Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0644
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0644, 811 aa
1>>>pF1KSDA0644 811 - 811 aa - 811 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2323+/-0.00105; mu= 9.0854+/- 0.063
mean_var=227.6628+/-45.234, 0's: 0 Z-trim(112.4): 176 B-trim: 565 in 1/51
Lambda= 0.085002
statistics sampled from 12999 (13182) to 12999 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.734), E-opt: 0.2 (0.405), width: 16
Scan time: 5.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 ( 811) 5490 686.8 3.7e-197
CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs108|chr5 ( 622) 581 84.7 5.1e-16
CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 514 76.5 1.5e-13
CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 514 76.5 1.6e-13
CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 ( 473) 469 70.9 5.8e-12
CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 ( 420) 449 68.4 2.9e-11
CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 450 68.8 4.5e-11
CCDS9342.1 RXFP2 gene_id:122042|Hs108|chr13 ( 754) 447 68.4 5.2e-11
CCDS75204.1 RXFP1 gene_id:59350|Hs108|chr4 ( 784) 446 68.3 5.8e-11
CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 442 67.6 6.1e-11
>>CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 (811 aa)
initn: 5490 init1: 5490 opt: 5490 Z-score: 3653.0 bits: 686.8 E(32554): 3.7e-197
Smith-Waterman score: 5490; 99.9% identity (100.0% similar) in 811 aa overlap (1-811:1-811)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHD
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CCDS75 MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS75 LLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNG
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CCDS75 HSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ALRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEPTPTASPGSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ALRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEPTPTASPGSAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SPAGDPWQRATKHRLGTEHQERAAQSDGGAGLPPLVSDPCDFNKFILCNLTVEAVGADSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPAGDPWQRATKHRLGTEHQERAAQSDGGAGLPPLVSDPCDFNKFILCNLTVEAVGADSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SVRWAVREHRSPRPLGGARFRLLFDRFGQQPKFHRFVYLPESSDSATLRELRGDTPYLVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SVRWAVREHRSPRPLGGARFRLLFDRFGQQPKFHRFVYLPESSDSATLRELRGDTPYLVC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VEGVLGGRVCPVAPRDHCAGLVTLPEAGSRGGVDYQLLTLALLTVNALLVLLALAAWASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VEGVLGGRVCPVAPRDHCAGLVTLPEAGSRGGVDYQLLTLALLTVNALLVLLALAAWASR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD WLRRKLRARRKGGAPVHVRHMYSTRRPLRSMGTGVSADFSGFQSHRPRTTVCALSEADLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WLRRKLRARRKGGAPVHVRHMYSTRRPLRSMGTGVSADFSGFQSHRPRTTVCALSEADLI
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KSD EFPCDRFMDSAGGGAGGSLRREDRLLQRFAD
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EFPCDRFMDSAGGGAGGSLRREDRLLQRFAD
790 800 810
>>CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs108|chr5 (622 aa)
initn: 886 init1: 235 opt: 581 Z-score: 401.0 bits: 84.7 E(32554): 5.1e-16
Smith-Waterman score: 581; 31.3% identity (60.0% similar) in 402 aa overlap (7-405:11-400)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPV--CPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSS
:::.::: : : : . . : :. ... : : :: .::.
CCDS47 MCGLQFSLPCLRLFLVVT-CYLLLLLHKEILGCSSVCQLCTGRQINCRNLGLSSIPKNF-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYL
:.... : :: :. :. .. : .: : :. ..: ..::.: .: .: :.:
CCDS47 ---PESTVFLYLTGNNISYINESELTGLHSLVALYLDNSNILYVYPKAFVQLRHLYFLFL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD GNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAV
.::... : :: . : .:: :: . :..: . :: :. : :. : :. : : .: ...
CCDS47 NNNFIKRLDPGIFKGLLNLRNLYLQYNQVSFVPRGVFNDLVSVQYLNLQRNRLTVLGSGT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD FAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSL
:. . : : : .: : .....: .: .: : :..:.: .: : :.:: :
CCDS47 FVGMVALRILDLSNNNILRISESGFQHLENLACLYLGSNNLTKVPSNA--FEVLKSLRRL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPT
:: : .. . : :. : : : :..... ... ..: :.. :..: : : : .: .
CCDS47 SLSHNPIEAIQPFAFKGLANLEYLLLKNSRIRNVTRDGFSGINNLKHLILSHNDLENLNS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLG-RLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYR
. :..: : :. :.. .. :: ..: :. :.: : :.:: .. .: .
