FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KSDA0680, 634 aa 1>>>pF1KSDA0680 634 - 634 aa - 634 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.0822+/-0.00042; mu= -20.0714+/- 0.026 mean_var=461.6713+/-96.196, 0's: 0 Z-trim(124.1): 64 B-trim: 1419 in 2/58 Lambda= 0.059691 statistics sampled from 45209 (45276) to 45209 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.794), E-opt: 0.2 (0.531), width: 16 Scan time: 12.090 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055536 (OMIM: 608724) phosphatase and actin reg ( 634) 4121 369.1 2.6e-101 NP_001093634 (OMIM: 608724) phosphatase and actin ( 645) 4095 366.9 1.2e-100 NP_001093636 (OMIM: 608724) phosphatase and actin ( 554) 2662 243.5 1.5e-63 NP_001093635 (OMIM: 608724) phosphatase and actin ( 565) 2662 243.5 1.5e-63 XP_016857662 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 686) 995 100.0 3e-20 XP_016857657 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 702) 995 100.0 3e-20 NP_001041648 (OMIM: 608726) phosphatase and actin ( 702) 995 100.0 3e-20 XP_016857655 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 710) 995 100.0 3.1e-20 XP_016857656 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 710) 995 100.0 3.1e-20 NP_076412 (OMIM: 608726) phosphatase and actin reg ( 712) 995 100.0 3.1e-20 XP_005246027 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 720) 995 100.0 3.1e-20 XP_016857658 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 695) 964 97.3 1.9e-19 XP_016857661 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 695) 964 97.3 1.9e-19 XP_016857659 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 695) 964 97.3 1.9e-19 XP_016857660 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 695) 964 97.3 1.9e-19 XP_016857654 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 711) 964 97.3 2e-19 XP_016857653 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 711) 964 97.3 2e-19 XP_016857652 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 718) 964 97.3 2e-19 XP_016857651 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 719) 964 97.3 2e-19 XP_016857650 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 719) 964 97.3 2e-19 XP_016857649 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 721) 964 97.3 2e-19 XP_016857648 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 721) 964 97.3 2e-19 XP_016857646 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 729) 964 97.3 2e-19 XP_016857647 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase ( 729) 964 97.3 2e-19 NP_001309240 (OMIM: 608723) phosphatase and actin ( 488) 886 90.5 1.5e-17 NP_001309241 (OMIM: 608723) phosphatase and actin ( 488) 886 90.5 1.5e-17 NP_001309242 (OMIM: 608723) phosphatase and actin ( 557) 886 90.5 1.7e-17 NP_001309237 (OMIM: 608723) phosphatase and actin ( 580) 886 90.5 1.7e-17 NP_112210 (OMIM: 608723) phosphatase and actin reg ( 580) 886 90.5 1.7e-17 NP_001309238 (OMIM: 608723) phosphatase and actin ( 580) 886 90.5 1.7e-17 NP_001229577 (OMIM: 608723) phosphatase and actin ( 580) 886 90.5 1.7e-17 XP_016865953 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 581) 886 90.5 1.7e-17 NP_001309239 (OMIM: 608723) phosphatase and actin ( 649) 886 90.6 1.9e-17 XP_005248991 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 649) 886 90.6 1.9e-17 NP_001309243 (OMIM: 608723) phosphatase and actin ( 650) 886 90.6 1.9e-17 XP_016865958 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 504) 852 87.6 1.2e-16 XP_016865956 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 504) 852 87.6 1.2e-16 XP_016865954 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 573) 852 87.6 1.3e-16 XP_016865955 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 573) 852 87.6 1.3e-16 XP_016865952 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 595) 852 87.6 1.3e-16 XP_016865950 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 596) 852 87.6 1.4e-16 XP_016865949 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 596) 852 87.6 1.4e-16 XP_016865951 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 596) 852 87.6 1.4e-16 XP_016865948 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 596) 852 87.6 1.4e-16 XP_016865947 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 597) 852 87.6 1.4e-16 XP_016865946 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 665) 852 87.6 1.5e-16 XP_016865945 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 665) 852 87.6 1.5e-16 XP_016865944 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 665) 852 87.6 1.5e-16 XP_016865943 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 665) 852 87.6 1.5e-16 XP_016865941 (OMIM: 608723) PREDICTED: phosphatase ( 666) 852 87.6 1.5e-16 >>NP_055536 (OMIM: 608724) phosphatase and actin regulat (634 aa) initn: 4121 init1: 4121 opt: 4121 Z-score: 1939.9 bits: 369.1 E(85289): 2.6e-101 Smith-Waterman score: 4121; 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87.2% identity (87.3% similar) in 631 aa overlap (4-634:15-565) 10 20 30 40 pF1KSD MDNAVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 MGQTSVSTLSPQPGSVDGLDKASIANSDGPTAGSQTPPFKRKGKLSTIGKIFKPWKWRKK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KSD KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 KTSDKFRETSAVLERKISTRQSREELIRRGVLKELPDQDGDVTVNFENSNGHMIPIGEES 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KSD TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKKENTENHSETPAAPALPPSAPPKPRSKPKP ::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TREENVVKSEEGNGSVSEKTPPLEEQAEDKK----------------------------- 130 140 150 170 180 190 200 210 220 pF1KSD KKSPVPPKGATAGASHKGDEVPPIKKNTKAPGKQAPVPPPKPASRNTTREAAGSSHSKKT ::::::::: NP_001 ---------------------------------------------------AGSSHSKKT 160 230 240 250 260 270 280 pF1KSD TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TGSKASASPSTSSTSSRPKASKETVSSKAGTVGTTKGKRKTDKQPITSHLSSDTTTSGTS 170 180 190 200 210 220 290 300 310 320 330 340 pF1KSD DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 DLKGEPAETRVESFKLEQTVPGAEEQNTGKFKSMVPPPPVAPAPSPLAPPLPLEDQCITA 230 240 250 260 270 280 350 360 370 380 390 400 pF1KSD SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 SDTPVVLVSVGADLPVSALDPSQLLWAEEPTNRTTLYSGTGLSVNRENAKCFTTKEELGK 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 460 pF1KSD TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 TVPQLLTPGLMGESSESFSASEDEGHREYQANDSDSDGPILYTDDEDEDEDEDGSGESAL 350 360 370 380 390 400 470 480 490 500 510 520 pF1KSD ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 ASKIRRRDTLAIKLGNRPSKKELEDKNILQRTSEEERQEIRQQIGTKLVRRLSQRPTTEE 410 420 430 440 450 460 530 540 550 560 570 580 pF1KSD LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 LEQRNILKQKNEEEEQEAKMELKRRLSRKLSLRPTVAELQARRILRFNEYVEVTDSPDYD 470 480 490 500 510 520 590 600 610 620 630 pF1KSD RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_001 RRADKPWARLTPADKAAIRKELNEFKSTEMEVHEESRQFTRFHRP 530 540 550 560 >>XP_016857662 (OMIM: 608726) PREDICTED: phosphatase and (686 aa) initn: 1205 init1: 688 opt: 995 Z-score: 484.6 bits: 100.0 E(85289): 3e-20 Smith-Waterman score: 1293; 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