FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0387, 1038 aa
1>>>pF1KSDA0387 1038 - 1038 aa - 1038 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0672+/-0.000945; mu= 10.3238+/- 0.057
mean_var=169.7761+/-33.143, 0's: 0 Z-trim(111.6): 114 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.098432
statistics sampled from 12360 (12475) to 12360 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.383), width: 16
Scan time: 5.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5947.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 (1015) 6527 939.7 0
CCDS5948.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 998) 6404 922.2 0
CCDS78294.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 977) 6150 886.2 0
CCDS5949.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 986) 3228 471.2 4.7e-132
CCDS56167.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 889) 2253 332.7 2.1e-90
CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 979) 2253 332.8 2.2e-90
CCDS56168.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 950) 2131 315.4 3.6e-85
CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 664 107.2 2.6e-22
CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 662 106.9 3.1e-22
CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 649 105.1 1.1e-21
CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 646 104.7 1.5e-21
CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 646 104.7 1.5e-21
CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 645 104.5 1.7e-21
CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 640 103.8 2.7e-21
CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 640 103.8 2.8e-21
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 636 103.3 5e-21
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 636 103.3 5.1e-21
CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 626 101.6 6.7e-21
CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 626 101.7 6.8e-21
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 624 101.6 1.4e-20
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 624 101.6 1.4e-20
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 624 101.6 1.4e-20
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 624 101.6 1.4e-20
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 624 101.6 1.4e-20
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 624 101.6 1.6e-20
CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 615 100.3 3.3e-20
CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 615 100.3 3.3e-20
CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 615 100.3 4e-20
CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 615 100.4 4.1e-20
CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 610 99.5 4.9e-20
CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 600 97.9 6.9e-20
CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 600 97.9 6.9e-20
CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 600 97.9 7.2e-20
CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 605 98.8 8.6e-20
CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 605 99.0 1.2e-19
CCDS9163.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 ( 593) 587 96.0 2.5e-19
CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 583 95.5 3.9e-19
CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 584 95.7 4.2e-19
CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 583 95.5 4.2e-19
CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2 ( 460) 569 93.4 1.2e-18
CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2 ( 926) 567 93.3 2.5e-18
CCDS11864.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 353) 559 91.9 2.6e-18
CCDS11863.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 387) 559 91.9 2.8e-18
CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 415) 559 91.9 2.9e-18
CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 565 93.0 3.1e-18
CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 565 93.1 3.6e-18
CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 435) 553 91.1 5.5e-18
CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 555 91.7 9.8e-18
CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 555 91.7 1.1e-17
CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 807) 545 90.2 2e-17
>>CCDS5947.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 (1015 aa)
initn: 6527 init1: 6527 opt: 6527 Z-score: 5016.0 bits: 939.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6527; 99.8% identity (99.9% similar) in 978 aa overlap (61-1038:38-1015)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
:::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FSESILTYVAHTSALTYPPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KSD EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KSD ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KSD GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
730 740 750 760 770 780
820 830 840 850 860 870
pF1KSD LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
790 800 810 820 830 840
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
850 860 870 880 890 900
940 950 960 970 980 990
pF1KSD FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
910 920 930 940 950 960
1000 1010 1020 1030
pF1KSD GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
970 980 990 1000 1010
>>CCDS5948.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 (998 aa)
initn: 6404 init1: 6404 opt: 6404 Z-score: 4921.7 bits: 922.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6404; 99.8% identity (99.9% similar) in 961 aa overlap (78-1038:38-998)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD VDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAMDFYRYEVSPVALQRLRV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLDGVFGRCQKVPAMDFYRYEVSPVALQRLRV
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KSD ALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPARPSKHSVGSERRYSREGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPARPSKHSVGSERRYSREGG
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KSD AALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDRFSESILTYVAHTSALTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDRFSESILTYVAHTSALTY
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KSD PPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALSAYAAQRPPAPPGEGSLE
::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALSAYAAQRPPAPPGEGSLE
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KSD PQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARIHTLLKDLQRQPAEVRGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARIHTLLKDLQRQPAEVRGL
