Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0441
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0441, 697 aa
1>>>pF1KSDA0441 697 - 697 aa - 697 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6151+/-0.00112; mu= 5.9815+/- 0.067
mean_var=250.3552+/-53.989, 0's: 0 Z-trim(112.0): 935 B-trim: 574 in 1/52
Lambda= 0.081058
statistics sampled from 11770 (12827) to 11770 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.715), E-opt: 0.2 (0.394), width: 16
Scan time: 3.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34509.1 ZBTB24 gene_id:9841|Hs108|chr6 ( 697) 4679 560.9 2.2e-159
CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 ( 699) 900 119.0 2.4e-26
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 873 115.9 2.2e-25
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 873 115.9 2.3e-25
CCDS58688.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 503) 863 114.6 3.8e-25
CCDS58687.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 555) 863 114.6 4e-25
CCDS12957.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 564) 863 114.6 4.1e-25
CCDS12956.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 577) 863 114.6 4.1e-25
CCDS74468.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 616) 863 114.6 4.3e-25
CCDS58686.1 ZNF211 gene_id:10520|Hs108|chr19 ( 629) 863 114.6 4.4e-25
CCDS35074.1 ZNF510 gene_id:22869|Hs108|chr9 ( 683) 862 114.6 5e-25
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 849 113.0 1.4e-24
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 849 113.0 1.5e-24
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 846 112.6 1.6e-24
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 843 112.2 1.8e-24
CCDS35067.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 816) 847 112.9 1.9e-24
CCDS35066.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 852) 847 112.9 2e-24
CCDS59136.1 ZNF484 gene_id:83744|Hs108|chr9 ( 854) 847 112.9 2e-24
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 848 113.1 2.1e-24
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 844 112.5 2.3e-24
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 842 112.2 2.4e-24
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 842 112.2 2.5e-24
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 842 112.2 2.5e-24
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 842 112.2 2.6e-24
CCDS12946.1 ZFP28 gene_id:140612|Hs108|chr19 ( 868) 841 112.2 3.3e-24
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 837 111.6 3.4e-24
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 837 111.6 3.5e-24
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 833 111.1 4.4e-24
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 832 110.9 4.4e-24
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 832 110.9 4.5e-24
CCDS82393.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 325) 828 110.3 4.7e-24
CCDS7205.2 ZNF485 gene_id:220992|Hs108|chr10 ( 441) 830 110.6 5e-24
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 832 111.0 5.1e-24
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 832 111.0 5.5e-24
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 831 110.9 5.5e-24
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 835 111.6 5.7e-24
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 831 110.9 5.8e-24
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 829 110.6 5.8e-24
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 833 111.2 5.8e-24
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 831 110.9 6e-24
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 833 111.3 6e-24
CCDS10901.1 ZNF19 gene_id:7567|Hs108|chr16 ( 458) 828 110.4 6e-24
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 829 110.6 6.4e-24
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 827 110.3 6.5e-24
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 829 110.6 6.6e-24
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 828 110.5 6.7e-24
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 827 110.3 6.8e-24
CCDS54313.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 828 110.5 6.9e-24
CCDS12860.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 828 110.5 6.9e-24
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 828 110.5 7.2e-24
>>CCDS34509.1 ZBTB24 gene_id:9841|Hs108|chr6 (697 aa)
initn: 4679 init1: 4679 opt: 4679 Z-score: 2975.0 bits: 560.9 E(32554): 2.2e-159
Smith-Waterman score: 4679; 99.9% identity (99.9% similar) in 697 aa overlap (1-697:1-697)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAETSPEPSGQLVVHSDAHSDTVLASFEDQRKKGFLCDITLIVENVHFRAHKALLAASSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAETSPEPSGQLVVHSDAHSDTVLASFEDQRKKGFLCDITLIVENVHFRAHKALLAASSE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD YFSMMFAEEGEIGQSIYMLEGMVADTFGILLEFIYTGYLHASEKSTEQILATAQFLKVYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YFSMMFAEEGEIGQSIYMLEGMVADTFGILLEFIYTGYLHASEKSTEQILATAQFLKVYD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LVKAYTDFQNNHSSPKPTTLNTAGAPVVVIPNKKNDPPKRKRGRPKKVNTLQEEKSELAA
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVKAYTDFQNNHSSPKPTTLNTAGAPVVVISNKKNDPPKRKRGRPKKVNTLQEEKSELAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EEEIQLRVNNSVQNRQNFVVKGDSGVLNEQIAAKEKEESEPTCEPSREEEMPVEKDENYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EEEIQLRVNNSVQNRQNFVVKGDSGVLNEQIAAKEKEESEPTCEPSREEEMPVEKDENYD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PKTEDGQASQSRYSKRRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PKTEDGQASQSRYSKRRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD CILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD QLQNLILSAQQEQTEHIQSLNMIESQMGPSQTEPVHVITLSKETLEHLHAHQEQTEELHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QLQNLILSAQQEQTEHIQSLNMIESQMGPSQTEPVHVITLSKETLEHLHAHQEQTEELHL
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KSD ATSTSDPAQHLQLTQEPGPPPPTHHVPQPTPLGQEQS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATSTSDPAQHLQLTQEPGPPPPTHHVPQPTPLGQEQS
670 680 690
>>CCDS35075.1 ZNF782 gene_id:158431|Hs108|chr9 (699 aa)
initn: 1528 init1: 878 opt: 900 Z-score: 586.6 bits: 119.0 E(32554): 2.4e-26
Smith-Waterman score: 900; 42.7% identity (67.5% similar) in 314 aa overlap (210-516:360-672)
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEEEIQLRVNNSVQNRQNFVVKGDSGVLNEQIAAKEKEESE--PTCEPSREEEMPVEKDE
.: :: : .: .: . . : ..
