNSENIKAYHSG-EGHMPFRTGTG 1280 1290 1300 1310 1320 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KSD LCSLEHLPPRTRNSGIWESPELDRNLA-EDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPES . . ::: . .. .:. . .:: .:..... ... :. . .: .: CCDS41 DIATCY-SPRTSTESF--APRDSVGLAPQDSQASNILVMDHMIMTPEMPTMEPEGGLDDS 1330 1340 1350 1360 1370 1350 1360 1370 pF1KSD GQ---------SEPGPPEVEGGT---------KATGNCFYVSMPSGPP--DSSTDHSEA- :. :. .: : .:.. . .:: :. . . : .::::. : CCDS41 GEHFFDAREAHSDENPSEGDGAVNKEEKDVNLRISGN--YLILDGYDPVQESSTDEEVAS 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1380 1390 1400 1410 pF1KSD -----PMSP-PQPDSLPAGQTEPQPQLQGGNDDPRRPS-----------------RSPPS ::. : .: : :: . : .: : .:: : CCDS41 SLTLQPMTGIPAVESTHQQQHSPQNTHSDGAISPFTPEFLVQQRWGAMEYSCFEIQSPSS 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KSD LALRDVGMIFHTIEQLTLKLNRLKDMELAHRELLKSLGGESSGGTTPVGSFHTEAARWTD : . ..:.. :... :..:: .: .. : . :.: CCDS41 CA-DSQSQIMEYIHKIEADLEHLKKVEESYTILCQRLAGSALTDKHSDKS 1500 1510 1520 1530 1540 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KSD GSLSPPAKEPLASDSRNSHELGPCPEDGSDAPLEDSTADAAASPGP >>CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (879 aa) initn: 806 init1: 712 opt: 1268 Z-score: 727.5 bits: 146.5 E(32554): 3.3e-34 Smith-Waterman score: 1447; 35.4% identity (60.6% similar) in 923 aa overlap (273-1165:8-824) 250 260 270 280 290 300 pF1KSD VLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDPGY :: :. . :. : .: . .::.. CCDS12 MEDFARGAASPGPSRPGL--VPVSIIGAEDEDFENEL 10 20 30 310 320 330 340 350 360 pF1KSD FNN--ESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSL .: :.. ::.::..: ::::: ..:... : .:.::. CCDS12 ETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLV------------------- 40 50 60 70 370 380 390 400 410 pF1KSD GKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN---SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQI ::: .: . :.: : : :::. : . :. .. . . .:. CCDS12 --------------LRVPVPPNVAFELD-RTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQL 80 90 100 110 120 420 430 440 450 460 pF1KSD HDYRTKRTLGLGSLYGENDLL------DLDGDPLRERQVAEKQLAALGDILSKY--EEDR .:.:.:: .:. : : : . :::.:::. : : .. .:.. CCDS12 EDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEK 130 140 150 160 170 180 470 480 490 500 510 520 pF1KSD SAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDAL :: . :.. :: : :.: . . :: . :: : : .: .... : CCDS12 SAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG-------------DKKSGRNFFRK-KVMGNRRSDEPAK 190 200 210 220 530 540 550 560 570 580 pF1KSD EDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPG-TQR : . :: .. : .: . :.. . . :: .:: :.: CCDS12 TKKGLSSILDAARWNRGEPQ----VP---------DFRHL------KAEVDAEKPGATDR 230 240 250 260 590 600 610 620 630 640 pF1KSD LSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATR . ..: ::. :. . :.. : . : : .. : . .:.: CCDS12 KGGVGMP--------SRD-----RNIGAPGQDTPGVSLH----PLSLDSPDREPGADAP- 270 280 290 300 310 650 660 670 680 690 700 pF1KSD LHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDL :. . :: . .: .:: .:: . : .. ::: : : : . :. : : CCDS12 LELGDSSPQGPMSLESL---APPESTDEGAET-ESPEPG---D-------EGEPGR-SGL 320 330 340 350 710 720 730 740 750 760 pF1KSD EPEPDAQ-NWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKK : ::. .:.. : :.. .: . .. :::::.::.::::.:.: :::: .:.: : . CCDS12 ELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAE 360 370 380 390 400 410 770 780 790 800 810 820 pF1KSD ENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREE-GPIIKEISDLMLARFDGPAREEL ..: ::: .::.: ::::.:. . . . : :.: : .:.::.:..:::::: . CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMKRRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWF 420 430 440 