Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0466
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0466, 1194 aa
1>>>pF1KSDA0466 1194 - 1194 aa - 1194 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6779+/-0.0012; mu= 6.7796+/- 0.074
mean_var=154.6425+/-30.743, 0's: 0 Z-trim(106.8): 17 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.103136
statistics sampled from 9160 (9172) to 9160 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 4.850
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30813.1 IGSF3 gene_id:3321|Hs108|chr1 (1194) 7998 1203.0 0
CCDS30814.1 IGSF3 gene_id:3321|Hs108|chr1 (1214) 5285 799.3 0
CCDS891.1 CD101 gene_id:9398|Hs108|chr1 (1021) 2097 324.9 6e-88
CCDS890.1 PTGFRN gene_id:5738|Hs108|chr1 ( 879) 776 128.4 7.8e-29
CCDS1195.1 IGSF8 gene_id:93185|Hs108|chr1 ( 613) 530 91.7 5.9e-18
>>CCDS30813.1 IGSF3 gene_id:3321|Hs108|chr1 (1194 aa)
initn: 7998 init1: 7998 opt: 7998 Z-score: 6436.6 bits: 1203.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7998; 100.0% identity (100.0% similar) in 1194 aa overlap (1-1194:1-1194)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDAGEYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDAGEYEC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQHSHLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQHSHLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKESDSVFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKESDSVFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIIVLPLKSSISVEVASNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIIVLPLKSSISVEVASNAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDRQNRRSNIMWLDRDGTVQPGSSYWERSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDRQNRRSNIMWLDRDGTVQPGSSYWERSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTPISITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 FGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTPISITA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDLVTFTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDLVTFTR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRKNYNNTWTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRKNYNNTWTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLNCSVKSQTSQNSHFAVLWYVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLNCSVKSQTSQNSHFAVLWYVH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGSY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLSQAQGNLSVLETRQVQLECVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLSQAQGNLSVLETRQVQLECVV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHLESPSPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHLESPSPGV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD YRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAGQTALTVMRPDASLQVDTVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 YRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAGQTALTVMRPDASLQVDTVVP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD NATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGKRSSPGLEEQEEEREEEEEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGKRSSPGLEEQEEEREEEEEED
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD DDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSPVLYRLTVLQASPQDTGNYSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSPVLYRLTVLQASPQDTGNYSC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD HVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIICSNDALFYFVFFYPFPIFGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIICSNDALFYFVFFYPFPIFGIL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD IITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTCLEPPVLSIHPGAID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTCLEPPVLSIHPGAID
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS30814.1 IGSF3 gene_id:3321|Hs108|chr1 (1214 aa)
initn: 5285 init1: 5285 opt: 5285 Z-score: 4254.8 bits: 799.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7943; 98.3% identity (98.4% similar) in 1214 aa overlap (1-1194:1-1214)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDAGEYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDAGEYEC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQHSHLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 HTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQHSHLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKESDSVFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKESDSVFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD LKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIIVLPL-------------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIIVLPLTDNWVVKVPQHHQ
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD -------KSSISVEVASNASVILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDRQNRRSNI
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LLSQGHLESSISVEVASNASVILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDRQNRRSNI
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KSD MWLDRDGTVQPGSSYWERSSFGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MWLDRDGTVQPGSSYWERSSFGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAV
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KSD DGEWQIVGERRASTPISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DGEWQIVGERRASTPISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSV
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KSD TWRFQPVGTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TWRFQPVGTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEA
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KSD GKYQCVAELWRKNYNNTWTRLAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GKYQCVAELWRKNYNNTWTRLAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLN
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KSD CSVKSQTSQNSHFAVLWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CSVKSQTSQNSHFAVLWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHV
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KSD SGGLFSLTVQRAEVSDSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SGGLFSLTVQRAEVSDSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLS
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KSD QAQGNLSVLETRQVQLECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QAQGNLSVLETRQVQLECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGE
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KSD QAAKNNLKGRLHLESPSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QAAKNNLKGRLHLESPSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAG
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD QTALTVMRPDASLQVDTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 QTALTVMRPDASLQVDTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGK
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD RSSPGLEEQEEEREEEEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 RSSPGLEEQEEEREEEEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD VLYRLTVLQASPQDTGNYSCHVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VLYRLTVLQASPQDTGNYSCHVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIIC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD SNDALFYFVFFYPFPIFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SNDALFYFVFFYPFPIFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTC
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1190
pF1KSD LEPPVLSIHPGAID
::::::::::::::
CCDS30 LEPPVLSIHPGAID
1210
>>CCDS891.1 CD101 gene_id:9398|Hs108|chr1 (1021 aa)
initn: 1439 init1: 795 opt: 2097 Z-score: 1692.4 bits: 324.9 E(32554): 6e-88
Smith-Waterman score: 2188; 38.3% identity (68.2% similar) in 961 aa overlap (4-953:10-945)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQN
:: .:. :.. .::.::::.:::.:.:: ..: :::.:.::::::.
CCDS89 MAGISYVASFFLLLTKLSI-----GQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD FQWSIYLPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARD
::::.:::..: .::::.:: :..: ::.::::::.: ...:::::::.::::. :: .:
CCDS89 FQWSVYLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AGEYECHTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETI
:::::::::.::..:.:::::: ::.::::.:..: ::: . : .:: ::::... :
CCDS89 AGEYECHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QHSHLSVAW-LRQKVG-EKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLT
::.::::.: : : : . .:.::::.::.: . :..: . ..:.:.::: :::::.
CCDS89 QHTHLSVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IFHLQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLH
: .:: ::::...:::.::::::: .:. .:.:... ... .::. :.: : . : :
CCDS89 IERLQSSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNI-TADSLF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TVGEPVEFRCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVA
. :.:.:. :.. ... . .. : ::.. :: . ..: :.... .: ..:.:.:.
CCDS89 AEGKPLELVCLVVSSGRDPQLQGI-WFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KESDSVFVLKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEF-IDKESKRPKNIPIIVLPLKSSI
: . ..: :::. : :: : : : :.: :: :: . . .... : . . : :.
CCDS89 KLGPKAFSLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSV
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD SVEVASNASVILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDR-QNRRSNIMWLDRDGTVQ
. . .. .:. ::: : : :. :: .. .:: : . : :.. . . .:: ::
CCDS89 VMSTKNKQQVVWEGETLAFLCK---AGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KSD PGSSYWERSSFGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVR--AVDGEWQIVG
:.:: : :....:... .:.: : . : : :::.:.: : : : :
CCDS89 LGASYGVPSYHGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWT---
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD ERRASTPISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAW-VPVSVTWRFQPV
.. : ... .:: .. :. .:: : : ...:::.:... : ::..:::.:::.
CCDS89 -QKIS--VTVKSLESSLQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPA
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KSD GTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVA
.. ::.:. .:..: ..::. : :. .: . ..: .: . :.. :.: ::: .
CCDS89 SSHIFHQLIRITHNGTIEWGNFLSRFQKKTKV--SQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEV
590 600 610 620 630 640
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]