Result of FASTA (ccds) for pF1KSDA0387
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KSDA0387, 1038 aa
  1>>>pF1KSDA0387 1038 - 1038 aa - 1038 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0672+/-0.000945; mu= 10.3238+/- 0.057
 mean_var=169.7761+/-33.143, 0's: 0 Z-trim(111.6): 114  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.098432
 statistics sampled from 12360 (12475) to 12360 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.383), width:  16
 Scan time:  5.520

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS5947.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7          (1015) 6527 939.7       0
CCDS5948.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7          ( 998) 6404 922.2       0
CCDS78294.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7         ( 977) 6150 886.2       0
CCDS5949.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7          ( 986) 3228 471.2 4.7e-132
CCDS56167.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2          ( 889) 2253 332.7 2.1e-90
CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2           ( 979) 2253 332.8 2.2e-90
CCDS56168.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2          ( 950) 2131 315.4 3.6e-85
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6           (1440)  664 107.2 2.6e-22
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1439)  662 106.9 3.1e-22
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20        (1460)  649 105.1 1.1e-21
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1446)  646 104.7 1.5e-21
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6          (1462)  646 104.7 1.5e-21
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20        (1441)  645 104.5 1.7e-21
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18         (1452)  640 103.8 2.7e-21
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18         (1465)  640 103.8 2.8e-21
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1898)  636 103.3   5e-21
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1            (1907)  636 103.3 5.1e-21
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20         ( 793)  626 101.6 6.7e-21
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20         ( 802)  626 101.7 6.8e-21
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1496)  624 101.6 1.4e-20
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1502)  624 101.6 1.4e-20
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9           (1505)  624 101.6 1.4e-20
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1505)  624 101.6 1.4e-20
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1506)  624 101.6 1.4e-20
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9          (1912)  624 101.6 1.6e-20
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1501)  615 100.3 3.3e-20
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1505)  615 100.3 3.3e-20
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1910)  615 100.3   4e-20
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19         (1948)  615 100.4 4.1e-20
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11          (1337)  610 99.5 4.9e-20
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 595)  600 97.9 6.9e-20
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 597)  600 97.9 6.9e-20
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12         ( 624)  600 97.9 7.2e-20
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7         (1448)  605 98.8 8.6e-20
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7         (2315)  605 99.0 1.2e-19
CCDS9163.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12         ( 593)  587 96.0 2.5e-19
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10          ( 642)  583 95.5 3.9e-19
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7          ( 780)  584 95.7 4.2e-19
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10          ( 700)  583 95.5 4.2e-19
CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2         ( 460)  569 93.4 1.2e-18
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2           ( 926)  567 93.3 2.5e-18
CCDS11864.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18         ( 353)  559 91.9 2.6e-18
CCDS11863.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18         ( 387)  559 91.9 2.8e-18
CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18         ( 415)  559 91.9 2.9e-18
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19         ( 937)  565 93.0 3.1e-18
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19         (1115)  565 93.1 3.6e-18
CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20         ( 435)  553 91.1 5.5e-18
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1           (1145)  555 91.7 9.8e-18
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1           (1306)  555 91.7 1.1e-17
CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1          ( 807)  545 90.2   2e-17


>>CCDS5947.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7               (1015 aa)
 initn: 6527 init1: 6527 opt: 6527  Z-score: 5016.0  bits: 939.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6527; 99.8% identity (99.9% similar) in 978 aa overlap (61-1038:38-1015)

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
        10        20        30        40        50        60       

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
        70        80        90       100       110       120       

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
       130       140       150       160       170       180       

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
       :::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FSESILTYVAHTSALTYPPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
       190       200       210       220       230       240       

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
       250       260       270       280       290       300       

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
       310       320       330       340       350       360       

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
       370       380       390       400       410       420       

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
       430       440       450       460       470       480       

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
       490       500       510       520       530       540       

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
       550       560       570       580       590       600       

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
       610       620       630       640       650       660       

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
       670       680       690       700       710       720       

              760       770       780       790       800       810
pF1KSD GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
       730       740       750       760       770       780       

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
       790       800       810       820       830       840       

              880       890       900       910       920       930
pF1KSD LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
       850       860       870       880       890       900       

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
       910       920       930       940       950       960       

             1000      1010      1020      1030        
pF1KSD GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
       970       980       990      1000      1010     

>>CCDS5948.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7               (998 aa)
 initn: 6404 init1: 6404 opt: 6404  Z-score: 4921.7  bits: 922.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6404; 99.8% identity (99.9% similar) in 961 aa overlap (78-1038:38-998)

        50        60        70        80        90       100       
pF1KSD VDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAMDFYRYEVSPVALQRLRV
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLDGVFGRCQKVPAMDFYRYEVSPVALQRLRV
        10        20        30        40        50        60       

       110       120       130       140       150       160       
pF1KSD ALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPARPSKHSVGSERRYSREGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPARPSKHSVGSERRYSREGG
        70        80        90       100       110       120       

