Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0644
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0644, 811 aa
1>>>pF1KSDA0644 811 - 811 aa - 811 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9784+/-0.00042; mu= 4.1681+/- 0.026
mean_var=247.3431+/-50.867, 0's: 0 Z-trim(119.7): 359 B-trim: 1382 in 1/55
Lambda= 0.081550
statistics sampled from 33495 (33929) to 33495 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.398), width: 16
Scan time: 14.660
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055632 (OMIM: 613356) TLR4 interactor with leuc ( 811) 5490 659.8 1.3e-188
NP_004961 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growt ( 605) 514 74.3 1.8e-12
NP_001139478 (OMIM: 601489,615961) insulin-like gr ( 643) 514 74.3 1.9e-12
NP_075380 (OMIM: 181500,605566) reticulon-4 recept ( 473) 469 68.9 6e-11
XP_011530481 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 412) 455 67.2 1.7e-10
NP_848665 (OMIM: 610462) reticulon-4 receptor-like ( 420) 449 66.5 2.8e-10
XP_016875878 (OMIM: 219050,606655) PREDICTED: rela ( 383) 447 66.2 3.1e-10
NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-co ( 883) 450 66.9 4.4e-10
NP_570718 (OMIM: 219050,606655) relaxin receptor 2 ( 754) 447 66.5 5e-10
XP_016864009 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 703) 446 66.3 5.2e-10
XP_016864008 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 703) 446 66.3 5.2e-10
XP_016864012 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 385) 440 65.4 5.5e-10
NP_001240656 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 784) 446 66.4 5.6e-10
NP_056379 (OMIM: 610868) leucine-rich repeat trans ( 516) 442 65.8 5.7e-10
XP_016864014 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 352) 438 65.1 6e-10
NP_004479 (OMIM: 173511) platelet glycoprotein V p ( 560) 432 64.6 1.4e-09
XP_011530476 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 783) 435 65.1 1.4e-09
XP_016864010 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 676) 431 64.6 1.7e-09
NP_067647 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 isofor ( 757) 431 64.6 1.9e-09
NP_001240657 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 724) 429 64.4 2.1e-09
XP_016864011 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 675) 420 63.3 4.2e-09
XP_016864007 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 756) 420 63.3 4.6e-09
XP_011530477 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 760) 419 63.2 5e-09
NP_072089 (OMIM: 300278,310500) nyctalopin precurs ( 481) 412 62.2 6.3e-09
XP_016885198 (OMIM: 300278,310500) PREDICTED: nyct ( 481) 412 62.2 6.3e-09
NP_821079 (OMIM: 610869) leucine-rich repeat trans ( 581) 411 62.1 7.9e-09
NP_079269 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat trans ( 518) 409 61.9 8.5e-09
NP_001269857 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 519) 409 61.9 8.5e-09
NP_612449 (OMIM: 608843) vasorin precursor [Homo s ( 673) 411 62.2 8.7e-09
NP_001269853 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 590) 409 61.9 9.4e-09
NP_001128217 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 590) 409 61.9 9.4e-09
NP_001317299 (OMIM: 610870) leucine-rich repeat tr ( 591) 409 61.9 9.4e-09
XP_016864013 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 361) 404 61.1 9.8e-09
NP_849161 (OMIM: 610867) leucine-rich repeat trans ( 522) 406 61.5 1.1e-08
XP_016859475 (OMIM: 610867) PREDICTED: leucine-ric ( 522) 406 61.5 1.1e-08
XP_016859476 (OMIM: 610867) PREDICTED: leucine-ric ( 522) 406 61.5 1.1e-08
XP_011530478 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 733) 404 61.4 1.6e-08
XP_016864006 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 759) 402 61.2 2e-08
NP_001333361 (OMIM: 606666,615311) leucine-rich re ( 927) 403 61.4 2.1e-08
NP_001159530 (OMIM: 219050,606655) relaxin recepto ( 730) 396 60.5 3.2e-08
XP_011528236 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 825) 396 60.5 3.5e-08
XP_011528235 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 830) 396 60.5 3.5e-08
XP_011528234 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 839) 396 60.5 3.5e-08
NP_612490 (OMIM: 616236) chondroadherin-like prote ( 762) 395 60.4 3.5e-08
XP_005261427 (OMIM: 616236) PREDICTED: chondroadhe ( 771) 395 60.4 3.6e-08
NP_003658 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-conta ( 907) 396 60.6 3.7e-08
