Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0466
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0466, 1194 aa
1>>>pF1KSDA0466 1194 - 1194 aa - 1194 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0054+/-0.00046; mu= 16.4914+/- 0.029
mean_var=158.1286+/-31.335, 0's: 0 Z-trim(114.2): 34 B-trim: 65 in 3/55
Lambda= 0.101993
statistics sampled from 23904 (23935) to 23904 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 13.910
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001007238 (OMIM: 149700,603491) immunoglobulin (1194) 7998 1190.2 0
XP_005270851 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu (1199) 7898 1175.5 0
NP_001533 (OMIM: 149700,603491) immunoglobulin sup (1214) 5285 791.0 0
XP_005270850 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu (1214) 5285 791.0 0
XP_011539617 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu (1214) 5285 791.0 0
XP_006710656 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu (1219) 5285 791.0 0
XP_011539618 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immu ( 657) 4385 658.4 4.4e-188
NP_004249 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfamil (1021) 2097 321.9 1.3e-86
NP_001243038 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfa (1021) 2097 321.9 1.3e-86
NP_001243035 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfa (1021) 2097 321.9 1.3e-86
NP_065173 (OMIM: 601204) prostaglandin F2 receptor ( 879) 776 127.4 3.9e-28
XP_016857363 (OMIM: 601204) PREDICTED: prostagland ( 885) 771 126.7 6.5e-28
NP_001243040 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfa ( 959) 632 106.3 9.9e-22
XP_016858335 (OMIM: 604516) PREDICTED: immunoglobu ( 974) 632 106.3 1e-21
XP_016858336 (OMIM: 604516) PREDICTED: immunoglobu ( 974) 632 106.3 1e-21
NP_001193594 (OMIM: 606644) immunoglobulin superfa ( 613) 530 91.1 2.4e-17
XP_016858324 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 613) 530 91.1 2.4e-17
XP_016858325 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 613) 530 91.1 2.4e-17
NP_443100 (OMIM: 606644) immunoglobulin superfamil ( 613) 530 91.1 2.4e-17
XP_016858326 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 613) 530 91.1 2.4e-17
NP_001307176 (OMIM: 606644) immunoglobulin superfa ( 613) 530 91.1 2.4e-17
XP_016858328 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 591) 518 89.3 7.8e-17
XP_016858327 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 591) 518 89.3 7.8e-17
XP_011508461 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 591) 518 89.3 7.8e-17
XP_016858329 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 591) 518 89.3 7.8e-17
XP_006711694 (OMIM: 606644) PREDICTED: immunoglobu ( 596) 518 89.3 7.9e-17
>>NP_001007238 (OMIM: 149700,603491) immunoglobulin supe (1194 aa)
initn: 7998 init1: 7998 opt: 7998 Z-score: 6367.6 bits: 1190.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7998; 100.0% identity (100.0% similar) in 1194 aa overlap (1-1194:1-1194)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDAGEYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDAGEYEC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQHSHLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQHSHLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKESDSVFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKESDSVFV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIIVLPLKSSISVEVASNAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIIVLPLKSSISVEVASNAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDRQNRRSNIMWLDRDGTVQPGSSYWERSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDRQNRRSNIMWLDRDGTVQPGSSYWERSS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTPISITA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTPISITA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDLVTFTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDLVTFTR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRKNYNNTWTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRKNYNNTWTR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLNCSVKSQTSQNSHFAVLWYVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLNCSVKSQTSQNSHFAVLWYVH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD KPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGSY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD YCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLSQAQGNLSVLETRQVQLECVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLSQAQGNLSVLETRQVQLECVV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHLESPSPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHLESPSPGV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD YRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAGQTALTVMRPDASLQVDTVVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAGQTALTVMRPDASLQVDTVVP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD NATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGKRSSPGLEEQEEEREEEEEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGKRSSPGLEEQEEEREEEEEED
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD DDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSPVLYRLTVLQASPQDTGNYSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSPVLYRLTVLQASPQDTGNYSC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD HVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIICSNDALFYFVFFYPFPIFGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIICSNDALFYFVFFYPFPIFGIL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD IITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTCLEPPVLSIHPGAID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTCLEPPVLSIHPGAID
1150 1160 1170 1180 1190
>>XP_005270851 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immunogl (1199 aa)
initn: 7898 init1: 7898 opt: 7898 Z-score: 6288.1 bits: 1175.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7898; 100.0% identity (100.0% similar) in 1180 aa overlap (15-1194:20-1199)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MEKAGRSDLGEQYLSQKAGGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QWSIYLPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QWSIYLPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GEYECHTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GEYECHTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQ
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD HSHLSVAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HSHLSVAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EPVEFRCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EPVEFRCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKES
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DSVFVLKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIIVLPLKSSISVEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSVFVLKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEFIDKESKRPKNIPIIVLPLKSSISVEV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD ASNASVILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDRQNRRSNIMWLDRDGTVQPGSSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ASNASVILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDRQNRRSNIMWLDRDGTVQPGSSY
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD WERSSFGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WERSSFGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTP
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDL
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD VTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRKNYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRKNYN
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD NTWTRLAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLNCSVKSQTSQNSHFAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NTWTRLAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLNCSVKSQTSQNSHFAV
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD LWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVS
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD DSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLSQAQGNLSVLETRQVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLSQAQGNLSVLETRQVQ
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD LECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHLES
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD PSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAGQTALTVMRPDASLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAGQTALTVMRPDASLQV
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD DTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGKRSSPGLEEQEEEREE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGKRSSPGLEEQEEEREE
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD EEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSPVLYRLTVLQASPQDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSPVLYRLTVLQASPQDT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD GNYSCHVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIICSNDALFYFVFFYPFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GNYSCHVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIICSNDALFYFVFFYPFP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD IFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTCLEPPVLSIHPGAID
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTCLEPPVLSIHPGAID
1150 1160 1170 1180 1190
>>NP_001533 (OMIM: 149700,603491) immunoglobulin superfa (1214 aa)
initn: 5285 init1: 5285 opt: 5285 Z-score: 4210.0 bits: 791.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7943; 98.3% identity (98.4% similar) in 1214 aa overlap (1-1194:1-1214)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNFQWSIY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDAGEYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDAGEYEC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQHSHLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQHSHLS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 LEPPVLSIHPGAID
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1190
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XP_005 LEPPVLSIHPGAID
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pF1KSD VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
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XP_011 VAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFHLQPSD
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XP_011 QGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVGEPVEF
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XP_011 RCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKESDSVFV
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.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 DGEWQIVGERRASTPISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAWVPVSV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TWRFQPVGTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD CSVKSQTSQNSHFAVLWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CSVKSQTSQNSHFAVLWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGGLFSLTVQRAEVSDSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLS
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pF1KSD QAQGNLSVLETRQVQLECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QAQGNLSVLETRQVQLECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGE
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pF1KSD QAAKNNLKGRLHLESPSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QAAKNNLKGRLHLESPSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRAEDTAG
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pF1KSD QTALTVMRPDASLQVDTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QTALTVMRPDASLQVDTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGK
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pF1KSD RSSPGLEEQEEEREEEEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSP
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XP_011 RSSPGLEEQEEEREEEEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRFQRLSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLYRLTVLQASPQDTGNYSCHVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTLQSIIC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNDALFYFVFFYPFPIFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLNYSPTC
