FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0387, 1038 aa 1>>>pF1KSDA0387 1038 - 1038 aa - 1038 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0672+/-0.000945; mu= 10.3238+/- 0.057 mean_var=169.7761+/-33.143, 0's: 0 Z-trim(111.6): 114 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.098432 statistics sampled from 12360 (12475) to 12360 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.383), width: 16 Scan time: 5.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5947.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 (1015) 6527 939.7 0 CCDS5948.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 998) 6404 922.2 0 CCDS78294.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 977) 6150 886.2 0 CCDS5949.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 ( 986) 3228 471.2 4.7e-132 CCDS56167.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 889) 2253 332.7 2.1e-90 CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 979) 2253 332.8 2.2e-90 CCDS56168.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 ( 950) 2131 315.4 3.6e-85 CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440) 664 107.2 2.6e-22 CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439) 662 106.9 3.1e-22 CCDS68127.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1460) 649 105.1 1.1e-21 CCDS47473.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1446) 646 104.7 1.5e-21 CCDS78179.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1462) 646 104.7 1.5e-21 CCDS42874.1 PTPRT gene_id:11122|Hs108|chr20 (1441) 645 104.5 1.7e-21 CCDS11840.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1452) 640 103.8 2.7e-21 CCDS58613.1 PTPRM gene_id:5797|Hs108|chr18 (1465) 640 103.8 2.8e-21 CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 636 103.3 5e-21 CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 636 103.3 5.1e-21 CCDS13039.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 793) 626 101.6 6.7e-21 CCDS13038.1 PTPRA gene_id:5786|Hs108|chr20 ( 802) 626 101.7 6.8e-21 CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 624 101.6 1.4e-20 CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 624 101.6 1.4e-20 CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 624 101.6 1.4e-20 CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 624 101.6 1.4e-20 CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 624 101.6 1.4e-20 CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 624 101.6 1.6e-20 CCDS12139.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1501) 615 100.3 3.3e-20 CCDS74265.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1505) 615 100.3 3.3e-20 CCDS12140.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1910) 615 100.3 4e-20 CCDS45930.1 PTPRS gene_id:5802|Hs108|chr19 (1948) 615 100.4 4.1e-20 CCDS7945.1 PTPRJ gene_id:5795|Hs108|chr11 (1337) 610 99.5 4.9e-20 CCDS44820.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 595) 600 97.9 6.9e-20 CCDS41744.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 597) 600 97.9 6.9e-20 CCDS44821.1 PTPN6 gene_id:5777|Hs108|chr12 ( 624) 600 97.9 7.2e-20 CCDS56505.