Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0677
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0677, 1064 aa
1>>>pF1KSDA0677 1064 - 1064 aa - 1064 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8669+/-0.000986; mu= 14.8196+/- 0.060
mean_var=109.9849+/-21.023, 0's: 0 Z-trim(107.8): 45 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.122295
statistics sampled from 9735 (9774) to 9735 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064) 7251 1290.9 0
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 813) 2041 371.7 3.7e-102
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 835) 2041 371.7 3.8e-102
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056) 2041 371.7 4.6e-102
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096) 2010 366.3 2.1e-100
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11 ( 523) 1713 313.7 6.7e-85
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 ( 506) 1646 301.9 2.4e-81
CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 151) 771 147.2 2.6e-35
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12 (1690) 489 98.0 1.8e-19
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1570) 466 93.9 2.9e-18
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1482) 453 91.6 1.3e-17
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1539) 453 91.6 1.4e-17
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1379) 452 91.4 1.4e-17
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1559) 452 91.5 1.6e-17
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1560) 452 91.5 1.6e-17
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1544) 445 90.2 3.7e-17
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1580) 445 90.2 3.8e-17
CCDS14080.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1058) 438 88.9 6.4e-17
CCDS77686.1 BRD1 gene_id:23774|Hs108|chr22 (1189) 438 88.9 7e-17
CCDS82729.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1119) 434 88.2 1.1e-16
CCDS82730.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1213) 434 88.2 1.2e-16
CCDS2575.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1214) 434 88.2 1.2e-16
CCDS33692.1 BRPF1 gene_id:7862|Hs108|chr3 (1220) 434 88.2 1.2e-16
CCDS34437.1 BRPF3 gene_id:27154|Hs108|chr6 (1205) 384 79.4 5.2e-14
CCDS4176.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 790) 372 77.2 1.6e-13
CCDS75305.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 791) 372 77.2 1.6e-13
CCDS78061.1 JADE2 gene_id:23338|Hs108|chr5 ( 834) 372 77.2 1.7e-13
CCDS14271.1 JADE3 gene_id:9767|Hs108|chrX ( 823) 360 75.1 7.2e-13
CCDS11327.1 MLLT6 gene_id:4302|Hs108|chr17 (1093) 360 75.1 9.1e-13
CCDS7135.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1027) 359 75.0 9.7e-13
CCDS55708.1 MLLT10 gene_id:8028|Hs108|chr10 (1068) 359 75.0 1e-12
CCDS47134.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 509) 351 73.4 1.4e-12
CCDS75191.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 830) 351 73.5 2.2e-12
CCDS34062.1 JADE1 gene_id:79960|Hs108|chr4 ( 842) 351 73.5 2.2e-12
>>CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064 aa)
initn: 7251 init1: 7251 opt: 7251 Z-score: 6913.6 bits: 1290.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7251; 99.9% identity (99.9% similar) in 1064 aa overlap (1-1064:1-1064)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASESETLNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MASESETLNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASYD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELERK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 DIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELERK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD YWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 YWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFGM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD WKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 WKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLRH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEYG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPTPEAAEFLKESELP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 KQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPTPEAAEFLKESELP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSELFPKEDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 PRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSELFPKEDL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SSEQYEMTECPAALAPVRPTHSSVRQVEDGLTFPDYSDSTEVKFEELKNVKLEEEDEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SSEQYEMTECPAALAPVRPTHSSVRQVEDGLTFPDYSDSTEVKFEELKNVKLEEEDEEEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QEAAALDLSVNPASVGGRLVFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSISSDSETSEPLSCRAQGQTG
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 QAAAALDLSVNPASVGGRLVFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSISSDSETSEPLSCRAQGQTG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD VLTVHSYAKGDGRVTVGEPCTRKKGSAARSFSERELAEVADEYMFSLEENKKSKGRRQPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 VLTVHSYAKGDGRVTVGEPCTRKKGSAARSFSERELAEVADEYMFSLEENKKSKGRRQPL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD SKLPRHHPLVLQECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKPLSQLWQNRPPNFEAEKEFNET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 SKLPRHHPLVLQECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKPLSQLWQNRPPNFEAEKEFNET