450 460 470 830 840 850 860 870 880 pF1KSD QQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKY :.....::: ::.::: .:.::::. :: :.:::::.:.::::::.:.: .:::::::: CCDS12 QKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKY 480 490 500 510 520 530 890 900 910 920 930 940 pF1KSD PLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATAL ::::.:: ..:: : :.::. : . :::::..::.::.. :. ::. ::.::: . : CCDS12 PLLLQSIGQNTEEPT-EREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHL 540 550 560 570 580 590 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD ERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLL ...:.:. .:::.::.: .:..::::::::..:::....:::::.:::.:::.:::.::: CCDS12 RQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLL 600 610 620 630 640 650 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD KCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSS : ::.: . . :.: . :::.:.... : ::::..::... : ::::::: : : CCDS12 KSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQ-EAQIYELVAQTVS 660 670 680 690 700 710 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD DKNTWMELLEEAVRN-ATRHPGAAPMPVHPPPPGPREP----AQQG-------PTPSRVE ....: :. :.. . . :.. : : .: : . ::: ...: :. .:.: CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKP-RPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTE 720 730 740 750 760 770 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD LDDSDVF-HGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLD ::.. .: :: ..: . ..: . .:.:. :..:.. .. .: CCDS12 RILSDLLPFCRPGPEGQLAAT-ALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSP 780 790 800 810 820 830 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD GENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPED CCDS12 ARTQEIQENLLSLEETMKQLEELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT 840 850 860 870 >>CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (912 aa) initn: 897 init1: 712 opt: 1268 Z-score: 727.3 bits: 146.6 E(32554): 3.4e-34 Smith-Waterman score: 1575; 36.6% identity (62.9% similar) in 923 aa overlap (273-1165:8-857) 250 260 270 280 290 300 pF1KSD VLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDPGY :: :. . :. : .: . .::.. CCDS12 MEDFARGAASPGPSRPGL--VPVSIIGAEDEDFENEL 10 20 30 310 320 330 340 350 360 pF1KSD FNN--ESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSL .: :.. ::.::..: ::::: ..:... : .:.::: : :.. . .::.... CCDS12 ETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKA 40 50 60 70 80 90 370 380 390 400 410 pF1KSD GKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN---SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQI :... ::::.: ::: .: . :.: : : :::. : . :. .. . . .:. CCDS12 FLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAFELD-RTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQL 100 110 120 130 140 150 420 430 440 450 460 pF1KSD HDYRTKRTLGLGSLYGENDLL------DLDGDPLRERQVAEKQLAALGDILSKY--EEDR .:.:.:: .:. : : : . :::.:::. : : .. .:.. CCDS12 EDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEK 160 170 180 190 200 210 470 480 490 500 510 520 pF1KSD SAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDAL :: . :.. :: : :.: . . :: . :: : : .: .... : CCDS12 SAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG-------------DKKSGRNFFRK-KVMGNRRSDEPAK 220 230 240 250 260 530 540 550 560 570 580 pF1KSD EDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPG-TQR : . :: .. : .: . :.. . . :: .:: :.: CCDS12 TKKGLSSILDAARWNRGEPQ----VP---------DFRHL------KAEVDAEKPGATDR 270 280 290 300 590 600 610 620 630 640 pF1KSD LSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATR . ..: ::. :. . :.. : . : : .. : . .:.: CCDS12 KGGVGMP--------SRD-----RNIGAPGQDTPGVSLH----PLSLDSPDREPGADAP- 