Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0537
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0537, 661 aa
1>>>pF1KSDA0537 661 - 661 aa - 661 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0618+/-0.000496; mu= 3.3139+/- 0.030
mean_var=420.8942+/-95.549, 0's: 0 Z-trim(118.7): 2157 B-trim: 1927 in 2/56
Lambda= 0.062516
statistics sampled from 29294 (31959) to 29294 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.718), E-opt: 0.2 (0.375), width: 16
Scan time: 11.250
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055655 (OMIM: 608130) NUAK family SNF1-like kin ( 661) 4417 413.8 1e-114
NP_112214 (OMIM: 608131) NUAK family SNF1-like kin ( 672) 1598 159.5 3.6e-38
NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity- ( 688) 924 98.7 7.3e-20
NP_001186796 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affini ( 752) 924 98.8 7.7e-20
XP_011541028 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre ( 660) 898 96.4 3.6e-19
XP_005271541 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1261) 898 96.8 5.2e-19
XP_011541024 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1309) 898 96.8 5.4e-19
NP_079440 (OMIM: 614776) serine/threonine-protein (1321) 898 96.8 5.4e-19
XP_011543095 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 784) 893 96.0 5.5e-19
NP_001034558 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 788) 893 96.0 5.5e-19
XP_011541023 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 898 96.8 5.5e-19
XP_005271538 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 898 96.8 5.5e-19
XP_011543094 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 793) 893 96.0 5.5e-19
XP_011543092 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 799) 893 96.0 5.5e-19
XP_011543091 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 808) 893 96.0 5.6e-19
XP_016872913 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1213) 892 96.2 7.5e-19
NP_001268678 (OMIM: 614776) serine/threonine-prote (1261) 892 96.2 7.6e-19
XP_005271539 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1321) 892 96.3 7.8e-19
NP_002367 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affinity- ( 729) 886 95.4 8.1e-19
XP_005267698 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 738) 886 95.4 8.2e-19
NP_001122391 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 744) 886 95.4 8.2e-19
NP_001122390 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 753) 886 95.4 8.3e-19
NP_059672 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 745) 885 95.3 8.8e-19
XP_016872799 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 763) 885 95.3 8.9e-19
XP_011543093 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 798) 885 95.3 9.1e-19
NP_001122392 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 713) 882 95.0 1e-18
XP_005267700 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 643) 881 94.8 1e-18
XP_016876781 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 722) 882 95.0 1e-18
XP_016876780 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 728) 882 95.0 1e-18
XP_005267699 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 737) 882 95.0 1.1e-18
XP_006720209 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 739) 878 94.6 1.4e-18
XP_016876782 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 708) 874 94.2 1.7e-18
NP_001156768 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 719) 870 93.9 2.2e-18
XP_011543099 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 739) 870 93.9 2.2e-18
XP_011543097 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 745) 870 93.9 2.2e-18
NP_001156769 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 709) 862 93.2 3.6e-18
NP_004945 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 724) 862 93.2 3.6e-18
XP_011543100 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 729) 862 93.2 3.6e-18
XP_016872800 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 738) 862 93.2 3.7e-18
XP_011543098 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 744) 862 93.2 3.7e-18
XP_011543096 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 753) 862 93.2 3.7e-18
NP_001273055 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 780) 848 92.0 9.1e-18
