Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0578
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0578, 1496 aa
1>>>pF1KSDA0578 1496 - 1496 aa - 1496 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0090+/-0.00118; mu= 20.1607+/- 0.071
mean_var=97.2984+/-18.521, 0's: 0 Z-trim(103.7): 97 B-trim: 2 in 1/51
Lambda= 0.130023
statistics sampled from 7420 (7518) to 7420 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.572), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 3.160
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS82450.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1496) 10032 1893.9 0
CCDS82449.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1499) 10016 1890.9 0
CCDS82451.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1507) 9990 1886.0 0
CCDS54360.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1477) 8317 1572.2 0
CCDS46282.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1547) 7435 1406.7 0
CCDS81831.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1571) 6180 1171.3 0
CCDS8077.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1712) 5299 1006.1 0
CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1061) 4631 880.6 0
CCDS31597.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1642) 3112 595.8 3.5e-169
CCDS82447.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 469) 2475 475.9 1.2e-133
CCDS82446.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 472) 2459 472.9 9.9e-133
CCDS45145.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 ( 459) 1731 336.4 1.2e-91
CCDS1845.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 442) 1487 290.6 7.3e-78
CCDS8078.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 ( 666) 1438 281.5 5.9e-75
CCDS82445.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 139) 838 168.5 1.3e-41
CCDS82444.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 ( 142) 822 165.5 1.1e-40
CCDS9871.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 ( 432) 589 122.1 3.7e-27
CCDS61515.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 ( 637) 589 122.2 5e-27
CCDS75836.1 CNTNAP3B gene_id:728577|Hs108|chr9 (1288) 537 112.7 7.4e-24
CCDS5889.1 CNTNAP2 gene_id:26047|Hs108|chr7 (1331) 519 109.3 7.9e-23
CCDS73915.1 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1308) 498 105.4 1.2e-21
CCDS46401.1 CNTNAP5 gene_id:129684|Hs108|chr2 (1306) 468 99.8 5.9e-20
CCDS11436.1 CNTNAP1 gene_id:8506|Hs108|chr17 (1384) 349 77.5 3.2e-13
CCDS10924.2 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1235) 317 71.4 1.9e-11
CCDS82015.1 CNTNAP4 gene_id:85445|Hs108|chr16 (1260) 317 71.4 1.9e-11
CCDS31025.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1 (5202) 323 73.0 2.7e-11
CCDS56363.1 EGFLAM gene_id:133584|Hs108|chr5 (1017) 309 69.9 4.6e-11
>>CCDS82450.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1496 aa)
initn: 10032 init1: 10032 opt: 10032 Z-score: 10166.8 bits: 1893.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10032; 100.0% identity (100.0% similar) in 1496 aa overlap (1-1496:1-1496)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRIN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD TGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD EDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD ADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIIN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD KGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD EVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAEC
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD PSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD MYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS82449.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1499 aa)
initn: 10018 init1: 9383 opt: 10016 Z-score: 10150.5 bits: 1890.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10016; 99.8% identity (99.8% similar) in 1499 aa overlap (1-1496:1-1499)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRIN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD TGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD EDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD ADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIIN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD KGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD EVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAEC
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KSD PSDDEDIDPCEPSS---ANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILIL
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PSDDEDIDPCEPSSGGLANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILIL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD LYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
1450 1460 1470 1480 1490
>>CCDS82451.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1507 aa)
initn: 10004 init1: 6802 opt: 9990 Z-score: 10124.2 bits: 1886.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9990; 99.3% identity (99.3% similar) in 1507 aa overlap (1-1496:1-1507)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KSD KFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSP
:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD STADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 STADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD FAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PGESEILDLDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PGESEILDLDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMA
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD EVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLS
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD YDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTV
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD NLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHT
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD RLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFR
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKG
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD YLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNL
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD PNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD EESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD VVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD VGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDD
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD ILVASAECPSDDEDIDPCEPSS---ANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAA
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGGLANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD AALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1490
