FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0634, 1288 aa
1>>>pF1KSDA0634 1288 - 1288 aa - 1288 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5537+/-0.00095; mu= 12.8849+/- 0.057
mean_var=134.7975+/-27.079, 0's: 0 Z-trim(110.5): 17 B-trim: 108 in 1/50
Lambda= 0.110467
statistics sampled from 11659 (11669) to 11659 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.358), width: 16
Scan time: 4.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6815.1 ASTN2 gene_id:23245|Hs108|chr9 (1288) 8728 1403.3 0
CCDS1319.1 ASTN1 gene_id:460|Hs108|chr1 (1294) 3617 588.7 3.2e-167
CCDS44280.1 ASTN1 gene_id:460|Hs108|chr1 (1216) 3410 555.7 2.6e-157
CCDS65732.1 ASTN1 gene_id:460|Hs108|chr1 (1228) 3410 555.7 2.6e-157
CCDS48009.2 ASTN2 gene_id:23245|Hs108|chr9 ( 440) 2714 444.6 2.7e-124
CCDS6814.1 ASTN2 gene_id:23245|Hs108|chr9 ( 395) 2593 425.3 1.6e-118
CCDS55334.1 ASTN2 gene_id:23245|Hs108|chr9 ( 194) 1174 198.9 1e-50
>>CCDS6815.1 ASTN2 gene_id:23245|Hs108|chr9 (1288 aa)
initn: 8728 init1: 8728 opt: 8728 Z-score: 7517.8 bits: 1403.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8728; 100.0% identity (100.0% similar) in 1288 aa overlap (1-1288:1-1288)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAAGARLSPGPGSGLRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPD
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CCDS68 MAAAGARLSPGPGSGLRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SPCRLKTVTVSTLPALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SPCRLKTVTVSTLPALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFVRNELPGRIAVQDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LFVRNELPGRIAVQDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GQLAQATAPTLQEPSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GQLAQATAPTLQEPSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QKSASTEATHEIHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QKSASTEATHEIHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PPRRANHVSREDEFGSQVTHTLDSLGHPGEEKVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PPRRANHVSREDEFGSQVTHTLDSLGHPGEEKVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TFYTEQYRSRRRSKGLLKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 TFYTEQYRSRRRSKGLLKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IADGSSFVVSEGSYLDISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 IADGSSFVVSEGSYLDISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ECSCHEGYAPDPVHRHLCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ECSCHEGYAPDPVHRHLCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GLWLPVSKSFVVPPVELSINPLASCKTDVLVTEDPADVREEAMLSTYFETINDLLSSFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 GLWLPVSKSFVVPPVELSINPLASCKTDVLVTEDPADVREEAMLSTYFETINDLLSSFGP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VRDCSRNNGGCTRNFKCVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 VRDCSRNNGGCTRNFKCVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EQLCLQQTLPLPYDATSSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVCEGPKCLKPDSKFND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EQLCLQQTLPLPYDATSSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVCEGPKCLKPDSKFND
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TLFGEMLHGYNNRTQHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQLADGLLVIPLPVEEQCRGVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 TLFGEMLHGYNNRTQHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQLADGLLVIPLPVEEQCRGVLSE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PLPDLQLLTGDIRYDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PLPDLQLLTGDIRYDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSRE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ELLSFIQHYGSHYIAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ELLSFIQHYGSHYIAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 ITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 PLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD WRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 WRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWY
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280
pF1KSD SILKDTKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SILKDTKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
1270 1280
>>CCDS1319.1 ASTN1 gene_id:460|Hs108|chr1 (1294 aa)
initn: 3876 init1: 1666 opt: 3617 Z-score: 3115.6 bits: 588.7 E(32554): 3.2e-167
Smith-Waterman score: 4296; 48.9% identity (74.1% similar) in 1312 aa overlap (46-1286:16-1292)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL
: . ::::.. .:.. :.::..:::.:
CCDS13 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSAL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KSD PALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAV
: :::.:. . :: .:.: .::. :::..::...:
CCDS13 PFLRENDL------------------SIMHSP-------SASEPKLLFSVRNDFPGEMVV
50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KSD QDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQE
:::.:::::.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: .