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD MAQQAPHCAVCMIFQTYHQVEFGGFNQNCGNASDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 MAQQAPHCAVCMIFQTYHQVEFGGFNQNCGNASDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NLSTPYLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPPAKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 NLSTPYLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPPAKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD RGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAERSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 RGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAERSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD AGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDDWPFVVFITCFRHKIPNLERAKGALQSIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDDWPFVVFITCFRHKIPNLERAKGALQSIT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD AGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNFDDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 AGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNFDDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFEDGSQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 EVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFEDGSQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KSD ASDMRFNEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYREDYIEPALYRAIME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS49 ASDMRFNEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYREDYIEPALYRAIME
1030 1040 1050 1060
>>CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (813 aa)
initn: 2946 init1: 2040 opt: 2041 Z-score: 1947.5 bits: 371.7 E(32554): 3.7e-102
Smith-Waterman score: 2897; 53.2% identity (74.2% similar) in 849 aa overlap (3-828:4-808)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASESET-LNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRAS
.: :. :::: .:::: :.:::::.:..:.::.::.::::::::::.::::::::
CCDS55 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD YDDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELE
:::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::.:::..::: ::::::: ..:.::
CCDS55 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RKYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYF
::::::::: ::::::.::..:.. ::::::.:: :.::.::.: ::.:::::::::::
CCDS55 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD GMWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFL
:::::.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::.::::.:.:.:.:::
CCDS55 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD RHKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIE
::::::::: .::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.
CCDS55 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD YGKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPTP----EAAEFL
::: : ::.:::::::::::.:::::::.::.::: ::: .:::: ::: :. .:
CCDS55 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSEL
.. . .:. .: . . . :: :. .::. .:.
CCDS55 QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEE--------------------EVSDEVDGAEV
370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD FPKEDLSSEQYEMTECPAALAPVRPTHSSVRQVEDGLTFP---DYSDSTEVKFEELKNVK
:. : ... ...: : . .: :..: .. .. . . :: ... . ...
CCDS55 -PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTS
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KSD LEEEDEEEEQEAAALDLSVNPASVGGRLVFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSISSDSETS---
. :. . :...: : :: : :. .: :.:: . :. :: :
CCDS55 VTEDIKTEDDKAYAYR-SVPSIS---------SEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPK
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KSD EPLSCRAQGQT-GVLT----VHSYAKGDGRVTVGEPCTRKKGSAARSFSERELAEVADEY
: :: . ... :::: ..:.: . :: . .: ::. .::
CCDS55 SPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNG-LEPGEIPAVPSGERN-SFKVPSIAE-----
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KSD MFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPLVL--QECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKPLS
::: ::. :.:::. : . :..: :. ::.: : :. :::.::::.:::::
CCDS55 ----GENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLI
570 580 590 600 610
650 660 670 680 690
pF1KSD QLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIFQTYHQVEFGGFNQNC---GNASDLAPQ
.:::.. ::: ::.:.: :.:.. ::::.: ... ::. . .. ... . .... .
CCDS55 HLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVVTS
620 630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KSD KQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTP--YLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPPAK
. .:::::::::: . .:. : : .:::::::.:.:: :: :::::::::.: .
CCDS55 EGKTKPLIPEMCFIYS--EENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHE
680 690 700 710 720 730
760 770 780 790 800 810
pF1KSD ASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAERSPV
. :.:.::. :: .::::.::::::.......:.:: ::::. :.::.:. ::. .
