Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0385
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0385, 1370 aa
1>>>pF1KSDA0385 1370 - 1370 aa - 1370 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2401+/-0.000994; mu= -2.1954+/- 0.060
mean_var=307.1403+/-62.903, 0's: 0 Z-trim(114.6): 22 B-trim: 182 in 1/52
Lambda= 0.073182
statistics sampled from 15145 (15158) to 15145 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.466), width: 16
Scan time: 5.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14409.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (1370) 9610 1029.1 0
CCDS55444.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (1358) 5774 624.1 8.4e-178
CCDS55443.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX ( 495) 3432 376.5 1e-103
CCDS45016.1 ZMYM2 gene_id:7750|Hs108|chr13 (1377) 1463 168.9 8.8e-41
CCDS2787.1 QRICH1 gene_id:54870|Hs108|chr3 ( 776) 864 105.5 6e-22
CCDS389.1 ZMYM4 gene_id:9202|Hs108|chr1 (1548) 733 91.9 1.5e-17
CCDS387.2 ZMYM6 gene_id:9204|Hs108|chr1 (1325) 651 83.2 5.5e-15
CCDS41302.1 ZMYM1 gene_id:79830|Hs108|chr1 (1142) 600 77.7 2e-13
>>CCDS14409.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (1370 aa)
initn: 9610 init1: 9610 opt: 9610 Z-score: 5494.4 bits: 1029.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9610; 100.0% identity (100.0% similar) in 1370 aa overlap (1-1370:1-1370)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDPSDFPSPFDPLTLPEKPLAGDLPVDMEFGEDLLESQTAPTRGWAPPGPSPSSGALDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MDPSDFPSPFDPLTLPEKPLAGDLPVDMEFGEDLLESQTAPTRGWAPPGPSPSSGALDLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DTPAGLEKDPGVLDGATELLGLGGLLYKAPSPPEVDHGPEGTLAWDAGDQTLEPGPGGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DTPAGLEKDPGVLDGATELLGLGGLLYKAPSPPEVDHGPEGTLAWDAGDQTLEPGPGGQT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PEVVPPDPGAGANSCSPEGLLEPLAPDSPITLQSPHIEEEETTSIATARRGSPGQEEELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PEVVPPDPGAGANSCSPEGLLEPLAPDSPITLQSPHIEEEETTSIATARRGSPGQEEELP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QGQPQSPNAPPSPSVGETLGDGINSSQTKPGGSSPPAHPSLPGDGLTAKASEKPPERKRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QGQPQSPNAPPSPSVGETLGDGINSSQTKPGGSSPPAHPSLPGDGLTAKASEKPPERKRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ERVRRAEPPKPEVVDSTESIPVSDEDSDAMVDDPNDEDFVPFRPRRSPRMSLRSSVSQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ERVRRAEPPKPEVVDSTESIPVSDEDSDAMVDDPNDEDFVPFRPRRSPRMSLRSSVSQRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GRSAVGTKMTCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQLFCSSSCLTTFSKKPSGKKTCTFCKKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GRSAVGTKMTCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQLFCSSSCLTTFSKKPSGKKTCTFCKKEI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WNTKDSVVAQTGSGGSFHEFCTSVCLSLYEAQQQRPIPQSGDPADATRCSICQKTGEVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WNTKDSVVAQTGSGGSFHEFCTSVCLSLYEAQQQRPIPQSGDPADATRCSICQKTGEVLH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EVSNGSVVHRLCSDSCFSKFRANKGLKTNCCDQCGAYIYTKTGSPGPELLFHEGQQKRFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EVSNGSVVHRLCSDSCFSKFRANKGLKTNCCDQCGAYIYTKTGSPGPELLFHEGQQKRFC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NTTCLGAYKKKNTRVYPCVWCKTLCKNFEMLSHVDRNGKTSLFCSLCCTTSYKVKQAGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NTTCLGAYKKKNTRVYPCVWCKTLCKNFEMLSHVDRNGKTSLFCSLCCTTSYKVKQAGLT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GPPRPCSFCRRSLSDPCYYNKVDRTVYQFCSPSCWTKFQRTSPEGGIHLSCHYCHSLFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPPRPCSFCRRSLSDPCYYNKVDRTVYQFCSPSCWTKFQRTSPEGGIHLSCHYCHSLFSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KPEVLDWQDQVFQFCCRDCCEDFKRLRGVVSQCEHCRQEKLLHEKLRFSGVEKSFCSEGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KPEVLDWQDQVFQFCCRDCCEDFKRLRGVVSQCEHCRQEKLLHEKLRFSGVEKSFCSEGC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VLLYKQDFTKKLGLCCITCTYCSQTCQRGVTEQLDGSTWDFCSEDCKSKYLLWYCKAARC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VLLYKQDFTKKLGLCCITCTYCSQTCQRGVTEQLDGSTWDFCSEDCKSKYLLWYCKAARC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HACKRQGKLLETIHWRGQIRHFCNQQCLLRFYSQQNQPNLDTQSGPESLLNSQSPESKPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HACKRQGKLLETIHWRGQIRHFCNQQCLLRFYSQQNQPNLDTQSGPESLLNSQSPESKPQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TPSQTKVENSNTVRTPEENGNLGKIPVKTRSAPTAPTPPPPPPPATPRKNKAAMCKPLMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TPSQTKVENSNTVRTPEENGNLGKIPVKTRSAPTAPTPPPPPPPATPRKNKAAMCKPLMQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD NRGVSCKVEMKSKGSQTEEWKPQVIVLPIPVPIFVPVPMHLYCQKVPVPFSMPIPVPVPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NRGVSCKVEMKSKGSQTEEWKPQVIVLPIPVPIFVPVPMHLYCQKVPVPFSMPIPVPVPM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FLPTTLESTDKIVETIEELKVKIPSNPLEADILAMAEMIAEAEELDKASSDLCDLVSNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FLPTTLESTDKIVETIEELKVKIPSNPLEADILAMAEMIAEAEELDKASSDLCDLVSNQS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD AEGLLEDCDLFGPARDDVLAMAVKMANVLDEPGQDLEADFPKNPLDINPSVDFLFDCGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AEGLLEDCDLFGPARDDVLAMAVKMANVLDEPGQDLEADFPKNPLDINPSVDFLFDCGLV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GPEDVSTEQDLPRTMRKGQKRLVLSESCSRDSMSSQPSCTGLNYSYGVNAWKCWVQSKYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GPEDVSTEQDLPRTMRKGQKRLVLSESCSRDSMSSQPSCTGLNYSYGVNAWKCWVQSKYA
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD NGETSKGDELRFGPKPMRIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NGETSKGDELRFGPKPMRIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GIQQYLLENNRMVNIFTDLYYLTFVQELNKSLSTWQPTLLPNNTVFSRVEEEHLWECKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GIQQYLLENNRMVNIFTDLYYLTFVQELNKSLSTWQPTLLPNNTVFSRVEEEHLWECKQL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GVYSPFVLLNTLMFFNTKFFGLQTAEEHMQLSFTNVVRQSRKCTTPRGTTKVVSIRYYAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GVYSPFVLLNTLMFFNTKFFGLQTAEEHMQLSFTNVVRQSRKCTTPRGTTKVVSIRYYAP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD VRQRKGRDTGPGKRKREDEAPILEQRENRMNPLRCPVKFYEFYLSKCPESLRTRNDVFYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VRQRKGRDTGPGKRKREDEAPILEQRENRMNPLRCPVKFYEFYLSKCPESLRTRNDVFYL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD QPERSCIAESPLWYSVIPMDRSMLESMLNRILAVREIYEELGRPGEEDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QPERSCIAESPLWYSVIPMDRSMLESMLNRILAVREIYEELGRPGEEDLD
1330 1340 1350 1360 1370
>>CCDS55444.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (1358 aa)
initn: 5809 init1: 5679 opt: 5774 Z-score: 3305.6 bits: 624.1 E(32554): 8.4e-178