CCDS47 DTFSLLKNLIYLKLDRNRIISIDNDTFENMGASLKILNLSFNNLTALHPRVLKPLSSLIH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD LDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGS
:. ..: : :.:.: ::. :.. . .:. . :..::..::. : :..
CCDS47 LQANSNPWECNCKLLGLRDWLA-----SSAITLNIYCQNPPSMRGRALRYINITNCVTSS
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAAR
CCDS47 INVSRAWAVVKSPHIHHKTTALMMAWHKVTTNGSPLENTETENITFWERIPTSPAGRFFQ
410 420 430 440 450 460
>>CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 (605 aa)
initn: 894 init1: 313 opt: 514 Z-score: 356.7 bits: 76.5 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 542; 34.8% identity (56.6% similar) in 385 aa overlap (66-395:201-575)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQI
:.:: .. . : :..::.:::. : .
CCDS10 SLWDLNLGWNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQPALFSGLAELRELDLSRNAL
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLE
:... ..: .: ::..::: ::. :.:::.. :. :: : . :... : . .: ::
CCDS10 RAIKANVFVQLPRLQKLYLDRNLIAAVAPGAFLGLKALRWLDLSHNRVAGLLEDTFPGLL
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANEL
.: :::. ::...: .: : : :.: :::: :.. .: ::.:. :.:. :.:
CCDS10 GLRVLRLSHNAIASLRPRTFKDLHFLEELQLGHNRIRQLAERSFEGLGQLEVLTLDHNQL
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260
pF1KSD QPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRG-------------
: .:..: : ... . ::.: :..: ..:. : .: : :.:
CCDS10 QEV--KAGAFLGLTNVAVMNLSGNCLRNLPEQVFRGLGKLHSLHLEGSCLGRIRPHTFTG
360 370 380 390 400
270 280
pF1KSD -----------------------------------NQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGN
:::::: . : :: :. : : :
CCDS10 LSGLRRLFLKDNGLVGIEEQSLWGLAELLELDLTSNQLTHLPHRLFQGLGKLEYLLLSRN
410 420 430 440 450 460
290 300 310 320 330 340
pF1KSD RLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAA
::..::. : ::. ::.: :.: :: . .. ::::: ::::::.: ... .
CCDS10 RLAELPADALGPLQRAFWLDVSHNRLEALPNSLLAPLGRLRYLSLRNNSLRTFTPQ----
470 480 490 500 510 520
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQG-RLLTVFVQ--CR----HPPALRGKY
:.: :: :.:: : : : :..:. :. :. . ::: :. .:::
CCDS10 PPGLERLWLEGNPWDCGCPLKALR----DFALQNPSAVPRFVQAICEGDDCQPPAYTYNN
530 540 550 560 570 580
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQG
CCDS10 ITCASPPEVVGLDLRDLSEAHFAPC
590 600
>>CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 (643 aa)
initn: 894 init1: 313 opt: 514 Z-score: 356.4 bits: 76.5 E(32554): 1.6e-13
Smith-Waterman score: 542; 34.8% identity (56.6% similar) in 385 aa overlap (66-395:239-613)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQI
:.:: .. . : :..::.:::. : .
CCDS53 SLWDLNLGWNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQPALFSGLAELRELDLSRNAL
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLE
:... ..: .: ::..::: ::. :.:::.. :. :: : . :... : . .: ::
CCDS53 RAIKANVFVQLPRLQKLYLDRNLIAAVAPGAFLGLKALRWLDLSHNRVAGLLEDTFPGLL
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANEL
.: :::. ::...: .: : : :.: :::: :.. .: ::.:. :.:. :.:
CCDS53 GLRVLRLSHNAIASLRPRTFKDLHFLEELQLGHNRIRQLAERSFEGLGQLEVLTLDHNQL
330 340 350 360 370 380
220 230 240 250 260
pF1KSD QPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRG-------------
: .:..: : ... . ::.: :..: ..:. : .: : :.:
CCDS53 QEV--KAGAFLGLTNVAVMNLSGNCLRNLPEQVFRGLGKLHSLHLEGSCLGRIRPHTFTG
390 400 410 420 430 440
270 280
pF1KSD -----------------------------------NQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGN
:::::: . : :: :. : : :
CCDS53 LSGLRRLFLKDNGLVGIEEQSLWGLAELLELDLTSNQLTHLPHRLFQGLGKLEYLLLSRN
450 460 470 480 490 500
290 300 310 320 330 340
pF1KSD RLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAA
::..::. : ::. ::.: :.: :: . .. ::::: ::::::.: ... .