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGPKATLRGDSFPDDGVQDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGPKATLRGDSFPDDGVQDD
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KSD DDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEEETAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEEETAGV
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KSD ENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQ
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KSD PSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQN
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KSD VTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 VTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLA
550 560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KSD CILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQRMATRPPDRPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 CILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQRMATRPPDRPEG
610 620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KSD PHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNR
670 680 690 700 710 720
770 780 790 800 810 820
pF1KSD LEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINAS
730 740 750 760 770 780
830 840 850 860 870 880
pF1KSD PIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEG
790 800 810 820 830 840
890 900 910 920 930 940
pF1KSD SNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLL
850 860 870 880 890 900
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD DFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQ
910 920 930 940 950 960
1010 1020 1030
pF1KSD RPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 RPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
970 980 990
>>CCDS78294.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 (977 aa)
initn: 6259 init1: 6150 opt: 6150 Z-score: 4726.9 bits: 886.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6187; 95.9% identity (96.0% similar) in 978 aa overlap (61-1038:38-977)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
:::::::::::::::::
CCDS78 LLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLGCLLEEGLCGASEACVN-------------
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 -------------------------GFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
:::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FSESILTYVAHTSALTYPPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
270 280 290 300 310 320
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
330 340 350 360 370 380
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
390 400 410 420 430 440
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
450 460 470 480 490 500
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
510 520 530 540 550 560
640 650 660 670 680 690
pF1KSD EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
570 580 590 600 610 620
700 710 720 730 740 750
pF1KSD ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
630 640 650 660 670 680
760 770 780 790 800 810
pF1KSD GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
690 700 710 720 730 740
820 830 840 850 860 870
pF1KSD LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
750 760 770 780 790 800
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
810 820 830 840 850 860
940 950 960 970 980 990
pF1KSD FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
870 880 890 900 910 920
1000 1010 1020 1030
pF1KSD GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
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>>CCDS5949.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 (986 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLLLLLLLPPRVLPAAPSSVPRGRQLPGRLGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
:::::::::::::::::::: ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FSESILTYVAHTSALTYPPGSRTQLREDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AYAAQRPPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGARI
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KSD HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADGP
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KSD KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERKK
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSL
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KSD PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADV
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 PAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDR-----------------------------
490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQA
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KSD EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQ
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KSD ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDIST
640 650 660 670 680 690
760 770 780 790 800 810
pF1KSD GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRV
700 710 720 730 740 750
820 830 840 850 860 870
pF1KSD LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTP
760 770 780 790 800 810
880 890 900 910 920 930
pF1KSD LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 LAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFH
820 830 840 850 860 870
940 950 960 970 980 990
pF1KSD FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 FLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAK
880 890 900 910 920 930
1000 1010 1020 1030
pF1KSD GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 GAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
940 950 960 970 980
>>CCDS56167.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 (889 aa)
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pF1KSD KVPAMDFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEA
:..:.:: ::::..::. .:. :: ::
CCDS56 MSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPR--LRPPE-
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KSD SSPARPSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPA
: :: .: . .: . : . : . .: ..:::.. : . : .
CCDS56 --P-RPRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVG
40 50 60 70
210 220 230 240 250 260
pF1KSD EGDDRFSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHL
.: : :. . .: :: :.. ::: :: . : . . .. . .:
CCDS56 KGGAGASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYL
80 90 100 110 120
270 280 290 300 310 320
pF1KSD MAALSAYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSST
. ... ..: . :: :. : .::. . : .. :: :: .
