Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0537
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0537, 661 aa
1>>>pF1KSDA0537 661 - 661 aa - 661 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1627+/-0.00113; mu= 1.2229+/- 0.066
mean_var=265.5583+/-58.577, 0's: 0 Z-trim(110.8): 693 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.078704
statistics sampled from 11100 (11891) to 11100 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 4.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 4417 515.7 8.4e-146
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 1598 195.6 1.9e-49
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 924 119.1 2.1e-26
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 924 119.1 2.3e-26
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 898 116.4 2.6e-25
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 893 115.6 2.7e-25
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 892 115.7 4.1e-25
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 886 114.8 4.4e-25
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 886 114.8 4.5e-25
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 886 114.8 4.5e-25
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 885 114.7 4.9e-25
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 882 114.3 6e-25
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 870 112.9 1.5e-24
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 862 112.0 2.9e-24
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 862 112.0 2.9e-24
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 848 110.5 9.3e-24
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 848 110.5 9.4e-24
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 848 110.5 9.4e-24
CCDS3932.2 PRKAA1 gene_id:5562|Hs108|chr5 ( 559) 822 107.4 5.6e-23
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 818 107.1 9.9e-23
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 818 107.1 9.9e-23
CCDS605.1 PRKAA2 gene_id:5563|Hs108|chr1 ( 552) 801 105.0 2.9e-22
CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 788 103.7 1.2e-21
CCDS12921.1 BRSK1 gene_id:84446|Hs108|chr19 ( 778) 778 102.5 2.3e-21
CCDS41590.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 668) 752 99.5 1.6e-20
CCDS58106.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 674) 752 99.5 1.6e-20
CCDS58107.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 736) 752 99.6 1.7e-20
CCDS59123.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 610) 719 95.7 2e-19
CCDS6606.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 651) 719 95.8 2.1e-19
CCDS58108.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 766) 716 95.5 3e-19
CCDS60696.1 BRSK2 gene_id:9024|Hs108|chr11 ( 614) 675 90.7 6.4e-18
CCDS43075.1 SNRK gene_id:54861|Hs108|chr3 ( 765) 650 88.0 5.4e-17
CCDS3943.1 NIM1K gene_id:167359|Hs108|chr5 ( 436) 643 87.0 6.2e-17
CCDS13610.1 HUNK gene_id:30811|Hs108|chr21 ( 714) 640 86.8 1.1e-16
CCDS59126.1 MELK gene_id:9833|Hs108|chr9 ( 619) 637 86.4 1.3e-16
CCDS65789.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 758) 636 86.4 1.6e-16
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 637 86.6 1.8e-16
CCDS31076.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 465) 612 83.5 7.4e-16
CCDS31077.1 AKT3 gene_id:10000|Hs108|chr1 ( 479) 612 83.5 7.6e-16
CCDS4112.1 TSSK1B gene_id:83942|Hs108|chr5 ( 367) 604 82.5 1.2e-15
CCDS13755.1 TSSK2 gene_id:23617|Hs108|chr22 ( 358) 599 81.9 1.7e-15
CCDS362.1 TSSK3 gene_id:81629|Hs108|chr1 ( 268) 591 80.9 2.6e-15
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 590 80.9 3.5e-15
CCDS33128.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 309) 588 80.6 3.7e-15
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 590 80.9 3.7e-15
CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 ( 454) 585 80.4 6.1e-15
CCDS515.1 PLK3 gene_id:1263|Hs108|chr1 ( 646) 588 80.9 6.2e-15
CCDS46206.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 275) 577 79.3 8e-15
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 579 79.6 8.3e-15
CCDS46205.1 AURKC gene_id:6795|Hs108|chr19 ( 290) 577 79.3 8.3e-15
>>CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 (661 aa)
initn: 4417 init1: 4417 opt: 4417 Z-score: 2731.1 bits: 515.7 E(32554): 8.4e-146
Smith-Waterman score: 4417; 100.0% identity (100.0% similar) in 661 aa overlap (1-661:1-661)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQET
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWALG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPDRRATIEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPDRRATIEDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAKPTTSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAKPTTSEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD MLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRPKGILKKRSNSEHRSHSTGFIEGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRPKGILKKRSNSEHRSHSTGFIEGV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQSATMPKKGILKKTQQRESGYYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQSATMPKKGILKKTQQRESGYYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLSCRRKGILKHSSKYSAGTMDPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLSCRRKGILKHSSKYSAGTMDPAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYRNRLADSSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYRNRLADSSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKL
610 620 630 640 650 660
pF1KSD N
:
CCDS31 N
>>CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 (672 aa)
initn: 2061 init1: 1389 opt: 1598 Z-score: 1001.1 bits: 195.6 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 2149; 57.2% identity (74.5% similar) in 656 aa overlap (24-660:65-671)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEP-RKPHGVKRHHHKHNLK
: . : . .: : ..::::::::::.