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (1448) 605 98.8 8.6e-20 CCDS34740.1 PTPRZ1 gene_id:5803|Hs108|chr7 (2315) 605 99.0 1.2e-19 CCDS9163.1 PTPN11 gene_id:5781|Hs108|chr12 ( 593) 587 96.0 2.5e-19 CCDS7658.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 642) 583 95.5 3.9e-19 CCDS5592.1 PTPN12 gene_id:5782|Hs108|chr7 ( 780) 584 95.7 4.2e-19 CCDS7657.1 PTPRE gene_id:5791|Hs108|chr10 ( 700) 583 95.5 4.2e-19 CCDS2161.1 PTPN18 gene_id:26469|Hs108|chr2 ( 460) 569 93.4 1.2e-18 CCDS2129.1 PTPN4 gene_id:5775|Hs108|chr2 ( 926) 567 93.3 2.5e-18 CCDS11864.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 353) 559 91.9 2.6e-18 CCDS11863.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 387) 559 91.9 2.8e-18 CCDS11865.1 PTPN2 gene_id:5771|Hs108|chr18 ( 415) 559 91.9 2.9e-18 CCDS54321.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 ( 937) 565 93.0 3.1e-18 CCDS33110.1 PTPRH gene_id:5794|Hs108|chr19 (1115) 565 93.1 3.6e-18 CCDS13430.1 PTPN1 gene_id:5770|Hs108|chr20 ( 435) 553 91.1 5.5e-18 CCDS1398.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1145) 555 91.7 9.8e-18 CCDS1397.2 PTPRC gene_id:5788|Hs108|chr1 (1306) 555 91.7 1.1e-17 CCDS863.1 PTPN22 gene_id:26191|Hs108|chr1 ( 807) 545 90.2 2e-17 >>CCDS5947.1 PTPRN2 gene_id:5799|Hs108|chr7 (1015 aa) initn: 6527 init1: 6527 opt: 6527 Z-score: 5016.0 bits: 939.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6527; 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CCDS56 --P-RPRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVG 40 50 60 70 210 220 230 240 250 260 pF1KSD EGDDRFSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHL .: : :. . .: :: :.. ::: :: . : . . .. . .: CCDS56 KGGAGASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYL 80 90 100 110 120 270 280 290 300 310 320 pF1KSD MAALSAYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSST . ... ..: . :: :. : .::. . : .. :: :: . CCDS56 FHQFGSRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPA 130 140 150 160 170 180 330 340 350 360 370 380 pF1KSD GDGARIHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSP-G--RAALG . . :: :. :: :. .. . : :: . . :. :: : . .:: CCDS56 -QLFQDSGLLYLAQELPAPSRA----RVPRLPE------QG-SSSRAEDSPEGYEKEGLG 190 200 210 220 390 400 410 420 430 pF1KSD ESGEQADGPKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQ---EVHRLS----ATLGGLLQ--DHGSR . ::. .: . :: ..: : :...:. .:: ::: .:. CCDS56 DRGEKPASPAVQ------PDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKGAG 230 240 250 260 270 280 440 450 460 470 480 pF1KSD LLPGALPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEE---ETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPH---S ::.. :. .: : : . .. : .:. . . . . ... . : : : CCDS56 RNPGGV-VNVGADI-KKTMEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSS 290 300 310 320 330 340 490 500 510 520 530 540 pF1KSD EPGAAAFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRP :: :: . : :.. : : .. : : ..:. :: ::::::. :: CCDS56 EPPKAARPPVT-----PVLLEKKSPLGQSQPTVAG-QPSARPAAEE-YGYIVTDQKPLSL 350 360 370 380 390 550 560 570 580 590 600 pF1KSD EEGRRLVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEE : .:.: .:. ... :..: .. :.:::.::.. : ::.. :: . . :..:: CCDS56 AAGVKLLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEA 400 410 420 430 440 450 610 620 630 640 650 660 pF1KSD TSGLKILQTGVGSKSKLK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHS .::.:::::::.. . :: :.. . . . ::::.:: . :.:.: .. :.:. CCDS56 QTGLQILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQH 460 470 480 490 500 510 670 680 690 700 710 720 pF1KSD SQHRLKEKLSGLGGDPGA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFS .... ::.:..:: . :: :.: ::.::::.:::. .: ::: . ::.:::::::: CCDS56 ARQQDKERLAALGPE-GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFS 520 530 540 550 560 570 730 740 750 760 770 780 pF1KSD DGPIPSPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAE :. :::..::. :: :::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.:::::::: CCDS56 DAAQASPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAE 580 590 600 610 620 630 790 800 810 820 830 840 pF1KSD PNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIA ::. .:: : :. ::: : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: ::::: CCDS56 PNTCATAQGEGNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIA 640 650 660 670 680 690 850 860 870 880 890 900 pF1KSD TQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSE ::::: :.::::::::::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.:::::::: CCDS56 TQGPLSHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSE 700 710 720 730 740 750 910 920 930 940 950 960 pF1KSD HIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRS ::::::::::::::::.::.::::.:::::::: .:.:.:.: :::::::::::::::: CCDS56 HIWCEDFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRS 760 770 780 790 800 810 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KSD CPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFA :::::::::::::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.::::: CCDS56 CPIIVHCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFA 820 830 840 850 860 870 1030 pF1KSD LTAVAEEVNAILKALPQ ::::::::::::::::: CCDS56 LTAVAEEVNAILKALPQ 880 >>CCDS2440.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 (979 aa) initn: 2318 init1: 1806 opt: 2253 Z-score: 1736.0 bits: 332.8 E(32554): 2.2e-90 Smith-Waterman score: 2456; 45.6% identity (67.4% similar) in 1002 aa overlap (61-1038:39-979) 40 50 60 70 80 90 pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM :::... ::. :.:..::.::.:: .. CCDS24 GLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQ 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR .:. .::::. .:..: . :..:.:: ::::..::. .:. :: :: : : CCDS24 ARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPR--LRPPE---P-R 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR : .: . .: . : . : . .: ..:::.. : . : ..: CCDS24 PRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVGKGGAG 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS : :. . .: :: :.. ::: :: . : . . .. . .:. .. CCDS24 ASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYLFHQFG 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 pF1KSD AYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGAR . ..: . :: :. : .::. . : .. :: :: . . . CCDS24 SRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPSPA-QLFQ 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KSD IHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSP-G--RAALGESGEQ :: :. :: :. .. . : :: . . :. :: : . .::. ::. CCDS24 DSGLLYLAQELPAPSRA----RVPRLPE------QG-SSSRAEDSPEGYEKEGLGDRGEK 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 pF1KSD ADGPKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQ---EVHRLS----ATLGGLLQ--DHGSRLLPGA .: . :: ..: : :...:. .:: ::: .:. ::. CCDS24 PASPAVQ------PDAALQRLAAVLAGYGVELRQLTPEQLSTLLTLLQLLPKGAGRNPGG 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 490 pF1KSD LPFARPLDMERKKSEHPESSLSSEE---ETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPH---SEPGAA . :. .: : : . .. : .:. . . . . ... . : : ::: : CCDS24 V-VNVGADI-KKTMEGPVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPTSSEVQQVPSPVSSEPPKA 380 390 400 410 420 430 500 510 520 530 540 550 pF1KSD AFGELQNQMPGPSKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRR : . : :.. : : .. : : ..:. :: ::::::. :: : . CCDS24 ARPPVT-----PVLLEKKSPLGQSQPTVAG-QPSARPAAEE-YGYIVTDQKPLSLAAGVK 440 450 460 470 480 560 570 580 590 600 610 pF1KSD LVEDVARLLQVPSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLK :.: .:. ... :..: .. :.:::.::.. : ::.. :: . . :..:: .::. CCDS24 LLEILAEHVHMSSGSFINISVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQ 490 500 510 520 530 540 620 630 640 650 660 670 pF1KSD ILQTGVGSKSKLK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRL :::::::.. . :: :.. . . . ::::.:: . :.:.: .. :.:. .... CCDS24 ILQTGVGQREEAAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQHARQQD 550 560 570 580 590 600 680 690 700 710 720 pF1KSD KEKLSGLGGDPGA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFSDGPIP ::.:..:: . :: :.: ::.::::.:::. .: ::: . ::.:::::::::. CCDS24 KERLAALGPE-GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQA 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 780 pF1KSD SPSARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSF :::..::. :: :::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.::::::::::. CCDS24 SPSSHSSTPSWCEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCA 670 680 690 700 710 720 790 800 810 820 830 840 pF1KSD VAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPL .:: : :. ::: : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: :::::::::: CCDS24 TAQGEGNIKKNRHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPL 730 740 750 760 770 780 850 860 870 880 890 900 pF1KSD PATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCE :.::::::::::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.::::::::::::: CCDS24 SHTIADFWQMVWESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCE 790 800 810 820 830 840 910 920 930 940 950 960 pF1KSD DFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIV :::::::::::.::.::::.:::::::: .:.:.:.: ::::::::::::::::::::: CCDS24 DFLVRSFYLKNVQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIV 850 860 870 880 890 900 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KSD HCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVA ::::::::.:::.