CCDS55 ICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQI
740 750 760 770 780 790
820 830 840 850 860 870
pF1KSD DVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDDWPFV
::..::: :.::
CCDS55 DVGRIPLQRLKLGRLGI
800 810
>>CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (835 aa)
initn: 2946 init1: 2040 opt: 2041 Z-score: 1947.4 bits: 371.7 E(32554): 3.8e-102
Smith-Waterman score: 2897; 53.2% identity (74.2% similar) in 849 aa overlap (3-828:26-830)
10 20 30
pF1KSD MASESET-LNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIES
.: :. :::: .:::: :.:::::.:..:.::.::
CCDS55 MKHYGLPWKRTEEAAADTALTIMEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMES
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD QGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASYDDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVRE
.::::::::::.:::::::: :::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::.:
CCDS55 KGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQCYDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD FRKIANSDKYCTPRYSEFEELERKYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTI
::..::: ::::::: ..:.::::::::::: ::::::.::..:.. ::::::.:: :.
CCDS55 FRQLANSGKYCTPRYLDYEDLERKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTV
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LDLVEKESGITIEGVNTPYLYFGMWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHG
::.::.: ::.::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::..:::::
CCDS55 LDVVEEECGISIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHG
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD KRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLRHKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYH
:::::::.::::.:.:.:.:::::::::::: .::::::::::.::::::::::::::::
CCDS55 KRLERLAQGFFPSSSQGCDAFLRHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD AGFNHGFNCAESTNFATRRWIEYGKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGK
::::::::::::::::: :::.::: : ::.:::::::::::.:::::::.::.::: ::
CCDS55 AGFNHGFNCAESTNFATVRWIDYGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD DNTVIDHTLPTP----EAAEFLKESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKH
: .:::: ::: :. .:.. . .:. .: . . . ::
CCDS55 DIYTIDHTKPTPASTPEVKAWLQRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEE---------
370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD RIGTKRHRVCLEIPQEVSQSELFPKEDLSSEQYEMTECPAALAPVRPTHSSVRQVEDGLT
:. .::. .:. :. : ... ...: : . .: :..: .. ..
CCDS55 -----------EVSDEVDGAEV-PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASR
420 430 440 450
460 470 480 490 500
pF1KSD FP---DYSDSTEVKFEELKNVKLEEEDEEEEQEAAALDLSVNPASVGGRLVFSGSKKKSS
. . :: ... . .... :. . :...: : :: : :. .:
CCDS55 MQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTSVTEDIKTEDDKAYAYR-SVPSIS---------SEADDS
460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KSD SSLGSGSSRDSISSDSETS---EPLSCRAQGQT-GVLT----VHSYAKGDGRVTVGEPCT
:.:: . :. :: : : :: . ... :::: ..:.: . :: .
CCDS55 IPLSSGYEKPEKSDPSELSWPKSPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNG-LEPGEIPA
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610
pF1KSD RKKGSAARSFSERELAEVADEYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPLVL--QECVSDDE
.: ::. .:: ::: ::. :.:::. : . :..: :. ::.:
CCDS55 VPSGERN-SFKVPSIAE---------GENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEE
570 580 590 600 610
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pF1KSD TSEQLTPEEEAEETEAWAKPLSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIFQTYHQ
: :. :::.::::.::::: .:::.. ::: ::.:.: :.:.. ::::.: ... ::.
CCDS55 LPEVLSIEEEVEETESWAKPLIHLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHK
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD VEFGGFNQNC---GNASDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTP--YLEEDGTSI
. .. ... . .... .. .:::::::::: . .:. : : .:::::::.
CCDS55 PDSSNEENDARWETKLDEVVTSEGKTKPLIPEMCFIYS--EENIEYSPPNAFLEEDGTSL
680 690 700 710 720 730
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:.:: :: :::::::::.: . . :.:.::. :: .::::.::::::.......:.