310 320 330 340 650 660 670 680 690 700 pF1KSD LHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDL :. . :: . .: .:: .:: . : .. ::: : : : . :. : : CCDS12 LELGDSSPQGPMSLESL---APPESTDEGAET-ESPEPG---D-------EGEPGR-SGL 350 360 370 380 710 720 730 740 750 760 pF1KSD EPEPDAQ-NWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKK : ::. .:.. : :.. .: . .. :::::.::.::::.:.: :::: .:.: : . CCDS12 ELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAE 390 400 410 420 430 440 770 780 790 800 810 820 pF1KSD ENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREE-GPIIKEISDLMLARFDGPAREEL ..: ::: .::.: ::::.:. . . . : :.: : .:.::.:..:::::: . CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMKRRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWF 450 460 470 480 490 500 830 840 850 860 870 880 pF1KSD QQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKY :.....::: ::.::: .:.::::. :: :.:::::.:.::::::.:.: .:::::::: CCDS12 QKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKY 510 520 530 540 550 560 890 900 910 920 930 940 pF1KSD PLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATAL ::::.:: ..:: : :.::. : . :::::..::.::.. :. ::. ::.::: . : CCDS12 PLLLQSIGQNTEEPT-EREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHL 570 580 590 600 610 620 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD ERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLL ...:.:. .:::.::.: .:..::::::::..:::....:::::.:::.:::.:::.::: CCDS12 RQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLL 630 640 650 660 670 680 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD KCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSS : ::.: . . :.: . :::.:.... : ::::..::... : ::::::: : : CCDS12 KSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQ-EAQIYELVAQTVS 690 700 710 720 730 740 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD DKNTWMELLEEAVRN-ATRHPGAAPMPVHPPPPGPREP----AQQG-------PTPSRVE ....: :. :.. . . :.. : : .: : . ::: ...: :. .:.: CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKP-RPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTE 750 760 770 780 790 800 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD LDDSDVF-HGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLD ::.. .: :: ..: . ..: . .:.:. :..:.. .. .: CCDS12 RILSDLLPFCRPGPEGQLAAT-ALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSP 810 820 830 840 850 860 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD GENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPED CCDS12 ARTQEIQENLLSLEETMKQLEELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT 870 880 890 900 910 >>CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (927 aa) initn: 897 init1: 712 opt: 1268 Z-score: 727.2 bits: 146.6 E(32554): 3.5e-34 Smith-Waterman score: 1575; 36.6% identity (62.9% similar) in 923 aa overlap (273-1165:23-872) 250 260 270 280 290 300 pF1KSD VLSDPGLDSPRTSPVIMARVAQHHRRQGSDAAVPSTGDQGVDQSPKPLIIGPEEDYDPGY :: :. . :. : .: . .::.. CCDS12 MASLSTWSSPAEPREMEDFARGAASPGPSRPGL--VPVSIIGAEDEDFENEL 10 20 30 40 50 310 320 330 340 350 360 pF1KSD FNN--ESDIIFQDLEKLKSRPAHLGVFLRYIFSQADPSPLLFYLCAEVYQQASPKDSRSL .: :.. ::.::..: ::::: ..:... : .:.::: : :.. . .::.... CCDS12 ETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKA 60 70 80 90 100 110 370 380 390 400 410 pF1KSD GKDIWNIFLEKNAPLRVKIPEMLQAEIDSRLRN---SEDA-RGVLCEAQEAAMPEIQEQI :... ::::.: ::: .: . :.: : : :::. : . :. .. . . .:. CCDS12 FLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAFELD-RTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQL 120 130 140 150 160 420 430 440 450 460 pF1KSD HDYRTKRTLGLGSLYGENDLL------DLDGDPLRERQVAEKQLAALGDILSKY--EEDR .:.:.:: .:. : : : . :::.:::. : : .. .:.. CCDS12 EDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEK 170 180 190 200 210 220 470 480 490 500 510 520 pF1KSD SAPMDFALNTYMSHAGIRLREARPSNTAEKAQSAPDKDKWLPFFPKTKKSSNSKKEKDAL :: . :.. :: : :.: . . :: . :: : : .: .... : CCDS12 SAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSG-------------DKKSGRNFFRK-KVMGNRRSDEPAK 230 240 250 260 270 530 540 550 560 570 580 pF1KSD EDKKRNPILKYIGKPKSSSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPG-TQR : . :: .. : .: . :.. . . :: .:: :.: CCDS12 TKKGLSSILDAARWNRGEPQ----VP---------DFRHL------KAEVDAEKPGATDR 280 290 300 310 590 600 610 620 630 640 pF1KSD LSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMDAAAEATR . ..: ::. :. . :.. : . : : .. : . .:.: CCDS12 KGGVGMP--------SRD-----RNIGAPGQDTPGVSLH----PLSLDSPDREPGADAP- 320 330 340 350 650 660 670 680 690 700 pF1KSD LHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPSLGFCTDTLLPHLLEDDLGQLSDL :. . :: . .: .:: .:: . : .. ::: : : : . :. : : CCDS12 LELGDSSPQGPMSLESL---APPESTDEGAET-ESPEPG---D-------EGEPGR-SGL 360 370 380 390 400 710 720 730 740 750 760 pF1KSD EPEPDAQ-NWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASHLRTLRVLDLIFYQRMKK : ::. .:.. : :.. .: . .. :::::.::.::::.:.: :::: .:.: : . CCDS12 ELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAE 410 420 430 440 450 460 770 780 790 800 810 820 pF1KSD ENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREE-GPIIKEISDLMLARFDGPAREEL ..: ::: .::.: ::::.:. . . . : :.: : .:.::.:..:::::: . CCDS12 CLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMKRRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWF 470 480 490 500 510 520 830 840 850 860 870 880 pF1KSD QQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAESHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKY :.....::: ::.::: .:.::::. :: :.:::::.:.::::::.:.: .:::::::: CCDS12 QKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKY 530 540 550 560 570 580 890 900 910 920 930 940 pF1KSD PLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATAL ::::.:: ..:: : :.::. : . :::::..::.::.. :. ::. ::.::: . : CCDS12 PLLLQSIGQNTEEPT-EREKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHL 590 600 610 620 630 640 950 960 970 980 990 1000 pF1KSD ERASNPLAAEFKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKDKTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLL ...:.:. .:::.::.: .:..::::::::..:::....:::::.:::.:::.:::.::: CCDS12 RQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLL 650 660 670 680 690 700 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KSD KCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSS : ::.: . . :.: . :::.:.... : ::::..::... : ::::::: : : CCDS12 KSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQ-EAQIYELVAQTVS 710 720 730 740 750 760 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KSD DKNTWMELLEEAVRN-ATRHPGAAPMPVHPPPPGPREP----AQQG-------PTPSRVE ....: :. :.. . . :.. : : .: : . ::: ...: :. .:.: CCDS12 ERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKP-RPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTE 770 780 790 800 810 820 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KSD LDDSDVF-HGEPEPEELPGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLD ::.. .: :: ..: . ..: . .:.:. :..:.. .. .: CCDS12 RILSDLLPFCRPGPEGQLAAT-ALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSP 830 840 850 860 870 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD GENRGIRTRNPIHLAFPGPLFMEGLADSALEDVENLRHLILWSLLPGHTMETQAAQEPED CCDS12 ARTQEIQENLLSLEETMKQLEELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT 880 890 900 910 920 >>CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 (986 aa) initn: 591 init1: 268 opt: 542 Z-score: 318.7 bits: 