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pF1KSD LEPPVLSIHPGAID
::::::::::::::
XP_011 LEPPVLSIHPGAID
1210
>>XP_006710656 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immunogl (1219 aa)
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Smith-Waterman score: 7843; 98.2% identity (98.3% similar) in 1200 aa overlap (15-1194:20-1219)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MEKAGRSDLGEQYLSQKAGGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQNF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD QWSIYLPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QWSIYLPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARDA
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GEYECHTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HSHLSVAWLRQKVGEKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLTIFH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLHTVG
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300 310 320 330 340 350
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EPVEFRCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVAKES
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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410 420 430 440 450
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.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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520 530 540 550 560 570
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 WVRAVDGEWQIVGERRASTPISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VPVSVTWRFQPVGTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SDTEAGKYQCVAELWRKNYNNTWTRLAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENK
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700 710 720 730 740 750
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PIQLNCSVKSQTSQNSHFAVLWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQ
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760 770 780 790 800 810
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FHYGEQAAKNNLKGRLHLESPSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSPSGMWYKRA
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940 950 960 970 980 990
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EDTAGQTALTVMRPDASLQVDTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRT
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1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD KAGGKRSSPGLEEQEEEREEEEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KAGGKRSSPGLEEQEEEREEEEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGSPWEGRLRF
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD QRLSPVLYRLTVLQASPQDTGNYSCHVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QRLSPVLYRLTVLQASPQDTGNYSCHVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIRVLDTSPTL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD QSIICSNDALFYFVFFYPFPIFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QSIICSNDALFYFVFFYPFPIFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLLWIKEPHLN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1180 1190
pF1KSD YSPTCLEPPVLSIHPGAID
:::::::::::::::::::
XP_006 YSPTCLEPPVLSIHPGAID
1210
>>XP_011539618 (OMIM: 149700,603491) PREDICTED: immunogl (657 aa)
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510 520 530 540 550 560
pF1KSD QYECHVTEWVRAVDGEWQIVGERRASTPISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCI
... ::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSSTEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCI
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570 580 590 600 610 620
pF1KSD IKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IKPHYPAWVPVSVTWRFQPVGTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNN
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630 640 650 660 670 680
pF1KSD VRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRKNYNNTWTRLAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRLSISRASDTEAGKYQCVAELWRKNYNNTWTRLAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKR
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pF1KSD TLTLVENKPIQLNCSVKSQTSQNSHFAVLWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TLTLVENKPIQLNCSVKSQTSQNSHFAVLWYVHKPSDADGKLILKTTHNSAFEYGTYAEE
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pF1KSD EGLRARLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EGLRARLQFERHVSGGLFSLTVQRAEVSDSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTE
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD VTVKQPDSRLRLSQAQGNLSVLETRQVQLECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTVKQPDSRLRLSQAQGNLSVLETRQVQLECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETV
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pF1KSD ARLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHLESPSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ARLSRDATFHYGEQAAKNNLKGRLHLESPSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEWLPSP
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pF1KSD SGMWYKRAEDTAGQTALTVMRPDASLQVDTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SGMWYKRAEDTAGQTALTVMRPDASLQVDTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFA
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pF1KSD VAWYSLRTKAGGKRSSPGLEEQEEEREEEEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VAWYSLRTKAGGKRSSPGLEEQEEEREEEEEEDDDDDDDPTERTALLSVGPDAVFGPEGS
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pF1KSD PWEGRLRFQRLSPVLYRLTVLQASPQDTGNYSCHVEEWLPSPQKEWYRLTEEESAPIGIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KSD VLDTSPTLQSIICSNDALFYFVFFYPFPIFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLDTSPTLQSIICSNDALFYFVFFYPFPIFGILIITILLVRFKSRNSSKNSDGKNGVPLL
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD WIKEPHLNYSPTCLEPPVLSIHPGAID
:::::::::::::::::::::::::::
XP_011 WIKEPHLNYSPTCLEPPVLSIHPGAID
640 650
>>NP_004249 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfamily me (1021 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQN
:: .:. :.. .::.::::.:::.:.:: ..: :::.:.::::::.