CCDS55 LISCAKCCVRVHASCYGIPSHEICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWA
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pF1KSD HVSCAVAILEARFVNIAERSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPT
:: ::::. :.::.:. ::. .::..::: :.::
CCDS55 HVMCAVAVPEVRFTNVPERTQIDVGRIPLQRLKLGRLGI
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:::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::.:::..::: ::::::: ..:.::
CCDS64 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
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::::::::: ::::::.::..:.. ::::::.:: :.::.::.: ::.:::::::::::
CCDS64 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEGVDEWNIARLNTVLDVVEEECGISIEGVNTPYLYF
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:::::.:::::::::::::::::::::::::..::::::::::::.::::.:.:.:.:::
CCDS64 GMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAQGFFPSSSQGCDAFL
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CCDS64 RHKMTLISPSVLKKYGIPFDKITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATVRWID
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::: : ::.:::::::::::.:::::::.::.::: ::: .:::: ::: :. .:
CCDS64 YGKVAKLCTCRKDMVKISMDIFVRKFQPDRYQLWKQGKDIYTIDHTKPTPASTPEVKAWL
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360 370 380 390 400 410
pF1KSD KESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSEL
.. . .:. .: . . . :: :. .::. .:.
CCDS64 QRRRKVRKASRSFQCARSTSKRPKADEEE--------------------EVSDEVDGAEV
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:. : ... ...: : . .: :..: .. .. . . :: ... . ...
CCDS64 -PNPDSVTDDLKVSEKSEAAVKLRNTEASSEEESSASRMQVEQNLSDHIKLSGNSCLSTS
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. :. . :...: : :: : :. .: :.:: . :. :: :
CCDS64 VTEDIKTEDDKAYAYR-SVPSIS---------SEADDSIPLSSGYEKPEKSDPSELSWPK
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: :: . ... :::: ..:.: . :: . .: ::. .::
CCDS64 SPESCSSVAESNGVLTEGEESDVESHGNG-LEPGEIPAVPSGERN-SFKVPSIAE-----
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::: ::. :.:::. : . :..: :. ::.: : :. :::.::::.:::::
CCDS64 ----GENKTSKSWRHPLSRPPARSPMTLVKQQAPSDEELPEVLSIEEEVEETESWAKPLI
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.:::.. ::: ::.:.: :.:.. ::::.: ... ::. . .. ... . .... .
CCDS64 HLWQTKSPNFAAEQEYNATVARMKPHCAICTLLMPYHKPDSSNEENDARWETKLDEVVTS
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pF1KSD KQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTP--YLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGVPPAK
. .:::::::::: . .:. : : .:::::::.:.:: :: :::::::::.: .
CCDS64 EGKTKPLIPEMCFIYS--EENIEYSPPNAFLEEDGTSLLISCAKCCVRVHASCYGIPSHE
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. :.:.::. :: .::::.::::::.......:.:: ::::. :.::.:. ::. .
CCDS64 ICDGWLCARCKRNAWTAECCLCNLRGGALKQTKNNKWAHVMCAVAVPEVRFTNVPERTQI
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::..::: :.:::::::..: ::..: :.:::.::::..:::.::.::::.:.:::::.:
CCDS64 DVGRIPLQRLKLKCIFCRHRVKRVSGACIQCSYGRCPASFHVTCAHAAGVLMEPDDWPYV
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pF1KSD VFITCFRHKI-PNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNFDDG
: :::::::. ::. ..:. . :..:: ::.::.: :.:.:.:. .:..::::: ::::
CCDS64 VNITCFRHKVNPNV-KSKACEKVISVGQTVITKHRNTRYYSCRVMAVTSQTFYEVMFDDG
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pF1KSD SFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFEDGSQ
::: . .::::::.:::..:::::::::::.: ::..::::. .:. .:::::::::::
CCDS64 SFSRDTFPEDIVSRDCLKLGPPAEGEVVQVKWPDGKLYGAKYFGSNIAHMYQVEFEDGSQ
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pF1KSD LVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRFNEIFTEKEVKQ-EKKRQRVINSRYREDYI
...::.:.::::::::::::.:.:.::::::.. : .. : :.:::::..::....:.
CCDS64 IAMKREDIYTLDEELPKRVKARFSTASDMRFEDTFYGADIIQGERKRQRVLSSRFKNEYV
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1060
pF1KSD EPALYRAIME
.::....