NP_848663 (OMIM: 610461) reticulon-4 receptor-like ( 441) 379 58.3 8.7e-08
NP_001240659 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 626) 362 56.4 4.5e-07
NP_001013675 (OMIM: 613505) leucine-rich repeat-co ( 334) 348 54.5 8.9e-07
NP_001240661 (OMIM: 606654) relaxin receptor 1 iso ( 625) 350 55.0 1.2e-06
>>NP_055632 (OMIM: 613356) TLR4 interactor with leucine (811 aa)
initn: 5490 init1: 5490 opt: 5490 Z-score: 3507.1 bits: 659.8 E(85289): 1.3e-188
Smith-Waterman score: 5490; 99.9% identity (100.0% similar) in 811 aa overlap (1-811:1-811)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD VLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_055 LLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD HSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 HSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD WTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 WTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ALRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEPTPTASPGSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ALRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEPTPTASPGSAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SPAGDPWQRATKHRLGTEHQERAAQSDGGAGLPPLVSDPCDFNKFILCNLTVEAVGADSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SPAGDPWQRATKHRLGTEHQERAAQSDGGAGLPPLVSDPCDFNKFILCNLTVEAVGADSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SVRWAVREHRSPRPLGGARFRLLFDRFGQQPKFHRFVYLPESSDSATLRELRGDTPYLVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SVRWAVREHRSPRPLGGARFRLLFDRFGQQPKFHRFVYLPESSDSATLRELRGDTPYLVC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD VEGVLGGRVCPVAPRDHCAGLVTLPEAGSRGGVDYQLLTLALLTVNALLVLLALAAWASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VEGVLGGRVCPVAPRDHCAGLVTLPEAGSRGGVDYQLLTLALLTVNALLVLLALAAWASR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD WLRRKLRARRKGGAPVHVRHMYSTRRPLRSMGTGVSADFSGFQSHRPRTTVCALSEADLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 WLRRKLRARRKGGAPVHVRHMYSTRRPLRSMGTGVSADFSGFQSHRPRTTVCALSEADLI
730 740 750 760 770 780
790 800 810
pF1KSD EFPCDRFMDSAGGGAGGSLRREDRLLQRFAD
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EFPCDRFMDSAGGGAGGSLRREDRLLQRFAD
790 800 810
>>NP_004961 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growth fa (605 aa)
initn: 894 init1: 313 opt: 514 Z-score: 344.8 bits: 74.3 E(85289): 1.8e-12
Smith-Waterman score: 542; 34.8% identity (56.6% similar) in 385 aa overlap (66-395:201-575)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQI
:.:: .. . : :..::.:::. : .
NP_004 SLWDLNLGWNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQPALFSGLAELRELDLSRNAL
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLE
:... ..: .: ::..::: ::. :.:::.. :. :: : . :... : . .: ::
NP_004 RAIKANVFVQLPRLQKLYLDRNLIAAVAPGAFLGLKALRWLDLSHNRVAGLLEDTFPGLL
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANEL
.: :::. ::...: .: : : :.: :::: :.. .: ::.:. :.:. :.:
NP_004 GLRVLRLSHNAIASLRPRTFKDLHFLEELQLGHNRIRQLAERSFEGLGQLEVLTLDHNQL
300 310 320 330 340 350
220 230 240 250 260
pF1KSD QPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRG-------------
: .:..: : ... . ::.: :..: ..:. : .: : :.:
NP_004 QEV--KAGAFLGLTNVAVMNLSGNCLRNLPEQVFRGLGKLHSLHLEGSCLGRIRPHTFTG
360 370 380 390 400
270 280
pF1KSD -----------------------------------NQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGN
:::::: . : :: :. : : :
NP_004 LSGLRRLFLKDNGLVGIEEQSLWGLAELLELDLTSNQLTHLPHRLFQGLGKLEYLLLSRN
410 420 430 440 450 460
290 300 310 320 330 340
pF1KSD RLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAA
::..::. : ::. ::.: :.: :: . .. ::::: ::::::.: ... .
NP_004 RLAELPADALGPLQRAFWLDVSHNRLEALPNSLLAPLGRLRYLSLRNNSLRTFTPQ----
470 480 490 500 510 520
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQG-RLLTVFVQ--CR----HPPALRGKY
:.: :: :.:: : : : :..:. :. :. . ::: :. .:::
NP_004 PPGLERLWLEGNPWDCGCPLKALR----DFALQNPSAVPRFVQAICEGDDCQPPAYTYNN
530 540 550 560 570 580
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQG
NP_004 ITCASPPEVVGLDLRDLSEAHFAPC
590 600
>--
initn: 332 init1: 236 opt: 294 Z-score: 204.9 bits: 48.4 E(85289): 0.00011
Smith-Waterman score: 294; 37.5% identity (63.7% similar) in 168 aa overlap (20-181:33-196)
10 20 30 40
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAE-PVCPERCDCQHPQH-----LLCTN
: :: :.:: : :.. . ..:..