Smith-Waterman score: 9496; 99.1% identity (99.1% similar) in 1370 aa overlap (1-1370:1-1358)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDPSDFPSPFDPLTLPEKPLAGDLPVDMEFGEDLLESQTAPTRGWAPPGPSPSSGALDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDPSDFPSPFDPLTLPEKPLAGDLPVDMEFGEDLLESQTAPTRGWAPPGPSPSSGALDLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DTPAGLEKDPGVLDGATELLGLGGLLYKAPSPPEVDHGPEGTLAWDAGDQTLEPGPGGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DTPAGLEKDPGVLDGATELLGLGGLLYKAPSPPEVDHGPEGTLAWDAGDQTLEPGPGGQT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PEVVPPDPGAGANSCSPEGLLEPLAPDSPITLQSPHIEEEETTSIATARRGSPGQEEELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEVVPPDPGAGANSCSPEGLLEPLAPDSPITLQSPHIEEEETTSIATARRGSPGQEEELP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QGQPQSPNAPPSPSVGETLGDGINSSQTKPGGSSPPAHPSLPGDGLTAKASEKPPERKRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QGQPQSPNAPPSPSVGETLGDGINSSQTKPGGSSPPAHPSLPGDGLTAKASEKPPERKRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ERVRRAEPPKPEVVDSTESIPVSDEDSDAMVDDPNDEDFVPFRPRRSPRMSLRSSVSQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ERVRRAEPPKPEVVDSTESIPVSDEDSDAMVDDPNDEDFVPFRPRRSPRMSLRSSVSQRA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GRSAVGTKMTCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQLFCSSSCLTTFSKKPSGKKTCTFCKKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GRSAVGTKMTCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQLFCSSSCLTTFSKKPSGKKTCTFCKKEI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WNTKDSVVAQTGSGGSFHEFCTSVCLSLYEAQQQRPIPQSGDPADATRCSICQKTGEVLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 WNTKDSVVAQTGSGGSFHEFCTSVCLSLYEAQQQRPIPQSGDPADATRCSICQKTGEVLH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EVSNGSVVHRLCSDSCFSKFRANKGLKTNCCDQCGAYIYTKTGSPGPELLFHEGQQKRFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EVSNGSVVHRLCSDSCFSKFRANKGLKTNCCDQCGAYIYTKTGSPGPELLFHEGQQKRFC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NTTCLGAYKKKNTRVYPCVWCKTLCKNFEMLSHVDRNGKTSLFCSLCCTTSYKVKQAGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NTTCLGAYKKKNTRVYPCVWCKTLCKNFEMLSHVDRNGKTSLFCSLCCTTSYKVKQAGLT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GPPRPCSFCRRSLSDPCYYNKVDRTVYQFCSPSCWTKFQRTSPEGGIHLSCHYCHSLFSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GPPRPCSFCRRSLSDPCYYNKVDRTVYQFCSPSCWTKFQRTSPEGGIHLSCHYCHSLFSG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KPEVLDWQDQVFQFCCRDCCEDFKRLRGVVSQCEHCRQEKLLHEKLRFSGVEKSFCSEGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KPEVLDWQDQVFQFCCRDCCEDFKRLRGVVSQCEHCRQEKLLHEKLRFSGVEKSFCSEGC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VLLYKQDFTKKLGLCCITCTYCSQTCQRGVTEQLDGSTWDFCSEDCKSKYLLWYCKAARC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLLYKQDFTKKLGLCCITCTYCSQTCQRGVTEQLDGSTWDFCSEDCKSKYLLWYCKAARC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HACKRQGKLLETIHWRGQIRHFCNQQCLLRFYSQQNQPNLDTQSGPESLLNSQSPESKPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HACKRQGKLLETIHWRGQIRHFCNQQCLLRFYSQQNQPNLDTQSGPESLLNSQSPESKPQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TPSQTKVENSNTVRTPEENGNLGKIPVKTRSAPTAPTPPPPPPPATPRKNKAAMCKPLMQ
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TPSQTKVENSNT------------IPVKTRSAPTAPTPPPPPPPATPRKNKAAMCKPLMQ
790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KSD NRGVSCKVEMKSKGSQTEEWKPQVIVLPIPVPIFVPVPMHLYCQKVPVPFSMPIPVPVPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NRGVSCKVEMKSKGSQTEEWKPQVIVLPIPVPIFVPVPMHLYCQKVPVPFSMPIPVPVPM
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FLPTTLESTDKIVETIEELKVKIPSNPLEADILAMAEMIAEAEELDKASSDLCDLVSNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FLPTTLESTDKIVETIEELKVKIPSNPLEADILAMAEMIAEAEELDKASSDLCDLVSNQS
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD AEGLLEDCDLFGPARDDVLAMAVKMANVLDEPGQDLEADFPKNPLDINPSVDFLFDCGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AEGLLEDCDLFGPARDDVLAMAVKMANVLDEPGQDLEADFPKNPLDINPSVDFLFDCGLV