CCDS56 FHQFGSRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPA
130 140 150 160 170 180
330 340 350 360 370 380
pF1KSD GDGARIHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSP-G--RAALG
. . :: :. :: :. .. . : :: . . :. :: : . .::
CCDS56 -QLFQDSGLLYLAQELPAPSRA----RVPRLPE------QG-SSSRAEDSPEGYEKEGLG
190 200 210 220
390 400 410 420 430
pF1KSD ESGEQADGPKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQ---EVHRLS----ATLGGLLQ--DHGSR
. ::. .: . :: ..: : :...:. .:: ::: .:.
CCDS56 DRGEKPASPAVQ------PDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKGAG
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480
pF1KSD LLPGALPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEE---ETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPH---S
::.. :. .: : : . .. : .:. . . . . ... . : : :
CCDS56 RNPGGV-VNVGADI-KKTMEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSS
290 300 310 320 330 340
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRP
:: :: . : :.. : : .. : : ..:. :: ::::::. ::
CCDS56 EPPKAARPPVT-----PVLLEKKSPLGQSQPTVAG-QPSARPAAEE-YGYIVTDQKPLSL
350 360 370 380 390
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEE
: .:.: .:. ... :..: .. :.:::.::.. : ::.. :: . . :..::
CCDS56 AAGVKLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEA
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TSGLKILQTGVGSKSKLK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHS
.::.:::::::.. . :: :.. . . . ::::.:: . :.:.: .. :.:.
CCDS56 QTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQH
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SQHRLKEKLSGLGGDPGA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFS
.... ::.:..:: . :: :.: ::.::::.:::. .: ::: . ::.::::::::
CCDS56 ARQQDKERLAALGPE-GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFS
520 530 540 550 560 570
730 740 750 760 770 780
pF1KSD DGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAE
:. :::..::. :: :::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.::::::::
CCDS56 DAAQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAE
580 590 600 610 620 630
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIA
::. .:: : :. ::: : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: :::::
CCDS56 PNTCATAQGEGNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIA
640 650 660 670 680 690
850 860 870 880 890 900
pF1KSD TQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSE
::::: :.::::::::::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.::::::::
CCDS56 TQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSE
700 710 720 730 740 750
910 920 930 940 950 960
pF1KSD HIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRS
::::::::::::::::.::.::::.:::::::: .:.:.:.: ::::::::::::::::
CCDS56 HIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRS
760 770 780 790 800 810
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD CPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFA
:::::::::::::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.:::::
CCDS56 CPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFA
820 830 840 850 860 870
1030
pF1KSD LTAVAEEVNAILKALPQ
:::::::::::::::::
CCDS56 LTAVAEEVNAILKALPQ
880
>>CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 (979 aa)
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Smith-Waterman score: 2456; 45.6% identity (67.4% similar) in 1002 aa overlap (61-1038:39-979)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
:::... ::. :.:..::.::.:: ..
CCDS24 GLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQ
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
.:. .::::. .:..: . :..:.:: ::::..::. .:. :: :: : :
CCDS24 ARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPR--LRPPE---P-R
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
: .: . .: . : . : . .: ..:::.. : . : ..:
CCDS24 PRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVGKGGAG
130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
: :. . .: :: :.. ::: :: . : . . .. . .:. ..
CCDS24 ASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYLFHQFG
170 180 190 200 210
280 290 300 310 320
pF1KSD AYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGAR
. ..: . :: :. : .::. . : .. :: :: . . .
CCDS24 SRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPA-QLFQ
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KSD IHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSP-G--RAALGESGEQ
:: :. :: :. .. . : :: . . :. :: : . .::. ::.
CCDS24 DSGLLYLAQELPAPSRA----RVPRLPE------QG-SSSRAEDSPEGYEKEGLGDRGEK
280 290 300 310 320
390 400 410 420 430
pF1KSD ADGPKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQ---EVHRLS----ATLGGLLQ--DHGSRLLPGA
.: . :: ..: : :...:. .:: ::: .:. ::.
