FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0558, 1145 aa
1>>>pF1KSDA0558 1145 - 1145 aa - 1145 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1624+/-0.000418; mu= 14.3305+/- 0.026
mean_var=139.6921+/-27.738, 0's: 0 Z-trim(116.0): 48 B-trim: 44 in 1/54
Lambda= 0.108515
statistics sampled from 26876 (26924) to 26876 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.316), width: 16
Scan time: 14.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001005505 (OMIM: 607082) voltage-dependent calc (1145) 7789 1232.1 0
NP_006021 (OMIM: 607082) voltage-dependent calcium (1143) 7748 1225.7 0
XP_005265638 (OMIM: 607082) PREDICTED: voltage-dep (1144) 7736 1223.8 0
NP_001167522 (OMIM: 607082) voltage-dependent calc (1150) 7715 1220.5 0
XP_011532545 (OMIM: 607082) PREDICTED: voltage-dep (1151) 7703 1218.6 0
NP_001278030 (OMIM: 607082) voltage-dependent calc (1076) 7268 1150.5 0
NP_000713 (OMIM: 114204) voltage-dependent calcium (1091) 3937 629.0 4.7e-179
XP_016868077 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1052) 3888 621.3 9.4e-177
XP_005250630 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1084) 3178 510.2 2.8e-143
XP_005250629 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1086) 3131 502.8 4.6e-141
XP_005250631 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1079) 3043 489.1 6.4e-137
XP_011514874 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1098) 2935 472.1 7.9e-132
XP_005250627 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1103) 2933 471.8 9.9e-132
XP_011514873 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1105) 2922 470.1 3.3e-131
XP_006716181 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1110) 2208 358.3 1.5e-97
XP_011514872 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1110) 2208 358.3 1.5e-97
XP_006716182 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1085) 2178 353.6 3.7e-96
XP_006716183 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep (1071) 2159 350.7 2.9e-95
NP_758952 (OMIM: 608171,610478) voltage-dependent (1137) 1539 253.6 5e-66
NP_060868 (OMIM: 606399) voltage-dependent calcium (1091) 1430 236.5 6.7e-61
XP_005265375 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1085) 1418 234.7 2.4e-60
XP_011532249 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1012) 1315 218.5 1.7e-55
XP_016862340 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 914) 1220 203.6 4.6e-51
XP_011532255 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 617) 1177 196.7 3.6e-49
XP_011532250 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 819) 1143 191.5 1.8e-47
XP_011532254 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 617) 1128 189.1 7.3e-47
XP_011532253 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 619) 1128 189.1 7.3e-47
XP_011532252 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 623) 1128 189.1 7.4e-47
XP_011532251 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 653) 1128 189.1 7.6e-47
XP_016862341 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 654) 1128 189.1 7.6e-47
XP_011532248 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1043) 1128 189.2 1.1e-46
XP_011519343 (OMIM: 608171,610478) PREDICTED: volt (1133) 1110 186.4 8.3e-46
XP_006716184 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-dep ( 580) 1097 184.2 2e-45
NP_001289819 (OMIM: 114204) voltage-dependent calc ( 309) 1040 175.1 6e-43
XP_016862339 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep (1061) 1021 172.5 1.2e-41
XP_016862343 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 628) 452 83.2 5.3e-15
XP_016862342 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 631) 452 83.2 5.4e-15
XP_011532256 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 616) 443 81.8 1.4e-14
XP_011532257 (OMIM: 606399) PREDICTED: voltage-dep ( 603) 334 64.8 1.9e-09
NP_002208 (OMIM: 146650) inter-alpha-trypsin inhib ( 890) 201 44.1 0.0047
XP_005265162 (OMIM: 146650) PREDICTED: inter-alpha ( 927) 201 44.1 0.0049
>>NP_001005505 (OMIM: 607082) voltage-dependent calcium (1145 aa)
initn: 7789 init1: 7789 opt: 7789 Z-score: 6594.3 bits: 1232.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7789; 100.0% identity (100.0% similar) in 1145 aa overlap (1-1145:1-1145)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD ASRRL
:::::
NP_001 ASRRL
>>NP_006021 (OMIM: 607082) voltage-dependent calcium cha (1143 aa)
initn: 7748 init1: 7244 opt: 7748 Z-score: 6559.7 bits: 1225.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7748; 99.7% identity (99.8% similar) in 1145 aa overlap (1-1145:1-1143)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 WDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVADF
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVNA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQCEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::
NP_006 SYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH--SDGPEQCEL
1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLVH
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD ASRRL
:::::
NP_006 ASRRL
1140
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Smith-Waterman score: 7736; 99.7% identity (99.7% similar) in 1146 aa overlap (1-1145:1-1144)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_005 FLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQYYFGSVN
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::::::
XP_005 ASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH--SDGPEQCE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVLV
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1140
pF1KSD HASRRL
::::::
XP_005 HASRRL
1140
>>NP_001167522 (OMIM: 607082) voltage-dependent calcium (1150 aa)
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Smith-Waterman score: 7715; 99.0% identity (99.1% similar) in 1152 aa overlap (1-1145:1-1150)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
