Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0620
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0620, 1925 aa
1>>>pF1KSDA0620 1925 - 1925 aa - 1925 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3886+/-0.000369; mu= 19.7764+/- 0.023
mean_var=97.1472+/-19.365, 0's: 0 Z-trim(115.5): 148 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.130125
statistics sampled from 25764 (25922) to 25764 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 19.730
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055918 (OMIM: 604282) plexin-D1 precursor [Homo (1925) 12962 2444.9 0
XP_011510890 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1894) 12705 2396.7 0
XP_011510892 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1467) 9765 1844.7 0
XP_011510891 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i (1795) 7865 1488.1 0
XP_011510894 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 i ( 981) 6461 1224.3 0
XP_006724476 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1967 380.8 6.8e-104
XP_005261968 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1967 380.8 6.8e-104
NP_036533 (OMIM: 604293) plexin-B2 precursor [Homo (1838) 1967 380.8 6.8e-104
XP_016884192 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1967 380.8 6.8e-104
XP_005261967 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1967 380.8 6.8e-104
XP_005261966 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1967 380.8 6.8e-104
XP_016884193 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1838) 1967 380.8 6.8e-104
XP_011528984 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 i (1901) 1967 380.9 7e-104
XP_005274762 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1853) 1676 326.2 1.9e-87
XP_006724892 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1841) 1649 321.1 6.4e-86
XP_005274763 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1789) 1571 306.5 1.6e-81
NP_059984 (OMIM: 300022) plexin-A3 precursor [Homo (1871) 1571 306.5 1.7e-81
XP_006719249 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1555) 1569 306.1 1.8e-81
XP_011529485 (OMIM: 300022) PREDICTED: plexin-A3 i (1684) 1569 306.1 2e-81
NP_005752 (OMIM: 604259) plexin-C1 precursor [Homo (1568) 1567 305.7 2.4e-81
NP_115618 (OMIM: 601055) plexin-A1 precursor [Homo (1896) 1564 305.2 4.2e-81
XP_011511211 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 i (1914) 1564 305.2 4.2e-81
XP_011511210 (OMIM: 601055) PREDICTED: plexin-A1 i (1914) 1564 305.2 4.2e-81
NP_001123554 (OMIM: 601053) plexin-B1 precursor [H (2135) 1145 226.6 2.2e-57
NP_002664 (OMIM: 601053) plexin-B1 precursor [Homo (2135) 1145 226.6 2.2e-57
XP_016862120 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2135) 1145 226.6 2.2e-57
XP_011532137 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 1134 224.5 9.2e-57
XP_016862119 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 1134 224.5 9.2e-57
XP_011532138 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 1134 224.5 9.2e-57
XP_011532136 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 1134 224.5 9.2e-57
XP_011532139 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 1134 224.5 9.2e-57
XP_011532135 (OMIM: 601053) PREDICTED: plexin-B1 i (2136) 1134 224.5 9.2e-57
NP_001156729 (OMIM: 300214) plexin-B3 isoform 2 [H (1932) 1029 204.8 7.3e-51
NP_079455 (OMIM: 601054) plexin-A2 precursor [Homo (1894) 1027 204.4 9.3e-51
XP_016868268 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1827) 1007 200.6 1.2e-49
XP_006716234 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1894) 1007 200.6 1.3e-49
NP_065962 (OMIM: 604280) plexin-A4 isoform 1 precu (1894) 1007 200.6 1.3e-49
XP_005250743 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1894) 1007 200.6 1.3e-49
NP_005384 (OMIM: 300214) plexin-B3 isoform 1 precu (1909) 1006 200.4 1.4e-49
XP_011514978 (OMIM: 604280) PREDICTED: plexin-A4 i (1437) 850 171.1 7.4e-41
XP_005273222 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 i (1823) 826 166.6 2.1e-39
XP_005273221 (OMIM: 601054) PREDICTED: plexin-A2 i (1974) 775 157.1 1.7e-36
XP_016874161 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1315) 709 144.6 6.4e-33
XP_011536032 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1322) 696 142.2 3.5e-32
XP_016874160 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1323) 695 142.0 4e-32
XP_011536033 (OMIM: 604259) PREDICTED: plexin-C1 i (1036) 412 88.8 3.2e-16
NP_001311330 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 ( 934) 391 84.8 4.5e-15
NP_001311331 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 ( 960) 391 84.8 4.6e-15
XP_006716053 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61 ( 960) 391 84.8 4.6e-15