CCDS13 VDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLFHIHHQDGAPSLPGQDPTEEP
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KSD PSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIPQ--KSASTEATHE
: .::...:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.:: ::::.::..:
CCDS13 QHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRWCKRRRVPQPQKSASAEAANE
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KSD IHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEEPPRRANHVSRE
::::::::.: ..:::.:..:.: ::: . :::::::: : : : : .:..::
CCDS13 IHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGY--EYDITDLR--HHLQRE
210 220 230 240 250
320 330
pF1KSD -----DEFGSQVTHTLDSL-------GH---PGEE-------------------------
..:.::::.::::: : :: .
CCDS13 CMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNKYKDNIIATSPVDSNHQ
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370
pF1KSD --------------KVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQLTFYTEQYRSRRRSK-GL
... . ..: .: .: ::.::... ::::::. ::::::. :
CCDS13 QATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLTFYTDPSRSRRRSRVGS
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHFIADGSSFVVSEGSYLD
.::::::.::::...::....::.:...:::.::.:::::::.::::: :.. ::: ::
CCDS13 PRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHLIADGSRFILLEGSQLD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD ISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETGECSCHEGYAPDPVHRH
:::::::.. :. : :...::. :::..: : ::. :::::::: :.::: ::::.:
CCDS13 ASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETGECLCYEGYMKDPVHKH
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KSD LCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQGLWLPVSKSFVVPPVE
::.:..:: ..:::::: ..::.::: ::: .::.: :..::.:.:::.:::::.::.:
CCDS13 LCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIFRFTYTLGEGMWLPLSKSFVIPPAE
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LSINPLASCKTDVLVTEDPADVREEAMLSTYFETINDLLSSFGPVRDCSRNNGGCTRNFK
:.::: :.::::. : :: ..:::: : :. :.... ::.:::::::::..::::..::.
CCDS13 LAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLEVLLDSFGPVRDCSKDNGGCSKNFR
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KSD CVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGCEQLCLQQTLPLPYDAT
:.:::..::.::::: :.::::.:::::. :.::::::::::::::::: :.: : :
CCDS13 CISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDCSDGFNGGCEQLCLQQMAPFPDDPT
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KSD SSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVC-EGPKCLKP-DSKFNDTLFGEMLHGYNNRT
.:.:::::.:.:::. ::.:: .....: :: : . . .:.::::::. ::::..
CCDS13 LYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDCGESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHS
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KSD QHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQ-LADGLLVIPLPVEEQCRGVLSEPLPDLQLLTGDIR
..: :::.. :::.::: . . : : :::.: .:.:.:: .::: :: ..::: .
CCDS13 KEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVPLENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVN
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KSD YDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSREELLSFIQHYGSHY
..:. :::..:.:.::: .:..::. .... ...:.:. : .:: .........:.::
CCDS13 FSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNALHSLDGATSRADFVALLDQFGNHY
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890 900 910
pF1KSD IAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQ---KETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTA
: ::.:: : .: : .:.:.::..:::.:. : .. ..: . : . . .:.
CCDS13 IQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGNSPSDESEERERDPKVLTFPEYITS
860 870 880 890 900 910
920 930 940 950 960
pF1KSD QMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQ
:::. .. .::...:. ::::::.: ::. .. . :::::.....:.: :.
CCDS13 --LSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVT
920 930 940 950 960 970
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEP
.: :.. .. : ::: :::: ::::.:::::: .:: :.:::.:.:: ::::::: . ::
CCDS13 NNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEP
980 990 1000 1010 1020 1030
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCV
:::.: ::: .: ::... ::.:...:: . : . . : :::.::..:: . :.
