Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0638
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0638, 1377 aa
1>>>pF1KSDA0638 1377 - 1377 aa - 1377 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0915+/-0.00112; mu= -16.5511+/- 0.067
mean_var=463.0626+/-94.062, 0's: 0 Z-trim(115.1): 28 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.059601
statistics sampled from 15683 (15705) to 15683 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16
Scan time: 5.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8401.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1377) 9054 793.9 0
CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1319) 5996 531.0 8.6e-150
CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1210) 1322 129.0 7.7e-29
CCDS46885.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1237) 1322 129.1 7.9e-29
CCDS46886.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1253) 1144 113.8 3.2e-24
>>CCDS8401.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1377 aa)
initn: 9054 init1: 9054 opt: 9054 Z-score: 4223.5 bits: 793.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9054; 100.0% identity (100.0% similar) in 1377 aa overlap (1-1377:1-1377)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RPFPKTTSTLKEMEKLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RPFPKTTSTLKEMEKLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQLQV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD KRFFRFTMVTESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KRFFRFTMVTESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
1330 1340 1350 1360 1370
>>CCDS44750.1 PHLDB1 gene_id:23187|Hs108|chr11 (1319 aa)
initn: 6290 init1: 5987 opt: 5996 Z-score: 2802.7 bits: 531.0 E(32554): 8.6e-150
Smith-Waterman score: 8527; 95.8% identity (95.8% similar) in 1377 aa overlap (1-1377:1-1319)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MDALNRNQIGPGCQTQTMVQKGPLDLIETGKGLKVQTDKPHLVSLGSGRLSTAITLLPLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGRTVIGSAARDISLQGPGLAPEHCYIENLRGTLTLYPCGNACTIDGLPVRQPTRLTQGC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MLCLGQSTFLRFNHPAEAKWMKSMIPAGGRAPGPPYSPVPAESESLVNGNHTPQTATRGP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPAATSPLSPMANGGRYLLSPPTSPG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AMSVGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASHSPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQPPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRPSGARSESPRLSRKGGHERPPSPGLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVVA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ISLSEYPASGALSQPTSIPGSPKFQPPVPAPRNKIGTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRQLVGRTFSDGLATRTLQPPESPRLGRRGLDSMRELPPLSPSLSRRALSPLPTRTTPDP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KLNREVAESPRPRRWAAHGASPEDFSLTLGARGRRTRSPSPTLGESLAPHKGSFSGRLSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYSLGSLTGASPCQSPCVQRKLSSGDLRVPVTRERKNSITEISDNEDDLLEYHRRQRQER
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADGGPEAGELPSIGEATAALALAGRRPSRGLAGA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGRSSEEPGVATQRLWESMERSDEENLKEECSSTESTQQEHEDAPSTKLQGEVLALEEER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AQVLGHVEQLKVRVKELEQQLQESAREAEMERALLQGEREAERALLQKEQKAVDQLQEKL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VALETGIQKERDKEAEALETETKLFEDLEFQQLERESRVEEERELAGQGLLRSKAELLRS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IAKRKERLAILDSQAGQIRAQAVQESERLARDKNASLQLLQKEKEKLTVLERRYHSLTGG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD RPFPKTTSTLKEMEKLLLPAVDLEQWYQELMAGLGTGPAAASPHSSPPPLPAKASRQLQV
:::::::::::: :
CCDS44 RPFPKTTSTLKE-----------------------------------------------V
910
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YRSKMDGEATSPLPRTRSGPLPSSSGSSSSSSQLSVATLGRSPSPKSALLTQNGTGSLPR
920 930 940 950 960 970
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NLAATLQDIETKRQLALQQKGQQVIEEQRRRLAELKQKAAAEAQCQWDALHGAAPFPAGP
980 990 1000 1010 1020 1030
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGFPPLMHHSILHHLPAGRERGEEGEHAYDTLSLESSDSMETSISTGGNSACSPDNMSSA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGLDMGKIEEMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESAR
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 RQQLVEKEVKMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCR
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GYLVKMGGKIKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAK
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1330 1340 1350 1360 1370
pF1KSD KRFFRFTMVTESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 -----------SPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
1280 1290 1300 1310
>>CCDS2962.1 PHLDB2 gene_id:90102|Hs108|chr3 (1210 aa)
initn: 2253 init1: 999 opt: 1322 Z-score: 631.2 bits: 129.0 E(32554): 7.7e-29
Smith-Waterman score: 2255; 39.5% identity (62.6% similar) in 1277 aa overlap (188-1376:22-1209)
160 170 180 190 200 210
pF1KSD PVPAESESLVNGNHTPQTATRGPSACASHSSLVSSIEKDLQEIMDSLVLEEPGAAGKKPA
:.: :.:.: :..:.:: : ::
CCDS29 MEEHSYIQKELDLQNGSLEEDSVVHSVENDSQNMMESL---SP----KK--
10 20 30 40
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ATSPLSPMANG---GRYL-LSPPTSPGAMS---VGSSYENTSPAFSPLSSPASSGSCASH
.: : ::: : :: :: :. :. : .:.: . .::... .. :: .
