Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0661
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0661, 1001 aa
1>>>pF1KSDA0661 1001 - 1001 aa - 1001 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.9636+/-0.000493; mu= -7.7603+/- 0.031
mean_var=483.1385+/-98.428, 0's: 0 Z-trim(120.9): 126 B-trim: 0 in 0/59
Lambda= 0.058350
statistics sampled from 36609 (36751) to 36609 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.431), width: 16
Scan time: 16.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055586 (OMIM: 607700) E3 ubiquitin-protein liga (1001) 6414 555.6 4.7e-157
NP_001273501 (OMIM: 607700) E3 ubiquitin-protein l (1001) 6414 555.6 4.7e-157
NP_001193962 (OMIM: 607700) E3 ubiquitin-protein l (1000) 6396 554.1 1.4e-156
XP_011544299 (OMIM: 607700) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 991) 5975 518.7 6.3e-146
NP_001193963 (OMIM: 607700) E3 ubiquitin-protein l ( 901) 3710 327.9 1.5e-88
NP_062538 (OMIM: 607699) E3 ubiquitin-protein liga ( 975) 1804 167.5 3.1e-40
XP_011517164 (OMIM: 607699) PREDICTED: E3 ubiquiti ( 975) 1804 167.5 3.1e-40
XP_016874551 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1120) 361 46.1 0.0013
XP_016874557 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1086) 355 45.6 0.0017
NP_001288177 (OMIM: 607127) ELKS/Rab6-interacting/ (1086) 355 45.6 0.0017
NP_829884 (OMIM: 607127) ELKS/Rab6-interacting/CAS (1116) 355 45.6 0.0018
XP_011519243 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1116) 355 45.6 0.0018
XP_016874553 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1116) 355 45.6 0.0018
XP_016874550 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1123) 351 45.3 0.0023
XP_016874552 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1119) 345 44.8 0.0032
XP_016874555 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1092) 338 44.2 0.0047
XP_016874549 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1134) 338 44.2 0.0048
XP_016874556 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1088) 332 43.7 0.0067
NP_829883 (OMIM: 607127) ELKS/Rab6-interacting/CAS (1088) 332 43.7 0.0067
XP_016874548 (OMIM: 607127) PREDICTED: ELKS/Rab6-i (1137) 328 43.3 0.0087
>>NP_055586 (OMIM: 607700) E3 ubiquitin-protein ligase B (1001 aa)
initn: 6414 init1: 6414 opt: 6414 Z-score: 2940.5 bits: 555.6 E(85289): 4.7e-157
Smith-Waterman score: 6414; 100.0% identity (100.0% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-1001)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAEL
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NP_055 AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 NSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPIN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD REMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSAHSTPNLGHPEDSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 REMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSAHSTPNLGHPEDSGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPGAQGPS
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NP_055 SAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPGAQGPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KSD TKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
970 980 990 1000
>>NP_001273501 (OMIM: 607700) E3 ubiquitin-protein ligas (1001 aa)
initn: 6414 init1: 6414 opt: 6414 Z-score: 2940.5 bits: 555.6 E(85289): 4.7e-157
Smith-Waterman score: 6414; 100.0% identity (100.0% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-1001)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPIN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD REMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSAHSTPNLGHPEDSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSAHSTPNLGHPEDSGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPGAQGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPGAQGPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KSD TKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
970 980 990 1000
>>NP_001193962 (OMIM: 607700) E3 ubiquitin-protein ligas (1000 aa)
initn: 5842 init1: 5768 opt: 6396 Z-score: 2932.4 bits: 554.1 E(85289): 1.4e-156
Smith-Waterman score: 6396; 99.9% identity (99.9% similar) in 1001 aa overlap (1-1001:1-1000)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLLATK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD NSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAGPIN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD REMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSAHSTPNLGHPEDSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSAHSTPNLGHPEDSGV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPGAQGPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPGAQGPS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
730 740 750 760 770 780
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
790 800 810 820 830 840
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
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::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_001 TKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
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Smith-Waterman score: 5975; 100.0% identity (100.0% similar) in 943 aa overlap (1-943:1-943)
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XP_011 ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
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pF1KSD IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
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pF1KSD EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