NP_004 LRKGGLALALLLLSWVALGPRSLEGADPGTPGEAEGPACPAACVCSYDDDADELSVFCSS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTF
:.: .: ...:. ..: : :: .... :. :..: :.:: .:. ::.:...
NP_004 RNLTRLP--DGVPGGTQALW--LDGNNLSSVPPAAFQNLSSLGFLNLQGGQLGSLEPQAL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD EKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLD
: : .:.: : :..:: ::.: : : ..:..::: : :::: :: : :
NP_004 LGLENLCHLHLERNQLRSLALGTFAHTPALASLGLSNNRLSRLEDGLFEGLGSLWDLNLG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD GNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAA
:.:..::::.: ::.:
NP_004 WNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQPALFSGLAELRELDLSRNALRAIKANVF
180 190 200 210 220 230
>>NP_001139478 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growth (643 aa)
initn: 894 init1: 313 opt: 514 Z-score: 344.4 bits: 74.3 E(85289): 1.9e-12
Smith-Waterman score: 542; 34.8% identity (56.6% similar) in 385 aa overlap (66-395:239-613)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQI
:.:: .. . : :..::.:::. : .
NP_001 SLWDLNLGWNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQPALFSGLAELRELDLSRNAL
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140 150
pF1KSD RSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLE
:... ..: .: ::..::: ::. :.:::.. :. :: : . :... : . .: ::
NP_001 RAIKANVFVQLPRLQKLYLDRNLIAAVAPGAFLGLKALRWLDLSHNRVAGLLEDTFPGLL
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KSD SLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANEL
.: :::. ::...: .: : : :.: :::: :.. .: ::.:. :.:. :.:
NP_001 GLRVLRLSHNAIASLRPRTFKDLHFLEELQLGHNRIRQLAERSFEGLGQLEVLTLDHNQL
330 340 350 360 370 380
220 230 240 250 260
pF1KSD QPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRG-------------
: .:..: : ... . ::.: :..: ..:. : .: : :.:
NP_001 QEV--KAGAFLGLTNVAVMNLSGNCLRNLPEQVFRGLGKLHSLHLEGSCLGRIRPHTFTG
390 400 410 420 430 440
270 280
pF1KSD -----------------------------------NQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGN
:::::: . : :: :. : : :
NP_001 LSGLRRLFLKDNGLVGIEEQSLWGLAELLELDLTSNQLTHLPHRLFQGLGKLEYLLLSRN
450 460 470 480 490 500
290 300 310 320 330 340
pF1KSD RLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAA
::..::. : ::. ::.: :.: :: . .. ::::: ::::::.: ... .
NP_001 RLAELPADALGPLQRAFWLDVSHNRLEALPNSLLAPLGRLRYLSLRNNSLRTFTPQ----
510 520 530 540 550 560
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQG-RLLTVFVQ--CR----HPPALRGKY
:.: :: :.:: : : : :..:. :. :. . ::: :. .:::
NP_001 PPGLERLWLEGNPWDCGCPLKALR----DFALQNPSAVPRFVQAICEGDDCQPPAYTYNN
570 580 590 600 610
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLTADRRRQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQG
NP_001 ITCASPPEVVGLDLRDLSEAHFAPC
620 630 640
>--
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Smith-Waterman score: 294; 37.5% identity (63.7% similar) in 168 aa overlap (20-181:71-234)
10 20 30 40
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAE-PVCPERCDCQHPQH-----LLCTN
: :: :.:: : :.. . ..:..
NP_001 PPAGGLALALLLLSWVALGPRSLEGADPGTPGEAEGPACPAACVCSYDDDADELSVFCSS
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KSD RGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTF
:.: .: ...:. ..: : :: .... :. :..: :.:: .:. ::.:...
