Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0662
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0662, 1101 aa
1>>>pF1KSDA0662 1101 - 1101 aa - 1101 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.9063+/-0.000407; mu= -13.6753+/- 0.026
mean_var=341.2544+/-69.432, 0's: 0 Z-trim(122.2): 26 B-trim: 21 in 1/59
Lambda= 0.069428
statistics sampled from 39856 (39882) to 39856 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.468), width: 16
Scan time: 16.160
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005383 (OMIM: 604351) lysine-specific demethyla (1096) 7056 721.2 8.1e-207
XP_005252108 (OMIM: 604351) PREDICTED: lysine-spec (1097) 7044 720.0 1.9e-206
XP_006717206 (OMIM: 604351) PREDICTED: lysine-spec (1062) 5198 535.1 8.3e-151
NP_001171826 (OMIM: 300263,300560) histone lysine ( 948) 1866 201.3 2.2e-50
XP_005262057 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist ( 984) 1866 201.3 2.3e-50
NP_001171827 (OMIM: 300263,300560) histone lysine ( 878) 1855 200.2 4.4e-50
NP_055922 (OMIM: 300263,300560) histone lysine dem (1024) 1855 200.2 5e-50
XP_016884851 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1024) 1855 200.2 5e-50
XP_005262056 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 1855 200.3 5.2e-50
XP_005262054 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 1855 200.3 5.2e-50
XP_016884850 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1049) 1855 200.3 5.2e-50
NP_001171825 (OMIM: 300263,300560) histone lysine (1060) 1855 200.3 5.2e-50
XP_011529080 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1085) 1855 200.3 5.3e-50
XP_005262053 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: hist (1085) 1855 200.3 5.3e-50
NP_001005366 (OMIM: 609078) lysine-specific demeth (1265) 572 71.8 3e-11
XP_005254013 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1299) 572 71.8 3e-11
XP_005254012 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1305) 572 71.8 3e-11
NP_115979 (OMIM: 609078) lysine-specific demethyla (1336) 572 71.8 3.1e-11
XP_011537171 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1337) 572 71.8 3.1e-11
XP_011537170 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1339) 572 71.8 3.1e-11
XP_011537169 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1353) 572 71.8 3.1e-11
XP_006718543 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1067) 522 66.7 8.2e-10
XP_011543162 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1134) 522 66.7 8.6e-10
XP_016872881 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1145) 522 66.7 8.7e-10
XP_016872880 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1145) 522 66.7 8.7e-10
NP_036440 (OMIM: 605657) lysine-specific demethyla (1162) 522 66.7 8.8e-10
>>NP_005383 (OMIM: 604351) lysine-specific demethylase P (1096 aa)
initn: 6696 init1: 6456 opt: 7056 Z-score: 3834.0 bits: 721.2 E(85289): 8.1e-207
Smith-Waterman score: 7056; 97.4% identity (97.6% similar) in 1101 aa overlap (1-1101:1-1096)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATVPVYCVCRLPYDVTRPRAARPPARPGPTRAAQRRGRATAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
:::::::::::::::::: . . . :::::::::::::::::::
NP_005 MATVPVYCVCRLPYDVTRFMIECDACKDWFHGSCVGVEEEEAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLKKKRTWHKHGPGQAPDVKPVQNGSQLFIKELRSRTFPRAEDVVARVPGSQLTLGYMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
NP_005 TLKKKRTWHKHGPGQAPDVKPVQNGSQLFIKELRSRTFPSAEDVVARVPGSQLTLGYMEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKATKSVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKATKSVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGNKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGNKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKIDEFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKIDEFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD PKLDSAAYKSDDSSDEGSLHIDTDTKPGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PKLDSAAYKSDDSSDEGSLHIDTDTKPGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEYN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQASDSCLQTTWGAGQAKGSSLAAHGARKNGGGSGKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQASDSCLQTTWGAGQAKGSSLAAHGARKNGGGSGKS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AGKRLLKRAAKNSVDLDDYEEEQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPIFKSRSKKRKGSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AGKRLLKRAAKNSVDLDDYEEEQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPIFKSRSKKRKGSD
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DAPYSPTARVGPSVPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKSKKKKSAKRKLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DAPYSPTARVGPSVPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKSKKKKSAKRKLT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTTPASTTPASTSTASSQASQEGSSPEPPPE
:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_005 PNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTT-----PASTSTASSQASQEGSSPEPPPE
970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SHSSSLADHEYTAAGTFTGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNNTAAKGKRTKKGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SHSSSLADHEYTAAGTFTGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNNTAAKGKRTKKGM
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100
pF1KSD ATAKQRLGKILKIHRNGKLLL
:::::::::::::::::::::
NP_005 ATAKQRLGKILKIHRNGKLLL
1080 1090
>>XP_005252108 (OMIM: 604351) PREDICTED: lysine-specific (1097 aa)
initn: 4751 init1: 4751 opt: 7044 Z-score: 3827.5 bits: 720.0 E(85289): 1.9e-206
Smith-Waterman score: 7044; 97.3% identity (97.5% similar) in 1102 aa overlap (1-1101:1-1097)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATVPVYCVCRLPYDVTRPRAARPPARPGPTRAAQRRGRATAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
:::::::::::::::::: . . . :::::::::::::::::::
XP_005 MATVPVYCVCRLPYDVTRFMIECDACKDWFHGSCVGVEEEEAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLKKKRTWHKHGPGQAPDVKPVQNGSQLFIKELRSRTFPRAEDVVARVPGSQLTLGYMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_005 TLKKKRTWHKHGPGQAPDVKPVQNGSQLFIKELRSRTFPSAEDVVARVPGSQLTLGYMEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 KCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKATKSVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKATKSVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGNKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGNKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKIDEFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKIDEFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD PKLDSAAYK-SDDSSDEGSLHIDTDTKPGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEY
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PKLDSAAYKQSDDSSDEGSLHIDTDTKPGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEY
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD NPSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQASDSCLQTTWGAGQAKGSSLAAHGARKNGGGSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NPSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQASDSCLQTTWGAGQAKGSSLAAHGARKNGGGSGK
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD SAGKRLLKRAAKNSVDLDDYEEEQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPIFKSRSKKRKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SAGKRLLKRAAKNSVDLDDYEEEQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPIFKSRSKKRKGS
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DDAPYSPTARVGPSVPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKSKKKKSAKRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DDAPYSPTARVGPSVPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKSKKKKSAKRKL
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD TPNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTTPASTTPASTSTASSQASQEGSSPEPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
XP_005 TPNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTT-----PASTSTASSQASQEGSSPEPPP
970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD ESHSSSLADHEYTAAGTFTGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNNTAAKGKRTKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ESHSSSLADHEYTAAGTFTGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNNTAAKGKRTKKG
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100
pF1KSD MATAKQRLGKILKIHRNGKLLL
::::::::::::::::::::::
XP_005 MATAKQRLGKILKIHRNGKLLL
1080 1090
>>XP_006717206 (OMIM: 604351) PREDICTED: lysine-specific (1062 aa)
initn: 3532 init1: 2903 opt: 5198 Z-score: 2828.5 bits: 535.1 E(85289): 8.3e-151
Smith-Waterman score: 6730; 94.1% identity (94.4% similar) in 1102 aa overlap (1-1101:1-1062)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATVPVYCVCRLPYDVTRPRAARPPARPGPTRAAQRRGRATAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
:::::::::::::::::: . . . :::::::::::::::::::
XP_006 MATVPVYCVCRLPYDVTRFMIECDACKDWFHGSCVGVEEEEAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLKKKRTWHKHGPGQAPDVKPVQNGSQLFIKELRSRTFPRAEDVVARVPGSQLTLGYMEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
XP_006 TLKKKRTWHKHGPGQAPDVKPVQNGSQLFIKELRSRTFPSAEDVVARVPGSQLTLGYMEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD YYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVD
::::::::::::::::::::::: ::
XP_006 VKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLK-----------------------------------VD
250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHED
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD ELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATP
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASP
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKATKSVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKATKSVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSE