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.:::::::::: CCDS24 HCSDGAGRTGTYILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVA 910 920 930 940 950 960 1030 pF1KSD EEVNAILKALPQ :::::::::::: CCDS24 EEVNAILKALPQ 970 >>CCDS56168.1 PTPRN gene_id:5798|Hs108|chr2 (950 aa) initn: 2265 init1: 1806 opt: 2131 Z-score: 1642.6 bits: 315.4 E(32554): 3.6e-85 Smith-Waterman score: 2345; 44.6% identity (65.8% similar) in 991 aa overlap (61-1038:39-950) 40 50 60 70 80 90 pF1KSD VEVMFVSGPQTRERTEPVDPRWQCLVQMWAGCLLEEGLCGASEACVNDGVFGRCQKVPAM :::... ::. :.:..::.::.:: .. CCDS56 GLGGSGGLRLLLCLLLLSSRPGGCSAVSAHGCLFDRRLCSHLEVCIQDGLFGQCQVGVGQ 10 20 30 40 50 60 100 110 120 130 140 150 pF1KSD DFYRYEVSPVALQRLRVALQKLSGTGFTWQDDYTQYVMDQELADLPKTYLRRPEASSPAR .:. .::::. .:..: . :..:.:: ::::..::. .:. :: :: : : CCDS56 ARPLLQVTSPVLQRLQGVLRQLMSQGLSWHDDLTQYVISQEMERIPR--LRPPE---P-R 70 80 90 100 110 120 160 170 180 190 200 210 pF1KSD PSKHSVGSERRYSREGGAALANALRRHLPFLEALSQAPASDVLARTHTAQDRPPAEGDDR : .: . .: . : . : . .: ..:::.. : . : ..: CCDS56 PRDRSGLAPKRPGPAG-----ELLLQDIP----TGSAPAAQ-----HRLPQPPVGKGGAG 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 pF1KSD FSESILTYVAHTSALTYPPGPRTQLHEDLLPRTLGQLQPDELSPKVDSGVDRHHLMAALS : :. . .: :: :.. ::: :: . : . . .. . .:. .. CCDS56 ASSSL----SPLQAELLPP----LLEHLLLPP-----QPPHPSLSYEPALLQPYLFHQFG 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 pF1KSD AYAAQR-PPAPPGEGSLEPQYLLRAPSRMPRPLLAPAAPQKWPSPLGDSEDPSSTGDGAR . ..: . :: :. : .::. . : .. :: :: CCDS56 SRDGSRVSEGSPGMVSVGPLPKAEAPALFSRTASKGIFGDHPGHSYGDLPGPS------- 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 pF1KSD IHTLLKDLQRQPAEVRGLSGLELDGMAELMAGLMQGVDHGVARGSPGRAALGESGEQADG ::.. ::: : :: : : . .:: .:: . : . .: CCDS56 -----------PAQLFQDSGL-LYLAQELPAPSRARVPRLPEQGSSSRAEDSPEGYEKEG 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 440 pF1KSD PKATLRGDSFPDDGVQDDDDRLYQEVHRLSATLGGLLQDHGSRLLPGALPFARPLDMERK ::.. . .:: : ..::.:.:.: . .: : : : . CCDS56 --LGDRGEKPASPAVQPD-----AALQRLAAVLAGYGVEL-RQLTPEQLSTLLTLLQLLP 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 500 pF1KSD KSEHPESSLSSEEETAGVENVKSQTYSKDLLGQQPHSEPGAAAFGELQNQMPG-P----- :. . .. .:: :: .. .: . : : .: . . ::: : CCDS56 KG--------AGRNPGGVVNVGADI-KKTMEG--PVEGRDTAELPARTSPMPGHPTASPT 370 380 390 400 410 510 520 530 540 550 560 pF1KSD SKEEQSLPAGAQEALSDGLQLEVQPSEEEARGYIVTDRDPLRPEEGRR-LVEDVARLLQV :.: :..:. .. . . : : : .. . .. . . . : .:. . .. CCDS56 SSEVQQVPSPVSSEPPKAARPPVTPVLLEKKSPLGQSQPTVAGQPSARPAAEEYGYIV-- 420 430 440 450 460 470 570 580 590 600 610 620 pF1KSD PSSAFADVEVLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSK .: .:.:::.::.. : ::.. :: . . :..:: .::.:::::::.. . CCDS56 -----TDQNVVGPALTFRIRHNEQNLSLADVTQQAGLVKSELEAQTGLQILQTGVGQREE 480 490 500 510 520 530 630 640 650 660 670 680 pF1KSD LK-FLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDP :: :.. . . . ::::.:: . :.:.: .. :.:. .... ::.:..:: . CCDS56 AAAVLPQTAHSTSPMRSVLLTLVALAGVAGLLVALAVALCVRQHARQQDKERLAALGPE- 540 550 560 570 580 690 700 710 720 730 pF1KSD GA--DATAAYQELCRQRMATRPP-DRPEGP-HTSRISSVSSQFSDGPIPSPSARSSASSW :: :.: ::.::::.:::. .: ::: . ::.:::::::::. :::..::. :: CCDS56 GAHGDTTFEYQDLCRQHMATKSLFNRAEGPPEPSRVSSVSSQFSDAAQASPSSHSSTPSW 590 600 610 620 630 640 740 750 760 770 780 790 pF1KSD SEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKN :::.:.:::::::::::.::::::.:..:: :::.::::::::::. .:: : :. :: CCDS56 