CCDS53 RLAELPADALGPLQRAFWLDVSHNRLEALPNSLLAPLGRLRYLSLRNNSLRTFTPQ----
510 520 530 540 550 560
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQG-RLLTVFVQ--CR----HPPALRGKY
:.: :: :.:: : : : :..:. :. :. . ::: :. .:::
CCDS53 PPGLERLWLEGNPWDCGCPLKALR----DFALQNPSAVPRFVQAICEGDDCQPPAYTYNN
570 580 590 600 610
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQG
CCDS53 ITCASPPEVVGLDLRDLSEAHFAPC
620 630 640
>>CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 (473 aa)
initn: 420 init1: 345 opt: 469 Z-score: 328.3 bits: 70.9 E(32554): 5.8e-12
Smith-Waterman score: 486; 33.4% identity (51.9% similar) in 416 aa overlap (159-571:61-439)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLES
.. : :: .. .: : : :: : :.:
CCDS13 CVCYNEPKVTTSCPQQGLQAVPVGIPAASQRIFLHGNRISHVPAASFRACRNLTILWLHS
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRI
: . . ::. :. :. :.:: : :. ::: : : .: :. .::.::: .
CCDS13 NVLARIDAAAFTGLALLEQLDLSDNAQLRSV-DPATFHGLGRLHTLHLDRCGLQELGPGL
100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEALDL
:. : : : :. : : : ..: : : .: :.:::.:..: .. ::::. : :
CCDS13 FRGLAALQYLYLQDNALQALPDDTFRDLGNLTHLFLHGNRISSVPERAFRGLHSLDRLLL
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDCRLR
:... .:: .: :::: : : : :::: . .: :: : :. : :.:::: :
CCDS13 HQNRVAHVHPHAFRDLGRLMTLYLFANNLSALPTEALAPLRALQYLRLNDNPWVCDCRAR
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLTADRR
: : : .. : . : : : : :. : : ..:: : . .: . . :
CCDS13 PL--WA--WLQKFRGSSSEVPCSLPQRLAGRDLKRLAANDLQ-GCAVATGPYHPIWTGR-
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRSALRLSRRG
:. :: : :: . ::. .. :.: : .:: ::. .:
CCDS13 ------ATDEE---PLGLPKCC--QPDAADK----ASVLEPGRPAS-AGN--ALK-GRVP
330 340 350 360
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEPTPTASPGSAPS--PAGDP
:: . :. : .:. .. .: : :.: :. : :: : :.. :
CCDS13 PGDSPPG------NGSGPRHIN--DSPFGTLPGSAEPPLTAVRP---EGSEPPGFPTSGP
370 380 390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KSD WQRATKHRLG-TEHQERAAQSDGGAGLPPLVSDPCDFNKFILCNLTVEAVGADSASVRWA
.: : . :. . : .:. .:.:
CCDS13 RRRPGCSRKNRTRSHCRLGQAGSGGGGTGDSEGSGALPSLTCSLTPLGLALVLWTVLGPC
420 430 440 450 460 470
>>CCDS7957.1 RTN4RL2 gene_id:349667|Hs108|chr11 (420 aa)
initn: 837 init1: 313 opt: 449 Z-score: 315.6 bits: 68.4 E(32554): 2.9e-11
Smith-Waterman score: 449; 35.3% identity (58.3% similar) in 309 aa overlap (156-460:61-361)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLH
: .: :..: . .: ..:. .::: :
CCDS79 CPMLCTCYSSPPTVSCQANNFSSVPLSLPPSTQRLFLQNNLIRTLRPGTFG--SNLLTLW
40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLG
: :: . . ..: .: :. :.:. :. ::. :: :. :.:: : .:. :
CCDS79 LFSNNLSTIYPGTFRHLQALEELDLGDNRHLRSLE-PDTFQGLERLQSLHLYRCQLSSLP
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pF1KSD PRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEA
::. : : : :. :.: :: . : : : .: :.:::: : ... : ::.