XP_005273191 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 781) 848 92.0 9.1e-18
XP_011507863 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 788) 848 92.0 9.2e-18
NP_061120 (OMIM: 606511) serine/threonine-protein ( 795) 848 92.0 9.2e-18
NP_001273053 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 796) 848 92.0 9.2e-18
XP_006723370 (OMIM: 606495) PREDICTED: MAP/microtu ( 685) 842 91.3 1.2e-17
NP_006242 (OMIM: 602739) 5'-AMP-activated protein ( 559) 822 89.4 3.8e-17
XP_011527776 (OMIM: 605705,616341) PREDICTED: seri ( 734) 822 89.6 4.5e-17
NP_775490 (OMIM: 605705,616341) serine/threonine-p ( 783) 818 89.3 5.9e-17
>>NP_055655 (OMIM: 608130) NUAK family SNF1-like kinase (661 aa)
initn: 4417 init1: 4417 opt: 4417 Z-score: 2180.3 bits: 413.8 E(85289): 1e-114
Smith-Waterman score: 4417; 100.0% identity (100.0% similar) in 661 aa overlap (1-661:1-661)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRYELQET
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHIISIYE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDLK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVDSWALG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPDRRATIEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPDRRATIEDI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAKPTTSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAKPTTSEV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD MLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRPKGILKKRSNSEHRSHSTGFIEGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRPKGILKKRSNSEHRSHSTGFIEGV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQSATMPKKGILKKTQQRESGYYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQSATMPKKGILKKTQQRESGYYS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLSCRRKGILKHSSKYSAGTMDPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLSCRRKGILKHSSKYSAGTMDPAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDSFDLLDLQENRPARQRIRS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYRNRLADSSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CVSAENFLQIQDFEGLQNRPRPQYLKRYRNRLADSSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKL
610 620 630 640 650 660
pF1KSD N
:
NP_055 N
>>NP_112214 (OMIM: 608131) NUAK family SNF1-like kinase (672 aa)
initn: 2061 init1: 1389 opt: 1598 Z-score: 806.2 bits: 159.5 E(85289): 3.6e-38
Smith-Waterman score: 2149; 57.2% identity (74.5% similar) in 656 aa overlap (24-660:65-671)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEP-RKPHGVKRHHHKHNLK
: . : . .: : ..::::::::::.
NP_112 PAALAHLLLAMESLVFARRSGPTPSAAELARPLAEGLIKSPKPLMKKQAVKRHHHKHNLR
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KSD HRYELQETLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNH
::::. ::::::::::::.: : :::.::::::::::::::::..::::::::::::::
NP_112 HRYEFLETLGKGTYGKVKKARES-SGRLVAIKSIRKDKIKDEQDLMHIRREIEIMSSLNH
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KSD PHIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKN
::::.:.:::::..::::.:::::.:.::::::::..:::::.:::::::::::::::.:
NP_112 PHIIAIHEVFENSSKIVIVMEYASRGDLYDYISERQQLSEREARHFFRQIVSAVHYCHQN
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GVVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGP
:::::::::::::: : :::::::::::::.. ::::::::::::::::::::.:: ::
NP_112 RVVHRDLKLENILLDANGNIKIADFGLSNLYHQGKFLQTFCGSPLYASPEIVNGKPYTGP
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPSDARGLIRWMLMVNPD
:::::.:::::: ::.::::::: ::: :..:::.: :::: .:::: :::::.:::::
NP_112 EVDSWSLGVLLYILVHGTMPFDGHDHKILVKQISNGAYREPPKPSDACGLIRWLLMVNPT
280 290 300 310 320 330
300 310 320 330 340
pF1KSD RRATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESP----LLARIIDWHHRSTGLQADTEAK
::::.::.:.:::::::: . : . .: :.. : : . :: .::. .. ::
NP_112 RRATLEDVASHWWVNWGYATRVGEQEAPHEGGHPGSDSARASMADWLRRSSRPLLENGAK
340 350 360 370 380 390
350 360 370 380 390
pF1KSD MKGLAK---PT--TSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQ----DAVPESPSKLSSKRPKG
. .. : : .. ::::.:::::.::::.::: . : . . :.: . : :::
NP_112 VCSFFKQHAPGGGSTTPGLERQHSLKKSRKENDMAQSLHSDTADDTAHRPGKSNLKLPKG
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KSD ILKKRSNSEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQS
::::. .. ::: ..: : : :: :.
