Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0620
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0620, 1925 aa
1>>>pF1KSDA0620 1925 - 1925 aa - 1925 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1734+/-0.000902; mu= 21.2758+/- 0.055
mean_var=96.4447+/-18.841, 0's: 0 Z-trim(108.3): 44 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.130598
statistics sampled from 10090 (10129) to 10090 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.311), width: 16
Scan time: 5.090
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925) 12949 2451.3 0
CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838) 1967 382.1 1.1e-104
CCDS14752.1 PLXNA3 gene_id:55558|Hs108|chrX (1871) 1571 307.5 3.1e-82
CCDS9049.1 PLXNC1 gene_id:10154|Hs108|chr12 (1568) 1567 306.7 4.6e-82
CCDS33847.2 PLXNA1 gene_id:5361|Hs108|chr3 (1896) 1564 306.2 7.9e-82
CCDS2765.1 PLXNB1 gene_id:5364|Hs108|chr3 (2135) 1145 227.3 5.1e-58
CCDS55536.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1932) 1029 205.4 1.8e-51
CCDS31013.1 PLXNA2 gene_id:5362|Hs108|chr1 (1894) 1027 205.0 2.3e-51
CCDS43646.1 PLXNA4 gene_id:91584|Hs108|chr7 (1894) 1007 201.3 3.1e-50
CCDS14729.1 PLXNB3 gene_id:5365|Hs108|chrX (1909) 1006 201.1 3.5e-50
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 391 85.1 2.1e-15
>>CCDS33854.1 PLXND1 gene_id:23129|Hs108|chr3 (1925 aa)
initn: 12949 init1: 12949 opt: 12949 Z-score: 13175.4 bits: 2451.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 12949; 99.8% identity (99.9% similar) in 1925 aa overlap (1-1925:1-1925)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTN
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CCDS33 MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NFALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NFALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LNSEARAGDKESQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRGDLYSRLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LNSEARAGDKESQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRGDLYSRLVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD NYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEPVHHVMQFDPADSVYLYLMTSHQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS33 NYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD MARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAY
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD CNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAF
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD FQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIRAIEPLS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS33 PMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIHAIEPLS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD GPLDGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GPLDGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD VVTVNASKEGKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VVTVNASKEGKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD PCTELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PCTELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD INGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 INGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD KEQDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSVNESLGAAVGQLPITIQVGNFNQTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KEQDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSVNESLGAAVGQLPITIQVGNFNQTI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD ATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIRE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD EIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD QGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD RCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSI
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD CMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLRENIEAKPRNLNV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS33 CMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLSEEWLLRENIEAKPRNLNV
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KSD SFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYIL
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KSD RDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPT
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KSD DELAEPKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DELAEPKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYF
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KSD FDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQ
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KSD AFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KSD SRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KSD CYSEA
:::::
CCDS33 CYSEA
>>CCDS43035.1 PLXNB2 gene_id:23654|Hs108|chr22 (1838 aa)
initn: 2140 init1: 725 opt: 1967 Z-score: 1993.1 bits: 382.1 E(32554): 1.1e-104
Smith-Waterman score: 3340; 35.0% identity (62.2% similar) in 1955 aa overlap (33-1918:5-1835)
10 20 30 40 50
pF1KSD PRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRR---FPSPTPT
: : ::: ::: :. : :
CCDS43 MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKEL
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KSD NNFALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRR
:..:.: :.:.:::.::: ::::. :.:.:: ..:.::. :. : .: . ..: : .
CCDS43 NHLAVDEASGVVYLGAVNALYQLD-AKLQLEQQVATGPALDNKKC-TPPIEASQC-HEAE
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LTDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSM
.::: :..: ::: . .: :::...:.: :: .::: .:. .: :
CCDS43 MTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGICALRALSNIS---LRLFYEDGSGEKSFV----
100 110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LNVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIA
:.: ...::::: ..: ::.:.: ..: :.. : : .: ..
CCDS43 ---ASNDEGVATVGLV--SSTGPGGDRVL----FVGKGNG--P-------H--DNGIIVS
150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KSD IRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYL
: :: : : . : . :. : : . ::.:: : : :...