CCDS64 ADPVYRTFLKSSFQKKCQKRQ
1040 1050
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CCDS12 MGSEDHGAQNPSCKIMTFRPTMEEFKDFNKYVAYIESQGAHRAGLAKIIPPKEWKPRQTY
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CCDS12 DDIDDVVIPAPIQQVVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVGEYRRLANSEKYCTPRHQDFDDLER
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:::::::: ::::::..:.::. : .:::: ::::::.::.: : ::::::::::::
CCDS12 KYWKNLTFVSPIYGADISGSLYDDDVAQWNIGSLRTILDMVERECGTIIEGVNTPYLYFG
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CCDS12 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYAIPPEHGKRLERLAIGFFPGSSQGCDAFLR
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::::::::..::::::::...::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.:
CCDS12 HKMTLISPIILKKYGIPFSRITQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATLRWIDY
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pF1KSD GKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPT----PE-----A
:: :. :.::::::::::::::: .:::::.::: ::: ::.::: :: :: :
CCDS12 GKVATQCTCRKDMVKISMDVFVRILQPERYELWKQGKDLTVLDHTRPTALTSPELSSWSA
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pF1KSD AEFLKESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGE---EGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQ
.. ...: :. .. :.. :: . :: ..: .. :. .... :.
CCDS12 SRASLKAKLLRRSHRKRSQPKKPKP--EDPKFPGEGTAGAALLEEAGGSVKEEAGPEVDP
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: . : :. ... : .: . . .:::.. : :. .. .: ..:
CCDS12 EEEEEE--PQPLPHGREAEGAE-EDGRGKLRPTKAKSERKKKSFGLLPPQLPPPPAHFPS
420 430 440 450 460 470
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. . : : ::.. : :: : .. . : .
CCDS12 EEALWLPSPLEPPVLGPGPAAMEESPLPAPLNVVPPEVPSEELEAKPRPIIPMLYVVPRP
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.. . ..: .::. . . .. . . . . : .:.: : .. . .:
CCDS12 GKAAFNQEHVSCQQAFEHFAQKGPTWKEPVSPMELTGPEDGAASSGAGRMETKARAGEGQ
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pF1KSD DEYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPRHHPL-VLQECVSDDETSEQLTPEEEAEETEAWAKP
:: . . .:.::.::.. : . :: :... .:.:: . .. ::.. . .:
CCDS12 APSTFSKLKMEIKKSRRHPLGRPPTRSPLSVVKQEASSDEEASPFSGEEDVSDPDALRPL
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pF1KSD LSQLWQNRPPNFEAEKEFNETMAQQAPHCAVCMIF-------QTYHQVEFGGFNQNCGNA
:: :.:: .:.::..:: . :. :.::.: .: :: ... .......: :
CCDS12 LSLQWKNRAASFQAERKFNAAAARTEPYCAICTLFYPYCQALQTEKEAPIASLGEGCP-A
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pF1KSD SDLAPQKQRTKPLIPEMCFTSTGCSTDINLSTPYLEEDGTSILVSCKKCSVRVHASCYGV
. . ..:.:.:::::::::: : .:. .. :. .:::: :..: :: ..:::::::.