       170       180       190       200       210       220       
pF1KSD AALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDRFSESILTYVAHTSALTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDRFSESILTYVAHTSALTY
       130       140       150       160       170       180       

       230       240       250       260       270       280       
pF1KSD PPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALSAYAAQRPPAPPGEGSLE
       ::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALSAYAAQRPPAPPGEGSLE
       190       200       210       220       230       240       

       290       300       310       320       330       340       
pF1KSD PQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARIHTLLKDLQRQPAEVRGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARIHTLLKDLQRQPAEVRGL
       250       260       270       280       290       300       

       350       360       370       380       390       400       
pF1KSD SGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGPKATLRGDSFPDDGVQDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGPKATLRGDSFPDDGVQDD
       310       320       330       340       350       360       

       410       420       430       440       450       460       
pF1KSD DDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEEETAGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEEETAGV
       370       380       390       400       410       420       

       470       480       490       500       510       520       
pF1KSD ENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQ
       430       440       450       460       470       480       

       530       540       550       560       570       580       
pF1KSD PSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQN
       490       500       510       520       530       540       

       590       600       610       620       630       640       
pF1KSD VTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLA
       550       560       570       580       590       600       

       650       660       670       680       690       700       
pF1KSD CILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQRMATRPPDRPEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQRMATRPPDRPEG
       610       620       630       640       650       660       

       710       720       730       740       750       760       
pF1KSD PHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNR
       670       680       690       700       710       720       

       770       780       790       800       810       820       
pF1KSD LEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINAS
       730       740       750       760       770       780       

       830       840       850       860       870       880       
pF1KSD PIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEG
       790       800       810       820       830       840       

       890       900       910       920       930       940       
pF1KSD SNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLL
       850       860       870       880       890       900       

       950       960       970       980       990      1000       
pF1KSD DFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQ
       910       920       930       940       950       960       

      1010      1020      1030        
pF1KSD RPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
       970       980       990        

>>CCDS78294.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7              (977 aa)
 initn: 6259 init1: 6150 opt: 6150  Z-score: 4726.9  bits: 886.2 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6187; 95.9% identity (96.0% similar) in 978 aa overlap (61-1038:38-977)

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
                                     :::::::::::::::::             
CCDS78 LLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLGCLLEEGLCGASEACVN-------------
        10        20        30        40        50                 

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 -------------------------GFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
                                    60        70        80         

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
      90       100       110       120       130       140         

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
       :::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FSESILTYVAHTSALTYPPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
     150       160       170       180       190       200         

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
     210       220       230       240       250       260         

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
     270       280       290       300       310       320         

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
     330       340       350       360       370       380         

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
     390       400       410       420       430       440         

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
     450       460       470       480       490       500         

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
     510       520       530       540       550       560         

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
     570       580       590       600       610       620         

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
     630       640       650       660       670       680         

              760       770       780       790       800       810
pF1KSD GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
     690       700       710       720       730       740         

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
     750       760       770       780       790       800         

              880       890       900       910       920       930
pF1KSD LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
     810       820       830       840       850       860         

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
     870       880       890       900       910       920         

             1000      1010      1020      1030        
pF1KSD GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
     930       940       950       960       970       

>>CCDS5949.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7               (986 aa)
 initn: 3273 init1: 3228 opt: 3228  Z-score: 2484.3  bits: 471.2 E(32554): 4.7e-132
Smith-Waterman score: 6271; 96.8% identity (96.9% similar) in 978 aa overlap (61-1038:38-986)

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
        10        20        30        40        50        60       

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
        70        80        90       100       110       120       

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
       130       140       150       160       170       180       

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
       :::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FSESILTYVAHTSALTYPPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
       190       200       210       220       230       240       

              280       290       300       310       320       330
pF1KSD AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
       250       260       270       280       290       300       

              340       350       360       370       380       390
pF1KSD HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
       310       320       330       340       350       360       

              400       410       420       430       440       450
pF1KSD KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
       370       380       390       400       410       420       

              460       470       480       490       500       510
pF1KSD SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
       430       440       450       460       470       480       

              520       530       540       550       560       570
pF1KSD PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
       :::::::::::::::::::::::::::::::                             
CCDS59 PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDR-----------------------------
       490       500       510                                     

              580       590       600       610       620       630
pF1KSD EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
      520       530       540       550       560       570        

              640       650       660       670       680       690
pF1KSD EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
      580       590       600       610       620       630        

              700       710       720       730       740       750
pF1KSD ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
      640       650       660       670       680       690        

              760       770       780       790       800       810
pF1KSD GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
      700       710       720       730       740       750        

              820       830       840       850       860       870
pF1KSD LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
      760       770       780       790       800       810        

              880       890       900       910       920       930
pF1KSD LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
      820       830       840       850       860       870        

              940       950       960       970       980       990
pF1KSD FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
      880       890       900       910       920       930        

