FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0617, 768 aa 1>>>pF1KSDA0617 768 - 768 aa - 768 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0587+/-0.00124; mu= 16.2385+/- 0.074 mean_var=76.6022+/-15.295, 0's: 0 Z-trim(101.1): 42 B-trim: 3 in 1/48 Lambda= 0.146539 statistics sampled from 6355 (6372) to 6355 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.196), width: 16 Scan time: 2.560 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS2462.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 768) 4997 1066.8 0 CCDS58751.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 ( 702) 4429 946.7 0 CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 667) 1094 241.7 3e-63 CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 759) 1009 223.7 8.5e-58 CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 895) 978 217.2 9.3e-56 CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 900) 978 217.2 9.3e-56 CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX ( 913) 978 217.2 9.4e-56 CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 ( 659) 932 207.4 6e-53 CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 745) 666 151.2 5.7e-36 CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 758) 666 151.2 5.7e-36 CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 ( 764) 666 151.2 5.8e-36 CCDS34772.1 CUL1 gene_id:8454|Hs108|chr7 ( 776) 615 140.4 1e-32 CCDS31668.1 CUL5 gene_id:8065|Hs108|chr11 ( 780) 324 78.9 3.4e-14 >>CCDS2462.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 (768 aa) initn: 4997 init1: 4997 opt: 4997 Z-score: 5707.5 bits: 1066.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4997; 100.0% identity (100.0% similar) in 768 aa overlap (1-768:1-768) 10 20 30 40 50 60 pF1KSD MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPMTMDEKYVNSIWDLLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPMTMDEKYVNSIWDLLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KSD AYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 AYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KSD DILMYMDRVYVQQNNVENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 DILMYMDRVYVQQNNVENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KSD GAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEAR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 GAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEAR 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KSD INEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 INEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMY 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KSD KLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 KLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESF 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KSD NNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSPEYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 NNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSPEYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFR 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KSD FMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSIS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 FMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSIS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KSD NTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 NTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYL 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KSD AKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 AKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMT 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KSD ILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 ILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFT 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KSD VNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 VNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHN 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KSD VLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS24 VLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA 730 740 750 760 >>CCDS58751.1 CUL3 gene_id:8452|Hs108|chr2 (702 aa) initn: 4429 init1: 4429 opt: 4429 Z-score: 5059.2 bits: 946.