CEEPAQANMDISTGHMILAYMEDHLRNRDRLAKEWQALCAYQAEPNTCATAQGEGNIKKN 650 660 670 680 690 700 800 810 820 830 840 850 pF1KSD RSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMV : : :::.:. ::.:.: :.:::::::::..:::: :::::::::: :.::::::: CCDS56 RHPDFLPYDHARIKLKVESSPSRSDYINASPIIEHDPRMPAYIATQGPLSHTIADFWQMV 710 720 730 740 750 760 860 870 880 890 900 910 pF1KSD WESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKN :::::.::::::::.:.::.:: .::::::..:::.:::::::::::::::::::::::: CCDS56 WESGCTVIVMLTPLVEDGVKQCDRYWPDEGASLYHVYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKN 770 780 790 800 810 820 920 930 940 950 960 970 pF1KSD LQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGT .::.::::.:::::::: .:.:.:.: :::::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS56 VQTQETRTLTQFHFLSWPAEGTPASTRPLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRTGT 830 840 850 860 870 880 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KSD YVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALP :.:::::::.::::.:::::::::::.::::::.:..:.::::::::::::::::::::: CCDS56 YILIDMVLNRMAKGVKEIDIAATLEHVRDQRPGLVRSKDQFEFALTAVAEEVNAILKALP 890 900 910 920 930 940 pF1KSD Q : CCDS56 Q 950 >>CCDS5137.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1440 aa) initn: 662 init1: 250 opt: 664 Z-score: 514.1 bits: 107.2 E(32554): 2.6e-22 Smith-Waterman score: 664; 31.1% identity (59.1% similar) in 447 aa overlap (602-1037:718-1151) 580 590 600 610 620 630 pF1KSD VLGPAVTFKVSANVQNVTTEDVEKATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAE .: .:. ..: : ... . . .: :. CCDS51 GDNRTYQGFWNPPLAPRKGYNIYFQAMSSVEKETKTQCVRI-ATKAAATEEPEVIPDPAK 690 700 710 720 730 740 640 650 660 670 680 690 pF1KSD QEDSTKFIALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQE : : . . .. .: . .. .:: .: ...: .: .: . :. . : . CCDS51 QTD--RVVKIAGISAGILVFILLLLVVILIVKKS---KLAKKRKDAMGNTRQEMTHMVNA 750 760 770 780 790 800 700 710 720 730 740 pF1KSD LCRQRMATRPPDRPEGPHTSRI---SSVSSQFSDGPIPSPSAR-----SSASSWSEEPVQ . :. .: . . : : . . . : .. . . :.: .: : : CCDS51 MDRS-YADQSTLHAEDPLSITFMDQHNFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQ 810 820 830 840 850 860 750 760 770 780 790 800 pF1KSD SNM---DISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSL ... : .. .. . ... ...:.:.. .... : ::....: ::: CCDS51 TGQLHPAIRVADLLQHINLMKTSDSYGFKEEYESF--FEGQSASWDVAKKDQNRAKNRYG 870 880 890 900 910 810 820 830 840 850 860 pF1KSD AVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWES ...::::::.:. .. ::::::. : : : :::::::. :: :::.:.:. CCDS51 NIIAYDHSRVILQPVEDDPSSDYINANYI-DGYQRPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQE 920 930 940 950 960 970 870 880 890 900 910 920 pF1KSD GCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQT . :::.: :.: : .::.::::. ...: ..:. : . : ..::.: :. CCDS51 QSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWPDD-TEVYGDFKVTCVEMEPLAE-YVVRTFTLERRGY 980 990 1000 1010 1020 1030 930 940 950 960 970 980 pF1KSD NETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVL :: : : :::: .: :.::: . .::.: :.:. . ::.:::: ::::.: :.. CCDS51 NEIREVKQFHFTGWPDHGVPYHATGLLSFIRRVKLSNPPSAGPIVVHCSAGAGRTGCYIV 1040 1050 1060 1070 1080 1090 990 1000 1010 1020 1030 