             1000      1010      1020      1030        
pF1KSD GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
      940       950       960       970       980      

>>CCDS56167.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2               (889 aa)
 initn: 2160 init1: 1806 opt: 2253  Z-score: 1736.6  bits: 332.7 E(32554): 2.1e-90
Smith-Waterman score: 2326; 46.1% identity (67.2% similar) in 947 aa overlap (116-1038:4-889)

          90       100       110       120       130       140     
pF1KSD KVPAMDFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEA
                                     :..:.:: ::::..::.  .:.  :: :: 
CCDS56                            MSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPR--LRPPE-
                                          10        20          30 

         150       160       170       180       190       200     
pF1KSD SSPARPSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPA
         : ::  .:  . .: .  :     . : . .:     ..:::..     :   . : .
CCDS56 --P-RPRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVG
                  40             50            60             70   

         210       220       230       240       250       260     
pF1KSD EGDDRFSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHL
       .:    : :.    .  .:   ::     :.. :::      :: . : . . .. . .:
CCDS56 KGGAGASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYL
            80            90           100            110       120

         270        280       290       300       310       320    
pF1KSD MAALSAYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSST
       .  ...  ..:   . ::  :. :    .::. . :        ..     ::   :: .
CCDS56 FHQFGSRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPA
              130       140       150       160       170       180

          330       340       350       360       370          380 
pF1KSD GDGARIHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSP-G--RAALG
        .  .   ::   :. ::  :.    ..  . :      :: . . :. :: :  . .::
CCDS56 -QLFQDSGLLYLAQELPAPSRA----RVPRLPE------QG-SSSRAEDSPEGYEKEGLG
               190       200                 210        220        

             390       400       410              420         430  
pF1KSD ESGEQADGPKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQ---EVHRLS----ATLGGLLQ--DHGSR
       . ::.  .: .       :: ..:     :     :...:.    .::  :::   .:. 
CCDS56 DRGEKPASPAVQ------PDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKGAG
      230       240             250       260       270       280  

            440       450       460          470       480         
pF1KSD LLPGALPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEE---ETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPH---S
         ::..      :. .:  : :  . .. :   .:. . .  . . ... . : :    :
CCDS56 RNPGGV-VNVGADI-KKTMEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSS
             290        300       310       320       330       340

        490       500       510       520       530       540      
pF1KSD EPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRP
       ::  ::   .      :   :.. : : ..    : :  ..:. ::  ::::::. ::  
CCDS56 EPPKAARPPVT-----PVLLEKKSPLGQSQPTVAG-QPSARPAAEE-YGYIVTDQKPLSL
              350            360       370        380        390   

        550       560       570       580       590       600      
pF1KSD EEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEE
         : .:.: .:. ... :..: .. :.:::.::..  : ::..  :: . .   :..:: 
CCDS56 AAGVKLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEA
           400       410       420       430       440       450   

        610       620        630       640       650       660     
pF1KSD TSGLKILQTGVGSKSKLK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHS
        .::.:::::::.. .    ::  :.. .  . . ::::.:: . :.:.: ..  :.:. 
CCDS56 QTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQH
           460       470       480       490       500       510   

         670       680         690       700         710       720 
pF1KSD SQHRLKEKLSGLGGDPGA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFS
       .... ::.:..:: . ::  :.:  ::.::::.:::.   .: ::: . ::.::::::::
CCDS56 ARQQDKERLAALGPE-GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFS
           520        530       540       550       560       570  

             730       740       750       760       770       780 
pF1KSD DGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAE
       :.   :::..::. :: :::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.::::::::
CCDS56 DAAQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAE
            580       590       600       610       620       630  

             790       800       810       820       830       840 
pF1KSD PNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIA
       ::.  .:: : :. :::    : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: :::::
CCDS56 PNTCATAQGEGNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIA
            640       650       660       670       680       690  

             850       860       870       880       890       900 
pF1KSD TQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSE
       :::::  :.::::::::::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.::::::::
CCDS56 TQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSE
            700       710       720       730       740       750  

             910       920       930       940       950       960 
pF1KSD HIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRS
       ::::::::::::::::.::.::::.::::::::  .:.:.:.: ::::::::::::::::
CCDS56 HIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRS
            760       770       780       790       800       810  

             970       980       990      1000      1010      1020 
pF1KSD CPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFA
       :::::::::::::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.:::::
CCDS56 CPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFA
            820       830       840       850       860       870  

            1030        
pF1KSD LTAVAEEVNAILKALPQ
       :::::::::::::::::
CCDS56 LTAVAEEVNAILKALPQ
            880         

>>CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2                (979 aa)
 initn: 2318 init1: 1806 opt: 2253  Z-score: 1736.0  bits: 332.8 E(32554): 2.2e-90
Smith-Waterman score: 2456; 45.6% identity (67.4% similar) in 1002 aa overlap (61-1038:39-979)