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4429; 100.0% identity (100.0% similar) in 680 aa overlap (89-768:23-702) 60 70 80 90 100 110 pF1KSD RNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVM :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVM 10 20 30 40 50 120 130 140 150 160 170 pF1KSD IRDILMYMDRVYVQQNNVENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 IRDILMYMDRVYVQQNNVENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVV 60 70 80 90 100 110 180 190 200 210 220 230 pF1KSD DRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 DRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVE 120 130 140 150 160 170 240 250 260 270 280 290 pF1KSD ARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 ARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGC 180 190 200 210 220 230 300 310 320 330 340 350 pF1KSD MYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLE 240 250 260 270 280 290 360 370 380 390 400 410 pF1KSD SFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSPEYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 SFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSPEYLSLFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVL 300 310 320 330 340 350 420 430 440 450 460 470 pF1KSD FRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 FRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMS 360 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 530 pF1KSD ISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 ISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRF 420 430 440 450 460 470 540 550 560 570 580 590 pF1KSD YLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 YLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQ 480 490 500 510 520 530 600 610 620 630 640 650 pF1KSD MTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 MTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHI 540 550 560 570 580 590 660 670 680 690 700 710 pF1KSD FTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 FTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQ 600 610 620 630 640 650 720 730 740 750 760 pF1KSD HNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS58 HNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA 660 670 680 690 700 >>CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (667 aa) initn: 1408 init1: 385 opt: 1094 Z-score: 1249.1 bits: 241.7 E(32554): 3e-63 Smith-Waterman score: 1596; 40.6% identity (67.0% similar) in 710 aa overlap (73-768:2-667) 50 60 70 80 90 pF1KSD EIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKV---REDVLNSLNN :: ::.. .:. .. ::: :.:. CCDS73 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL- 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KSD NFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNV--------ENVY-NLGLIIFRDQ ::. .: :.:: :.:::.:....::.:: ::.. .: ..:: .:: . CCDS73 -FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSICPVSYCLYRDMGLELFRTH 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 210 pF1KSD VVRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFL .. .... . .: .: :::.::.:::. .:. :: : .::...:: :: CCDS73 IISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDL-----QVYKDSFELKFL 90 100 110 120 130 140 220 230 240 250 260 270 pF1KSD EMSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELIS : . .. :.:... : . :...: :..:: .::. ::.::..:.. ::..:.. CCDS73 EETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLG 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 pF1KSD KHMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVS .:. .:.. .:: :.: .... ::. ::.::::: .: ... . : :.. : :.: CCDS73 EHLTAILQ---KGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVI 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 pF1KSD EEGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSP-EYLS . . : :..: :::.:.. :. . :.... : . . .:: :.: .: : .. CCDS73 NPEKDK---DMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIA 270 280 290 300 310 390 400 410 420 430 440 pF1KSD LFIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDD .:.::. : : :..:.: ::: :.::::.. ::::: .::. ::.:::..::.: : CCDS73 KHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVD 320 330 340 350 360 370 450 460 470 480 490 500 pF1KSD SEKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLT .::.:.:::: ::: :::::::::.:: .:. : .:.::.: . : : .:::: .:: CCDS73 AEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDS-GPIDLTVNILT 380 390 400 410 420 430 510 520 530 540 550 560 pF1KSD TGYWPTQSATP-KCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVK ::::: :: . .. : . :.:. :::.:::::.: : .: : :.: : CCDS73 MGYWPTY--TPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEF----- 440 450 460 470 480 490 570 580 590 600 610 620 pF1KSD KEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELV :: .: .::: :: .:..::. . ..::::.. : : . :: CCDS73 KEGKKE-----------------FQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELR 500 510 520 530 630 640 650 660 670 680 pF1KSD RALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPER :.:::::::: ::: : ::.::.:.: : : .: :: :.::. . : :. :. CCDS73 RTLQSLACGKA--RVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMK--ETVEEQ 540 550 560 570 580 690 700 710 720 730 740 pF1KSD KETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGL : ..: .::...:.:::::::: :: . ::.::.:. .::: : .: .:::::.: CCDS73 VSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLK--FPVKPGDLKKRIESL 590 600 610 620 630 640 750 760 pF1KSD IEREYLARTPEDRKVYTYVA :.:.:. : .. . : ::: CCDS73 IDRDYMERDKDNPNQYHYVA 650 660 >>CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (759 aa) initn: 1259 init1: 385 opt: 1009 Z-score: 1151.1 bits: 223.7 E(32554): 8.5e-58 Smith-Waterman score: 1707; 39.6% identity (67.5% similar) in 766 aa overlap (9-768:39-759) 10 20 30 pF1KSD MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPMTMDEKYVNSIWDLLK ::.: . .: : . ..:... : :. CCDS41 GSFSALVGRTNGLTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRP-RLPDNYTQDTWRKLH 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KSD NAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKV---REDVLN .:.. .: ... ..::::. . .. :: . :: ::.. .:. .. ::: :. CCDS41 EAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLD 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KSD SLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNN-VENVYNLGLIIFRDQVVRY :. ::. .: :.:: :.:::.:....::.:: ::. . .....:: .:: ... CCDS41 SVL--FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISD 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KSD GCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSA .... . .: .: :::.::.:::. .:. :: : .::...:: ::: . CCDS41 KMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDL-----QVYKDSFELKFLEETN 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KSD EFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMK .. :.:... : . :...: :..:: .::. ::.::..:.. ::..:...:. CCDS41 CLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLT 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KSD TIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGE .:.. .:: :.: .... ::. ::.::::: .: ... . : :.. : :.: . . CCDS41 AILQ---KGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEK 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KSD GKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSP-EYLSLFID : :..: :::.:.. :. . :.... : . . .:: :.: .: : .. .: CCDS41 DK---DMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVD 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KSD DKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKN .::. : : :..:.: ::: :.::::.. ::::: .::. ::.:::..::.: :.::. CCDS41 SKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKS 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KSD MISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYW :.:::: ::: :::::::::.:: .:. : .:.::.: . : : .:::: .:: ::: CCDS41 MLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDS-GPIDLTVNILTMGYW 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KSD PTQSATP-KCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDG :: :: . .. : . :.:. :::.:::::.: : .: : :.: : :: CCDS41 PTY--TPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEF-----KEGK 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 pF1KSD SEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQ .: .::: :: .:..::. . ..::::.. : : . :: :.:: CCDS41 KE-----------------FQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQ 590 600 610 620 640 650 660 670 680 690 pF1KSD SLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETR :::::: ::: : ::.::.:.: : : .: :: :.::. . : :. :. : CCDS41 SLACGK--ARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMK--ETVEEQVSTT 630 