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGNKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGNKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFG
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKIDEFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKIDEFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTK
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770
pF1KSD PKLDSAAYK-SDDSSDEGSLHIDTDTKPGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEY
::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PKLDSAAYKQSDDSSDEGSLHIDTDTKPGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEY
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pF1KSD NPSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQASDSCLQTTWGAGQAKGSSLAAHGARKNGGGSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NPSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQASDSCLQTTWGAGQAKGSSLAAHGARKNGGGSGK
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pF1KSD SAGKRLLKRAAKNSVDLDDYEEEQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPIFKSRSKKRKGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SAGKRLLKRAAKNSVDLDDYEEEQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPIFKSRSKKRKGS
810 820 830 840 850 860
900 910 920 930 940 950
pF1KSD DDAPYSPTARVGPSVPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKSKKKKSAKRKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DDAPYSPTARVGPSVPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKSKKKKSAKRKL
870 880 890 900 910 920
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD TPNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTTPASTTPASTSTASSQASQEGSSPEPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
XP_006 TPNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTT-----PASTSTASSQASQEGSSPEPPP
930 940 950 960 970 980
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD ESHSSSLADHEYTAAGTFTGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNNTAAKGKRTKKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ESHSSSLADHEYTAAGTFTGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNNTAAKGKRTKKG
990 1000 1010 1020 1030 1040
1080 1090 1100
pF1KSD MATAKQRLGKILKIHRNGKLLL
::::::::::::::::::::::
XP_006 MATAKQRLGKILKIHRNGKLLL
1050 1060
>>NP_001171826 (OMIM: 300263,300560) histone lysine deme (948 aa)
initn: 2802 init1: 1657 opt: 1866 Z-score: 1025.6 bits: 201.3 E(85289): 2.2e-50
Smith-Waterman score: 2749; 45.2% identity (64.5% similar) in 1121 aa overlap (1-1101:1-923)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATVPVYCVCRLPYDVTRPRAARPPARPGPTRAAQRRGRATAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
::.:::::.::::::::: . . . : :::.::::::: :: :
NP_001 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPS
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD TLKKKRTWHK-HGPGQAPDVKPVQNGSQLFIKELRSRTFPRAEDVVARVPGSQLTLGYME
.::.: : : .. :::..:: :..::::::: ...:. . :.:::. ..:
NP_001 IMKKRRGSSKGHDTHKG---KPVKTGSPTFVRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLE
70 80 90 100 110
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pF1KSD EHGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVD
:..:. :::: ::::::...:.:.: : :::.::: .. .:: :::.: :::::: .::
NP_001 ENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD YYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLI
:::: .:..:::: .:::::::.:..:: : ::.::::::: ::.. .. .:.: ::::.
NP_001 YYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLM
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD CVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQV
:.::::::::: ::.:.::::::::: ::::::..::..:.: : :.::..::::.:::
NP_001 SVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD DKCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGS
:::::: ::::::::::.:::.:.:::::::::.:.:::::..:::..:::.:.::. ..
NP_001 DKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTAD
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD LTQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHE
: .:::::: :::.:::.:. :.: ... .. .::.:.: :: :::.::.:.:: .::
NP_001 LFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD DELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSE-NASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEA
::.:: . :::::::.:::: : : . : : .: . . : ...
NP_001 DEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEFNITGA--------------CLNDSDDDSPDLDLDG
420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KSD TPPQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESA
. . : .: ...:. :. :
NP_001 N------------------------------------ESPLALLMSNGSTKRVK------
470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KSD SPTIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKATKSVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSK
.:.: .. : .:.: : :: . ::.