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
                                     :::... ::.  :.:..::.::.::   ..
CCDS24 GLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQ
       10        20        30        40        50        60        

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
            .:.  .::::. .:..: . :..:.:: ::::..::.  .:.  :: ::   : :
CCDS24 ARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPR--LRPPE---P-R
       70        80        90       100       110         120      

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
       :  .:  . .: .  :     . : . .:     ..:::..     :   . : ..:   
CCDS24 PRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVGKGGAG
            130            140           150            160        

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
        : :.    .  .:   ::     :.. :::      :: . : . . .. . .:.  ..
CCDS24 ASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYLFHQFG
      170           180           190            200       210     

               280       290       300       310       320         
pF1KSD AYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGAR
       .  ..:   . ::  :. :    .::. . :        ..     ::   :: . .  .
CCDS24 SRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPA-QLFQ
         220       230       240       250       260       270     

     330       340       350       360       370          380      
pF1KSD IHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSP-G--RAALGESGEQ
          ::   :. ::  :.    ..  . :      :: . . :. :: :  . .::. ::.
CCDS24 DSGLLYLAQELPAPSRA----RVPRLPE------QG-SSSRAEDSPEGYEKEGLGDRGEK
          280       290                 300        310       320   

        390       400       410              420         430       
pF1KSD ADGPKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQ---EVHRLS----ATLGGLLQ--DHGSRLLPGA
         .: .       :: ..:     :     :...:.    .::  :::   .:.   ::.
CCDS24 PASPAVQ------PDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKGAGRNPGG
           330             340       350       360       370       

       440       450       460          470       480          490 
pF1KSD LPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEE---ETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPH---SEPGAA
       .      :. .:  : :  . .. :   .:. . .  . . ... . : :    :::  :
CCDS24 V-VNVGADI-KKTMEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKA
        380        390       400       410       420       430     

             500       510       520       530       540       550 
pF1KSD AFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRR
       :   .      :   :.. : : ..    : :  ..:. ::  ::::::. ::    : .
CCDS24 ARPPVT-----PVLLEKKSPLGQSQPTVAG-QPSARPAAEE-YGYIVTDQKPLSLAAGVK
         440            450       460        470        480        

             560       570       580       590       600       610 
pF1KSD LVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLK
       :.: .:. ... :..: .. :.:::.::..  : ::..  :: . .   :..::  .::.
CCDS24 LLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQ
      490       500       510       520       530       540        

             620        630       640       650       660       670
pF1KSD ILQTGVGSKSKLK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRL
       :::::::.. .    ::  :.. .  . . ::::.:: . :.:.: ..  :.:. .... 
CCDS24 ILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQHARQQD
      550       560       570       580       590       600        

              680         690       700         710       720      
pF1KSD KEKLSGLGGDPGA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFSDGPIP
       ::.:..:: . ::  :.:  ::.::::.:::.   .: ::: . ::.:::::::::.   
CCDS24 KERLAALGPE-GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQA
      610        620       630       640       650       660       

        730       740       750       760       770       780      
pF1KSD SPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSF
       :::..::. :: :::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.::::::::::.  
CCDS24 SPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCA
       670       680       690       700       710       720       

        790       800       810       820       830       840      
pF1KSD VAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPL
       .:: : :. :::    : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: ::::::::::
CCDS24 TAQGEGNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPL
       730       740       750       760       770       780       

        850       860       870       880       890       900      
pF1KSD PATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCE
         :.::::::::::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.:::::::::::::
CCDS24 SHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCE
       790       800       810       820       830       840       

        910       920       930       940       950       960      
pF1KSD DFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIV
       :::::::::::.::.::::.::::::::  .:.:.:.: :::::::::::::::::::::
CCDS24 DFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIV
       850       860       870       880       890       900       

        970       980       990      1000      1010      1020      
pF1KSD HCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVA
       ::::::::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.::::::::::
CCDS24 HCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVA
       910       920       930       940       950       960       

       1030        
pF1KSD EEVNAILKALPQ
       ::::::::::::
CCDS24 EEVNAILKALPQ
       970         

>>CCDS56168.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2               (950 aa)
 initn: 2265 init1: 1806 opt: 2131  Z-score: 1642.6  bits: 315.4 E(32554): 3.6e-85
Smith-Waterman score: 2345; 44.6% identity (65.8% similar) in 991 aa overlap (61-1038:39-950)

               40        50        60        70        80        90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
                                     :::... ::.  :.:..::.::.::   ..
CCDS56 GLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQ
       10        20        30        40        50        60        

              100       110       120       130       140       150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
            .:.  .::::. .:..: . :..:.:: ::::..::.  .:.  :: ::   : :
CCDS56 ARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPR--LRPPE---P-R
       70        80        90       100       110         120      

              160       170       180       190       200       210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
       :  .:  . .: .  :     . : . .:     ..:::..     :   . : ..:   
CCDS56 PRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVGKGGAG
            130            140           150            160        