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pF1KSD SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
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XP_011 ESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKLLKLRESPLPACKCLWG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKLA
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pF1KSD ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHESQGELSS
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pF1KSD APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVELE
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pF1KSD LQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENRRL
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pF1KSD QDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNKHL
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pF1KSD AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQAEL
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQK-----------------------------
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSAHSTPNLGHPEDSGV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPGAQGPS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGLRAELK
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pF1KSD KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDRRESKK
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pF1KSD IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRLLQQLR
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pF1KSD EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKERALQG
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pF1KSD SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESRAAREK
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pF1KSD ESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVL
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pF1KSD TKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
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pF1KSD MSGPGNKRAAGDGGSG-PPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKL
::: :::::::. :.. ::::: . :.. :: .: :.:::.:::::.:...:: ::.::
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pF1KSD AERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHE-SQGEL
:: :.:::: ::::::.:::::.:::::::.::::::::.:.::... .:. .. ::
NP_062 AEMLDQRQAIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLG
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD SSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVE
. : . .: ::: .. .. . : .:::..:...:..:::::.:
NP_062 DLLTERKALV-------VPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEME
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pF1KSD LELQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENR
.:: :.: :. :::..: . :.::..:: : ... : ::. . ::.: . :..::
NP_062 SQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNS-GDNLIVEEAVQELNSFLAQENM
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD RLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNK
:::.:. :::::. .: :.:.::.:: .::..: .:. ..::::::.:.:::::.::.
NP_062 RLQELTDLLQEKHRTMSQEFSKLQSKVETAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNR
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD HLAEALEQLNS-GYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQ
::::.::..:: :: : :..:.. :: ::.. .::: .:::::::.:::..:. :::::.
NP_062 HLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRLCELEKLR
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD AELQGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLL
... .. ::.::: ::: :.::.:: ::: .:.:::.:::::::.:..::::: ::
NP_062 QDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEQVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLH
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD ATKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAG
.:...: ...: .: ::..:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_062 GTRGTHQHQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAG
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD PINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSA--HSTPNLGHP
::::::::::::::::::::::.. ::::::::.:....: : . :::: .: . :
NP_062 PINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLR-SGSALLQSQSSTEDP
480 490 500 510 520
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pF1KSD EDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPG
.: :: : ::. .... .... .: . . . :..: .
NP_062 KDE----PAELK----------PDS-EDLS--SQSSASKASQEDANEIKSKRDEEE-RER
530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD AQGPSSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGL
. . : :: : : :.. :::: .: : :.::.: .. ..::.:..: :
NP_062 ERREKERERERE-REKEKEREREKQKLKESEKERD-SAKDKEKGKHDDGRKKEAEIIKQL
580 590 600 610 620
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pF1KSD RAELKKAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDR
. :::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:.:::...::.:...::....
NP_062 KIELKKAQESQKEMKLLLDMYRSAPKEQRDKVQLMAAEKKSKAELEDLRQRLKDLEDKEK
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD RESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRL
.:.::.:::::::.:: .:::::.::.::. .::::::::::::::::::::::::: ::
NP_062 KENKKMADEDALRKIRAVEEQIEYLQKKLAMAKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNIRL
690 700 710 720 730 740
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pF1KSD LQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKE
.:::::::::::::::::::.:::::::.:::.::..::: ::.:::::: .:.::::::
NP_062 MQQLREKDDANFKLMSERIKSNQIHKLLKEEKEELADQVLTLKTQVDAQLQVVRKLEEKE
750 760 770 780 790 800
840 850 860 870 880 890
pF1KSD RALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESR
. ::...: :::: ::.::::.:::::.::::::.:::.::: .: .:...: ..:.
