Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0420
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0420, 696 aa
1>>>pF1KSDA0420 696 - 696 aa - 696 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8405+/-0.000843; mu= 17.2420+/- 0.051
mean_var=71.3940+/-14.302, 0's: 0 Z-trim(107.3): 27 B-trim: 27 in 1/49
Lambda= 0.151790
statistics sampled from 9459 (9484) to 9459 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 3.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS45403.1 SEC14L5 gene_id:9717|Hs108|chr16 ( 696) 4753 1050.2 0
CCDS45789.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 681) 2392 533.2 4.9e-151
CCDS11752.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 715) 2392 533.2 5.1e-151
CCDS42385.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 ( 719) 2392 533.2 5.1e-151
CCDS46685.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 392) 685 159.3 1e-38
CCDS13876.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 403) 684 159.0 1.2e-38
CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 360) 670 156.0 9.2e-38
CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 406) 670 156.0 1e-37
CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 400) 642 149.8 7e-36
CCDS54518.1 SEC14L6 gene_id:730005|Hs108|chr22 ( 397) 625 146.1 9.2e-35
CCDS58801.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 341) 534 126.2 8.1e-29
CCDS58800.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 323) 475 113.2 6e-25
CCDS56228.1 SEC14L2 gene_id:23541|Hs108|chr22 ( 320) 416 100.3 4.6e-21
>>CCDS45403.1 SEC14L5 gene_id:9717|Hs108|chr16 (696 aa)
initn: 4753 init1: 4753 opt: 4753 Z-score: 5619.2 bits: 1050.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4753; 100.0% identity (100.0% similar) in 696 aa overlap (1-696:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVQRYQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MVQRYQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRVDAPRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LRVDAPRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EDWTCFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EDWTCFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD WTPAPVREEDARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTLGPALEAVSMDGDKLDADYIERCLGHLTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 WTPAPVREEDARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTLGPALEAVSMDGDKLDADYIERCLGHLTP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD MQESCLIQLRHWLQETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQSLSWRKQHQVDLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MQESCLIQLRHWLQETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQSLSWRKQHQVDLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGEEALLRHVLSVNEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGEEALLRHVLSVNEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEVVEDNYPETLGRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEVVEDNYPETLGRLL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDREVIPDFLGGESVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDREVIPDFLGGESVC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSETYHSASVLRGAPHEVAVEILEGESVITWDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSETYHSASVLRGAPHEVAVEILEGESVITWDF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD DILRGDVVFSLYHTKQAPRLGAREPGTRASGQLIDKGWVLGRDYSRVEAPLVCREGESIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DILRGDVVFSLYHTKQAPRLGAREPGTRASGQLIDKGWVLGRDYSRVEAPLVCREGESIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTALHSPGPKCKLLYYCEVLASEDFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTALHSPGPKCKLLYYCEVLASEDFR
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KSD GSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
670 680 690
>>CCDS45789.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 (681 aa)
initn: 3082 init1: 1803 opt: 2392 Z-score: 2825.1 bits: 533.2 E(32554): 4.9e-151
Smith-Waterman score: 3117; 66.0% identity (85.7% similar) in 685 aa overlap (35-696:1-681)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD YQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCRLRVD
.:.::... : .: :::.::.:: :.: ::
CCDS45 MFVGSDTVNEFKSEDGAIHVIERRCKLDVD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD APRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPENEDWT
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CCDS45 APRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAYNETFSNRVIINEHCCYTVHPENEDWT
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD CFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPRWTPA
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CCDS45 CFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLRQLEEEGITFVPRWSPP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KSD PVREE-DARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTL-----GPALEA-------VSMDGDKLDADYI
. .. .... .. .:. . :...: : :: . :. ::::::::
CCDS45 SITTSSETSSSSSKKQAASMAVVIPEAALKEGLSGDALSSPSAPEPVVGTPDDKLDADYI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQSLSW
.: :: :::.::::::.::.::::::::::::::::::::::.::..:::::.. :::.:
CCDS45 KRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQSLTW
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGEEALL
::::::: .:.:: :: .:...::::::..: ::::::.:::::::::::..:.::::::
CCDS45 RKQHQVDYILETWTPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGEEALL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD RHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEVVEDN
:.:::.:::: .::: .:. .::::::::::.::::::::::::::::::::.::::: :
CCDS45 RYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEVVEAN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD YPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDREVIP
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CCDS45 YPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDKEIIP
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DFLGGESVCNVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSET-YHSASVLRGAPHEVAVEIL
:::.:: .:.:::::::::::: : :: :. : : :.:: :.::::..:::::. ..:.