              220       230       240       250       260       270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
        : :.    .  .:   ::     :.. :::      :: . : . . .. . .:.  ..
CCDS56 ASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYLFHQFG
      170           180           190            200       210     

               280       290       300       310       320         
pF1KSD AYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGAR
       .  ..:   . ::  :. :    .::. . :        ..     ::   ::       
CCDS56 SRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPS-------
         220       230       240       250       260               

     330       340       350       360       370       380         
pF1KSD IHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADG
                  ::..   ::: :    :: :     : .   .:: .::  .  : . .:
CCDS56 -----------PAQLFQDSGL-LYLAQELPAPSRARVPRLPEQGSSSRAEDSPEGYEKEG
                 270        280       290       300       310      

     390       400       410       420       430       440         
pF1KSD PKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERK
            ::..  . .:: :       ..::.:.:.:   .   .: :  :     : .   
CCDS56 --LGDRGEKPASPAVQPD-----AALQRLAAVLAGYGVEL-RQLTPEQLSTLLTLLQLLP
          320       330            340        350       360        

     450       460       470       480       490       500         
pF1KSD KSEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPG-P-----
       :.        . .. .:: :: ..  .: . :  :     .: .    . ::: :     
CCDS56 KG--------AGRNPGGVVNVGADI-KKTMEG--PVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPT
      370               380        390         400       410       

           510       520       530       540       550        560  
pF1KSD SKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRR-LVEDVARLLQV
       :.: :..:. ..     . .  : :   : .. .  ..  .  . . :  .:. . ..  
CCDS56 SSEVQQVPSPVSSEPPKAARPPVTPVLLEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIV--
       420       430       440       450       460       470       

            570       580       590       600       610       620  
pF1KSD PSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSK
            .: .:.:::.::..  : ::..  :: . .   :..::  .::.:::::::.. .
CCDS56 -----TDQNVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREE
              480       490       500       510       520       530

             630       640       650       660       670       680 
pF1KSD LK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDP
           ::  :.. .  . . ::::.:: . :.:.: ..  :.:. .... ::.:..:: . 
CCDS56 AAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQHARQQDKERLAALGPE-
              540       550       560       570       580          

               690       700         710       720       730       
pF1KSD GA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSW
       ::  :.:  ::.::::.:::.   .: ::: . ::.:::::::::.   :::..::. ::
CCDS56 GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQASPSSHSSTPSW
     590       600       610       620       630       640         

       740       750       760       770       780       790       
pF1KSD SEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKN
        :::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.::::::::::.  .:: : :. ::
CCDS56 CEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKN
     650       660       670       680       690       700         

       800       810       820       830       840       850       
pF1KSD RSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMV
       :    : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: ::::::::::  :.:::::::
CCDS56 RHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMV
     710       720       730       740       750       760         

       860       870       880       890       900       910       
pF1KSD WESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKN
       :::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.::::::::::::::::::::::::
CCDS56 WESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKN
     770       780       790       800       810       820         

       920       930       940       950       960       970       
pF1KSD LQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGT
       .::.::::.::::::::  .:.:.:.: :::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS56 VQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGT
     830       840       850       860       870       880         

       980       990      1000      1010      1020      1030       
pF1KSD YVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALP
       :.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.:::::::::::::::::::::
CCDS56 YILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVAEEVNAILKALP
     890       900       910       920       930       940         

        
pF1KSD Q
       :
CCDS56 Q
     950

>>CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6                (1440 aa)
 initn: 662 init1: 250 opt: 664  Z-score: 514.1  bits: 107.2 E(32554): 2.6e-22
Smith-Waterman score: 664; 31.1% identity (59.1% similar) in 447 aa overlap (602-1037:718-1151)

             580       590       600       610       620       630 
pF1KSD VLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAE
                                     .:  .:. ..:  : ...  . . .:  :.
CCDS51 GDNRTYQGFWNPPLAPRKGYNIYFQAMSSVEKETKTQCVRI-ATKAAATEEPEVIPDPAK
       690       700       710       720        730       740      

             640       650       660       670       680       690 
pF1KSD QEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQE
       : :  . . .. .: . .. .::   .:  ...:   .: .: .   :.   . :   . 
CCDS51 QTD--RVVKIAGISAGILVFILLLLVVILIVKKS---KLAKKRKDAMGNTRQEMTHMVNA
          750       760       770          780       790       800 

             700       710          720       730            740   
pF1KSD LCRQRMATRPPDRPEGPHTSRI---SSVSSQFSDGPIPSPSAR-----SSASSWSEEPVQ
       . :. .: .   . : : .  .    . : .. .    . :.:           .: : :
CCDS51 MDRS-YADQSTLHAEDPLSITFMDQHNFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQ
              810       820       830       840       850       860

              750       760       770       780       790       800
pF1KSD SNM---DISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSL
       ...    : .. ..      . ...  ...:.:..  ....  :  ::....:  :::  
CCDS51 TGQLHPAIRVADLLQHINLMKTSDSYGFKEEYESF--FEGQSASWDVAKKDQNRAKNRYG
              870       880       890         900       910        