CCDS12 TLPSKSRQKTRPLIPEMCFTSGGENTEPLPANSYIGDDGTSPLIACGKCCLQVHASCYGI
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pF1KSD PPAKASEDWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWVHVSCAVAILEARFVNIAE
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CCDS12 RPELVNEGWTCSRCAAHAWTAECCLCNLRGGALQMTTDRRWIHVICAIAVPEARFLNVIE
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pF1KSD RSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPTAFHVSCAQAAGVMMQPDD
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CCDS12 RHPVDISAIPEQRWKLKCVYCRKRMKKVSGACIQCSYEHCSTSFHVTCAHAAGVLMEPDD
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pF1KSD WPFVVFITCFRHKIPNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTETFYEVNF
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CCDS12 WPYVVSITCLKHKSGG--HAVQLLRAVSLGQVVITKNRNGLYYRCRVIGAASQTCYEVNF
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pF1KSD DDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQMYQVEFED
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CCDS12 DDGSYSDNLYPESITSRDCVQLGPPSEGELVELRWTDGNLYKAKFISSVTSHIYQVEFED
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pF1KSD GSQLVVKRDDVYTLDEELPKRVKSRLSVASDMRFNEIFTEKEVKQEKKRQRVINSRYRED
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CCDS12 GSQLTVKRGDIFTLEEELPKRVRSRLSLSTGAPQEPAFSGEEAKAAK-RPRVGTPLATED
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1060
pF1KSD YIEPALYRAIME
. : :..:
CCDS12 SGRSQDYVAFVESLLQVQGRPGAPF
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CCDS83 METMKSKANCAQNPNCNIMIFHPTKEEFNDFDKYIAYMESQGAHRAGLAKIIPPKEWKAR
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pF1KSD ASYDDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEE
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CCDS83 ETYDNISEILIATPLQQVASGRAGVFTQYHKKKKAMTVGEYRHLANSKKYQTPPHQNFED
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pF1KSD LERKYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYL
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CCDS83 LERKYWKNRIYNSPIYGADISGSLFDENTKQWNLGHLGTIQDLLEKECGVVIEGVNTPYL
130 140 150 160 170 180
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pF1KSD YFGMWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEA
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CCDS83 YFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHLGEPKTWYVVPPEHGQRLERLARELFPGSSRGCGA
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pF1KSD FLRHKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRW
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CCDS83 FLRHKVALISPTVLKENGIPFNRITQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRW
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pF1KSD IEYGKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPTPEAAEFL--
:.:::.: ::: . : .:::.::: .::::: ::: :.: .:.:: : :.. :
CCDS83 IDYGKMASQCSCGEARVTFSMDAFVRILQPERYDLWKRGQDRAVVDHMEPRVPASQELST
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pF1KSD -KESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSE
:: .:: ::
CCDS83 QKEVQLPRRAALGLRQLPSHWARHSPWPMAARSGTRCHTLVCSSLPRRSAVSGTATQPRA
370 380 390 400 410 420
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10 20 30 40 50
pF1KSD MASESETLNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRASY
: : : ::::::::::: .:. :.::.::::::.::::::.:::::: : :
CCDS44 MKSVHSSPQNTSHTIMTFYPTMEEFADFNTYVAYMESQGAHQAGLAKVIPPKEWKARQMY
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELER
:::.:..: .:.::...::.:.::::. .:::: : ..:..::: :: :: ...: .::.
CCDS44 DDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPHQNFADLEQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD KYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFG
.:::. ::::::::..:.:.:. . .::.:.: :::::.:.: :..::::::::::::
CCDS44 RYWKSHPGNPPIYGADISGSLFEESTKQWNLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KSD MWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLR
::::.::::::::::::::::::::::.:: ::::::..:::::. .:: ...::::::
CCDS44 MWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTWYVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD HKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEY
::..:::: .::. ::::. .::::::::.::::::::::::::::::. :::: :::.:
CCDS44 HKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFMVTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD GKQAVLCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPTPEAAEFLKESEL
::.: ::: .. : .::: ::: ::: :.::: .: ....:: :
CCDS44 GKMASQCSCGESTVTFSMDPFVRIVQPESYELWKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRD
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEEGDLKTSLAKHRIGTKRHRVCLEIPQEVSQSELFPKED
CCDS44 DIVLRRAALGLRLLPNLTAQCPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLT
370 380 390 400 410 420
>>CCDS78379.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (151 aa)
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Smith-Waterman score: 771; 75.4% identity (93.0% similar) in 142 aa overlap (3-143:4-145)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASESET-LNPSARIMTFYPTMEEFRNFSRYIAYIESQGAHRAGLAKVVPPKEWKPRAS
.: :. :::: .:::: :.:::::.:..:.::.::.::::::::::.::::::::
CCDS78 MEVAEVESPLNPSCKIMTFRPSMEEFREFNKYLAYMESKGAHRAGLAKVIPPKEWKPRQC
10 20 30 40 50 60
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pF1KSD YDDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTPRYSEFEELE
:::::.:.:::::::.::::::::::::::::::::.:::..::: ::::::: ..:.::
CCDS78 YDDIDNLLIPAPIQQMVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVKEFRQLANSGKYCTPRYLDYEDLE
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120 130 140 150 160 170
pF1KSD RKYWKNLTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYF
::::::::: ::::::.::..:..