pF1KSD KDKEYYV
:::::::
CCDS82 KDKEYYV
>>CCDS54360.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1477 aa)
initn: 8964 init1: 5762 opt: 8317 Z-score: 8428.2 bits: 1572.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9716; 97.3% identity (97.3% similar) in 1507 aa overlap (1-1496:1-1477)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KSD KFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSP
:::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSP
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD STADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 STADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD FAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTA
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PGESEILDLDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PGESEILDLDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMA
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD EVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLS
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD YDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTV
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD NLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHT
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD RLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFR
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKG
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD YLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNL
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGC
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD PNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAI
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD EESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAG--------------------
1210 1220 1230 1240
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD VVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ----------RQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAI
1250 1260 1270 1280 1290
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD VGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VGNVRLVGEVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDD
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD ILVASAECPSDDEDIDPCEPSS---ANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAA
:::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ILVASAECPSDDEDIDPCEPSSGGLANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAA
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD AALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKN
1420 1430 1440 1450 1460 1470
1490
pF1KSD KDKEYYV
:::::::
CCDS54 KDKEYYV
>>CCDS46282.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (1547 aa)
initn: 9220 init1: 6802 opt: 7435 Z-score: 7533.8 bits: 1406.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9786; 96.7% identity (96.7% similar) in 1531 aa overlap (17-1496:17-1547)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
190 200 210 220 230 240
250 260
pF1KSD AVCDCSRTGFRGKDCSQE---------------------------------DNNVEGLAH
:::::::::::::::::: :::::::::
CCDS46 AVCDCSRTGFRGKDCSQEIKFGLQCVLPVLLHDNDQGKYCCINTAKPLTEKDNNVEGLAH
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKS
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370
pF1KSD ADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ---------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQHSGIGHAMV
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KSD ------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NKLHCSVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKE
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KSD VVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKWNAKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKWNAKK
490 500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KSD TGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGT
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600 610
pF1KSD IKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLDDELYLGGLPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 IKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLDDELYLGGLPE
610 620 630 640 650 660
620 630 640 650 660 670
pF1KSD NKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPC
670 680 690 700 710 720
680 690 700 710 720 730
pF1KSD LSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAE
730 740 750 760 770 780
740 750 760 770 780 790
pF1KSD DVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFA
790 800 810 820 830 840
800 810 820 830 840 850
pF1KSD GYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSS
850 860 870 880 890 900
860 870 880 890 900 910
pF1KSD VPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALAT
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950 960 970
pF1KSD LQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSN
970 980 990 1000 1010 1020
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD KPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD KLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD QWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD KEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD GGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KSD TIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSMTTESTA
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD TAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD SS---ANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDE
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SSGGLANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD GSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
1510 1520 1530 1540
>>CCDS81831.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1571 aa)
initn: 3939 init1: 3131 opt: 6180 Z-score: 6261.4 bits: 1171.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6596; 70.5% identity (87.2% similar) in 1383 aa overlap (12-1394:10-1364)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKWNACCESEMSFQLKT
: : .:.:: : : :::: : .::.:. .:.: .:..:::.::
CCDS81 MSSTLHSVFFTLKVSILL-GSLLGLCLGLEFMGLPNQWARYLRWDASTRSDLSFQFKT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRIR
. ::.::.:: : :::: : :. ::.:: ::. ::: : .:.. :::..:: . .
CCDS81 NVSTGLLLYLDDGGVCDFLCLSLV-DGRVQLRFSMDCAETA-VLSNKQVNDSSWHFLMVS
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREPF
:. :.:..: :.. :.. .: : : : ::.::.: ..: .:: :: .:. :
CCDS81 RDRLRTVLMLDG-EGQSGELQPQRPYMDVVSDLFLGGVPTDIRPSAL--TLDGVQAMPGF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPPNSGGGSPCEAGEEGEGGVCLNGGVCSVVDDQ
:: : :.. ..:. . : :..: : : : ::: :::.: ..: .