NP_112 ILKKKVSAS--------AEGV-----------QED-----------PPELSPIPASPGQA
460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD ATM-PKKGILKKTQQRESGYYSSPERSESSELLDSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLS
: . :::::::: .::::::::::: :::.::::..::. :. :. . : : .:
NP_112 APLLPKKGILKKPRQRESGYYSSPEPSESGELLDAGDVFVSGDPKEQKPPQAS----GLL
490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KSD CRRKGILKHSSKYSAGTMDPALVSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVL
.:::::: ..:.: ... :..: :. ::.: . : . :.:. ::::...:.::.:
NP_112 LHRKGILKLNGKFSQTALE--LAAP--TTFGSLDELA-PPRPLARA-SRPSGAVSEDSIL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KSD SSDSFDLLDLQENRPARQRIRSCVSAENFLQIQDFEGLQNRPR--P-QYLKRYR-NRLAD
::.::: ::: : : . .:.:::..:. ::.. : : . :.:.: . :.:
NP_112 SSESFDQLDLPERLP-EPPLRGCVSVDNLT------GLEEPPSEGPGSCLRRWRQDPLGD
600 610 620 630 640
640 650 660
pF1KSD SSFSLLTDMDDVTQVYKQALEICSKLN
: ::: :: ..:: .:.:::..::::
NP_112 SCFSL-TDCQEVTATYRQALRVCSKLT
650 660 670
>>NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity-regu (688 aa)
initn: 773 init1: 684 opt: 924 Z-score: 477.6 bits: 98.7 E(85289): 7.3e-20
Smith-Waterman score: 924; 33.3% identity (62.9% similar) in 574 aa overlap (6-563:8-561)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAG---ATAALEPRKPHGVKRHHHKHNLKHRY
:: ..:: . :. :: : . : .. .: : ... ... :
NP_113 MSSRTVLAP-GNDRNSDTHGTLGSGRSSDKGPSWSSRSLGARCRNSIASCPEEQPHVGNY
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD ELQETLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDMVHIRREIEIMSSLNHPHI
.: .:.:::...::: : . ..:: :::: : : .. . ... .. ::..::..::::.:
NP_113 RLLRTIGKGNFAKVKLARHILTGREVAIKIIDKTQL-NPSSLQKLFREVRIMKGLNHPNI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD ISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSAVHYCHKNGVV
....::.:.. . ..::::: ::..::. . :..:.:.: ::::::::::::....:
NP_113 VKLFEVIETEKTLYLVMEYASAGEVFDYLVSHGRMKEKEARAKFRQIVSAVHYCHQKNIV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD HRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVNGRPYRGPEVD
::::: ::.::: . ::::::::.:: . . :.:::::: ::.::. .:. : :::::
NP_113 HRDLKAENLLLDAEANIKIADFGFSNEFTLGSKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPS-DARGLIRWMLMVNPDRR
:.:::.::::: :..:::: . :.: ... :.:: : : : ....: .:..:: .:
NP_113 IWSLGVILYTLVSGSLPFDGHNLKELRERVLRGKYRVPFYMSTDCESILRRFLVLNPAKR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ATIEDIANHWWVNWGYKSSVCDCDALHDSESPLLARIIDWHHRSTGLQADTEAKMKGLAK
:.:.: . :.: ::.. . . . :: . .:. : ..:..