950 960 970 980 990 1000
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GPEDVSTEQDLPRTMRKGQKRLVLSESCSRDSMSSQPSCTGLNYSYGVNAWKCWVQSKYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GPEDVSTEQDLPRTMRKGQKRLVLSESCSRDSMSSQPSCTGLNYSYGVNAWKCWVQSKYA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD NGETSKGDELRFGPKPMRIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NGETSKGDELRFGPKPMRIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCL
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GIQQYLLENNRMVNIFTDLYYLTFVQELNKSLSTWQPTLLPNNTVFSRVEEEHLWECKQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GIQQYLLENNRMVNIFTDLYYLTFVQELNKSLSTWQPTLLPNNTVFSRVEEEHLWECKQL
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GVYSPFVLLNTLMFFNTKFFGLQTAEEHMQLSFTNVVRQSRKCTTPRGTTKVVSIRYYAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GVYSPFVLLNTLMFFNTKFFGLQTAEEHMQLSFTNVVRQSRKCTTPRGTTKVVSIRYYAP
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD VRQRKGRDTGPGKRKREDEAPILEQRENRMNPLRCPVKFYEFYLSKCPESLRTRNDVFYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VRQRKGRDTGPGKRKREDEAPILEQRENRMNPLRCPVKFYEFYLSKCPESLRTRNDVFYL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD QPERSCIAESPLWYSVIPMDRSMLESMLNRILAVREIYEELGRPGEEDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QPERSCIAESPLWYSVIPMDRSMLESMLNRILAVREIYEELGRPGEEDLD
1310 1320 1330 1340 1350
>>CCDS55443.1 ZMYM3 gene_id:9203|Hs108|chrX (495 aa)
initn: 3432 init1: 3432 opt: 3432 Z-score: 1975.7 bits: 376.5 E(32554): 1e-103
Smith-Waterman score: 3432; 99.4% identity (99.6% similar) in 494 aa overlap (1-494:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDPSDFPSPFDPLTLPEKPLAGDLPVDMEFGEDLLESQTAPTRGWAPPGPSPSSGALDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDPSDFPSPFDPLTLPEKPLAGDLPVDMEFGEDLLESQTAPTRGWAPPGPSPSSGALDLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DTPAGLEKDPGVLDGATELLGLGGLLYKAPSPPEVDHGPEGTLAWDAGDQTLEPGPGGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DTPAGLEKDPGVLDGATELLGLGGLLYKAPSPPEVDHGPEGTLAWDAGDQTLEPGPGGQT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PEVVPPDPGAGANSCSPEGLLEPLAPDSPITLQSPHIEEEETTSIATARRGSPGQEEELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PEVVPPDPGAGANSCSPEGLLEPLAPDSPITLQSPHIEEEETTSIATARRGSPGQEEELP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD QGQPQSPNAPPSPSVGETLGDGINSSQTKPGGSSPPAHPSLPGDGLTAKASEKPPERKRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QGQPQSPNAPPSPSVGETLGDGINSSQTKPGGSSPPAHPSLPGDGLTAKASEKPPERKRS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ERVRRAEPPKPEVVDSTESIPVSDEDSDAMVDDPNDEDFVPFRPRRSPRMSLRSSVSQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ERVRRAEPPKPEVVDSTESIPVSDEDSDAMVDDPNDEDFVPFRPRRSPRMSLRSSVSQRA
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CCDS55 GRSAVGTKMTCAHCRTPLQKGQTAYQRKGLPQLFCSSSCLTTFSKKPSGKKTCTFCKKEI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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CCDS55 WNTKDSVVAQTGSGGSFHEFCTSVCLSLYEAQQQRPIPQSGDPADATRCSICQKTGEVLH
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CCDS55 EVSNGSVVHRLCSDSCFSKFRANKGLKTNCCDQCGAYIYTKTGSPGPELLFHEGQQKRFC
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pF1KSD NTTCLGAYKKKNTRVYPCVWCKTLCKNFEMLSHVDRNGKTSLFCSLCCTTSYKVKQAGLT
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CCDS55 NTTCLGAYKKVGPRE
490
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:. .:. .. :. .: ::: :. :.. : . .. ::: .. :. . .