CCDS45 DFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENED-LKLWTETIYQSASVFKGAPHEILIQIV
460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KSD EGESVITWDFDILRGDVVFSLYHTKQAPR------LGARE---PGTRASGQLIDKGWVLG
.. ::::::::. .::.::..::.:..:. :::. :: . ::::: : ::
CCDS45 DASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGAHSITSPGGN-NVQLIDKVWQLG
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KSD RDYSRVEAPLVCREGESIQGSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTALHSP
:::: ::.::.:.::::.:::::::::: :.:::..:: :. .: ::: :::::..:.
CCDS45 RDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWKFHSMPACAASSLPRVDDVLASLQVS
570 580 590 600 610 620
650 660 670 680 690
pF1KSD GPKCKLLYYCEVLASEDFRGSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
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CCDS45 SHKCKVMYYTEVIGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSS--QSHSSSMISR
630 640 650 660 670 680
>>CCDS11752.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 (715 aa)
initn: 3306 init1: 1803 opt: 2392 Z-score: 2824.7 bits: 533.2 E(32554): 5.1e-151
Smith-Waterman score: 3341; 67.0% identity (86.1% similar) in 719 aa overlap (1-696:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVQRYQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCR
:::.::::::::::::::.:::::.:::::: ::.:.::... : .: :::.::.:: :.
CCDS11 MVQKYQSPVRVYKYPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVGSDTVNEFKSEDGAIHVIERRCK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRVDAPRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPEN
: :::::::.:::::..: ::: : :: .:::: :::.::::.:::..:::: :::::::
CCDS11 LDVDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAYNETFSNRVIINEHCCYTVHPEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EDWTCFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPR
::::::::::::::.::::::...:::::::::.:.:.:::.::.:: .: .: . .::
CCDS11 EDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLRQLEEEGITFVPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KSD WTPAPVREE-DARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTL-----GPALEA-------VSMDGDKLD
:.: . .. .... .. .:. . :...: : :: . :. ::::
CCDS11 WSPPSITTSSETSSSSSKKQAASMAVVIPEAALKEGLSGDALSSPSAPEPVVGTPDDKLD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ADYIERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQ
::::.: :: :::.::::::.::.::::::::::::::::::::::.::..:::::.. :
CCDS11 ADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGE
::.:::::::: .:.:: :: .:...::::::..: ::::::.:::::::::::..:.::
CCDS11 SLTWRKQHQVDYILETWTPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EALLRHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEV
:::::.:::.:::: .::: .:. .::::::::::.::::::::::::::::::::.:::
CCDS11 EALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD VEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDR
:: :::::::::::.::::::::::::.::::..:::::::::.:..:::::::.::.:.
CCDS11 VEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDK
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EVIPDFLGGESVCNVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSET-YHSASVLRGAPHEVA
:.:::::.:: .:.:::::::::::: : :: :. : : :.:: :.::::..:::::.
CCDS11 EIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENED-LKLWTETIYQSASVFKGAPHEIL
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD VEILEGESVITWDFDILRGDVVFSLYHTKQAPR------LGARE---PGTRASGQLIDKG
..:... ::::::::. .::.::..::.:..:. :::. :: :::::
CCDS11 IQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGAHSITSPGGNNV-QLIDKV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD WVLGRDYSRVEAPLVCREGESIQGSHVTRWPGVYLLQWQMHSPPSSVACSLPGVDDVLTA
: :::::: ::.::.:.::::.:::::::::: :.:::..:: :. .: ::: :::::..
CCDS11 WQLGRDYSMVESPLICKEGESVQGSHVTRWPGFYILQWKFHSMPACAASSLPRVDDVLAS
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KSD LHSPGPKCKLLYYCEVLASEDFRGSMSSLESCTSGFSQLSAATSSSSSGQSHSSSLVSR
:. . :::..:: ::..::::::::.:::: ::::::::::.::: ::::::..::
CCDS11 LQVSSHKCKVMYYTEVIGSEDFRGSMTSLESSHSGFSQLSAATTSSS--QSHSSSMISR
660 670 680 690 700 710
>>CCDS42385.1 SEC14L1 gene_id:6397|Hs108|chr17 (719 aa)
initn: 3306 init1: 1803 opt: 2392 Z-score: 2824.7 bits: 533.2 E(32554): 5.1e-151
Smith-Waterman score: 3341; 67.0% identity (86.1% similar) in 719 aa overlap (1-696:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVQRYQSPVRVYKYPFELVMAAYEKRFPTCPQIPVFLGSEVLRESRSPDGAVHVVERSCR
:::.::::::::::::::.:::::.:::::: ::.:.::... : .: :::.::.:: :.