CCDS81 KGLILDLKYGNSEPRLLGSRGVQMDAEGPC--GERPCE-----------NGGICFLLDGH
180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AVCDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNP
.:::: ::. :: ::.. .. ::.::::..:.. :: .:::.::::.::::::::
CCDS81 PTCDCSTTGYGGKLCSEDVSQDPGLSHLMMSEQAR----EENVATFRGSEYLCYDLSQNP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNG
:::::::::::::: :::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::.::::::
CCDS81 IQSSSDEITLSFKTWQRNGLILHTGKSADYVNLALKDGAVSLVINLGSGAFEAIVEPVNG
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD KFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 KFNDNAWHDVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPE
:::::::::::::::::::.::::::::. .: ::::.: :.::::::::::::.:::::
CCDS81 PVSNNFMGCLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPE
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDG
..:::::::.:. ::::::::::::::::::.::::...:::. . ::::::.:.:::
CCDS81 AYISLPKWNTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDG
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILD
.:::::::::::::.:: ::.:::::::::.::::::::::::. :::.:: :::::::
CCDS81 NLYLLLDMGSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILD
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LDDELYLGGLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGV
:. ..::::::::.:::..:::.:::.::::::::::::::::.::.:::.::.:..:::
CCDS81 LEGDMYLGGLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGV
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMK
: :::. .:: : : :::::..:.:::::..:::.:::: ::.:::::..:::::::.::
CCDS81 KSSCSRMSAKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMK
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRIN
: .:.::::::::::.:: ::::::.:.::::::::::::::::.::::: :::::::::
CCDS81 IIMPMVMHTEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRIN
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIE
::::::::::.:: .::::::::::::::::::::::::. : : :.::::::::::::
CCDS81 CNSSKGPETLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVA-EGTMVGDHTRLEFHNIE
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KSD TGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVT
:::.::.::.: :::.:::::::: :::. :::::::::::::::.::::.:::::::::
CCDS81 TGIMTEKRYISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVT
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDL
:::::::..:::::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.:::::::.::::::
CCDS81 FKTKSSYLSLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDL
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYI
::: :.:::.:..::::::::::.:.::.:: :..:.:::..::. ::.:::::.:::.
CCDS81 GNGPNVIKGNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYM
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD GGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQ
.:.:. :..::::: ...:::::::::::::::::::.::: .:::::::::::::::
CCDS81 AGLAQGMYSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQ
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD EDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTR
::::.:::::.:::.::.:::::::.:: :::::.::::.:.:: : : :: :::::::
CCDS81 EDSCANQGVCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTR
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD ADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIIN
.::::.::::. :...:::.::. ::::.:.:::.:::::: ::.:: ::.:.: . .:
CCDS81 SDRLAVGFSTTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVN
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLD
:::::::::::.:::::::::.::: :.::.::.::::. ...:.::.. .: :.::: .
CCDS81 DGKYHVVRFTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTGNTDNERFQMVKQKIPFKYNRPVEEWLQE
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD KGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVG
:::::::::.:: : ::::..:. ::::::::::.:::::::::::. :: : :.:::::
CCDS81 KGRQLTIFNTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD EVPSSMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAEC
:::: . : .: :.: ::::..::::::.::.:.:... . :. :.:: ::.::::
CCDS81 EVPSILGTTQT-TSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR--STASIQPTSDD-LVSSAEC
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD PSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYA
:::::. ::::.
CCDS81 SSDDEDFVECEPSTDKSLSTSIFEGGYKAHAPKWESKDFRPNKVSETSRTTTTSLSPELI
1360 1370 1380 1390 1400 1410
>--
initn: 496 init1: 426 opt: 503 Z-score: 506.1 bits: 106.4 E(32554): 7.2e-22
Smith-Waterman score: 503; 79.6% identity (94.2% similar) in 103 aa overlap (1394-1496:1471-1571)
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD EPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMV
.::::. : :. ::..:::::::::::::
CCDS81 VLLPLPTAYELDSTKLKSPLITSPMFRNVPTANPTEPGIRR-VPGASEVIRESSSTTGMV
1450 1460 1470 1480 1490
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD VGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSS
:::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::...:::: :: ::.
CCDS81 VGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS-KSG
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1490
pF1KSD NKNKKNKDKEYYV
.:..::::.::::
CCDS81 HKKQKNKDREYYV
1560 1570
>>CCDS8077.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1712 aa)
initn: 5424 init1: 3681 opt: 5299 Z-score: 5367.7 bits: 1006.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6500; 67.6% identity (85.1% similar) in 1424 aa overlap (16-1394:14-1417)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
: :::: : ..:::: :. :::.:. .: .: .:.::.:.
CCDS80 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
: ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : .
CCDS80 TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
:. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . :
CCDS80 TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPP---NSGG--GSPCEAGEEGEGGVCLNGGVC
:.: . .. :: ..:: .: : :. . . : :::.:
CCDS80 FRGLLANL---------------KLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLC
180 190 200 210
240 250 260 270
pF1KSD SVVDDQAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMM-----------GDQGK-------
.:. : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: . : :.
CCDS80 TVLAPGEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLNSEVGSLLFSEGGAGRGGAGDVH
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KSD --SKGKEEYIATFKGSEYFCYDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNL
.:::::..:::::.:.::::::.::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::
CCDS80 QPTKGKEEFVATFKGNEFFCYDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNL
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370
pF1KSD ALKNGAVSLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ---------------
.::.::: :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS80 SLKSGAVWLVINLGSGAFEALVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVNKLHYL
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KSD VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNN
:::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::.::::::
CCDS80 VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNN
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KSD DVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISF
: .::::::::.::::::..: ..:.::.::.:::.:::.::.:..::.:.::.:::::.