640 650 660 670 680 700 710 720 730 740 750 pF1KSD QKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIERE ..: .::...:.:::::::: :: . ::.::.:. .::: : .: .:::::.::.:. CCDS41 ERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLK--FPVKPGDLKKRIESLIDRD 690 700 710 720 730 740 760 pF1KSD YLARTPEDRKVYTYVA :. : .. . : ::: CCDS41 YMERDKDNPNQYHYVA 750 >>CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (895 aa) initn: 1336 init1: 380 opt: 978 Z-score: 1114.5 bits: 217.2 E(32554): 9.3e-56 Smith-Waterman score: 1705; 38.7% identity (69.4% similar) in 768 aa overlap (9-768:174-895) 10 20 30 pF1KSD MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAF---PMTMDEKYVNSIWD :: : :. :. : : . :.:.. :. CCDS43 ILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSAK--KLVIKNFKDKP-KLPENYTDETWQ 150 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 90 pF1KSD LLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHL---INKVRED ::.:.. :: ... ..::::. . .. .: . .:: ::.. .:. :.. ::: CCDS43 KLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFRED 210 220 230 240 250 260 100 110 120 130 140 150 pF1KSD VLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNV-ENVYNLGLIIFRDQV :.:. ::. ... :..: :.:::.:....::.:: ::.. .....:: .:: .. CCDS43 SLDSVL--FLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHI 270 280 290 300 310 160 170 180 190 200 210 pF1KSD VRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLE . .... . .: .: :::.::..::. .:. .:: : ..:...:: ::: CCDS43 ISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDL-----QIYQDSFEQRFLE 320 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 pF1KSD MSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISK . ... :.::.. : . :...:. :..:: .:.. ::..:.. .. .::..:... CCDS43 ETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGE 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 pF1KSD HMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSE :. .:.. .:: ..: ... .::. .:.::::: .:.... . :.. :...: . CCDS43 HLTAILQ---KGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVIN 440 450 460 470 480 490 340 350 360 370 380 390 pF1KSD EGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSP-EYLSL . :. ..: :::.:.. :... : ... : ... :: :.: .: : .. CCDS43 PEKDKT---MVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKRPNKPAELIAK 500 510 520 530 540 400 410 420 430 440 450 pF1KSD FIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDS ..:.::. : : :..:.: .::: :..:::. ::::: .::. ::.:::..::.: :. CCDS43 YVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDA 550 560 570 580 590 600 460 470 480 490 500 510 pF1KSD EKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTT ::.:.:::: ::: :::::::::.:: .:. : .:.:..: .: :...::: .:: CCDS43 EKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVP-GNIELTVNILTM 610 620 630 640 650 660 520 530 540 550 560 570 pF1KSD GYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKE ::::: . . ..:: . :::. :::.:::::.: : .: :.: : :: CCDS43 GYWPTY-VPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKAEF-----KE 670 680 690 700 710 720 580 590 600 610 620 630 pF1KSD DGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRA .: :::: :: .:..::. :....:::.: : : . :: :. CCDS43 GKKE-----------------LQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRT 730 740 750 760 640 650 660 670 680 690 pF1KSD LQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKE :::::::: :::.:.::.:.::.: : ::.: :: :.::. . : :. :. CCDS43 LQSLACGK--ARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMK--ETVEEQAS 770 780 790 800 810 700 710 720 730 740 750 pF1KSD TRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIE : ..: .::...:.:::::::: :: ..::.::.:: .::: : .:. .:::::.::. CCDS43 TTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLK--FPVKPADLKKRIESLID 820 830 840 850 860 870 760 pF1KSD REYLARTPEDRKVYTYVA :.:. : :. . :.:.: CCDS43 RDYMERDKENPNQYNYIA 880 890 >>CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (900 aa) initn: 1336 init1: 380 opt: 978 Z-score: 1114.5 bits: 217.2 E(32554): 9.3e-56 Smith-Waterman score: 1705; 38.7% identity (69.4% similar) in 768 aa overlap (9-768:179-900) 10 20 30 pF1KSD MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAF---PMTMDEKYVNSIWD :: : :. :. : : . :.:.. :. CCDS83 ILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSAK--KLVIKNFKDKP-KLPENYTDETWQ 