CCDS43 TRLLD-RTDSREAF----EAYTDHAT-YKAGYLSTNTQQFVAAF---EDGP-----YVFF
190 200 210 220 230
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ALNSEARAGDKE-SQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAG----GAGRGDL
..:.. ::. .. :.::::.: : . ::... ::: .:. :
CCDS43 VFNQQ----DKHPARNRTLLARMCRE-----DPNYY--SYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTC
240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KSD YSRLVSVFPARER-LFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACFV--EP
. :.. :. : :.::: : : .. . :.:: : . :.: ..: :.::.. .
CCDS43 LAASVAA-PGSGRVLYAVFSRD--SRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTRE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KSD APDVV-AVLDSVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPG
: :. . . .: : : . ... ::. :: .::. . :..: :.. :
CCDS43 ARDIFYKPFHGDIQCGGHA-------PGSSKSFPCGSEHLPYPLGSRDGLRGTAVLQRGG
340 350 360 370 380
480 490 500 510 520
pF1KSD L--TSVAVASVNNYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEPVHHVMQFDPA
: :.:.::. ::.:..:::: .::.::. :. . . : .. :.. . .. .
CCDS43 LNLTAVTVAAENNHTVAFLGTSDGRILKVYLTPDGTSSEYDSILVEINKRVKRDLVLS-G
390 400 410 420 430 440
530 540 550 560 570 580
pF1KSD DSVYLYLMTSHQMARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQH
: :: ::. .. :. : : . :: .: . : :::::..: ::: . .: . .
CCDS43 DLGSLYAMTQDKVFRLPVQECLSYPTCTQCRDSQDPYCGWCVVEGRCTRKAECPRAEEAS
450 460 470 480 490 500
590 600 610 620 630 640
pF1KSD FWTSASEGPSRCPAMT-VLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGM-EMACDYGNNIRTV
: :.. : : :.: . :.... : . : . . ::.:: :. : .:..
CCDS43 HWL-WSRSKS-CVAVTSAQPQNMSRRAQ--GEVQLTVSPLPALSEEDELLCLFGESPPHP
510 520 530 540 550 560
650 660 670 680 690 700
pF1KSD ARVPGPAFGHQIAYCNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNI--VKANFTIYDCSR
::: : : . :: : ...: ::.::::.: ... . :: .. .. .::: .
CCDS43 ARVEGEA-----VICNS-P-SSIPVTPPGQDHVAVTIQLLLRRGNIFLTSYQYPFYDCRQ
570 580 590 600 610
710 720 730 740 750
pF1KSD TAQVYPHTACTSCLSAQWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTS-------PQDCPRTLL
. .. . : ::.: .: : : . : : : :::::: . ..::. :
CCDS43 AMSLEENLPCISCVSNRWTCQWDLRYHEC-----R-EASPNPEDGIVRAHMEDSCPQFLG
620 630 640 650 660 670
760 770 780 790 800 810
pF1KSD -SPLAPVPTGGSQNILVPLANTAFFQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTT
:::. .: . .. : .:..:. . : ...: : ..:: . .. .
CCDS43 PSPLV-IPMNHETDVNFQGKNLDTVKGSSLHVGSDLLKFMEPVTMQESGTFAFRTPKLSH
680 690 700 710 720 730
820 830 840 850 860 870
pF1KSD RKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDG--
....:: : .:. .. .:: . : .:::..: ::: : . . . : : :
CCDS43 DANETLPLHLYVKSY-GKNIDS--KLHVTLYNCSFGRSDCSLCRAANP-DYRCAWCGGQS
740 750 760 770 780
880 890 900 910 920 930
pF1KSD -CRLRGPLQPMAGTCPAPEIRAIEPLSGPLDGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVA
: . : .. :: : : :.: .::: :: .:: : ::: . .:. . . ..:
CCDS43 RC-VYEALCNTTSECPPPVITRIQPETGPLGGGIRITILGSNLGVQAGDIQR-ISVAGRN
790 800 810 820 830 840
940 950 960 970 980 990
pF1KSD CEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSGVVTVNA-SKEGKSRD--RFSYVLPLVHSLEPTM
: :.::.:: .:::: : :..: : :.. .: :.: .:.. : :.:: .