NP_001 RNLTRLP--DGVPGGTQALW--LDGNNLSSVPPAAFQNLSSLGFLNLQGGQLGSLEPQAL
110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KSD EKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLD
: : .:.: : :..:: ::.: : : ..:..::: : :::: :: : :
NP_001 LGLENLCHLHLERNQLRSLALGTFAHTPALASLGLSNNRLSRLEDGLFEGLGSLWDLNLG
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KSD GNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAA
:.:..::::.: ::.:
NP_001 WNSLAVLPDAAFRGLGSLRELVLAGNRLAYLQPALFSGLAELRELDLSRNALRAIKANVF
220 230 240 250 260 270
>>NP_075380 (OMIM: 181500,605566) reticulon-4 receptor p (473 aa)
initn: 420 init1: 345 opt: 469 Z-score: 317.6 bits: 68.9 E(85289): 6e-11
Smith-Waterman score: 486; 33.4% identity (51.9% similar) in 416 aa overlap (159-571:61-439)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLES
.. : :: .. .: : : :: : :.:
NP_075 CVCYNEPKVTTSCPQQGLQAVPVGIPAASQRIFLHGNRISHVPAASFRACRNLTILWLHS
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRI
: . . ::. :. :. :.:: : :. ::: : : .: :. .::.::: .
NP_075 NVLARIDAAAFTGLALLEQLDLSDNAQLRSV-DPATFHGLGRLHTLHLDRCGLQELGPGL
100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KSD FQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEALDL
:. : : : :. : : : ..: : : .: :.:::.:..: .. ::::. : :
NP_075 FRGLAALQYLYLQDNALQALPDDTFRDLGNLTHLFLHGNRISSVPERAFRGLHSLDRLLL
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDCRLR
:... .:: .: :::: : : : :::: . .: :: : :. : :.:::: :
NP_075 HQNRVAHVHPHAFRDLGRLMTLYLFANNLSALPTEALAPLRALQYLRLNDNPWVCDCRAR
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPSPSASLTADRR
: : : .. : . : : : : :. : : ..:: : . .: . . :
NP_075 PL--WA--WLQKFRGSSSEVPCSLPQRLAGRDLKRLAANDLQ-GCAVATGPYHPIWTGR-
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RQPLPTAAGEEMTPPAGLAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRSALRLSRRG
:. :: : :: . ::. .. :.: : .:: ::. .:
NP_075 ------ATDEE---PLGLPKCC--QPDAADK----ASVLEPGRPAS-AGN--ALK-GRVP
330 340 350 360
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEPTPTASPGSAPS--PAGDP
:: . :. : .:. .. .: : :.: :. : :: : :.. :
NP_075 PGDSPPG------NGSGPRHIN--DSPFGTLPGSAEPPLTAVRP---EGSEPPGFPTSGP
370 380 390 400 410
550 560 570 580 590 600
pF1KSD WQRATKHRLG-TEHQERAAQSDGGAGLPPLVSDPCDFNKFILCNLTVEAVGADSASVRWA
.: : . :. . : .:. .:.:
NP_075 RRRPGCSRKNRTRSHCRLGQAGSGGGGTGDSEGSGALPSLTCSLTPLGLALVLWTVLGPC
420 430 440 450 460 470
>>XP_011530481 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin recepto (412 aa)
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10 20 30
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCL-ALP-PLAEPV--CPERCD
. ::..: : ::: :: : : .:
XP_011 DKYFASYYKMTSQYPFEAETPECSFHFFLFITLLFLVPHCHHALPLPLDSVVGSVPVQCL
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KSD CQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQY
:: .: : . .::.::..:: .: ..:: :.: .. :. .:..: ::
XP_011 CQG-LELDCDETNLRAVPSVSS-----NVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQN
140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KSD NQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFE
:.: :. .:. :. : .:::..: . : ::.. :..:. : . :..::.: .:
XP_011 NKITSISIYAFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFY
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAP-LGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLS
::.::. : : .:.: ::: . . : .: ::.:.:. : . .: . ..: : .
XP_011 GLNSLILLVLMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMR
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KSD ANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPE
:... . :::::..:. : :..:....: : ::. : .:. :.: : . .. .