CCDS13 SSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLSFVDDIISGAKSPCA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD AAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDD
. .::. .. :.:..::::: .: :::..::. ::.:. : : ..: ::.:::
CCDS13 MPS----QVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVIVKTPCPVVDD
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSE
::.:::::::::.:::::::::: :::::..... : :: .:::.:::.::.:.:: :
CCDS13 VKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYESFGEFTWRCE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILK
:::::::: ::: .: .:: :..::. :. : .. :: :: :..: :. : . .
CCDS13 DELGPRKAGLILSQLGDLSSWCNGLLQEPKISLRRSSLKYLGCRYSEIKPYGLDWAELSR
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1270 1280
pF1KSD DTKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
: . ::::. .:. : ::.::
CCDS13 DLRKTCEEQTLSIPYNDYGDSKEI
1280 1290
>>CCDS44280.1 ASTN1 gene_id:460|Hs108|chr1 (1216 aa)
initn: 3665 init1: 1666 opt: 3410 Z-score: 2937.8 bits: 555.7 E(32554): 2.6e-157
Smith-Waterman score: 4089; 49.4% identity (74.6% similar) in 1236 aa overlap (46-1210:16-1216)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL
: . ::::.. .:.. :.::..:::.:
CCDS44 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSAL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KSD PALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAV
: :::.:. . :: .:.: .::. :::..::...:
CCDS44 PFLRENDL------------------SIMHSP-------SASEPKLLFSVRNDFPGEMVV
50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KSD QDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQE
:::.:::::.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: .
CCDS44 VDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLFHIHHQDGAPSLPGQDPTEEP
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KSD PSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIPQ--KSASTEATHE
: .::...:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.:: ::::.::..:
CCDS44 QHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRWCKRRRVPQPQKSASAEAANE
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KSD IHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEEPPRRANHVSRE
::::::::.: ..:::.:..:.: ::: . :::::::: : : : : .:..::
CCDS44 IHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGY--EYDITDLR--HHLQRE
210 220 230 240 250
320 330
pF1KSD -----DEFGSQVTHTLDSL-------GH---PGEE-------------------------
..:.::::.::::: : :: .
CCDS44 CMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNKYKDNIIATSPVDSNHQ
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370
pF1KSD --------------KVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQLTFYTEQYRSRRRSK-GL
... . ..: .: .: ::.::... ::::::. ::::::. :
CCDS44 QATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLTFYTDPSRSRRRSRVGS
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHFIADGSSFVVSEGSYLD
.::::::.::::...::....::.:...:::.::.:::::::.::::: :.. ::: ::
CCDS44 PRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHLIADGSRFILLEGSQLD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD ISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETGECSCHEGYAPDPVHRH
:::::::.. :. : :...::. :::..: : ::. :::::::: :.::: ::::.:
CCDS44 ASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETGECLCYEGYMKDPVHKH
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KSD LCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQGLWLPVSKSFVVPPVE
::.:..:: ..:::::: ..::.::: ::: .::.: :..::.:.:::.:::::.::.:
CCDS44 LCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIFRFTYTLGEGMWLPLSKSFVIPPAE
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LSINPLASCKTDVLVTEDPADVREEAMLSTYFETINDLLSSFGPVRDCSRNNGGCTRNFK
:.::: :.::::. : :: ..:::: : :. :.... ::.:::::::::..::::..::.
CCDS44 LAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLEVLLDSFGPVRDCSKDNGGCSKNFR
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KSD CVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGCEQLCLQQTLPLPYDAT
:.:::..::.::::: :.::::.:::::. :.::::::::::::::::: :.: : :
CCDS44 CISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDCSDGFNGGCEQLCLQQMAPFPDDPT
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KSD SSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVC-EGPKCLKP-DSKFNDTLFGEMLHGYNNRT
.:.:::::.:.:::. ::.:: .....: :: : . . .:.::::::. ::::..
CCDS44 LYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDCGESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHS
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KSD QHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQ-LADGLLVIPLPVEEQCRGVLSEPLPDLQLLTGDIR
..: :::.. :::.::: . . : : :::.: .:.:.:: .::: :: ..::: .