              810       820       830       840       850       860
pF1KSD AVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWES
        ...::::::.:.  ..   ::::::. : :   :   :::::::.  :: :::.:.:. 
CCDS51 NIIAYDHSRVILQPVEDDPSSDYINANYI-DGYQRPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQE
      920       930       940        950       960       970       

              870       880       890       900       910       920
pF1KSD GCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQT
         . :::.: :.: :  .::.::::. ...:  ..:. :  .   : ..::.: :.    
CCDS51 QSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWPDD-TEVYGDFKVTCVEMEPLAE-YVVRTFTLERRGY
       980       990      1000       1010      1020       1030     

              930       940       950       960       970       980
pF1KSD NETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVL
       :: : : :::: .: :.:::  . .::.: :.:.      . ::.:::: ::::.: :..
CCDS51 NEIREVKQFHFTGWPDHGVPYHATGLLSFIRRVKLSNPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIV
        1040      1050      1060      1070      1080      1090     

              990      1000      1010      1020      1030          
pF1KSD IDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ  
       ::..:. ::.    .::   .. ::..: .::::.::. :   :. :       :.:   
CCDS51 IDIMLD-MAEREGVVDIYNCVKALRSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIPVCE
        1100       1110      1120      1130      1140      1150    

CCDS51 FKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRNHDKNRFMDMLPPD
         1160      1170      1180      1190      1200      1210    

>--
 initn: 322 init1: 147 opt: 464  Z-score: 360.6  bits: 78.8 E(32554): 9.1e-14
Smith-Waterman score: 464; 35.4% identity (62.9% similar) in 280 aa overlap (760-1027:1166-1435)

     730       740       750       760       770           780     
pF1KSD ARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAY----QAEPNSS
                                     :   :...:. :...: .     :::  : 
CCDS51 HDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCS-
        1140      1150      1160      1170      1180      1190     

         790       800       810       820       830       840     
pF1KSD FVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGP
        .:   .:  ::: . .:  :.   .: . ...: :.::::. .::   .  :.:.:: :
CCDS51 -IACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGES-SNYINAA-LMDSYRQPAAFIVTQYP
          1200      1210      1220       1230       1240      1250 

         850       860       870        880       890       900    
pF1KSD LPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQ-CYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIW
       :: :: :::..:.. ::. ::::.   :  . : : .:::.::   :   .:. .:  . 
CCDS51 LPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLN---EVDLSQGCPQYWPEEGMLRYGPIQVECMSCSMD
            1260      1270         1280      1290      1300        

          910       920         930        940       950           
pF1KSD CEDFLVRSFYLKNLQTNETR--TVTQFHFLSWYD-RGVPSSSRSLLDFRRKVNK----CY
       : : . : : . ::   .     : ::..:.: . : ::.:.::.: .  .:.:    : 
CCDS51 C-DVINRIFRICNLTRPQEGYLMVQQFQYLGWASHREVPGSKRSFLKLILQVEKWQEECE
      1310      1320      1330      1340      1350      1360       

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KSD RGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQ
       .:..   :.:: .:.:::: .  : .:. .:.:  . .:.  ... ::...:.::.. ::
CCDS51 EGEG-RTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVV-EMVKRQNVVDVFHAVKTLRNSKPNMVEAPEQ
      1370       1380      1390       1400      1410      1420     

      1020      1030        
pF1KSD FEFALTAVAEEVNAILKALPQ
       ..:   .. :           
CCDS51 YRFCYDVALEYLESS      
        1430      1440      

>>CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6               (1439 aa)
 initn: 662 init1: 250 opt: 662  Z-score: 512.6  bits: 106.9 E(32554): 3.1e-22
Smith-Waterman score: 662; 31.9% identity (59.1% similar) in 423 aa overlap (626-1037:740-1150)

         600       610       620       630       640       650     
pF1KSD ATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLA
                                     .:  :.: :  . . .. .: . .. .:: 
CCDS75 YFQAMSSVEKETKTQCVRIATKAATEEPEVIPDPAKQTD--RVVKIAGISAGILVFILLL
     710       720       730       740         750       760       

         660       670       680       690       700       710     
pF1KSD SGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRI--
         .:  ...:   .: .: .   :.   . :   . . :. .: .   . : : .  .  
CCDS75 LVVILIVKKS---KLAKKRKDAMGNTRQEMTHMVNAMDRS-YADQSTLHAEDPLSITFMD
       770          780       790       800        810       820   

            720       730            740          750       760    
pF1KSD -SSVSSQFSDGPIPSPSAR-----SSASSWSEEPVQSNM---DISTGHMILSYMEDHLKN
         . : .. .    . :.:           .: : :...    : .. ..      . ..
CCDS75 QHNFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQTGQLHPAIRVADLLQHINLMKTSD
           830       840       850       860       870       880   