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: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLV
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pF1KSD LSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVF
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD VPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQY
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pF1KSD YFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPAD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:
NP_001 YFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH--SD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRP
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140
pF1KSD QPQVLVHASRRL
::::::::::::
NP_001 QPQVLVHASRRL
1140 1150
>>XP_011532545 (OMIM: 607082) PREDICTED: voltage-depende (1151 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MAVPARTCGASRPGPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRR
190 200 210 220 230 240
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pF1KSD QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSG
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pF1KSD SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAV
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pF1KSD QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRT
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pF1KSD VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEA
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPN
490 500 510 520 530 540
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pF1KSD YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KSD KY-------FEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSK
: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KLPISKLKDFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSK
670 680 690 700 710 720
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pF1KSD QCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTE
730 740 750 760 770 780
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pF1KSD NPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPA
790 800 810 820 830 840
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pF1KSD VVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQK-CGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFL
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKQCGPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFL
850 860 870 880 890 900
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pF1KSD VLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGV
910 920 930 940 950 960
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pF1KSD FVPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FVPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSPETRESSCVMKQTQ
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD YYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .
XP_011 YYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETH--S
1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD DGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140
pF1KSD PQPQVLVHASRRL
:::::::::::::
XP_011 PQPQVLVHASRRL
1140 1150
>>NP_001278030 (OMIM: 607082) voltage-dependent calcium (1076 aa)
initn: 7268 init1: 7268 opt: 7268 Z-score: 6153.9 bits: 1150.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7268; 100.0% identity (100.0% similar) in 1076 aa overlap (70-1145:1-1076)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PPRPLWLLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYK
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYK
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KSD DNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDI
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KSD VYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGST
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KSD VILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPWRAPKKIDLYDVRRR
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KSD PWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPV
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KSD SCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMF
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIR
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KSD INTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 INTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQDGPGEKKNQ
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDF
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KSD LDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGL
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KSD VLPPYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLPPYSTFYLQANLSDQILQVKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLK
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KSD NFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGI
640 650 660 670 680 690
760 770 780 790 800 810
pF1KSD TRVFPNKAAEDWTENPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRVFPNKAAEDWTENPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVST
700 710 720 730 740 750
820 830 840 850 860 870
pF1KSD AVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKCGPNSHCEMDCEVNNE
760 770 780 790 800 810
880 890 900 910 920 930
pF1KSD DLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAP
820 830 840 850 860 870
940 950 960 970 980 990
pF1KSD QPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPPGNLGAAPRGVFVPTVADFLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEGSP
880 890 900 910 920 930
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD ETRESSCVMKQTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETRESSCVMKQTQYYFGSVNASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCE
940 950 960 970 980 990
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD AGRLLQKETHCPADGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGRLLQKETHCPADGPEQCELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1120 1130 1140
pF1KSD SLQLLLLLGLPPRPQPQVLVHASRRL
::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLQLLLLLGLPPRPQPQVLVHASRRL
1060 1070
>>NP_000713 (OMIM: 114204) voltage-dependent calcium cha (1091 aa)
initn: 3345 init1: 779 opt: 3937 Z-score: 3335.5 bits: 629.0 E(85289): 4.7e-179
Smith-Waterman score: 3937; 54.3% identity (78.6% similar) in 1098 aa overlap (44-1126:7-1080)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD GPARTARPWPGCGPHPGPGTRRPTSGPPRPLWLLLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHW
: : : :. : .: ::. :.. :
NP_000 MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSW
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KSD ARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFEVQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQA
. ...... . . .::.:: .::. ..:. :. :. ..::: .: :::.::. . .:
NP_000 VDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KSD LKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKADAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIE
: ::: ::. : ::.:.... ...:::.:: : :::..: : ::. .. :::
NP_000 LVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFIE
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KSD DPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELNWTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSA
: :: ...:..:::.::::::.:::..::::::: ::..:: .::..::.:::::::::
NP_000 DANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSA
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300
pF1KSD TGVTRYYPATPW----RAPKKIDLYDVRRRPWYIQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKL
::..:::::.:: :.:.:::::::::::::::::.:::::.:.::::::::::::::
NP_000 TGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKL
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCFTHLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTT
..::: :::.::::::.::::::: .:: :::: ::::::::::::.:.::....::: :
NP_000 IRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGIT
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDGGEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVG
:: :: .::.:: : :..::::::.::.::::::.:.:..:.::: .. :::::::::
NP_000 DYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSVG
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVY
::::: :.::::: :::::.::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::
NP_000 QHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EDALGLGLVVTGTLPVFNLTQ--DGPGEKKNQLILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANG
::: ::::.::::::::.: .. . ::::::::::.::.:.::::::: .:: ::
NP_000 LDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNG
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFLDAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIR
: :::: ::::::::::.:.. . .:::::::::::::.. : ::: .::::..:.: .:
NP_000 YYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFR
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLVLPPYSTFYLQANLSDQILQ-------V
::::: ::::::. .:.:::.:. .:.:::.:::: :: .:..:.: . : : .
NP_000 TLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGKM
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDNNTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLL
: : : :..:: :..:::::.::.::. :::::::: :: :.... ::.. .:: :.
NP_000 KDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLI
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFAATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNA
. ..::.:.:..::. : : : .. : :..::::::::.:..:.:.: :::: ..
NP_000 NRVLLDAGFTNELVQNYWSKQK-NIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYED
700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTVGILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLD
:::.::::: .::: :. . : :. ::.:: :::. . . :.:::::.:.:
NP_000 SFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKS-GPGAYES---GIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKID
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890
pF1KSD LEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKC-GPNSHCEMDCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNH
...: :.: ..: .: : :: : ::. :.. . ::..::::::...:..
NP_000 VNSWIENF-----TKTSIRDP--CAGPV--C--DCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDD
810 820 830 840 850
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYDYQAACAPQPPGNLGAAPRGVFVPTVAD
.:.::::.:.: .:: : : : :. ..:::::..: : . ::. :...::.:::
NP_000 YTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVAD
860 870 880 890 900 910
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD FLNLAWWTSAAAWSLFQQLLYGLIYHSWFQADPAEAEG-SPETRESSCVMKQTQYYFGSV
.:...::..:::::..::.: .: . ..: : . . ..::. .::::.: .
NP_000 ILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDND
920 930 940 950 960 970
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD NASYNAIIDCGNCSRLFHAQRLTNTNLLFVVAEKPLCSQCEAGRLLQKETHCPADGPEQC
. :.....:::::::.::...: ::::.:...:. :.. :.: : .:::. :
NP_000 SKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQ--TSDGPNPC
980 990 1000 1010 1020 1030
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD ELVQRPRYRRGPHICFDYNATEDTSDCGRGASFPPSLGVLVSLQLLLLLGLPPRPQPQVL
..:..::::.:: .::: :. :: .::: ... ::: ....:.:::
NP_000 DMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1140
pF1KSD VHASRRL
>>XP_016868077 (OMIM: 114204) PREDICTED: voltage-depende (1052 aa)
initn: 3345 init1: 779 opt: 3888 Z-score: 3294.3 bits: 621.3 E(85289): 9.4e-177
Smith-Waterman score: 3888; 55.0% identity (79.4% similar) in 1065 aa overlap (77-1126:1-1041)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD LLPLLPLLAAPGASAYSFPQQHTMQHWARRLEQEVDGVMRIFGGVQQLREIYKDNRNLFE
..... . . .::.:: .::. ..:.