CCDS29 YSSSLRFKANGDYSGSYLTLSQPV-PAKRSPSPLGTSVR-SSPSLAKIQ-----GS-KQF
50 60 70 80 90
280 290 300 310 320
pF1KSD SPSGQEPGPSVPPLVPARSSSYHLALQP----PQSRPSGARSESP-RLSRKGGHERPPSP
: .: . . . : .: ... :. : .. .: :: :::.: . . :
CCDS29 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
100 110 120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KSD GLRGLLTDSPAATVLAEARRATESPRLGGQLPVV-AISLSEY-PASGALSQPTSIPGSPK
: :. . :.:.:. :. : . . :::. : . : .:.:.:::
CCDS29 --RHKSHDNVYSLGGLEGRKAS-----GSLLAMWNGSSLSDAGPPPISRSGAASMPSSPK
160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KSD FQPPVPAPRNKI-GTLQDRPPSPFREPPGSERVLTTSPSRQLVGRTFSD-GLATRTLQPP
: . .: .: .: .. .:: . .:. . ..: : .:.:
CCDS29 -----QARKMSIQDSLALQPKLTRHKELASENINLR--TRKYSSSSLSHMGAYSRSL---
210 220 230 240 250
450 460 470 480 490
pF1KSD ESPRLGRRGLDSMREL--PPLSPSLSRRALSPLPTRTTP------DPKLN-REVAESPRP
::: : ... : :: . ::. . : . : : :: .. . :
CCDS29 --PRLYRATENQLTPLSLPPRN-SLGNSKRTKLGEKDLPHSVIDNDNYLNFSSLSSGALP
260 270 280 290 300 310
500 510 520 530 540
pF1KSD RRWAAHGASPE-DFSLTLGARGRRTRS---PSPTLGESLAPHKGSFSGRLSPAYSLGSLT
. .: ..: . .:.. : : .:. : . : ..:. : .:..:: :.
CCDS29 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA
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550 560 570 580 590
pF1KSD GASPCQSPCVQRKLSSG-------DLRV---------PVTRERKNSITEISDNEDDLLEY
: : . ..:..: : ::. :. ::::.::. :: ..:::..:
CCDS29 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY
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pF1KSD HRRQRQERLREQEMERLERQRLETILNLCAEYSRADG----GPEAGELPSIGEATAALAL
:::::.::::::::::::::::::::.:::::.. :. : . .. .:.. : :
CCDS29 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL
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. .. :. ::. .. :. . : : .. : ::
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::: ::. . : . . :. :.:: : .:...:.:: ..
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:....:..:: :: .:: :::.::...: . :.::.. .:.:..:.. :: .: :. :.
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:. :..:.: ::::::::::.:::..::.: : ::: :: :.:..:::... : .:
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:..: :: .:.......:: ...::.:::.: ::..: ::.::. :: . .::::
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. . .. . .. :: :. .. : . ::. . .:: . .
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: :: .. .:: : ..: ::.::: .::. : : : :. :: :: .::: .:
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:..:.: . ..: . : .:. .:. ...:.:.. ...: .: :
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: ..:.:::::.:::::::::: ::::::.:::: ....::
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pF1KSD EMEKMLKEAHAEKNRLMESREREMELRRQALEEERRRREQVERRLQSESARRQQLVEKEV
:::..::.:::::.::.:::::::: ...:::::.:::: .:.::: :...::.:.::::
CCDS29 EMERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEV
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pF1KSD KMREKQFSQARPLTRYLPIRKEDFDLKTHIESSGHGVDTCLHVVLSSKVCRGYLVKMGGK
:.::.: .::::::::::.:::::::..:.:..::..::: :: .. :.:::.:.:::::
CCDS29 KIRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGK
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pF1KSD IKSWKKRWFVFDRLKRTLSYYVDKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLRSAAKKRFFRFTMV
::.:::::::::: :::.:::.::::::::::::::::::::::::..: :
CCDS29 IKTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANK---------
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pF1KSD TESPNPALTFCVKTHDRLYYMVAPSAEAMRIWMDVIVTGAEGYTQFMN
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CCDS29 --SPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
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CCDS46 YKTSASEGNPYVSSTLSVPASPRVARKMLLASTSSCASDDFDQASYVGT-NPSHSL--LA
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CCDS46 SY-------------KDQAFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIE
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CCDS46 EMERLLKQAHAEKTRLLESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEV
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CCDS46 KIRERQRAQARPLTRYLPVRKEDFDLRSHVETAGHNIDTCYHVSITEKTCRGFLIKMGGK
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CCDS46 IKTWKKRWFVFDRNKRTFSYYADKHETKLKGVIYFQAIEEVYYDHLKNANK---------
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CCDS46 --SPNPLLTFSVKTHDRIYYMVAPSPEAMRIWMDVIVTGAEGYTHFLL
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CCDS46 SYDGTDKNIPMKPPTPLLNTTSSLSGYPLGRADFDHYTGRDSERALRLSEKPPYSKYSS-
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CCDS46 GESD-RVFATRRNFSCGSVEFDEADLESLRQASGTPQPALRERKSSISSIS-GRDDLMDY
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CCDS46 HRRQREERLREQEMERLERQRLETILSLCAEYTKPDSRLSTGTTVEDVQKINKELEKLQL
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pF1KSD AGRR----------------------PSRGLAGASGRSSEEPGVATQRLWESMER-SDEE
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CCDS46 SDEESVFEEALMSPDTRYRCHRKDSLPDADLASCGSLSQSSASFFTPRSTRNDELLSDLT
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CCDS46 RTPPPPSSTFPKASSESSYLSILPKTPEGISEEQRSQELAAMEETRIVILNNLEELKQKI
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CCDS46 EGHRQKSEFYNRTASESNVYLNSFH----YP----------DHSY-------------KD
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CCDS46 QAFDTLSLDSSDSMETSIS-----ACSPDNISSASTSNIARIEEMERLLKQAHAEKTRLL
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CCDS46 ESREREMEAKKRALEEEKRRREILEKRLQEETSQRQKLIEKEVKIRERQRAQARPLTRYL
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