          770       780       790       800       810       820    
pF1KSD KNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYI
       .  ...:.:..  ....  :  ::....:  :::   ...::::::.:.  ..   ::::
CCDS75 SYGFKEEYESF--FEGQSASWDVAKKDQNRAKNRYGNIIAYDHSRVILQPVEDDPSSDYI
           890         900       910       920       930       940 

          830       840       850       860       870       880    
pF1KSD NASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWP
       ::. : :   :   :::::::.  :: :::.:.:.   . :::.: :.: :  .::.:::
CCDS75 NANYI-DGYQRPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQEQSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWP
              950       960       970       980       990      1000

          890       900       910       920       930       940    
pF1KSD DEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSR
       :. ...:  ..:. :  .   : ..::.: :.    :: : : :::: .: :.:::  . 
CCDS75 DD-TEVYGDFKVTCVEMEPLAE-YVVRTFTLERRGYNEIREVKQFHFTGWPDHGVPYHAT
              1010      1020       1030      1040      1050        

          950       960       970       980       990      1000    
pF1KSD SLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHL
       .::.: :.:.      . ::.:::: ::::.: :..::..:. ::.    .::   .. :
CCDS75 GLLSFIRRVKLSNPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIVIDIMLD-MAEREGVVDIYNCVKAL
     1060      1070      1080      1090      1100       1110       

         1010      1020      1030                                  
pF1KSD RDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ                          
       :..: .::::.::. :   :. :       :.:                           
CCDS75 RSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEF
      1120      1130      1140      1150      1160      1170       

CCDS75 QTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGESSNYINAALMDS
      1180      1190      1200      1210      1220      1230       

>--
 initn: 322 init1: 147 opt: 464  Z-score: 360.6  bits: 78.8 E(32554): 9.1e-14
Smith-Waterman score: 464; 35.4% identity (62.9% similar) in 280 aa overlap (760-1027:1165-1434)

     730       740       750       760       770           780     
pF1KSD ARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAY----QAEPNSS
                                     :   :...:. :...: .     :::  : 
CCDS75 HDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCS-
         1140      1150      1160      1170      1180      1190    

         790       800       810       820       830       840     
pF1KSD FVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGP
        .:   .:  ::: . .:  :.   .: . ...: :.::::. .::   .  :.:.:: :
CCDS75 -IACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGES-SNYINAA-LMDSYRQPAAFIVTQYP
           1200      1210      1220       1230       1240      1250

         850       860       870        880       890       900    
pF1KSD LPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQ-CYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIW
       :: :: :::..:.. ::. ::::.   :  . : : .:::.::   :   .:. .:  . 
CCDS75 LPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLN---EVDLSQGCPQYWPEEGMLRYGPIQVECMSCSMD
             1260      1270         1280      1290      1300       

          910       920         930        940       950           
pF1KSD CEDFLVRSFYLKNLQTNETR--TVTQFHFLSWYD-RGVPSSSRSLLDFRRKVNK----CY
       : : . : : . ::   .     : ::..:.: . : ::.:.::.: .  .:.:    : 
CCDS75 C-DVINRIFRICNLTRPQEGYLMVQQFQYLGWASHREVPGSKRSFLKLILQVEKWQEECE
       1310      1320      1330      1340      1350      1360      

       960       970       980       990      1000      1010       
pF1KSD RGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQ
       .:..   :.:: .:.:::: .  : .:. .:.:  . .:.  ... ::...:.::.. ::
CCDS75 EGEG-RTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVV-EMVKRQNVVDVFHAVKTLRNSKPNMVEAPEQ
       1370       1380      1390       1400      1410      1420    

      1020      1030        
pF1KSD FEFALTAVAEEVNAILKALPQ
       ..:   .. :           
CCDS75 YRFCYDVALEYLESS      
         1430               

>>CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20             (1460 aa)
 initn: 626 init1: 202 opt: 649  Z-score: 502.5  bits: 105.1 E(32554): 1.1e-21
Smith-Waterman score: 663; 32.0% identity (60.9% similar) in 447 aa overlap (610-1037:739-1171)

     580       590       600       610       620       630         
pF1KSD KVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAEQEDSTKF-
                                     : .: ::...... . . :. . ....:. 
CCDS68 SKANGETKINCVRLATKAPMGSAQVTPGTPLCLLTTGASTQNS-NTVEPEKQVDNTVKMA
      710       720       730       740       750        760       

        640       650       660       670       680       690      
pF1KSD --IALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQR
         ::  :. .  .:::.:.   :   :.. ..    ::.          ..: .:.    
CCDS68 GVIAGLLMFIIILLGVMLT---IKRRRNAYSYSYYLKLA---KKQKETQSGAQREMGPVA
       770       780          790       800          810       820 