NP_001 ----------------SLSK---SRRTKIAKKV-------------DKARL-MAEQV---
490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SEAKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLAGNKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGV
::.: :.. :...... : .. .:: :
NP_001 -----------------MEDEFDLDS-------DDELQIDERLGKEKATLIIRPKF-PR-
510 520 530
660 670 680 690 700 710
pF1KSD FGALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKIDEFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPV
: . :: : . : . ::. :: :..
NP_001 -------KLPRAKPCSDP-NRVREPGEV---EFDIEED----------------------
540 550 560
720 730 740 750 760 770
pF1KSD TKPKLDSAAYKSDDSSDEGSLHIDTDTKPGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALE
: .:.. :: .. : : .::.:.::::::.::..::. .
NP_001 ---------YTTDEDMVEG-----VEGKLG--------NGSGAGGILDLLKASRQVGGPD
570 580 590 600
780 790 800 810 820 830
pF1KSD YNPSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQASDSC-----LQTTWGAGQAK--GSSLAAHGAR
: .. :::::::::::::: :::::.:.: ::. : .:: . ::: .. :.
NP_001 YAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSSSSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTV
610 620 630 640 650 660
840 850 860 870 880
pF1KSD KNGGGSGKSAGKRLLKRAAKNSVDLDDYEE-----EQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDN
.:. .: .. ::: .:: : .. .. :: ::: : :::::..:.:::::::.:.
NP_001 SNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDD
670 680 690 700 710 720
890 900 910 920 930 940
pF1KSD PIFKSRSKKRKGSDDAPYSPTARVGPSVPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEE
: .::: ::.:.:::::.:: ::: :..:.:::::::::::::::::::::::::.:::
NP_001 PALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPKQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLAQQEL
730 740 750 760 770 780
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD QKSKKKKSAKRK-LTPNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTTPASTTPASTSTAS
::..::: :.: : .. .: : ... . :.:: :. :. . ..
NP_001 QKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPR---------------PQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVT
790 800 810 820
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD SQASQEGSSPEPPPESH----SSSLADHEYTA-AGTFTGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRP
: ::: :::: . :.::::::::: ..: :::.:.. :::::::::::::
NP_001 S------SSPLPPPEPKQEALSGSLADHEYTARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRP
830 840 850 860 870 880
1070 1080 1090 1100
pF1KSD SASSPNNNTAAKGKRTKKGMATAKQRLGKILKIHRNGKLLL
:..: ..: :..::: :::.::::::::.::::::::::::
NP_001 SVGS-QSNQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLK
890 900 910 920 930 940
NP_001 RRDAHP
>>XP_005262057 (OMIM: 300263,300560) PREDICTED: histone (984 aa)
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Smith-Waterman score: 2749; 45.2% identity (64.5% similar) in 1121 aa overlap (1-1101:37-959)
10 20 30
pF1KSD MATVPVYCVCRLPYDVTRPRAARPPARPGP
::.:::::.::::::::: .
XP_005 IVQRGRVLPPPAPLDTTNLAGRRTLQGRAKMASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWF
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KSD TRAAQRRGRATAPDIDIYHCPNCEKTHGKSTLKKKRTWHK-HGPGQAPDVKPVQNGSQLF
. . : :::.::::::: :: : .::.: : : .. :::..:: :
XP_005 HGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPSIMKKRRGSSKGHDTHKG---KPVKTGSPTF
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KSD IKELRSRTFPRAEDVVARVPGSQLTLGYMEEHGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDV
..::::::: ...:. . :.:::. ..::..:. :::: ::::::...:.:.: : ::
XP_005 VRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDV
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KSD ENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVDYYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPP
:.::: .. .:: :::.: :::::: .:: :::: .:..:::: .:::::::.:..:: :
XP_005 EHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETP
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KSD DIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLICVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFY
::.::::::: ::.. .. .:.: ::::. :.::::::::: ::.:.::::::::: ::
XP_005 KIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFY
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQVDKCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDC
::::..::..:.: : :.::..::::.::::::::: ::::::::::.:::.:.::::::
XP_005 LIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGDQVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDC
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGSLTQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGK
:::.:.:::::..:::..:::.:.::. ..: .:::::: :::.:::.:. :.: ... .