NP_000236 (OMIM: 114550,164860,605074,607278,61670 (1390) 391 84.9 6.3e-15
>>NP_055918 (OMIM: 604282) plexin-D1 precursor [Homo sap (1925 aa)
initn: 12962 init1: 12962 opt: 12962 Z-score: 13141.1 bits: 2444.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 12962; 99.9% identity (99.9% similar) in 1925 aa overlap (1-1925:1-1925)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NFALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NFALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSML
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LNSEARAGDKESQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRGDLYSRLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LNSEARAGDKESQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAGGAGRGDLYSRLVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD VFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VFPARERLFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACFVEPAPDVVAVLD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVVQGTGPACERKLNIQLQPEQLDCGAAHLQHPLSILQPLKATPVFRAPGLTSVAVASVN
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD NYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEPVHHVMQFDPADSVYLYLMTSHQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
NP_055 NYTAVFLGTVNGRLLKINLNESMQVVSRRVVTVAYGEPVHHVMQFDPADSGYLYLMTSHQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MARVKVAACNVHSTCGDCVGAADAYCGWCALETRCTLQQDCTNSSQQHFWTSASEGPSRC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PAMTVLPSEIDVRQEYPGMILQISGSLPSLSGMEMACDYGNNIRTVARVPGPAFGHQIAY
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD CNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CNLLPRDQFPPFPPNQDHVTVEMSVRVNGRNIVKANFTIYDCSRTAQVYPHTACTSCLSA
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pF1KSD QWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QWPCFWCSQQHSCVSNQSRCEASPNPTSPQDCPRTLLSPLAPVPTGGSQNILVPLANTAF
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pF1KSD FQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FQGAALECSFGLEEIFEAVWVNESVVRCDQVVLHTTRKSQVFPLSLQLKGRPARFLDSPE
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pF1KSD PMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIRAIEPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PMTVMVYNCAMGSPDCSQCLGREDLGHLCMWSDGCRLRGPLQPMAGTCPAPEIRAIEPLS
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD GPLDGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GPLDGGTLLTIRGRNLGRRLSDVAHGVWIGGVACEPLPDRYTVSEEIVCVTGPAPGPLSG
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pF1KSD VVTVNASKEGKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VVTVNASKEGKSRDRFSYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTD
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pF1KSD PCTELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PCTELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSP
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pF1KSD VSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFF
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pF1KSD INGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 INGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIH
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pF1KSD KEQDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSVNESLGAAVGQLPITIQVGNFNQTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KEQDSLGLQSHEYRVKIGQVSCDIQIVSDRIIHCSVNESLGAAVGQLPITIQVGNFNQTI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ATLQLGGSETAIIVSIVICSVLLLLSVVALFVFCTKSRRAERYWQKTLLQMEEMESQIRE
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pF1KSD EIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EIRKGFAELQTDMTDLTKELNRSQGIPFLEYKHFVTRTFFPKCSSLYEERYVLPSQTLNS
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD QGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QGSSQAQETHPLLGEWKIPESCRPNMEEGISLFSSLLNNKHFLIVFVHALEQQKDFAVRD
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pF1KSD RCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RCSLASLLTIALHGKLEYYTSIMKELLVDLIDASAAKNPKLMLRRTESVVEKMLTNWMSI
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pF1KSD CMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLRENIEAKPRNLNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CMYSCLRETVGEPFFLLLCAIKQQINKGSIDAITGKARYTLNEEWLLRENIEAKPRNLNV
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pF1KSD SFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SFQGCGMDSLSVRAMDTDTLTQVKEKILEAFCKNVPYSQWPRAEDVDLEWFASSTQSYIL
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pF1KSD RDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RDLDDTSVVEDGRKKLNTLAHYKIPEGASLAMSLIDKKDNTLGRVKDLDTEKYFHLVLPT
