Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0642
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0642, 1320 aa
1>>>pF1KSDA0642 1320 - 1320 aa - 1320 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1106+/-0.000533; mu= -21.8313+/- 0.033
mean_var=740.1173+/-153.058, 0's: 0 Z-trim(123.5): 171 B-trim: 651 in 1/56
Lambda= 0.047144
statistics sampled from 43153 (43371) to 43153 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.777), E-opt: 0.2 (0.509), width: 16
Scan time: 19.740
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001096617 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid (1320) 8875 620.3 2.8e-176
NP_001096616 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid (1299) 7501 526.8 3.8e-148
NP_056390 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid-ri (1299) 7501 526.8 3.8e-148
NP_001096618 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid (1293) 7436 522.4 8.1e-147
XP_016868020 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino ( 974) 1045 87.6 4.7e-16
XP_005250589 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino (1035) 870 75.7 1.9e-12
NP_072096 (OMIM: 612064) PERQ amino acid-rich with (1035) 870 75.7 1.9e-12
XP_011514779 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino (1050) 870 75.7 1.9e-12
XP_011514774 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino (1051) 870 75.7 1.9e-12
XP_016868017 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino (1076) 870 75.7 1.9e-12
XP_016868018 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino (1076) 870 75.7 1.9e-12
XP_016868019 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino (1076) 870 75.7 1.9e-12
XP_016868015 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino (1076) 870 75.7 1.9e-12
XP_016868016 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino (1076) 870 75.7 1.9e-12
NP_009044 (OMIM: 190370) trichohyalin [Homo sapien (1943) 414 45.0 0.0064
>>NP_001096617 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid-ric (1320 aa)
initn: 8875 init1: 8875 opt: 8875 Z-score: 3285.6 bits: 620.3 E(85289): 2.8e-176
Smith-Waterman score: 8875; 100.0% identity (100.0% similar) in 1320 aa overlap (1-1320:1-1320)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GWRLAGSRRDGERWRPHSPDGPRSAGWREHMERRRRFEFDFRDRDDERGYRRVRSGSGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GWRLAGSRRDGERWRPHSPDGPRSAGWREHMERRRRFEFDFRDRDDERGYRRVRSGSGSI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKDE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD PKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEPDDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEPDDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQEH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTALYQMQHLQYQQFLIQQQYAQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTALYQMQHLQYQQFLIQQQYAQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LAQQQKAALSSQQQQQLALLLQQFQTLKMRISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LAQQQKAALSSQQQQQLALLLQQFQTLKMRISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTAS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD QPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEEA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTACQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTACQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD SQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGTT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD KSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWAS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD DLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSVGVSNRQNKKVEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSVGVSNRQNKKVEEEE
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD KLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD HSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>>NP_001096616 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid-ric (1299 aa)
initn: 7383 init1: 6178 opt: 7501 Z-score: 2780.7 bits: 526.8 E(85289): 3.8e-148
Smith-Waterman score: 8645; 98.3% identity (98.3% similar) in 1321 aa overlap (1-1320:1-1299)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVG--
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 --------------------RPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG
180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GWRLAGSRRDGERWRPHSPDGPRSAGWREHMERRRRFEFDFRDRDDERGYRRVRSGSGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GWRLAGSRRDGERWRPHSPDGPRSAGWREHMERRRRFEFDFRDRDDERGYRRVRSGSGSI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KSD GSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGV-ASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKD
:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVEASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKD
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD EPKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNP
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SPTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEPDDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEPDDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQE
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD HRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQ
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD PLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTALYQMQHLQYQQFLIQQQYAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTALYQMQHLQYQQFLIQQQYAQ
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD VLAQQQKAALSSQQQQQLALLLQQFQTLKMRISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLAQQQKAALSSQQQQQLALLLQQFQTLKMRISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD SQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQ
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD EELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEE
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD ALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHE
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD EEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTAC
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD QSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGT
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD TKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD SDLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSVGVSNRQNKKVEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSVGVSNRQNKKVEEE
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD EKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD GDTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHST
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD LHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDD
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1320
pF1KSD Y
:
NP_001 Y
>>NP_056390 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid-rich w (1299 aa)
initn: 7383 init1: 6178 opt: 7501 Z-score: 2780.7 bits: 526.8 E(85289): 3.8e-148
Smith-Waterman score: 8645; 98.3% identity (98.3% similar) in 1321 aa overlap (1-1320:1-1299)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVG--
130 140 150 160 170
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GWRLAGSRRDGERWRPHSPDGPRSAGWREHMERRRRFEFDFRDRDDERGYRRVRSGSGSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 DDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSE
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:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVEASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EPKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SPTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEPDDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQE
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NP_056 HRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRACDESFQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 PLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTALYQMQHLQYQQFLIQQQYAQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 VLAQQQKAALSSQQQQQLALLLQQFQTLKMRISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 ALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHE
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NP_056 EEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTAC
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NP_056 QSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGT
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pF1KSD TKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 TKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 SDLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSVGVSNRQNKKVEEE
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pF1KSD EKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 EKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 GDTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHST
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_056 LHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDD
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pF1KSD Y
:
NP_056 Y
>>NP_001096618 (OMIM: 607688,612003) PERQ amino acid-ric (1293 aa)
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Smith-Waterman score: 8580; 97.8% identity (97.8% similar) in 1321 aa overlap (1-1320:1-1293)
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pF1KSD MAAETQTLNFGPEWLRALSSGGSITSPPLSPALPKYKLADYRYGREEMLALFLKDNKIPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGR
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pF1KSD SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSSRGRGRGRGECGFYQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVG--
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pF1KSD NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 --------------------RPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG
180 190 200 210
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pF1KSD GWRLAGSRRDGERWRPHSPDGPRSAGWREHMERRRRFEFDFRDRDDERGYRRVRSGSGSI
::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GWRLAGSRRDGERWRPHSP------GWREHMERRRRFEFDFRDRDDERGYRRVRSGSGSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSE
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:::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GSHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVEASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPKTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPTLRPVETPVVGAPGMGSVSTEPDDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTALYQMQHLQYQQFLIQQQYAQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLAQQQKAALSSQQQQQLALLLQQFQTLKMRISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTA
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pF1KSD SQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQERREAEMRAKREEEERKRQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQREQEIALRRQREEEERQQQEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQRRLEENRLRMEEEAARLRHE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLAQMKLPSSSTWGQQSNTTAC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGT
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pF1KSD TKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWA
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pF1KSD SDLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSVGVSNRQNKKVEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SDLVSSIWSNADTKNSNMGFWDDAVKEVGPRNSTNKNKNNASLSKSVGVSNRQNKKVEEE
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pF1KSD EKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKLLKLFQGVNKAQDGFTQWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYL
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pF1KSD GDTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GDTSEAKEFAKQFLERRAKQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHST
1180 1190 1200 1210 1220 1230
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pF1KSD LHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LHSVFQTNQSNNQQSNFEAVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDD
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1320
pF1KSD Y
:
NP_001 Y
>>XP_016868020 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino acid (974 aa)
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pF1KSD LPPLALVPFTEEEQRNFSMSVNSAAVLRLTGRGGGGTVVGAPRGRSSSRGRGRGRGECGF
:.:.: ..:. :::.:.:.::::::. :
XP_016 MGKGAGPPLAGTSRGRGSTRSRGRGRGDSCF
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pF1KSD YQRSFDEVEGVFGRGGGREMHRSQSWEERGDRRFEKPGRKDVGKKNGYYCMYSPVLLLGQ
::::..: .:.:::. ::..:::::..::.::::: .:.: : :
XP_016 YQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRD-----GARC----------
40 50 60 70
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pF1KSD PLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDGGWRL-AGSRRDGERW
.::::: .: ..: ::.::::: .::::. :.:.:.::: :: ::::.::
XP_016 -------GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEGSWRLGAGPRRDGDRW
80 90 100 110 120
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pF1KSD RPHSPDG-PRSAGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG------YRRVRSGSGSID
: :::: ::::::::: ::::.::::.: :: .. :: :: :. : ..