CCDS14 PAALAHLLLAMESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLR
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KSD HRYELQETLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNH
::::. ::::::::::::.: : :::.::::::::::::::::..::::::::::::::
CCDS14 HRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNH
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KSD PHIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKN
::::.:.:::::..::::.:::::.:.::::::::..:::::.:::::::::::::::.:
CCDS14 PHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQN
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GVVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGP
:::::::::::::: : :::::::::::::.. ::::::::::::::::::::.:: ::
CCDS14 RVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGP
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPD
:::::.:::::: ::.::::::: ::: :..:::.: :::: .:::: :::::.:::::
CCDS14 EVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDACGLIRWLLMVNPT
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340
pF1KSD RRATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESP----LLARIIDWHHRSTGLQADTEAK
::::.::.:.:::::::: . : . .: :.. : : . :: .::. .. ::
CCDS14 RRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAK
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390
pF1KSD MKGLAK---PT--TSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQ----DAVPESPSKLSSKRPKG
. .. : : .. ::::.:::::.::::.::: . : . . :.: . : :::
CCDS14 VCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKG
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KSD ILKKRSNSEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQS
::::. .. ::: ..: : : :: :.
CCDS14 ILKKKVSAS--------AEGV-----------QED-----------PPELSPIPASPGQA
460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ATM-PKKGILKKTQQRESGYYSSPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLS
: . :::::::: .::::::::::: :::.::::..::. :. :. . : : .:
CCDS14 APLLPKKGILKKPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQAS----GLL
490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD CRRKGILKHSSKYSAGTMDPALVSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVL
.:::::: ..:.: ... :..: :. ::.: . : . :.:. ::::...:.::.:
CCDS14 LHRKGILKLNGKFSQTALE--LAAP--TTFGSLDELA-PPRPLARA-SRPSGAVSEDSIL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SSDSFDLLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPR--P-QYLKRYR-NRLAD
::.::: ::: : : . .:.:::..:. ::.. : : . :.:.: . :.:
CCDS14 SSESFDQLDLPERLP-EPPLRGCVSVDNLT------GLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGD
600 610 620 630 640
640 650 660
pF1KSD SSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKLN
: ::: :: ..:: .:.:::..::::
CCDS14 SCFSL-TDCQEVTATYRQALRVCSKLT
650 660 670
>>CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 (688 aa)
initn: 773 init1: 684 opt: 924 Z-score: 587.4 bits: 119.1 E(32554): 2.1e-26
Smith-Waterman score: 924; 33.3% identity (62.9% similar) in 574 aa overlap (6-563:8-561)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAG---ATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRY
:: ..:: . :. :: : . : .. .: : ... ... :
CCDS12 MSSRTVLAP-GNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ELQETLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHI
.: .:.:::...::: : . ..:: :::: : : .. . ... .. ::..::..::::.:
CCDS12 RLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQL-NPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVV
....::.:.. . ..::::: ::..::. . :..:.:.: ::::::::::::....:
CCDS12 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD HRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVD
::::: ::.::: . ::::::::.:: . . :.:::::: ::.::. .:. : :::::
CCDS12 HRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPS-DARGLIRWMLMVNPDRR
:.:::.::::: :..:::: . :.: ... :.:: : : : ....: .:..:: .:
CCDS12 IWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAK
:.:.: . :.: ::.. . . . :: . .:. : ..:..