NP_113 CTLEQIMKDKWINIGYEGEELKPYTEPEEDFGDTKRI----EVMVGMGYTREEIKESLTS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KSD PTTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSG---------QDAVPESPSKLSSKRPKGILKKRS
.:: .:... .: . : .:.. . :. .... :: .. :
NP_113 QKYNEVTATYLLLGRKTEEGGDRGAPGLALARVRAPSDTTNGTSSSKGTSHSKG-QRSSS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD NSEHRS--HSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPKQSATMP
.. ::. :: ::. :. .. ... :: : ..::. . ..:
NP_113 STYHRQRRHSD-----FCGPS-PAPLHPKRSPTSTGE--AELKEERLPGRKASCSTAGSG
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD KKGILKKTQQRESGYYSSPERSESSELL-DSNDVMGSSIPSPSPPDPARVTSHSLSCRRK
..:. .. . :.. .:...: : ::... .. :: . : .. . .:
NP_113 SRGLPPSSPMVSSAH--NPNKAEIPERRKDSTSTPNNLPPSMMTRRNTYVCTERPGAERP
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD GILKHSSKYSAGTMDPALVSPEMPTLESLSEPGVPAEGLSRSYSRPSSVISDDSVLSSDS
..: .... :.:: : : : :. .::. :. :.:
NP_113 SLLPNGKENSSGT--PR-VPPASPSSHSLAPPSGERSRLARGSTIRSTFHGGQVRDRRAG
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
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10 20 30 40 50
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:: ..:: . :. :: : . : .. .: : ... ... :
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.: .:.:::...::: : . ..:: :::: : : .. . ... .. ::..::..::::.:
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60 70 80 90 100 110
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....::.:.. . ..::::: ::..::. . :..:.:.: ::::::::::::....:
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::::: ::.::: . ::::::::.:: . . :.:::::: ::.::. .:. : :::::
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:.:::.::::: :..:::: . :.: ... :.:: : : : ....: .:..:: .:
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:.:.: . :.: ::.. . . . :: . .:. : ..:..
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.:: .:... .: . : .:.. . :. .... :: .. :
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.. ::. :: ::. :. .. ... :: : ..::. . ..:
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..:. .. . :.. .:...: : ::... .. :: . : .. . .:
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..: .... :.:: : : : :. .::. :. :.:
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NP_001 GGGGGGVQNGPPASPTLAHEAAPLPAGRPRPTTNLFTKLTSKLTRRVADEPERIGGPEVT
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10 20 30 40
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XP_011 IMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTA
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pF1KSD GRPYRGPEVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPT-QPSDARGLIR
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.: .....
XP_011 VNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHT
410 420 430 440 450 460
>>XP_005271541 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/threonin (1261 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRH
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pF1KSD IMSSLNHPHIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSA
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XP_005 IMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTA
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pF1KSD VHYCHKNGVVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVN
:..:: ..:::::: ::.::: : ::::::::.:::. ..:.:.:::: ::.::. .
XP_005 VYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFE
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pF1KSD GRPYRGPEVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPT-QPSDARGLIR
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XP_005 GKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIR
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pF1KSD WMLMVNPDRRATIEDIANHWWVNWG-----YKSSVCDCDALHDSES--PLLARIIDWHHR
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XP_005 HMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVL-LAME
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pF1KSD STGLQADTEAKMKGLAKPTTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRP
. :: : : ...: . . .. . . :... . . : :.: : :. . :
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.: .....
XP_005 VNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHT
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>>XP_011541024 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/threonin (1309 aa)
initn: 796 init1: 670 opt: 898 Z-score: 462.1 bits: 96.8 E(85289): 5.4e-19
Smith-Waterman score: 898; 37.8% identity (67.8% similar) in 413 aa overlap (3-407:18-419)
10 20 30 40
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRH
:.:.:.. : ::::: .: . :: .:: : ..:
XP_011 MAAAAASGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPP---PAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRG
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XP_011 PMPARIGY-YEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQL-DEENLKKIFREVQ
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD IMSSLNHPHIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSA
::. : ::::: .:.:.:.. : .. :::: ::..:.. . :..:.:.:. :.:::.:
XP_011 IMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTA
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pF1KSD VHYCHKNGVVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVN
:..:: ..:::::: ::.::: : ::::::::.:::. ..:.:.:::: ::.::. .
XP_011 VYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFE
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pF1KSD GRPYRGPEVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPT-QPSDARGLIR
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XP_011 GKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIR
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pF1KSD WMLMVNPDRRATIEDIANHWWVNWG-----YKSSVCDCDALHDSES--PLLARIIDWHHR
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XP_011 HMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVL-LAME
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pF1KSD STGLQADTEAKMKGLAKPTTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRP
. :: : : ...: . . .. . . :... . . : :.: : :. . :
XP_011 DMGL--DKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTL-RLG--ALPSMPRALAFQAP
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pF1KSD KGILKKRSNSEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPK
.: .....