CCDS80 DFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRCEDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISL
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KSD DFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKAL
::::::::::.:::.:. ..: . ..:.::.:.:::::::::::::: ::..:
CCDS80 DFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHSSAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRAS
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGL
.::::::: :::::::::.:.::::. ::. : :.::::::..:::::::::. .. :
CCDS80 SRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNSRSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDL
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KSD VFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPC
.: ::::: : :::::.:::::::.:.:.: .::.:...:: : ::.:: : : : ::
CCDS80 PLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGRSRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPC
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720 730
pF1KSD KNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLR
.:.:.::.::::..::: :::.::: ::::::::::::::.:::.:: .:::::::::::
CCDS80 RNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVCEREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLR
700 710 720 730 740 750
740 750 760 770 780 790
pF1KSD FRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLN
: ::::::..::::::.::::::::::.:..::::::::.:..: ::::::::::..::
CCDS80 FMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELDGGQMKLTVNLDCLRVGCAPSKGPETLFAGHKLN
760 770 780 790 800 810
800 810 820 830 840 850
pF1KSD DNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNF
::::::::::::::::.:.::. .. ::::: : :::::::::::.::::..: :::::
CCDS80 DNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVEGQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNF
820 830 840 850 860 870
860 870 880 890 900 910
pF1KSD IGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYT
::::..:.:::. :.: ::.::: :::::::::.: :.:::::::..:::.::::::::.
CCDS80 IGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCELNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYA
880 890 900 910 920 930
920 930 940 950 960 970
pF1KSD SMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLND
:::::::::::. :::.:.:::.::::::.::::::.::::::::: .:.::.:.::.::
CCDS80 SMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDFIVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVND
940 950 960 970 980 990
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD NQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHA
::::::..::: .:.::.:::.. .:: . ::::::::..:::::..:. ...::::: .
CCDS80 NQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQHSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVAS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KSD KEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGF
..:::::::::::::::::::.::: ::.::::.:::::: :.::.::::::::::::
CCDS80 RDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHRIGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGF
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD SCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVL
.:::.:::..::.::::::::::.:::. ::: :::::::::: ::::.:::: :. :::
CCDS80 TCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGGALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KSD VRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNAT
:::::.:::::::.::: :: .:: ::::::::.:.: :::..:::::::::::::::::
CCDS80 VRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFNVGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNAT
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD LQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIG
:::::::: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: ::
CCDS80 LQVDSWPVNERYPAGNFDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQAAIKIG
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1280 1290 1300 1310 1320 1330
pF1KSD GKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQ
:..::.:::::.::::::::::: .:::.: :. :..::::: :: . ..:.:::..
CCDS80 GRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAAESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLL
1300 1310 1320 1330 1340 1350
1340 1350 1360 1370 1380 1390
pF1KSD SEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSA
..:.:.:::::::.::.:.:::. :: .. .:.:::.:::::::::::::.. ::::.
CCDS80 ADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTLRDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTG
1360 1370 1380 1390 1400 1410
1400 1410 1420 1430 1440 1450
pF1KSD NPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVD
CCDS80 GELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPPPPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQ
1420 1430 1440 1450 1460 1470
>--
initn: 557 init1: 496 opt: 530 Z-score: 532.9 bits: 111.5 E(32554): 2.3e-23
Smith-Waterman score: 530; 80.6% identity (88.9% similar) in 108 aa overlap (1389-1496:1607-1712)
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD KPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSS
: :. :::: : : : ::..::::::::
CCDS80 NPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPT-ANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSS
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::: :.