150 160 170 180 190 200 40 50 60 70 80 90 pF1KSD LLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHL---INKVRED ::.:.. :: ... ..::::. . .. .: . .:: ::.. .:. :.. ::: CCDS83 KLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFRED 210 220 230 240 250 260 100 110 120 130 140 150 pF1KSD VLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNV-ENVYNLGLIIFRDQV :.:. ::. ... :..: :.:::.:....::.:: ::.. .....:: .:: .. CCDS83 SLDSVL--FLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHI 270 280 290 300 310 320 160 170 180 190 200 210 pF1KSD VRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLE . .... . .: .: :::.::..::. .:. .:: : ..:...:: ::: CCDS83 ISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDL-----QIYQDSFEQRFLE 330 340 350 360 370 220 230 240 250 260 270 pF1KSD MSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISK . ... :.::.. : . :...:. :..:: .:.. ::..:.. .. .::..:... CCDS83 ETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGE 380 390 400 410 420 430 280 290 300 310 320 330 pF1KSD HMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSE :. .:.. .:: ..: ... .::. .:.::::: .:.... . :.. :...: . CCDS83 HLTAILQ---KGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVIN 440 450 460 470 480 490 340 350 360 370 380 390 pF1KSD EGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSP-EYLSL . :. ..: :::.:.. :... : ... : ... :: :.: .: : .. CCDS83 PEKDKT---MVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKRPNKPAELIAK 500 510 520 530 540 550 400 410 420 430 440 450 pF1KSD FIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDS ..:.::. : : :..:.: .::: :..:::. ::::: .::. ::.:::..::.: :. CCDS83 YVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDA 560 570 580 590 600 610 460 470 480 490 500 510 pF1KSD EKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTT ::.:.:::: ::: :::::::::.:: .:. : .:.:..: .: :...::: .:: CCDS83 EKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVP-GNIELTVNILTM 620 630 640 650 660 670 520 530 540 550 560 570 pF1KSD GYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKE ::::: . . ..:: . :::. :::.:::::.: : .: :.: : :: CCDS83 GYWPTY-VPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKAEF-----KE 680 690 700 710 720 580 590 600 610 620 630 pF1KSD DGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRA .: :::: :: .:..::. :....:::.: : : . :: :. CCDS83 GKKE-----------------LQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRT 730 740 750 760 640 650 660 670 680 690 pF1KSD LQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKE :::::::: :::.:.::.:.::.: : ::.: :: :.::. . : :. :. CCDS83 LQSLACGK--ARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMK--ETVEEQAS 770 780 790 800 810 820 700 710 720 730 740 750 pF1KSD TRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIE : ..: .::...:.:::::::: :: ..::.::.:: .::: : .:. .:::::.::. CCDS83 TTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLK--FPVKPADLKKRIESLID 830 840 850 860 870 880 760 pF1KSD REYLARTPEDRKVYTYVA :.:. : :. . :.:.: CCDS83 RDYMERDKENPNQYNYIA 890 900 >>CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs108|chrX (913 aa) initn: 1336 init1: 380 opt: 978 Z-score: 1114.4 bits: 217.2 E(32554): 9.4e-56 Smith-Waterman score: 1705; 38.7% identity (69.4% similar) in 768 aa overlap (9-768:192-913) 10 20 30 pF1KSD MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAF---PMTMDEKYVNSIWD :: : :. :. : : . :.:.. :. CCDS35 ILISSVASVHHANGLAKSSTTVSSFANSKPGSAK--KLVIKNFKDKP-KLPENYTDETWQ 170 180 190 200 210 40 50 60 70 80 90 pF1KSD LLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHL---INKVRED ::.:.. :: ... ..::::. . .. .: . .:: ::.. .:. :.. ::: CCDS35 KLKEAVEAIQNSTSIKYNLEELYQAVENLCSYKISANLYKQLRQICEDHIKAQIHQFRED 220 230 240 250 260 270 100 110 120 130 140 150 pF1KSD VLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNNV-ENVYNLGLIIFRDQV :.:. ::. ... :..: :.:::.:....::.:: ::.. .....:: .:: .. CCDS35 SLDSVL--FLKKIDRCWQNHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSMLPSIWDMGLELFRAHI 280 290 300 310 320 330 160 170 180 190 200 210 pF1KSD VRYGCIRDHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLE . .... . .: .: :::.::..::. .:. .:: : ..:...:: ::: CCDS35 ISDQKVQNKTIDGILLLIERERNGEAIDRSLLRSLLSMLSDL-----QIYQDSFEQRFLE 340 350 360 370 380 390 220 230 240 250 260 270 pF1KSD MSAEFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISK . ... :.::.. : . :...:. :..:: .:.. ::..:.. .. .::..:... CCDS35 ETNRLYAAEGQKLMQEREVPEYLHHVNKRLEEEADRLITYLDQTTQKSLIATVEKQLLGE 400 410 420 430 440 450 280 290 300 310 320 330 pF1KSD HMKTIVEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSE :. .:.. .:: ..: ... .::. .:.::::: .:.... . :.. :...: . CCDS35 HLTAILQ---KGLNNLLDENRIQDLSLLYQLFSRVRGGVQVLLQQWIEYIKAFGSTIVIN 460 470 480 490 500 340 350 360 370 380 390 pF1KSD EGEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSP-EYLSL . :. ..: :::.:.. :... : ... : ... :: :.: .: : .. CCDS35 PEKDKT---MVQELLDFKDKVDHIIDICFLKNEKFINAMKEAFETFINKRPNKPAELIAK 510 520 530 540 550 560 400 410 420 430 440 450 pF1KSD FIDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDS ..:.::. : : :..:.: .::: :..:::. ::::: .::. ::.:::..::.: :. CCDS35 YVDSKLRAGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDA 570 580 590 600 610 620 460 470 480 490 500 510 pF1KSD EKNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTT ::.:.:::: ::: :::::::::.:: .:. : .:.:..: .: :...::: .:: CCDS35 EKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQNVP-GNIELTVNILTM 630 640 650 660 670 680 520 530 540 550 560 570 pF1KSD GYWPTQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKE ::::: . . ..:: . :::. :::.:::::.: : .: :.: : :: CCDS35 GYWPTY-VPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGHCVLKAEF-----KE 690 700 710 720 730 580 590 600 610 620 630 pF1KSD DGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRA .: :::: :: .:..::. :....:::.: : : . :: :. CCDS35 GKKE-----------------LQVSLFQTLVLLMFNEGEEFSLEEIKQATGIEDGELRRT 740 750 760 770 780 640 650 660 670 680 690 pF1KSD LQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKE :::::::: :::.:.::.:.::.: : ::.: :: :.::. . : :. :. CCDS35 LQSLACGK--ARVLAKNPKGKDIEDGDKFICNDDFKHKLFRIKINQIQMK--ETVEEQAS 790 800 810 820 830 700 710 720 730 740 750 pF1KSD TRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIE : ..: .::...:.:::::::: :: ..::.::.:: .::: : .:. .:::::.::. CCDS35 TTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLVSEVYNQLK--FPVKPADLKKRIESLID 840 850 860 870 880 890 760 pF1KSD REYLARTPEDRKVYTYVA :.:. : :. . :.:.: CCDS35 RDYMERDKENPNQYNYIA 900 910 >>CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs108|chr13 (659 aa) initn: 1315 init1: 385 opt: 932 Z-score: 1064.1 bits: 207.4 E(32554): 6e-53 Smith-Waterman score: 1624; 40.9% identity (67.9% similar) in 702 aa overlap (73-768:2-659) 50 60 70 80 90 pF1KSD EIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKV---REDVLNSLNN :: ::.. .:. .. ::: :.:. CCDS95 MLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVL- 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KSD NFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQQNN-VENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIR ::. .: :.:: :.:::.:....::.:: ::. . .....:: .:: ... .. CCDS95 -FLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQ 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 210 pF1KSD DHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFFQ .. . .: .: :::.::.:::. .:. :: : .::...:: ::: . .. CCDS95 SKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDL-----QVYKDSFELKFLEETNCLYA 90 100 110 120 130 140 220 230 240 250 260 270 pF1KSD MESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTIVE :.:... : . :...: :..:: .::. ::.::..:.. ::..:...:. .:.. CCDS95 AEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQ 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 pF1KSD MENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGKNP .:: :.: .... ::. ::.::::: .: ... . : :.. : :.: . . : CCDS95 ---KGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDK-- 210 220 230 240 250 340 350 360 370 380 390 pF1KSD VDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNSRSP-EYLSLFIDDKLK :..: :::.:.. :. . :.... : . . .:: :.: .: : .. .:.::. CCDS95 -DMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLR 260 270 280 290 300 310 400 410 420 430 440 450 pF1KSD KGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNMISK : : :..:.: ::: :.::::.. ::::: .::. ::.:::..::.: :.::.:.:: CCDS95 AGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSK 320 330 340 350 360 370 460 470 480 490 500 510 pF1KSD LKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLQATGVSLGGVDLTVRVLTTGYWPTQS :: ::: :::::::::.:: .:. : .:.::.: . : : .:::: .:: ::::: CCDS95 LKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDS-GPIDLTVNILTMGYWPTY- 380 390 400 410 420 430 520 530 540 550 560 570 pF1KSD ATP-KCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVKKEDGSEVG :: . .. : . :.:. :::.:::::.: : .: : :.: : :: .: CCDS95 -TPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEF-----KEGKKE-- 440 450 460 470 480 580 590 600 610 620 630 pF1KSD VGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELVRALQSLAC .::: :: .:..::. . ..::::.. : : . :: :.:::::: CCDS95 ---------------FQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLAC 490 500 510 520 530 640 650 660 670 680 690 pF1KSD GKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVD :: ::: : ::.::.:.: : : .: :: :.::. . : :. :. : ..: CCDS95 GKA--RVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMK--ETVEEQVSTTERVF 540 550 560 570 580 700 710 720 730 740 750 pF1KSD DDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLAR .::...:.:::::::: :: . ::.::.:. .::: : .: .:::::.::.:.:. : CCDS95 QDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLK--FPVKPGDLKKRIESLIDRDYMER 590 600 610 620 630 640 760 pF1KSD TPEDRKVYTYVA .. . : ::: CCDS95 DKDNPNQYHYVA 650 >>CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (745 aa) initn: 912 init1: 323 opt: 666 Z-score: 759.3 bits: 151.2 E(32554): 5.7e-36 Smith-Waterman score: 1073; 27.8% identity (63.2% similar) in 785 aa overlap (16-768:1-745) 10 20 30 40 50 pF1KSD MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPMTMDEKYVNSIWDLLKNAIQ-EIQRKNNSGLSFEELYR : .. . .:: . :.. .: ... : .. . . : ..: CCDS71 MSLKPRVVDFDETW-NKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYA 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KSD --NAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMV :: : ::.::: . . :. . .... ::.: ... : .. :.... . CCDS71 LCVAYPEPL---GERLYTETK-IFLENHVRHLHKRVLES-EEQVLVMYHRYWEEYSKGAD 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 pF1KSD MIRDILMYMDRVYVQQNNVENV---YNLGLIIFRDQVVRYGCIR-DHLRQTLLD------ .. . :.. ....:.. .. :. : . . . ... : . : :. ... CCDS71 YMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAIL 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 pF1KSD --MIARE----RKGE----VVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFF :. :: : :: : .:.: . .. . . :.: ::.::: ..:.. CCDS71 IRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYY 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KSD QMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTI- ..:....: :.. : :..:: .:...: : . : :. ... ...... :.. . CCDS71 KQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLH 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KSD VEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGK .: .: .... : .:.. :: :. : .:: : . ........: .:. . . CCDS71 AECHN-----IIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQEN 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KSD NPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNS-----RSPEYLSLF :. .....:.....: ... .:.:. : ... . .: ..:: :. . CCDS71 MPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKY 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KSD IDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSE :. :::..::.::.::: : . ...:.....::::...: . ::.::. . :.: ::: CCDS71 CDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSE 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KSD KNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHL--QATGVSLGGVDLTVRVLT . ::.::: :: .:::::. :. :::.: ..: . . : : ..:: ... . :: CCDS71 EAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLG-ISFQIYVLQ 460 470 480 490 500 510 510 520 530 540 550 560 pF1KSD TGYWP-TQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVK .: :: ::. . :: ... ..:. :: . :::.:: :.. ..... .. : CCDS71 AGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLG--- 520 530 540 550 560 570 570 580 590 600 610 620 pF1KSD KEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELV . .. .:.:.::..:. ::: : ...:.:. :.. :.::. CCDS71 -------------------KPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELT 580 590 600 610 630 640 650 660 670 680 pF1KSD RALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPER ....:: ...... ....:. :..: .:.:: :.:.. ... : .. : CCDS71 