Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0482
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0482, 1290 aa
1>>>pF1KSDA0482 1290 - 1290 aa - 1290 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8296+/-0.00104; mu= -4.1005+/- 0.062
mean_var=467.5634+/-95.524, 0's: 0 Z-trim(116.6): 71 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.059314
statistics sampled from 17221 (17286) to 17221 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.531), width: 16
Scan time: 6.340
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11131.1 PER1 gene_id:5187|Hs108|chr17 (1290) 8794 768.0 0
CCDS2528.1 PER2 gene_id:8864|Hs108|chr2 (1255) 1882 176.5 3.8e-43
CCDS89.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1201) 1811 170.5 2.5e-41
CCDS76097.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1191) 1776 167.5 2e-40
CCDS72695.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1210) 1771 167.0 2.7e-40
>>CCDS11131.1 PER1 gene_id:5187|Hs108|chr17 (1290 aa)
initn: 8794 init1: 8794 opt: 8794 Z-score: 4084.6 bits: 768.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8794; 99.9% identity (99.9% similar) in 1290 aa overlap (1-1290:1-1290)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPCPGPSLADDTDANSNGSSGNESNGH
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CCDS11 MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPCPGPSLADDTDANSNGSSGNESNGH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQDNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQDNPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQANQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQANQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISEQAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISEQAAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKSVFCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKSVFCR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPDKRIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPDKRIF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLAGQPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLAGQPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD DHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAPSPAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAPSPAP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAEGPGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAEGPGP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPELEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPELEAG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSSYTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSSYTTS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVGGTLSPLALANKAESVVSVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVGGTLSPLALANKAESVVSVTS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QCSFSSTIVHVGDKKPPESDIIMMEDLPGLAPGPAPSPAPSPTVAPDPAPDAYRPVGLTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QCSFSSTIVHVGDKKPPESDIIMMEDLPGLAPGPAPSPAPSPTVAPDPAPDAYRPVGLTK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD AVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGRLRGLDSSSTAPSALGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGRLRGLDSSSTAPSALGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD RSRHHQNPRAEAPCYVSHPSPVPPSTPWPTPPATTPFPAVVQPYPLPVFSPRGGPQPLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RSRHHQNPRAEAPCYVSHPSPVPPSTPWPTPPATTPFPAVVQPYPLPVFSPRGGPQPLPP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD APTSVPPAAFPAPLVTPMVALVLPNYLFPTPSSYPYGALQTPAEGPPTPASHSPSPSLPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 APTSVPPAAFPAPLVTPMVALVLPNYLFPTPSSYPYGALQTPAEGPPTPASHSPSPSLPA
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LPPSPPHRPDSPLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPRAEGAAVAGGPGSSAGPPPPSAEAAEP
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LAPSPPHRPDSPLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPRAEGAAVAGGPGSSAGPPPPSAEAAEP
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EARLAEVTESSNQDALSGSSDLLELLLQEDSRSGTGSAASGSLGSGLGSGSGSGSHEGGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EARLAEVTESSNQDALSGSSDLLELLLQEDSRSGTGSAASGSLGSGLGSGSGSGSHEGGS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD TSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARGGAEPGDQVIKYVLQDPIWLLMANADQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARGGAEPGDQVIKYVLQDPIWLLMANADQR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD VMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKGQLPRALDVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKGQLPRALDVM
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD ACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGLEPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGLEPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKA
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290
pF1KSD SSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
1270 1280 1290
>>CCDS2528.1 PER2 gene_id:8864|Hs108|chr2 (1255 aa)
initn: 2832 init1: 1712 opt: 1882 Z-score: 888.2 bits: 176.5 E(32554): 3.8e-43
Smith-Waterman score: 3152; 44.5% identity (66.4% similar) in 1297 aa overlap (26-1240:9-1245)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSGPLEGADGGGDPRPGESFCPGGVPSPGPPQHRPC-PGPS---LADDTDANSNGSSGNE
:::. : ..: : :: : .:.: .: ::::.:
CCDS25 MNGYAEFPPSPSNPTKEPVEPQPSQVPLQEDVDMSS-GSSGHE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SNGHESRGASQRSSHSSSSGNGKDSALLETTESSKSTNSQSPSPPSSSIAYSLLSASSEQ
.: . : : ....: ..: ::. ..: ... :::. ..::. :.::.
CCDS25 TNENCSTGRDSQGSDCDDS--GKELGMLVEPPDAR----QSPD------TFSLMMAKSEH
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRGKGRSGTLATLQYALACVKQVQ
:::::::::.::... :.:::. .:.:::..:: ....::...:::::.::: ::::.