CCDS78 RKYWKNLTFVAPIYGADINGSIYDEVHSYLQ
130 140 150
>>CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12 (1690 aa)
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Smith-Waterman score: 505; 24.5% identity (50.0% similar) in 926 aa overlap (90-921:359-1252)
60 70 80 90 100 110
pF1KSD DDIDDLVIPAPIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIAN---SDKYCTPRYSEFEE
. .:.. : ..:. :: . : . :
CCDS41 DVPKGDWRCPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTE
330 340 350 360 370 380
120 130 140 150
pF1KSD L-ERKYWKNLT-FNPPI---YGADVN----GTLY--------------EKHVDEWNIGRL
: :...:. .. .. . ::::.. :. . : .. ::.. .
CCDS41 LVEKEFWRLVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNM
390 400 410 420 430 440
160 170 180 190 200 210
pF1KSD RTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFGMWKTSFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPP
.. . : . .. : :...:.:: :: .:: :: :: :::::::.::::.::.::
CCDS41 PVLEQSVLAHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPS
450 460 470 480 490 500
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLRHKMTLISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPY
. ...::.. . . : .: .:.. .:...: .: ..:.: ...: ::::..:::
CCDS41 HAAEQLEEVMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPR
510 520 530 540 550 560
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEYGKQAVLCSCR-KDMVKISMDVFVRKFQPERYKLW
.::.:::.:.: ::..:: : :. :.: : : . .: . .. :. . :
CCDS41 AYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECL-
570 580 590 600 610 620
340 350 360 370 380
pF1KSD KAGKDNTVIDHTLPTPEAAEFLKESELPPRAGNEEECPEEDMEGVEDGEE--GDLKTS--
.: : . : :.:: . . :: : .: : : :. . .:.
CCDS41 DVGLAAMVCKELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEE---EVFELVPDDERQCSACRTTCF
630 640 650 660 670 680
390 400 410 420 430 440
pF1KSD LAKHRIGTKRHR-VCLEIPQEVSQSELFPKEDLSSEQYEMTECPAALAPVRPTHSS----
:. . . .: ::: : .. . :. : .: . . :. : :. .:
CCDS41 LSALTCSCNPERLVCLYHPTDLCPCPM-QKKCLRY-RYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTW
690 700 710 720 730 740
450 460 470 480 490
pF1KSD VRQVEDGLT--FPDYSDSTEVK--FEELKNVKLEEEDEEEEQEAAALDLSVNPASVGGRL
: .: ..:. : .: :.. .:. .. : :.: .. . :. . . :::. .:
CCDS41 VSRVTEALSANFNHKKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETC-ASVA-QL
750 760 770 780 790 800
500 510 520 530 540 550
pF1KSD VFSGSKKKSSSSLGSGSSRDSISSDSETSEPLSCRAQGQTGVLTVHSYAKGDGRVT--VG
..: .:.: .: :: .: .. : : :. .: .. : : :. . :
CCDS41 LLS-KKQKHRQSPDSGRTRTKL-----TVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVE
810 820 830 840 850
560 570 580 590 600 610
pF1KSD EPCTRKKGS----AARSFSERELAEVADEYMFSLEENKKSKGRRQPLSKLPR-HHPLVLQ
: : . . . : . . : .... . : : . : . : : . . :
CCDS41 EFHERAQEAMMDETPDSSKLQMLIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDP
860 870 880 890 900 910
620 630 640 650
pF1KSD ECVSDD------ETSEQLTPEEEAEETEAWAKPL---SQLW--------QNRPPNFEAEK
. :. : ... :.:.. .:.. : . : :. : : :: . :
CCDS41 QQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHHAVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASL
920 930 940 950 960 970
660 670 680 690 700
pF1KSD EFNETMAQQAP---------HCAVCMIFQTYHQVEFGGFNQNCGNASDLAPQKQRTKPLI
: . :.. : . :. . .:: ..: . .: . . .: :
CCDS41 ESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKEALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRP-I
980 990 1000 1010 1020 1030
710 720 730 740 750
pF1KSD PEMCFTSTGCSTDINLSTPYLEEDGTSILVSCKKCSV------RVHASCYGVPPAKASE-
: . ... . . :. : ..: . .. .. :. . :: . ..
