Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0558
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0558, 1145 aa
1>>>pF1KSDA0558 1145 - 1145 aa - 1145 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1133+/-0.00107; mu= 14.9989+/- 0.065
mean_var=140.3742+/-28.155, 0's: 0 Z-trim(108.9): 22 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.108251
statistics sampled from 10480 (10497) to 10480 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.662), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16
Scan time: 5.020
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS63647.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1145) 7789 1229.1 0
CCDS33763.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1143) 7748 1222.6 0
CCDS54588.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1150) 7715 1217.5 0
CCDS77748.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1076) 7268 1147.7 0
CCDS5598.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 (1091) 3937 627.5 5.3e-179
CCDS44785.1 CACNA2D4 gene_id:93589|Hs108|chr12 (1137) 1539 253.0 3e-66
CCDS54598.1 CACNA2D3 gene_id:55799|Hs108|chr3 (1091) 1430 235.9 3.9e-61
CCDS78253.1 CACNA2D1 gene_id:781|Hs108|chr7 ( 309) 1040 174.6 3.2e-43
>>CCDS63647.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1145 aa)
initn: 7789 init1: 7789 opt: 7789 Z-score: 6578.0 bits: 1229.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7789; 100.0% identity (100.0% similar) in 1145 aa overlap (1-1145:1-1145)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD ASRRL
:::::
CCDS63 ASRRL
>>CCDS33763.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1143 aa)
initn: 7748 init1: 7244 opt: 7748 Z-score: 6543.4 bits: 1222.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7748; 99.7% identity (99.8% similar) in 1145 aa overlap (1-1145:1-1143)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::
CCDS33 SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH--SDGPEQCEL
1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD ASRRL
:::::
CCDS33 ASRRL
1140
>>CCDS54588.1 CACNA2D2 gene_id:9254|Hs108|chr3 (1150 aa)
initn: 4953 init1: 4449 opt: 7715 Z-score: 6515.5 bits: 1217.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7715; 99.0% identity (99.1% similar) in 1152 aa overlap (1-1145:1-1150)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KSD KY-------FEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSK
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KLPISKLKDFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSK
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD QCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTE
730 740 750 760 770 780
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVF
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pF1KSD VPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQY
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:
CCDS54 YFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH--SD
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1080 1090 1100 1110 1120 1130
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRP
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1140
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CCDS54 QPQVLVHASRRL
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CCDS77 MQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYK
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CCDS77 DNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDI
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CCDS77 VYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGST
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CCDS77 VILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRR
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CCDS77 PWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPV
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CCDS77 SCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMF
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CCDS77 TDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 INTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VLPPYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 NFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TRVFPNKAAEDWTENPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVST
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pF1KSD AVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 QPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSP
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pF1KSD ETRESSCVMKQTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ETRESSCVMKQTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCE
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pF1KSD AGRLLQKETHCPADGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AGRLLQKETHCPADGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLV
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CCDS77 SLQLLLLLGLPPRPQPQVLVHASRRL
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: : : :. : .: ::. :.. :
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. ...... . . .::.:: .::. ..:. :. :. ..::: .: :::.::. . .:
CCDS55 VDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKA
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pF1KSD LKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIE
: ::: ::. : ::.:.... ...:::.:: : :::..: : ::. .. :::
CCDS55 LVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFIE
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: :: ...:..:::.::::::.:::..::::::: ::..:: .::..::.:::::::::
CCDS55 DANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSA
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pF1KSD TGVTRYYPATPW----RAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKL
::..:::::.:: :.:.:::::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::::
CCDS55 TGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKL
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pF1KSD MKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTT
..::: :::.::::::.::::::: .:: :::: ::::::::::::.:.::....::: :
CCDS55 IRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGIT
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pF1KSD GYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVG
:: :: .::.:: : :..::::::.::.::::::.:.:..:.::: .. :::::::::
CCDS55 DYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSVG
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pF1KSD QHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVY
::::: :.::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::
CCDS55 QHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVY
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pF1KSD EDALGLGLVVTGTLPVFNLTQ--DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANG
::: ::::.::::::::.: .. . ::::::::::.::.:.::::::: .:: ::
CCDS55 LDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNG
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pF1KSD YVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIR
: :::: ::::::::::.:.. . .:::::::::::::.. : ::: .::::..:.: .:
CCDS55 YYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFR
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pF1KSD TLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQ-------V
::::: ::::::. .:.:::.:. .:.:::.:::: :: .:..:.: . : : .
CCDS55 TLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGKM
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pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
: : : :..:: :..:::::.::.::. :::::::: :: :.... ::.. .:: :.