XP_016 MQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYT
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KSD VQENEPQKLVEKVAGDIESLLDRKVQALKRLADAAENFQKAHRWQDNIKEEDIVYYDAKA
:. :. ..::: .: :::.::. . .:: ::: ::. : ::.:.... ...:::.::
XP_016 VEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKD
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KSD DAELDDPESEDVERGSKASTLRLDFIEDPNFKNKVNYSYAAVQIPTDIYKGSTVILNELN
: :::..: : ::. .. :::: :: ...:..:::.::::::.:::..:::::
XP_016 DL---DPEKNDSEPGSQ--RIKPVFIEDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELN
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KSD WTEALENVFMENRRQDPTLLWQVFGSATGVTRYYPATPW----RAPKKIDLYDVRRRPWY
:: ::..:: .::..::.:::::::::::..:::::.:: :.:.:::::::::::::
XP_016 WTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWY
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KSD IQGASSPKDMVIIVDVSGSVSGLTLKLMKTSVCEMLDTLSDDDYVNVASFNEKAQPVSCF
::::.:::::.:.::::::::::::::..::: :::.::::::.::::::: .:: ::::
XP_016 IQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCF
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KSD THLVQANVRNKKVFKEAVQGMVAKGTTGYKAGFEYAFDQLQNSNITRANCNKMIMMFTDG
::::::::::::.:.::....::: : :: :: .::.:: : :..::::::.::.::::
XP_016 QHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDG
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KSD GEDRVQDVFEKYNWPNRTVRVFTFSVGQHNYDVTPLQWMACANKGYYFEIPSIGAIRINT
::.:.:..:.::: .. :::::::::::::: :.::::: :::::.::::::::::::
XP_016 GEERAQEIFNKYN-KDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINT
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KSD QEYLDVLGRPMVLAGKEAKQVQWTNVYEDALGLGLVVTGTLPVFNLTQ--DGPGEKKNQL
::::::::::::::: .:::::::::: ::: ::::.::::::::.: .. . ::::
XP_016 QEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQL
390 400 410 420 430 440
530 540 550 560 570 580
pF1KSD ILGVMGIDVALNDIKRLTPNYTLGANGYVFAIDLNGYVLLHPNLKPQTTNFREPVTLDFL
::::::.::.:.::::::: .:: ::: :::: ::::::::::.:.. . .::::::::
XP_016 ILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKNPKSQEPVTLDFL
450 460 470 480 490 500
590 600 610 620 630 640
pF1KSD DAELEDENKEEIRRSMIDGNKGHKQIRTLVKSLDERYIDEVTRNYTWVPIRSTNYSLGLV
:::::.. : ::: .::::..:.: .:::::: ::::::. .:.:::.:. .:.:::.::
XP_016 DAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALV
510 520 530 540 550 560
650 660 670 680 690
pF1KSD LPPYSTFYLQANLSDQILQ-------VKYFEFLLPSSFESEGHVFIAPREYCKDLNASDN
:: :: .:..:.: . : : .: : : :..:: :..:::::.::.::. :::
XP_016 LPTYSFYYIKAKLEETITQARSKKGKMKDSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDN
570 580 590 600 610 620
700 710 720 730 740 750
pF1KSD NTEFLKNFIELMEKVTPDSKQCNNFLLHNLILDTGITQQLVERVWRDQDLNTYSLLAVFA
::::: :: :.... ::.. .:: :.. ..::.:.:..::. : : : .. : :.
XP_016 NTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYWSKQK-NIKGVKARFV
630 640 650 660 670 680
760 770 780 790 800 810
pF1KSD ATDGGITRVFPNKAAEDWTENPEPFNASFYRRSLDNHGYVFKPPHQDALLRPLELENDTV
.::::::::.:..:.:.: :::: .. :::.::::: .::: :. . : :.
XP_016 VTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKS-GPGAYES---
690 700 710 720 730
820 830 840 850 860 870
pF1KSD GILVSTAVELSLGRRTLRPAVVGVKLDLEAWAEKFKVLASNRTHQDQPQKC-GPNSHCEM
::.:: :::. . . :.:::::.:.:...: :.: ..: .: : :: :
XP_016 GIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENF-----TKTSIRDP--CAGPV--C--
740 750 760 770 780
880 890 900 910 920 930
pF1KSD DCEVNNEDLLCVLIDDGGFLVLSNQNHQWDQVGRFFSEVDANLMLALYNNSFYTRKESYD
::. :.. . ::..::::::...:.. .:.::::.:.: .:: : : : :. ..:::
XP_016 DCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYD
790 800 810 820 830 840
940 950 960 970 980 990
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pF1KSD VHASRRL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]