CCDS80 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPA
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1480 1490
pF1KSD SAKSSNKNKKNKDKEYYV
. :. .: ::::::::::
CCDS80 APKTPSKAKKNKDKEYYV
1700 1710
>>CCDS9870.1 NRXN3 gene_id:9369|Hs108|chr14 (1061 aa)
initn: 5372 init1: 2404 opt: 4631 Z-score: 4693.4 bits: 880.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5581; 74.8% identity (89.8% similar) in 1098 aa overlap (399-1496:1-1061)
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DVKVTRNLRQVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 MLGSDDFFYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMG
10 20 30
430 440 450 460 470 480
pF1KSD CLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKCENVATLDPITFETPESFISLPKW
:::::::::::.::::::::. .: ::::.: :.::::::::::::.:::::..::::::
CCDS98 CLKEVVYKNNDIRLELSRLARIADTKMKIYGEVVFKCENVATLDPINFETPEAYISLPKW
40 50 60 70 80 90
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHPQMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDM
:.:. ::::::::::::::::::.::::...:::. . ::::::.:.:::.:::::::
CCDS98 NTKRMGSISFDFRTTEPNGLILFTHGKPQERKDARSQKNTKVDFFAVELLDGNLYLLLDM
100 110 120 130 140 150
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNTLRTPYTAPGESEILDLDDELYLG
::::::.:: ::.:::::::::.::::::::::::. :::.:: ::::::::. ..:::
CCDS98 GSGTIKVKATQKKANDGEWYHVDIQRDGRSGTISVNSRRTPFTASGESEILDLEGDMYLG
160 170 180 190 200 210
610 620 630 640 650 660
pF1KSD GLPENKAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQSKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKET
:::::.:::..:::.:::.::::::::::::::::.::.:::.::.:..:::: :::. .
CCDS98 GLPENRAGLILPTELWTAMLNYGYVGCIRDLFIDGRSKNIRQLAEMQNAAGVKSSCSRMS
220 230 240 250 260 270
670 680 690 700 710 720
pF1KSD AKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSCEREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMH
:: : : :::::..:.:::::..:::.:::: ::.:::::..:::::::.::: .:.:::
CCDS98 AKQCDSYPCKNNAVCKDGWNRFICDCTGTGYWGRTCEREASILSYDGSMYMKIIMPMVMH
280 290 300 310 320 330
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELDAGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPE
:::::::.:: ::::::.:.::::::::::::::::.::::: :::::::::::::::::
CCDS98 TEAEDVSFRFMSQRAYGLLVATTSRDSADTLRLELDGGRVKLMVNLDCIRINCNSSKGPE
340 350 360 370 380 390
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMTGQMAGDHTRLEFHNIETGIITERR
::.:: .::::::::::::::::::::::::. : : :.:::::::::::::::.::.:
CCDS98 TLYAGQKLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDDVA-EGTMVGDHTRLEFHNIETGIMTEKR
400 410 420 430 440
850 860 870 880 890 900
pF1KSD YLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCELNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYV
:.: :::.:::::::: :::. :::::::::::::::.::::.::::::::::::::::.
CCDS98 YISVVPSSFIGHLQSLMFNGLLYIDLCKNGDIDYCELKARFGLRNIIADPVTFKTKSSYL
450 460 470 480 490 500
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDFIVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIK
.:::::::::::::::::::: ::.::.:::::::::.:::::::.::::::::: :.::
CCDS98 SLATLQAYTSMHLFFQFKTTSPDGFILFNSGDGNDFIAVELVKGYIHYVFDLGNGPNVIK
510 520 530 540 550 560
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETY
:.:..::::::::::.:.::.:: :..:.:::..::. ::.:::::.:::..:.:. :
CCDS98 GNSDRPLNDNQWHNVVITRDNSNTHSLKVDTKVVTQVINGAKNLDLKGDLYMAGLAQGMY
570 580 590 600 610 620
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD KSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFCNGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQG
..::::: ...:::::::::::::::::::.::: .:::::::::::::::::::.:::
CCDS98 SNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLINDALHRSGQIERGCEGPSTTCQEDSCANQG
630 640 650 660 670 680
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGF
::.:::.::.:::::::.:: :::::.::::.:.:: : : :: :::::::.::::.::
CCDS98 VCMQQWEGFTCDCSMTSYSGNQCNDPGATYIFGKSGGLILYTWPANDRPSTRSDRLAVGF
690 700 710 720 730 740
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD STVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVR
::. :...:::.::. ::::.:.:::.:::::: ::.:: ::.:.: . .:::::::::
CCDS98 STTVKDGILVRIDSAPGLGDFLQLHIEQGKIGVVFNIGTVDISIKEERTPVNDGKYHVVR
750 760 770 780 790 800
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD FTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIF
:::.:::::::::.::: :.::.: ::::::
CCDS98 FTRNGGNATLQVDNWPVNEHYPTG------------------------------RQLTIF
810 820 830
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD NSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPSSMTT
:.:: : ::::..:. ::::::::::.:::::::::::. :: : :.::::::::: . :
CCDS98 NTQAQIAIGGKDKGRLFQGQLSGLYYDGLKVLNMAAENNPNIKINGSVRLVGEVPSILGT
840 850 860 870 880 890
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD ESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDID
.: :.: ::::..::::::.::.:.:... . :. :.:: ::.:::: :::::.