CCDS45 LENT-DGRDMNLMITHVTSLQNTNLGDVSNGLQSSNFGVNIQTYTPSLTSQTKTGVGPFN
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240 250 260 270 280
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: . . . : . : .:. .... :.: .... :. ... : :
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.. .. ::.:. . . :.:::.:. ::::::::::::: .::::..::..::.::.
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:: :..:::.: . : ..:::. :. ::.:::.. :::::: .:. : .: . .:
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:.:: : :. :::: ...:.:::: ::...: .:: :::.::: :. .: :. : .
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.: .::::::: .:.. ::. :..: . : :. :.:
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570 580 590 600 610
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.:.::. :: .::: ..::.: :.:.:.::.. : .:::.:.:...: :
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: :.::.:::: :..:.:..::: . ::::::: .:. :: ::::: :: :: : : .
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CCDS45 LK-SSKSVKLKEDLLSHTTAELNYGLAHFVNEIRRPNGENYAPDSIYYLCLGIQEYLCGS
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CCDS27 QQQPQQQTPQEQT--------PPPQQQQQQLQVTCSAQTVQVAEVEPQSQPQPSPELLLP
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. .:. :...:: :.:.: :.: : . :..: . .:..::... ..:::::
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CCDS27 DVQPRVTPLGYVLPSHVTEEMLWECKQLGAHSPSTLLTTLMFFNTKYFLLKTVDQHMKLA
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CCDS27 FSKVLRQTKKNPSNPKD--KSTSIRYLKALGIHQ-----TGQKVTDDMYA--EQTENPEN
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pF1KSD LAVREIYEELGRPGEEDLD
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CCDS27 LVIREIQEAIAVANASTMH
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CCDS38 KDFSLVRENSKETFSGKEKNRDLTYEREKRLDKPHKDLDSRLKSSFFDKAANQVEETLHT
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CCDS38 HLPQTPETNFRDSSYPFANKESIGSELGNSFASNIRIKEEPLDDEYDKAMAPQQGLLDKI
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CCDS38 KDEPDNAQEYSHGQQQKTQEGELKISAVFSVSGSPLAPQLTTG------------FQP--
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CCDS38 ----SLASSGMNKMLPSVPATAVRVSCSGCKKILQKGQTAYQRKGSTQLFCSTLCLTGYT
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CCDS38 VPPARPPPPLTKKTCSSCSKDILNPKDVISAQFENTTTSKDFCSQSCLSTYELKK-KPIV
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CCDS38 TINTNSISTKCSMCQKNAVIRHEVNYQNVVHKLCSDACFSKFRSANNLTMNCCENCGGYC
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CCDS38 YS--GSGQCHMLQIEGQSKKFCSSSCITAYKQKSAKITPCALCKSLRSSAEMIENTNSLG
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CCDS38 KTELFCSVNCLSAYRVKMVTSAGVQVQCNSCKTS-AIPQYHLAMSDGSIRNFCSYSCVVA
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pF1KSD FQR----------------------------TSPEGG-----------------------
:: : ::
CCDS38 FQNLFNKPTGMNSSVVPLSQGQVIVSIPTGSTVSAGGGSTSAVSPTSISSSAAAGLQRLA
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..:.:..:. ::. :::.::.. ..:::: ..: ...:.. .:...::
CCDS38 AQSQHVGFARSVVKLKCQHCNRLFATKPELLDYKGKMFQFCGKNCSDEYKKINNVMAMCE
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.:. ::...: .::::..:::::::: ::::.:..:. : : :.:: :: . : ..:
CCDS38 YCKIEKIVKETVRFSGADKSFCSEGCKLLYKHDLAKRWGNHCKMCSYCLQTSPKLVQNNL