XP_011 VNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHT
410 420 430 440 450 460
>>NP_079440 (OMIM: 614776) serine/threonine-protein kina (1321 aa)
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10 20 30 40
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGLGAPGSPREAVAGATAALEPRKPHGVKRH
:.:.:.. : ::::: .: . :: .:: : ..:
NP_079 MAAAAASGAGGAAGAGTGGAGPAGRLLPP---PAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRG
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NP_079 PMPARIGY-YEIDRTIGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQL-DEENLKKIFREVQ
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pF1KSD IMSSLNHPHIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRHFFRQIVSA
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NP_079 IMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTA
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pF1KSD VHYCHKNGVVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPLYASPEIVN
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NP_079 VYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFE
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD GRPYRGPEVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPT-QPSDARGLIR
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NP_079 GKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIR
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KSD WMLMVNPDRRATIEDIANHWWVNWG-----YKSSVCDCDALHDSES--PLLARIIDWHHR
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NP_079 HMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVL-LAME
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pF1KSD STGLQADTEAKMKGLAKPTTSEVMLERQRSLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLSSKRP
. :: : : ...: . . .. . . :... . . : :.: : :. . :
NP_079 DMGL--DKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYSLLCDRHKRHKTL-RLG--ALPSMPRALAFQAP
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pF1KSD KGILKKRSNSEHRSHSTGFIEGVVGPALPSTFKMEQDLCRTGVLLPSSPEAEVPGKLSPK
.: .....
NP_079 VNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINPENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHT
410 420 430 440 450 460
>>XP_011543095 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/threonin (784 aa)
initn: 768 init1: 665 opt: 893 Z-score: 461.9 bits: 96.0 E(85289): 5.5e-19
Smith-Waterman score: 895; 32.4% identity (61.4% similar) in 627 aa overlap (10-616:36-631)
10 20 30
pF1KSD MEGAAAPVAGDRPDLGL--GAPGSPREAVAGATAALEPR
: : :: . :.: . . : ..:
XP_011 SPFPFLQSVACLLTLAHIPAVGNILQHRRRGAGPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSAT---
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD KPHGVKRHHHKHNLKHRYELQETLGKGTYGKVKRATERFSGRVVAIKSIRKDKIKDEQDM
.. .. : : :.: .:.:::...::: : . ..:. ::.: : : .. . ...
XP_011 ---SADEQPHIGN----YRLLKTIGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQL-NSSSL
70 80 90 100 110
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pF1KSD VHIRREIEIMSSLNHPHIISIYEVFENKDKIVIIMEYASKGELYDYISERRRLSERETRH
.. ::..::. ::::.:....::.:.. . ..::::: ::..::. . :..:.:.:
XP_011 QKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEVIETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FFRQIVSAVHYCHKNGVVHRDLKLENILLDDNCNIKIADFGLSNLYQKDKFLQTFCGSPL
::::::::.:::.. .:::::: ::.::: . ::::::::.:: . . :.::::::
XP_011 KFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKAENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPP
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KSD YASPEIVNGRPYRGPEVDSWALGVLLYTLVYGTMPFDGFDHKNLIRQISSGEYREPTQPS
::.::. .:. : ::::: :.:::.::::: :..:::: . :.: ... :.:: : :
XP_011 YAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGVILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMS
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD -DARGLIRWMLMVNPDRRATIEDIANHWWVNWGYKSSVCD--CDALHDSESPLLARIIDW
: ..:.. .:..::..:.:.:.: . :.: :.... . : : ..: ....
XP_011 TDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQIMKDRWMNVGHEDDELKPYVEPLPDYKDPRRTELM--
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD HHRSTGLQADTEAKMKGLAKPTTSEVMLERQR-SLKKSKKENDFAQSGQDAVPESPSKLS
... : . .:. .::: . :.:. :.: :. . :.
XP_011 ----VSMGYTREEIQDSLVGQRYNEVMATYLLLGYKSSELEGDTIT----LKPRPSADLT
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