CCDS24 PASPAVQ------PDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKGAGRNPGG
330 340 350 360 370
440 450 460 470 480 490
pF1KSD LPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEE---ETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPH---SEPGAA
. :. .: : : . .. : .:. . . . . ... . : : ::: :
CCDS24 V-VNVGADI-KKTMEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKA
380 390 400 410 420 430
500 510 520 530 540 550
pF1KSD AFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRR
: . : :.. : : .. : : ..:. :: ::::::. :: : .
CCDS24 ARPPVT-----PVLLEKKSPLGQSQPTVAG-QPSARPAAEE-YGYIVTDQKPLSLAAGVK
440 450 460 470 480
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLK
:.: .:. ... :..: .. :.:::.::.. : ::.. :: . . :..:: .::.
CCDS24 LLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQ
490 500 510 520 530 540
620 630 640 650 660 670
pF1KSD ILQTGVGSKSKLK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRL
:::::::.. . :: :.. . . . ::::.:: . :.:.: .. :.:. ....
CCDS24 ILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQHARQQD
550 560 570 580 590 600
680 690 700 710 720
pF1KSD KEKLSGLGGDPGA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFSDGPIP
::.:..:: . :: :.: ::.::::.:::. .: ::: . ::.:::::::::.
CCDS24 KERLAALGPE-GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQA
610 620 630 640 650 660
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSF
:::..::. :: :::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.::::::::::.
CCDS24 SPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCA
670 680 690 700 710 720
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPL
.:: : :. ::: : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: ::::::::::
CCDS24 TAQGEGNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPL
730 740 750 760 770 780
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCE
:.::::::::::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.:::::::::::::
CCDS24 SHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCE
790 800 810 820 830 840
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIV
:::::::::::.::.::::.:::::::: .:.:.:.: :::::::::::::::::::::
CCDS24 DFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIV
850 860 870 880 890 900
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD HCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVA
::::::::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.::::::::::
CCDS24 HCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVA
910 920 930 940 950 960
1030
pF1KSD EEVNAILKALPQ
::::::::::::
CCDS24 EEVNAILKALPQ
970
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40 50 60 70 80 90
pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM
:::... ::. :.:..::.::.:: ..
CCDS56 GLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQ
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pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR
.:. .::::. .:..: . :..:.:: ::::..::. .:. :: :: : :
CCDS56 ARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPR--LRPPE---P-R
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pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR
: .: . .: . : . : . .: ..:::.. : . : ..:
CCDS56 PRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVGKGGAG
130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS
: :. . .: :: :.. ::: :: . : . . .. . .:. ..
CCDS56 ASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYLFHQFG
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pF1KSD AYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGAR
. ..: . :: :. : .::. . : .. :: ::
CCDS56 SRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPS-------
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KSD IHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADG
::.. ::: : :: : : . .:: .:: . : . .:
CCDS56 -----------PAQLFQDSGL-LYLAQELPAPSRARVPRLPEQGSSSRAEDSPEGYEKEG
270 280 290 300 310
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pF1KSD PKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERK
::.. . .:: : ..::.:.:.: . .: : : : .
CCDS56 --LGDRGEKPASPAVQPD-----AALQRLAAVLAGYGVEL-RQLTPEQLSTLLTLLQLLP
320 330 340 350 360
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pF1KSD KSEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPG-P-----
:. . .. .:: :: .. .: . : : .: . . ::: :
CCDS56 KG--------AGRNPGGVVNVGADI-KKTMEG--PVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPT
370 380 390 400 410
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pF1KSD SKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRR-LVEDVARLLQV
:.: :..:. .. . . : : : .. . .. . . . : .:. . ..
CCDS56 SSEVQQVPSPVSSEPPKAARPPVTPVLLEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIV--
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD PSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSK
.: .:.:::.::.. : ::.. :: . . :..:: .::.:::::::.. .
CCDS56 -----TDQNVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREE
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD LK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDP
:: :.. . . . ::::.:: . :.:.: .. :.:. .... ::.:..:: .