CCDS98 TQT-TSMPPEMSTTVMETTTTMATTTTRKNR--STASIQPTSDD-LVSSAECSSDDEDFV
900 910 920 930 940 950
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD PCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRD
::::.::::. : :. ::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS98 ECEPSTANPTEPGIRR-VPGASEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRD
960 970 980 990 1000 1010
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD EGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
::::.:::.::::::::::::...:::: :: ::..:..::::.::::
CCDS98 EGSYQVDETRNYISNSAQSNGTLMKEKQQSS-KSGHKKQKNKDREYYV
1020 1030 1040 1050 1060
>>CCDS31597.1 NRXN2 gene_id:9379|Hs108|chr11 (1642 aa)
initn: 5897 init1: 2253 opt: 3112 Z-score: 3150.8 bits: 595.8 E(32554): 3.5e-169
Smith-Waterman score: 6196; 66.3% identity (84.0% similar) in 1397 aa overlap (16-1394:14-1347)
10 20 30 40 50
pF1KSD MGTALLQRGGCFLLCLSLLLLGCWAELGSGLEFPGAEGQWTRFPKW-NACCESEMSFQLK
: :::: : ..:::: :. :::.:. .: .: .:.::.:.
CCDS31 MASGSRWRPTPPPLLLLLLLALAARADGLEFGGGPGQWARYARWAGAASSGELSFSLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TRSARGLVLYFDDEGFCDFLELILTRGGRLQLSFSIFCAEPATLLADTPVNDGAWHSVRI
: ..:.:.::.:: : ::::::.:. :::.: :.. ::::::: :::: : :: : .
CCDS31 TNATRALLLYLDDGGDCDFLELLLV-DGRLRLRFTLSCAEPATLQLDTPVADDRWHMVLL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RRQFRNTTLFIDQVEAKWVEVKSKRRDMTVFSGLFVGGLPPELRAAALKLTLASVREREP
:. : :.: .: ::. .::.::::.: : : :::::.::..: .:: ::..:. . :
CCDS31 TRDARRTALAVDG-EARAAEVRSKRREMQVASDLFVGGIPPDVRLSAL--TLSTVKYEPP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FKGWIRDVRVNSSQVLPVDSGEVKLDDEPP---NSGG--GSPCEAGEEGEGGVCLNGGVC
:.: . .. :: ..:: .: : :. . . : :::.:
CCDS31 FRGLLANL---------------KLGERPPALLGSQGLRGATADPLCAPARNPCANGGLC
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SVVDDQAV-CDCSRTGFRGKDCSQEDNNVEGLAHLMMGDQGKSKGKEEYIATFKGSEYFC
.:. : ::::.::: :: ::.:.. .:: ::: .. :.::::..:::::.:.::
CCDS31 TVLAPGEVGCDCSHTGFGGKFCSEEEHPMEGPAHLTLN----SEGKEEFVATFKGNEFFC
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YDLSQNPIQSSSDEITLSFKTLQRNGLMLHTGKSADYVNLALKNGAVSLVINLGSGAFEA
::::.::::::.:::::.:.::::::::::::::::::::.::.::: ::::::::::::
CCDS31 YDLSHNPIQSSTDEITLAFRTLQRNGLMLHTGKSADYVNLSLKSGAVWLVINLGSGAFEA
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KSD LVEPVNGKFNDNAWHDVKVTRNLRQ--------VTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDF
:::::::::::::::::.::::::: :::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVEPVNGKFNDNAWHDVRVTRNLRQHAGIGHAMVTISVDGILTTTGYTQEDYTMLGSDDF
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KSD FYVGGSPSTADLPGSPVSNNFMGCLKEVVYKNNDVRLELSRLAKQGDPKMKIHGVVAFKC
::.::::.::::::::::::::::::.::::::: .::::::::.::::::..: ..:.:
CCDS31 FYIGGSPNTADLPGSPVSNNFMGCLKDVVYKNNDFKLELSRLAKEGDPKMKLQGDLSFRC
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KSD ENVATLDPITFETPESFISLPKWNAKKTGSISFDFRTTEPNGLILFSHGKPRHQKDAKHP
:.::.:::.:::.::.:..::.:.::.:::::.::::::::::.:::.:. ..:
CCDS31 EDVAALDPVTFESPEAFVALPRWSAKRTGSISLDFRTTEPNGLLLFSQGRRAGGGAGSHS
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KSD QMIKVDFFAIEMLDGHLYLLLDMGSGTIKIKALLKKVNDGEWYHVDFQRDGRSGTISVNT
. ..:.::.:.:::::::::::::: ::..: .::::::: :::::::::.:.::::.