CCDS43 CSFQPERYSVSTRIVCVIEAAETPFTGGVEVDVFGKLGRSPPNVQFTFQQPKPLSVEPQQ
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:....:::.. :. :::.:..:: .::. ::.::::. :: ...: : ...: :
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:: : :..::: ::.. .::.: .: . ... .:: :.. .::
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1920
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CCDS43 LENKVTDL
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CCDS14 YKTLTLHCVCPENEGSAQVPVKVLNCDSITQAKDKLLDTVYKGIPYSQRPKAEDMDLEWR
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CCDS14 LTRLLATKGTLQKFVDDLFETVFSTAHRGSALPLAIKYMFDFLDEQADQRQISDPDVRHT
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CCDS14 WKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFMDSCSTSEHRLGKDSPSNK
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CCDS14 LLYAKDIPNYKSWVERYYRDIAKMASISDQDMDAYLVEQSRLHASDFSVLSALNELYFYV
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CCDS14 TKYRQEILTALDRDASCRKHKLRQKLEQIISLVSSDS
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CCDS90 MEVSRRKAPPRPPRPAAPLPLLAYLLALAAPGRGADEPVWR--SEQAI
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:::..:...:: :..:..::: ..:::. ::.:..:: :...:.:: :::. . .::
CCDS33 HFLLTFIRTLEAQRSFSMRDRGNVASLIMTALQGEMEYATGVLKQLLSDLIEKNLESKNH
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pF1KSD PKLMLRRTESVVEKMLTNWMSICMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKAR
:::.:::::::.:::::::... .:. :.: .:::.:.: ::::::..:: ::::::.::
CCDS33 PKLLLRRTESVAEKMLTNWFTFLLYKFLKECAGEPLFMLYCAIKQQMEKGPIDAITGEAR
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pF1KSD YTLNEEWLLRENIEAKPRNLN-VSFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPY
:.:.:. :.:..:. : .:: :. .. . . :...: ::.::.:::.:.: :.:::
CCDS33 YSLSEDKLIRQQIDYKTLTLNCVNPENENAPEVPVKGLDCDTVTQAKEKLLDAAYKGVPY
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:: :.: :.:::: . ::.: : :. ... :.:::::::.. .:.:.:.
CCDS33 SQRPKAADMDLEWRQGRMARIILQDEDVTTKIDNDWKRLNTLAHYQVTDGSSVALVPKQT
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pF1KSD --------SLIDKK--------------DNTLGRVK----DLDT-EKYFHLVLPTDELAE
: . :. :. .:. ::.. : .::: :.: .
CCDS33 SAYNISNSSTFTKSLSRYESMLRTASSPDSLRSRTPMITPDLESGTKLWHLVKNHDHL-D
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pF1KSD PKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSI--REDKPPLAVKYFFDF
... : : :.. ::::::::.::::::::.::::..:.: : . :::.::.:::
CCDS33 QREGDRGS---KMVSEIYLTRLLATKGTLQKFVDDLFETIFSTAHRGSALPLAIKYMFDF
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pF1KSD LEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFI
:.:::.:. : : :. : ::.: ::::::::..::::::::: :.. ::::::.::.:.
CCDS33 LDEQADKHQIHDADVRHTWKSNCLPLRFWVNVIKNPQFVFDIHKNSITDACLSVVAQTFM
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pF1KSD DACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRK
:.:: :. .::::::.:::::::.::.:.. :.::: .: : .:.:.:.:.:::.::
CCDS33 DSCSTSEHKLGKDSPSNKLLYAKDIPNYKSWVERYYADIAKMPAISDQDMSAYLAEQSRL
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pF1KSD YQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYS
. ..::. :. :::.: .:. .:.:::: . ::: .:. :.:::: :
CCDS33 HLSQFNSMSALHEIYSYITKYKDEILAALEKDEQARRQRLRSKLEQVVDTMALSS
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pF1KSD EA
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CCDS27 WRRLNTLQHYKVPDGATVALVPCLTKHVLRENQDYVPGERTPMLEDVDEGGIRPWHLVKP
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CCDS27 SDE-PEPPRPRRGSLRGGERERAKAIPEIYLTRLLSMKGTLQKFVDDLFQVILS--TSRP
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pF1KSD -PLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHID
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CCDS27 VPLAVKYFFDLLDEQAQQHGISDQDTIHIWKTNSLPLRFWINIIKNPQFVFDVQTSDNMD
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pF1KSD ACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQE
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CCDS27 AVLLVIAQTFMDACTLADHKLGRDSPINKLLYARDIPRYKRMVERYYADIRQTVPASDQE
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pF1KSD MNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVA
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CCDS27 MNSVLAELSWNYSGDLGARVALHELYKYINKYYDQIITALEEDGTAQKMQLGYRLQQIAA
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pF1KSD LMEDNIYECYSEA
.:...