CCDS56 AAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQHARQQDKERLAALGPE-
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pF1KSD GA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSW
:: :.: ::.::::.:::. .: ::: . ::.:::::::::. :::..::. ::
CCDS56 GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQASPSSHSSTPSW
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pF1KSD SEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKN
:::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.::::::::::. .:: : :. ::
CCDS56 CEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKN
650 660 670 680 690 700
800 810 820 830 840 850
pF1KSD RSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMV
: : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: :::::::::: :.:::::::
CCDS56 RHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMV
710 720 730 740 750 760
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pF1KSD WESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKN
:::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.::::::::::::::::::::::::
CCDS56 WESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKN
770 780 790 800 810 820
920 930 940 950 960 970
pF1KSD LQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGT
.::.::::.:::::::: .:.:.:.: :::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS56 VQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGT
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pF1KSD YVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALP
:.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.:::::::::::::::::::::
CCDS56 YILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVAEEVNAILKALP
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pF1KSD Q
:
CCDS56 Q
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pF1KSD VLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAE
.: .:. ..: : ... . . .: :.
CCDS51 GDNRTYQGFWNPPLAPRKGYNIYFQAMSSVEKETKTQCVRI-ATKAAATEEPEVIPDPAK
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pF1KSD QEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQE
: : . . .. .: . .. .:: .: ...: .: .: . :. . : .
CCDS51 QTD--RVVKIAGISAGILVFILLLLVVILIVKKS---KLAKKRKDAMGNTRQEMTHMVNA
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD LCRQRMATRPPDRPEGPHTSRI---SSVSSQFSDGPIPSPSAR-----SSASSWSEEPVQ
. :. .: . . : : . . . : .. . . :.: .: : :
CCDS51 MDRS-YADQSTLHAEDPLSITFMDQHNFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQ
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750 760 770 780 790 800
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... : .. .. . ... ...:.:.. .... : ::....: :::
CCDS51 TGQLHPAIRVADLLQHINLMKTSDSYGFKEEYESF--FEGQSASWDVAKKDQNRAKNRYG
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810 820 830 840 850 860
pF1KSD AVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWES
...::::::.:. .. ::::::. : : : :::::::. :: :::.:.:.
CCDS51 NIIAYDHSRVILQPVEDDPSSDYINANYI-DGYQRPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQE
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pF1KSD GCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQT
. :::.: :.: : .::.::::. ...: ..:. : . : ..::.: :.
CCDS51 QSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWPDD-TEVYGDFKVTCVEMEPLAE-YVVRTFTLERRGY
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930 940 950 960 970 980
pF1KSD NETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVL
:: : : :::: .: :.::: . .::.: :.:. . ::.:::: ::::.: :..
CCDS51 NEIREVKQFHFTGWPDHGVPYHATGLLSFIRRVKLSNPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIV
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pF1KSD IDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
::..:. ::. .:: .. ::..: .::::.::. : :. : :.:
CCDS51 IDIMLD-MAEREGVVDIYNCVKALRSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIPVCE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
CCDS51 FKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRNHDKNRFMDMLPPD
1160 1170 1180 1190 1200 1210
>--
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Smith-Waterman score: 464; 35.4% identity (62.9% similar) in 280 aa overlap (760-1027:1166-1435)
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAY----QAEPNSS
: :...:. :...: . ::: :
CCDS51 HDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCS-
1140 1150 1160 1170 1180 1190
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pF1KSD FVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGP
.: .: ::: . .: :. .: . ...: :.::::. .:: . :.:.:: :
CCDS51 -IACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGES-SNYINAA-LMDSYRQPAAFIVTQYP
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pF1KSD LPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQ-CYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIW
:: :: :::..:.. ::. ::::. : . : : .:::.:: : .:. .: .