        700       710           720          730        740        
pF1KSD MATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQ----FSDGP---IPSPSARSSASSW-SEEPVQSNM--
        : .:  .  . ....  : :::    :.::    . .:.   ..  . . .::. ..  
CCDS68 SADKPTTKLSASRNDEGFSSSSQDVNGFTDGSRGELSQPTLTIQTHPYRTCDPVEMSYPR
             830       840       850       860       870       880 

        750       760            770       780       790       800 
pF1KSD DISTGHMILSYMEDHLKNKNR-----LEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLA
       :     . .. . .:. . .:     ...:.:::   ...  :  .:...::  :::   
CCDS68 DQFQPAIRVADLLQHITQMKRGQGYGFKEEYEAL--PEGQTASWDTAKEDENRNKNRYGN
             890       900       910         920       930         

             810       820       830        840       850       860
pF1KSD VLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMD-HDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWES
       ...:::::: : . ..  :::::::. :   : ::.  :::::::.  :: :::.:.:. 
CCDS68 IISYDHSRVRLLVLDGDPHSDYINANYIDGYHRPRH--YIATQGPMQETVKDFWRMIWQE
     940       950       960       970         980       990       

              870       880       890       900       910       920
pF1KSD GCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQT
       . . :::.: :.: :  .: .::::. ...:   .:.:.  .   : ...:.: ...   
CCDS68 NSASIVMVTNLVEVGRVKCVRYWPDD-TEVYGDIKVTLIETEPLAE-YVIRTFTVQKKGY
      1000      1010      1020       1030      1040       1050     

              930       940       950       960       970       980
pF1KSD NETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVL
       .: : .  ::: :: :.:::  . .:: : :.:.     .. ::.:::: ::::.: .. 
CCDS68 HEIRELRLFHFTSWPDHGVPCYATGLLGFVRQVKFLNPPEAGPIVVHCSAGAGRTGCFIA
        1060      1070      1080      1090      1100      1110     

              990      1000      1010      1020      1030          
pF1KSD IDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ  
       :: .:. ::..   .::   ...:: :: ..:::.::. :.  :. :       :.:   
CCDS68 IDTMLD-MAENEGVVDIFNCVRELRAQRVNLVQTEEQYVFVHDAILEACLCGNTAIPVCE
        1120       1130      1140      1150      1160      1170    

CCDS68 FRSLYYNISRLDPQTNSSQIKDEFQTLNIVTPRVRPEDCSIGLLPRNHDKNRSMDVLPLD
         1180      1190      1200      1210      1220      1230    

>--
 initn: 350 init1: 147 opt: 474  Z-score: 368.2  bits: 80.2 E(32554): 3.4e-14
Smith-Waterman score: 474; 32.9% identity (64.3% similar) in 280 aa overlap (760-1031:1186-1459)

     730       740       750       760       770         780       
pF1KSD ARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAY--QAEPNSSFV
                                     :   :..... :...:     ...:..  .
CCDS68 HDAILEACLCGNTAIPVCEFRSLYYNISRLDPQTNSSQIKDEFQTLNIVTPRVRPEDCSI
        1160      1170      1180      1190      1200      1210     

       790       800       810       820       830       840       
pF1KSD AQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLP
       .   .:  ::::. ::  :.   .: . ...: :.::::. .::   .  :...:: :::
CCDS68 GLLPRNHDKNRSMDVLPLDRCLPFLISVDGES-SNYINAA-LMDSHKQPAAFVVTQHPLP
        1220      1230      1240       1250       1260      1270   

       850       860       870       880       890       900       
pF1KSD ATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCED
        ::::::..:.. .:  .:::. .  . .. :..:::.. :. :   .:..::  :  ::
CCDS68 NTVADFWRLVFDYNCSSVVMLNEM--DTAQFCMQYWPEKTSGCYGPIQVEFVSADI-DED
          1280      1290        1300      1310      1320       1330

       910       920         930        940       950          960 
pF1KSD FLVRSFYLKNLQTNET--RTVTQFHFLSWYD-RGVPSSSRSLLDFRRKVNK---CYRGRS
       .. : : . :.   .   : : ......:   : .: :.::::   :...:    : :: 
CCDS68 IIHRIFRICNMARPQDGYRIVQHLQYIGWPAYRDTPPSKRSLLKVVRRLEKWQEQYDGRE
             1340      1350      1360      1370      1380      1390

             970       980       990      1000      1010      1020 
pF1KSD CPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFA
          .::: .:.:::::.  :  :  .: .  . ::.   .. ::... .::.: ::..:.
CCDS68 GRTVVHCLNGGGRSGTFCAICSVC-EMIQQQNIIDVFHIVKTLRNNKSNMVETLEQYKFV
             1400      1410       1420      1430      1440         

            1030        
pF1KSD LTAVAEEVNAILKALPQ
         .. : ...       
CCDS68 YEVALEYLSSF      
    1450      1460      




1038 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Thu Nov  3 01:34:20 2016 done: Thu Nov  3 01:34:21 2016
 Total Scan time:  5.520 Total Display time:  0.460

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com