XP_016 RSASPDGGPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGGSSHLRRCRAPEG-FE
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD DDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMDFRPVDEGEECSDSEG
.:.:.::::::.: .:::::::.::::: ::: :::::::::.::. ..: :: :::
XP_016 EDKDGLPEWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELDFQGLEEEEE--PSEG
190 200 210 220 230 240
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pF1KSD SHNEEAKEPDKTNKKEGEKTDRVGVASEETPQTSSSSARPGTPSDHQSQEASQFERKDEP
. :: :..... : :....:
XP_016 LE-------------------------EEGPEAGGKELTPLPPQEEKS------------
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pF1KSD KTEQTEKAEEETRMENSLPAKVPSRGDEMVADVQQPLSQIPSDTASPLLILPPPVPNPSP
: :. .:. : :: .: :: . .
XP_016 ----------------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGDETAEKEPPAAED---
270 280 290
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pF1KSD TLRPVETPVVGAPGMGSVSTEP---DDEEGLKHLEQQAEKMVAYLQDSALDDERLASKLQ
.: .. .::.:: . : .:.::::::.:.:::.:: ::::.:..:.... .:
XP_016 DIRGIQL----SPGVGSSAGPPGDLEDDEGLKHLQQEAEKLVASLQDSSLEEEQFTAAMQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD ----EHRAKGVSIPLMHEAMQKWYYKDPQGEIQGPFNNQEMAEWFQAGYFTMSLLVKRAC
.: : ....:: : : .::.::::::::::::..::::::::::::.:::::::.:
XP_016 TQGLRHSAAATALPLSHGAARKWFYKDPQGEIQGPFTTQEMAEWFQAGYFSMSLLVKRGC
360 370 380 390 400 410
600 610 620 630 640 650
pF1KSD DESFQPLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTA--LYQ-MQHLQYQQF
::.:::::...::::::::.:::.::: .:..::::: .::::.: ::: .:: :. :.
XP_016 DEGFQPLGEVIKMWGRVPFAPGPSPPPLLGNMDQERLKKQQELAAAALYQQLQHQQFLQL
420 430 440 450 460 470
660 670 680 690 700
pF1KSD LIQQQYAQVLAQQQKAALSS----------QQQQQLALLLQQFQTLKM-RISDQNIIPSV
. ..: : : ..::::.. ::::::. .:::.:.:: : .:::..:..
XP_016 VSSRQLPQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQALKPPRGGDQNLLPTM
480 490 500 510 520 530
710 720 730 740 750 760
pF1KSD TRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALEQLQQLEKAKAAKLEQ
.::.::::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: ::::: .: :
XP_016 SRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILEQLQLQHKF------Q
540 550 560 570 580
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pF1KSD ERREAEMRAKREEEERKRQEELRRQQEEILRRQQEEERKRREEEELARRKQEEALRRQRE
::::.:.:::::::::::.:: :::: ::::...:.::::: :::.
XP_016 ERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQ------QQEEQKRRQEEEELFRRKHV--------
590 600 610 620 630
830 840 850 860 870 880
pF1KSD QEIALRRQREEEERQQQEEALRRLEERRREEEERRKQEELLRKQEEEAAKWAREEEEAQR
XP_016 ------------------------------------------------------------
890 900 910 920 930 940
pF1KSD RLEENRLRMEEEAARLRHEEEERKRKELEVQRQKELMRQRQQQQEALRRLQQQQQQQQLA
::.::. :. :::::
XP_016 -------------------------------RQQELL---------LKLLQQQQA-----
640
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD QMKLPSSSTWGQQSNTTACQSQATLSLAEIQKLEEERERQLREEQRRQQRELMKALQQQQ
. .: . . : :
XP_016 -VPVPPAPS-----------SPPPL-----------------------------------
650
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pF1KSD QQQQQKLSGWGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQQPNRARNNTHSNLHT
:....: . . :.:::.: : ::..:: .. : ::. .:
XP_016 ---------WAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPPRE----PARAQAPNHR----
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:...:.: :::.:. .. .:.. : . .:..:.:.:. : : :. :
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: ... ::: : . .:.: ::.:::::::::.::. . :::::::::::::.:.....