CCDS44 KEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVPLENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVN
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KSD YDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSREELLSFIQHYGSHY
..:. :::..:.:.::: .:..::. .... ...:.:. : .:: .........:.::
CCDS44 FSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNALHSLDGATSRADFVALLDQFGNHY
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890 900 910
pF1KSD IAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQ---KETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTA
: ::.:: : .: : .:.:.::..:::.:. : .. ..: . : . . .:.
CCDS44 IQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGNSPSDESEERERDPKVLTFPEYITS
860 870 880 890 900 910
920 930 940 950 960
pF1KSD QMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQ
:::. .. .::...:. ::::::.: ::. .. . :::::.....:.: :.
CCDS44 --LSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVT
920 930 940 950 960 970
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEP
.: :.. .. : ::: :::: ::::.:::::: .:: :.:::.:.:: ::::::: . ::
CCDS44 NNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEP
980 990 1000 1010 1020 1030
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCV
:::.: ::: .: ::... ::.:...:: . : . . : :::.::..:: . :.
CCDS44 SSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLSFVDDIISGAKSPCA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD AAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDD
. .::. .. :.:..::::: .: :::..::. ::.:. : : ..: ::.:::
CCDS44 MPS----QVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVIVKTPCPVVDD
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSE
::.:::::::::.:::::::::: :::::..... : :: .:::.:::.::.:.:: :
CCDS44 VKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYESFGEFTWRCE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILK
::::::
CCDS44 DELGPR
>>CCDS65732.1 ASTN1 gene_id:460|Hs108|chr1 (1228 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KSD LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL
: . ::::.. .:.. :.::..:::.:
CCDS65 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSAL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KSD PALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAV
: :::.:. . :: .:.: .::. :::..::...:
CCDS65 PFLRENDL------------------SIMHSP-------SASEPKLLFSVRNDFPGEMVV
50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KSD QDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQE
:::.:::::.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: .
CCDS65 VDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLFHIHHQDGAPSLPGQDPTEEP
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KSD PSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIPQ--KSASTEATHE
: .::...:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.:: ::::.::..:
CCDS65 QHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRWCKRRRVPQPQKSASAEAANE
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260 270 280 290 300 310
pF1KSD IHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEEPPRRANHVSRE
::::::::.: ..:::.:..:.: ::: . :::::::: : : : : .:..::
CCDS65 IHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGY--EYDITDLR--HHLQRE
210 220 230 240 250
320 330
pF1KSD -----DEFGSQVTHTLDSL-------GH---PGEE-------------------------
..:.::::.::::: : :: .
CCDS65 CMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNKYKDNIIATSPVDSNHQ
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370
pF1KSD --------------KVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQLTFYTEQYRSRRRSK-GL
... . ..: .: .: ::.::... ::::::. ::::::. :
CCDS65 QATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLTFYTDPSRSRRRSRVGS
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHFIADGSSFVVSEGSYLD
.::::::.::::...::....::.:...:::.::.:::::::.::::: :.. ::: ::
CCDS65 PRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHLIADGSRFILLEGSQLD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD ISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETGECSCHEGYAPDPVHRH
:::::::.. :. : :...::. :::..: : ::. :::::::: :.::: ::::.:
CCDS65 ASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETGECLCYEGYMKDPVHKH
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KSD LCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQGLWLPVSKSFVVPPVE
::.:..:: ..:::::: ..::.::: ::: .::.: :..::.:.:::.:::::.::.:
CCDS65 LCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIFRFTYTLGEGMWLPLSKSFVIPPAE
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LSINPLASCKTDVLVTEDPADVREEAMLSTYFETINDLLSSFGPVRDCSRNNGGCTRNFK
:.::: :.::::. : :: ..:::: : :. :.... ::.:::::::::..::::..::.