XP_005 LAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTADLFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRR
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD QLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHEDELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSE-NASKA
. .::.:.: :: :::.::.:.:: .::::.:: . :::::::.:::: : : . :
XP_005 HPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHEDEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEFNITGA
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD VRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEATPPQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKP
: .: . . : ....
XP_005 --------------CLNDSDDDSPDLDLDGN-----------------------------
490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KSD PKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESASPTIPNLDLLEAHTKEALTKMEPPKKGKAT
. : .: ...:. :. : .:.: .. : .
XP_005 -------ESPLALLMSNGSTKRVK----------------------SLSK---SRRTKIA
510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KSD KSVLSVPNKDVVHMQNDVERLEIREQTKSKSEAKWKYKNSKPDSLLKMEEEQKLEKSPLA
:.: : :: . ::. ::.: :..
XP_005 KKV-------------DKARL-MAEQV--------------------MEDEFDLDS----
530 540 550
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pF1KSD GNKDNKFSFSFSNKKLLGSKALRPPTSPGVFGALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKI
:...... : .. .:: : : . :: : . : . ::.
XP_005 ---DDELQIDERLGKEKATLIIRPKF-PR--------KLPRAKPCSDP-NRVREPGEV--
560 570 580 590
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pF1KSD DEFPIRRKKNAPKRDLSFLLDKKAVLPTPVTKPKLDSAAYKSDDSSDEGSLHIDTDTKPG
:: :.. : .:.. :: .. : :
XP_005 -EFDIEED-------------------------------YTTDEDMVEG-----VEGKLG
600 610
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pF1KSD RNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGALEYNPSSQPPASPSTQEAIQGMLSMANLQASD
.::.:.::::::.::..::. .: .. :::::::::::::: :::::.:.
XP_005 --------NGSGAGGILDLLKASRQVGGPDYAALTEAPASPSTQEAIQGMLCMANLQSSS
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD SC-----LQTTWGAGQAK--GSSLAAHGARKNGGGSGKSAGKRLLKRAAKNSVDLDDYEE
: ::. : .:: . ::: .. :. .:. .: .. ::: .:: : .. .. ::
XP_005 SSPATSSLQAWWTGGQDRSSGSSSSGLGTVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEE
680 690 700 710 720 730
870 880 890 900 910
pF1KSD -----EQDHLDACFKDSDYVYPSLESDEDNPIFKSRSKKRKGSDDAPYSPTARVGPSVPR
::: : :::::..:.:::::::.:.: .::: ::.:.:::::.:: ::: :..:.