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:::: :..::::::::.::::::. :::: ::::::::::::::::::.:::::::
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.: .. ..:...::.:.:.. . ...: :.. :..
XP_016 ------------------EAW-LSSASLQTAFQANHSTKLGPG----EGSKAKRRALMLH
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.:::.::
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XP_005 PGEGSKAKRRALMLHSDPSILGYSLHGSS-----GEIESVDDY
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NP_072 -LKLLQQQQA------VPVPPAPS-----------SPPPL--------------------
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pF1KSD RRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQ
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NP_072 ------------------------WAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPPRE---
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pF1KSD AVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY
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NP_072 PGEGSKAKRRALMLHSDPSILGYSLHGSS-----GEIESVDDY
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XP_011 ELQDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGR
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XP_011 GSTRSRGRGRGDSCFYQRSIEEGDGAFGRSP-REIQRSQSWDDRGERRFEKSARRD----
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pF1KSD NGYYCMYSPVLLLGQPLCQGRPNFEEGGPTSVGRKHEFIRSESENWRIFREEQNGEDEDG
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XP_011 -GARC-----------------GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEG
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pF1KSD GWRL-AGSRRDGERWRPHSPDG-PRSAGWREHMERRRRFEFDFR-DR-----DDERG---
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XP_011 SWRLGAGPRRDGDRWRSASPDGGPRSAGWREHGERRRKFEFDLRGDRGGCGEEEGRGGGG
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290 300 310 320 330 340
pF1KSD ---YRRVRSGSGSIDDDRDSLPEWCLEDAEEEMGTFDSSGAFLSLKKVQKEPIPEEQEMD
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XP_011 SSHLRRCRAPEG-FEEDKDGLPEWCLDDEDEEMGTFDASGAFLPLKKGPKEPIPEEQELD
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:. ..: :: ::: . :: :..... : :..
XP_011 FQGLEEEEE--PSEGLE-------------------------EEGPEAGGKELTPLPPQE
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..: : :. .:. : :: .:
XP_011 EKS----------------------------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGD
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:: . . .: .. .::.:: . : .:.::::::.:.:::.:: :
XP_011 ETAEKEPPAAEDD---IRGIQL----SPGVGSSAGPPGDLEDDEGLKHLQQEAEKLVASL
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:::.:..:.... .: .: : ....:: : : .::.::::::::::::..:::::::
XP_011 QDSSLEEEQFTAAMQTQGLRHSAAATALPLSHGAARKWFYKDPQGEIQGPFTTQEMAEWF
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pF1KSD QAGYFTMSLLVKRACDESFQPLGDIMKMWGRVPFSPGPAPPPHMGELDQERLTRQQELTA
:::::.:::::::.:::.:::::...::::::::.:::.::: .:..::::: .::::.:
XP_011 QAGYFSMSLLVKRGCDEGFQPLGEVIKMWGRVPFAPGPSPPPLLGNMDQERLKKQQELAA
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::: .:: :. :.. ..: : : ..::::.. ::::::. .:::.:.
XP_011 AALYQQLQHQQFLQLVSSRQLPQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQA
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:: : .:::..:...::.::::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: ::
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::: .: :::::.:.:::::::::::.:: :::: ::::...:.::::
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: :::.
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::.::.
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:. ::::: . .: . . : :
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:....: . . :.:::.: : ::..:: .