XP_011 KNKINH--LNENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQAN
310 320 330 340 350 360
280 290 300 310 320
pF1KSD AFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEAL--DLSGNELSALHPATFGHLGRLRE
: : :. : ::: ..:.. ...:: .: . .: :... . :
XP_011 QFDYLVKLKSLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHMYHNLLGSDFYSAH
370 380 390 400 410
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQ
>>NP_848665 (OMIM: 610462) reticulon-4 receptor-like 2 p (420 aa)
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Smith-Waterman score: 449; 35.3% identity (58.3% similar) in 309 aa overlap (156-460:61-361)
130 140 150 160 170 180
pF1KSD TLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLH
: .: :..: . .: ..:. .::: :
NP_848 CPMLCTCYSSPPTVSCQANNFSSVPLSLPPSTQRLFLQNNLIRTLRPGTFG--SNLLTLW
40 50 60 70 80
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLG
: :: . . ..: .: :. :.:. :. ::. :: :. :.:: : .:. :
NP_848 LFSNNLSTIYPGTFRHLQALEELDLGDNRHLRSLE-PDTFQGLERLQSLHLYRCQLSSLP
90 100 110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEA
::. : : : :. :.: :: . : : : .: :.:::: : ... : ::.
NP_848 GNIFRGLVSLQYLYLQENSLLHLQDDLFADLANLSHLFLHGNRLRLLTEHVFRGLGSLDR
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDC
: : ::.:...: :.: :.:: : : ::.:..: :. .: :.: : :..: :.:::
NP_848 LLLHGNRLQGVHRAAFRGLSRLTILYLFNNSLASLPGEALADLPSLEFLRLNANPWACDC
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCRHPPALRGKYLDYLDDQQLQNGSCADPS-PSASLT
: : : : : ...:. . : : :: .:. : : . ..: : :. :..
NP_848 RARPL--WA--WFQRARVSSSDVTCATPPERQGRDLRALREADFQACPPAAPTRPGSRAR
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ADRRRQPLPTAAGEEMTPPAG---LAEELPPQPQLQQQGRFLAGVAWDGAARELVGNRSA
.. . : .: : .::: : ..:: . . .::
NP_848 GNSSSNHLYGVA-EAGAPPADPSTLYRDLPAEDSRGRQGGDAPTEDDYWGGYGGEDQRGE
330 340 350 360 370 380
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LRLSRRGPGLQQPSPSVAAAAGPAPQSLDLHKKPQRGRPTRADPALAEPTPTASPGSAPS
NP_848 QMCPGAACQAPPDSRGPALSAGLPSPLLCLLLLVPHHL
390 400 410 420
>>XP_016875878 (OMIM: 219050,606655) PREDICTED: relaxin (383 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPS
:. :::.. . : :.: :. :: :.
XP_016 DTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKETE-LECVNGDLKSVPMISN---
90 100 110 120 130
60 70 80 90 100 110
pF1KSD PHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNN
.: :: : : .. : . .:... ::.: :: . :.: : :. :::..:
XP_016 --NVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHN
140 150 160 170 180 190
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAP
. .: :: . :..: : . : :.:.:. : ::.:: : . .: : ::: . :
XP_016 CITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSMVNNYLEALPKQMCAQ
200 210 220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILS
. .: .. ::.:::..: ...: . .: : : : : .. ::. :..:. : ::
XP_016 MPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRN--QIGFVPEKTFSSLKNLGELDLS
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALL
.:.. .:.:..:. : : :.: .: : .: . : .:. :. : :: .. .. : ..
XP_016 SNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDLERIEIPNINTRMF
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLD
.:...:
XP_016 QPMKNLSHMC
380
>>NP_001264155 (OMIM: 606667) leucine-rich repeat-contai (883 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLL----CTNRGLRVVPKT
:: .: :. ..: :.. :: .:..
NP_001 SRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSELPSN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KSD SS----------------LPSPHDVLTY----SLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQY
: ::.: : . :.:: .: : : : .:. : ::
NP_001 LSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQN
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD NQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFE
::.: . .....: :. : : : .. . :. .. :..:: :. . : .... .:.
NP_001 NQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFR
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAPLGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSA
.: .: . : : . .:: .:. :..:. :::..:::. :::. : : .:. :.:.
NP_001 SLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNY
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD NELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRG-NQLTHLAPE
:.:. . ... : .:. : . : .: .: :::::.: :.: : .:.:.. :.
NP_001 NNLD---EFPTAIRTLSNLKELHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEF-PD
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELS
. : :. : : : ..:.:: .. . : .:..:::: : : : : .:. .:....
NP_001 -LTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDL-P-SFSVCQKLQKID
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KSD LRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLDGNGWTCDCRLRGLKRWMGDWHSQGRLLTVFVQCR
::.: . .. : : .: :.: :
NP_001 LRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPIT
360 370 380 390 400 410
>>NP_570718 (OMIM: 219050,606655) relaxin receptor 2 iso (754 aa)
initn: 387 init1: 240 opt: 447 Z-score: 300.9 bits: 66.5 E(85289): 5e-10
Smith-Waterman score: 447; 33.7% identity (61.6% similar) in 276 aa overlap (28-303:112-379)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCLALPPLAEPVCPERCDCQHPQHLLCTNRGLRVVPKTSSLPS
:. :::.. . : :.: :. :: :.