NP_062 HLLQSNIGTGEKELGLRTQALEMNKRKAMEAAQLADDLKAQLELAQKKLHDFQDEIVENS
810 820 830 840 850 860
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pF1KSD AAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRK
...::. ::.::::::::::::::: .: . ::::.::::.::::::::::: ::
NP_062 VTKEKDMFNFKRAQEDISRLRRKLETTKKPDNVPKCDEILMEEIKDYKARLTCPCCNMRK
870 880 890 900 910 920
960 970 980 990 1000
pF1KSD KDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
:::::::::::::::::. ::..::::::::::::::.:::::::
NP_062 KDAVLTKCFHVFCFECVKTRYDTRQRKCPKCNAAFGANDFHRIYIG
930 940 950 960 970
>>XP_011517164 (OMIM: 607699) PREDICTED: E3 ubiquitin-pr (975 aa)
initn: 3082 init1: 1767 opt: 1804 Z-score: 843.4 bits: 167.5 E(85289): 3.1e-40
Smith-Waterman score: 3581; 58.8% identity (81.3% similar) in 1005 aa overlap (1-1000:1-974)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSGPGNKRAAGDGGSG-PPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQFKNKKL
::: :::::::. :.. ::::: . :.. :: .: :.:::.:::::.:...:: ::.::
XP_011 MSGIGNKRAAGEPGTSMPPEKKAAVEDSGTT--VETIKLGGVSSTEELDIRTLQTKNRKL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD AERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATDDATLLIVNRYWAQLDETVEALLRCHE-SQGEL
:: :.:::: ::::::.:::::.:::::::.::::::::.:.::... .:. .. ::
XP_011 AEMLDQRQAIEDELREHIEKLERRQATDDASLLIVNRYWSQFDENIRIILKRYDLEQGLG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVALGASSSEEVE
. : . .: ::: .. .. . : .:::..:...:..:::::.:
XP_011 DLLTERKALV-------VPEPEPDSDSNQERKDDRERGEGQEPAFSFLATLASSSSEEME
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD LELQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAHTRELGRENR
.:: :.: :. :::..: . :.::..:: : ... : ::. . ::.: . :..::
XP_011 SQLQERVESSRRAVSQIVTVYDKLQEKVELLSRKLNS-GDNLIVEEAVQELNSFLAQENM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RLQDLATQLQEKHHRISLEYSELQDKVTSAETKVLEMETTVEDLQWDIEKLRKREQKLNK
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XP_011 RLQELTDLLQEKHRTMSQEFSKLQSKVETAESRVSVLESMIDDLQWDIDKIRKREQRLNR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD HLAEALEQLNS-GYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQELANSRMAELEKLQ
::::.::..:: :: : :..:.. :: ::.. .::: .:::::::.:::..:. :::::.
XP_011 HLAEVLERVNSKGYKVYGAGSSLYGGTITINARKFEEMNAELEENKELAQNRLCELEKLR
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD AELQGAVRTNERLKVALRSLPEEVVRETGEYRMLQAQFSLLYNESLQVKTQLDEARGLLL
... .. ::.::: ::: :.::.:: ::: .:.:::.:::::::.:..::::: ::
XP_011 QDFEEVTTQNEKLKVELRSAVEQVVKETPEYRCMQSQFSVLYNESLQLKAHLDEARTLLH
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pF1KSD ATKNSHLRHIEHMESDELGLQKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQNLAANEQAG
.:...: ...: .: ::..:.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_011 GTRGTHQHQVELIERDEVSLHKKLRTEVIQLEDTLAQVRKEYEMLRIEFEQTLAANEQAG
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pF1KSD PINREMRHLISSLQNHNHQLKGDAQRYKRKLREVQAEIGKLRAQASGSA--HSTPNLGHP
::::::::::::::::::::::.. ::::::::.:....: : . :::: .: . :
XP_011 PINREMRHLISSLQNHNHQLKGEVLRYKRKLREAQSDLNKTRLR-SGSALLQSQSSTEDP
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pF1KSD EDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELVPSEEDFQGITPG
.: :: : ::. .... .... .: . . . :..: .
XP_011 KDE----PAELK----------PDS-EDLS--SQSSASKASQEDANEIKSKRDEEE-RER
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pF1KSD AQGPSSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEETKRKESELLKGL
. . : :: : : :.. :::: .: : :.::.: .. ..::.:..: :
XP_011 ERREKERERERE-REKEKEREREKQKLKESEKERD-SAKDKEKGKHDDGRKKEAEIIKQL
580 590 600 610 620
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pF1KSD RAELKKAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDELRSRIRELEERDR
. :::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:.:::...::.:...::....