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.: ::. .: : :...:.: :::.:. .. .:.. : . .:..:.:.:
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. : : :. :: ... ::: : . .:.: ::.:::::::::.::. . :::::
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::::::::.:.....:::: :..::::::::.::::::. :::: ::::::::::::::
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XP_011 FQGLEEEEE--PSEGLE-------------------------EEGPEAGGKELTPLPPQE
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XP_011 AALYQQLQHQQFLQLVSSRQLPQC-ALREKAALGDLTPPPPPPPQQQQQQLTAFLQQLQA
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XP_011 LKPPRGGDQNLLPTMSRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILE
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XP_011 -LKLLQQQQA------VPVPPAPS-----------SPPPL--------------------
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:....: . . :.:::.: : ::..:: .
XP_011 ------------------------WAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPP----R
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XP_011 EPARAQAPNHR--------VQLGGLGTAPLNQWVSE-AGPLWGGPDKSGGGSSGLGLWED
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XP_011 TPKSGGSLVRGLGLKNSRSSPSLSDSYSHLSGRPIRKKTEEEEKLLKLLQGIPRPQDGFT
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pF1KSD QWCEQMLHALNTANNLDVPTFVSFLKEVESPYEVHDYIRAYLGDTSEAKEFAKQFLERRA
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XP_011 QWCEQMLHTLSATGSLDVPMAVAILKEVESPYDVHDYIRSCLGDTLEAKEFAKQFLERRA
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pF1KSD KQKANQQRQQQQLPQQQQQQPPQQPPQQPQQQDSVWGMNHSTLHSVFQTNQSNNQQSNFE
::::.::::::: .: .. ..:...::.:.: ...
XP_011 KQKASQQRQQQQ---------------------EAW-LSSASLQTAFQANHS----TKLG
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pF1KSD AVQSGKKKKKQKMVRADPSLLGFSVNASSERLNMGEIETLDDY
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XP_011 PGEGSKAKRRALMLHSDPSILASPRLQGTPCTDLLVRSRAWMTTDQPGPPAPGL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>>XP_016868017 (OMIM: 612064) PREDICTED: PERQ amino acid (1076 aa)
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10 20 30 40 50 60
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XP_016 ELQDKEFAAVLQDEPLQPLALEPLTEEEQRNFSLSVNSVAVLRLMGKGAGPPLAGTSRGR
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XP_016 -GARC-----------------GFEEGG---AGPRKEHARSDSENWRSLREEQE-EEEEG
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XP_016 FQGLEEEEE--PSEGLE-------------------------EEGPEAGGKELTPLPPQE
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XP_016 EKS----------------------------SSPSPLPTLG---------PLWGTNGDGD
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pF1KSD LKM-RISDQNIIPSVTRSVSVPDTGSIWELQPTASQPTVWEGGSVWDLPLDTTTPGPALE
:: : .:::..:...::.::::.: .:... .::. . :. :.::.:....: :: ::
XP_016 LKPPRGGDQNLLPTMSRSLSVPDSGRLWDVHTSASSQSGGEA-SLWDIPINSSTQGPILE
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XP_016 QLQLQHKF------QERREVELRAKREEEERKRREEKRRQQ------QQEEQKRRQEEEE
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XP_016 LFRRKHV-----------------------------------------------------
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XP_016 ----------------------------------------------RQQELL--------
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XP_016 -LKLLQQQQA------VPVPPAPS-----------SPPPL--------------------
740 750 760
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD RRQQRELMKALQQQQQQQQQKLSGWGNVSKPSGTTKSLLEIQQEEARQMQKQQQQQQQHQ
:....: . . :.:::.: : ::..:: .
XP_016 ------------------------WAGLAKQGLSMKTLLELQLEGERQLHKQPPPR----
770 780 790
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD QPNRARNNTHSNLHTSIGNSVWGSINTGPPNQWASDLVSSIWSNADTK---NSNMGFWDD
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