CCDS25 -NPSTSGCSSDQSSKVDTHKELIKTLKELKVHLPADKKAKGKASTLATLKYALRSVKQVK
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQNQDTFSVAVSFLTGRIVYISE
::.:::: ::.::. :. .::.::.: .:::. ..: : :.::::...:.:.:::.
CCDS25 ANEEYYQLLMSSEGHPCGADVPSYTVEEMESVTSEHIVKNADMFAVAVSLVSGKILYISD
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRLPTWGTGASAGSGLRDFTQEKS
:.: ...::::.: ..: :.:::.:::::.. :.: .:: :. ..: : .. .:::
CCDS25 QVASIFHCKRDAFSDAKFVEFLAPHDVGVFHSFTSPYKLPLWSMCSGADSFTQECMEEKS
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAPAQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPD
:::. ... ::.:::.:::..:.: ..:: .: ::::.:::.:::::::::::.
CCDS25 FFCRVSVRKSHENEIRYHPFRMTPYLVKVRDQQGAESQLCCLLLAERVHSGYEAPRIPPE
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAPVLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLA
:::::: :::.::::::::::.::::::::::. .:::. ::: :::::::::::::: .
CCDS25 KRIFTTTHTPNCLFQDVDERAVPLLGYLPQDLIETPVLVQLHPSDRPLMLAIHKKILQSG
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GQPFDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRKVAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAP
:::::.::::: ::::::.:.::::..:..:::::..:..::::::..:::::::.
CCDS25 GQPFDYSPIRFRARNGEYITLDTSWSSFINPWSRKISFIIGRHKVRVGPLNEDVFAAHPC
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCGVGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAE
. .: .::::.::::::::::: . .: ..:. : : : ::::::: .
CCDS25 TEEKALHPSIQELTEQIHRLLLQPVPHSGSSGYGSLGSNGSHEHLMSQTSSSDSNGHE--
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARPQSRPRLPATGTFKAKALPCQSPDPE
. .:::. . .:.... .. . .: .. .. . ::. :
CCDS25 ----DSRRRRAEICKNGNKTKNRSHYSHESGEQKKKSVTEMQTNPPAEKKAV------PA
510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSS
.: : :. ::: :. .::::::.::::..::::::: .: :::: ..
CCDS25 MEKDSLGVS-----FPEELACKNQPTCSYQQISCLDSVIRYLESCNEAATLKRKCEFPAN
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KSD YTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSGEGATPRKEPVVGGTLSPLALANKAESVV
. .:: . ..: . . .::: . : : :: :. ::: .:::::.
CCDS25 VPALRSSDKRKATVSPGPHAGEAEPPSRVNSRTG--------VGTHLTSLALPGKAESVA
620 630 640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KSD SVTSQCSFSSTIVHVGDKKPPESDIIMMEDLPGLAPGPAP-----SPAPSPTVAPDPAPD
:.:::::.:::::::::::: . .. :.:: : :: .:: . .. . :
CCDS25 SLTSQCSYSSTIVHVGDKKP-QPELEMVEDA---ASGPESLDCLAGPALACGLSQEKEP-
670 680 690 700 710
780 790 800 810
pF1KSD AYRPVGLTKAVLSLHTQKEEQAFLSRFRDLGRL---------------RGLDSSSTAPSA
.. .:::: ::. :::::::.::..:... .: .: : :::.
CCDS25 -FKKLGLTKEVLAAHTQKEEQSFLQKFKEIRKLSIFQSHCHYYLQERSKGQPSERTAPGL
720 730 740 750 760 770
820 830 840 850 860
pF1KSD LGERGCHHGPAPPSRRHHCRSKAKRSRHHQN------PRAEAPCYVSHPSPV--PPSTPW
. : .. .. .:: . : .. : . : :. . . : .:
CCDS25 RNTSGIDSPWKKTGKNRKLKSKRVKPRDSSESTGSGGPVSARPPLVGLNATAWSPSDTSQ
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910
pF1KSD PTPPATTPFPAVVQP-YPLPVFSPRGGPQPLPPAPT----SVP-------------PAAF
. ::. :::: : : :::: : : :::: .:: : :
CCDS25 SSCPAV-PFPAPVPAAYSLPVF-PAPGTVAAPPAPPHASFTVPAVPVDLQHQFAVQPPPF
840 850 860 870 880 890
920 930 940 950
pF1KSD PAPLVTPMVALVLPNYLFPTPS-SYPYGALQTPAEGPPTP------ASHS----PS----
::::. :..:..::.: ::. . . : . . . . : : :: : ::
CCDS25 PAPLA-PVMAFMLPSYSFPSGTPNLPQAFFPSQPQFPSHPTLTSEMASASQPEFPSRTSI
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000
pF1KSD PSLP-------ALPPSPPHRPDSPLFNSRCSSPLQLNLLQLEELPRAEGAAVAGGPGSS-
: : : ::: : . :::.:: ::::::::::::: :.. :... : :..