CCDS65 LAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLEVLLDSFGPVRDCSKDNGGCSKNFR
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD CVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGCEQLCLQQTLPLPYDAT
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CCDS65 CISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDCSDGFNGGCEQLCLQQMAPFPDDPT
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD SSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVC-EGPKCLKP-DSKFNDTLFGEMLHGYNNRT
.:.:::::.:.:::. ::.:: .....: :: : . . .:.::::::. ::::..
CCDS65 LYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDCGESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHS
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD QHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQ-LADGLLVIPLPVEEQCRGVLSEPLPDLQLLTGDIR
..: :::.. :::.::: . . : : :::.: .:.:.:: .::: :: ..::: .
CCDS65 KEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVPLENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVN
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD YDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSREELLSFIQHYGSHY
..:. :::..:.:.::: .:..::. .... ...:.:. : .:: .........:.::
CCDS65 FSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNALHSLDGATSRADFVALLDQFGNHY
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pF1KSD IAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQ---KETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTA
: ::.:: : .: : .:.:.::..:::.:. : .. ..: . : . . .:.
CCDS65 IQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGNSPSDESEERERDPKVLTFPEYITS
860 870 880 890 900 910
920 930 940 950 960
pF1KSD QMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQ
:::. .. .::...:. ::::::.: ::. .. . :::::.....:.: :.
CCDS65 --LSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVT
920 930 940 950 960 970
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEP
.: :.. .. : ::: :::: ::::.:::::: .:: :.:::.:.:: ::::::: . ::
CCDS65 NNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEP
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCV
:::.: ::: .: ::... ::.:...:: . : . . : :::.::..:: . :.
CCDS65 SSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLSFVDDIISGAKSPCA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD AAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDD
. .::. .. :.:..::::: .: :::..::. ::.:. : : ..: ::.:::
CCDS65 MPS----QVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVIVKTPCPVVDD
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSE
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CCDS65 VKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYESFGEFTWRCE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILK
::::::
CCDS65 DELGPRLPACWDSQRSCR
1220
>>CCDS48009.2 ASTN2 gene_id:23245|Hs108|chr9 (440 aa)
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850 860 870 880 890 900
pF1KSD IQHYGSHYIAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPFITYLS
: : :: .:::::::::::::::::::::
CCDS48 MNTLLCKGMFCLLSWEADSRGRLGEYTLQPLSLQ-TEETTELGSKKELKSMPFITYLS
10 20 30 40 50
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pF1KSD GLLTAQMLSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GLLTAQMLSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTL
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD IQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTV
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pF1KSD EPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 EPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSC
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pF1KSD VAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDN
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pF1KSD KAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSED
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD ELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 ELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKD
360 370 380 390 400 410
1270 1280
pF1KSD TKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
:::::::::::::::::::::::
CCDS48 TKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
420 430 440
>>CCDS6814.1 ASTN2 gene_id:23245|Hs108|chr9 (395 aa)
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Smith-Waterman score: 2593; 100.0% identity (100.0% similar) in 385 aa overlap (898-1282:1-385)
870 880 890 900 910 920
pF1KSD HFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 MPFITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCE
10 20 30
930 940 950 960 970 980
pF1KSD EKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSG
40 50 60 70 80 90
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD KGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 KGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKV
100 110 120 130 140 150
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD SDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKC
160 170 180 190 200 210
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD LEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 LEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQ
220 230 240 250 260 270
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pF1KSD QMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 QMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCS
280 290 300 310 320 330
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pF1KSD SLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKDTKITCEEKMVSMARNTYGESKG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 SLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKDTKITCEEKMVSMARNTYYLTLS
340 350 360 370 380 390
pF1KSD R
CCDS68 KVSPF
>>CCDS55334.1 ASTN2 gene_id:23245|Hs108|chr9 (194 aa)
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870 880 890 900 910 920
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CCDS55 MPFITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCE
10 20 30
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CCDS55 EKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSG
40 50 60 70 80 90
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CCDS55 KGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKV
100 110 120 130 140 150
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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CCDS55 SDYILQHKKVDEYTDTDLYTVYCWITFID--LRILNQPCIPGMKPT
160 170 180 190
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]