CCDS55 KDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLI
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pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
. ..::.:.:..::. : : : .. : :..::::::::.:..:.:.: :::: ..
CCDS55 NRVLLDAGFTNELVQNYWSKQK-NIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYED
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pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
:::.::::: .::: :. . : :. ::.:: :::. . . :.:::::.:.:
CCDS55 SFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKS-GPGAYES---GIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKID
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pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKC-GPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNH
...: :.: ..: .: : :: : ::. :.. . ::..::::::...:..
CCDS55 VNSWIENF-----TKTSIRDP--CAGPV--C--DCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDD
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pF1KSD QWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVAD
.:.::::.:.: .:: : : : :. ..:::::..: : . ::. :...::.:::
CCDS55 YTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVAD
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pF1KSD FLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEG-SPETRESSCVMKQTQYYFGSV
.:...::..:::::..::.: .: . ..: : . . ..::. .::::.: .
CCDS55 ILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDND
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pF1KSD NASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQC
. :.....:::::::.::...: ::::.:...:. :.. :.: : .:::. :
CCDS55 SKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQ--TSDGPNPC
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pF1KSD ELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVL
..:..::::.:: .::: :. :: .::: ... ::: ....:.:::
CCDS55 DMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
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1140
pF1KSD VHASRRL
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10 20 30 40
pF1KSD MAVPARTCGASR----PGPARTARPWPGCGPHPGPGTRR-PTSGPPRP----------LW
:: : :.: : :. .:. ..: : . : ::
CCDS44 MVCGCSALLPLPNPRPTMPATPNFLANPSSSSRWIPLQPMPVAWAFVQKTSALLW
10 20 30 40 50
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pF1KSD LLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLF
:: :: .:. . ..: . :.. :: . .. ... ..: :.. ::: .. .
CCDS44 LL--LLGTSLSPAWGQAKIPLE-TVKLWADTFGGDLYNTVTKYSGSLLLQKKYKDVESSL
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD EVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAK
...: . .::.: . :.:..: :::.:.. :..:::. . :...... . ::..
CCDS44 KIEEVDGLELVRKFSEDMENMLRRKVEAVQNLVEAAEEADLNHEFNESLVFD---YYNSV
120 130 140 150 160
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pF1KSD ADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPN--FKN-KVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVIL
: :. ... :: :. .:. . : :.: :: : ..::.::..:. . ::
CCDS44 LINERDE-KGNFVELGA-------EFLLESNAHFSNLPVNTSISSVQLPTNVYNKDPDIL
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230 240 250 260 270 280
pF1KSD NELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKK-IDLYDVRRRPW
: . .:::. ::.:: ..:::: :: :::::: : ::. : .. . .: : : :
CCDS44 NGVYMSEALNAVFVENFQRDPTLTWQYFGSATGFFRIYPGIKWTPDENGVITFDCRNRGW
230 240 250 260 270 280
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pF1KSD YIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVS-
:::.:.::::.::.::::::..:: . . : .. .::::...:..:. ..:. .. .
CCDS44 YIQAATSPKDIVILVDVSGSMKGLRMTIAKHTITTILDTLGENDFINIIAYNDYVHYIEP
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD CFTH-LVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRAN--CNKMIM
:: ::::. :.. :: :. ...::. ... ::. :.. . .. . ::. ::
CCDS44 CFKGILVQADRDNREHFKLLVEELMVKGVGVVDQALREAFQILKQFQEAKQGSLCNQAIM
350 360 370 380 390 400
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pF1KSD MFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGA
...::. . . ::::::::. :::::. .:.. . ..:.:: ::::: .: ...
CCDS44 LISDGAVEDYEPVFEKYNWPDCKVRVFTYLIGREVSFADRMKWIACNNKGYYTQISTLAD
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD IRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYED-------ALGLGLVVTGTLPVFNLTQ
. :..::: ::.::::. .. ... ::..: : : .: :..: ..:::. .
CCDS44 TQENVMEYLHVLSRPMVI--NHDHDIIWTEAYMDSKLLSSQAQSLTLLTTVAMPVFSKKN
470 480 490 500 510
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pF1KSD DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTN
. ... ..:::.: :::: .. .:.: : ::..::.: :::.: ::.:.: .
CCDS44 E---TRSHGILLGVVGSDVALRELMKLAPRYKLGVHGYAFLNTNNGYILSHPDLRPLYRE
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD FRE--PV----TLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRN
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: .. : .: .:::.:: .. . : .: : .. ..: :. . : .
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:: :.. . . :. .:... . :: .:.. :......:. .: . : :
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:: . . .: .: .:. : : .:... .:: . : . :.
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CCDS44 LR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]