CCDS31 SAQRADYFAMELLDGHLYLLLDMGSGGIKLRASSRKVNDGEWCHVDFQRDGRKGSISVNS
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KSD LRTPYTAPGESEILDLDDELYLGGLPEN-KAGLVFPTEVWTALLNYGYVGCIRDLFIDGQ
::. : :.::::::..:::::::::. .. : .: ::::: : :::::.:::::::.
CCDS31 RSTPFLATGDSEILDLESELYLGGLPEGGRVDLPLPPEVWTAALRAGYVGCVRDLFIDGR
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KSD SKDIRQMAEVQSTAGVKPSCSKETAKPCLSNPCKNNGMCRDGWNRYVCDCSGTGYLGRSC
:.:.: .::.:...:: : ::.:: : : : ::.:.:.::.::::..::: :::.::: :
CCDS31 SRDLRGLAEAQGAVGVAPFCSRETLKQCASAPCRNGGVCREGWNRFICDCIGTGFLGRVC
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KSD EREATVLSYDGSMFMKIQLPVVMHTEAEDVSLRFRSQRAYGILMATTSRDSADTLRLELD
:::::::::::::.:::.:: .:::::::::::: ::::::..::::::.::::::::::
CCDS31 EREATVLSYDGSMYMKIMLPNAMHTEAEDVSLRFMSQRAYGLMMATTSRESADTLRLELD
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KSD AGRVKLTVNLDCIRINCNSSKGPETLFAGYNLNDNEWHTVRVVRRGKSLKLTVDDQQAMT
.:..:::::: .:::::::::..::::::::::::::::::.:.::. ..
CCDS31 GGQMKLTVNL---------GKGPETLFAGHKLNDNEWHTVRVVRRGKSLQLSVDNV-TVE
760 770 780 790 800
830 840 850 860 870 880
pF1KSD GQMAGDHTRLEFHNIETGIITERRYLSSVPSNFIGHLQSLTFNGMAYIDLCKNGDIDYCE
::::: : :::::::::::.::::..: :::::::::..:.:::. :.: ::.::: :::
CCDS31 GQMAGAHMRLEFHNIETGIMTERRFISVVPSNFIGHLSGLVFNGQPYMDQCKDGDITYCE
810 820 830 840 850 860
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LNARFGFRNIIADPVTFKTKSSYVALATLQAYTSMHLFFQFKTTSLDGLILYNSGDGNDF
::::::.: :.:::::::..:::.::::::::.:::::::::::. :::.:.:::.::::
CCDS31 LNARFGLRAIVADPVTFKSRSSYLALATLQAYASMHLFFQFKTTAPDGLLLFNSGNGNDF
870 880 890 900 910 920
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD IVVELVKGYLHYVFDLGNGANLIKGSSNKPLNDNQWHNVMISRDTSNLHTVKIDTKITTQ
::.::::::.::::::::: .:.::.:.::.::::::::..::: .:.::.:::.. .::
CCDS31 IVIELVKGYIHYVFDLGNGPSLMKGNSDKPVNDNQWHNVVVSRDPGNVHTLKIDSRTVTQ
930 940 950 960 970 980
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD ITAGARNLDLKSDLYIGGVAKETYKSLPKLVHAKEGFQGCLASVDLNGRLPDLISDALFC
. ::::::::..:::::..:. ...::::: ...:::::::::::::::::::.:::
CCDS31 HSNGARNLDLKGELYIGGLSKNMFSNLPKLVASRDGFQGCLASVDLNGRLPDLIADALHR
990 1000 1010 1020 1030 1040
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD NGQIERGCEGPSTTCQEDSCSNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGG
::.::::.:::::: :.::.::::::::::::.:::.:::..::.::::::::::.:::
CCDS31 IGQVERGCDGPSTTCTEESCANQGVCLQQWDGFTCDCTMTSYGGPVCNDPGTTYIFGKGG
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD GQITYKWPPNDRPSTRADRLAIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFN
. ::: :::::::::: ::::.:::: :. ::::::::.:::::::.::: :: .:: ::
CCDS31 ALITYTWPPNDRPSTRMDRLAVGFSTHQRSAVLVRVDSASGLGDYLQLHIDQGTVGVIFN
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1190 1200 1210 1220 1230 1240
pF1KSD VGTDDIAIEESNAIINDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQ
::::::.:.: :::..::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS31 VGTDDITIDEPNAIVSDGKYHVVRFTRSGGNATLQVDSWPVNERYPAG------------
1170 1180 1190 1200 1210
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KSD RIPYRLGRVVDEWLLDKGRQLTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAA
::::::::::.: :::..::.:::::.::::::::::: .::
CCDS31 ------------------RQLTIFNSQAAIKIGGRDQGRPFQGQVSGLYYNGLKVLALAA
1220 1230 1240 1250
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KSD ENDANIAIVGNVRLVGEVPSSM-TTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPT-
:.: :. :..::::: :: . ..:.:::.. ..:.:.:::::::.::.:.:::. ::
CCDS31 ESDPNVRTEGHLRLVGEGPSVLLSAETTATTLLADMATTIMETTTTMATTTTRRGRSPTL
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1370 1380 1390 1400 1410 1420
pF1KSD KEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGM
.. .:.:::.:::::::::::::.. ::::.