CCDS51 LPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLN---EVDLSQGCPQYWPEEGMLRYGPIQVECMSCSMD
1260 1270 1280 1290 1300
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pF1KSD CEDFLVRSFYLKNLQTNETR--TVTQFHFLSWYD-RGVPSSSRSLLDFRRKVNK----CY
: : . : : . :: . : ::..:.: . : ::.:.::.: . .:.: :
CCDS51 C-DVINRIFRICNLTRPQEGYLMVQQFQYLGWASHREVPGSKRSFLKLILQVEKWQEECE
1310 1320 1330 1340 1350 1360
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pF1KSD RGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQ
.:.. :.:: .:.:::: . : .:. .:.: . .:. ... ::...:.::.. ::
CCDS51 EGEG-RTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVV-EMVKRQNVVDVFHAVKTLRNSKPNMVEAPEQ
1370 1380 1390 1400 1410 1420
1020 1030
pF1KSD FEFALTAVAEEVNAILKALPQ
..: .. :
CCDS51 YRFCYDVALEYLESS
1430 1440
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pF1KSD ATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLA
.: :.: : . . .. .: . .. .::
CCDS75 YFQAMSSVEKETKTQCVRIATKAATEEPEVIPDPAKQTD--RVVKIAGISAGILVFILLL
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pF1KSD SGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRI--
.: ...: .: .: . :. . : . . :. .: . . : : . .
CCDS75 LVVILIVKKS---KLAKKRKDAMGNTRQEMTHMVNAMDRS-YADQSTLHAEDPLSITFMD
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pF1KSD -SSVSSQFSDGPIPSPSAR-----SSASSWSEEPVQSNM---DISTGHMILSYMEDHLKN
. : .. . . :.: .: : :... : .. .. . ..
CCDS75 QHNFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQTGQLHPAIRVADLLQHINLMKTSD
830 840 850 860 870 880
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pF1KSD KNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYI
. ...:.:.. .... : ::....: ::: ...::::::.:. .. ::::
CCDS75 SYGFKEEYESF--FEGQSASWDVAKKDQNRAKNRYGNIIAYDHSRVILQPVEDDPSSDYI
890 900 910 920 930 940
830 840 850 860 870 880
pF1KSD NASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWP
::. : : : :::::::. :: :::.:.:. . :::.: :.: : .::.:::
CCDS75 NANYI-DGYQRPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQEQSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWP
950 960 970 980 990 1000
890 900 910 920 930 940
pF1KSD DEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSR
:. ...: ..:. : . : ..::.: :. :: : : :::: .: :.::: .
CCDS75 DD-TEVYGDFKVTCVEMEPLAE-YVVRTFTLERRGYNEIREVKQFHFTGWPDHGVPYHAT
1010 1020 1030 1040 1050
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD SLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHL
.::.: :.:. . ::.:::: ::::.: :..::..:. ::. .:: .. :
CCDS75 GLLSFIRRVKLSNPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIVIDIMLD-MAEREGVVDIYNCVKAL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1010 1020 1030
pF1KSD RDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ
:..: .::::.::. : :. : :.:
CCDS75 RSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEF
1120 1130 1140 1150 1160 1170
CCDS75 QTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGESSNYINAALMDS
1180 1190 1200 1210 1220 1230
>--
initn: 322 init1: 147 opt: 464 Z-score: 360.6 bits: 78.8 E(32554): 9.1e-14
Smith-Waterman score: 464; 35.4% identity (62.9% similar) in 280 aa overlap (760-1027:1165-1434)
730 740 750 760 770 780
pF1KSD ARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAY----QAEPNSS
: :...:. :...: . ::: :
CCDS75 HDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCS-
1140 1150 1160 1170 1180 1190
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGP
.: .: ::: . .: :. .: . ...: :.::::. .:: . :.:.:: :
CCDS75 -IACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGES-SNYINAA-LMDSYRQPAAFIVTQYP
1200 1210 1220 1230 1240 1250
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQ-CYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIW
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