KTIKSLL----DVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSK--RTKFKITTSMQKDTPQEM 620 630 640 650 660 690 700 710 720 730 740 pF1KSD KETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGL ..::. ::.::: ..::::::::.:: ..::.:. :: .: .::: :: .::: :: : CCDS71 EQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVL 670 680 690 700 710 720 750 760 pF1KSD IEREYLARTPEDRKVYTYVA :...:. :. . :.::: CCDS71 IDKQYIERSQASADEYSYVA 730 740 >>CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs108|chr10 (758 aa) initn: 912 init1: 323 opt: 666 Z-score: 759.2 bits: 151.2 E(32554): 5.7e-36 Smith-Waterman score: 1073; 27.8% identity (63.2% similar) in 785 aa overlap (16-768:14-758) 10 20 30 40 50 pF1KSD MSNLSKGTGSRKDTKMRIRAFPMTMDEKYVNSIWDLLKNAIQ-EIQRKNNSGLSFEELYR : .. . .:: . :.. .: ... : .. . . : ..: CCDS73 MVPGKEFQHYTCTMSLKPRVVDFDETW-NKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KSD --NAYTMVLHKHGEKLYTGLREVVTEHLINKVREDVLNSLNNNFLQTLNQAWNDHQTAMV :: : ::.::: . . :. . .... ::.: ... : .. :.... . CCDS73 LCVAYPEPL---GERLYTETK-IFLENHVRHLHKRVLES-EEQVLVMYHRYWEEYSKGAD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KSD MIRDILMYMDRVYVQQNNVENV---YNLGLIIFRDQVVRYGCIR-DHLRQTLLD------ .. . :.. ....:.. .. :. : . . . ... : . : :. ... CCDS73 YMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAIL 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KSD --MIARE----RKGE----VVDRGAIRNACQMLMILGLEGRSVYEEDFEAPFLEMSAEFF :. :: : :: : .:.: . .. . . :.: ::.::: ..:.. CCDS73 IRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYY 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KSD QMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERVMHCLDKSTEEPIVKVVERELISKHMKTI- ..:....: :.. : :..:: .:...: : . : :. ... ...... :.. . CCDS73 KQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHPSSYTKVIHECQQRMVADHLQFLH 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KSD VEMENSGLVHMLKNGKTEDLGCMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSEEGEGK .: .: .... : .:.. :: :. : .:: : . ........: .:. . . CCDS73 AECHN-----IIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQEN 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KSD NPVDYIQGLLDLKSRFDRFLLESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLNS-----RSPEYLSLF :. .....:.....: ... .:.:. : ... . .: ..:: :. . CCDS73 MPTLFVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVNYREPKSVCKAPELLAKY 350 360 370 380 390 400 400 410 420 430 440 450 pF1KSD IDDKLKKGVKGLTEQEVETILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSE :. :::..::.::.::: : . ...:.....::::...: . ::.::. . :.: ::: CCDS73 CDNLLKKSAKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHGLSMSMDSE 410 420 430 440 450 460 460 470 480 490 500 pF1KSD KNMISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHL--QATGVSLGGVDLTVRVLT . ::.::: :: .:::::. :. :::.: ..: . . : : ..:: ... . :: CCDS73 EAMINKLKQACGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLG-ISFQIYVLQ 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 pF1KSD TGYWP-TQSATPKCNIPPAPRHAFEIFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPVK .: :: ::. . :: ... ..:. :: . :::.:: :.. ..... .. : CCDS73 AGAWPLTQAPSSTFAIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEVKMNYLG--- 530 540 550 560 570 580 570 580 590 600 610 620 pF1KSD KEDGSEVGVGGAQVTGSNTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKYTFEEIQQETDIPERELV . .. .:.:.::..:. ::: : ...:.:. :.. :.::. CCDS73 -------------------KPYVAMVTTYQMAVLLAFNNSETVSYKELQDSTQMNEKELT 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 pF1KSD RALQSLACGKPTQRVLTKEPKSKEIENGHIFTVNDQFTSKLHRVKIQTVAAKQGESDPER ....:: ...... ....:. :..: .:.:: :.:.. ... : .. : CCDS73 KTIKSLL----DVKMINHDSEKEDIDAESSFSLNMNFSSK--RTKFKITTSMQKDTPQEM 630 640 650 660 670 690 700 710 720 730 740 pF1KSD KETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRKKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGL ..::. ::.::: ..::::::::.:: ..::.:. :: .: .::: :: .::: :: : CCDS73 EQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVL 680 690 700 710 720 730 750 760 pF1KSD IEREYLARTPEDRKVYTYVA :...:. :. . :.::: CCDS73 IDKQYIERSQASADEYSYVA 740 750 768 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 02:19:12 2016 done: Thu Nov 3 02:19:13 2016 Total Scan time: 2.560 Total Display time: 0.180 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]