CCDS25 PRQPCACPATRATPPSAMGRASPPLFQSRSSSPLQLNLLQLEEAPEG-GTGAMGTTGATE
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD -----AGPPPPSAEAAEPEARLA--EVTESSNQDALSGSSDLLELLLQEDSRSGTGSAAS
: : ... .:.: :. : ....:.:::: :: ::.:::.:: :..:::::
CCDS25 TAAVGADCKPGTSRDQQPKAPLTRDEPSDTQNSDALSTSSGLLNLLLNEDLCSASGSAAS
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD GSLGSGLGSGSGSGSHEGGSTSASITRSSQSSHTSKYFGSIDSSEAEAGAARG-GAEPGD
::::: . ..: : : ::..:::::::::::::: . : . : : ..
CCDS25 ESLGSGSLGCDASPSGAG---------SSDTSHTSKYFGSIDSSENNHKAKMNTGMEESE
1080 1090 1100 1110 1120
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD QVIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQVPSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRR
. :: :::::::::::.::. ::::::.:::.. .:::.:::.:. .:: ::::.:.:..
CCDS25 HFIKCVLQDPIWLLMADADSSVMMTYQLPSRNLEAVLKEDREKLKLLQKLQPRFTESQKQ
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD ELGAVHSWVRKGQLPRALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGL-EPMEEGGGEQ
:: ::.:.. : :: :.:: :: : ... :. : .. .::: : . :.
CCDS25 ELREVHQWMQTGGLPAAIDVAECVYC--ENKEKGNICIPYEEDIPSLGLSEVSDTKEDEN
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KSD GSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKASSSQDLAMEEEEEGRSSSSPALPTAGNCTS
::
CCDS25 GSPLNHRIEEQT
1250
>>CCDS89.1 PER3 gene_id:8863|Hs108|chr1 (1201 aa)
initn: 1487 init1: 489 opt: 1811 Z-score: 855.6 bits: 170.5 E(32554): 2.5e-41
Smith-Waterman score: 2241; 38.2% identity (61.8% similar) in 1188 aa overlap (126-1213:43-1187)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD QSPSPPSSSIAYSLLSASSEQDNPSTSGCSSEQSARARTQKELMTALRELKLRLPPERRG
:::. : :...::. ...:.: .: :::.
CCDS89 GAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERRN
20 30 40 50 60 70
160 170 180 190 200 210
pF1KSD KGRSGTLATLQYALACVKQVQANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQ
: .:: .:.::: ::..::::.:..: : ..: : . :.: :.:::: :.::.: .
CCDS89 K--PSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILS-QNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSK
80 90 100 110 120
220 230 240 250 260 270
pF1KSD NQDTFSVAVSFLTGRIVYISEQAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRL
: ::: .. :::.::.:.::::::..: :.::. ...: .::::::. :::. :: ..:
CCDS89 NTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQL
130 140 150 160 170 180
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PTWGTGASAGSGLRDFTQEKSVFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAP---
: :.. . .. . . : ::::::: :: ..:::. ::. ... . :
CCDS89 PFWNNW-TQRAARYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVH-HPAQPELE
190 200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KSD AQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPDKRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAP
..:::: ..:.::::::::::: .:::::: :::.:.: .:::.:.::::::::::.:.
CCDS89 SEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTS
250 260 270 280 290 300
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VLLFLHPEDRPLMLAIHKKILQLAGQP-FDHSPIRFCARNGEYVTMDTSWAGFVHPWSRK
.: .:::::: ::.:::.:.:. ::.: :.:::::::..::.:. .:.::..::.:::::
CCDS89 ILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRK
310 320 330 340 350 360
460 470 480 490 500 510
pF1KSD VAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAPSPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCG
..:..:::::::.:::::::. . . : :: ::.:::..::::::: .: .
CCDS89 ISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDN-DKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGS
370 380 390 400 410 420
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pF1KSD VGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAEGPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARP
.:. : : : .:::...: .: .:.::. .:. .:. ::::.::: ..