CCDS31 RDSTTQNTDDLLVASAECPSDDEDLEECEPSTGGELILPIITEDSLDPPPVATRSPFVPP
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1430 1440 1450 1460 1470 1480
pF1KSD VVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKS
CCDS31 PPTFYPFLTGVGATQDTLPPPAARRPPSGGPCQAERDDSDCEEPIEASGFASGEVFDSSL
1380 1390 1400 1410 1420 1430
>--
initn: 557 init1: 496 opt: 530 Z-score: 533.2 bits: 111.5 E(32554): 2.2e-23
Smith-Waterman score: 530; 80.6% identity (88.9% similar) in 108 aa overlap (1389-1496:1537-1642)
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KSD KPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDDEDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSS
: :. :::: : : : ::..::::::::
CCDS31 NPPLGPGAPTSFEPRRPPPLRPGVTSAPGFPHLPT-ANPTGPGERGP-PGAVEVIRESSS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KSD TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::::: :.
CCDS31 TTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKYRNRDEGSYQVDQSRNYISNSAQSNGAVVKEKAPA
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1480 1490
pF1KSD SAKSSNKNKKNKDKEYYV
. :. .: ::::::::::
CCDS31 APKTPSKAKKNKDKEYYV
1630 1640
>>CCDS82447.1 NRXN1 gene_id:9378|Hs108|chr2 (469 aa)
initn: 2475 init1: 2475 opt: 2475 Z-score: 2512.6 bits: 475.9 E(32554): 1.2e-133
Smith-Waterman score: 2475; 100.0% identity (100.0% similar) in 382 aa overlap (1115-1496:88-469)
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SNQGVCLQQWDGFSCDCSMTSFSGPLCNDPGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HIHHFHGSSKHHSVPIAIYRSPASLRGGHAGTTYIFSKGGGQITYKWPPNDRPSTRADRL
60 70 80 90 100 110
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD AIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AIGFSTVQKEAVLVRVDSSSGLGDYLELHIHQGKIGVKFNVGTDDIAIEESNAIINDGKY
120 130 140 150 160 170
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD HVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 HVVRFTRSGGNATLQVDSWPVIERYPAGNNDNERLAIARQRIPYRLGRVVDEWLLDKGRQ
180 190 200 210 220 230
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD LTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LTIFNSQATIIIGGKEQGQPFQGQLSGLYYNGLKVLNMAAENDANIAIVGNVRLVGEVPS
240 250 260 270 280 290
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD SMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SMTTESTATAMQSEMSTSIMETTTTLATSTARRGKPPTKEPISQTTDDILVASAECPSDD
300 310 320 330 340 350
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD EDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EDIDPCEPSSANPTRAGGREPYPGSAEVIRESSSTTGMVVGIVAAAALCILILLYAMYKY
360 370 380 390 400 410
1450 1460 1470 1480 1490
pF1KSD RNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RNRDEGSYHVDESRNYISNSAQSNGAVVKEKQPSSAKSSNKNKKNKDKEYYV
420 430 440 450 460
1496 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:09:36 2016 done: Thu Nov 3 02:09:37 2016
Total Scan time: 3.160 Total Display time: 0.600
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]