CCDS41 PVRLEALPQVESQVAAARAWRERTGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGVYGSGKNRRKKV
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KSD DWMCSRCSANALEEDCCLCSLRGGALQRANDDRWV-------HVSCAVAILEARFVNIAE
. . . . :. . : .:. : :... : : . . :. : .:.:.
CCDS41 KELIEKEKEKDLDLEP-LSDLEEG-LEETRDTAMVVAVFKEREQKEIEAMHSLRAANLAK
1100 1110 1120 1130 1140 1150
820 830 840 850 860
pF1KSD RSPVDVSKIPLPRFKLKCIFCKKRRKRTAGCCVQCSHGRCPTAFHVSC-------AQAAG
. :: .: .: :: : :: ..: .:: : :: :: .: :
CCDS41 MTMVD--RIEEVKF---CI-C---RKTASGFMLQCEL--CKDWFHNSCVPLPKSSSQKKG
1160 1170 1180 1190 1200
870 880 890 900 910 920
pF1KSD VMMQPDDWPFVVFITCFRHKIPNLERAKGALQSITAGQKVISKHKNGRFYQCEVVRLTTE
: . :. . :.: . : :: . : :. ::. . .:. :: . :
CCDS41 SSWQAKEVKFLCPL-CMRSRRPRLETILSLLVSL---QKLPVRLPEGEALQCLTERAMSW
1210 1220 1230 1240 1250
930 940 950 960 970 980
pF1KSD TFYEVNFDDGSFSDNLYPEDIVSQDCLQFGPPAEGEVVQVRWTDGQVYGAKFVASHPIQM
CCDS41 QDRARQALATDELSSALAKLSVLSQRMVEQAAREKTEKIISAELQKAAANPDLQGHLPSF
1260 1270 1280 1290 1300 1310
>>CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1570 aa)
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Smith-Waterman score: 466; 37.1% identity (66.2% similar) in 210 aa overlap (100-304:445-651)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PIQQLVTGQSGLFTQYNIQKKAMTVREFRKIANSDKYCTP--RYSEFEELER---KYWKN
..:: . .: . . . : : ..: .
CCDS55 FWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKRQSLTVLTRLISSFWAQ
420 430 440 450 460 470
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LTFNPPIYGADVNGTLYEKHVDEWNIGRLRTILDLVEKESGITIEGVNTPYLYFGMWKTS
.. :: . : : : : .. ::.. . .. . : . . : :...:.:: :: ..
CCDS55 AVL-PP-WPPKVLG-LQEYATSGWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSA
480 490 500 510 520 530
190 200 210 220 230 240
pF1KSD FAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKSWYSVPPEHGKRLERLAKGFFPGSAQSCEAFLRHKMTL
: :: :: :::::::.::::.::.:: ...::.. : . : .: .:.. .::
CCDS55 FCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTL
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD ISPLMLKKYGIPFDKVTQEAGEFMITFPYGYHAGFNHGFNCAESTNFATRRWIEYGKQAV
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CCDS55 MNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCI
600 610 620 630 640 650
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pF1KSD LCSCRKDMVKISMDVFVRKFQPERYKLWKAGKDNTVIDHTLPTPEAAEFLKESELPPRAG
CCDS55 EHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVT
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]