XP_005 NASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDDDDPALKSRPKKKKNSDDAPWSPKARVTPTLPK
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD QDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQEEQKSKKKKSAKRK-LTPNTTSPSTSTSISAG
:::::::::::::::::::::::::.::: ::..::: :.: : .. .:
XP_005 QDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLAQQELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPR--------
800 810 820 830 840
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KSD TTSTSTTPASTTPASTTPASTTPASTSTASSQASQEGSSPEPPPESH----SSSLADHEY
: ... . :.:: :. :. . ..: ::: :::: . :.:::::::
XP_005 -------PQDSNLSLTVPAPTVAATPQLVTS------SSPLPPPEPKQEALSGSLADHEY
850 860 870 880
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pF1KSD TA-AGTFTGAQAGRTSQPMAPGVFLTQRRPSASSPNNNTAAKGKRTKKGMATAKQRLGKI
:: ..: :::.:.. ::::::::::::::..: ..: :..::: :::.::::::::.:
XP_005 TARPNAFGMAQANRSTTPMAPGVFLTQRRPSVGS-QSNQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRI
890 900 910 920 930 940
1100
pF1KSD LKIHRNGKLLL
:::::::::::
XP_005 LKIHRNGKLLLRQVIVQAECRQAIHEPKLKRRDAHP
950 960 970 980
>>NP_001171827 (OMIM: 300263,300560) histone lysine deme (878 aa)
initn: 2411 init1: 1659 opt: 1855 Z-score: 1020.1 bits: 200.2 E(85289): 4.4e-50
Smith-Waterman score: 2467; 44.4% identity (67.9% similar) in 959 aa overlap (1-944:1-866)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATVPVYCVCRLPYDVTRPRAARPPARPGPTRAAQRRGRATAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
::.:::::.::::::::: . . . : :::.::::::: :: :
NP_001 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KSD TLKKKRTWHKHGPGQAPDV---KPVQNGSQLFIKELRSRTFPRAEDVVARVPGSQLTLGY
.::.: : ... :. :::..:: :..::::::: ...:. . :.:::. .
NP_001 IMKKRR-----GSSKGHDTHKGKPVKTGSPTFVRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD MEEHGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEF
.::..:. :::: ::::::...:.:.: : :::.::: .. .:: :::.: :::::: .:
NP_001 LEENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD VDYYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYC
: :::: .:..:::: .:::::::.:..:: : ::.::::::: ::.. .. .:.: :::
NP_001 VKYYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD LICVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFAD
:. :.::::::::: ::.:.::::::::: ::::::..::..:.: : :.::..::::.:
NP_001 LMSVRDSYTDFHIDFGGTSVWYHVLKGEKIFYLIRPTNANLTLFECWSSSSNQNEMFFGD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QVDKCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKL
:::::::: ::::::::::.:::.:.:::::::::.:.:::::..:::..:::.:.::.
NP_001 QVDKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLST
300 310 320 330 340 350
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pF1KSD GSLTQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAE
..: .:::::: :::.:::.:. :.: ... .. .::.:.: :: :::.::.:.:: .
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360 370 380 390 400 410
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::::.:: . :::::::.:::: :. . ..:...... .: : . :
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: : ... . . .. ::: . : :: : : : ...:::.:
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. . .:.......:: : :. :. ... . . ..: :..
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: .: .:: . : :: :. .. .:.. . .. .:.. ....
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::.. ::: ::.::: : : .::.:
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. .::. .. :: . .. .::. .:. .. ... ... . .
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. .:. :::::::::::::: :::::.:.: ::. : .:: . ::: .. :.
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.:. .: .. ::: .:: : .. .. :: ::: : :::::..:.:::::::.:
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pF1KSD DELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEAT
::.:: . :::::::.:::: :. . ..:...... .: : . : :
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::.. ::: ::.::: ..: . :: .. : :.
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pF1KSD PVTKPKLDSAAYKSDDSSDEGSLHIDTDTKPGRNARVKKESGSSAAGILDLLQASEEVGA
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. .:. .: .. ::: .:: : .. .. :: ::: : :::::..:.:::::::.