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:.. .:: :.: ::: . . . :.: :::::::: :...:::...:::: :.: : .:
CCDS38 GGKVEEFCCEECMSKYTVLFYQMAKCDACKRQGKLSESLKWRGEMKHFCNLLCILMFCNQ
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pF1KSD Q---------NQPNLD----TQSGPESLLNSQSPE-----SKPQTPSQTKVENSNTVRTP
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CCDS38 QSVCDPPSQNNAANISMVQAASAGPPSLRKDSTPVIANVVSLASAPAAQPTVNSNSVLQG
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CCDS38 AVPTVTAKI-IGDASTQTDALKLPPSQPPRLLKNKALLCKPITQTKATSCKPHTQNKECQ
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CCDS38 TEDTPSQPQIIVVPVPVPVFVPIPLHLYTQYAPVPFGIPVPMPVPMLIPSSMDSEDKVTE
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.::..: :.:..:.:::.: ::::::: :: :... :. . : .. .:
CCDS38 SIEDIKEKLPTHPFEADLLEMAEMIAEDEEKKTLSQGESQTSEHELFLDTKIFEKDQGST
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pF1KSD EDCDLFGPA-------RDDVLAMAVKMANVLD-----------EPGQDLEADFPKNPLD-
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.: . . . . ..: .:. :.:.:. ... : : . . : : .:
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:.: ::::::: ::: : :.. .:: :. : :. :.
CCDS38 LKYMYGVNAWKNWVQWK--NAKEEQGD-LKCGGVEQASSSPRSDPLGSTQDHALSQESSE
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pF1KSD --------RIKEDILACSAAELNYGLAQFVREITRPNGERYEPDSIYYLCLGIQQYLLEN
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CCDS38 GRIDNIFTE-PYSRFMIELTKLLKIWEPTILPNGYMFSRIEEEHLWECKQLGAYSPIVLL
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CCDS38 NTLLFFNTKYFQLKNVTEHLKLSFAHVMRRTR---TLKYSTKMTYLRFFPPLQKQESEPD
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CCDS38 KLTVGKRKRNEDDEVPVGVEMAENTDNPLRCPVRLYEFYLSKCSESVKQRNDVFYLQPER
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CCDS38 SCVPNSPMWYSTFPIDPGTLDTMLTRILMVREVHEELAKAKSEDSDVELSD
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CCDS38 MKEPLDGECGKAV--VPQQELLDKIKE-EPDNA
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CCDS38 KDVITTRFENSYPSKDFCSQSCLSSYELKK-KPVVTIYTKSISTKCSMCQKNADTRFEVK
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CCDS38 YQNVVHGLCSDACFSKFHSTNNLTMNCCENCGSYCYS---SSGPC------QSQKVFSST
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CCDS38 VSCHSCKTS-AIPQYHLAMSNGTIYSFCSSSCVVAFQNVFSKPKGTNSSAVPLSQGQVVV
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:: :: ..:.:..:. ::
CCDS38 SPPSSRSAVSIGGGNTSAVSPSSIRGSAAASLQPLAEQSQQVALTHTVVKLKCQHCNHLF
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CCDS38 VCKFLSARDFGERWGNYCKMCSYCSQTSPNLVENRLEGKLEEFCCEDCMSKFTVLFYQMA
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CCDS38 KCDGCKRQGKLSESIKWRGNIKHFCNLFCVLEFCHQQIMNDCLPQNKVNISKAKTAVTEL
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CCDS38 PSARTDTTPVITSVMSLAKIPATLSTGNTNSVLKGAVTKEAAKI-IQDESTQEDAMKFPS
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CCDS38 SQSSQPSRLLKNKGISCKPVTQTKATSCKPHTQHKECQTDLPMPNEKNDAELDSPPSKKK
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CCDS41 CHRQQSRTQENELKINAVFSESASQLTAGIQLSLASSGVNKMLPSVSTTAIQVSCAGCKK
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CCDS41 ILQKGQTAYQRKGSAQLFCSIPCITEYISSASSPVPS-KRTCSNCSKDILNPKDVISVQL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]