CCDS27 AVENKVTDL
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10 20 30 40
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CCDS55 MELTPASSLTCSLLSPRLPGSFPQLRRVPPCSRPWLPKAPVMARWPPFGLCLLLLLLSPP
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CCDS55 PLPLTGAHRFSAPNTTLNHLALAPGRGTLYVGAVNRLFQLS-PELQLEAVAVTGPVIDSP
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CCDS55 DC-VPFRDPAECPQAQ-LTDNANQLLLVSSRAQELVACGQVRQGVCETRRLGDVAEVLYQ
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pF1KSD FPPAAPPAEPVTVFPSMLNVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFP
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CCDS55 ---AEDPGDGQFV-------AANTPGVATVGLVVP----LPGRDLLLVA-----------
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pF1KSD RNRSLEDHRFENTPEIAIRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSA
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CCDS55 --RGLAGKLSAGVPPLAIRQL------AGSQPF----SSEGLGRLVVGDFSDYNNSYVGA
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CCDS55 LACQG---QGLIQ----AAFLAPGTLLGVFA---AGP--RGTQAALCAFPMVELGASMEQ
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CCDS55 ARRLCYTAGGRGPSGAEEATVEYGVTSRC---VTLPLDSPESYPCGDEHTPSPIAGRQPL
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.. :... . ...::. ..... .::: ..:.: :. :. :. : . . : .
CCDS55 EVQPLLKLGQPVSAVAALQADGHMIAFLGDTQGQLYKVFLHGSQGQVYHSQQVGPPGSAI
410 420 430 440 450 460
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pF1KSD HHVMQFDPADSVYLYLMTSHQMARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQ
. .: . : .::..:.::. :. :::: :..:. : : ::::.:. ::: .
CCDS55 SPDLLLDSSGS-HLYVLTAHQVDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKG
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::::::.::::::::.::::....: : . :::.::.::::.:::....: : :. :
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CCDS43 FNTMSALSEIFSYVGKYSEEILGPLDHDDQCGKQKLAYKLEQVITLMSLDS
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CCDS14 ALQADGHMIAFLGDTQGQLYKVFLHGSQGQVYHSQQVGPPGSAISPDLLLDSSGS-HLYV
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CCDS14 LTAHQVDRIPVAACPQFPDCASCLQAQDPLCGWCVLQGRCTRKGQCGRAGQLNQWLWSYE
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CCDS14 EDSHCLHIQSLLPGH-HPRQEQGQVTLSVP-RLPILDADEYFHCAFGD-YDSLAHVEGP-
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..: : :.:: : ::. ::::: ... . ... .::..:::: . . .
CCDS14 ---HVA-CVTPPQDQVPLNPPGTDHVTVPLALMFEDVTVAATNFSFYDCSAVQALEAAAP
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: .:... : : :: :. :: .. : :.. . .: ::.. : .:
CCDS14 CRACVGSIWRCHWCPQSSHCVYGEHCPEGERTIYSAQEVDIQVRGPGACPQVEGLAGPHL
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pF1KSD PVPTGGSQNILVPLANTAFFQG--AALECSF-------GLEEIFEAVWVNESVVRCDQVV
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CCDS14 -VPVGWESHLALRVRNLQHFRGLPASFHCWLELPGELRGLPATLEETAGDSGLIHCQAHQ
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pF1KSD LHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPEPMTVMVYNCAMGSPDCSQCLG-REDLGHLCMW
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]