CCDS89 LGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE-ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKS
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD QSRPRLPATGTFKAKALPCQ---SPDPELEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASSCSYQQI
. .: . .: : . :. : :. .:. .. : : :.. : :::::
CCDS89 SFKP-VTGTRTEPNGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTE------PCEDLRNDEHSPSYQQI
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pF1KSD NCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSSYTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPPSAALSG
::.::..:::.: :.:. :::: : .. ::::.:..:.: . : : .: .:
CCDS89 NCIDSVIRYLKSYNIPAL-KRKCISCTN-TTSSSSEEDKQ-------NHKADDVQALQAG
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: :..: :. : : .: :.. :. : :::..::::::: :::.
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: .. . : ::: . . .. :::: :::: ::::::: ....:
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:. . ..: ..:. . :: ..: :. : ::.
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... : ::: . : .: : ::. ::.. :. : :: :.::...:
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pF1KSD YPLPVFSPRGGPQPLPPAPTSVPPAAFPAPLVTPMVALVLPNY-LFP--TPSSYPYGALQ
: : .:.: . :: . : ::: : . .... ::. . : .:: : :
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. : . .:. : . ::.: : .: . :...:: ::::::::::
CCDS89 ATASSAISPSMSSAMSPTLDPPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQLNLLQ-
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pF1KSD EELPRAEGAA--------------VAGGPGSSAGPPPPSAEAAEPEARLAEVTESSNQDA
::.:: . :.:. :: ..: .: .. : : . .:
CCDS89 EEMPRPSESPDQMRRNTCPQTEYCVTGNNGSESSPATTGALSTGSPPR--ENPSHPTASA
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:: :: . . : .::: : .: :. : : . :: :.
CCDS89 LSTGSPPMKNPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSP
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pF1KSD TSASITRS----SQSSHTSKYF-GSIDSSEAEAGAARGGAEPGDQVIKYVLQDPIWLLMA
: : .:. : :: .: :. .:. ::. .. .. ... : ..::: ..
CCDS89 PSESPSRTGSAASGSSDSSIYLTSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIWRMIR
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.. .:..:::::: : :::.: :.:..:..:::.::. :..::. :..:... . .
CCDS89 QTPERILMTYQVPERVKEVVLKEDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQ
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pF1KSD ALDVMACVDCGSSTQDPGHPDDPLFSELDGLGLEPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEGCEEAQ
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CCDS89 EIDIQACVTCENEDSADGAATSCGQVLVEDSC
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CCDS76 ISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDN-DKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGS
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.:. : : : .:::...: .: .:.::. .:. .:. ::::.::: ..
CCDS76 LGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE-ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKS
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. .: : : .:.. :. : :. .:. .. : : :.. :
CCDS76 SFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTE------PCEDLRNDEHS
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CCDS76 PSYQQINCIDSVIRYLKSYNIPAL-KRKCISCTN-TTSSSSEEDKQ-------NHKADDV
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:::. : .. . : ::: . . .. :::: :::: :::::::
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....::. . ..: ..:. . :: ..: :. : ::
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CCDS76 DSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCPSAASSPHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAF-PLPAA
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::::: ::.:: . :.:. :: ..: .: .. : :
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. .::: :: . . : . : : . . .. ..:: . : : . . .
CCDS76 HPTASALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTATVLSTGSPPSESPSRTGSAA
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pF1KSD SQSSHTSKYF-GSIDSSEAEAGAARGGAEPGDQVIKYVLQDPIWLLMANADQRVMMTYQV
: :: .: :. .:. ::. .. .. ... : ..::: .. .. .:..:::::
CCDS76 SGSSDSSIYLTSSVYSSKISQNGQQSQDVQKKETFPNVAEEPIWRMIRQTPERILMTYQV
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pF1KSD PSRDMTSVLKQDRERLRAMQKQQPRFSEDQRRELGAVHSWVRKGQLPRALDVMACVDCGS
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CCDS76 PERVKEVVLKEDLEKLESMRQQQPQFSHGQKEELAKVYNWIQSQTVTQEIDIQACVTCEN
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pF1KSD STQDPGHPDDPLFSELDGLGLEPMEEGGGEQGSSGGGSGEGEGCEEAQGGAKASSSQDLA
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CCDS76 EDSADGAATSCGQVLVEDSC
1180 1190
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CCDS72 GAKDEALGEESGERWSPEFHLQRKLADSSHSEQQDRNRVSEELIMVVQEMKKYFPSERRN
20 30 40 50 60 70
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pF1KSD KGRSGTLATLQYALACVKQVQANQEYYQQWSLEEGEPCSMDMSTYTLEELEHITSEYTLQ
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CCDS72 K--PSTLDALNYALRCVHSVQANSEFFQILS-QNGAP-QADVSMYSLEELATIASEHTSK
80 90 100 110 120
220 230 240 250 260 270
pF1KSD NQDTFSVAVSFLTGRIVYISEQAAVLLRCKRDVFRGTRFSELLAPQDVGVFYGSTAPSRL
: ::: .. :::.::.:.::::::..: :.::. ...: .::::::. :::. :: ..:
CCDS72 NTDTFVAVFSFLSGRLVHISEQAALILNRKKDVLASSHFVDLLAPQDMRVFYAHTARAQL
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD PTWGTGASAGSGLRDFTQEKSVFCRIRGGPDRDPGPRYQPFRLTPYVTKIRVSDGAP---
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CCDS72 PFWNNWTQRAAARYECAPVKPFFCRIRGGEDRKQEKCHSPFRIIPYLIHVH-HPAQPELE
190 200 210 220 230 240
340 350 360 370 380 390
pF1KSD AQPCCLLIAERIHSGYEAPRIPPDKRIFTTRHTPSCLFQDVDERAAPLLGYLPQDLLGAP
..:::: ..:.::::::::::: .:::::: :::.:.: .:::.:.::::::::::.:.