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pF1KSD DELAEPKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DELAEPKKSHRQSHRKKVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYF
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pF1KSD FDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQ
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pF1KSD AFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEE
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KSD SRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYE
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KSD CYSEA
:::::
NP_055 CYSEA
>>XP_011510890 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 isofo (1894 aa)
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Smith-Waterman score: 12705; 99.8% identity (99.9% similar) in 1887 aa overlap (1-1887:1-1887)
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XP_011 MAPRAAGGAPLSARAAAASPPPFQTPPRCPVPLLLLLLLGAARAGALEIQRRFPSPTPTN
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XP_011 PCTELMRTDTSIACTMPEGALPAPVPVCVRFERRGCVHGNLTFWYMQNPVITAISPRRSP
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XP_011 VSGGRTITVAGERFHMVQNVSMAVHHIGREPTLCKVLNSTLITCPSPGALSNASAPVDFF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 INGRAYADEVAVAEELLDPEEAQRGSRFRLDYLPNPQFSTAKREKWIKHHPGEPLTLVIH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 GLAADHRAARQAGVLHQHHEGAAGGPH
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>>XP_011510891 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 isofo (1795 aa)
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XP_011 FDFLEEQAEKRGISDPDTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQ
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XP_011 AFIDACSISDLQLGKDSPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEE
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XP_011 SRKYQNEFNTNVAMAEIYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYE
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XP_011 CYSEA
>>XP_011510894 (OMIM: 604282) PREDICTED: plexin-D1 isofo (981 aa)
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XP_011 SYVLPLVHSLEPTMGPKAGGTRITIHGNDLHVGSELQVLVNDTDPCTELMRTDTSIACTM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVLPEIYLTRLLSTKGTLQKFLDDLFKAILSIREDKPPLAVKYFFDFLEEQAEKRGISDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DTLHIWKTNSLPLRFWVNILKNPQFVFDIDKTDHIDACLSVIAQAFIDACSISDLQLGKD
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pF1KSD SPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SPTNKLLYAKEIPEYRKIVQRYYKQIQDMTPLSEQEMNAHLAEESRKYQNEFNTNVAMAE
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IYKYAKRYRPQIMAALEANPTARRTQLQHKFEQVVALMEDNIYECYSEA
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>>XP_006724476 (OMIM: 604293) PREDICTED: plexin-B2 isofo (1838 aa)
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: : ::: ::: :. : :
XP_006 MALQLWALTLLGLLGAGASLRPRKLDFFRSEKEL
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pF1KSD NNFALDGAAGTVYLAAVNRLYQLSGANLSLEAEAAVGPVPDSPLCHAPQLPQASCEHPRR
:..:.: :.:.:::.::: ::::. :.:.:: ..:.::. :. : .: . ..: : .
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40 50 60 70 80 90
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pF1KSD LTDNYNKILQLDPGQGLVVVCGSIYQGFCQLRRRGNISAVAVRFPPAAPPAEPVTVFPSM
.::: :..: ::: . .: :::...:.: :: .::: .:. .: :
XP_006 MTDNVNQLLLLDPPRKRLVECGSLFKGICALRALSNIS---LRLFYEDGSGEKSFV----
100 110 120 130 140
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pF1KSD LNVAANHPNASTVGLVLPPAAGAGGSRLLVGATYTGYGSSFFPRNRSLEDHRFENTPEIA
:.: ...::::: ..: ::.:.: ..: :.. : : .: ..
XP_006 ---ASNDEGVATVGLV--SSTGPGGDRVL----FVGKGNG--P-------H--DNGIIVS
150 160 170 180
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pF1KSD IRSLDTRGDLAKLFTFDLNPSDDNILKIKQGAKEQHKLGFVSAFLHPSDPPPGAQSYAYL
: :: : : . : . :. : : . ::.:: : : :...
XP_006 TRLLD-RTDSREAF----EAYTDHAT-YKAGYLSTNTQQFVAAF---EDGP-----YVFF
190 200 210 220 230
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pF1KSD ALNSEARAGDKE-SQARSLLARICLPHGAGGDAKKLTESYIQLGLQCAG----GAGRGDL
..:.. ::. .. :.::::.: : . ::... ::: .:. :
XP_006 VFNQQ----DKHPARNRTLLARMCRE-----DPNYY--SYLEMDLQCRDPDIHAAAFGTC
240 250 260 270
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pF1KSD YSRLVSVFPARER-LFAVFERPQGSPAARAAPAALCAFRFADVRAAIRAARTACFV--EP
. :.. :. : :.::: : : .. . :.:: : . :.: ..: :.::.. .
XP_006 LAASVAA-PGSGRVLYAVFSRD--SRSSGGPGAGLCLFPLDKVHAKMEANRNACYTGTRE
280 290 300 310 320 330
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:: : :..::: ::.. .::.: .: . ... .:: :.. .::
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1920
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