pF1KSD IDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFALTAVAEEVNAILKALPQ ::..:. ::. .:: .. ::..: .::::.::. : :. : :.: CCDS51 IDIMLD-MAEREGVVDIYNCVKALRSRRINMVQTEEQYIFIHDAILEACLCGETAIPVCE 1100 1110 1120 1130 1140 1150 CCDS51 FKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCSIACLPRNHDKNRFMDMLPPD 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >-- initn: 322 init1: 147 opt: 464 Z-score: 360.6 bits: 78.8 E(32554): 9.1e-14 Smith-Waterman score: 464; 35.4% identity (62.9% similar) in 280 aa overlap (760-1027:1166-1435) 730 740 750 760 770 780 pF1KSD ARSSASSWSEEPVQSNMDISTGHMILSYMEDHLKNKNRLEKEWEALCAY----QAEPNSS : :...:. :...: . ::: : CCDS51 HDAILEACLCGETAIPVCEFKAAYFDMIRIDSQTNSSHLKDEFQTLNSVTPRLQAEDCS- 1140 1150 1160 1170 1180 1190 790 800 810 820 830 840 pF1KSD FVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGP .: .: ::: . .: :. .: . ...: :.::::. .:: . :.:.:: : CCDS51 -IACLPRNHDKNRFMDMLPPDRCLPFLITIDGES-SNYINAA-LMDSYRQPAAFIVTQYP 1200 1210 1220 1230 1240 1250 850 860 870 880 890 900 pF1KSD LPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQ-CYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIW :: :: :::..:.. ::. ::::. : . : : .:::.:: : .:. .: . CCDS51 LPNTVKDFWRLVYDYGCTSIVMLN---EVDLSQGCPQYWPEEGMLRYGPIQVECMSCSMD 1260 1270 1280 1290 1300 910 920 930 940 950 pF1KSD CEDFLVRSFYLKNLQTNETR--TVTQFHFLSWYD-RGVPSSSRSLLDFRRKVNK----CY : : . : : . :: . : ::..:.: . : ::.:.::.: . .:.: : CCDS51 C-DVINRIFRICNLTRPQEGYLMVQQFQYLGWASHREVPGSKRSFLKLILQVEKWQEECE 1310 1320 1330 1340 1350 1360 960 970 980 990 1000 1010 pF1KSD RGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQ .:.. :.:: .:.:::: . : .:. .:.: . .:. ... ::...:.::.. :: CCDS51 EGEG-RTIIHCLNGGGRSGMFCAIGIVV-EMVKRQNVVDVFHAVKTLRNSKPNMVEAPEQ 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1020 1030 pF1KSD FEFALTAVAEEVNAILKALPQ ..: .. : CCDS51 YRFCYDVALEYLESS 1430 1440 >>CCDS75517.1 PTPRK gene_id:5796|Hs108|chr6 (1439 aa) initn: 662 init1: 250 opt: 662 Z-score: 512.6 bits: 106.9 E(32554): 3.1e-22 Smith-Waterman score: 662; 31.9% identity (59.1% similar) in 423 aa overlap (626-1037:740-1150) 600 610 620 630 640 650 pF1KSD ATVDNKDKLEETSGLKILQTGVGSKSKLKFLPPQAEQEDSTKFIALTLVSLACILGVLLA .: :.: : . . .. .: . .. .:: CCDS75 YFQAMSSVEKETKTQCVRIATKAATEEPEVIPDPAKQTD--RVVKIAGISAGILVFILLL 710 720 730 740 750 760 660 670 680 690 700 710 pF1KSD SGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQRMATRPPDRPEGPHTSRI-- .: ...: .: .: . :. . : . . :. .: . . : : . . CCDS75 LVVILIVKKS---KLAKKRKDAMGNTRQEMTHMVNAMDRS-YADQSTLHAEDPLSITFMD 770 780 790 800 810 820 720 730 740 750 760 pF1KSD -SSVSSQFSDGPIPSPSAR-----SSASSWSEEPVQSNM---DISTGHMILSYMEDHLKN . : .. . . :.: .: : :... : .. .. . .. CCDS75 QHNFSPRYENHSATAESSRLLDVPRYLCEGTESPYQTGQLHPAIRVADLLQHINLMKTSD 830 840 850 860 870 880 770 780 790 800 810 820 pF1KSD KNRLEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYI . ...:.:.. .... : ::....: ::: ...::::::.:. .. :::: CCDS75 SYGFKEEYESF--FEGQSASWDVAKKDQNRAKNRYGNIIAYDHSRVILQPVEDDPSSDYI 890 900 910 920 930 940 830 840 850 860 870 880 pF1KSD NASPIMDHDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWP ::. : : : :::::::. :: :::.:.:. . :::.: :.: : .::.::: CCDS75 NANYI-DGYQRPSHYIATQGPVHETVYDFWRMIWQEQSACIVMVTNLVEVGRVKCYKYWP 950 960 970 980 990 1000 890 900 910 920 930 940 pF1KSD DEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQTNETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSR :. ...: ..:. : . : ..::.: :. :: : : :::: .: :.::: . 