CCDS79 GNIFRGLVSLQYLYLQENSLLHLQDDLFADLANLSHLFLHGNRLRLLTEHVFRGLGSLDR
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDC
: : ::.:...: :.: :.:: : : ::.:..: :. .: :.: : :..: :.:::
CCDS79 LLLHGNRLQGVHRAAFRGLSRLTILYLFNNSLASLPGEALADLPSLEFLRLNANPWACDC
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD RLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPS-PSASLT
: : : : : ...:. . : : :: .:. : : . ..: : :. :..
CCDS79 RARPL--WA--WFQRARVSSSDVTCATPPERQGRDLRALREADFQACPPAAPTRPGSRAR
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pF1KSD ADRRRQPLPTAAGEEMTPPAG---LAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRSA
.. . : .: : .::: : ..:: . . .::
CCDS79 GNSSSNHLYGVA-EAGAPPADPSTLYRDLPAEDSRGRQGGDAPTEDDYWGGYGGEDQRGE
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pF1KSD LRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEPTPTASPGSAPS
CCDS79 QMCPGAACQAPPDSRGPALSAGLPSPLLCLLLLVPHHL
390 400 410 420
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:: .: :. ..: :.. :: .:..
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: ::.: : . :.:: .: : : : .:. : ::
CCDS61 LSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQN
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pF1KSD NQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFE
::.: . .....: :. : : : .. . :. .. :..:: :. . : .... .:.
CCDS61 NQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFR
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160 170 180 190 200 210
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CCDS61 SLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNY
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pF1KSD NELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRG-NQLTHLAPE
:.:. . ... : .:. : . : .: .: :::::.: :.: : .:.:.. :.
CCDS61 NNLD---EFPTAIRTLSNLKELHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEF-PD
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. : :. : : : ..:.:: .. . : .:..:::: : : : : .:. .:....
CCDS61 -LTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDL-P-SFSVCQKLQKID
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340 350 360 370 380 390
pF1KSD LRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCR
::.: . .. : : .: :.: :
CCDS61 LRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPIT
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:. :::.. . : :.: :. :: :.
CCDS93 DTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKETE-LECVNGDLKSVPMISN---
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pF1KSD PHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNN
.: :: : : .. : . .:... ::.: :: . :.: : :. :::..:
CCDS93 --NVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHN
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pF1KSD LLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAP
. .: :: . :..: : . : :.:.:. : ::.:: : . .: : ::: . :
CCDS93 CITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSMVNNYLEALPKQMCAQ
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. .: .. ::.:::..: ...: . .: : : : : .. ::. :..:. : ::
CCDS93 MPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRN--QIGFVPEKTFSSLKNLGELDLS
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pF1KSD ANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALL
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CCDS93 SNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDLERIEIPNINTRMF
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pF1KSD EPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLD
.:...:
CCDS93 QPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRIFVWVIAFITCFGN
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CCDS75 DKYFASYYKMTSQYPFEAETPECSFHFFLFITLLFLVPHCHHALPLPLDSVVGSVPVQCL
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CCDS75 CQG-LELDCDETNLRAVPSVSS-----NVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQN
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CCDS75 NKITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFY
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::.::. : : .:.: ::: . . : .: ::.:.:. : . .: . ..: : .
CCDS75 GLNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMR
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CCDS75 KNKINHL--NENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQAN
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CCDS75 QFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGIS
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CCDS75 SLENLLASIIQRVFVWVVSAVTCFGNIFVICMRPYIRSENKLYAMSIISLCCADCLMGIY
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CCDS47 TDKGS----LGLSLRHNHITELERDQFASFSQLTWLHLDHNQISTVKEDAFQGLYKLKEL
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CCDS47 ILSSNKIFYLPNTTFTQLINLQNLDLSFNQLSSLHPELFYGLRKLQTLHLRSNSLRTIPV
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pF1KSD AVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLS
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CCDS47 RLFWDCRSLEFLDLSTNRLRSLARNGFAGLIKLRELHL----------------------
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CCDS47 -----------------EH-----------NQLTKINFAHFLRLSSLHTLFLQWNKISNL
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.. .:: :::.:::..:. ..: . :. : . :: :..:.. :. . .:
CCDS47 TCGMEWTWGTLEKLDLTGNEIKAIDLTVFETMPNLKILLMDNNKLNSLDSKILNSLRSLT
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CCDS47 TVGLSGNLWECSARICALASWLGSF--QGRWEHS-ILCHSPDHTQGEDILDAVHGFQL--
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]