CCDS35 RTHATDKYSDYHPCTETFSYQSTFSVHQKVHIRAKPYEYNECGKSCSMNSHLIWPQKSHT
330 340 350 360 370 380
240 250 260 270 280 290
pF1KSD NYDPKT--EDGQASQSRYSKRRIWRS-VKLKDYKLVG-DQE-DHGSAKRICGRRKRPGGP
. : : :.: . . :. :. . : :: : :. . :. :: .: . :
CCDS35 GEKPYECPECGKAFSEKSRLRKHQRTHTGEKPYKCDGCDKAFSAKSGLRI-HQRTHTGEK
390 400 410 420 430 440
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTC
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CCDS35 PFECHECGKSFNYKSILIVHQRTHTGEKPFECNECGKSFSHMSGLRNHRRTHTGERPYKC
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD TVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCH
:.::. : .: .: :.:.: . :.:::: :.:. ::..:.:.:::.. .:. :
CCDS35 DECGKAFKLKSGLRKHHRTHTGEKPYKCNQCGKAFGQKSQLRGHHRIHTGEKPYKCNHCG
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD RKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFS
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CCDS35 EAFSQKSNLRVHHRTHTGEKPYQCEECGKTFRQKSNLRGHQRTHTGEKPYECNECGKAFS
570 580 590 600 610 620
480 490 500 510 520 530
pF1KSD DSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEE
..:. :.: :::.::..: .:. :.. .::..: . :. ::
CCDS35 EKSVLRKHQRTHTGEKPYNCNQCGEAFSQKSNLRVHQRTHTGEKPYKCDKCGRTFSQKSS
630 640 650 660 670 680
540 550 560 570 580 590
pF1KSD VRNILQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANL
CCDS35 LREHQKAHPGD
690
>>CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 (748 aa)
initn: 868 init1: 868 opt: 873 Z-score: 569.2 bits: 115.9 E(32554): 2.2e-25
Smith-Waterman score: 873; 47.4% identity (73.9% similar) in 234 aa overlap (283-516:318-551)
260 270 280 290 300 310
pF1KSD YSKRRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIH
: .: . .:..::: : .. : .:
CCDS74 LIIHYRTHTGEKPYKCEECGKCFSQSSNFQCHQRVHTEEKPYKCEECGKGFGWSVNLRVH
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KSD QRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLH
:: : ::.:.::.::::::.: ...: :.::::.:: : ::.:... . :. : .:
CCDS74 QRVHRGEKPYKCEECGKGFTQAAHFHIHQRVHTGEKPYKCDVCGKGFSHNSPLICHRRVH
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SGQKSFTCDQCGKYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEK
.:.: . :. ::: :..: .:. :.:::::.. .::.: . : ..:.:. : .:::::
CCDS74 TGEKPYKCEACGKGFTRNTDLHIHFRVHTGEKPYKCKECGKGFSQASNLQVHQNVHTGEK
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KSD PFTCEICGKSFTAKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSC
: :: :::.:. .:.:::: :.: ::::: : .:::.:: :: . : ..:::.::..:
CCDS74 RFKCETCGKGFSQSSKLQTHQRVHTGEKPYRCDVCGKDFSYSSNLKLHQVIHTGEKPYKC
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KSD PECNLQFARLDNLKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEI
::. :. .::.:: ..:: ::
CCDS74 EECGKGFSWRSNLHAHQRVHSGEKPYKCEQCDKSFSQAIDFRVHQRVHTGEKPYKCGVCG
530 540 550 560 570 580
>--
initn: 1014 init1: 650 opt: 679 Z-score: 446.6 bits: 93.2 E(32554): 1.5e-18
Smith-Waterman score: 679; 45.9% identity (71.6% similar) in 194 aa overlap (295-488:554-747)