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pF1KSD EEQKSKKKKSAKRK-LTPNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTTPASTTPASTST
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATVPVYCVCRLPYDVTRPRAARPPARPGPTRAAQRRGRATAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
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pF1KSD YYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLI
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XP_016 YYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLM
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pF1KSD DKCYKCIVKQGQTLFIPSGWIYATLTPVDCLAFAGHFLHSLSVEMQMRAYEVERRLKLGS
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XP_016 DKCYKCSVKQGQTLFIPTGWIHAVLTPVDCLAFGGNFLHSLNIEMQLKAYEIEKRLSTAD
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pF1KSD LTQFPNFETACWYMGKHLLEAFKGSHKSGKQLPPHLVQGAKILNGAFRSWTKKQALAEHE
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XP_016 LFRFPNFETICWYVGKHILDIFRGLRENRRHPASYLVHGGKALNLAFRAWTRKEALPDHE
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pF1KSD DELPEHFKPSQLIKDLAKEIRLSENASKAVRPEVNTVASSDEVCDGDREKEEPPSPIEAT
::.:: . :::::::.:::: :. . ..:...... .: : . : :
XP_016 DEIPETVRTVQLIKDLAREIRLVEDIFQ------QNVGKTSNIFGLQR--IFPAGSIPLT
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pF1KSD PPQSLLEKVSKKKTPKTVKMPKPSKIPKPPKPPKPPRPPKTLKLKDGGKKKGKKSRESAS
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XP_016 RP-------AHSTSVSMSRLSLPSKNGSKKKGLKP----KELFKK--AERKGKESSALGP
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XP_016 ------GNESPLALLMSNGSTKRVKS-LSKSRRTKIAKKVDKARLMAEQVME--------
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pF1KSD GALQNFKEDKPKPVRDEYEYVSDDGELKIDEFPIRRKKNA---PKRDLSFLLDKKAVLPT
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XP_016 ---------------DEFDLDSDD-ELQIDERLGKEKATLIIRPKFPRKLPRAKPCSDPN
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XP_016 TVSNSPASQRTPGKRPIKRPAYWRTESEEEEENASLDEQDSLGACFKDAEYIYPSLESDD
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pF1KSD DNPIFKSRSKKRKGSDDAPYSPTARVGPSVPRQDRPVREGTRVASIETGLAAAAAKLSQQ
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pF1KSD EEQKSKKKKSAKRK-LTPNTTSPSTSTSISAGTTSTSTTPASTTPASTTPASTTPASTST
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XP_016 ELQKAQKKKYIKKKPLLKEVEQPR---------------PQDSNLSLTVPAPTVAATPQL
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XP_016 RPSVGS-QSNQAGQGKRPKKGLATAKQRLGRILKIHRNGKLLL
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Smith-Waterman score: 2969; 46.4% identity (68.7% similar) in 1123 aa overlap (1-1101:1-1024)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MATVPVYCVCRLPYDVTRPRAARPPARPGPTRAAQRRGRATAPDIDIYHCPNCEKTHGKS
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XP_005 MASVPVYCLCRLPYDVTRFMIECDMCQDWFHGSCVGVEEEKAADIDLYHCPNCEVLHGPS
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pF1KSD TLKKKRTWHK-HGPGQAPDVKPVQNGSQLFIKELRSRTFPRAEDVVARVPGSQLTLGYME
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XP_005 IMKKRRGSSKGHDTHKG---KPVKTGSPTFVRELRSRTFDSSDEVILKPTGNQLTVEFLE
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pF1KSD EHGFTEPILVPKKDGLGLAVPAPTFYVSDVENYVGPERSVDVTDVTKQKDCKMKLKEFVD
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XP_005 ENSFSVPILVLKKDGLGMTLPSPSFTVRDVEHYVGSDKEIDVIDVTRQADCKMKLGDFVK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD YYYSTNRKRVLNVTNLEFSDTRMSSFVEPPDIVKKLSWVENYWPDDALLAKPKVTKYCLI
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XP_005 YYYSGKREKVLNVISLEFSDTRLSNLVETPKIVRKLSWVENLWPEECVFERPNVQKYCLM
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD CVKDSYTDFHIDSGGASAWYHVLKGEKTFYLIRPASANISLYERWRSASNHSEMFFADQV
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..: ::: :::: . :.::::::::: ..: :::.:.. :::::::::::
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:::..: ..: :..::: :::.::::::::.::::::::::::
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:35:05 2016 done: Thu Nov 3 02:35:07 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]