NP_004 MAGISYVASFFLLLTKLSI-----GQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD FQWSIYLPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARD
::::.:::..: .::::.:: :..: ::.::::::.: ...:::::::.::::. :: .:
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60 70 80 90 100 110
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pF1KSD AGEYECHTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETI
:::::::::.::..:.:::::: ::.::::.:..: ::: . : .:: ::::... :
NP_004 AGEYECHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATA
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD QHSHLSVAW-LRQKVG-EKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLT
::.::::.: : : : . .:.::::.::.: . :..: . ..:.:.::: :::::.
NP_004 QHTHLSVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IFHLQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLH
: .:: ::::...:::.::::::: .:. .:.:... ... .::. :.: : . : :
NP_004 IERLQSSDQGQLFCEATEWIQDPDETWMFITKKQTDQTTLRIQPAVKDFQVNI-TADSLF
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD TVGEPVEFRCILEAQNVPDRYFAVSWAFNSSLIATMGPNAVPVLNSEFAHREARGQLKVA
. :.:.:. :.. ... . .. : ::.. :: . ..: :.... .: ..:.:.:.
NP_004 AEGKPLELVCLVVSSGRDPQLQGI-WFFNGTEIAHIDAGGVLGLKNDYKERASQGELQVS
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD KESDSVFVLKIYHLRQEDSGKYNCRVTEREKTVTGEF-IDKESKRPKNIPIIVLPLKSSI
: . ..: :::. : :: : : : :.: :: :: . . .... : . . : :.
NP_004 KLGPKAFSLKIFSLGPEDEGAYRCVVAEVMKTRTGSWQVLQRKQSPDSHVHLRKPAARSV
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD SVEVASNASVILEGEDLRFSCSVRTAGRPQGRFSVIWQLVDR-QNRRSNIMWLDRDGTVQ
. . .. .:. ::: : : :. :: .. .:: : . : :.. . . .:: ::
NP_004 VMSTKNKQQVVWEGETLAFLCK---AGGAESPLSVSWWHIPRDQTQPEFVAGMGQDGIVQ
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD PGSSYWERSSFGGVQMEQVQPNSFSLGIFNSRKEDEGQYECHVTEWVR--AVDGEWQIVG
:.:: : :....:... .:.: : . : : :::.:.: : : : :
NP_004 LGASYGVPSYHGNTRLEKMDWATFQLEITFTAITDSGTYECRVSEKSRNQARDLSWT---
480 490 500 510 520
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pF1KSD ERRASTPISITALEMGFAVTAISRTPGVTYSDSFDLQCIIKPHYPAW-VPVSVTWRFQPV
.. : ... .:: .. :. .:: : : ...:::.:... : ::..:::.:::.
NP_004 -QKIS--VTVKSLESSLQVSLMSRQPQVMLTNTFDLSCVVRAGYSDLKVPLTVTWQFQPA
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD GTVEFHDLVTFTRDGGVQWGDRSSSFRTRTAIEKAESSNNVRLSISRASDTEAGKYQCVA
.. ::.:. .:..: ..::. : :. .: . ..: .: . :.. :.: ::: .
NP_004 SSHIFHQLIRITHNGTIEWGNFLSRFQKKTKV--SQSLFRSQLLVHDATEEETGVYQCEV
590 600 610 620 630 640
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pF1KSD ELWRKN--YNNTWTRLAERTSNLLEIRVLQPVTKLQVSKSKRTLTLVENKPIQLNCSVKS
:.. .: ::: : : :. :.: : : .::.:.. ... : :. ...::. :
NP_004 EVYDRNSLYNNRPPR-ASAISHPLRIAVTLPESKLKVNSRSQVQELSINSNTDIECSILS
650 660 670 680 690 700
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pF1KSD QTSQNSHFAVLWYVHKPSDADGKL-ILKTTHNSAFEYGTYAEEEGLRARLQFERHVSGGL
... : ..:..:: : . : ::. ...... : . . ... :. :: :
NP_004 RSNGNLQLAIIWYFSPVSTNASWLKILEMDQTNVIKTGDEFHTPQRKQKFHTEK-VSQDL
710 720 730 740 750 760
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pF1KSD FSLTVQRAEVSDSGSYYCHVEEWLLSPNYAWYKLAEEVSGRTEVTVKQPDSRLRLSQAQG
:.: . .: :: :.:.: ::::::: : .:.::.:. :: ::. .: :..:.:..