71.1 E(32554): 2e-11 Smith-Waterman score: 667; 25.0% identity (54.1% similar) in 913 aa overlap (611-1442:106-970) 590 600 610 620 630 640 pF1KSD PEPGTQRLSTGSFPEDLLESDSSRSEIRLGRSESLKGREEMKRSRKAENVPRSRSDVDMD .: ::... ... .. : :: .. CCDS53 HNRCKDTLANCTKVKQKQQKAALLKNNTALQSVSLRSKTTIRERPSSAIYP---SD-SFR 80 90 100 110 120 130 650 660 670 680 690 pF1KSD AAAEATRLHQSASSSTSSLSTRSLENPTPPFTPKMGRRSIESPS---LGFCTDTLLPHLL . ..: .:. : ..:.:: .. . .: .: : : : : :.. . :: . : CCDS53 QSLLGSRRGRSSLSLAKSVSTTNIAGHFNDESP-LGLRRILSQSTDSLNMRNRTLSVESL 140 150 160 170 180 190 700 710 720 730 740 pF1KSD EDDLG-----QLSDLE-PEPD--AQNWQHTVGKDVVAGLTQREIDRQEVINELFVTEASH :. .::.: : : :..:. .: .. . .. . .:.:: ::. :: : CCDS53 IDEAEVIYSELMSDFEMDEKDFAADSWSLAVDSSFLQQHKKEVMKQQDVIYELIQTELHH 200 210 220 230 240 250 750 760 770 780 790 800 pF1KSD LRTLRVLDLIFYQRMKKENLMPREELARLFPNLPELIEIHNSWCEAMKKLREEG--P--- .:::... .: : .: . . ::: . :: .::. . . . :... : CCDS53 VRTLKIMTRLFRTGMLEELHLEPGVVQGLFPCVDELSDIHTRFLSQLLERRRQALCPGST 260 270 280 290 300 310 810 820 830 840 850 860 pF1KSD ---IIKEISDLMLARFDGPAREELQQVAAQFCSYQSIALELIKTKQRKESRFQLFMQEAE .:....::....:.::. :.. .. ..::: .: ::.: : ...::: :.... CCDS53 RNFVIHRLGDLLISQFSGPSAEQMCKTYSEFCSRHSKALKLYKELYARDKRFQQFIRKVT 320 330 340 350 360 370 870 880 890 900 910 920 pF1KSD SHPQCRRLQLRDLIISEMQRLTKYPLLLESIIKHTEGGTSEHEKLCRARDQCREILKYVN .: ... :. ::.::::::. :..:..: :.. : : .:.:. :. CCDS53 RPAVLKRHGVQECILLVTQRITKYPLLISRILQHSHGIEEERQDLTTALGLVKELLSNVD 380 390 400 410 420 430 930 940 950 960 970 pF1KSD EAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAE--FKSLDLTTRKMIHEGPLTWRISKD :.. : :. ::. .:.: ::..:. .. : .: ::.::.: : :. . CCDS53 EGIYQLEKGARLQEIYNRMDP----RAQTPVPGKGPFGREELLRRKLIHDGCLLWKTATG 440 450 460 470 480 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KSD KTLDLHVLLLEDLLVLLQKQDEKLLLKCHSKTAVGSSDSKQTFSPVLKLNAVLIRSVATD . :. :::. :.::.::..:.: .. .: .: ..:. ...:..:.. CCDS53 RFKDVLVLLMTDVLVFLQEKDQKYIFPTLDKPSV------------VSLQNLIVRDIANQ 490 500 510 520 530 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KSD KRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRNATRHPGAAPMPVHPPPPGP ....:.: .. ::..::. . . .:..::.......::. :. .:. CCDS53 EKGMFLISAA---PPEMYEVHTASRDDRSTWIRVIQQSVRTC---PSREDFPLIETEDEA 540 550 560 570 580 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KSD --REPAQQGPTPSR--VEL--DDSDVF----HGEPEPE--------ELPGGTGSQQRVQG :. .. .: ::: . .: : . : . :: : .. ... CCDS53 YLRRIKMELQQKDRALVELLREKVGLFAEMTHFQAEEDGGSGMALPTLPRGLFRSESLES 590 600 610 620 630 640 1150 1160 1170 1180 pF1KSD -KHQVLLEDP--EQEGSAEEE-----ELGVLP-CPSTSLDGENRGIR----TRNPIHLAF . . ::.: : :: . :: . : :. :. .. : : : .: CCDS53 PRGERLLQDAIREVEGLKDLLVGPGVELLLTPREPALPLEPDSGGNTSPGVTANGEARTF 650 660 670 680 690 700 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KSD PGPLFM-EGLADSALEDV----------ENLRHLI-LWSLLPGHTMETQAAQEP---EDD : . . .. .::. .: : :..:. :..:: : ... .::. : CCDS53 NGSIELCRADSDSSQRDRNGNQLRSPQEEALQRLVNLYGLL--HGLQAAVAQQDTLMEAR 710 720 730 740 750 760 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KSD LTPTP----SVISVTSHPWDPGSPGQAPPGGEGDNTQLAGLEGERPE-QEDMGLCSLEHL . : .. ..:. . : : :: . : . :.:: :. .. ::.. : CCDS53 FPEGPERREKLCRANSRDGEAGRAGAAPVAPEKQATELALLQRQHALLQEELRRCR---- 770 780 790 800 810 820 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KSD PPRTRNSGIWESPELDRNLAEDASSTEAAGGYKVVRKAEVAGSKVVPALPESGQSEPGPP : . :. :. : : .: : . . :.:: : . . :: ::.:: : CCDS53 --RLGEERATEAGSLEARLRE----SEQARAL-LEREAEEA-RRQLAAL---GQTEPLPA 830 840 850 860 870 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KSD EVEGGTKAT---------GNCFYVSMPSGPPDSSTDHSEAPMSPPQPDSLPAGQTEPQPQ :. . . . :. .:.:. :. .::. . :.. . . : . . 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