CCDS72 SEPCCLTVVEKIHSGYEAPRIPVNKRIFTTTHTPGCVFLEVDEKAVPLLGYLPQDLIGTS
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CCDS72 ILSYLHPEDRSLMVAIHQKVLKYAGHPPFEHSPIRFCTQNGDYIILDSSWSSFVNPWSRK
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pF1KSD VAFVLGRHKVRTAPLNEDVFTPPAPSPAPSLDTDIQELSEQIHRLLLQPVHSPSPTGLCG
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CCDS72 ISFIIGRHKVRTSPLNEDVFATKIKKMNDN-DKDITELQEQIYKLLLQPVHVSVSSGYGS
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pF1KSD VGAVTSPGPLHSPGSSSDSNGGDAEGPGPPAPVTFQQICKDVHLVKHQGQQLFIESRARP
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CCDS72 LGSSGSQEQLVSIASSSEASGHRVE-ETKAEQMTLQQVYASVNKIKNLGQQLYIESMTKS
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pF1KSD QSRPRL-----PATGTFKAKAL-PCQ---SPDPELEAGSAPVQAPLALVPEEAERKEASS
. .: : : .:.. :. : :. .:. .. : : :.. :
CCDS72 SFKPVTGTRTEPNGGGESANGGGECKTFTSFHQTLKNNSVYTE------PCEDLRNDEHS
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pF1KSD CSYQQINCLDSILRYLESCNLPSTTKRKCASSSSYTTSSASDDDRQRTGPVSVGTKKDPP
:::::::.::..:::.: :.:. :::: : .. ::::.:..:.: . : :
CCDS72 PSYQQINCIDSVIRYLKSYNIPAL-KRKCISCTN-TTSSSSEEDKQ-------NHKADDV
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pF1KSD SAALSGEG--ATPRKE-PVVG-----GTLSPLALANKAESVVSVTSQCSFSSTIVHVGDK
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CCDS72 QALQAGLQIPAIPKSEMPTNGRSIDTGGGAPQILSTAMLSLGSGISQCGYSSTIVHV---
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:::. : .. . : ::: . . .. :::: :::: :::::::
CCDS72 PPPETARDATLFCEPWTLNMQPAPLTS-----------EEFKHVGLTAAVLSAHTQKEEQ
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....::. . ..: ..:. . :: ..: :. : ::
CCDS72 NYVDKFREKILSSPYSSYLQQESRSKAKYSYFQGDSTSKQTRSAGCRKGKHKRKKLPEPP
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. ... : ::: . : .: : ::. ::.. :. : :: :.::.
CCDS72 DSSSSNTGSGPRRGAHQNAQPCCPSAASSPHTSSPTFPPAAMVPSQAPYLVPAF-PLPAA
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CCDS72 TSPGREYAAPGTAPEGL-HGLPLSEGLQPYPAFPFPYLDTFMTVFLPDPPVCPLLSPSFL
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CCDS72 PCPFLGATASSAISPSMSSAMSPTLDPPPSVTSQRREEEKWEAQSEGHPFITSRSSSPLQ
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. .::: :: . . : .::: : .: :. : : . ::
CCDS72 SHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASALSTGSPPMKNPSHPTASTLSMGLPPSRTPSHPTAT
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