NP_570 DTSGWATIFGTVHGNANSVALTQECFLKQYPQCCDCKETE-LECVNGDLKSVPMISN---
90 100 110 120 130
60 70 80 90 100 110
pF1KSD PHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPKTFEKLSRLEELYLGNN
.: :: : : .. : . .:... ::.: :: . :.: : :. :::..:
NP_570 --NVTLLSLKKNKIHSLPDKVFIKYTKLKKIFLQHNCIRHISRKAFFGLCNLQILYLNHN
140 150 160 170 180 190
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLRLDGNALGALPDAVFAP
. .: :: . :..: : . : :.:.:. : ::.:: : . .: : ::: . :
NP_570 CITTLRPGIFKDLHQLTWLILDDNPITRISQRLFTGLNSLFFLSMVNNYLEALPKQMCAQ
200 210 220 230 240 250
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLRHAATFAPLRSLSSLILS
. .: .. ::.:::..: ...: . .: : : : : .. ::. :..:. : ::
NP_570 MPQLNWVDLEGNRIKYLTNSTFLSCDSLTVLFLPRN--QIGFVPEKTFSSLKNLGELDLS
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KSD ANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALRELRLEGNRLSQLPTALL
.:.. .:.:..:. : : :.: .: : .: . : .:. :. : :: .. .. : ..
NP_570 SNTITELSPHLFKDLKLLQKLNLSSNPLMYLHKNQFESLKQLQSLDLERIEIPNINTRMF
320 330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KSD EPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSALSGDIFAASPALYRLDLD
.:...:
NP_570 QPMKNLSHIYFKNFRYCSYAPHVRICMPLTDGISSFEDLLANNILRIFVWVIAFITCFGN
380 390 400 410 420 430
>>XP_016864009 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin recepto (703 aa)
initn: 362 init1: 198 opt: 446 Z-score: 300.7 bits: 66.3 E(85289): 5.2e-10
Smith-Waterman score: 446; 34.4% identity (62.6% similar) in 302 aa overlap (7-303:22-315)
10 20 30 40
pF1KSD MEAARALRLLLVVCGCL-ALP-PLAEPV--CPERCDCQHPQHLLC
. ::..: : ::: :: : : .: :: .: :
XP_016 MTSQYPFEAETPECSFHFFLFITLLFLVPHCHHALPLPLDSVVGSVPVQCLCQG-LELDC
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD TNRGLRVVPKTSSLPSPHDVLTYSLGGNFITNITAFDFHRLGQLRRLDLQYNQIRSLHPK
. .::.::..:: .: ..:: :.: .. :. .:..: :: :.: :.
XP_016 DETNLRAVPSVSS-----NVTAMSLQWNLIRKLPPDCFKNYHDLQKLYLQNNKITSISIY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD TFEKLSRLEELYLGNNLLQALAPGTLAPLRKLRILYANGNEISRLSRGSFEGLESLVKLR
.:. :. : .:::..: . : ::.. :..:. : . :..::.: .: ::.::. :
XP_016 AFRGLNSLTKLYLSHNRITFLKPGVFEDLHRLEWLIIEDNHLSRISPPTFYGLNSLILLV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LDGNALGALPDAVFAP-LGNLLYLHLESNRIRFLGKNAFAQLGKLRFLNLSANELQPSLR
: .:.: ::: . . : .: ::.:.:. : . .: . ..: : . :...
XP_016 LMNNVLTRLPDKPLCQHMPRLHWLDLEGNHIHNLRNLTFISCSNLTVLVMRKNKINHL--
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD HAATFAPLRSLSSLILSANSLQHLGPRIFQHLPRLGLLSLRGNQLTHLAPEAFWGLEALR
. :::::..:. : :..:....: : ::. : .:. :.: : . .. . : : :.
XP_016 NENTFAPLQKLDELDLGSNKIENLPPLIFKDLKELSQLNLSYNPIQKIQANQFDYLVKLK
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ELRLEGNRLSQLPTALLEPLHSLEALDLSGNELSALHPATFGHLGRLRELSLRNNALSAL
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XP_016 SLSLEGIEISNIQQRMFRPLMNLSHIYFKKFQYCGYAPHVRSCKPNTDGISSLENLLASI
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