CCDS42 MVQKYQSPVRVYKYPFELIMAAYERRFPTCPLIPMFVGSDTVNEFKSEDGAIHVIERRCK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LRVDAPRLLRKIAGVEHVVFVQTNILNWKERTLLIEAHNETFANRVVVNEHCSYTVHPEN
: :::::::.:::::..: ::: : :: .:::: :::.::::.:::..:::: :::::::
CCDS42 LDVDAPRLLKKIAGVDYVYFVQKNSLNSRERTLHIEAYNETFSNRVIINEHCCYTVHPEN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD EDWTCFEQSASLDIRSFFGFENALEKIAMKQYTANVKRGKEVIEHYLNELISQGTSHIPR
::::::::::::::.::::::...:::::::::.:.:.:::.::.:: .: .: . .::
CCDS42 EDWTCFEQSASLDIKSFFGFESTVEKIAMKQYTSNIKKGKEIIEYYLRQLEEEGITFVPR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KSD WTPAPVREE-DARNQAGPRDPSSLEAHGPRSTL-----GPALEA-------VSMDGDKLD
:.: . .. .... .. .:. . :...: : :: . :. ::::
CCDS42 WSPPSITTSSETSSSSSKKQAASMAVVIPEAALKEGLSGDALSSPSAPEPVVGTPDDKLD
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ADYIERCLGHLTPMQESCLIQLRHWLQETHKGKIPKDEHILRFLRAHDFHLDKAREMLRQ
::::.: :: :::.::::::.::.::::::::::::::::::::::.::..:::::.. :
CCDS42 ADYIKRYLGDLTPLQESCLIRLRQWLQETHKGKIPKDEHILRFLRARDFNIDKAREIMCQ
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD SLSWRKQHQVDLLLQTWQPPALLEEFYAGGWHYQDIDGRPLYILRLGQMDTKGLMKAVGE
::.:::::::: .:.:: :: .:...::::::..: ::::::.:::::::::::..:.::
CCDS42 SLTWRKQHQVDYILETWTPPQVLQDYYAGGWHHHDKDGRPLYVLRLGQMDTKGLVRALGE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EALLRHVLSVNEEGQKRCEGSTRQLGRPISSWTCLLDLEGLNMRHLWRPGVKALLRMIEV
:::::.:::.:::: .::: .:. .::::::::::.::::::::::::::::::::.:::
CCDS42 EALLRYVLSINEEGLRRCEENTKVFGRPISSWTCLVDLEGLNMRHLWRPGVKALLRIIEV
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD VEDNYPETLGRLLIVRAPRVFPVLWTLISPFINENTRRKFLIYSGSNYQGPGGLVDYLDR
:: :::::::::::.::::::::::::.::::..:::::::::.:..:::::::.::.:.
CCDS42 VEANYPETLGRLLILRAPRVFPVLWTLVSPFIDDNTRRKFLIYAGNDYQGPGGLLDYIDK
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD EVIPDFLGGESVCNVPEGGLVPKSLYMTEEEQEHTDQLWQWSET-YHSASVLRGAPHEVA
:.:::::.:: .:.:::::::::::: : :: :. : : :.:: :.::::..:::::.
CCDS42 EIIPDFLSGECMCEVPEGGLVPKSLYRTAEELENED-LKLWTETIYQSASVFKGAPHEIL
490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD VEILEGESVITWDFDILRGDVVFSLYHTKQAPR------LGARE---PGTRASGQLIDKG
..:... ::::::::. .::.::..::.:..:. :::. :: :::::
CCDS42 IQIVDASSVITWDFDVCKGDIVFNIYHSKRSPQPPKKDSLGAHSITSPGGNNV-QLIDKV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
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:: :.. .: .:.:::. ..... ::: . : ..: .: .::: . . : .
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CCDS13 YEGCPVYFNIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMV
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CCDS13 DYFLLRWLRARNFDLQKSEALLRKYMEFRKTMDIDHILD-WQPPEVIQKYMPGGLCGYDR
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CCDS54 TKMGERQRAREMTEVLPSQRYNAHMVPEDGILTCLQAGSYVLRFYNTYSLVHSKRISYTV
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CCDS54 EVLLPDQTFMEKMEKF
390
696 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:39:55 2016 done: Thu Nov 3 01:39:55 2016
Total Scan time: 3.600 Total Display time: 0.130
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]