CCDS12 CTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRI----EVMVGMGYTREEIKESLTS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD PTTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSG---------QDAVPESPSKLSSKRPKGILKKRS
.:: .:... .: . : .:.. . :. .... :: .. :
CCDS12 QKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKG-QRSSS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD NSEHRS--HSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQSATMP
.. ::. :: ::. :. .. ... :: : ..::. . ..:
CCDS12 STYHRQRRHSD-----FCGPS-PAPLHPKRSPTSTGE--AELKEERLPGRKASCSTAGSG
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KKGILKKTQQRESGYYSSPERSESSELL-DSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLSCRRK
..:. .. . :.. .:...: : ::... .. :: . : .. . .:
CCDS12 SRGLPPSSPMVSSAH--NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERP
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD GILKHSSKYSAGTMDPALVSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDS
..: .... :.:: : : : :. .::. :. :.:
CCDS12 SLLPNGKENSSGT--PR-VPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAG
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KSD FDLLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYRNRLADSSFSLLTD
CCDS12 GGGGGGVQNGPPASPTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVTLDPSKRQNSNRC
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:: ..:: . :. :: : . : .. .: : ... ... :
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....::.:.. . ..::::: ::..::. . :..:.:.: ::::::::::::....:
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::::: ::.::: . ::::::::.:: . . :.:::::: ::.::. .:. : :::::
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:.:::.::::: :..:::: . :.: ... :.:: : : : ....: .:..:: .:
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:.:.: . :.: ::.. . . . :: . .:. : ..:..
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.:: .:... .: . : .:.. . :. .... :: .. :
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.. ::. :: ::. :. .. ... :: : ..::. . ..:
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..:. .. . :.. .:...: : ::... .. :: . : .. . .:
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..: .... :.:: : : : :. .::. :. :.:
CCDS56 SLLPNGKENSSGT--PR-VPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAG
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CCDS56 GGGGGGVQNGPPASPTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVADEPERIGGPEVT
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10 20 30 40
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::. : ::::: .:.:.:.. : .. :::: ::..:.. . :..:.:.:. :.:::.:
CCDS83 IMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTA
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:..:: ..:::::: ::.::: : ::::::::.:::. ..:.:.:::: ::.::. .
CCDS83 VYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFE
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CCDS83 GKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIR
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CCDS83 HMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVL-LAME
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. :: : : ...: . . .. . . :... . . : :.: : :. . :
CCDS83 DMGL--DKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTL-RLG--ALPSMPRALAFQAP
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.: .....
CCDS83 VNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHT
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:.:....::.:.. . ..::::: ::..::. . :..:.:.: ::::::::.:::..
CCDS53 PNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQK
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.:::::: ::.::: . ::::::::.:: . . :.:::::: ::.::. .:. : ::
CCDS53 FIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGP
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::: :.:::.::::: :..:::: . :.: ... :.:: : : : ..:.. .:..::
CCDS53 EVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNP
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CCDS53 SKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELM------VSMGYTREEIQ
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pF1KSD KGLAKPTTSEVMLERQR-SLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLS-SKRPKGILK-KRSN
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CCDS53 DSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTIT----LKPRPSADLTNSSAPSPSHKVQRSV
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: . .. : . ..:::.:.. .. . ... . :: . . . ...: .: .