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIHQRSHTGERPFKC
.:..: : :. . .::: ::::.:.::
CCDS74 PYKCEECGKGFSWRSNLHAHQRVHSGEKPYKCEQCDKSFSQAIDFRVHQRVHTGEKPYKC
530 540 550 560 570 580
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLHSGQKSFTCDQCG
. :::::.:. .:: : :.::::.:: : ::.:.. . ... :. :.:.: . :..::
CCDS74 GVCGKGFSQSSGLQSHQRVHTGEKPYKCDVCGKGFRYSSQFIYHQRGHTGEKPYKCEECG
590 600 610 620 630 640
390 400 410 420 430 440
pF1KSD KYFSQNRQLKSHYRVHTGHSLPECKDCHRKFMDVSQLKKHLRTHTGEKPFTCEICGKSFT
: :... .:. : :::::.. :..: . : :.:. :: .:: :: : :: :::.:.
CCDS74 KGFGRSLNLRHHQRVHTGEKPHICEECGKAFSLPSNLRVHLGVHTREKLFKCEECGKGFS
650 660 670 680 690 700
450 460 470 480 490 500
pF1KSD AKSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDN
.. :..: :.: :::::.: :: :.: : : .:::::
CCDS74 QSARLEAHQRVHTGEKPYKCDICDKDFRHRSRLTYHQKVHTGKKL
710 720 730 740
510 520 530 540 550 560
pF1KSD LKAHLKIHSKEKHASDASSISGSSNTEEVRNILQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVHNIN
>>CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 (799 aa)
initn: 868 init1: 868 opt: 873 Z-score: 568.8 bits: 115.9 E(32554): 2.3e-25
Smith-Waterman score: 873; 47.4% identity (73.9% similar) in 234 aa overlap (283-516:369-602)
260 270 280 290 300 310
pF1KSD YSKRRIWRSVKLKDYKLVGDQEDHGSAKRICGRRKRPGGPEARCKDCGKVFKYNHFLAIH
: .: . .:..::: : .. : .:
CCDS12 LIIHYRTHTGEKPYKCEECGKCFSQSSNFQCHQRVHTEEKPYKCEECGKGFGWSVNLRVH
340 350 360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KSD QRSHTGERPFKCNECGKGFAQKHSLQVHTRMHTGERPYTCTVCSKALTTKHSLLEHMSLH
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CCDS58 RVHIGEKP
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CCDS58 RVHIGEKP
550
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CCDS12 RVHIGEKP
560
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CCDS12 RVHIGEKP
570
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CCDS58 FECSKCGKACTRRCNLIQHQKVHSEERPYECNECGKFFTYYSSFIIHQRVHTGERPYACP
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CCDS58 ECGKSFSQIYSLNSHRKVHTGERPYECGECGKSFSQRSNLMQHRRVHTGERPYECSECGK
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CCDS58 SFSQNFSLIYHQRVHTGERPHECNECGKSFSRSSSLIHHRRLHTGERPYECSKCGKSFKQ
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450 460 470 480 490 500
pF1KSD KSSLQTHIRIHRGEKPYSCGICGKSFSDSSAKRRHCILHTGKKPFSCPECNLQFARLDNL
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CCDS58 SSSFSSHRKVHTGERPYVCGECGKSFSHSSNLKNHQRVHTGERPVECSECSKSFSCKSNL
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pF1KSD KAHLKIHSKEK--HASD-ASSISGSSNTEEVRNI-LQLQPYQLSTSGEQEIQLLVTDSVH
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CCDS58 IKHLRVHTGERPYECSECGKSFSQSSSLIQHRRVHTGKRPYQCSQCGKSFGCKSVLIQHQ
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pF1KSD NINFMPGPSQGISIVTAESSQNMTADQAANLTLLTQQPEQLQNLILSAQQEQTEHIQSLN
CCDS58 RVHIGEKP
697 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]