XP_011 KIELKKAQESQKEMKLLLDMYRSAPKEQRDKVQLMAAEKKSKAELEDLRQRLKDLEDKEK
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD RESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNGRL
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XP_011 KENKKMADEDALRKIRAVEEQIEYLQKKLAMAKQEEEALLSEMDVTGQAFEDMQEQNIRL
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pF1KSD LQQLREKDDANFKLMSERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLKSQVDAQLLTVQKLEEKE
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XP_011 MQQLREKDDANFKLMSERIKSNQIHKLLKEEKEELADQVLTLKTQVDAQLQVVRKLEEKE
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pF1KSD RALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLEHVQTRLREIQPCLAESR
. ::...: :::: ::.::::.:::::.::::::.:::.::: .: .:...: ..:.
XP_011 HLLQSNIGTGEKELGLRTQALEMNKRKAMEAAQLADDLKAQLELAQKKLHDFQDEIVENS
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pF1KSD AAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEEIKEYKARLTCPCCNTRK
...::. ::.::::::::::::::: .: . ::::.::::.::::::::::: ::
XP_011 VTKEKDMFNFKRAQEDISRLRRKLETTKKPDNVPKCDEILMEEIKDYKARLTCPCCNMRK
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pF1KSD KDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRIYIS
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XP_011 KDAVLTKCFHVFCFECVKTRYDTRQRKCPKCNAAFGANDFHRIYIG
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:..::. ... .. . .. . :.: .:. .:.. ... :..::
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pF1KSD RCHESQGELSSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVAL
. : .:.. . :.. . : :: ..:: . ...:. . : . :
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.. ::.:: :.: .: ....: :. ... :. : :.: : .: . .
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::.:.. . ... : . :..:... :. :.. . ::.::.:. ..:
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:. . :. : . : : ...:.:. .: . :. . .. .... ..:. .:
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.:. :. :.:. . : :.. . .. .:. :. : ::... : :. .
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: ... . : : .. : . : : : .:: : . : : . :.
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:..: .. ::: :. ... ... . . . :. . ...::. . ....:. ...
XP_016 --QDMAEEKGTQAGEIH-DLKDMLDVKERKVNVLQKKIENLQEQLRDKEKQMSSLKERVK
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530 540 550 560 570 580
pF1KSD GSAHSTPNLGHPEDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELV
. .: : :..... ::. : . ::. :.::.
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..:.. . .. .. : :: .:.:. . ::. .:.:.. .: :.
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650 660 670 680 690 700
pF1KSD TKRKESELLKGLRAELKKAQESQKEMKLLLDMYKSAPKEQRDKVQLMAAERKAKAEVDEL
..:. : :: ....::::.:. : . .: . .:. .. ::.::::.:
XP_016 LEQKKEECLK-MESQLKKAHEAALEARASPEMSDRIQHLEREITRYKDESSKAQAEVDRL
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710 720 730 740 750 760
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..:.:.. ..::::. ..: :.... .... .:..: . :.. .: :
XP_016 LEILKEVENEKNDKDKKIAELESLTSRQVKDQNKKVANLKHKEQVEKKKSAQMLEEARRR
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770 780 790 800 810
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. ..: ..: : ..::.::: .: : .: :.. : .::. . . .
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.::. :....:.... ......:..... .: . .:.. .: . .: : :...
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880 890 900 910 920 930
pF1KSD LEHVQTRLREIQPCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQ
: . . . : . .: . . : :..::... :.: ::.: :.
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940 950 960 970 980 990
pF1KSD EEIKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFH
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.. ::.:: :.: .: ....: :. ... :. : :.: : .: . .
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::.:.. . ... : . :..:... :. :.. . ::.::.:. ..:
XP_016 TRRLAEAEMHVHHLESLLEQKEKENSMLREEMHRRFENAPDSAKTKALQTVIEMKD----
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pF1KSD IEKLRKREQKLNKHLAEALEQLNSGYYVSGSSSGFQGGQITLSMQKFEMLNAELEENQEL
:. . :. : . : : ...:.:. .: . :. . .. .... ..:. .:
XP_016 -SKISSMERGL-RDLEEEIQMLKSNGALSTEEREEEMKQMEVYRSHSKFMKNKVEQLKEE
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.:. :. :.:. . : :.. . .. .:. :. : ::... : :. .