CCDS53 SANPKQRR-FSDQAAGPAIPTSNSYSKKT-QSNNAENKRPEEDRESGRKASSTAKVPASP
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pF1KSD --GILKK----TQQRESGYYSSPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPS-----PPDPARVTS
:. .: : . .: .: .::..: ::. .. .:: . . : . : ..:
CCDS53 LPGLERKKTTPTPSTNSVLSTSTNRSRNSPLLERASLGQASIQNGKDSLTMPGSRASTAS
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: . .:....:: .. : .: .: :: : :. . .: : . :
CCDS53 ASAAVSAARPRQHQKSMSA-SVHPNKASG-LPPTESNCEVPRPSTAPQRV---PVASPSA
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pF1KSD DSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYRNRLAD
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CCDS53 HNISSSGGAP--D-RTNFPRGVSSRSTFHAGQLRQVRDQQNLPYGVTPASPSGHSQGRRG
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pF1KSD SSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKLN
CCDS53 ASGSIFSKFTSKFVRRNLSFRFARRNLNEPESKDRVETLRPHVVGSGGNDKEKEEFREAK
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CCDS60 GKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIR
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CCDS60 HMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMED
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CCDS60 MGLDKEQTLQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQ-IVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRY
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CCDS60 LSMRRHTVGVADPRTEVMEDLQKLLPGF-PGV-NPQAP-FLQVAPNVNFMHNLLPMQ-NL
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. :.: : :: .:
CCDS60 QPTGQLEYKEQSLLQPPTLQLLNGMGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMT
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CCDS41 MSTRTPLPTVNERDTENHTSHGDGRQEVTSRTSRSGARCRNSIASCADEQPHIGNYRLLK
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CCDS41 TIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQL-NPTSLQKLFREVRIMKILNHPNIVKLF
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CCDS41 KAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTVGGKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSL
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pF1KSD GVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPS-DARGLIRWMLMVNPDRRATIE
::.::::: :..:::: . :.: ... :.:: : : : ..:.. .:..:: .:.:.:
CCDS41 GVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKRFLVLNPIKRGTLE
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD DIANHWWVNWGYKSSVCD---CDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAKP
.: . :.: :.. . : :.. . .. . . .: .. .::: .
CCDS41 QIMKDRWINAGHEEDELKPFVEPELDISDQKRIDIMVGMGYSQEEIQ-ESLSKMK-YDEI
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD TTSEVMLERQRS-LKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSS-KRPKGILKKRSNSEHRS--
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CCDS41 TATYLLLGRKSSELDASDSSSSSNLSLAKVRPSSDLNNSTGQSPHHKVQRSVSSSQKQRR
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pF1KSD ---HSTGFIEGVVG-PALPSTFKMEQDLCRTGV--------------LLPSSP---EAEV
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CCDS41 YSDHAGPAIPSVVAYPKRSQTSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASN
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:.: . : :.:.:.:... . . :.. : : . . . . . .: .:.::. :
CCDS41 PNKADIPERKKSSTVPSSNTASGGMTRRNTYVCSERTTADRHSVIQNGKENSTIPDQRTP
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pF1KSD DPARVTSHSLSCRRKGILKHSSKYSAGTMDPALVSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSR
...::.: .. .. :: . . . .. . : :: : : :.
CCDS41 ---VASTHSIS---SAATPDRIRFPRGTASRSTFHGQPRERRTATYNGPPA---SPSLSH
540 550 560 570 580
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pF1KSD PSSVISDDSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKR
.. .:. : : .:.. .. .:.: :::: : :. . .::
CCDS41 EATPLSQTR--SRGSTNLFSKLTSKLTRSR---NVSAE-----QKDENKEAKPRSLRFTW
590 600 610 620 630
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pF1KSD YRNRLADSSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKLN
CCDS41 SMKTTSSMDPGDMMREIRKVLDANNCDYEQRERFLLFCVHGDGHAENLVQWEMEVCKLPR
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]