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CCDS68 SKANGETKINCVRLATKAPMGSAQVTPGTPLCLLTTGASTQNS-NTVEPEKQVDNTVKMA 710 720 730 740 750 760 640 650 660 670 680 690 pF1KSD --IALTLVSLACILGVLLASGLIYCLRHSSQHRLKEKLSGLGGDPGADATAAYQELCRQR :: :. . .:::.:. : :.. .. ::. ..: .:. CCDS68 GVIAGLLMFIIILLGVMLT---IKRRRNAYSYSYYLKLA---KKQKETQSGAQREMGPVA 770 780 790 800 810 820 700 710 720 730 740 pF1KSD MATRPPDRPEGPHTSRISSVSSQ----FSDGP---IPSPSARSSASSW-SEEPVQSNM-- : .: . . .... : ::: :.:: . .:. .. . . .::. .. CCDS68 SADKPTTKLSASRNDEGFSSSSQDVNGFTDGSRGELSQPTLTIQTHPYRTCDPVEMSYPR 830 840 850 860 870 880 750 760 770 780 790 800 pF1KSD DISTGHMILSYMEDHLKNKNR-----LEKEWEALCAYQAEPNSSFVAQREENVPKNRSLA : . .. . .:. . .: ...:.::: ... : .:...:: ::: CCDS68 DQFQPAIRVADLLQHITQMKRGQGYGFKEEYEAL--PEGQTASWDTAKEDENRNKNRYGN 890 900 910 920 930 810 820 830 840 850 860 pF1KSD VLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMD-HDPRNPAYIATQGPLPATVADFWQMVWES ...:::::: : . .. :::::::. : : ::. :::::::. :: :::.:.:. CCDS68 IISYDHSRVRLLVLDGDPHSDYINANYIDGYHRPRH--YIATQGPMQETVKDFWRMIWQE 940 950 960 970 980 990 870 880 890 900 910 920 pF1KSD GCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCEDFLVRSFYLKNLQT . . :::.: :.: : .: .::::. ...: .:.:. . : ...:.: ... CCDS68 NSASIVMVTNLVEVGRVKCVRYWPDD-TEVYGDIKVTLIETEPLAE-YVIRTFTVQKKGY 1000 1010 1020 1030 1040 1050 930 940 950 960 970 980 pF1KSD NETRTVTQFHFLSWYDRGVPSSSRSLLDFRRKVNKCYRGRSCPIIVHCSDGAGRSGTYVL .: : . ::: :: :.::: . .:: : :.:. .. ::.:::: ::::.: .. 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CCDS68 HDAILEACLCGNTAIPVCEFRSLYYNISRLDPQTNSSQIKDEFQTLNIVTPRVRPEDCSI 1160 1170 1180 1190 1200 1210 790 800 810 820 830 840 pF1KSD AQREENVPKNRSLAVLTYDHSRVLLKAENSHSHSDYINASPIMDHDPRNPAYIATQGPLP . .: ::::. :: :. .: . ...: :.::::. .:: . :...:: ::: CCDS68 GLLPRNHDKNRSMDVLPLDRCLPFLISVDGES-SNYINAA-LMDSHKQPAAFVVTQHPLP 1220 1230 1240 1250 1260 1270 850 860 870 880 890 900 pF1KSD ATVADFWQMVWESGCVVIVMLTPLAENGVRQCYHYWPDEGSNLYHIYEVNLVSEHIWCED ::::::..:.. .: .:::. . . .. :..:::.. :. : .:..:: : :: CCDS68 NTVADFWRLVFDYNCSSVVMLNEM--DTAQFCMQYWPEKTSGCYGPIQVEFVSADI-DED 1280 1290 1300 1310 1320 1330 910 920 930 940 950 960 pF1KSD FLVRSFYLKNLQTNET--RTVTQFHFLSWYD-RGVPSSSRSLLDFRRKVNK---CYRGRS .. : : . :. . : : ......: : .: :.:::: :...: : :: CCDS68 IIHRIFRICNMARPQDGYRIVQHLQYIGWPAYRDTPPSKRSLLKVVRRLEKWQEQYDGRE 1340 1350 1360 1370 1380 1390 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KSD CPIIVHCSDGAGRSGTYVLIDMVLNKMAKGAKEIDIAATLEHLRDQRPGMVQTKEQFEFA .::: .:.:::::. : : .: . . ::. .. ::... .::.: ::..:. CCDS68 GRTVVHCLNGGGRSGTFCAICSVC-EMIQQQNIIDVFHIVKTLRNNKSNMVETLEQYKFV 1400 1410 1420 1430 1440 1030 pF1KSD LTAVAEEVNAILKALPQ .. : ... CCDS68 YEVALEYLSSF 1450 1460 1038 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 01:34:20 2016 done: Thu Nov 3 01:34:21 2016 Total Scan time: 5.520 Total Display time: 0.460 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]