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530 540 550 560 570 580
pF1KSD GSAHSTPNLGHPEDSGVSAPAPGKEEGGPGPVSTPDNRKEMAPVPGTTTTTTSVKKEELV
. .: : :..... ::. : . ::. :.::.
XP_016 SLQADTTNT----DTALTT----LEEALAEKERTIERLKEQ------RDRDEREKQEEID
610 620 630 640
590 600 610 620 630 640
pF1KSD PSEEDFQGITPGAQGPSSRGREPEARPKRELREREGPSLGPPPVASALSRADREKAKVEE
..:.. . .. .. : :: .:.:. . ::. .:.:.. .: :.
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650 660 670 680 690 700
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XP_016 LEQKKEECLK-MESQLKKAHEAALEARASPEMSDRIQHLEREITRYKDESSKAQAEVDRL
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pF1KSD RSRIRELEERDRRESKKIADEDALRRIRQAEEQIEHLQRKLGATKQEEEALLSEMDVTGQ
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XP_016 LEILKEVENEKNDKDKKIAELE--RQVKDQNKKVANLKHKEQVEKKKSAQMLEEARRRED
770 780 790 800 810
770 780 790 800 810
pF1KSD AFEDMQEQNGRLLQQLREKDDANFKLM-----SERIKANQIHKLLREEKDELGEQVLGLK
..: ..: : ..::.::: .: : .: :.. : .::. . . .
XP_016 NLNDSSQQ---LQDSLRKKDDRIEELEEALRESVQITAEREMVLAQEESARTNAE-----
820 830 840 850 860 870
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pF1KSD SQVDAQLLTVQKLEEKERALQGSLGGVEKELTLRSQALELNKRKAVEAAQLAEDLKVQLE
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880 890 900 910 920 930
pF1KSD HVQTRLREIQPCLAESRAAREKESFNLKRAQEDISRLRRKLEKQRKVEVYADADEILQEE
. . . : . .: . . : :..::... :.: ::.: :.
XP_016 ALLAAISEKDANIALLELSSSK-----KKTQEEVAALKR--EKDRLVQQLKQQTQNRMKL
930 940 950 960 970 980
940 950 960 970 980 990
pF1KSD IKEYKARLTCPCCNTRKKDAVLTKCFHVFCFECVRGRYEARQRKCPKCNAAFGAHDFHRI
XP_016 MADNYEDDHFKSSHSNQTNHKPSPDQIIQPLLELDQNRSKLKLYIGHLTTLCHDRDPLIL
990 1000 1010 1020 1030 1040
>>NP_001288177 (OMIM: 607127) ELKS/Rab6-interacting/CAST (1086 aa)
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pF1KSD MSGPGNKRAAGDGGSGPPEKKLSREEKTTTTLIEPIRLGGISSTEEMDLKVLQ
:. . .: . .: . ... : ..
NP_001 ASSGVASDTIAFGEHHLPPVSMASTVPHSLRQARDNTIMDLQTQLKEVLRENDLLRKDVE
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD FKNKKLAERLEQRQACEDELRERIEKLEKRQATD----DATLLIVNRYWAQLDETVEALL
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NP_001 VKESKLSSSMNSIKTFWSPELKKERALRKDEASKITIWKEQYRVVQEENQHMQMTIQALQ
180 190 200 210 220 230
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RCHESQGELSSAPEAPGTQEGPTCDGTPLPEPGTSELRDPLLMQLRPPLSEPALAFVVAL
. : .:.. . :.. . : :: ..:: . ...:. . : . :
NP_001 DELRIQRDLNQLFQ----QDSSSRTG----EPCVAELTEENFQRLHAEHERQAKELF--L
240 250 260 270 280
170 180 190 200 210 220
pF1KSD GASSSEEVELELQGRMEFSKAAVSRVVEASDRLQRRVEELCQRVYSRGDSEPLSEAAQAH
.. ::.:: :.: .: ....: :. ... :. : :.: : .: . .
NP_001 LRKTLEEMEL----RIETQK----QTLNARDESIKKLLEMLQ---SKGLSAKATEEDHER
290 300 310 320 330
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