NP_004 FQLHILNVEDSDRGKYHCAVEEWLLSTNGTWHKLGEKKSGLTELKLKPTGSKVRVSKVYW
770 780 790 800 810 820
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pF1KSD NLSVLETRQVQLECVVLNRTSITSQLMVEWFVWKPNHPERETVARLSRDATFHYGEQAAK
. .: : :.: ..: . . : .. : :. :. .. . ...:..:. ..:::.
NP_004 TENVTEHREVAIRCSLESVGSSATLYSVMWY-WNRENSGSKLLVHLQHDGLLEYGEE---
830 840 850 860 870
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pF1KSD NNLKGRLHLESPSPGVYRLFIQNVAVQDSGTYSCHVEEW-LPSPSGMWYKRAEDTAGQTA
.:. .:: : . : ...: ..:.: : :.: :: : . . : ..: : . . .
NP_004 -GLRRHLHCYRSSSTDFVLKLHQVEMEDAGMYWCRVAEWQLHGHPSKWINQASDESQRMV
880 890 900 910 920 930
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pF1KSD LTVMRPDASLQVDTVVPNATVSEKAAFQLDCSIVSRSSQDSRFAVAWYSLRTKAGGKRSS
:::. . .:
NP_004 LTVLPSEPTLPSRICSSAPLLYFLFICPFVLLLLLLISLLCLYWKARKLSTLRSNTRKEK
940 950 960 970 980 990
>>NP_001243038 (OMIM: 604516) immunoglobulin superfamily (1021 aa)
initn: 1439 init1: 795 opt: 2097 Z-score: 1675.8 bits: 321.9 E(85289): 1.3e-86
Smith-Waterman score: 2188; 38.3% identity (68.2% similar) in 961 aa overlap (4-953:10-945)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKCFFPVLSCLAVLGVVSAQRQVTVQEGPLYRTEGSHITIWCNVSGYQGPSEQN
:: .:. :.. .::.::::.:::.:.:: ..: :::.:.::::::.
NP_001 MAGISYVASFFLLLTKLSI-----GQREVTVQKGPLFRAEGYPVSIGCNVTGHQGPSEQH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD FQWSIYLPSSPEREVQIVSTMDSSFPYAIYTQRVRGGKIFIERVQGNSTLLHITDLQARD
::::.:::..: .::::.:: :..: ::.::::::.: ...:::::::.::::. :: .:
NP_001 FQWSVYLPTNPTQEVQIISTKDAAFSYAVYTQRVRSGDVYVERVQGNSVLLHISKLQMKD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD AGEYECHTPSTDKQYFGSYSAKMNLVVIPDSLQTTAMPQTLHRVEQDPLELTCEVASETI
:::::::::.::..:.:::::: ::.::::.:..: ::: . : .:: ::::... :
NP_001 AGEYECHTPNTDEKYYGSYSAKTNLIVIPDTLSATMSSQTLGKEEGEPLALTCEASKATA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QHSHLSVAW-LRQKVG-EKPVEVISLSRDFMLHSSSEYAQRQSLGEVRLDKLGRTTFRLT
::.::::.: : : : . .:.::::.::.: . :..: . ..:.:.::: :::::.
NP_001 QHTHLSVTWYLTQDGGGSQATEIISLSKDFILVPGPLYTERFAASDVQLNKLGPTTFRLS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IFHLQPSDQGEFYCEAAEWIQDPDGSWYAMTRKRSEGAVVNVQPTDKEFTVRLETEKRLH
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]